本发明公开了一种基于ICA-R算法的2FSK信号抗干扰方法及装置,在接收到的输入信号中包括干扰信号及通信信号时,可以基于2FSK信号的任意一个调制频率生成一个参考信号,然后利用此参考信号,用ICA-R算法,对输入信号中包含的通信信号进行分离提取,继而对干扰信号和噪声信号进行抑制,从而实现抗干扰。依照本发明公开的方法,在接收端仅需要知道发送端通信信号的调制频率即可产生ICA-R算法所需的参考信号,无需其他先验信息,容易实现。且不需要像常规的盲源分离方法那样先对接收信号中含有的所有源信号进行分离,然后再对分离得到的各信号进行区分识别,减少了对目标信号进行分离提取的步骤,可提高通信信号分离的效率。