本发明涉及柴油机发动机系统及其运行方法。本发明提供用于多缸柴油发动机中的气缸停用的系统和方法包括使用涡轮增压器将空气泵入柴油发动机的进气歧管。使用进气辅助装置将空气泵入进气歧管。并且,对柴油发动机中的至少一个气缸燃料喷射被选择性地停用。对于柴油发动机的至少一个气缸选择性地停用进气门和排气门。