本发明公开了一种集杀菌运输于一体的胶囊输送系统,涉及胶囊输送技术领域,包括底板,所述底板的顶部设置有消毒箱,所述消毒箱的两侧均开设有输送槽,该集杀菌运输于一体的胶囊输送系统,通过设置有传动齿轮、第一转辊与第二转辊,在输送台移动的同时,位于输送辊上方的输送台一侧设置的传动齿轮在第一齿条的作用力下,传动齿轮转动,使得第一转辊转动,进而使得第一转辊通过第一传动皮带带动第二皮带轮转动,使得第二转辊转动,使得第一转辊与第二转辊同步向一个方向转动,从而使得胶囊旋转,从而使得胶囊在消毒箱内部移动的过程中,紫外线灯能够对胶囊全方位进行照射消毒杀菌,使得胶囊的外侧均能够进行消毒杀菌。