本发明属于农业生物技术领域,具体涉及与谷子抗咪唑乙烟酸除草剂基因紧密连锁的分子标记SV9和SV13及其应用。本发明的分子标记SV9的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示;所述分子标记SV13的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4所示。本发明在目标基因的上游和下游分别开发出了分子标记,且上下游分子标记离目标基因物理距离小于150kb,本发明的分子标记与目标基因连锁关系更稳定,且上下游标记结合使用,进行分子标记筛选更准确。
本发明公开了小麦粒重基因TaCYP78A16的KASP标记开发及其应用、鉴定或辅助鉴定小麦粒重的方法。该方法包括:检测待测小麦的基因型,根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦粒重;所述基因型为小麦基因组中KASP-78A16位点的基因型;所述KASP-78A16位点是小麦基因组中的一个SNP位点,位于小麦第5A号染色体上SEQ ID No.4的第51位核苷酸,其核苷酸种类为A或T。实验证明,该KASP-78A16位点AA基因型的小麦品种的粒重显著高于或候选高于KASP-78A16位点TT基因型的待测小麦品种,说明KASP-78A16位点是与小麦粒重相关的SNP分子标记。
本发明公开了小麦白粉病抗性基因pmCH7015的KASP标记开发及其应用、鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性的方法。该方法包括:检测待测小麦的基因型,根据待测小麦的基因型鉴定或辅助鉴定小麦白粉病抗性;基因型为CC基因型、AA基因型或CA基因型;CC基因型表示小麦基因组中KASP-7015位点的核苷酸种类为C的纯合型;AA基因型表示小麦基因组中KASP-7015位点的核苷酸种类为A的纯合型;CA基因型表示小麦基因组中KASP-7015位点的核苷酸种类为C和A的杂合型;KASP-7015位点是小麦基因组中的一个SNP位点,位于小麦第5A号染色体上SEQ ID No.4的第101位核苷酸。实验证明,该KASP-7015位点AA基因型的小麦品种的白粉病抗性低于KASP-7015位点CC基因型的小麦品种,说明KASP-7015位点是与小麦白粉病抗性相关的SNP分子标记。