本发明提供一种生物柴油的酶催化反应装置及酶催化反应方法。反应装置包括依次相连的N个反应罐,原料油进料管路、碱液进料管路、酶进料管路、软水进料管路和甲醇进料管路;N为大于0的整数;反应罐包括罐体,设置在罐体上的进料口和出料口;第一个反应罐的进料口的外部连接有外部进料总管,反应罐的进料口的内部连接内部进料总管,内部进料总管连接进料分布管,通过进料分布管连接有若干个物料喷射器。混合物料经外部进料总管进入罐体,并经物料喷射器进行循环喷射反应。本发明的生物柴油的酶催化反应装置和反应方法,可有效实现生物柴油的连续式反应生产。不仅原料油的转化率明显增加,能耗显著减少,而且装置的反应能力大。