本发明涉及一种具有GNSS驯服和间隔时间保持能力的标准计时系统,包括GNSS接收机、FPGA模块、时间间隔测量模块,GNSS接收机中设有时间信息输出端、卫星信号输入端和秒脉输出端,FPGA模块中设有时间信息输入端、触发计数模块、分频模块、滤波控制模块、当前时刻输出端、时间间隔输出端,时间间隔测量模块中设有测量结果输出端、停止端和启动端。该发明系统能实现高精度的晶振驯服,不仅稳定度和同步性高,且实现过程不复杂。当GNSS信号失锁后,可有效保持本地时间的准确和稳定性,在毫秒级数字时钟分辨力下满足标准计时的应用需求。