阅读说明：本技术 用于改良植物性状的方法及组合物 (Methods and compositions for improving plant traits ) 是由 卡斯滕·泰米 阿尔文·塔姆希尔 莎拉·布洛赫 罗斯玛丽·克拉克 艾米丽·董 凯文·哈米尔 于 2018-01-12 设计创作，主要内容包括：提供了用于产生和利用包含至少一种基因工程细菌菌株的细菌组合物的方法和系统,所述细菌菌株在已经用每英亩超过20磅氮施肥的农业系统中固定大气氮。(Methods and systems are provided for producing and utilizing bacterial compositions comprising at least one genetically engineered bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen in an agricultural system that has been fertilized with more than 20 pounds of nitrogen per acre.)

用于改良植物性状的方法及组合物

交叉引用

本申请要求2017年1月12日提交的美国临时申请62/445,570、2017年1月12日提交的美国临时申请62/445,557、2017年1月18日提交的美国临时申请62/447,889、2017年3月3日提交的美国临时申请62/467,032、2017年9月29日提交的美国临时申请62/566,199、2017年10月25日提交的美国临时申请62/577,147的权益，这些申请均通过引用并入本文。

关于序列表的声明

本申请包含序列表，该序列表已经以ASCII格式通过电子方式提交，并且通过引用整体并入本文。所述ASCII副本创建于2018年1月3日，命名为47736-707_601_SL.txt，大小约为599kb。

关于联邦资助研究的声明

本发明是基于国家科学基金会授予的SBIR基金1520545，在美国政府的支持下完成的。政府对所公开的主题享有一定的权利。

背景技术

植物通过共享的代谢物组与微生物组相联系。特定作物性状与潜在代谢物组之间的多维关系的特征在于具有许多局部极大值的景象。由于多种原因，如作物优化，可能需要通过改变微生物组对代谢物组的影响来将较差局部极大值优化到另一个代表较佳性状的局部极大值。为了满足日益增长的全球人口的需求，需要经济、环境及社会均可持续的农业和粮食生产方法。***粮农组织(he United Nations’Food and AgricultureOrganization)预计，到2050年，粮食总产量必须增加70％才能满足日益增长的人口需求，而这一挑战又因许多因素而加剧，包括淡水资源减少、对耕地的竞争加剧、能源价格上涨，投入成本增加，以及可能需要作物能够适应更干燥、更炎热以及更极端的全球气候的压力。

一个值得关注的领域是固氮的改善。氮气(N₂)是地球大气的主要组成部分。另外，元素氮(N)是构成活生物体的许多化学化合物的重要组成部分。然而，许多生物体不能直接利用N₂合成诸如生长和繁殖等生理过程中使用的化学物质。为了利用N₂，N₂必须与氢组合。氢与N₂的组合被称为固氮。无论是以化学方式还是以生物学方式完成，固氮都需要投入大量的能量。在生物系统中，被称为固氮酶的酶催化导致固氮的反应。固氮研究的一个重要目标是将这种表型扩展到非豆科植物，特别是诸如小麦、稻和玉米等重要的农业禾本科植物。尽管在了解根瘤菌与豆科植物之间的固氮共生关系的发展方面取得了巨大进展，但是利用这一知识在非豆科作物上诱导固氮结节的途径尚不清楚。同时，随着日益增长的对增加粮食生产的需求，例如在肥料中提供充足的补充氮源的挑战将继续增加。

发明内容

本发明的一个方面提供了一种包含至少一种基因工程细菌菌株的细菌组合物，所述细菌菌株在已经用每英亩超过20磅氮施肥的农业系统中固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种包含至少一种基因工程细菌菌株的细菌组合物，所述细菌菌株已被培育为在已经用每英亩超过20磅氮施肥的农业系统中固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种包含至少一种固定大气氮的基因工程细菌菌株的细菌组合物，所述至少一种基因工程细菌菌株包含外源添加的DNA，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株具有至少80％的同一性。

本发明的另一方面提供了一种种子组合物，其包含接种有细菌组合物的植物种子。

本发明的另一方面提供了使用多个种子种植作物的方法，所述种子具有接种有细菌组合物的种子组合物。

本发明的另一方面提供了一种将细菌组合物施加至田间的方法。

本发明的另一方面提供了一种包含细菌组合物的肥料组合物。

本发明的另一方面提供了一种维持土壤氮水平的方法。该方法包括在田间土壤中种植以固定大气氮的基因工程细菌接种的作物。该方法还包括收获所述作物，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过90％。

本发明的另一方面提供了一种向作物植物递送益生菌补充剂的方法。该方法包括用种子包衣、种子处理物或种衣剂(seed dressing)涂覆作物种子。所述种子包衣、种衣剂或种子处理物包含所述益生菌的活体代表。另外，该方法包括在田间土壤中施加所述作物种子。

在本发明的另一方面，所述基因工程细菌菌株是基因工程***菌株。在一些情况下，该基因工程***菌株具有改变的Nif簇调节物的表达水平。在一些情况下，该基因工程***菌株表达减少量的Nif簇的负调节物。在一些情况下，该基因工程细菌菌株表达减少量的GlnR。在一些情况下，该基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。在一些情况下，该基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。在一些情况下，该基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。在一些情况下，该基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中的固氮的方法。该方法包括向植物施加多种非属间细菌，所述多种非属间细菌包含以下非属间细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。另外，植物中(in planta)的所述多种非属间细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。此外，所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中的固氮的方法。该方法包括向植物施加多种非属间细菌，所述多种非属间细菌包含以下非属间细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。另外，植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。此外，所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种培育微生物菌株以改良农艺相关性的特定性状的方法。该方法包括提供具有定植于所需作物的能力的多种微生物菌株。该方法还包括通过基因组内重排来改良影响该性状的调节网络。此外，该方法包括评估所述多种微生物菌株内的微生物菌株，以确定该性状的量度。另外，该方法包括选择所述多种微生物菌株中的一种或多种微生物菌株，其在所需作物的存在下产生性状的改良。

本发明的另一方面提供了一种培育微生物菌株以改良农艺相关性的特定性状的方法。该方法包括提供具有定植于所需作物的能力的多种微生物菌株。该方法还包括将遗传多样性引入所述多种微生物菌株中。另外，该方法包括评估所述多种微生物菌株内的微生物菌株，以确定该性状的量度。此外，该方法包括选择所述多种微生物菌株中的一种或多种微生物菌株，其在所需作物的存在下产生性状的改良。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述非豆科植物暴露于工程化非属间微生物，所述工程化非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异或至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

本发明的另一方面提供了一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述玉米植物暴露于工程化非属间微生物，所述微生物在选自nifL、glnB、glnE和amtB的至少两种基因内包含工程化遗传变异。

本发明的另一方面提供了一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述玉米植物暴露于工程化非属间微生物，所述微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异，其中如通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N所测量的，植物中的所述工程化非属间微生物在所述玉米植物中产生至少5％的固定氮。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中的固氮的方法。该方法包括向该植物施加多种非属间细菌，所述多种非属间细菌包含以下非属间细菌，其：(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。另外，(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-8mmol N。此外，植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。另外，所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中的固氮的方法。该方法包括向该植物施加多种细菌，所述多种细菌包含以下细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。另外，植物中的所述多种细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。

本发明的另一方面提供了一种能够增加非豆科植物中的固氮的非属间细菌群体，其包含多种非属间细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^{- 17}mmol N的固定N。另外，植物中的所述多种非属间细菌在所述多种非属间细菌的存在下生长的植物中产生1％或更多的固定氮。此外，所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

本发明的另一方面提供了一种能够增加非豆科植物中的固氮的细菌群体，该细菌群体包含多种细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。另外，植物中的所述多种细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。

在本发明的另一方面，提供了一种细菌，其(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

在本发明的另一方面，提供了一种非属间细菌，其包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮，并且其中所述细菌(i)具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且/或者(ii)每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

在本发明的另一个方面，提供了一种增加植物中的固氮的方法，其包括向该植物施用有效量的组合物，该组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269、277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列的细菌；纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276、284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌；和/或纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌；并且其中与未施用该组合物的植物相比，施用有效量的该组合物的植物表现出固氮的增加。

本发明的另一方面提供了一种分离的细菌，其包含与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269、277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列；与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276、284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列；和/或与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列。

本发明的另一方面提供了一种检测非天然连接序列的方法，其包括：扩增与SEQID NO：372-405共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列。

本发明的另一方面提供了一种检测非天然连接序列的方法，其包括：扩增与SEQID NO：372-405中包含的至少10个连续碱基对片段共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列，所述连续碱基对片段由以下序列的交叉点处的核苷酸组成：包含SEQ ID NO：304-337的上游序列和包含SEQ ID NO：338-371的下游序列。

本发明的另一方面提供了一种非天然连接序列，其包含与SEQ ID NO：372-405共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列。

本发明的另一方面提供了一种非天然连接序列，其包含与SEQ ID NO：372-405中包含的至少10个连续碱基对片段共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列，所述连续碱基对片段由以下序列的交叉点处的核苷酸组成：包含SEQ ID NO：304-337的上游序列和包含SEQ ID NO：338-371的下游序列。

本发明的另一方面提供了一种细菌组合物，其包含至少一种固定大气氮的重塑细菌菌株，所述至少一种重塑细菌菌株包含外源添加的DNA，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少80％的同一性。

本发明的另一方面提供了一种维持土壤氮水平的方法。该方法包括在田间土壤中种植以固定大气氮的重塑细菌接种的作物。该方法还包括收获所述作物，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过90％。

本发明的另一方面提供了一种向作物植物递送益生菌补充剂的方法。该方法包括用种子包衣、种子处理物或种衣剂涂覆作物种子，其中所述种子包衣、种衣剂或种子处理物包含所述益生菌的活体代表。该方法还包括在田间土壤中施加所述作物种子。

本发明的另一方面提供了一种增加非豆科植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述非豆科植物暴露于重塑的非属间微生物，所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异或至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

本发明的另一方面提供了一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述玉米植物暴露于重塑的非属间微生物，所述微生物在选自nifL、glnB、glnE和amtB的至少两种基因内包含重塑的遗传变异。

本发明的另一方面提供了一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法。该方法包括将所述玉米植物暴露于重塑的非属间微生物，所述微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异，其中如通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N所测量的，植物中的所述重塑的非属间微生物在所述玉米植物中产生至少5％的固定氮。

本发明的其它方面提供了针对在非豆科作物中进行植物中固氮而进化和优化的微生物属。特别地，公开了增加非豆科植物中的固氮的方法。所述方法可包括将所述植物暴露于多种细菌。所述多种细菌的每个成员包含一个或多个引入细菌固氮或氮同化遗传调节网络的一个或多个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。所述细菌不是属间微生物。另外，植物中的细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。

本发明的其它方面提供了有益的分离的微生物和微生物组合物。特别地，提供了分离的和生物学纯的微生物，其尤其在增加作物中的固氮方面具有应用。所公开的微生物可以以其分离的和生物学纯的状态使用，以及配制成组合物。此外，本公开提供了含有所公开的微生物的至少两个成员的微生物组合物，以及利用所述微生物组合物的方法。

援引并入

本说明书中提到的所有出版物、专利及专利申请均通过引用并入本文，其程度如同特别地且单独地指出每个单独的出版物、专利或专利申请均通过引用而并入。

附图说明

本发明的新颖特征在所附权利要求书中具体阐述。通过参考以下对利用到本发明原理的说明性实施方案加以阐述的详细描述以及附图，将会对本发明的特征和优点获得更好的理解，在附图中：

图1A-B描绘了固氮细菌的富集和分离。(A)用Nfb琼脂板分离固氮细菌的单菌落。(B)在Balch管中浇注的半固体Nfb琼脂。箭头指向富含固氮细菌的薄膜。

图2描绘了代表性的nifH PCR筛选。在该筛选中，在～350bp处观察到两个菌落的阳性条带。处于下方的条带代表引物二聚体。

图3描绘了来自CRISPR-Cas选择诱变的菌落的PCR筛选的实例。用nifL基因座特异性引物筛选CI006菌落。预期野生型PCR产物约为2.2kb，而预期突变体约为1.1kb。筛选出的10个菌落中有7个明确地显示出所需的缺失。

图4A-D描绘了各个菌株的体外表型。在补充有0至10mM谷氨酰胺的固氮培养基中生长的菌株CI010的突变体(图4A)和菌株CI006的突变体(图4B)的乙炔还原试验(ARA)活性。其它菌株的ARA活性示于图4C中，并且两种菌株随时间的铵排出曲线示于图4D中。

图5描绘了参与重氮营养(diazaotrophic)固氮的菌株CI006中9种不同基因的培养表达谱。数字代表每个转录物的计数。示出了各种条件(0mM、1mM、10mM谷氨酰胺和N₂中0％、10％、20％的大气)。

图6描绘了玉米根部的CI006定植。用带有RFP表达质粒的CI006接种玉米幼苗。通过用合适的抗生素浇灌进行生长和质粒维持两周后，收获根并通过荧光显微术成像。观察根细胞间隙的定植。

图7描绘了来源于WT(CI050)和优化(CM002)菌株中微生物水平的氮。

图8示出了用于Micro-Tom果实质量测定的实验装置。

图9示出了用于增加Micro-Tom植物果实质量的10个菌株的筛选。展示了六个重复的结果。对于第3列，p＝0.07。对于第7列，p＝0.05。

图10A-C描绘了在补充有0至10mM谷氨酰胺的固氮培养基中生长的候选微生物和对应候选突变体的ARA活性的另外结果。

图11描绘了显示比其来源的单突变体更高的氨排出的双突变体。

图12描绘了从15N气体摄取实验获得的NDFA(使用暴露的天数外推)以测量施肥条件下玉米植物中的NDFA。

图13描绘了从15N气体摄取实验获得的NDFA值(使用暴露的天数外推)以测量施肥条件下狗尾草属植物中的NDFA。

图14A描绘了15N气体的掺入率。与未接种的植物相比，接种了进化菌株的植物显示15N气体掺入增加。

图14B描绘了在种植后4周，接种了进化菌株的植物中高达7％的氮源自微生物固氮。

图14C描绘了与未接种或野生型接种的植物相比，在接种了进化菌株的植物中叶面积(和其它生物质测量值，数据未示出)增加。

图15A描绘了通过在植物中转录物组研究中测量的，在根组织中显示出明显更高的nifH产量的进化菌株。

图15B描绘了在植物组织中发现的固氮速率与特定植物被HoME优化菌株定植的速率相关。

图16A描绘了测试定植的各个田间土壤的土壤质地图。一些微生物最初来源的土壤以星号指示。

图16B描绘了在四种不同的土壤类型(圆圈)中测试的菌株1和菌株5的定植率。两种菌株在不同的土壤类型中均显示出相对稳健的定植谱。

图16C描绘了在生长季节跨度上在田间试验中测试的菌株1的定植。菌株1在玉米组织中保持至种植后第12周，并且在那之后开始显示出定植下降。

图17A描绘了根据实施方案的微生物育种的示意图。

图17B描绘了如图17A中所示的微生物组组成的测量的展开图。

图17C描绘了实施例7中使用的根的采样。

图18描绘了衍生自菌株CI006的修饰菌株的谱系。

图19描绘了衍生自菌株CI019的修饰菌株的谱系。

图20描绘了本公开的微生物每英亩-季节递送的氮的磅数的热图，其被记录为每g-鲜重的微生物相对于mmol氮/微生物-hr的函数。横切较大图像的细线下方是每英亩-季节递送不到一磅氮的微生物，而在线的上方是每英亩-季节递送超过一磅氮的微生物。热图下方的表格给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及热图中显示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。测定热图中使用的微生物在玉米中的N产生。对于WT菌株CI006和CI019，玉米根定植数据取自单个田间地点。对于其余的菌株，假定定植与WT田间水平相同。在5mM谷氨酰胺的存在下使用体外ARA试验测定N-固定活性。

图21描绘了暴露于菌株CI006的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率(win rate)。

图22描绘了暴露于菌株CM029的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图23描绘了暴露于菌株CM038的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图24描绘了暴露于菌株CI019的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图25描绘了暴露于菌株CM081的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图26描绘了暴露于菌株CM029和CM081的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图27描绘了作为合计蒲式耳增加/损失的植物的植物产率。圆的面积对应于相对产率，而阴影对应于特定的MRTN处理。x轴是p值，y轴是成功率。

图28A-28E示出了在类似于高硝酸盐农业土壤的条件下在体外固定并排出氮的衍生微生物。图28A示出了PBC6.1中控制固氮和氮同化的调节网络，包括被描绘为双结构域ATase-AR酶的关键节点NifL、NifA、GS、GlnE和AmtB。图28B示出了Kosakonia sacchari分离株PBC6.1的基因组。围绕基因组的三条轨道分别传递来自PBC6.1、PBC6.38的转录数据和菌株之间的差异表达。图28C示出了固氮基因簇和转录数据，将其放大以获得更精细的细节。图28D示出了用乙炔还原试验测量不同浓度的外源氮下的固氮酶活性。随着谷氨酰胺浓度增加，野生型菌株表现出对固氮酶活性的抑制，而衍生菌株显示出不同程度的稳健性。误差条代表至少三次生物学重复的平均值的标准误差。图28E示出了在mM浓度下观察到衍生菌株的氨的暂时排出。未观察到野生型菌株排出固定氮，并且在培养基中积累的氨可忽略不计。误差条代表平均值的标准误差。

图29A-29C示出了温室实验，证明了玉米中的微生物固氮。图29A示出了以PBC6.1衍生菌株接种玉米植物六周后的微生物定植。误差条显示至少八次生物学重复的平均值的标准误差。图29B示出了通过从根中提取总RNA并随后进行Nanostring分析而测量的nifH的植物中转录。只有衍生菌株在根环境中显示nifH转录。误差条显示至少3次生物学重复的平均值的标准误差。图29C示出了通过在植物组织中稀释同位素示踪剂而测量的微生物固氮。衍生微生物表现出固定氮向植物中的大量转移。误差条显示至少十次生物学重复的平均值的标准误差。

图30示出了在玉米根中PBC6.1定植到根相关微生物群的接近21％的丰度。丰度数据基于接种PBC6.1并在温室条件下生长的玉米植物的根际和内生物的16S扩增子测序。

图31示出了与乙炔还原率相关的PBC6.1衍生菌株中nifA的转录率。如方法部分中所述进行ARA试验，之后对培养物采样，并进行qPCR分析以确定nifA转录物水平。误差条显示每个测量中至少三次生物学重复的平均值的标准误差。

图32示出了2017年夏季田间测试实验的结果。获得的产率结果表明，本公开的微生物可以充当潜在的肥料替代品。例如，利用本公开的微生物(即6-403)导致比野生型菌株(WT)更高的产率和比未处理的对照(UTC)更高的产率。“-25lbs N”处理比每个地区的标准农业实践使用每英亩少25磅的氮。“100％N”UTC处理旨在描述该地区的标准农业实践，其中100％的标准N利用由农民部署。微生物“6-403”以NCMA 201708004保藏并且可以在表A中找到。这是突变Kosakonia sacchari(也称为CM037)，并且是来自CI006 WT的后代突变株。

图33示出了2017年夏季田间测试实验的结果。获得的产率结果表明，本公开的微生物在不同的地点表现一致。此外，产率结果表明，本公开的微生物在氮胁迫环境以及具有足够氮供应的环境中都表现良好。微生物“6-881”(也称为CM094、PBC6.94)是来自CI006 WT的后代突变Kosakonia sacchari菌株，以NCMA 201708002保藏，并且可以在表A中找到。微生物“137-1034”是来自CI137 WT的后代突变变栖克雷伯氏菌菌株，以NCMA 201712001保藏，可以在表A中找到。微生物“137-1036”是来自CI137 WT的后代突变变栖克雷伯氏菌菌株，以NCMA 201712002保藏，并且可以在表A中找到。微生物“6-404”(也称为CM38、PBC6.38)是来自CI006 WT的后代突变Kosakonia sacchari菌株，以NCMA 201708003保藏，并且可以在表A中找到。“养分胁迫”条件对应于0％氮方案。“充足肥料”条件对应于100％氮状态。

