本发明提供了一种燃料电池热管理系统控制装置,包括燃料电池电堆、出堆温度传感器、水泵、三通阀、车载散热器、外循环温度传感器、加热器、入堆温度传感器和控制器;燃料电池电堆分别与出堆温度传感器和入堆温度传感器相连接;出堆温度传感器与水泵相连接;水泵与三通阀相连接;三通阀分别与车载散热器、外循环温度传感器和加热器相连接;车载散热器与外循环温度传感器相连接;外循环温度传感器与加热器相连接;加热器与入堆温度传感器相连接;控制器接收和发送所有信号,执行嵌入在控制软件中的控制逻辑,控制所有可执行器件。本发明响应速度快,控制精确度高,稳定性高,大大地提高了燃料电池的工作效率,延长了燃料电池的工作寿命。