本发明公开了一种基于肌电和MR眼镜的控制系统及其控制方法,该控制系统包括肌电信号采集头套、MR眼镜、执行终端,所述肌电信号采集头套包括头套主体、肌电采集电极、控制机构,肌电采集电极、控制机构分别设置在头套主体内,肌电信号采集头套与MR眼镜一体成型,肌电信号采集头套通过肌电采集电极采集使用者头部的肌电信号。该控制系统利用肌电信号采集头套采集头部的肌电信号,用以实现准确获取混合现实智能眼镜的头部指令,避免造成误操作,该控制系统使用简单,穿戴方便；该控制方法通过采集使用者头部的肌电信号,实现对混合现实智能眼镜的精确选择,进行对执行终端的动作控制,避免操作失误,无需占用双手,操作简单,使用方便。