图34描绘了衍生自菌株CI006(也称为“6”，Kosakonia sacchari WT)的修饰菌株的谱系。

图35描绘了衍生自菌株CI019(也称为“19”，水生拉恩氏菌WT)的修饰菌株的谱系。

图36描绘了衍生自菌株CI137(也称为(“137”，变栖克雷伯氏菌WT)的修饰菌株的谱系。

图37描绘了衍生自菌株1021(Kosakonia pseudosacchari WT)的修饰菌株的谱系。

图38描绘了衍生自菌株910(Kluyvera intermedia WT)的修饰菌株的谱系。

图39描绘了衍生自菌株63(水生拉恩氏菌WT)的修饰菌株的谱系。

图40描绘了本公开的微生物每英亩-季节递送的氮的磅数的热图，其被记录为每g-鲜重的微生物相对于mmol氮/微生物-hr的函数。横切较大图像的细线下方是每英亩-季节递送不到一磅氮的微生物，而在线的上方是每英亩-季节递送超过一磅氮的微生物。实施例12中的表C给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及热图中显示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。图40中的数据来源于在田间条件下测定玉米中的N产量的微生物菌株。每个点代表由微生物产生的lb N/英亩，其利用来自单个田间地点的玉米根定植数据。在谷氨酰胺或磷酸铵形式的5mM N的存在下使用体外ARA试验测定N-固定活性。

图41描绘了本公开的微生物每英亩-季节递送的氮的磅数的热图，其被记录为每g-鲜重的微生物相对于mmol氮/微生物-hr的函数。横切较大图像的细线下方是每英亩-季节递送不到一磅氮的微生物，而在线的上方是每英亩-季节递送超过一磅氮的微生物。实施例12中的表D给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及热图中显示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。图41中的数据来源于在实验室和温室条件下测定玉米中的N产量的微生物菌株。每个点代表由单个菌株产生的lb N/英亩。白点代表在温室条件下收集玉米根定植数据的菌株。黑点代表玉米根定植水平来源于野生型亲本菌株的平均田间根定植水平的突变菌株。带阴影线的点代表处于其平均田间玉米根定植水平的野生型亲本菌株。在所有情况下，在谷氨酰胺或磷酸铵形式的5mM N的存在下通过体外ARA试验测定N-固定活性。

具体实施方式

虽然本文已经显示并描述了本发明的各种实施方案，但是对于本领域技术人员显而易见的是，这些实施方案仅以举例的方式提供。在不脱离本发明的情况下，本领域技术人员可以想到许多变化、改变和替换。应当理解，可以采用本文所述的本发明实施方案的各种替代方案。

肥料利用率的提高带来了环境问题，而且全球许多承受经济压力的地区也可能无法实施。此外，微生物领域的许多行业参与者都致力于创造属间微生物。然而，对被表征/分类为属间的工程微生物存在严重的监管负担。这些属间微生物不仅面临更高的监管负担，使得广泛采用和实施变得困难，而且它们还面临着大量公众所知的审查。

目前，市场上没有能够增加非豆科作物的固氮作用的非属间工程微生物。这类微生物的缺乏是帮助开创真正环境友好且更具可持续性的21世纪农业系统中所缺失的一个环节。

本公开内容解决了上述问题，并提供了已被工程化为易于在作物中固定氮的非属间微生物。这些微生物没有被表征/分类为属间微生物，因此不会面临严格的监管负担。此外，所教导的非属间微生物将有助于帮助21世纪的农民减少对利用不断增加用量的外源氮肥的依赖。

定义

术语“多核苷酸”、“核苷酸”、“核苷酸序列”、“核酸”和“寡核苷酸”可互换使用。它们是指任何长度的核苷酸——无论是脱氧核糖核苷酸还是核糖核苷酸——的聚合形式，或其类似物。多核苷酸可具有任何三维结构，并且可以执行任何已知或未知的功能。以下是多核苷酸的非限制性实例：基因或基因片段的编码区或非编码区、由连锁分析定义的基因座(基因座)、外显子、内含子、信使RNA(mRNA)、转移RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、短干扰RNA(siRNA)、短发夹RNA(shRNA)、微RNA(miRNA)、核酶、cDNA、重组多核苷酸、分支多核苷酸、质粒、载体、任何序列分离的DNA、任何序列分离的RNA、核酸探针和引物。多核苷酸可包含一个或多个修饰的核苷酸，如甲基化核苷酸和核苷酸类似物。如果存在，则可以在组装聚合物之前或之后对核苷酸结构进行修饰。核苷酸序列可以被非核苷酸组分中断。聚合后如通过与标记组分缀合可进一步修饰多核苷酸。

“杂交”是指这样的反应，即其中一个或多个多核苷酸反应以通过核苷酸残基的碱基之间的氢键形成稳定的复合体。可通过Watson Crick碱基配对、Hoogstein结合或根据碱基互补性以其它任何序列特异性方式进行氢键结合。所述复合体可包含形成双链结构的两条链、形成多链复合体的三条链或更多条链、单一自我杂交链或它们的任何组合。杂交反应可构成更广泛过程中的步骤，诸如PCR的启动或内切核酸酶对多核苷酸的酶促切割。与第一序列互补的第二序列被称为第一序列的“互补体”。应用于多核苷酸的术语“可杂交的”是指多核苷酸通过杂交反应中核苷酸残基的碱基之间的氢键结合而形成稳定的复合体的能力。

“互补性”是指核酸通过传统Watson-Crick或其它非传统类型的方式与另一核酸序列形成氢键的能力。互补性百分比表示可与第二核酸序列形成氢键(例如，Watson-Crick碱基配对)的核酸分子中的残基的百分比(例如，10个中有5、6、7、8、9、10个则分别为50％、60％、70％、80％、90％和100％互补)。“完全互补”是指核酸序列的所有连续残基将与第二核酸序列中相同数目的连续残基氢键结合。如本文所用的“基本互补”是指在8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50个或更多个核苷酸区域内互补程度至少为60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％、97％、98％、99％或100％，或指在严格条件下杂交的两个核酸。例如为了评估互补性百分比，序列同一性可以通过任何合适的比对算法测量得到，包括但不限于Needleman-Wunsch算法(参见例如，可从www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/nucleotide.html获得的EMBOSS Needle比对器，可选地使用默认设置)、BLAST算法(参见例如，可从blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi获得的BLAST比对工具，可选地使用默认设置)或Smith-Waterman算法(参见例如，可从www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/nucleotide.html获得的EMBOSS Water比对器，可选地使用默认设置)。可以使用所选算法的任何合适参数(包括默认参数)来评估最佳比对。

通常，针对杂交的“严格条件”是指与靶序列具有互补性的核酸主要与靶序列杂交且基本上不与非靶序列杂交的条件。严格条件通常是序列相关的，并且取决于许多因素。通常，序列越长，序列与其靶序列特异性杂交的温度越高。严格条件的非限制性实例详细描述于Tijssen(1993)，Laboratory Technniques In Biochemistry And Molecular Biology-Hybridization With Nucleic Acid Probes第I部分，第二章“Overview of principlesof hybridization and the strategy of nucleic acid probe assay”，Elsevier，N.Y.中。

如本文所用的，“表达”是指多核苷酸从DNA模板转录(如转录成mRNA和其它RNA转录物)的过程，和/或转录的mRNA随后翻译成肽、多肽或蛋白质的过程。转录物和编码的多肽可以统称为“基因产物”。如果多核苷酸来源于基因组DNA，则表达可包括mRNA在真核细胞中的剪接。

术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”在本文中可互换使用，是指任何长度的氨基酸的聚合物。该聚合物可以是直链或支链的，它可以包含修饰的氨基酸，并且可以被非氨基酸中断。该术语还包括已被修饰的氨基酸聚合物；例如二硫键形成、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或其它任何操作，如与标记组分缀合。如本文所用的，术语“氨基酸”包括天然和/或非天然或合成氨基酸，包括甘氨酸和D或L光学异构体，以及氨基酸类似物和模拟肽。

如本文所用的，术语“约”与术语“近似”同义使用。说明性地，关于量的术语“约”的使用表示略微超出引用值，例如加或减0.1％至10％的数值。

术语“生物学纯的培养物”或“基本纯培养物”是指本文所述的细菌物种的培养物，其不含其它细菌物种，其量足以干扰培养物的复制或者通过正常的细菌学技术检测得到。

“植物生产力”通常是指植物生长或发育的任何方面，这是植物生长的原因。对于粮食作物，如谷物或蔬菜，“植物生产力”可指从特定作物收获的谷物或水果的产量。如本文所用的，提高的植物生产力广义地指为了各种目的提高所收获的谷物、果实、花或其它植物部分的产量，改善植物部分(包括茎、叶和根)的生长，促进植物生长，维持叶片中高叶绿素含量，增加果实或种子数，增加果实或种子单位重量，由于氮肥用量减少降低NO₂排放，以及类似改善植物的生长和发育。

粮食作物内外的微生物可影响这些作物的性状。可能受微生物影响的植物性状包括：产率(例如，谷物生产、生物质生成、果实发育、开花)；营养(例如，氮、磷、钾、铁、微量营养素获得)；非生物应激管理(例如，耐旱性、耐盐性、耐热性)；和生物应激管理(例如，害虫、杂草、昆虫、真菌和细菌)。改变作物性状的策略包括：增加关键代谢物浓度；改变微生物对关键代谢物影响的时间动力学；将微生物代谢物的产生/降解与新的环境线索联系起来；减少负性代谢物；以及改善代谢物或潜在蛋白质的平衡。

如本文所用的，“控制序列”是指操纵子、启动子、沉默子或终止子。

如本文所用的，“植物中(in planta)”是指在植物中，并且其中所述植物还包括植物部分、组织、叶、根、茎、种子、胚珠、花粉、花、果实等。

在一些实施方案中，将本公开的基因的天然或内源控制序列替换为一个或多个属内控制序列。

如本文所用的，“引入”是指通过现代生物技术引入，而不是自然发生的引入。

在一些实施方案中，本公开的细菌已被修饰，使得它们不是天然存在的细菌。

在一些实施方案中，本公开的细菌以每克植物鲜重或干重至少10³cfu、10⁴cfu、10⁵cfu、10⁶cfu、10⁷cfu、10⁸cfu、10⁹cfu、10¹⁰cfu、10¹¹cfu或10¹²cfu的量存在于植物中。在一些实施方案中，本公开的细菌以每克植物鲜重或干重至少约10³cfu、约10⁴cfu、约10⁵cfu、约10⁶cfu、约10⁷cfu、约10⁸cfu、约10⁹cfu、约10¹⁰cfu、约10¹¹cfu或约10¹²cfu的量存在于植物中。在一些实施方案中，本公开的细菌以每克植物鲜重或干重至少10³至10⁹、10³至10⁷、10³至10⁵、10⁵至10⁹、10⁵至10⁷、10⁶至10¹⁰、10⁶至10⁷cfu的量存在于植物中。

本公开的肥料和外源氮可包括以下含氮分子：铵、硝酸盐、亚硝酸盐、氨、谷氨酰胺等。本公开的氮源可包括无水氨、硫酸铵、尿素、磷酸氢二铵、尿素形式、磷酸一铵、硝酸铵、氮溶液、硝酸钙、硝酸钾、硝酸钠等。

如本文所用的，“外源氮”是指在非氮限制条件下存在的土壤、田间或生长介质中容易获得的非大气氮，包括氨、铵、硝酸盐、亚硝酸盐、尿素、尿酸、铵酸等。

如本文所用的，“非氮限制条件”是指在土壤、田间、介质中可获得的浓度大于约4mM氮的非大气氮，如Kant等人(2010.J.Exp.Biol.62(4)：1499-1509)所描述的，其通过引用并入于此。

如本文所用的，“属间微生物”是通过有意组合由最初从不同分类学属的生物体中分离的遗传物质而形成的微生物。“属间突变体”可与“属间微生物”互换使用。示例性的“属间微生物”包括含有首先在微生物中鉴定的不同于受体微生物的属的移动遗传元件的微生物。进一步的解释尤其可以在40 C.F.R.§725.3中找到。

在一些方面，本文教导的微生物是“非属间的”，这意味着这些微生物不是属间的。

如本文所用的，“属内微生物”是通过有意组合由最初从相同分类学属的生物体中分离的遗传物质而形成的微生物。“属内突变体”可与“属内微生物”互换使用。

如本文所用的，“引入的遗传物质”是指添加到受体的基因组的遗传物质，并且保持为受体基因组的组分。

在一些实施方案中，固氮和氮同化遗传调节网络包含编码指导、调节和/或控制微生物固氮和/或氮同化的基因和非编码序列的多核苷酸，并且可包含nif簇(例如，nifA、nifB、nifC、......nifZ)的多核苷酸序列、编码氮调节蛋白C的多核苷酸、编码氮调节蛋白B的多核苷酸、gln簇(例如，glnA和glnD)的多核苷酸序列、draT和氨转运蛋白/通透酶。在一些情况下，Nif簇可包含NifB、NifH、NifD、NifK、NifE、NifN、NifX、hesa和NifV。在一些情况下，Nif簇可包含NifB、NifH、NifD、NifK、NifE、NifN、NifX、hesa和NifV的亚组。

在一些实施方案中，本公开的肥料包含按重量计至少5％、6％、7％、8％、9％、10％、11％、12％、13％、14％、15％、16％、17％、18％、19％、20％、21％、22％、23％、24％、25％、26％、27％、28％、29％、30％、31％、32％、33％、34％、35％、36％、37％、38％、39％、40％、41％、42％、43％、44％、45％、46％、47％、48％、49％、50％、51％、52％、53％、54％、55％、56％、57％、58％、59％、60％、61％、62％、63％、64％、65％、66％、67％、68％、69％、70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％的氮。

在一些实施方案中，本公开的肥料包含按重量计至少约5％、约6％、约7％、约8％、约9％、约10％、约11％、约12％、约13％、约14％、约15％、约16％、约17％、约18％、约19％、约20％、约21％、约22％、约23％、约24％、约25％、约26％、约27％、约28％、约29％、约30％、约31％、约32％、约33％、约34％、约35％、约36％、约37％、约38％、约39％、约40％、约41％、约42％、约43％、约44％、约45％、约46％、约47％、约48％、约49％、约50％、约51％、约52％、约53％、约54％、约55％、约56％、约57％、约58％、约59％、约60％、约61％、约62％、约63％、约64％、约65％、约66％、约67％、约68％、约69％、约70％、约71％、约72％、约73％、约74％、约75％、约76％、约77％、约78％、约79％、约80％、约81％、约82％、约83％、约84％、约85％、约86％、约87％、约88％、约89％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％或约99％的氮。

在一些实施方案中，本公开的肥料包含按重量计约5％-50％、约5％-75％、约10％-50％、约10％-75％、约15％-50％、约15％-75％、约20％-50％、约20％-75％、约25％-50％、约25％-75％、约30％-50％、约30％-75％、约35％-50％、约35％-75％、约40％-50％、约40％-75％、约45％-50％、约45％-75％或约50％-75％的氮。

在一些实施方案中，相对于尚未暴露于本公开的细菌的对照植物，测量到植物中固氮的增加和/或1％或更多的氮的产生。相对于对照细菌，测量到细菌中的所有增加或降低。相对于对照植物，测量到植物中的所有增加或降低。

如本文所用的，“组成型启动子”是在大多数条件下和/或在大多数发育阶段期间有活性的启动子。在生物技术中使用的表达载体中使用组成型启动子有几个优点，如：用于选择转基因细胞或生物体的蛋白质的高水平生产；报道蛋白或可评分的标记物的高水平表达，易于检测和定量；调节转录系统部分的转录因子的高水平生产；在生物体中需要普遍存在活性的化合物的生产；以及所有发育阶段所需的化合物的生产。非限制性的示例性组成型启动子包括CaMV 35S启动子、冠瘿碱启动子、遍在蛋白启动子、醇脱氢酶启动子等。

如本文所用的，“非组成型启动子”是在某些条件下，某些类型细胞中和/或在某些发育阶段期间有活性的启动子。例如，组织特异性的、组织优选的、细胞类型特异的、细胞类型优选的诱导型启动子和处于发育控制下的启动子是非组成型启动子。处于发育控制下的启动子的实例包括优先在某些组织中启动转录的启动子。

如本文所用的，“诱导型”或“可抑制型”启动子是在化学或环境因素控制下的启动子。可通过诱导型启动子影响转录的环境条件的实例包括厌氧条件、某些化学品、光的存在、酸性或碱性条件等。

如本文所用的，“组织特异性”启动子是仅在某些组织中启动转录的启动子。与基因的组成型表达不同，组织特异性表达是若干个基因调节的相互作用水平的结果。如此，在本领域中，有时优选使用来自同源或紧密相关物种的启动子来实现转基因在特定组织中有效且可靠的表达。这是在科学文献和专利文献中均找到的从特定组织中分离的大量组织特异性启动子的主要原因之一。

如本文所用的，术语“可操作地连接”是指单个核酸片段上的核酸序列的缔合，使得一个核酸序列的功能由另一个调节。例如，当启动子能够调节编码序列的表达(即，编码序列处于启动子的转录控制之下)时，启动子与编码序列可操作地连接。编码序列可以以有义或反义方向可操作地连接至调节序列。在另一个实例中，本公开的互补RNA区域可直接或间接地可操作地连接至靶mRNA的5′或靶mRNA的3′或在靶mRNA内部，或者第一互补区域位于靶mRNA的5′而其互补***于靶mRNA的3′。

在一些方面，“向植物施加多种非属间细菌”包括使植物(包括植物部分，如种子、根、茎、组织等)在植物生命周期的任何阶段与所述细菌接触(即暴露)的任何手段。因此，“向植物施加多种非属间细菌”包括以下任何一种将植物(包括植物部分，如种子、根、茎、组织等)暴露于所述细菌的手段：喷洒到植物上，滴在植物上，作为种子包衣应用，施加到稍后播种种子的田间，施加到已播种种子的田间，施加到具有成年植物的田间，等等。

如本文所用的，“MRTN”是最大氮回报的首字母缩写，并且在实施例中用作实验处理。MRTN由爱荷华州立大学开发，其信息可见于：http://cnrc.agron.iastate.edu/。MRTN是氮应用的经济净回报最大化时的氮用量。计算MRTN的方法是各州制定玉米氮用量指南的区域性方法。对伊利诺伊州、爱荷华州、密歇根州、明尼苏达州、俄亥俄州和威斯康星州的氮用量试验数据进行了评价，在这些州可以获得对大豆后种植玉米和玉米后种植玉米的足够数量的研究试验。试验在春季、追肥或种植前分割/追肥施氮的情况下进行，除了威斯康星州指示灌溉沙地之外，不对地点进行灌溉。MRTN由爱荷华州立大学开发，这是由于确定玉米生产所需的建议氮用量的方法有明显差异、与氮用量指南有关的错误认识以及对施用量的担忧。通过计算MRTN，从业者可以确定以下内容：(1)施氮的经济净回报最大化时的氮用量，(2)经济最优氮用量，这是最后一次氮增量获得大到足以补偿额外氮的产量增加时的点，(3)由施氮引起的玉米粒增加值，以及最大产量，即施加更多氮不会导致玉米产量增加时的产量。因此，MRTN计算为从业者提供了在不同地区使玉米作物最大化，同时使施氮引起的经济收益最大化的手段。

