基于厄洛替尼靶向降解egfr蛋白小分子化合物及其制备方法和应用
阅读说明：本技术 基于厄洛替尼靶向降解egfr蛋白小分子化合物及其制备方法和应用 (Erlotinib-based EGFR protein targeted degradation small molecule compound and preparation method and application thereof ) 是由 张兴贤 王文冰 于 2021-04-28 设计创作，主要内容包括：本发明提供了一种基于厄洛替尼靶向降解EGFR蛋白小分子化合物及其制备方法和应用,该化合物(I)或其药学上可接受的盐或水合物,以及包含该化合物的药物组合物可应用于制备预防或/和治疗癌症的药物；本发明选用泊马度胺作为PROTACs中与E3连接酶进行结合的部位,厄洛替尼为靶向EGFR小分子化合物,选用合适的连接链将两者相连接构建PROTACs,体外抗肿瘤活性测试及体外EGFR蛋白降解活性表明,本发明化合物表现出了良好的抗肿瘤活性,并表现出优异的EGFR蛋白降解作用,可用于预防或/和治疗多种癌症,在医药领域具有巨大的应用前景。(The invention provides an erlotinib-based EGFR protein targeted degradation small molecule compound and a preparation method and application thereof, wherein the compound (I) or pharmaceutically acceptable salt or hydrate thereof and a pharmaceutical composition containing the compound can be applied to preparation of drugs for preventing or/and treating cancers; according to the invention, pomalidomide is selected as a part of PROTACs combined with E3 ligase, erlotinib is a targeted EGFR (epidermal growth factor receptor) small molecular compound, and the PROTACs are constructed by connecting the pomalidomide and the erlotinib through a proper connecting chain, and in vitro anti-tumor activity test and in vitro EGFR protein degradation activity show that the compound shows good anti-tumor activity and excellent EGFR protein degradation effectCan be used for preventing or/and treating various cancers, and has great application prospect in the field of medicine.)
技术领域
本发明涉及一种靶向降解EGFR蛋白的化合物及其制备方法和应用。
背景技术
泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome systerm，UPS)是细胞内蛋白质降解的主要途径，参与细胞内80％以上蛋白质的降解，UPS属于一个多步骤反应过程，有多种不同蛋白质参与，蛋白质先被泛素(多肽)标记，然后被蛋白酶体识别和降解。
该系统由泛素、泛素活化酶E1、泛素结合酶E2、泛素连接酶E3、蛋白酶体及其底物(蛋白质)构成。UPS特异性降解蛋白质的过程分两个阶段：(1)蛋白底物泛素化：泛素分子由APP提供能量，被E1激活转移到E2，然后经E3与特异性蛋白底物结合；(2)蛋白底物降解：被泛素化的蛋白分子能够被蛋白酶体识别，并进入蛋白酶体降解成短链的多肽分子。
蛋白水解靶向嵌合分子(Proteolysis Targeting Chimeras，PROTACs)是利用一种双功能小分子将目标蛋白和细胞内的E3拉近，从而导致目标蛋白质的降解。PROTACs包含三部分功能结构：(1)可以与蛋白底物相结合的部分；(2)能够与E3相结合的部分；(3)前两部分的连接链(Linker)。细胞内PROTACs可以同时与靶蛋白及E3结合，使本来不能与E3结合的靶蛋白泛素化，进而被蛋白酶体识别并降解(Angew.Chem.Int.Ed.Engl.,2016,55(6),1996-1973)。
