本发明提供了一种FeS纳米复合材料的制备方法。与现有技术相比,本发明利用异化金属还原菌以有机物为代谢底物,产生电子后以水溶性含硫化合物和三价铁盐为电子受体,经生物还原产生的Fe~(2+)与S~(2-)结合形成FeS纳米颗粒,锚定在细胞表面的FeS纳米颗粒与细菌耦合形成细菌-纳米材料杂合体,大量聚集在胞外的FeS纳米颗粒在有效去除重金属的同时,还缓解了重金属离子对细菌细胞的毒害作用;纳米FeS引起良好的导电性进一步增强了细菌的胞外电子传递能力,强化了细菌对重金属的胞外还原和对FeS的再生,同时纳米FeS与重金属反应后的产物也为细菌再次合成纳米FeS提供了电子受体,可实现纳米FeS的循环再生。