术语mmol是毫摩尔的缩写，其为摩尔(在本文中缩写为mol)的千分之一(10^-3)。

如本文所用的，术语“微生物”或“微生物体”应广义地采用。这些术语可互换使用，包括但不限于两个原核域：细菌和古菌。该术语还可包括真核的真菌和原生生物。

术语“微生物共生群”或“微生物群”是指各个微生物种或种的株的微生物群落的子集，其可被描述为执行共同功能，或者可被描述为参与或导致或关联于可识别的参数，如感兴趣的表型性状。

术语“微生物群落”是指包含两个或更多个种或株的一组微生物。与微生物共生群不同，微生物群落不必执行共同的功能，或者不必参与导致或关联于可识别的参数，如感兴趣的表型性状。

如本文所用的，“分离物”、“分离的”、“分离的微生物”和类似术语旨在表示一种或多种微生物已经与在特定环境(例如土壤、水、植物组织等)中与其相关的至少一种材料分离。因此，“分离的微生物”在其天然存在的环境中并不存在；而是通过本文所述的各种技术，微生物已从其自然环境中移取并处于非天然存在的状态。因此，分离的菌株或分离的微生物可以作为例如生物学纯的培养物存在，或作为孢子(或其它形式的菌株)存在。在一些方面，分离的微生物可以与可接受的载体结合，该载体可以是农业上可接受的载体。

在本公开的某些方面，分离的微生物以“分离的和生物学纯的培养物”存在。本领域技术人员将会理解，特定微生物的分离的和生物学纯的培养物表示所述培养物基本上不含其它活生物体，而是仅含有所讨论的单个微生物。培养物可含有不同浓度的所述微生物。本公开内容指出，分离的和生物学纯的微生物通常“必然不同于较不纯的或不纯的材料”。参见，例如，In re Bergstrom，427 F.2d 1394(CCPA 1970)(讨论纯化的***素)中，另见In re Bergy，596F.2d 952(CCPA 1979)(讨论纯化的微生物)，另见Parke-Davis&Co.v.H.K.Mulford&Co.，189 F.95(SDNY 1911)(作者讨论纯化的肾上腺素)，部分增补，部分修订，196 F.496(2d Cir.1912)，其中每一个都通过引用并入本文。此外，在一些方面，本公开提供了在分离的和生物学纯的微生物培养物中必然发现的浓度或纯度限制的某些定量测量。在某些实施方案中，这些纯度值的存在是将目前公开的微生物与以天然状态存在的那些微生物区分开的另一属性。参见，例如，Merck&Co.v.Olin Mathieson ChemicalCorp.，253F.2d 156(4th Cir.1958)(讨论由微生物产生的维生素B12的纯度限制)，在此引入作为参考。

如本文所用的，“单个分离物”应当被认为是指在与一种或多种其它微生物分离后主要包含微生物的单一属、种或株的组合物或培养物。

本公开的微生物可以包括孢子和/或营养细胞。在一些实施方案中，本公开的微生物包括处于存活但不可培养(VBNC)状态的微生物。如本文所用的，“孢子”或“孢子体”是指由细菌和真菌产生的适于存活和分散的结构。孢子通常被表征为休眠结构；然而，孢子能够通过萌发过程进行分化。萌发是孢子分化成能够代谢活动、生长和繁殖的营养细胞。单个孢子的萌发导致单个真菌或细菌营养细胞。真菌孢子是无性繁殖的单位，在一些情况下是真菌生命周期中必需的结构。细菌孢子是通常可能无益于营养细胞的存活或生长的存活条件的结构。

如本文所用的，“微生物组合物”是指包含一种或多种本公开的微生物的组合物。在一些实施方案中，将微生物组合物施用于植物(包括各种植物部分)和/或农田间。

如本文所用的，“载体”、“可接受的载体”或“农业上可接受的载体”是指可以与微生物一起施用的稀释剂、佐剂、赋形剂或媒介物，其不会对微生物产生不利影响。

固氮的调节

在一些情况下，固氮途径可以充当基因工程和优化的靶标。可以通过本文所述的方法靶向调节的一个性状是固氮。氮肥是农场最大的运营费用，也是玉米和小麦等行栽作物产量提高的最大动力。本文描述了可以在非豆科作物中递送可再生形式氮的微生物产品。虽然一些内生菌具有固定纯培养物中氮所必需的遗传基础，但是根本的技术挑战是谷类和禾类的野生型内生菌停止在施肥田中固氮。化肥施加及田间土壤中残留的氮水平表明微生物关闭固氮的生化途径。

改变固氮调节网络的组分的转录水平和翻译后水平对研发能够在肥料的存在下将氮固定并转移至玉米的微生物可能是有利的。为此，本文描述了用于精确演化调节网络并引发新型表型的宿主-微生物演化(HoME)技术。本文还描述了从玉米中分离的固氮内生菌的独特的专有文库，与在不同环境条件(如氮胁迫和过量条件下)围绕微生物和宿主植物的相互作用的大量组学数据配对。在一些实施方案中，该技术使得内生菌遗传调节网络的精确进化能够产生即使在田间施肥的情况下也能主动固氮的微生物。本文还描述了对在玉米根组织中定植并对施肥植物产生氮的进化微生物的技术潜力的评估，以及评估内生菌与标准制剂实践和不同土壤的相容性，以确定将微生物整合到现代氮管理策略中的可行性。

为了利用元素氮(N)进行化学合成，生物将大气中可得的氮气(N2)与氢气组合，该过程被称为固氮。由于生物固氮的能量密集性质，固氮生物(固定大气氮气的细菌和古菌)已经进化出nif基因簇响应于环境氧和可用氮的复杂且严密的调节。Nif基因编码参与固氮的酶(如固氮酶复合体)并调节固氮的蛋白质。Shamseldin(2013.GlobalJ.Biotechnol.Biochem.8(4)：84-94)公开了对nif基因及其产物的详细描述，并通过引用并入于此。本文描述了生产具有改良性状的植物的方法，其包括从第一植物分离细菌，将遗传变异引入到分离细菌的基因中以提高固氮，将第二植物暴露于变异细菌，从相对于第一植物具有改良性状的第二植物分离细菌，以及用从第二植物分离的细菌重复所述步骤。

在变形菌门中，调节围绕σ₅₄-依赖性增强子结合蛋白NifA的固氮中心，nif簇的阳性转录调节子。活性NifA的细胞内水平受两个关键因素控制：nifLA操纵子的转录以及通过蛋白质-蛋白质与NifL的相互作用抑制NifA的活性。这两个过程都是通过PII蛋白信号级联放大响应于细胞内谷氨酰胺水平。该级联反应由GlnD介导，GlnD直接感测谷氨酰胺并催化两种PII调节蛋白(GlnB和GlnK)的尿苷酰化或去尿苷酰化，GlnB和GlnK分别响应于结合的谷氨酰胺的缺乏或存在。在氮过量的条件下，未修饰的GlnB表明nifLA启动子失活。然而，在氮限制条件下，GlnB翻译后修饰，抑制其活性并导致nifLA操纵子的转录。通过这种方式，nifLA转录通过PII蛋白信号级联放大严格控制对环境氮的响应。在NifA调节的翻译后水平上，根据细胞内游离GlnK的整体水平，GlnK抑制NifL/NifA相互作用。

NifA由nifLA操纵子转录，其启动子被磷酸化的NtrC(另一种σ₅₄-依赖性调节子)激活。NtrC的磷酸化状态由组氨酸激酶NtrB介导，NtrB与去尿苷酰化的GlnB相互作用，但不与尿苷酰化的GlnB相互作用。在氮过量的条件下，细胞内高水平的谷氨酰胺导致GlnB去尿苷酰化，然后与NtrB相互作用以使其磷酸化活性失活并激活其磷酸酶活性，导致NtrC去磷酸化及nifLA启动子的失活。然而，在氮限制条件下，低水平的细胞内谷氨酰胺导致GlnB尿苷酰化，抑制其与NtrB的相互作用并允许NtrC磷酸化及nifLA操纵子的转录。通过这种方式，响应于环境氮而经由PII蛋白信号级联放大来严格控制nifLA表达。nifA、ntrB、ntrC和glnB均是可以在本文所述的方法中突变的基因。这些过程也可以响应于氨、尿素或硝酸盐的细胞内或细胞外水平。

NifA的活性在翻译后也响应于环境氮而调节，最典型地通过NifL介导的NifA活性的抑制。一般而言，尽管GlnK与NifL/NifA之间的相互作用的性质在不同的固氮生物之间明显不同，但NifL与NifA的相互作用经由GlnK受到PII蛋白信号级联放大的影响。在肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)中，两种形式的GlnK均抑制NifL/NifA相互作用，并且GlnK与NifL/NifA之间的相互作用由细胞内游离GlnK的总水平来决定。在氮过量的条件下，去尿苷酰化的GlnK与铵转运蛋白AmtB相互作用，用于阻断AmtB对铵的吸收并将GlnK与膜隔离，从而允许NifL抑制NifA。另一方面，在棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii)中，NifL/NifA相互作用和NifA抑制需要与去尿苷酰化的GlnK相互作用，而GlnK的尿苷化则抑制其与NifL的相互作用。在缺乏nifL基因的固氮生物中，有证据表明在氮过量条件下，NifA活性直接受到GlnK和GlnB的去尿苷酰化形式的相互作用的抑制。在一些细菌中，Nif簇可能受glnR调节，并且在一些情况下，这可能包括负调节。与机制无关，NifA的翻译后抑制是大多数已知固氮生物中nif簇的重要调节剂。另外，nifL、amtB、glnK和glnR均是可以在本文所述的方法中突变的基因。

除了调节nif基因簇的转录之外，许多固氮生物还发展了直接翻译后修饰及抑制固氮酶本身的机制，称为固氮酶关闭。这是由铁蛋白(NifH)在氮过量的条件下ADP-核糖基化介导的，这破坏其与MoFe蛋白复合体(NifDK)的相互作用并消除固氮酶活性。DraT催化Fe蛋白的ADP-核糖基化并关闭固氮酶，而DraG催化ADP-核糖的去除和固氮酶的再活化。与nifLA转录和NifA抑制一样，固氮酶关闭也通过PII蛋白信号级联放大来调节。在氮过量的条件下，去尿苷酰化的GlnB与DraT相互作用并激活DraT，而去尿苷酰化的GlnK与DraG和AmtB相互作用形成复合体，将DraG与膜隔离。在氮限制的条件下，GlnB和GlnK的尿苷酰化形式分别不与DraT和DraG相互作用，导致DraT的失活及DraG向Fe蛋白的扩散，从而除去ADP-核糖并激活固氮酶。本文所述的方法也考虑将遗传变异引入到nifH、nifD、nifK和draT基因中。

尽管一些内生菌具有体外固氮的能力，但是通常高水平的外源化学肥料使该遗传学在田间沉默。可以将外源氮的感测与固氮酶的表达分开，以促进基于田间的固氮。进一步通过提高固氮酶活性随时间的积分来增加氮的产生以供作物利用。利用本文所述的方法促进基于田间的固氮的遗传变异的具体靶标包括选自下组的一个或多个基因：nifA、nifL、ntrB、ntrC、glnA、glnB、glnK、draT、amtB、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB和nifQ。

利用本文所述的方法促进基于田间的固氮的遗传变异的额外靶标是NifA蛋白质。NifA蛋白质通常是用于固氮基因表达的激活剂。增加NifA的产量(组成性地或在高氨条件下)避开了天然氨感测途径。另外，降低NifL蛋白(一种已知的NifA抑制剂)的产生也导致游离活性NifA的水平增加。另外，提高nifAL操纵子的转录水平(组成性地或在高氨条件下)也导致整体上更高水平的NifA蛋白。通过改变启动子本身或通过降低NtrB的表达(在高氮条件下最初会导致关闭nifAL操纵子的ntrB和ntrC信号级联放大的一部分)来实现nifAL表达水平提高。通过本文所述的这些方法或其它任何方法实现的高水平的NifA提高了内生菌的固氮活性。

利用本文所述的方法促进基于田间的固氮的遗传变异的额外靶标是GlnD/GlnB/GlnK PII信号级联放大。通过GlnD/GlnB/GlnK PII信号级联放大感测细胞内谷氨酰胺水平。GlnD中的活性位点突变消除了GlnD的尿苷酰基去除活性，破坏了氮感测级联反应。另外，GlnB浓度的降低使谷氨酰胺感测级联反应短路。这些突变“诱使”细胞感知氮限制状态，从而增加固氮水平活性。这些过程也可以响应于氨、尿素或硝酸盐的细胞内或细胞外水平。

amtB蛋白也是利用本文所述的方法促进基于田间的固氮的遗传变异的靶标。通过降低amtB蛋白的表达水平可以降低从环境摄取氨。没有细胞内氨，内生菌不能感知高水平的氨，阻止了固氮基因的下调。设法进入细胞内隔室的任何氨都被转化成谷氨酰胺。细胞内谷氨酰胺水平是氮感测的主要指标。降低细胞内谷氨酰胺水平防止细胞感测环境中的高铵水平。该效果可以通过增加谷氨酰胺酶(一种将谷氨酰胺转化为谷氨酸的酶)的表达水平来实现。另外，细胞内谷氨酰胺也可以通过减少谷氨酰胺合酶(一种将氨转化为谷氨酰胺的酶)来降低。在固氮生物中，固定氨很快吸收到谷氨酰胺和谷氨酸中，用于细胞过程。氨同化的中断可能导致要作为氨从细胞输出的固定氮的转移。固定氨主要被glnA编码的谷氨酰胺合成酶(GS)同化到谷氨酰胺中，随后被谷氨酰胺氧化戊二酸转氨酶(GOGAT)同化到谷氨酰胺中。在一些实例中，glnS编码谷氨酰胺合成酶。GS由GS腺苷酰转移酶(GlnE)翻译后调节，GlnE是由glnE编码的双功能酶，其分别通过其腺苷酰转移酶(AT)和腺苷酰基去除(AR)结构域的活性来催化GS的腺苷酰化和去腺苷酰化。在氮限制的条件下，表达glnA、GlnE的AR结构域去腺苷酰化GS，使其活跃。在氮过量的条件下，关闭glnA表达，GlnE的AT结构域被谷氨酰胺变构活化，导致GS的腺苷酰化及失活。

此外，draT基因也是利用本文所述的方法促进基于田间的固氮的遗传变异的靶标。一旦氮固定酶由细胞产生，则关闭固氮酶代表另一个水平，其中细胞在高氮条件下下调固定活性。该关闭可通过降低DraT的表达水平来消除。

赋予新微生物表型的方法可以在转录、翻译和翻译后水平下进行。转录水平包括启动子的改变(如改变σ因子亲和性或转录因子的结合位点，包括全部或部分启动子的缺失)或改变转录终止子和弱化子。翻译水平包括核糖体结合位点的改变和改变的mRNA降解信号。翻译后水平包括突变酶的活性位点及改变蛋白质-蛋白质相互作用。这些变化可以通过多种方式实现。通过以较低的强度/效率将天然核糖体结合位点(RBS)或启动子与另一个进行交换来实现表达水平的降低(或完全消除)。ATG起始位点可以交换成GTG、TTG或CTG起始密码子，这导致编码区翻译活性的降低。通过敲除(删除)基因的编码区可以完全消除表达。将开放阅读框(ORF)移码可能会导致沿ORF提前终止密码子，从而产生非功能性截短产物。框内终止密码子的***也将类似地产生非功能性截短产物。还可以在N或C末端添加降解标签以降低特定基因的有效浓度。

相反，本文所述基因的表达水平可以通过使用更强的启动子来实现。为了在高氮水平条件(或其它任何条件)下确保高启动子活性，可以获得在高氮水平条件下全基因组的转录概况，并且可以从该数据集中选择具有期望转录水平的活性启动子以代替弱启动子。弱起始密码子可以替换为ATG起始密码子以获得更好的翻译起始效率。弱核糖体结合位点(RBS)也可以用不同的具有较高翻译起始效率的RBS换掉。另外，也可以进行位点特异性诱变以改变酶的活性。

增加植物中固氮水平可导致作物生产所需的化学肥料的量降低，并减少温室气体排放(例如，一氧化二氮)。

细菌群体的产生

细菌的分离

可用于本文公开的方法和组合物中的微生物可以通过从天然植物的表面或组织中提取微生物来获得。可以通过研磨种子以分离微生物来获得微生物。通过在不同的土壤样品中播种种子并从组织中回收微生物可以获得微生物。另外，可以通过用外源微生物接种植物并确定哪些微生物出现在植物组织中来获得微生物。植物组织的非限制性实例可包括种子、幼苗、叶、插枝、植物、球茎或块茎。

获得微生物的方法可以是通过从土壤中分离细菌。可以从各种土壤类型中收集细菌。在一些实例中，土壤的特征可以是诸如高或低肥力、水分水平、矿物水平和各种种植实践。例如，土壤可能参与作物轮作，其中在连续的种植季节中将不同的作物种植在同一土壤中。不同作物在同一土壤上的连续生长可以防止某些矿物的不成比例的消耗。可以从在所选土壤中生长的植物中分离细菌。可以在生长2-6周时收获幼苗植物。例如，在一轮收获中可以收集至少400个分离物。土壤和植物类型揭示了植物表型以及条件，这允许下游富集某些表型。

可以从植物组织中分离微生物以评估微生物性状。可以改变用于处理组织样品的参数，以分离不同类型的关联微生物，如根际细菌、附生菌或内生菌。可以在无氮培养基中培养分离物，以富集进行固氮的细菌。或者，可以从全球菌株库中获得微生物。

进行植物中分析以评估微生物性状。在一些实施方案中，可以处理植物组织以供通过DNA和RNA的高通量加工进行筛选。另外，可以使用非侵入性测量来评估植物特性，如定植。可以逐个植物获得对野生微生物的测量。对野生微生物的测量也可以使用中等通量方法在现场获得。测量可以随时间连续进行。可以使用模型植物系统，包括但不限于狗尾草(Setaria)。

可以通过植物系统中微生物的转录概况分析来筛选植物系统中的微生物。通过转录概况分析筛选的实例是使用定量聚合酶链反应(qPCR)、用于转录物检测的分子条形码、下一代测序和采用荧光标记物的微生物标记的方法。可以测量影响因素以评估温室中的定植，包括但不限于微生物组、非生物因素、土壤条件、氧、水分、温度、接种条件和根定位。可以通过如本文所述的IRMS或NanoSIMS测量15N气体/肥料(稀释)而在细菌中评估固氮，NanoSIMS是高分辨率二次离子质谱法。NanoSIMS技术是一种从生物样品研究化学活性的方法。可以在细胞、亚细胞、分子和元素水平上研究减少驱动微生物代谢的氧化反应的催化作用。NanoSIMS可提供大于0.1μm的高空间分辨率。NanoSIMS可以检测诸如¹³C、¹⁵N和¹⁸O等同位素示踪剂的使用。因此，NanoSIMS可用于细胞中的氮化学活性。

自动化温室可用于植物分析。响应于微生物暴露的植物指标包括但不限于生物质、叶绿体分析、CCD相机、体积断层摄影测量。

富集微生物群体的一种方法是根据基因型。例如，使用靶向引物或特异性引物的聚合酶链反应(PCR)测定。针对nifH基因设计的引物可用来鉴定固氮生物，因为固氮生物在固氮过程中表达nifH基因。微生物群体也可以通过不依赖于单细胞培养的方法和趋化性引导的分离方法来富集。或者，可以通过在选择培养基上培养微生物来进行微生物的靶向分离。用于针对期望性状富集微生物群体的预计方法可以由生物信息学数据来指导，并在本文中描述。