研究证明，泊马度胺可以与CRBN蛋白结合，CRBN蛋白为CUL4-RBX1-DDB1-Cereblon(CRL4CRBN)E3泛素连接酶复合物的底物受体蛋白，结合后通过泛素-蛋白酶体途径进行蛋白水解(Nature,2014,512(7512):49-53)。
当前，在许多实体肿瘤中存在EGFR的高表达或异常表达，EGFR与肿瘤细胞的增殖、血管生成、肿瘤侵袭、转移及细胞凋亡的抑制有关。EGFR的过表达在恶性肿瘤的演变进中起重要作用，胶质细胞、肾癌、肺癌、前列腺癌、胰腺癌、乳腺癌等组织中都有EGFR的过表达。EGFR已成为有效的抗肿瘤靶点，多个EGFR抑制剂已经上市用于多种癌症的治疗。但是目前所用的EGFR抑制剂抑制效果有限，且已存在一定的耐药问题，因此，开发出一种可降解EGFR蛋白的化合物具有极其重要的制药价值。
发明内容
本发明提供了一种基于厄洛替尼靶向泛素化诱导EGFR蛋白降解的化合物及其制备方法和应用，该化合物不仅具有EGFR蛋白降解作用和抗肿瘤活性，且对人体毒副作用小，可用于制备抗肿瘤药物。
本发明的技术方案如下：
一种式(I)所示的靶向泛素化诱导EGFR蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐：
式(I)中，
R为C1～C6烷基、C1～C6烯基、C1～C6炔基、氨基或乙酰胺基；
Linker为C1～C6烷基，或者n＝1～10(优选n＝3～6)。
本发明特别优选如下表1中所示的化合物。
表1
本发明所述的化合物为一种蛋白水解靶向嵌合分子(PROTACs)，其包括可以与EGFR蛋白底物相结合的部分、可以与E3结合的部分以及连接链，利用这种双功能小分子可以将目标蛋白和细胞内的E3拉近，从而使本来不能与E3结合的EGFR靶蛋白泛素化，进而被蛋白酶体识别并降解。
本发明所述式(I)所示的靶向泛素化诱导EGFR蛋白降解的化合物的制备方法为：
将厄洛替尼(II)溶于有机溶剂中，于室温(20～30℃)下加入化合物(III)、五水硫酸铜和维生素C(Vc)，加热至40～90℃反应4～10h，之后经后处理，得到产物(I)；
所述厄洛替尼(II)、化合物(III)、五水硫酸铜、维生素C的物质的量之比为1：1：0.15～0.2：0.3～0.4；
所述有机溶剂为二甲基亚砜(DMSO)，所述有机溶剂的体积用量以厄洛替尼(II)的物质的量计为5～10L/mol；
优选将五水硫酸铜和维生素C溶于水后投料；
所述后处理的方法为：反应结束后，反应液中加入水，乙酸乙酯萃取，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析分离，以二氯甲烷：甲醇体积比为10：1的混合液为洗脱剂，收集含目标化合物的洗脱液，蒸除溶剂并干燥，得到产物(I)；
式(III)中，R、Linker的定义与式(I)中相同。
本发明所述式(I)所示的靶向泛素化诱导EGFR蛋白降解的化合物或其药学上可接受的盐或水合物可应用于制备预防或/和治疗癌症的药物。
本发明通过免疫荧光、免疫印迹分析等实验，证实该小分子化合物可以很好的结合EGFR蛋白，并通过泛素蛋白酶体途径降解EGFR蛋白。
本发明式(I)所示化合物可用于与EGFR蛋白酶活性异常表达相关的疾病中的应用，通过体外活性筛选，发现本发明化合物具有抗肿瘤活性，因此本发明还公开了所述化合物在制备预防或/和治疗癌症的药物中的应用。
所述的癌症为乳腺癌、结肠癌、前列腺癌、胰腺癌、甲状腺乳头状癌、卵巢癌、黑色素瘤、白血病或非小细胞肺癌。优选为非小细胞肺癌，这是由于实验表明该化合物抗非小细胞肺癌活性极高。
本发明化合物可作为唯一的抗癌药物使用，或者与一种或多种其它抗肿瘤药物联合使用。联合治疗通过将各个治疗组分同时，顺序或隔开给药来实现。
此外，本发明还涉及药物组合物，该药物组合物含有式(I)所示化合物或其药学上可接受的盐或水合物和药物上可接受的赋形剂。所述药物上可接受的赋形剂是指任何可用于药物领域的稀释剂、辅助剂和/或载体。
本发明化合物可以与其他活性成分组合使用，只要它们不产生其它不利作用，例如过敏反应。
本发明的药物组合物可配置成若干剂型，其中含有药物领域中常用的一些赋形剂。
具体的剂型例如：口服制剂；可注射的制剂；局部制剂。
口服制剂可为片剂、胶囊剂、溶液或混悬液；注射制剂可为注射溶液或混悬剂，或者可注射的干燥粉末，在注射前加入注射用水可立即使用；局部制剂可为软膏或溶液。
药学上可接受的辅料包括：口服制剂用的粘合剂、润滑剂、崩解剂、助溶剂、稀释剂、稳定剂、悬浮剂、色素或矫味剂；注射制剂用的防腐剂、加溶剂或稳定剂；局部制剂用的基质、稀释剂、润滑剂、防腐剂等。
