一种使用柔性围隔实现入湖河道蓝藻防控和船只通行的方法,涉及蓝藻防控技术领域,在两边的河墙上垂直向分别设置滑轨,滑轮置于滑轨内,可沿滑轨上下滑动,一端固定滑轮的连接件,其另一端连接围隔;围隔由二段组成,二段围隔也通过连接件活动连接;所述连接件由连接板一和连接板二构成,水平向排列的连接板一和连接板二以活动机构连接;需要控藻时,保持二段围隔的活动连接关系,需要通航时,解除二段围隔的连接件的活动连接关系,且把解除活动连接关系的围隔一侧挂在与该围隔另一侧仍保持连接关系的河墙的上部,围隔被打开,空出湖面用于通航。本方法能根据拦截需求,使用柔性围隔,能及时方便完成蓝藻防控与船只自由通行的转换。