本发明提供一种用于检测人EGFR基因突变的数字PCR试剂盒,所述数字PCR试剂盒包括在同一反应管数字PCR反应体系中同时检测多种Ex19Del突变和L858R突变,其中Ex19Del位点使用多条ARMS引物识别突变型,L858R位点使用TaqMan荧光探针识别野生型和突变型；进行PCR扩增后,通过荧光信号位置和强度检测Ex19Del突变型、L858R突变型和L858R野生型,并对其直接进行绝对定量。本发明的试剂盒通量高、成本低,实现了Ex19Del25位点和L858R位点合为一管检测,提高了检测通量,降低了试剂耗材成本。

本发明公开了一种用于捕获同源重组修复基因的探针组,该探针组捕获的基因组区域主要包括ATM、BARD1、BRCA1、BRCA2、BRIP1、CDK12、CHEK1、CHEK2、FANCA、FANCL、PALB2、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L这15个前列腺癌相关的同源重组修复基因的全编码区和外显子-内含子连接区。本发明还公开了同源重组修复基因的高通量测序方法、突变检测方法及试剂盒。本发明通过设计前列腺癌基因集panel进行杂交捕获和高通量测序,可一次性平行检测15个HRR相关基因的多种变异形式,不仅可检测突变类型全,而且准确性和测序覆盖深度高,均一性好。

本发明属于生物技术领域,公开了基于甲基化的乳腺癌风险预测诊断标志物、装置、方法及介质。所述标志物包括两组基因集的甲基化位点和血细胞组分：第一组基因集包括：第一组基因集包括：ENTPD3、ITGA4、KRT83、LAPTM4B、LIN54、NEFL、NUP133、OTOS、PNLDC1、PSCA、RALA和SOX14,第二组基因集包括：DCC、DHRS7C、ECHDC3、NKX2-6、RAB4A、SIGIRR、SYT12、TCTN1、WDR89、C6orf72和FLJ20184,所述血细胞组分包括T细胞比例、B细胞比例、NK细胞比例、淋巴细胞比例、单核细胞比例、粒细胞比例、CD4阳性细胞比例、CD8阳性细胞比例。

本发明涉及一种制造分子阵列的方法,所述方法包括i)使第一和第二探针组与遗传样品接触,ii)使第一和第二探针组的至少一部分分别与所述遗传样品的核苷酸分子中的第一和第二目标核酸区杂交,iii)可选地分别扩增第一和第二探针组以形成第一和第二经扩增的探针组,iv)在扩增或固定之前或之后,用分别用第一和第二标记来标记第一和第二标记探针和/或第一和第二经扩增的探针组的至少一部分,v)将第一和第二探针组和/或第一和第二经扩增的探针组的至少一部分固定至基板,和vi)分析经标记的经固定的寡核苷酸的至少一部分是否相对于另一部分经标记的经固定的寡核苷酸是光学上能够单独解析的。

本发明公开了一种可区分幽门螺杆菌耐药突变体的可视化试纸,包括核酸检测试纸,所述核酸检测试纸包括野生检测区和至少一个突变检测区,所述野生检测区设有野生检测探针,所述野生检测探针和突变检测探针均设置荧光团和猝灭团；所述野生检测探针、突变检测探针分别能够识别野生型幽门螺杆菌核酸、突变型幽门螺杆菌核酸并进行链取代反应,且识别野生型幽门螺杆菌核酸后能够使荧光团和猝灭团分开,从而发出荧光；所述消耗探针能够识别野生型幽门螺杆菌核酸,并与野生型幽门螺杆菌核酸杂交。本发明提供的可视化试纸能够对幽门螺杆菌耐药突变体对应的野生型和点基因突变型序列进行高特异性检测。

本发明公开了高度近视基因检测试剂盒,所述试剂盒包括捕获第一目标基因的第一探针和捕获第二目标基因的第二探针；所述第一目标基因是通过外显子测序捕获的高度近视致病基因,所述第二目标基因是从全身系统综合征或遗传性眼病伴随高度近视的患者中检测到的突变基因。本发明试剂盒能够提高分子诊断的覆盖率和检出率,可以用于高度近视的早期筛查、辅助临床诊断、筛查易感高危病人,为疾病的早期精确诊断、早期防控以及治疗的研究提供理论依据,具有良好的市场应用前景。

本发明属于生物基因技术领域,公开了一种DNA甲基化位点分析方法、DNA生物传感器,利用AuNPs@rGO复合材料修饰金电极；捕获探针、辅助探针、不同甲基化位点的靶序列的设计；DNA杂交诱导金纳米粒子聚集信号放大；抗-5甲基胞嘧啶抗体特异性识别甲基化位点；电化学传感分析技术的最适实验条件的优化；电化学检测；血清中甲基化DNA的检测。本发明将三螺旋核酸结构与电化学技术相结合,构建一种简单、稳定、特异性强的DNA甲基化位点分析技术,DNA甲基化位点的最大检出个数为7,优于其他文献报道的结果,为基因表观紊乱疾病和肿瘤的早期临床诊断以及去甲基化靶向治疗方案的选择提供新的技术手段。

本发明涉及用于鉴定和定量的方法和装置,包括低丰度的核苷酸碱基突变、插入、缺失、易位、剪接变体、miRNA变体、可变转录物、可变起始位点、可变编码序列、可变非编码序列、可变剪接、外显子插入、外显子缺失、内含子插入、或基因组水平上的其他重排和/或甲基化核苷酸碱基。

本发明公开了一种快速通用的低丰度突变检测方法。它包括如下步骤,步骤一：制备单脱碱基的双标记荧光探针；步骤二：设计所需的突变链,野生链,引导链,桥梁链和阻遏链；步骤三：配置液体；步骤四：制备浓度为500nm混合样本；步骤五：加入阻遏链；步骤六：将引导链和桥梁链混合配置成混合液；步骤七：将混合液静置；步骤八：将步骤四配置的混合液分别加入到步骤七处理的混合液,配置成混合液；步骤九：在步骤七的混合液中加入步骤一制得的探针；步骤十：在步骤八的混合液中加入酶；步骤十一：将步骤九的液体加入到检测管中检测荧光曲线；步骤十二：得到突变点的荧光曲线。本发明具有能高选择性、快速、低成本地检测目标DNA序列的优点。

本发明涉及用于测定源自至少一个多倍体细胞的核酸样品中目的序列变异体的相对频率的可靠方法,其中该方法使用UMI以校正任何的扩增偏差。本发明还涉及UMI在用于准确地测定源自至少一个多倍体细胞的核酸样品中目的序列变异体的相对频率中的用途。