本发明提供一种水下小型井口连续油管钻井系统,包括浮式钻井台、连续油管钻井机构和钻井液回流单元,所述连续油管钻井机构包括连续油管绞车、连续油管导入装置、钻井液体积控制单元、连续油管防喷器和小型井口基盘,所述连续油管水下防喷器固定在所述小型井口基盘上,所述钻井液体积控制单元固定在所述连续油管水下防喷器上,所述钻井液体积控制单元固定在所述连续油管水下控制单元上;所述钻井液回流单元也固定在所述小型井口基盘上,且所述钻井液体积控制单元与所述钻井液回流单元通过钻井液回流软管相连通;该水下小型井口连续油管钻井系统使钻井液可以回收利用,有利于钻井平台小型化。