药物制剂可以经口服或胃肠外方式(如静脉内、皮下、腹膜内或局部)给药，如果某些药物在胃部条件下是不稳定的，可将其配制成肠衣片剂。
与现有技术相比，本发明具有以下有益效果：
本发明选用泊马度胺作为PROTACs中与E3连接酶进行结合的部位，厄洛替尼为靶向EGFR小分子化合物，选用合适的连接链将两者相连接构建PROTACs。体外抗肿瘤活性测试及体外EGFR蛋白降解活性表明，本发明化合物表现出了良好的抗肿瘤活性，并表现出优异的EGFR蛋白降解作用，可用于预防或/和治疗多种癌症，在医药领域具有巨大的应用前景。
附图说明
图1PROTACs技术原理示意图。
图2实施例2得到的化合物ALP-1的核磁谱图。
图3实施例3得到的化合物ALP-2的核磁谱图。
图4实施例4得到的化合物ALP-3的核磁谱图。
图5实施例5中ALP-2和ALP-3不同浓度下EGFR蛋白降解情况。
具体实施方式
下面通过具体实施例进一步描述本发明，但本发明的保护范围并不仅限于此。
本发明中涉及的缩写词意义为：Boc为叔丁氧羰基，DMF为二甲基甲酰胺，DIPEA为二异丙基乙胺，TBAB为四丁基溴化铵，EA为乙酸乙酯，Et为乙基，Me为甲基，M即摩尔，PE为石油醚，Ph为苯基，THF为四氢呋喃，TFA为三氟乙酸，TLC为薄层色谱，NSCLC为非小细胞肺癌，WT为野生型。
下面的合成路线描述了本发明通式(I)化合物的制备，所有的原料都是通过这些路线中描述的方法、通过有机化学领域普通技术人员熟知的方法制备的或者可商购。本发明的全部最终化合物都是通过这些路线中描述的方法或通过与其类似的方法制备的，这些方法是有机化学领域普通技术人员熟知的。这些路线中应用的全部可变因数如下文的定义或如权利要求中的定义。
实施例1：E3配体小分子化合物的制备(化合物6)
化合物6a的制备：
将化合物1a(100mmol)(n＝1)溶于30mL DCM中，加入Et3N(200mmol)，将TsCl(140mmol)溶于70mL DCM中，在冰浴条件下滴入反应液。过夜反应后，TLC检测(PE:EA＝1:2)原料反应完全，产物Rf＝0.3。将反应液抽滤，用少量DCM洗涤滤饼，滤液用6N盐酸调节pH至中性，加适量水，用DCM萃取水相两次，合并有机相，减压浓缩，柱层析分离后得到化合物2a，产率40.7％。
将所得化合物2a溶于100mL DMF中，常温下加入NaN3(100mmol)，油浴温度100℃条件下反应。反应4h后，TLC检测(PE:EA＝1:2)碘显，原料反应完全，产物Rf＝0.6。加入大量水，用EA萃取水相4次，合并有机相后，用饱和食盐水洗涤有机相2次，减压浓缩，过柱纯化，得到化合物3a，产率92.1％。
将NaH(10.2mmol)置于50mL圆底烧瓶中，置换N2后，冰浴下加入化合物3a(5mmol)的4mL THF溶液，反应半小时。撤去冰浴，室温下加入溴乙酸叔丁酯，室温下反应6h，TLC检测(PE:EA＝2:1)反应完全，产物Rf＝0.5。加水淬灭反应，EA萃取水相三次，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析分离，得到化合物4a，产率60.1％。
将化合物4a(2.5mmol)溶于甲醇(4.2mL)，将氢氧化钠固体(6.2mmol)溶于水(4.2mL)后加入反应液。过夜反应后，TLC检测(PE:EA＝1:1)原料反应完全，将3.0mol/L盐酸调pH＝3～4，二氯甲烷萃取，减压浓缩。向此浓缩物中滴加草酰氯(7mmol)。反应30min，减压除去草酰氯，加入4mL DMF和泊马度胺(1.1mmol)，于90℃油浴下反应20min，TLC检测(PE:EA＝1:2)，原料反应完全，产物Rf＝0.4。加水，EA萃取，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析纯化，得化合物6a，产率62％。
1H NMR(500MHz,DMSO)δ11.18(s,1H),10.36(s,1H),8.73(d,J＝8.4Hz,1H),7.98–7.77(m,1H),7.63(d,J＝7.3Hz,1H),5.17(dd,J＝12.9,5.4Hz,1H),4.21(s,2H),3.77(dd,J＝5.8,3.4Hz,2H),3.69(dd,J＝5.7,3.5Hz,2H),3.62–3.45(m,6H),3.35(d,J＝5.7Hz,2H),2.91(ddd,J＝17.1,13.9,5.4Hz,1H),2.69–2.58(m,1H),2.57–2.47(m,1H),2.09(ddd,J＝10.4,5.3,3.1Hz,1H).
