本发明属于空天地海一体化信息网络技术领域,具体公开了一种低轨卫星通信系统快速频率捕获方法、系统及终端,该系统包括,包括初始估计与补偿模块,粗频偏估计与补偿模块,细频偏估计与补偿模块,以及相位估计与补偿模块,该方法通过接收卫星周期播发的FCCH信道信号m(n)及语音DTB突发信号r(n),运算获得信号x(n),最后进行解调编译码。采用本技术方案,能够有效将通信的频率偏移量降低到最小范围,使移动终端在载波同步处理部分设计简单,便于提升终端的便捷性与稳定性,以及有效保障了整个卫星通信过程中的频率稳定性。