本发明提出了天然河床渗滤取水集成系统及其设计方法,所述的天然河床渗滤取水集成系统由管井取水,大口井取水,辐射井取水,渗渠取水,下沉式人工滤池取水,反向渗滤取水中的至少两种取水方法任意集合而成的一种一体化取水系统。本发明依据天然河床的实际条件,选择两种及以上取水方式集合成一种新型的系统取水方式,实现高效、低成本、规模化开采天然河床潜流水。该集成系统适用于各种复杂地质条件的河段,重点打破了传统、单一取水方法受地质条件、施工条件的限制,高效地扩大了产水量,并保障了优良水质。通过传感器和物联网技术,与控制反冲系统协同工作,形成一套高度自动化的集成取水系统。