使用生物信息学富集具有固氮能力的微生物

可以使用生物信息学工具来鉴定并分离促进植物生长的根际细菌(PGPR)，它们根据其进行固氮的能力进行选择。具有高固氮能力的微生物可以促进植物的有利性状。用于鉴定PGPR的生物信息学分析模式包括但不限于基因组学、宏基因组学、靶向分离、基因测序、转录物组测序和建模。

基因组学分析可用来鉴定PGPR，并用本文所述的下一代测序方法和微生物形式控制来确认突变的存在。

宏基因组学可用来使用用于定植的预测算法来鉴定并分离PGPR。元数据还可以用来确定环境样品和温室样品中工程菌株的存在。

转录物组测序可用来预测导致PGPR表型的基因型。另外，转录物组数据用来鉴定改变基因表达的启动子。可以结合全基因组序列(WGS)分析转录物组数据，以产生代谢模型和基因调节网络。

微生物的驯化

从自然界分离的微生物可以经历驯化过程，其中微生物被转化为遗传上可追踪且可鉴别的形式。驯化微生物的一种方法是用抗生素抗性来改造微生物。抗生素抗性工程化的过程可以开始于确定野生型微生物株中的抗生素敏感性。如果细菌对抗生素敏感，那么该抗生素可以是抗生素抗性工程化的良好候选者。随后，可以使用重组工程方法将抗生素抗性基因或可反选择的***载体并入微生物的基因组中。可反选择的***载体可以由目的基因的缺失、选择标记和反选择标记sacB组成。反选择可用来将天然微生物DNA序列交换为抗生素抗性基因。中等通量方法可用来同时评价多个微生物，从而允许平行驯化。备选的驯化方法包括使用归巢核酸酶来防止***载体序列环出或防止获得间插载体序列。

可以通过包括电穿孔和化学转化在内的几种方法将DNA载体引入细菌中。标准的载体文库可用于转化。基因编辑方法的一个实例是在CRISPR前进行Cas9测试，以确保微生物中Cas9的活性。

微生物的非转基因工程化

通过定向进化可以获得具有有利性状的微生物群体。定向进化是这样一种方法，其中模拟自然选择的过程，以使蛋白质或核酸朝向用户定义的目标进化。定向进化的一个实例是当将随机突变引入微生物群体中时，选择具有最有利的性状的微生物，并继续使所选微生物生长。促进生长的根际细菌(PGPR)中最有利的性状可能是固氮。定向进化的方法可以是迭代的和适应性的，其基于每次迭代之后的选择过程。

可以产生具有高固氮能力的促进植物生长的根际细菌(PGPR)。PGPR的进化可以通过引入遗传变异来进行。可通过聚合酶链反应诱变、寡核苷酸指导的诱变、饱和诱变、片段改组诱变、同源重组、CRISPR/Cas9系统、化学诱变及其组合来引入遗传变异。这些方法可以将随机突变引入微生物群体中。例如，可以通过寡核苷酸指导的诱变使用合成DNA或RNA产生突变体。可以使用质粒上包含的工具产生突变体，所述工具随后被固化。可以使用来自具有改良的性状的其它物种的文库鉴定目的基因，这些改良的性状包括但不限于改善的PGPR性质、改善的谷物定植、增加的氧敏感性、增加的固氮和增加的氨排出。可以使用诸如Geneious或Platypus设计软件等软件基于这些文库设计属内基因。可以借助于机器学习来设计突变。可以借助于代谢模型来设计突变。可以使用la Platypus进行突变的自动化设计，并将指导RNA以用于Cas指导的诱变。

可以将属内基因转移到宿主微生物中。另外，也可以将报告系统转移到微生物中。报告系统表征启动子、确定转化成功、筛选突变体并充当负筛选工具。

携带突变的微生物可以通过连续传代来培养。微生物菌落含有微生物的单一变体。借助于自动化菌落挑取器和液体处理器筛选微生物菌落。具有基因复制和拷贝数增加的突变体表达期望性状的更高基因型。

基于固氮对促进植物生长的微生物的选择

可以使用各种试验筛选微生物菌落以评估固氮。测量固氮的一种方法是通过测量氮排出的单一发酵试验。一种备选方法是乙炔还原试验(ARA)，随时间进行在线采样。ARA可以在微管阵列的高通量板中进行。ARA可以用活植物和植物组织进行。在ARA试验中可以改变培养基配方和培养基氧浓度。筛选微生物变体的另一种方法是使用生物传感器。使用NanoSIMS和拉曼显微光谱法可以用来研究微生物的活性。在一些情况下，还可以使用生物反应器中的发酵方法培养和扩充细菌。生物反应器旨在提高细菌生长的稳健性并降低细菌对氧的敏感性。基于中等至高TP板的微发酵罐用来评价氧敏感性、营养需求、固氮和氮排出。细菌也可以与竞争性或有益的微生物共培养，以阐明隐藏的途径。流式细胞术可用来使用化学、比色或荧光指示剂筛选产生高水平氮的细菌。可以在存在或不存在氮源的情况下培养细菌。例如，细菌可以与谷氨酰胺、氨、尿素或硝酸盐一起培养。

微生物育种

微生物育种是一种系统性地鉴定并改善作物微生物组中物种的作用的方法。该方法包括三个步骤：1)通过对植物-微生物相互作用进行作图并预测与特定表型相关的调节网络来选择候选物种，2)通过调节网络和基因簇的种内交叉来实际和可预测地改善微生物表型，以及3)筛选并选择产生所需作物表型的新微生物基因型。为了系统性地评估菌株的改良，创建了一个模型，其将微生物群落的定植动力学与关键物种的遗传活动联系起来。该模型用来预测遗传目标育种并提高选择微生物组编码的农艺相关性性状改善的频率。该过程的一个实施方案的图示参见图17A。具体地，图17A描绘了根据实施方案的微生物育种的示意图。如图17A所示，作物微生物组的合理改进可用来增加土壤生物多样性，调节关键物种的影响，和/或改变重要代谢途径的时机和表达。为此，本发明人开发了一种微生物育种路线，以鉴定并改善作物微生物组内的菌株的作用。该方法包括三个步骤：1)通过对植物-微生物相互作用进行作图并预测与特定表型相关的调节网络来选择候选物种，2)通过基因调节网络和基因簇的基因组内交叉来实际和可预测地改善微生物表型，以及3)筛选并选择产生所需作物表型的新微生物基因型。为了系统性地评估菌株的改善，本发明人采用了一种模型，该模型将微生物群落的定植动力学与关键物种的遗传活动联系起来。该过程代表了用于培育和选择微生物组编码的农艺相关性性状改良的方法。

通过连续传代可以产生细菌以改良植物性状(例如，固氮)。除了鉴定能够将一种或多种改良性状赋予一种或多种植物的细菌和/或组合物之外，该细菌的产生可以通过选择受微生物菌丛影响的、具有特定改良性状的植物来完成。一种产生细菌以改良植物性状的方法，其包括以下步骤：(a)从第一植物的组织或土壤中分离细菌；(b)将遗传变异引入到一种或多种细菌中以产生一种或多种变异细菌；(c)将多种植物暴露于所述变异细菌；(d)从所述多种植物其中之一的组织或土壤中分离细菌，其中分离细菌的植物相对于多种植物中的其它植物具有改良的性状；以及(e)用从具有改良性状的植物中分离的细菌(步骤(d))重复步骤(b)至(d)。步骤(b)至(d)可以重复任意次数(例如，一次、两次、三次、四次、五次、十次或更多次)，直到植物中改良的性状达到期望的水平。此外，所述多种植物可以是多于两种植物，如，10种至20种植物，或者20种或更多种、50种或更多种、100种或更多种、300种或更多种、500种或更多种、或1000种或更多种植物。

除了获得具有改良性状的植物之外，还获得了包含细菌的细菌群体，该细菌包含引入到一个或多个基因(例如，调节固氮的基因)的一个或多个遗传变异。通过重复上述步骤，可以获得包括群体中与感兴趣的植物性状相关的最合适的成员的细菌群体。可以鉴定该群体中的细菌，并通过诸如遗传和/或表型分析确定其有益性质。可对步骤(a)中分离的细菌进行遗传分析。可以使用以下技术获得表型和/或基因型信息：植物来源的化学成分的高通量筛选、包括遗传物质的高通量测序的测序技术、差异显示技术(包括DDRT-PCR和DD-PCR)、核酸微阵列技术、RNA-seq(全转录物组鸟枪测序法)和qRT-PCR(定量实时PCR)。所获得的信息可用于获得关于存在的细菌的身份和活性的群落概况分析信息，如编码rRNA操纵子组分或其它分类学信息基因座的核酸的系统发育分析或基于微阵列的筛选。分类学信息基因座的实例包括16S rRNA基因、23S rRNA基因、5S rRNA基因、5.8S rRNA基因、12S rRNA基因、18S rRNA基因、28S rRNA基因、gyrB基因、rpoB基因、fusA基因、recA基因、coxl基因、nifD基因。在US20140155283中描述了确定群体中存在的分类群的分类学概况分析的示例过程。细菌鉴定可包括表征一个或多个基因或一个或多个信号传导途径的活性，如与固氮途径相关的基因。在细菌群体中还可存在不同细菌物种之间的协同相互作用(其中两个组分由于其组合而增加的所需效果超过添加量)。

遗传变异-基因组改变的位置和来源

所述遗传变异可以是选自以下基因的变异：nifA、nifL、ntrB、ntrC、glnA、glnB、glnK、draT、amtB、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB和nifQ。该遗传变异可以是编码具有选自下组的功能的蛋白质的基因的变异：谷氨酰胺合成酶、谷氨酰胺酶、谷氨酰胺合成酶腺苷酰转移酶、转录激活因子、抗转录激活因子、丙酮酸黄素氧还蛋白氧化还原酶、黄素氧还蛋白或NAD+-双氮还原酶aDP-D-核糖转移酶。该遗传变异可以是导致以下一些或多项的突变：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。引入遗传变异可包括在靶位点处一个或多个核苷酸(如，1、2、3、4、5、10、25、50、100、250、500个或更多个核苷酸)的***和/或缺失。引入到本文公开的方法的一种或多种细菌中的遗传变异可以是敲除突变(例如，启动子的缺失、产生过早终止密码子的***或缺失、整个基因的缺失)，或者可以是消除或停止蛋白质结构域的活性(例如，影响活性位点的点突变、或编码蛋白质产物相关部分的基因的一部分缺失)，或者可以是改变或消除靶基因的调节序列。还可以***一个或多个调节序列，包括在对应于引入了遗传变异的细菌的细菌物种或属的基因组内发现的异源调节序列和调节序列。此外，调节序列可基于细菌培养或植物组织内基因的表达水平来选择。该遗传变异可以是特异性引入到靶位点的预定遗传变异。该遗传变异可以是靶位点内的随机突变。该遗传变异可以是一个或多个核苷酸的***或缺失。在一些情况下，在将细菌暴露于植物以评估性状改良之前，将多种(例如，2种、3种、4种、5种、10种或更多种)不同的遗传变异引入到一种或多种分离的细菌中。多种遗传变异可以是上述类型(相同或不同类型)中的任何一种以及任何组合。在一些情况下，连续引入多种不同的遗传变异，在第一次分离步骤之后引入第一遗传变异，在第二次分离步骤之后引入第二遗传变异等等，从而在细菌中累积多种遗传变异，进而逐步改良相关植物的性状。

遗传变异-引入基因组改变的方法

通常，术语“遗传变异”是指相对于参考多核苷酸(如，参照基因组或其部分，或者参照基因或其部分)引入到多核苷酸序列中的任何变化。遗传变异可称为“突变”，并且包含遗传变异的序列或生物体可称为“遗传变体”或“突变体”。遗传变异可具有许多影响，诸如某些生物活性的增加或减少，包括基因表达、代谢和细胞信号传导。遗传变异可以特定地引入到靶位点或者随机引入。有多种分子工具和方法可用于引入遗传变异。例如，可通过聚合酶链反应诱变、寡核苷酸指导的诱变、饱和诱变、片段改组诱变、同源重组、重组工程、λred介导的重组、CRISPR/Cas9系统、化学诱变及其组合来引入遗传变异。引入遗传变异的化学方法包括将DNA暴露于化学诱变剂，例如甲磺酸乙酯(EMS)、甲磺酸甲酯(MMS)、N-亚硝基脲(EN U)、N-甲基-N-硝基-N′-亚硝基胍、4-硝基喹啉N-氧化物、硫酸二乙酯、苯并芘、环磷酰胺、博来霉素、三乙基三聚氰胺、丙烯酰胺单体、氮芥子气、长春新碱、二环氧烷烃(例如，二环氧丁烷)、ICR-170、甲醛、盐酸甲基苄肼、环氧乙烷、二甲基亚硝胺、7，12二甲基苯丙(a)蒽、苯丁酸氮芥、六甲基磷酰胺、白消安(bisulfan)等。辐射诱变剂包括紫外辐射、γ辐照、X射线和快速中子轰击。还可以使用例如紫外线的三甲基补骨脂素将遗传变异引入到核酸中。移动DNA元件(例如，转座因子)的随机或靶向***是产生遗传变异的另一种合适方法。可以例如使用聚合酶链反应(PCR)技术如易错PCR，在无细胞体外系统扩增期间将遗传变异引入到核酸中。可使用DNA改组技术(例如，外显子改组、结构域交换等)在体外将遗传变异引入到核酸中。由于细胞中DNA修复酶的缺乏，也可将遗传变异引入到核酸中，例如，在细胞中存在编码突变DNA修复酶的突变基因预期在细胞基因组中产生高频率突变(即，约1个突变/100个基因-1个突变/10,000个基因)。编码DNA修复酶的基因的实例包括但不限于MutH、Mut S、Mut L和Mut U，以及其它物种中的同源物(例如，MSH 16、PMS 1 2、MLH 1、GTBP、ERCC-1等)。用于引入遗传变异的各种方法的示例性描述在例如Stemple(2004)Nature 5：1-7；Chiang等人(1993)PCR Methods Appl 2(3)：210-217；Stemmer(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91：10747-10751；和美国专利6,033,861和6,773,900中提供。

引入微生物的遗传变异可以被分类为转基因、顺式基因(cisgenic)、基因组内、属内、属间、合成、进化、重排或SNP。

可以将遗传变异引入微生物内的许多代谢途径中以引起上述性状的改良。代表性途径包括硫摄取途径、糖原生物合成、谷氨酰胺调节途径、钼摄取途径、固氮途径、氨同化、氨排出或分泌、氮摄取、谷氨酰胺生物合成、annamox、磷酸盐溶解、有机酸转运、有机酸产生、凝集素产生、活性氧自由基清除基因、吲哚乙酸生物合成、海藻糖生物合成、植物细胞壁降解酶或途径、根附着基因、胞外多糖分泌、谷氨酸合酶途径、铁摄取途径、铁载体途径、壳多糖酶途径、ACC脱氨酶、谷胱甘肽生物合成、磷信号传导基因、群体猝灭途径、细胞色素途径、血红蛋白途径、细菌血红蛋白样途径、小RNA rsmZ、根瘤菌毒素生物合成、lapA粘附蛋白、AHL群体感应途径、吩嗪生物合成、环脂肽生物合成和抗生素产生。

CRISPR/Cas9(成簇规律间隔短回文重复)/CRISPR相关(Cas)系统可用来引入所需突变。CRISPR/Cas9通过使用CRISPR RNA(crRNA)为细菌和古菌提供针对病毒和质粒的适应性免疫，以指导入侵核酸的沉默化。Cas9蛋白质(或其功能等同物和/或变体，即，Cas9样蛋白)天然含有DNA内切核酸酶活性，该活性依赖于蛋白质与被称为crRNA和tracrRNA(也称为指导RNA)的两种天然存在的或合成的RNA分子之间的缔合。在一些情况下，这两种分子共价连接形成单个分子(也称为单个指导RNA(“sgRNA”))。因此，Cas9或Cas9样蛋白质与DNA靶向的RNA(该术语包括两分子指导RNA构型和单分子指导RNA构型)相缔合，其激活Cas9或Cas9样蛋白质并将该蛋白质引导至靶核酸序列。如果Cas9或Cas9样蛋白质保留其天然的酶功能，则其将切割靶DNA以产生双链断裂，这可导致基因组改变(即，编辑：缺失、***(当供体多核苷酸存在时)、替换等)，从而改变基因表达。Cas9的某些变体(其中变体包含在术语Cas9样中)已被改变，使得它们具有降低的DNA切割活性(在一些情况下，它们切割单链而不切割靶DNA的两条链，而在其它情况下，它们已经剧烈降低至不具有DNA切割活性)。用于引入遗传变异的CRISPR系统的其它示例性描述可以在例如US8795965中找到。

作为循环扩增技术，聚合酶链反应(PCR)诱变使用诱变引物来引入所需的突变。PCR通过变性、退火和延伸的循环来进行。通过PCR扩增后，突变DNA的选择和亲本质粒DNA的去除可通过以下步骤完成：1)在PCR期间用羟甲基化-dCTP置换dCTP，然后用限制酶消化仅除去非羟甲基化亲本DNA；2)同时诱变抗生素抗性基因和所研究的将质粒改变为不同的抗生素抗性的基因，新的抗生素抗性促进其后选择所需的突变；3)在引入期望的突变后，通过限制酶DpnI消化亲本甲基化模板DNA，限制性酶Dpn1仅裂解甲基化DNA，由此恢复诱变的非甲基化链；或4)在另外的连接反应中使突变的PCR产物环化以提高突变DNA的转化效率。示例性方法的进一步描述可以在例如US7132265、US6713285、US6673610、US6391548、US5789166、US5780270、US5354670、US5071743和US20100267147中找到。

寡核苷酸指导的诱变(也称为定向诱变)通常使用合成的DNA引物。该合成引物含有所需的突变，并且与突变位点周围的模板DNA互补，从而可以与目的基因中的DNA杂交。突变可以是单个碱基改变(点突变)、多个碱基改变、删除或***，或它们的组合。然后使用DNA聚合酶延伸单链引物，该DNA聚合酶复制基因的其余部分。如此复制的基因含有突变位点，然后可以作为载体引入到宿主细胞并克隆。最后，可通过DNA测序选择突变体来检查它们是否含有所需的突变。

可以使用易错PCR来引入遗传变异。在该技术中，在缺乏序列复制保真度的条件下，使用DNA聚合酶扩增目的基因。结果是该扩增产物在序列中包含至少一个错误。当基因扩增并且与模板分子相比，所得到的反应产物含有一个或多个序列改变时，所得产物相比于模板被诱变。另一种引入随机突变的手段是将细胞暴露于化学诱变剂，如亚硝基胍或甲磺酸乙酯(Nestmann，Mutat Res 1975年6月；28(3)：323-30)，然后从宿主中分离含有该基因的载体。

饱和诱变是随机诱变的另一种形式，其中人们试图在特定位点或基因的狭窄区域内产生全部或几乎所有可能的突变。一般意义上，饱和诱变包括在待诱变的多核苷酸序列(其中待诱变的序列的长度例如为15至100,000个碱基)中诱变一套完整的诱变盒(其中每个盒的长度为例如1-500个碱基)。因此，将一组突变(例如，1至100个突变)引入到每个盒中以进行诱变。待引入到一个盒中的一组突变可以与在一轮饱和诱变应用期间引入到第二盒中的第二组突变不同或相同。这样的分组通过缺失、添加、特定密码子的分组和特定核苷酸盒的分组来例举。

片段改组诱变也称为DNA改组，是快速传播有益突变的一种方式。在改组过程的实例中，使用DNAse将一组亲本基因片段化成例如长度约50-100bp的片。然后是无引物的聚合酶链反应(PCR)-具有足够重叠的同源序列的DNA片段将彼此退火，并然后通过DNA聚合酶延伸。在一些DNA分子达到亲本基因的尺寸之后，允许发生数轮PCR延伸。然后可以用另一个PCR来扩增这些基因，将该加入设计为补足链末端的引物。引物可以在其5′端添加额外的序列，如连接到克隆载体所需的限制酶识别位点的序列。在US20050266541中提供了改组技术的其它示例。

