本发明公开了一种高压膜过滤系统、回收率控制及保护方法,膜过滤系统包括至少一个膜组件、高压泵、循环泵、原水管路、浓水管路、高压调节阀及PLC控制器,高压泵设置在原水管路上,原水管路上设置有进水流量计,膜组件的进口端设置有压力变送器S1,膜组件的出口端设置有压力变送器S2,循环泵设置在浓水管路上,浓水管路上设置有高压调节阀及浓水流量计,高压泵、进水流量计、浓水流量计、压力变送器、高压调节阀均与PLC控制器连接,PLC根据系统回收率H及跨膜压差K对系统进行回收率控制和连锁保护。本发明利用模糊控制的方法对系统进行回收率控制,可消除高压调节阀频繁开关的现象,保证膜过滤系统的稳定运行,提高系统的回收率及过滤质量。