本发明公开一种适用于大跨度活塞杆的分区喷涂方法及活塞杆表面涂层结构,活塞杆表面涂层结构包括沿活塞杆长度方向划分的多个喷涂段,各喷涂段上的涂层数量相同,相邻两喷涂段之间,位于同一层的涂层相接,且相邻涂层之间,涂层相接的位置相互偏移。在喷涂作业前,本发明基于分区策略将大跨度活塞杆分为多个喷涂区域,各喷涂区域根据长度划分为一个或多个喷涂段,以分区域依次进行喷涂,并通过对喷枪的喷涂扫描路径进行规划使得相邻喷涂段之间的涂层相接点相互偏移,能够避免单层喷涂时间过长导致已喷涂表面沉积灰尘影响加工质量,同时方便装夹,避免喷涂过程中装夹造成的活塞杆基体弯曲变形。