同源重组诱变涉及外源DNA片段与靶向多核苷酸序列之间的重组。发生双链断裂后，断裂5′端周围的DNA部分被切除，该过程称为切除。在随后的链侵入步骤中，破裂DNA分子的突出3′端然后“侵入”未破裂的相似或相同DNA分子。所述方法可用于删除基因、去除外显子、添加基因以及引入点突变。同源重组诱变可以是永久的或有条件的。通常还提供重组模板。重组模板可以是另一种载体的组分，其包含在单独的载体中，或作为单独的多核苷酸提供。在一些实施方案中，将重组模板设计作为同源重组(如在由位点特异性核酸酶切开或切割的靶序列内或附近)中的模板。模板多核苷酸可以具有任何合适的长度，如长度约或大于约10、15、20、25、50、75、100、150、200、500、1000个或更多个核苷酸。在一些实施方案中，模板多核苷酸与包含靶序列的多核苷酸的一部分互补。当最佳比对时，模板多核苷酸可与靶序列的一个或多个核苷酸(例如，约或大于约1、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70个，80、90、100个或更多个核苷酸)重叠。在一些实施方案中，当模板序列和包含靶序列的多核苷酸最佳比对时，模板多核苷酸的最近核苷酸是约1、5、10、15、20、25、50、75、100、200、300、400、500、1000、5000、10000个或更多个来自靶序列的核苷酸。用于同源重组方法的定点核酸酶的非限制性实例包括锌指核酸酶、CRISPR核酸酶、TALE核酸酶和大范围核酸酶。关于使用此类核酸酶的进一步描述，参见例如US8795965和US20140301990。

主要产生点突变和短缺失、***、颠换和/或转换的诱变剂(包括化学诱变剂或辐射)可用于产生遗传变异。诱变剂包括但不限于甲磺酸乙酯、甲基甲磺酸、N-乙基-N-亚硝基脲，三乙基三聚氰胺、N-甲基-N-亚硝基脲、丙卡巴肼、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、硫酸二乙酯、丙烯酰胺单体、苯丙氨酸氮芥、氮芥子气、长春新碱、二甲基亚硝胺、N-甲基-N′-硝基-亚硝基胍、亚硝基胍、2-氨基嘌呤，7，12二甲基-苯丙蒽、环氧乙烷、六甲基磷酰胺、白消安、二环氧烷(二环氧辛烷、二环氧丁烷等)、2-甲氧基-6-氯-9-[3-(乙基-2-氯-乙基)氨丙基氨基]吖啶二盐酸和甲醛。

引入遗传变异可能是一个不完整的过程，使得处理的细菌群体中的一些细菌携带期望的突变，而其它细菌则不携带。在一些情况下，希望施加选择压力以富集携带期望遗传变异的细菌。传统上，选择成功的遗传变异体包括选择或抵抗由遗传变异赋予或消除的一些功能，如***抗生素抗性基因或消除能将非致死性化合物转化为致死性代谢物的代谢活动。也可以基于多核苷酸序列本身施加选择压力，使得仅需要引入期望的遗传变异(例如，也不需要选择性标记物)。在这种情况下，选择压力可包括切割缺乏引入到靶位点的遗传变异的基因组，使得选择有效地针对力图待引入遗传变异的参考序列。通常，切割发生在靶位点的100个核苷酸内(例如，在离靶位点75、50、25、10个或更少核苷酸内，包括靶位点处或靶位点内的切割)。切割由选自锌指核酸酶、CRISPR核酸酶、TALE核酸酶(TALEN)或大范围核酸酶的位点特异性核酸酶来指导。除了未提供用于同源重组的模板之外，这样的过程类似于用于增强靶位点处的同源重组的过程。因此，缺乏所需遗传变异的细菌更可能经历***、未修复，从而导致细胞死亡。然后可以分离在选择下存活的细菌，用于暴露于植物以评估改良的性状。

CRISPR核酸酶可用作位点特异性核酸酶以指导对靶位点的切割。通过使用Cas9可获得突变微生物的改进选择以杀死未突变的细胞。然后用突变微生物接种植物以重新确认共生并产生进化压力以选择有效的共生体。然后可以从植物组织中重新分离微生物。除了未提供用于同源重组的模板，用于针对非变体选择的CRISPR核酸酶系统可以使用与上文关于引入遗传变异所描述的相似的元件。定向至靶位点的切割因此增强了受影响的细胞的死亡。

可以使用其它选择来特异性诱导靶位点处的切割，如锌指核酸酶、TALE核酸酶(TALEN)系统和大范围核酸酶。锌指核酸酶(ZFN)是通过将锌指DNA结合域与DNA切割结构域融合而产生的人工DNA内切核酸酶。可将ZFN工程化为靶向期望的DNA序列，并且这使得锌指核酸酶能够切割独特的靶序列。当引入到细胞时，ZFN可用于通过诱导双链断裂来编辑细胞中的靶DNA(例如，细胞的基因组)。转录激活剂样效应物核酸酶(TALEN)通过将TAL(转录激活剂样)效应物DNA结合域与DNA切割结构域融合而产生人工DNA内切核酸酶。TALENS可快速工程化以实际结合任何所需的DNA序列，并且当引入到细胞时，TALEN可通过诱导双链断裂来编辑细胞中的靶DNA(例如，细胞的基因组)。大范围核酸酶(寻靶内切核酸酶)是以大识别位点为特征的脱氧核糖内切核酸酶(12至40个碱基对的双链DNA序列)。大范围核酸酶可用于以高度靶向的方式取代、消除或修饰序列。通过蛋白质工程修饰它们的识别序列，可以改变靶序列。大范围核酸酶可用于修饰所有的基因组类型，无论是细菌、植物还是动物，通常分为四个家族：LAGLIDADG家族(SEQ ID NO：1)、GIY-YIG家族，His-Cyst box家族和HNH家族。示例性的寻靶内切核酸酶包括I-SceI、I-CeuI、PI-PspI、PI-Sce、I-SceIV、I-CsmI、I-PanI、I-SceII、I-PpoI、I-SceIII、I-CreI、I-TevI、I-TevII和I-TevIII。

遗传变异-鉴定方法

本公开的微生物可以通过已经引入所述微生物中的一种或多种遗传修饰或改变来鉴定。可以鉴定所述遗传修饰或改变的一种方法是通过参考SEQ ID NO，其含有足以鉴定遗传修饰或改变的微生物基因组序列的一部分。

此外，在未将基因修饰或改变引入其基因组的微生物(例如野生型，WT)的情况下，本公开可利用16S核酸序列来鉴定所述微生物。16S核酸序列是“分子标记”或“遗传标记”的实例，其是指在显示核酸序列特征差异的方法中使用的指示物。其它此类指示物的实例是限制性片段长度多态性(RFLP)标记、扩增片段长度多态性(AFLP)标记、单核苷酸多态性(SNP)、***突变、微卫星标记(SSR)、序列特征扩增区域(SCAR)、切割扩增多态性序列(CAPS)标记或同工酶标记或本文所述的定义特定遗传和染色***置的标记的组合。标记进一步包括编码16S或18S rRNA的多核苷酸序列，以及内部转录间隔区(ITS)序列，其为在小亚单位和大亚单位rRNA基因之间发现的序列，已经证明它们尤其可用于在彼此比较时阐明关系或区别。此外，本公开利用在目的基因(例如，nifH，D，K，L，A、glnE、amtB等)中发现的独特序列来鉴定本文公开的微生物。

主要rRNA亚单位16S的一级结构包含保守、可变和高变区的特定组合，它们以不同的速率进化，并且能够解析非常古老的谱系如结构域和更现代的谱系如属。16S亚单位的二级结构包括大约50个螺旋，其导致约67％的残基的碱基配对。这些高度保守的二级结构特征具有极大的功能重要性，并且可用来确保多序列比对和系统发育分析中的位置同源性。在过去的几十年中，16S rRNA基因已成为测序最多的分类标记，并且是当前细菌和古菌系统分类的基石(Yarza等人2014.Nalure Rev.Micro.12：635-45)。

因此，在某些方面，本公开提供了与表E、F、G或H中的任何序列共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的序列。

因此，在某些方面，本公开提供了包含某种序列的微生物，该序列与SEQ ID NO：62-303共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表F、G和H。

在一些方面，本公开内容提供了包含16S核酸序列的微生物，该16S核酸序列与SEQID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269、277-283共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表G和H。

在一些方面，本公开提供了包含核酸序列的微生物，该核酸序列与SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276、284-295共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表G和H。

在一些方面，本公开提供了包含核酸序列的微生物，该核酸序列与SEQ ID NO：177-260、296-303共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表G和H。

在一些方面，本公开提供了包含核酸序列的微生物，或包含核酸序列的引物，或包含核酸序列的探针，或包含核酸序列的非天然连接序列，该核酸序列与SEQ ID NO：304-424共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表E。

在一些方面，本公开提供了包含非天然连接序列的微生物，该非天然连接序列与SEQ ID NO：372-405共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表E。

在一些方面，本公开提供了包含氨基酸序列的微生物，该氨基酸序列与SEQ IDNO：77、78、81、82或83共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同一性。这些序列及其相关描述可见于表F和H。

遗传变异-检测方法：引物，探针和试验

本公开教导了可用于检测本文教导的微生物的引物、探针和试验。在一些方面，本公开提供了检测WT亲本菌株的方法。在其它方面，本公开提供了检测衍生自WT菌株的非属间工程化微生物的方法。在一些方面，本公开提供了鉴定微生物中的非属间遗传改变的方法。

在一些方面，本公开的基因组工程方法导致在衍生的非属间微生物中产生非天然核苷酸“连接”序列。这些非天然存在的核苷酸连接可以用作一种类型的诊断物，其指示本文教导的微生物中存在特定的遗传改变。

本技术能够通过利用专门的定量PCR方法(包括独特设计的引物和探针)检测这些非天然存在的核苷酸连接。在一些方面，本公开的探针与非天然存在的核苷酸连接序列结合。在一些方面，使用传统的PCR。在其它方面，使用实时PCR。在一些方面，使用定量PCR(qPCR)。

因此，本公开内容可以涵盖用于实时检测PCR产物的两种常用方法的使用：(1)嵌入任何双链DNA的非特异性荧光染料，和(2)由用荧光报道分子标记的寡核苷酸组成的序列特异性DNA探针，其仅在该探针与其互补序列杂交后允许检测。在一些方面，仅有非天然存在的核苷酸连接会通过教导的引物扩增，因此可以通过非特异性染料或通过利用特异性杂交探针进行检测。在其它方面，选择本公开的引物，使得引物位于连接序列的任一侧，使得如果发生扩增反应，则存在所述连接序列。

本公开的方面涉及非天然存在的核苷酸连接序列分子本身，以及能够在温和至严格杂交条件下与所述非天然存在的核苷酸连接序列结合的其它核苷酸分子。在一些方面，能够在温和至严格杂交条件下与所述非天然存在的核苷酸连接序列结合的核苷酸分子被称为“核苷酸探针”。

在一些方面，可以从样品中提取基因组DNA，并用来通过使用qPCR来量化本公开的微生物的存在。在qPCR反应中使用的引物可以是由Primer Blast(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast)设计的引物，用来扩增野生型基因组的独特区域或工程化非属间突变株的独特区域。qPCR反应可以使用SYBR GreenER qPCR SuperMixUniversal(Thermo Fisher P/N 11762100)试剂盒来进行，其中仅使用正向和反向扩增引物；或者，Kapa Probe Force试剂盒(Kapa Biosystems P/N KK4301)可与扩增引物和含有5′端的FAM染料标记物、内部ZEN猝灭剂和小沟结合剂和3′端的荧光猝灭剂的TaqMan探针(Integrated DNA Technologies)一起使用。

表E中列出了某些引物、探针和非天然连接序列。qPCR反应效率可以使用由来自靶基因组的已知量的gDNA产生的标准曲线来测量。可以使用组织重量和提取体积将数据对每g鲜重的基因组拷贝进行归一化。

定量聚合酶链反应(qPCR)是一种实时量化一种或多种核酸序列的扩增的方法。PCR测定的实时定量允许通过比较扩增目的核酸和适当的对照核酸序列来确定PCR扩增步骤产生的核酸的量，该对照核酸序列可以作为校准标准。

TaqMan探针通常在需要增加的特异性来量化靶核酸序列的qPCR测定中使用。TaqMan探针包含寡核苷酸探针，该探针具有附接至探针5′端的荧光团和附接至探针3′端的猝灭剂。当TaqMan探针保持原样，探针的5′和3′端彼此紧密接触时，猝灭剂阻止荧光信号从荧光团传递。TaqMan探针被设计为在由特定引物组扩增的核酸区域内退火。当Taq聚合酶延伸引物并合成新生链时，Taq聚合酶的5′至3′外切核酸酶活性降解与模板退火的探针。该探针降解释放荧光团，从而破坏与猝灭剂的紧密接近，并允许荧光团发荧光。在qPCR测定中检测到的荧光与释放的荧光团和反应中存在的DNA模板的量成正比。

qPCR的特征允许从业者消除准备凝胶电泳的劳动密集的扩增后步骤，而这通常是观察传统PCR测定的扩增产物所必需的。qPCR相比于常规PCR的益处是相当大的，包括提高的速度、易用性、再现性和定量能力。

性状的改良

可采用本公开的方法来引入或改良多种期望性状中的一种或多种。可引入或改良的性状的实例包括：根系生物量、根长、高度、枝条长度、叶数、水分利用效率、总生物量、产量、果实大小、粒度、光合速率、对干旱的耐受性、耐热性、耐盐性、对线虫应激的抗性、对真菌病原体的抗性、对细菌病原体的抗性、对病毒病原体的抗性、代谢物水平和蛋白质组表达。所需的性状(包括：高度、总生物量、根/枝条生物量、种子萌发、幼苗存活、光合效率、蒸腾速率、种子/果实数或质量、植物籽粒或果实产量、叶片叶绿素含量、光合速率、根长或其任何组合)可用于测定生长，并与在相同条件下生长的参照农业植物(例如，未改良性状的植物)的生长速率进行比较。

如本文所述，待引入或改良的优选性状是固氮。在一些情况下，由本文所述方法得到的植物表现出性状差异，其比相同条件下在土壤中生长的参照农业植物大至少约5％，例如至少约5％、至少约8％、至少约10％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约40％、至少约50％、至少约60％、至少约75％、至少约80％、至少约80％、至少约90％或at least 100％、至少约200％、至少约300％、至少约400％或更大。在另外的实例中，由本文所述方法得到的植物表现出性状差异，其比相似条件下在土壤中生长的参照农业植物大至少约5％，例如至少约5％、至少约8％、至少约10％、至少约15％、至少约20％、至少约25％、至少约30％、至少约40％、至少约50％、至少约60％、至少约75％、至少约80％、至少约80％、至少约90％或at least 100％、至少约200％、至少约300％、至少约400％或更大。

可以在包括施加一种或多种生物或非生物应激物的条件下评估待改良的性状。应激物的实例包括非生物应激(如热应激、盐应激、干旱应激、低温应激和低营养应激)和生物应激(如线虫应激、昆虫食草性应激、真菌病原体应激、细菌病原体应激和病毒病原体应激)。

通过本公开的方法和组合物改良的性状可以是固氮，包括在之前不能固氮的植物中固氮。在一些情况下，根据本文所述的方法分离的细菌产生1％或更多(例如，2％、3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、15％、20％或更多)的植物氮，这可表示与引入任何遗传变异之前从第一植物分离的细菌相比，固氮能力增加至少2倍(例如，3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、20倍、50倍、100倍、1000倍或更多倍)。在一些情况下，细菌会产生5％或更多的植物氮。可将引入遗传变异、暴露于多种植物以及从具有改良性状的植物中分离细菌的步骤重复一次或多次(例如，1、2、3、4、5、10、15、25次或更多次)后，实现所期望的固氮水平。在一些情况下，在补充有谷氨酰胺、氨或其它化学氮源的肥料的存在下可实现固氮水平的提高。评估固氮程度的方法是已知的，其实例在本文中描述。

微生物育种是一种系统性地鉴定并改善作物微生物组中物种的作用的方法。该方法包括三个步骤：1)通过对植物-微生物相互作用进行作图并预测与特定表型相关的调节网络来选择候选物种，2)通过调节网络和基因簇的种内交叉来实际和可预测地改善微生物表型，以及3)筛选并选择产生所需作物表型的新微生物基因型。为了系统性地评估菌株的改良，创建了一个模型，其将微生物群落的定植动力学与关键物种的遗传活动联系起来。该模型用来预测遗传目标育种并提高选择微生物组编码的农艺相关性性状改良的频率。

测量在农业相关领域背景下递送的氮

在本领域中，递送的氮的量可以通过定植的函数乘以活性来确定。

上述等式需要(1)每单位植物组织的平均定植，和(2)作为每个微生物细胞固定的氮量或排出的氨量的活性。为了转化为氮的磅数/英亩，随时间追踪玉米生长生理学，例如，在整个成熟阶段植物的大小和相关的根系。

每英亩-季节递送到作物的氮的磅数可以通过以下等式计算：

递送的氮＝∫植物组织(t)×定植(t)×活性(t)dt

植物组织(t)是随生长时间(t)的玉米植物组织鲜重。合理地进行计算的值在题为“根、生长和营养物摄取”的出版物(Mengel.Dept.of Agronomy Pub.#AGRY-95-08(Rev.May-95.p.1-8)中详细描述。

定植(t)是在生长季节期间的任何特定时间t，每克植物组织鲜重，在植物组织中发现的感兴趣的微生物的量。在仅有一个可用时间点的情况下，将单个时间点相对于整个季节的峰值定植率进行归一化，并相应地调整剩余时间点的定植率。

活性(t)是在生长季节期间的任何特定时间t，每单位时间，感兴趣的微生物固定N的速率。在本文公开的实施方案中，在5mM铵离子的存在下，在ARA培养基中存在5mM谷氨酰胺或铵排出测定的情况下，通过ARA培养基中的体外乙炔还原试验(ARA)来近似估计该活性速率。

然后通过上述函数的数值积分来计算氮递送量。在设定时间点离散地测量上述变量的值的情况下，通过进行线性插值来近似估计这些时间点之间的值。

固氮

本文描述了增加植物中的固氮的方法，其包括将该植物暴露于包含一个或多个引入调节固氮的一个或多个基因中的遗传变异的细菌，其中所述细菌在植物中产生1％或更多(例如，2％、5％、10％或更多)的氮，这表示所述植物的固氮能力可以是不存在细菌的植物的至少2倍。该细菌可在补充有谷氨酰胺、尿素、硝酸盐或氨的肥料的存在下产生氮。遗传变异可以是任何数目的本文所述任何遗传变异及任何组合，包括以上提供的实例。该遗传变异可以引入到选自下组的基因中：nifA、nifL、ntrB、ntrC、谷氨酰胺合成酶、glnA、glnB、glnK、draT、amtB、谷氨酰胺酶、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB和nifQ。该遗传变异可以是导致以下一项或多项的突变：nifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；nifL、ntrB、谷氨酰胺合成酶、glnB、glnK、draT、amtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。引入到本文公开的方法的一种或多种细菌的遗传变异可以是敲除突变，或者其可消除靶基因的调节序列，或者其可包含异源调节序列的***，例如在相同细菌物种或属的基因组内发现的调节序列的***。该调节序列可基于细菌培养或植物组织内基因的表达水平来选择。该遗传变异可通过化学诱变产生。步骤(c)中生长的植物可暴露于生物或非生物应激物。

