本发明公开了一种顾及观测值系统误差的部分模糊度固定算法,获取卫星集合对应的载波相位观测值和伪距观测值,初步解算得到整周模糊度参数,然后通过LAMBDA算法搜索得到最优模糊度组和次优模糊度组,对最优模糊度组进行可靠性检验,如果检验通过,则根据最优模糊度组计算得到其他待估参数固定解,如果检验不通过,当最优固定解和次优解固定解的三维分量差值小于阈值时,进行卫星集合筛选并能过位置精度衰减因子判断筛选出的卫星集合是否满足部分模糊度固定要求:满足由进行部分模糊度固定,否则本历元模糊度固定失败。本发明同时考虑模糊度浮点受到的系统误差影响及其方差信息,提高模糊度固定的成功率,缩短收敛时间。