本发明公开了一种采用尿囊素降低明胶中内毒素的方法,包括以下步骤:在容器中,将待处理明胶溶于温度保持在45-55℃的水中,调节明胶溶液pH为4.5-6.0;加入氯化钠,在45-55℃下搅拌10-30min;加入尿囊素,得预处理溶液;在45-55℃下搅拌孵育15-60min,过滤,浓缩,灭菌,干燥,粉碎,得低内毒素明胶颗粒。经该方法处理的明胶中内毒素含量低于200EU/g,且处理过程对明胶性质无显著影响,冻力,粘度,粘降,凝冻点和灰分指标在处理前后改变程度在5%以内,可广泛应用在制备可吸收止血海绵、可再生医药、医用辅食等领域;且该方法工艺过程简单温和,能够实现准工业化水平的放量制备。