本文所述的植物中发生的固氮量可以以若干种方式进行测量，例如通过乙炔还原(AR)试验。乙炔还原试验可在体外或体内进行。特定细菌为植物提供固定的氮的证据可包括：1)总植物N在接种后显著增加，优选伴随植物中N浓度增加；2)接种后在N限制条件下(应该包括干物质增加)，缺氮症状得以缓解；3)通过使用¹⁵N方法(其可以是同位素稀释实验、¹⁵N₂还原试验或¹⁵N天然丰度测定)记录N₂固定；4)固定的N掺入到植物蛋白质或代谢物中；以及5)在未接种的植物或用接种菌株的突变体接种的植物中未看到所有这些作用。

野生型固氮调节级联反应可以表示为数字逻辑电路，其中输入O₂和NH₄ ⁺通过或非门，其输出除了ATP之外还进入与门。在一些实施方案中，本文公开的方法在调节级联反应中的多个点处破坏NH₄ ⁺对该回路的影响，使得甚至在施肥田间中微生物也可产生氮。然而，本文公开的方法还设想改变ATP或O₂对电路的影响，或用细胞中的其它调节级联反应替代该电路，或改变除固氮以外的遗传电路。基因簇可被重新工程化以在异源调节系统的控制下产生功能性产物。通过消除基因簇编码序列之外和之内的天然调节因子，并用替代的调节系统取代它们，复杂的遗传操纵子和其它基因簇的功能性产物可被控制并且/或者移动到异源细胞(包括衍生天然基因的物种之外的不同物种的细胞)。一旦重新设计，合成基因簇可通过遗传电路或其它诱导型调节系统来控制，从而根据需要控制产物的表达。可将表达盒设计成逻辑门、脉冲发生器、振荡器、开关或存储设备。控制表达盒可以与启动子连接，使得表达盒用作环境传感器，如氧气、温度、触觉、渗透应力、膜应力或氧化还原传感器。

举例来说，nifL、nifA、nifT和nifX基因可从nif基因簇中消除。可通过密码子随机化编码每个氨基酸序列的DNA来设计合成基因。进行密码子选择，指定密码子使用与天然基因中密码子使用尽可能不同。针对任何不希望的特征(如，限制酶识别位点、转座子识别位点、重复序列、σ54和σ70启动子、隐蔽核糖体结合位点和rho独立终止子)扫描推荐的序列。选择合成的核糖体结合位点以匹配每个相应的天然核糖体结合位点的强度，如通过构建荧光报告质粒，其中围绕基因起始密码子的150bp(-60至+90)与荧光基因融合。该嵌合体可在Ptac启动子的控制下表达，并通过流式细胞术测量荧光。为了产生合成的核糖体结合位点，使用150bp(-60至+90)的合成表达盒产生报告质粒文库。简而言之，合成表达盒可以由随机DNA间隔区、编码RBS文库的简并序列和针对每个合成基因的编码序列组成。筛选多个克隆以鉴定与天然核糖体结合位点最佳匹配的合成核糖体结合位点。因此构建由与天然操纵子的相同基因组成的合成操纵子并对功能互补进行测试。US20140329326中提供了合成操纵子的进一步示例性描述。

细菌种

可用于本文公开的方法和组合物的微生物可以从任何来源获得。在一些情况下，微生物可能是细菌、古菌、原生生物或真菌。本公开的微生物可以是固氮微生物，例如固氮细菌、固氮古菌、固氮真菌、固氮酵母或固氮原生生物。可用于本文公开的方法和组合物的微生物可以是孢子形成微生物，例如孢子形成细菌。在一些情况下，可用于本文公开的方法和组合物的细菌可以是***或革兰氏阴性细菌。在一些情况下，该细菌可以是厚壁菌门(Firmicute)的形成内生孢子的细菌。在一些情况下，该细菌可以是固氮生物(diazatroph)。在一些情况下，该细菌可能不是固氮生物(diazotroph)。

本公开的方法和组合物可以使用古菌，例如，嗜热自养甲烷杆菌(Methanothermobacter thermoautotrophicus)。

在一些情况下，可能有用的细菌包括但不限于放射形土壤杆菌(Agrobacteriumradiobacter)、酸热芽孢杆菌(Bacillus acidocaldarius)、酸土芽孢杆菌(Bacillusacidoterrestris)、土壤芽孢杆菌(Bacillus agri)、Bacillus aizawai、乳白芽孢杆菌(Bacillus albolactis)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillus alcalophilus)、蜂房芽孢杆菌(Bacillus alvei)、氨基葡萄糖芽孢杆菌(Bacillus aminoglucosidicus)、噬胺芽孢杆菌(Bacillus aminovorans)、溶淀粉芽孢杆菌(Bacillus amylolyticus)(也称为溶淀粉类芽孢杆菌(Paenibacillus amylolyticus))、解淀粉芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)、解硫胺素芽孢杆菌(Bacillus aneurinolyticus)、萎缩芽孢杆菌(Bacillus atrophaeus)、产氮芽孢杆菌(Bacillus azotoformans)、栗褐芽孢杆菌(Bacillus badius)、蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)(同义词：Bacillus endorhythmos、Bacillus medusa)、Bacillus chitinosporus、环状芽孢杆菌(Bacillus circulaus)、凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulaus)、Bacillus endoparasiticus、苛求芽孢杆菌(Bacillusfastidiosus)、坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)、Bacillus kurstaki、栖乳芽孢杆菌(Bacillus lacticola)、乳病芽孢杆菌(Bacillus lactimorbus)、乳芽孢杆菌(Bacilluslactis)、侧孢芽孢杆菌(Bacillus laterosporus)(也称为侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus))、灿烂芽孢杆菌(Bacillus lautus)、缓病芽孢杆菌(Bacillus lentimorbus)、迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)、地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis)、摩洛哥芽孢杆菌(Bacillus maroccanus)、巨大芽孢杆菌(Bacillusmegaterium)、Bacillus metiens、蕈状芽孢杆菌(Bacillus mycoides)、纳豆芽孢杆菌(Bacillus natto)、Bacillus nematocida、黑色芽孢杆菌(Bacillus nigrificans)、黑芽孢杆菌(Bacillus nigrum)、泛酸芽孢杆菌(Bacillus pantothenticus)、日本甲虫芽孢杆菌(Bacillus popillae)、冷解糖芽孢杆菌(Bacillus psychrosaccharolyticus)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)、Bacillus siamensis、史氏芽孢杆菌(Bacillus smithii)、环形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)、Bacillus uniflagellatus、日本慢生根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)、短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)、侧孢短芽孢杆菌(revibacillus laterosporus)(以前称为侧孢芽孢杆菌(Bacillus laterosporus))、Chromobacterium subtsugae、食酸代尔夫特菌(Delftia acidovorans)、嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)、抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)、产酶溶杆菌(Lysobacter enzymogenes)、Paenibacillus alvei、多粘类芽孢杆菌(Paenibacilluspolymyxa)、Paenibacillus popilliae(以前称为日本甲虫芽胞杆菌(Bacilluspopilliae))、成团泛菌(Pantoea agglomerans)、穿刺巴斯德氏芽菌(Pasteuriapenetrans)(以前称为穿刺芽孢杆菌(Bacillus penetrans))、Pasteuria usgae、胡萝卜软腐果胶杆菌(Pectobacterium carotovorum(以前称为胡萝卜软腐欧文氏菌(Erwiniacarotovora))、绿脓假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、致黄假单胞菌(Pseudomonasaureofaciens)、洋葱假单胞菌(Pseudomonas cepacia)(以前称为洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderia cepacia))、绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)、Pseudomonas proradix、恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、嗜虫沙雷氏菌(Serratiaentomophila)、粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)、Streptomyces colombiensis、鲜黄链霉菌(Streptomyces galbus)、Streptomyces goshikiensis、Streptomycesgriseoviridis、淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)、Streptomyces prasinus、Streptomyces saraceticus、委内瑞拉链霉菌(Streptomyces venezuelae)、野油菜黄单胞菌(Xanthomonas campestris)、发光致病杆菌(Xehorhabdus luminescens)、嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus nematophila)、球状红球菌(Rhodococcus globerulus)AQ719(NRRL保藏号B-21663))、(芽孢杆菌AQ175(ATCC保藏号55608))、(芽孢杆菌AQ 177(ATCC保藏号55609))、(芽孢杆菌AQ178(ATCC保藏号53522)和链霉菌株NRRL保藏号B-30145。在一些情况下，该细菌可以是圆褐固氮菌(Azotobacter chroococcum)、巴氏甲烷八叠球菌(Methanosarcina barkeri)、肺炎克雷伯氏菌(Klesiella pneumoniae)、棕色固氮菌(Azotobacter vinelandii)、球形红杆菌(Rhodobacter spharoides)、英膜红杆菌(Rhodobacter capsulatus)、Rhodobcter palustris、红红螺菌(Rhodosporillumrubrum)、豌豆根瘤菌(Rhizobium leguminosarum)或菜豆根瘤菌(Rhizobium etli)。

在一些情况下，所述细菌可以是梭菌属(Clostridium)的种，例如巴斯德氏梭菌(Clostridium pasteurianum)、拜氏梭菌(Clostridium bcijerinckii)、产气英膜梭菌(Clostridium perfringens)、破伤风梭菌(Clostridium tetani)、丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)。

在一些情况下，与本公开的方法和组合物一起使用的细菌可以是蓝藻。蓝藻属的实例包括鱼腥藻属(Anabaena)(例如鱼腥藻PCC7120)、念珠藻属(Nostoc)(例如念珠藻(Nostoc punctiforme))或集胞藻属(Synechocystis)(例如集胞藻PCC6803)。

在一些情况下，与本公开的方法和组合物一起使用的细菌可以属于绿细菌门(Chlorobi)，例如Chlorobium tepidum。

在一些情况下，与本公开的方法和组合物一起使用的微生物可包含与已知NifH基因同源的基因。已知的NifH基因的序列可见于例如Zehr lab NifH数据库(https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/，2014年4月4日)或Buckley lab NifH数据库(http://www.css.cornell.edu/faculty/buckley/nifh.htm和Gaby，John Christian和Daniel H.Buckley.″A comprehensive aligned nifH gene database：a multipurposetool for studies of nitrogen-fixing bacteria.″Database 2014(2014)：bau001.)在一些情况下，与本公开的方法和组合物一起使用的微生物可包含编码多肽的序列，其与来自Zehrlab NifH数据库(https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/，2014年4月4日)的序列具有至少60％、70％、80％、85％、90％、95％、96％、96％、98％、99％或超过99％的序列同一性。在一些情况下，与本公开的方法和组合物一起使用的微生物可包含编码多肽的序列，其与来自Buckley lab NifH数据库(Gaby，John Christian和DanielH.Buckley.″A comprehensive aligned nifH gene database：a multipurpose tool forstudies of nitrogen-fixing bacteria.″Database 2014(2014)：bau001.)的序列具有至少60％、70％、80％、85％、90％、95％、96％、96％、98％、99％或超过99％的序列同一性。

可用于本文公开的方法和组合物的微生物可通过从天然植物的表面或组织提取微生物来获得；研磨种子以分离微生物；将种子种植在不同的土壤样品中并从组织中回收微生物；或用外源微生物接种植物并确定哪些微生物出现在植物组织中。植物组织的非限制性实例包括种子、幼苗、叶、切片、植物、球茎或块茎。在一些情况下，从种子分离细菌。处理样品的参数可以变化，以分离不同类型的缔合微生物，如根际、附生植物或内生菌。细菌也可能来自储存库(如环境应变集合)，而不是从第一植物最初分离的。通过测序分离微生物的基因组，微生物可以是基因型和表型；对植物中群落的组成进行概况分析；表征群落或分离的微生物的转录功能；或使用选择性或表型培养基(例如，固氮或溶磷表型)筛选微生物特征。选定的候选菌株或群体可以通过序列数据；表型数据；植物数据(例如，基因组、表型和/或产量数据)；土壤数据(例如，pH、N/P/K含量和/或非根际土生物群落)；或它们的任何组合来获得。

本文所述的细菌及产生细菌的方法可适用于能够在叶表面、根表面或植物组织内部有效地自我繁殖而不诱导有害植物防御反应的细菌或对植物防御反应具有抗性的细菌。本文所述的细菌可以通过在未添加氮的培养基中培养植物组织提取物或叶表面洗涤剂来分离。然而，细菌可能是不可培养的，也就是说，使用本领域已知的标准方法不能培养或难以培养。本文所述的细菌可以是内生菌或附生植物或居住在植物根际的细菌(根际细菌)。将引入遗传变异、暴露于多种植物以及从具有改良性状的植物中分离细菌的步骤重复一次或多次(例如，1、2、3、4、5、10、15、25次或更多次)后获得的细菌可以是内生植物的、附生植物的或根际的。内生菌是进入植物内部而没有引起疾病症状或引起共生结构形成的生物体，并且由于它们可以增强植物生长并改善植物的营养(例如，通过固氮)，因此具有农学价值。细菌可以是种子携带的内生菌。种子携带的内生菌包括与草或植物的种子相关或源自其的细菌，如在成熟、干燥、未受损(例如，无裂纹、可见真菌感染或过早萌发)的种子中发现的种子携带的细菌内生菌。种子携带的细菌内生菌可与种子表面相关联或来源于种子表面；备选地或另外地，它可与内部种子隔室(例如，表面灭菌的种子)关联或来源于内部种子隔室。在一些情况下，种子携带的细菌内生菌能够在植物组织内(例如，在种子内部)复制。此外，在一些情况下，种子携带的细菌内生菌能够在干燥的条件下存活。

根据本公开的方法分离的或在本公开的方法或组合物中使用的细菌可包括多种不同的细菌分类群的组合。举例来说，所述细菌可包括变形菌门(如假单胞菌属、肠杆菌属、寡养单胞菌属、伯克霍尔德氏菌属、根瘤菌属、草螺菌属、泛菌属、沙雷氏菌属、拉恩氏菌属、固氮螺菌属、固氮根瘤菌属、固氮菌属、杜氏藻属(Duganella)、代尔夫特菌属(Delftia)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)和盐单胞菌属)、厚壁菌门(如芽孢杆菌属、类芽孢杆菌属、乳杆菌属、枝原体属和Acetabacterium)和放线菌门(如链霉菌属、红球菌属(Rhodacoccus)、微杆菌属和短小杆菌属(Curtobacterium))。在本公开的方法和组合物中使用的细菌可以包括两个或更多个种的固氮细菌共生群。在一些情况下，细菌共生群的一个或多个细菌种可能能够固定氮。在一些情况下，细菌共生群的一个或多个种可促进或增强其它细菌固定氮的能力。固定氮的细菌和增强其它细菌固定氮的能力的细菌可以相同或不同。在一些实例中，细菌菌株在与不同的细菌菌株组合时或在某些细菌共生群中能够固定氮，但在单一培养物中可能无法固定氮。可以在固氮细菌共生群中发现的细菌属的实例包括但不限于草螺菌属(Herbaspirillum)、固氮螺菌属(Azospirillum)、肠杆菌属(Enterobacter)和芽孢杆菌属。

可通过本文公开的方法产生的细菌包括固氮菌属的种、慢生根瘤菌属的种、克雷伯氏菌属的种和中华根瘤菌属的种。在一些情况下，该细菌可选自：棕色固氮菌、日本慢生根瘤菌、肺炎克雷伯氏菌和苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)。在一些情况下，该细菌可以是肠杆菌属或拉恩氏菌属。在一些情况下，该细菌可以是弗兰克氏菌属(Franlia)或梭菌属(Clostridium)。梭菌属细菌的实例包括但不限于丙酮丁醇梭菌、巴斯德氏梭菌、拜氏梭菌，产气英膜梭菌和破伤风梭菌。在一些情况下，该细菌可以是类芽孢杆菌属(Paenibacillus)，例如固氮类芽孢杆菌(Paenibacillus azotofixans)、Paenibacillusborealis、Paenibacillus durus、浸麻类芽胞杆菌(Paenibacillus macerans)、多粘类芽孢杆菌、Paenibacillus alvei、溶淀粉类芽孢杆菌、坎皮纳斯类芽孢杆菌(Paenibacilluscampinasensis)、Paenibacillus chibensis、Paenibacillus glucanolyticus、Paenibacillus illinoisensis、幼虫芽孢杆菌幼虫亚种(Paenibacillus larvaesubsp.Larvae)、幼虫芽孢杆菌Pulvifaciens亚种、Paenibacillus lautus、浸麻类芽胞杆菌、马阔里类芽孢杆菌(Paenibacillus macquariensis)、马阔里类芽孢杆菌、饲料类芽孢杆菌(Paenibacillus pabuli)、Paenibacillus peoriae或多粘类芽孢杆菌。

在一些实例中，根据本公开的方法分离的细菌可以是以下一个或多个分类群的成员：无色杆菌属(Achromobacter)、酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)、食酸菌属(Acidovorax)、Acidovoraz、不动杆菌属(Acinetobacter)、游动放线菌属(Actinoplanes)、Adlercreutzia、气球菌属(Aerococcus)、气单胞菌属(Aeromonas)、阿菲波菌属(Afipia)、壤霉菌属(Agromyces)、曲杆菌属(Ancylobacter)、节杆菌属(Arthrobacter)、Atopostipes、固氮螺菌属(Azospirillum)、芽孢杆菌属、蛭弧菌属(Bdellovibrio)、拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)、包西氏菌属(Bosea)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus)、短波单胞菌属(Brevundimonas)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、Candidatus Haloredivivus、柄杆菌属(Caulobacter)、纤维单胞菌属(Cellulomonas)、纤维弧菌属(Cellvibrio)、金黄杆菌属(Chryseobacterium)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、梭菌属、Coraliomargarita、棒状杆菌属(Corynebacterium)、Cupriavidus、短小杆菌属(Curtobacterium)、Curvibacter、异常球菌属(Deinococcus)、代尔夫特菌属、德库菌属(Desemzia)、Devosia、Dokdonella、Dyella、水栖菌属(Enhydrobacter)、肠杆菌属、肠球菌属(Enterococcus)、欧文氏菌属(Erwinia)、埃希氏菌属(Escherichia)、埃希氏菌属/志贺氏菌属(Shigella)、微小杆菌属(Exiguobacterium)、Ferroglobus、Filimonas、Finegoldia、Flavisolibacter、黄杆菌属(Flavobacterium)、Frigoribacterium、葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)、哈夫尼菌属(Hafnia)、盐棒杆菌属(Halobaculum)、盐单胞菌属(Halomonas)、盐简菌属(Halosimplex)、草螺菌属(Herbaspirillum)、薄层菌属(Hymenobacter)、克雷伯氏菌属、考克氏菌属(Kocuria)、Kosakonia、乳杆菌属(Lactobacillus)、勒克氏菌属(Leclercia)、伦茨氏菌属(Lentzea)、Luteibacter、藤黄单胞菌属(Luteimonas)、Massilia、中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、微杆菌属(Microbacterium)、微球菌属(Micrococcus)、Microvirga、分枝杆菌属(Mycobacterium)、奈瑟菌属(Neisseria)、诺卡氏菌属(Nocardia)、Oceanibaculum、苍白杆菌属(Ochrobactrum)、Okibacterium、Oligotropha、Oryzihumus、嗜草酸菌属(Oxalophagus)、类芽孢杆菌属、Panteoa、泛菌属(Pantoea)、Pelomonas、Perlucidibaca、Plantibacter、Polynucleobacter、丙酸菌属(Propionibacterium)、Propioniciclava、Pseudoclavibacter、假单胞菌属、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、拉恩氏菌属、罗尔斯通菌属(Ralstonia)、Rheinheimera、根瘤菌属(Rhizobium)、红球菌属(Rhodococcus)、红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、Roseateles、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、Sebaldella、沉积物芽盹杆菌属(Sediminibacillus)、Sediminibacterium、沙雷氏菌属(Serratia)、志贺氏菌属、Shinella、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、Sinosporangium、鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、Sphingopyxis、Sphingosinicella、葡萄球菌属(Staphylococcus)、25寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、Strenotrophomonas、链球菌属(Streptococcus)、链霉菌属(Streptomyces)、憎叶菌属(Stygiolobus)、Sulfurisphaera、塔特姆菌属(Tatumella)、Tepidimonas、热单胞菌属(Thermomonas)、硫杆菌属(THiobacillus)、贪噬菌属(Variovorax)、WPS-2属incertae sedis、黄杆菌属(Xanthomonas)和Zimmermannella。

