本申请公开了一种背压机电机同轴双驱动控制系统及控制方法,所述背压机通过离合器与电机同轴连接,以给大型设备提供驱动力；所述背压机的进汽端通过进汽调节门连接有供汽的高压缸,其排汽端通过排汽调节门排汽至下游蒸汽联箱；包括监测模块和控制模块；所述控制模块配置用于：根据所述下游蒸汽联箱内压力p-(1)、高压缸排汽压力p-(2)、背压机排汽压力p-(0)和背压机输入轴转速WS-(1)调节所述进汽调节门的开度。本申请对背压机进汽大小和压力的调节充分考虑了背压机上游、下游及本身运行的参数影响,使得背压机排汽稳定。