化合物6b的制备：
依照化合物6a的制备方法将起始化合物2a改用化合物2b(100mmol)(n＝2)，其余合成步骤及反应条件相同，得化合物6b，产率为66％。
1H NMR(500MHz,DMSO)δ11.18(s,1H),10.37(s,1H),8.73(d,J＝8.4Hz,1H),7.95–7.82(m,1H),7.64(d,J＝7.2Hz,1H),5.18(dd,J＝12.9,5.4Hz,1H),4.21(s,2H),3.77(dd,J＝5.7,3.5Hz,2H),3.68(dd,J＝5.6,3.6Hz,2H),3.61–3.47(m,14H),3.42–3.37(m,2H),2.91(ddd,J＝17.1,14.0,5.4Hz,1H),2.60(dd,J＝19.8,11.2Hz,1H),2.55–2.45(m,1H),2.09(ddd,J＝10.3,5.2,3.0Hz,1H).
化合物6c的制备：
依照化合物6a的制备方法将起始化合物2a改用化合物2c(100mmol)(n＝3)，其余合成步骤及反应条件相同，得化合物6c，产率为64％。
1H NMR(500MHz,DMSO)δ11.17(s,1H),10.37(s,1H),8.73(d,J＝8.4Hz,1H),7.91–7.83(m,1H),7.64(d,J＝7.2Hz,1H),5.17(dd,J＝12.9,5.4Hz,1H),4.21(s,2H),3.77(dd,J＝5.7,3.5Hz,2H),3.68(dd,J＝5.6,3.6Hz,2H),3.59(dd,J＝6.5,3.4Hz,2H),3.57–3.47(m,16H),3.40–3.37(m,2H),2.89(s,1H),2.66–2.58(m,1H),2.55(dd,J＝13.5,4.4Hz,1H),2.09(d,J＝5.4Hz,1H).
实施例2：PROTACs化合物ALP-1的制备
将实施例1制得的化合物6a(0.11mmol)，厄洛替尼7(0.11mmol)溶于1mL DMSO中，开启搅拌。将五水硫酸铜(0.02mmol)，维生素C(0.04mmol)溶于0.5mL水加入反应体系，50℃反应4h。TLC检测(EA:MeOH＝10:1)原料反应完全。加入水，EA萃取，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析分离，得化合物ALP-1，产率70％。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ11.19(s,1H),10.29(s,1H),9.61(s,1H),8.67(d,J＝8.4Hz,1H),8.52(s,1H),8.47(s,1H),8.30(s,1H),7.95(s,1H),7.88(d,J＝8.1Hz,1H),7.84–7.77(m,1H),7.58(d,J＝7.2Hz,1H),7.53(d,J＝7.7Hz,1H),7.43(t,J＝7.9Hz,1H),7.20(s,1H),5.15(dd,J＝12.9,5.4Hz,1H),4.58(t,J＝5.1Hz,2H),4.30(dt,J＝16.6,4.6Hz,4H),4.13(s,2H),3.86(t,J＝5.2Hz,2H),3.82–3.73(m,4H),3.69(dd,J＝5.8,3.3Hz,2H),3.62(dd,J＝5.8,3.3Hz,2H),3.59–3.52(m,4H),3.36(s,6H),2.90(ddd,J＝17.3,14.0,5.4Hz,1H),2.55(s,2H),2.12–2.05(m,1H).