在一些情况下，使用选自以下属中的至少一种的细菌种：肠杆菌属、克雷伯氏菌属、Kosakonia和拉恩氏菌属。在一些情况下，使用来自以下属的细菌种的组合：肠杆菌属、克雷伯氏菌属、Kosakonia和拉恩氏菌属。在一些情况下，所使用的种可以是以下一种或多种：Enterobacter sacchari、变栖克雷伯氏菌、Kosakonia sacchari和水生拉恩氏菌。

在一些情况下，革兰氏阳性微生物可具有钼-铁固氮酶系统，其包含：nifH、nifD、nifK、nifB、nifE、nifN、nifX、hesA、nifV、nifW、nifU、nifS、nifI1和nifI2。在一些情况下，革兰氏阳性微生物可具有钒固氮酶系统，其包含：vnfDG、vnfK、vnfE、vnfN、vupC、vupB、vupA、vnfV、vnfR1、vnfH、vnfR2、vnfA(转录调节物)。在一些情况下，革兰氏阳性微生物可具有仅含铁的固氮酶系统，其包含：anfK、anfG、anfD、anfH、anfA(转录调节物)。在一些情况下，革兰氏阳性微生物可具有包含glnB和glnK(氮信号传导蛋白)的固氮酶系统。在革兰氏阳性微生物中参与氮代谢的酶的一些实例包括glnA(谷氨酰胺合成酶)、gdh(谷氨酸脱氢酶)、bdh(3-羟基丁酸脱氢酶)、谷氨酰胺酶、gltAB/gltB/gltS(谷氨酸合酶)、asnA/asnB(天冬氨酸-氨连接酶/天冬酰胺合成酶)和ansA/ansZ(天冬酰胺酶)。在革兰氏阳性微生物中参与氮转运的蛋白质的一些实例包括amtB(铵转运蛋白)、glnK(铵转运调节物)、glnPHQ/glnQHMP(ATP依赖性谷氨酰胺/谷氨酸转运蛋白)、glnT/alsT/yrbD/yflA(谷氨酰胺样质子同向转运蛋白)和gltP/gltT/yhcl/nqt(谷氨酸样质子同向转运蛋白)。

可能特别感兴趣的革兰氏阳性微生物的实例包括多粘类芽孢杆菌、Paenibacillus riograndensis、类芽孢杆菌属的种、弗兰克氏菌属的种、太阳杆菌属(Heliobacterium)的种、绿螺旋杆菌(Heliobacterium chlorum)、螺旋杆菌属的种、嗜阳菌属(Heliophilum)的种、Heliorestis的种、丙酮丁醇梭菌、梭菌属的种、Mycobacteriumflaum、分枝杆菌属(Mycobacterium)的种、节杆菌属的种(Arthrobacter)、壤霉菌属(Agromyces)的种、Corynebacterium autitrophicum、棒状杆菌属(Corynebacterium)的种、小单孢菌属(Micromonspora)的种、丙酸杆菌属(Propionibacteria)的种、链霉菌属的种和微杆菌属(Microbacterium)的种。

可以在革兰氏阳性微生物中进行的遗传改变的一些实例包括：在环境氮的存在下删除glnR以去除BNF的负调节，在nif簇的直接上游***不同的启动子以消除响应于环境氮的GlnR的调节，突变glnA以降低GS-GOGAT途径的铵同化速率，删除amtB以减少来自培养基的铵的摄取，突变glnA使其在反馈抑制(FBI-GS)状态下组成型地减少GS-GOGAT途径的铵同化。

在一些情况下，glnR是类芽孢杆菌中N代谢和固定的主要调节物。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可能不含有产生glnR的基因。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可能不含有产生glnE或glnD的基因。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可含有产生glnB或glnK的基因。例如类芽孢杆菌WLY78不包含glnB的基因，或其在古菌Methanococcusmaripaludis中发现的同源物nifI1和nifI2。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可以是可变化的。例如，多粘类芽孢杆菌E681缺乏glnK和gdh，具有几种氮化合物转运蛋白，但只有amtB似乎受GlnR控制。在另一个实例中，类芽孢杆菌JDR2具有glnK、gdh和大多数其它中心氮代谢基因，具有许多较少的氮化合物转运蛋白，但具有由GlnR控制的glnPHQ。Paenibacillus riograndensis SBR5含有标准的glnRA操纵子、fdx基因、主要nif操纵子、次级nif操纵子和anf操纵子(编码仅含铁的固氮酶)。在每个这些操纵子的上游发现了推定的glnR/tnrA位点。除了anf操纵子外，GlnR可以调节所有上述操纵子。GlnR可以作为二聚体与这些调节序列中的每一个结合。

类芽孢杆菌N-固定菌株可分为两个亚组：亚组I和亚组II，亚组I仅包含最小的nif基因簇，亚组II包含最小簇加上nifX与hesA之间的未表征的基因，并且通常其它簇重复一些nif基因，如nifH、nifHDK、nifBEN，或编码钒(vanadaium)固氮酶(vnf)或仅含铁固氮酶(anf)基因的簇。

在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可能不含有产生glnB或glnK的基因。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可含有最小nif簇，其具有从sigma-70启动子转录的9个基因。在一些情况下，类芽孢杆菌nif簇可被氮或氧负调节。在一些情况下，类芽孢杆菌的基因组可能不含产生sigma-54的基因。例如，类芽孢杆菌WLY78不含sigma-54的基因。在一些情况下，nif簇可以由glnR和/或TnrA调节。在一些情况下，可以通过改变glnR和/或TnrA的活性来改变nif簇的活性。

在芽孢杆菌中，谷氨酰胺合成酶(GS)被高浓度的细胞内谷氨酰胺反馈抑制，从而导致构象转变(称为FBI-GS)。Nif簇包含针对几种杆菌中的调节物GlnR和TnrA的不同结合位点。GlnR在过量的细胞内谷氨酰胺和AMP的存在下结合并抑制基因表达。GlnR的作用可能是在高氮利用度的条件下防止谷氨酰胺和铵的流入和细胞内产生。TnrA可以在限制性细胞内谷氨酰胺的存在下和/或在FBI-GS的存在下结合和/或激活(或抑制)基因表达。在一些情况下，可以通过改变GlnR的活性来改变芽孢杆菌nif簇的活性。

反馈抑制的谷氨酰胺合成酶(FBI-GS)可以结合GlnR并稳定GlnR与识别序列的结合。几种细菌种在nif簇上游具有GlnR/TnrA结合位点。改变FBI-GS和GlnR的结合可以改变nif途径的活性。

微生物的来源

所述细菌(或根据本公开的任何微生物)可从任何一般的陆地环境(包括其土壤、植物、真菌、动物(包括无脊椎动物)和其它生物；包括湖泊和河流的沉积物、水和生物)；海洋环境，其生物和沉积物(例如，海水、海泥、海洋植物、海洋无脊椎动物(例如，海绵)、海洋脊椎动物(例如，鱼类))；陆地和海洋地圈(表土和岩石，例如地下碎石、沙子和粘土)；冰冻圈及其融水；大气(例如，过滤的空中尘埃、云雾和雨滴)；城市、工业和其它人造环境(例如，在混凝土、路边排水沟、屋顶表面和路面上堆积的有机和矿物质)中获得。

从中获得细菌(或根据本公开的任何微生物)的植物可以是具有一种或多种期望性状的植物，例如在特定环境或在特定感兴趣的条件下天然生长的植物。举例来说，某种植物可自然生长在高盐度的沙质土壤或沙地中，或者在极端温度下，或者几乎没有水，或者它可以抵抗环境中存在的某些害虫或疾病，并且它对于在这种条件下生长经济作物是所需的，特别是如果这些条件是例如在特定地理位置可获得的唯一条件。作为进一步的实例，可从在这样的环境中生长的经济作物中收集细菌，或者更具体地从在任何特定环境下生长的作物中显示出最感兴趣的性状的单个作物中收集：例如，在盐限制土壤中生长的作物中生长速度最快的植物、或受到严重昆虫损害或疾病流行的作物中受损最小的植物、或具有期望量的某些代谢物和其它化合物(包括纤维含量、含油量等)的植物、或展现所需颜色、味道或气味的植物。可从感兴趣的植物或在感兴趣的环境中存在的任何物质(包括真菌和其它动物和植物生物、土壤、水、沉积物和前面提到的环境的其它元素)中收集细菌。

所述细菌(或根据本公开的任何微生物)可从植物组织中分离。该分离可以发生在植物的任何合适的组织中，包括例如根、茎和叶以及植物再生组织。举例来说，用于从植物分离的常规方法通常包括无菌切除感兴趣的植物材料(例如，根或茎长、叶)、用合适的溶液(例如，2％的次氯酸钠)进行表面灭菌，之后将植物材料放置在营养培养基上用于微生物生长。或者，表面灭菌的植物材料可在无菌液体(通常为水)和液体悬浮液中粉碎，包括小片的植物材料散布在合适的固体琼脂培养基或培养基的表面上，这可以是或可以不是有选择性的(例如，只含有植酸作为磷的来源)。这种方法对于细菌是特别有用的，该细菌可形成分离的菌落，并且可以单独地挑取以分离营养培养基平板，并通过众所周知的方法进一步纯化成单一物种。或者，未对植物根部或叶子样品进行表面杀菌，而只是在分离过程中温和地洗涤(包括表面居住的附生微生物)，或者通过在琼脂培养基的表面上压印及提取植物根、茎或叶，然后如上所述分离单菌落，可以分别分离附生微生物。例如，该方法对细菌特别有用。或者，可以处理根部而不洗掉附着在根上的少量土壤，包括在植物根际定植的微生物。另外，可去除粘附于根部的土壤、稀释并散布在合适的选定和非选定培养基的琼脂上以分离根际细菌的单菌落。

国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约

本公开的微生物保藏是根据“国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约”(布达佩斯条约)的规定进行的。

申请人声明，根据37 C.F.R.§1.808(a)(2)，“保***对公众获取保藏材料的所有限制将在授予专利权后不可撤销地取消。”本声明依据本节(b)款(即37 C.F.R.§1.808(b))。

水生拉恩氏菌和Enterobacter sacchari的生物学纯培养物于2015年7月14日保藏在美国典型培养物保藏中心(ATCC；国际保藏机构)(10801 University Blvd.，Manassas，VA 20110，USA)，并且分别给予ATTC专利保藏号PTA-122293和PTA-122294。适用的保藏信息见以下表A。

Enterobacter sacchari现已被重新分类为Kosakonia sacchari，该生物体的名称可在整篇文稿中互换使用。

本公开的许多微生物衍生自两个野生型菌株，如图18和图19所示。菌株CI006是先前被分类为肠杆菌属的细菌种(参见上述重新分类为Kosakonia)，图19确定了衍生自CI006的突变体的谱系。菌株CI019是分类为拉恩氏菌属的细菌种，图19确定了衍生自CI019的突变体的谱系。关于图18和图19，应当指出名称中包含CM的菌株是紧邻所述CM菌株左侧描绘的菌株的突变体。CI006 Kosakonia野生型(WT)和CI019拉恩氏菌WT的保藏信息见以下表A。

本申请中描述的一些微生物于2017年1月6日或2017年8月11日保藏于BigelowNational Center for Marine Algae and Microbiota(NCMA)，其位于60 Bigelow Drive，East Boothbay，Maine 04544，USA。如上所述，所有保藏均根据“国际承认用于专利程序的微生物保存布达佩斯条约”的条款进行。表A中提供了用于上述布达佩斯条约保藏的Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota保藏号和保藏日期

Kosakonia sacchari(WT)、水生拉恩氏菌(WT)和变异Kosakonia sacchari菌株的生物学纯的培养物于2017年1月6日保藏于Bigelow National Center for Marine Algaeand Microbiota(NCMA)，其位于60 Bigelow Drive，East Boothbay，Maine 04544，USA，并分别给予NCMA专利保藏号201701001、201701003和201701002。适用的保藏信息见以下表A。

变异Kosakonia sacchari菌株的生物学纯的培养物于2017年8月1日保藏于Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota(NCMA)，其位于60Bigelow Drive，East Boothbay，Maine 04544，USA，并分别给予NCMA专利保藏号201708004、201708003和201708002。适用的保藏信息见以下表A。

变栖克雷伯氏菌(WT)的生物学纯的培养物于2017年8月11日保藏于BigelowNational Center for Marine Algae and Microbiota(NCMA)，其位于60 Bigelow Drive，East Boothbay，Maine 04544，USA，并给予NCMA专利保藏号201708001。两种变栖克雷伯氏菌变体的生物学纯的培养物于2017年12月20日保藏于Bigelow National Center forMarine Algae and Microbiota(NCMA)，其位于60 Bigelow Drive，East Boothbay，Maine04544，USA，并分别给予NCMA专利保藏号201712001和201712002。适用的保藏信息见以下表A。

表A：根据布达佩斯条约保藏的微生物

分离的和生物学纯的微生物

在某些实施方案中，本公开提供了分离的和生物学纯的微生物，它们尤其在农业中具有应用。所公开的微生物可以以其分离的和生物学纯的状态使用，以及配制成组合物(参见下面的示例性组合物描述部分)。此外，本公开提供了含有所公开的分离的和生物学纯的微生物的至少两个成员的微生物组合物，以及利用所述微生物组合物的方法。此外，本公开提供了通过利用所公开的分离的和生物学纯的微生物来调节植物中的固氮的方法。

在一些方面，本公开的分离的和生物学纯的微生物是来自表A的那些微生物。在其它方面，本公开的分离的和生物学纯的微生物衍生自表A的微生物。例如，本文提供了来自表A的微生物的菌株、子代、突变体或衍生物。本公开考虑到表A中列出的微生物的所有可能的组合，所述组合有时形成微生物共生群。来自表A的微生物，无论是单独地还是任意组合地，都可以与本公开中提到的任何植物、活性物质(合成的、有机的等)、佐剂、载体、补充物或生物剂组合。

组合物

包含根据本文所述方法产生的和/或具有本文所述特征的细菌或细菌群体的组合物可以是液体、泡沫或干燥产品的形式。包含根据本文所述方法产生的和/或具有本文所述特征的细菌或细菌群体的组合物也可以用来改良植物性状。在一些实例中，包含细菌群体的组合物可以是干粉、粉末和水的浆液或可流动的种子处理物的形式。包含细菌群体的组合物可以涂覆在种子的表面上，并且可以是液体形式。

所述组合物可以在生物反应器如连续搅拌罐反应器、间歇反应器和农场中制备。在一些实例中，组合物可以储存在容器如壶中或小批储存。在一些实例中，组合物可以储存在选自瓶子、罐子、安瓿、包装、器皿、袋子、盒子、箱子、包封、纸箱、容器、筒仓、运输容器、车厢和/或箱体的物体中。

组合物也可用来改良植物性状。在一些实例中，可将一种或多种组合物涂覆到种子上。在一些实例中，可将一种或多种组合物涂覆到幼苗上。在一些实例中，可将一种或多种组合物涂覆到种子表面上。在一些实例中，可将一种或多种组合物涂覆为种子表面上的层。在一些实例中，涂覆在种子上的组合物可以是液体形式、干燥产品形式、泡沫形式、粉末和水的浆液形式，或可流动的种子处理物的形式。在一些实例中，可以通过用一种或多种组合物对种子和/或幼苗进行喷洒、浸渍、涂覆、包封和/或撒粉而将一种或多种组合物施加至种子和/或幼苗。在一些实例中，可以将多种细菌或细菌群体涂覆到植物的种子和/或幼苗上。在一些实例中，细菌组合的至少两种、至少三种、至少四种、至少五种、至少六种、至少七种、至少八种、至少九种、至少十种或超过十种细菌可以选自以下属之一：食酸菌属、土壤杆菌属(Agrobacterium)、芽孢杆菌属、伯克霍尔德氏菌属、金黄杆菌属、短小杆菌属、肠杆菌属、埃希氏菌属、甲基杆菌属、类芽孢杆菌属、泛菌属、假单胞菌属、罗尔斯通菌属、糖芽胞杆菌属(Saccharibacillus)、鞘氨醇单胞菌属和寡养单胞菌属。

在一些实例中，内生组合的至少两种、至少三种、至少四种、至少五种、至少六种、至少七种、至少八种、至少九种、至少十种或超过十种细菌和细菌群体选自以下科之一：芽孢杆菌科(Bacillaceae)、伯克氏菌科(Burkholderiaceae)、丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、黄杆菌科(Flavobacteriaceae)、甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)、微杆菌科(Microbacteriaceae)、类芽孢杆菌科(Paenibacillileae)、假单胞菌科(Pseudomonnaceae)、根瘤菌科(Rhizobiaceae)、鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、黄色单胞菌科(Xanthomonadaceae)、Cladosporiaceae、日规壳菌科(Gnomoniaceae)、Incertae sedis、Lasiosphaeriaceae、Netriaceae和多孢菌科(Pleosporaceae)。

在一些实例中，内生组合的至少两种、至少三种、至少四种、至少五种、至少六种、至少七种、至少八种、至少九种、至少十种或超过十种细菌和细菌群体选自以下科之一：芽孢杆菌科(Bacillaceae)、伯克氏菌科(Burkholderiaceae)、丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、黄杆菌科(Flavobacteriaceae)、甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)、微杆菌科(Microbacteriaceae)、类芽孢杆菌科(Paenibacillileae)、假单胞菌科(Pseudomonnaceae)、根瘤菌科(Rhizobiaceae)、鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、黄色单胞菌科(Xanthornonadaceae)、Cladosporiaceae、日规壳菌科(Gnomoniaceae)、Incertae sedis、Lasiosphaeriaceae、Netriaceae和多孢菌科(Pleosporaceae)。

组合物的实例可包括用于商业上重要的农作物(例如，高粱、油菜、番茄、草莓、大麦、稻、玉米和小麦)的种子包衣。组合物的实例还可包括用于玉米、大豆、油菜、高粱、马铃薯、稻、蔬菜、谷物和油籽的种子包衣。本文提供的种子可以是遗传修饰的生物体(GMO)，非GMO的、有机的或常规的。在一些实例中，可以将组合物喷洒在植物的地上部分，或者通过***播种植物种子的犁沟中、向土壤浇水、或将根浸入组合物的悬浮液中而施加至根部。在一些实例中，组合物可以以维持细胞活力及人工接种并定植于宿主植物的能力的合适方式脱水。细菌种可以以10⁸-10¹⁰CFU/ml的浓度存在于组合物中。在一些实例中，组合物可补充有痕量金属离子，例如钼离子、铁离子、锰离子或这些离子的组合。本文所述组合物的实例中的离子浓度可在约0.1mM至约50mM之间。一些组合物实例还可以与载体(如β-葡聚糖、羧甲基纤维素(CMC)、细菌胞外聚合物质(EPS)、糖、动物乳或其它合适的载体)一起配制。在一些实例中，可以使用泥炭或种植材料作为载体，或者其中组合物被包埋在生物聚合物中的生物聚合物可用作载体。包含本文所述的细菌群体的组合物可改良植物性状，如促进植物生长、维持叶片中高叶绿素含量、增加果实或种子数量以及增加果实或种子单位重量。

