本发明公开了一种航天器返回搜寻定位系统及搜寻定位方法。该系统包括：平流层飞艇、多个Lora定位终端、艇载Lora物联网网关终端和指挥中心接收站,其中：Lora定位终端分别安装在航天器返回舱上和搜寻队员身上,获取航天器返回舱和搜寻队员的位置信息并将位置信息发送给艇载Lora物联网网关终端；平流层飞艇布置在航天器预定返回区域上空；艇载Lora物联网网关终端安装在平流层飞艇上,接收来自Lora定位终端的位置信息并将位置信息发送给指挥中心接收站；指挥中心接收站放置于地面指挥中心,接收艇载Lora物联网网关终端发回的位置信息。该系统在平流层飞艇上搭载Lora网关终端,采用Lora调制方式传输信息,有效减小发射功率,利于定位终端的小型化和便携式设计。