实施例3：PROTACs化合物ALP-2的制备
将实施例1制得的化合物6b(0.35mmol)，厄洛替尼7(0.35mmol)溶于2mL DMSO中，开启搅拌。将五水硫酸铜(0.06mmol)，维生素C(0.14mmol)溶于2mL水加入反应体系，50℃反应5h。TLC检测(EA:MeOH＝10:1)原料反应完全，加入水，EA萃取，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析分离，得化合物ALP-2，产率72％。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ11.18(s,1H),10.33(s,1H),9.60(s,1H),8.70(d,J＝8.4Hz,1H),8.54(s,1H),8.47(s,1H),8.28(s,1H),7.95(s,1H),7.90(d,J＝8.0Hz,1H),7.87–7.82(m,1H),7.61(d,J＝7.3Hz,1H),7.54(d,J＝7.7Hz,1H),7.45(t,J＝7.9Hz,1H),7.22(s,1H),5.16(dd,J＝12.9,5.4Hz,1H),4.59(t,J＝5.1Hz,2H),4.30(dt,J＝14.2,4.5Hz,4H),4.17(s,2H),3.88(t,J＝5.2Hz,2H),3.81–3.70(m,6H),3.61(dd,J＝5.6,3.6Hz,2H),3.56–3.47(m,8H),3.43(t,J＝4.2Hz,6H),2.89(ddd,J＝18.3,13.9,5.3Hz,2H),2.61(dd,J＝15.2,2.4Hz,1H),2.11–1.95(m,2H).
实施例4：PROTACs化合物ALP-3的制备
将实施例1制得的化合物6c(0.25mmol)、厄洛替尼7(0.25mmol)溶于2mL DMSO中，开启搅拌。将五水硫酸铜(0.05mmol)，维生素C(0.10mmol)溶于2mL水加入反应体系，50℃反应7h。TLC检测(EA:MeOH＝10:1)原料反应完全，加入水，EA萃取，合并有机相，饱和食盐水洗涤，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，柱层析分离，得化合物ALP-3，产率76％。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.34(s,1H),9.77(s,1H),8.73–8.68(m,1H),8.54(s,1H),8.47(s,1H),8.31(s,1H),8.02(s,1H),7.91(d,J＝9.1Hz,1H),7.88–7.82(m,1H),7.62(d,J＝7.2Hz,1H),7.54(d,J＝7.7Hz,1H),7.44(t,J＝7.9Hz,1H),7.21(s,1H),5.19–5.14(m,2H),4.76(dt,J＝6.6,3.3Hz,2H),4.59(t,J＝5.1Hz,2H),4.34–4.31(m,2H),4.30–4.27(m,2H),4.18(s,2H),3.80–3.72(m,12H),3.65–3.62(m,4H),3.56–3.54(m,2H),3.52–3.47(m,6H),3.41(s,6H),2.91–2.85(m,1H),2.64–2.61(m,2H),2.08(ddd,J＝10.3,5.2,3.0Hz,1H).
实施例5：活性测定
(1)MTT法测定PROTACs化合物对肿瘤细胞增殖抑制活性
本次活性筛选研究主要涉及以下几种非小细胞肺癌细胞株，其名称及特点如下表2所示：
表2非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系种类及突变位点
将处于对数生长期的肿瘤细胞(H1975、PC9、PC9-IR、HCC827)分别以5×103、5×103、5×103、1.5×103个细胞接种于96孔板，培育24h，加入不同浓度PROTACs化合物后，细胞在37℃、5％CO2条件下继续培养72小时，每孔加入20uL MTT(5mg/mL)溶液继续培养4小时，用DMSO溶解结晶，用酶联免疫检测仪在490nm波长处测定其OD值并计算IC50，具体结果如下表3所示，化合物ALP-2和ALP-3均具有较好的抑瘤活性，尤其是对PC9细胞株，其IC50值分别为4.69μmol·L-1和4.36μmol·L-1.。
表3化合物ALP-1～ALP-3对不同NSCLC细胞系的生长抑制作用
(2)Western Blot测定EGFR蛋白降解作用
ALP-2和ALP-3化合物处理PC9细胞48h后，用预冷的PBS洗涤2次，加入适量含1×PMSF和1×cOmplete的RIPA裂解液收集细胞，冰上裂解细胞30min后，4℃，12000r/min，30min离心，取上清，即细胞总蛋白。用BCA法定量检测蛋白量，用5×蛋白上样缓冲液稀释蛋白后100℃变性5min。蛋白在SDS—PAGE电泳分离，转膜，封闭2h，一抗4℃孵育过夜。TBST洗膜，二抗1:2000孵育2h，洗膜，化学发光后显影。
实验结果表明(图5)，ALP-2和ALP-3均能降解EGFR蛋白，其中化合物ALP-3具有较佳的降解效果。
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