本发明属于微生物及环境科学技术领域,具体涉及一种高效生物转化重金属污染土壤中有机结合态镉的菌株及其应用。本发明提供了能高效生物转化土壤中有机结合态镉的一种新的微生物菌株(Paraburkholderia),将其命名为Paraburkholderia fungorum strain ZW,该微生物菌株能将稻田土壤中难去除、易转化的有机结合态镉高效转化成可溶态镉,将Paraburkholderia fungorum strain ZW菌株用于处理镉污染土壤,总镉的去除率为14.08％,有效镉的去除率为29.22％,有机结合态镉的去除率为50.46％,且周期短,费用低,不产生二次污染,易于推广。