包含本文所述的细菌群体的组合物可以涂覆到种子的表面上。如此，也考虑包含用本文所述的一种或多种细菌涂覆的种子的组合物。种子包衣可通过将细菌群体与多孔的、化学惰性的粒状载体混合而形成。或者，可将该组合物直接***到播种种子的犁沟中，或喷洒到植物叶子上，或通过将根浸入组合物的悬浮液中而施用。可以使用有效量的组合物来填充邻近具有活细菌生长的植物根部的土壤下部分，或者填充具有活细菌生长的植物叶子。通常，有效量是足以使植物具有改良的性状(例如，期望的固氮水平)的量。

本文所述的细菌组合物可使用农业上可接受的载体来配制。可用于这些实施方案的制剂可包括选自增粘剂、微生物稳定剂、杀真菌剂、抗菌剂、防腐剂、稳定剂、表面活性剂、抗复合剂、除草剂、杀线虫剂、杀虫剂、植物生长调节剂、肥料、灭鼠剂、干燥剂、杀细菌剂、营养物或其任何组合中的至少一种。在一些实例中，组合物可以是货架稳定的。例如，本文所述的任何组合物可包含农业上可接受的载体，例如，一种或多种肥料(如非天然存在的肥料)、粘合剂(如非天然存在的粘合剂)以及杀虫剂(如非天然存在的杀虫剂)。非天然存在的粘合剂可以是例如聚合物、共聚物或合成蜡。例如，本文所述的任何包衣的种子、幼苗或植物可在种子包衣中含有此类农业上可接受的载体。在本文所述的任何组合物或方法中，农业上可接受的载体可以是或可包括非天然存在的化合物(例如，非天然存在的肥料、非天然存在的粘合剂(如聚合物、共聚物或合成蜡)或非天然存在的杀虫剂)。下面描述农业上可接受的载体的非限制性实例。农业上可接受的载体的其它实例是本领域已知的。

在一些情况下，细菌与农业上可接受的载体混合。该载体可以是固体载体或液体载体，并且可以包括微球、粉末、乳剂等各种形式。载体可以是赋予各种性质(如，增加的稳定性、润湿性或分散性)的许多载体中的任何一种或多种。润湿剂如天然或合成表面活性剂(其可以是非离子型或离子型表面活性剂)或其组合可以包括在该组合物中。油包水乳液也可用于配制包含分离的细菌的组合物(参见例如美国专利7,485,451)。可以制备的合适制剂包括可湿性粉剂、颗粒剂、凝胶剂、琼脂条或丸剂、增稠剂等、微囊化颗粒等、诸如水流动剂的液体、水性悬液、油包水乳剂等。该制剂可包括谷物或豆类产品，例如磨碎的谷物或豆类、由谷物或豆类得到的汤或面粉、淀粉、糖或油。

在一些实施方案中，农业载体可以是土壤或植物生长培养基。可以使用的其它农业载体包括水、肥料、基于植物的油、保湿剂或其组合。或者，该农业载体可以是固体，如硅藻土、壤土、二氧化硅、藻酸盐、粘土、膨润土、蛭石、果皮、其它植物和动物产品或其组合，其包括颗粒剂、丸剂或悬浮液。还可考虑将任何上述成分的混合物作为载体，诸如但不限于pesta(面粉和高岭土)，在壤土、沙子或粘土等中的琼脂或基于粉状物的丸块。制剂可包括细菌的食品来源(如大麦、稻或其它生物材料(如种子、植物部分、蔗渣))、来自谷物加工的外壳或茎秆、来自建筑工地废物的磨碎的植物材料或木材、来自再循环纸、织物或木材的锯屑或小纤维。

例如，肥料可有助于促进生长或为种子、幼苗或植物提供营养物。肥料的非限制性实例包括氮、磷、钾、钙、硫、镁、硼、氯化物、锰、铁、锌、铜、钼和硒(或其盐)。肥料的其它实例包括氨基酸、盐、碳水化物、维生素、葡萄糖、NaCl、酵母提取物，NH₄H₂PO₄、(NH₄)₂SO₄、甘油、缬氨酸、L-亮氨酸、乳酸、丙酸、琥珀酸、苹果酸、柠檬酸、KH酒石酸、木糖、来苏糖和卵磷脂中的一种或多种。在一个实施方案中，该制剂可包含增粘剂或粘附剂(被称为粘合剂)以帮助将其它活性剂与物质(例如，种子的表面)结合。此类试剂可用于将细菌与可含有其它化合物的载体(例如，非生物控制剂)组合以产生涂层组合物。此类组合物有助于在植物或种子周围产生涂层，以保持微生物和其它试剂与植物或植物部分之间的接触。在一个实施方案中，粘合剂选自藻酸盐、树胶、淀粉、卵磷脂、芒柄花素(formononetin)、聚乙烯醇、芒柄花碱(alkali formononetinate)、橙皮素、聚醋酸乙烯酯、脑磷脂、***树胶、黄原胶、矿物油，聚乙二醇(PEG)、聚乙烯吡咯烷酮(PVP)、***半乳聚糖、甲基纤维素、PEG 400、壳聚糖、聚丙烯酰胺、聚丙烯酸酯、聚丙烯腈、甘油、三甘醇、乙酸乙烯酯、吉兰糖胶、聚苯乙烯、聚乙烯、羧甲基纤维素、印度胶和聚氧乙烯-聚氧丁烯嵌段共聚物。

在一些实施方案中，粘合剂可以是例如，蜡(如巴西棕榈蜡、蜂蜡、中国蜡、紫胶蜡、鲸蜡、小烛树蜡、蓖麻蜡、小冠巴西棕蜡和米糠蜡)、多糖(例如，淀粉、糊精、麦芽糖糊精、藻酸盐和壳聚糖)、脂肪、油、蛋白质(例如，明胶和玉米)、浮胶(gum arables)和虫胶。粘合剂可以是非天然存在的化合物，例如聚合物、共聚物和蜡。例如，可用作粘合剂的聚合物的非限制性实例包括：聚醋酸乙烯酯、聚醋酸乙烯酯共聚物、乙烯醋酸乙烯酯(EVA)共聚物、聚乙烯醇、聚乙烯醇共聚物、纤维素(例如，乙基纤维素、甲基纤维素、羟甲基纤维素、羟丙基纤维素和羧甲基纤维素)、聚乙烯吡咯烷酮、氯乙烯、偏二氯乙烯共聚物、木质素磺酸钙、丙烯酸共聚物、聚乙烯丙烯酸酯、聚环氧乙烷、酰胺聚合物和共聚物、聚羟乙基丙烯酸酯、甲基丙烯酰胺单体和聚氯丁烯。

在一些实例中，粘合剂、抗真菌剂、生长调节剂和杀虫剂(例如，杀虫剂)中的一种或多种是非天然存在的化合物(例如，以任何组合)。农业上可接受的载体的其它实例包括分散剂(例如，聚乙烯吡咯烷酮/乙酸乙烯酯PVPIVA S-630)、表面活性剂、粘结剂和填充剂。

所述制剂还可包含表面活性剂。表面活性剂的非限制性实例包括诸如Prefer 28(Cenex)、Surf-N(US)、Inhance(Brandt)、P-28(Wilfarm)和Patrol(Helena)的氮-表面活性剂混合物；酯化的种子油包括Sun-It II(AmCy)、MSO(UAP)、Scoil(Agsco)、Hasten(Wilfarm)和Mes-100(Drexel)；以及有机硅表面活性剂包括Silwet L77(UAP)、Silikin(Terra)、Dyne-Amic(Helena)、Kinetic(Helena)、Sylgard 309(Wilbur-Ellis)和Century(Precision)。在一个实施方案中，该表面活性剂以0.01％v/v至10％v/v的浓度存在。在另一个实施方案中，该表面活性剂以0.1％v/v至1％v/v的浓度存在。

在某些情况下，所述制剂包含微生物稳定剂。此类试剂可包括干燥剂，该干燥剂可包含可以分类为干燥剂的任何化合物或化合物的混合物，而不管所述化合物是否以其实际上对液体接种剂具有干燥作用的浓度使用。此类干燥剂理想地与所使用的细菌群体相容，并且应该促进微生物群体在种子上施用以及在干燥下存活的能力。合适的干燥剂的实例包括海藻糖、蔗糖、甘油和甲二醇中的一种或多种。其它合适的干燥剂包括但不限于非还原糖和糖醇(例如，甘露醇或山梨糖醇)。引入到制剂中的干燥剂的量按重量计可为每体积约5％至约50％，例如，约10％至约40％、约15％至约35％、或约20％至约30％。在一些情况下，制剂含有诸如杀真菌剂、抗菌剂、除草剂、杀线虫剂、杀虫剂、植物生长调节剂、灭鼠剂、杀细菌剂或营养物等试剂是有利的。在一些实例中，试剂可包括提供针对种子表面带有的病原体的保护的保护剂。在一些实例中，保护剂可以提供对土壤传播的病原体的一定程度的控制。在一些实例中，保护剂可主要在种子表面上有效。

在一些实例中，杀真菌剂可包括化合物或试剂，无论是化学的还是生物的，其可以抑制真菌的生长或杀死真菌。在一些实例中，杀真菌剂可包括可以抑制真菌或杀真菌的化合物。在一些实例中，杀真菌剂可以是主要在种子表面上有效的保护剂或试剂，提供针对种子表面带有的病原体的保护并提供对土壤传播的病原体的一定程度的控制。保护性杀真菌剂的非限制性实例包括克菌丹(captan)、代森锰(maneb)、福美双(thiram)或咯菌腈(fludioxonil)。

在一些实例中，杀真菌剂可以是内吸性杀真菌剂，其可被吸收到新出现的幼苗中并抑制或杀死宿主植物组织内的真菌。用于种子处理的内吸性杀真菌剂包括但不限于以下物质：嘧菌酯(azoxystrobin)、萎锈灵(carboxin)、精甲霜灵(mefenoxam)、甲霜灵(metalaxyl)、噻苯哒唑(thiabendazole)、肟菌酯(trifloxystrobin)和各种***类杀真菌剂，包括苯醚甲环唑(difenoconazole)、环戊唑醇(ipconazole)、戊唑醇(tebuconazole)和灭菌唑(triticonazole)。精甲霜灵和甲霜灵主要用于靶向水霉菌真菌腐霉属(Pythium)和疫霉属(Phytophthora)。取决于植物物种，一些杀真菌剂优于其它杀真菌剂，这是因为致病真菌物种的敏感性的细微差异，或者是因为杀真菌剂分布或植物敏感性的差异。在一些实例中，杀真菌剂可以是生物控制剂，如细菌或真菌。这类生物体可寄生于致病真菌，或分泌毒素或其它可杀死或以其它方式阻止真菌生长的物质。任何类型的杀真菌剂，特别是通常用于植物的杀真菌剂，可用作种子组合物中的控制剂。

在一些实例中，种子包衣组合物包含具有抗菌性质的控制剂。在一个实施方案中，具有抗菌性质的控制剂选自本文其它地方描述的化合物。在另一个实施方案中，该化合物是链霉素、土霉素、噁喹酸或庆大霉素。可用作种子包衣组合物的一部分的抗菌化合物的其它实例包括基于菌霉净和苯甲醇半缩甲醛(benzylalcohol hemi formal)的化合物(来自ICI的

或来自Thor Chemie的

RS，和来自Rohm&Haas的

MK25)，和异噻唑啉酮衍生物，如烷基异噻唑啉酮和苯并异噻唑啉酮(来自Thor Chemie的

MBS)。

在一些实例中，生长调节剂选自：脱落酸、酰胺氯(amidochlor)、环丙嘧啶醇(ancymidol)、6-苄氨基嘌呤、芸苔素内酯、仲丁灵(butralin)、矮壮素(chlormequat)(矮壮素氯化物)、氯化胆碱、环丙酰草胺(cyclanilide)、丁酰肼(daminozide)、调呋酸(dikegulac)、噻节因(dimethipin)、2，6-二甲基嘌呤、乙烯利(ethephon)、氟节胺(flumetralin)、呋嘧醇(flurprimidol)、嗪草酸(fluthiacet)、氯吡脲(forchlorfenuron)、赤霉酸、抗倒胺(inabenfide)、吲哚-3-乙酸、马来酰肼、氟草磺(mefluidide)、缩节胺(mepiquat)(缩节胺氯化物)、萘乙酸、N-6-苄基腺嘌呤、多效唑(paclobutrazol)、调环酸三硫代磷酸酯(prohexadione phosphorotrithioate)、2，3，5-三碘苯甲酸、抗倒酯(trinexapac-ethyl)和烯效唑(uniconazole)。生长调节剂的其它非限制性实例包括油菜素类固醇、细胞激动素(例如，激动素和玉米素)、植物生长激素(例如，吲哚乙酸和吲哚乙酰天冬氨酸)、类黄酮和异类黄酮(例如，芒柄花素和香叶木素)、植物抗毒素(phytoaixins)(例如，大豆抗毒素(glyceolline))和植物抗毒素诱导的寡糖(例如，果胶、角素、壳聚糖、多聚半乳糖醛酸和寡聚半乳糖醛酸)以及gibellerins。此类试剂理想地与在其上施加该制剂的农业种子或幼苗相容(例如，它不应该对植物的生长或健康有害)。此外，理想地，所述试剂是不会引起人类、动物或工业用途的安全性问题的试剂(例如，没有安全问题，或者所述化合物非常不稳定以至于源自植物的商品植物产品只含有可忽略量的化合物)。

线虫拮抗生物控制剂的一些实例包括ARF18；30节丛孢(Arthrobotrys spp.)；毛壳属的种(Chaetomium spp.)；柱孢属的种(Cylindrocarpon spp.)；外瓶霉属的种(Exophilia spp.)；镰孢属的种(Fusarium spp.)；帚霉属的种(Gliocladium spp.)；被毛孢属的种(Hirsutella spp.)；轮枝属的种(Lecanicillium spp.)；单顶孢属的种(Monacrosporium spp.)；漆斑菌属的种(Myrothecium spp.)；新赤壳属的种(Neocosmospora spp.)；拟青霉属的种(Paecilomyces spp.)；普可尼亚属的种(Pochoniaspp.)；壳多胞菌属的种(Stagonospora spp.)；囊状树霉菌根真菌(vesicular-arbuscularmycorrhizal fungi)、伯克氏菌属的种(Burkholderia spp.)；巴斯德氏芽菌属的种(Pasteuria spp.)、短芽孢杆菌属的种(Brevibacillus spp.)；假单胞菌属的种；和根际细菌。特别优选的线虫拮抗生物控制剂包括ARFl8、少孢节丛孢(Arthrobotrys oligospora)、指状节丛孢(Arthrobotrys dactyloides)、球毛壳菌(Chaetomium globosum)、Cylindrocarpon heteronema、Exophilia jeanselmei、Exophilia pisciphila、Fusariumaspergilus、腐皮镰孢(Fusarium solani)、链孢粘帚霉(Gliocladium catenulatum)、粉红粘帚霉(Gliocladium roseum)、Gliocladium vixens、洛斯里被毛孢(Hirsutellarhossiliensis)、明尼苏达被毛孢(Hirsutella minnesotensis)、蜡蚧轮枝菌(Lecanicillium lecanii)、Monacrosporium drechsleri、Monacrosporiumgephyropagum、Myrotehcium verrucaria、Neocosmospora vasinfecta、淡紫色拟青霉(Paecilomyces lilacinus)、厚垣孢普可尼亚菌(Pochonia chlamydosporia)、Stagonospora heteroderae、Stagonospora phaseoli、囊状树霉菌根真菌、洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia)、Pasteuria penetrans、Pasteuria thornei、Pasteurianishizawae、分支巴斯德氏菌(Pasteuria ramosa)、Pastrueia usage、侧孢短芽孢杆菌G4株、荧光假单胞菌和根际细菌。

营养物的一些实例可选自氮肥，包括但不限于尿素、硝酸铵、硫酸铵、无压力氮溶液、氨水、无水氨、硫代硫酸铵、含硫尿素、尿素-甲醛、IBDU、含聚合物尿素、硝酸钙、脲甲醛(Ureaform)和亚甲基脲，磷肥，如磷酸氢二铵、磷酸二氢铵、多聚磷酸铵、浓过磷酸钙和三过磷酸钙，和钾肥，如氯化钾、硫酸钾、硫酸镁钾、硝酸钾。这类组合物可以作为种子包衣组合物中的游离盐或离子存在。或者，营养物/肥料可以复合或螯合以随时间提供持续释放。

灭鼠剂的一些实例可包括选自下组的物质：2-异戊酰基茚-1，3-二酮、4-(喹喔啉-2-基氨基)苯磺酰胺、α-氯代醇、磷化铝、安妥(antu)、氧化砷、碳酸钡、双鼠脲(bisthiosemi)、溴鼠隆(brodifacoum)、溴敌隆(bromadiolone)、溴鼠胺(bromethalin)、氰化钙、氯醛糖、氯敌鼠(chlorophacinone)、胆钙化醇、氯灭鼠灵(coumachlor)、克灭鼠(coumafuryl)、杀鼠迷(coumatetralyl)、鼠立死(crimidine)、鼠得克(difenacoum)、噻鼠灵(difethialone)、敌鼠(diphacinone)、麦角钙化醇(ergocalciferoi)、氟鼠灵(flocoumafen)、氟乙酰胺(fluoroacetamide)、氟鼠啶(flupropadine)、氟鼠啶盐酸盐、氰化氢、碘甲烷、林丹(lindane)、磷化镁、甲基溴、鼠特灵(norbormide)、毒鼠磷(phosacetim)、磷化氢、磷、杀鼠酮(pindone)、***、灭鼠优(pyrinuron)、海葱糖苷(scilliroside)、***、***、氟乙酸钠、***(strychnine)、硫酸铊、华法林和磷化锌。

以液体例如溶液或悬浮液的形式，可将细菌群体混合或悬浮于水中或水溶液中。合适的液体稀释剂或载体包括水、水溶液、石油馏出物或其它液体载体。

固体组合物可通过将细菌群体分散在适当分开的固体载体如泥炭、小麦、麸、蛭石、粘土、滑石、膨润土、硅藻土、漂白土、巴氏杀菌的土壤等中来制备得到。当此类制剂用作可湿性粉剂时，可使用生物相容的分散剂，如非离子型、阴离子型、两性或阳离子型分散剂和乳化剂。

配制时使用的固体载体例如包括诸如高岭土、叶蜡石、膨润土、蒙脱石、硅藻土、酸性白土、蛭石和珠光体等矿物载体，以及诸如硫酸铵、磷酸铵、硝酸铵、尿素、氯化铵和碳酸钙等无机盐。另外，可使用诸如小麦粉、麦麸、米糠等有机细粉。液体载体包括植物油(如大豆油和棉籽油)、甘油、乙二醇、聚乙二醇、丙二醇、聚丙二醇等。

细菌群体在作物上的施加

本文所述的细菌或细菌群体的组合物可以在犁沟中、在滑石中或作为种子处理物施加。该组合物可以施加至散装、小批、袋装或在滑石中的种子包装。

种植者可以按照常规方式、以双排或不需要耕种的方式种植经处理的种子并使作物生长。可以使用控制料斗或单个料斗分配种子。也可以使用加压空气或手动分配种子。可以使用可变速率技术进行种子布置。另外，可以使用可变速率技术进行本文描述的细菌或细菌群体的施加。在一些实例中，细菌可以施加至玉米、大豆、油菜、高粱、马铃薯、稻、蔬菜、谷物、假谷物(pseudocereals)和油籽的种子。谷物的实例可包括大麦、fonio、燕麦、palmer草、黑麦、珍珠粟、高粱、spelt、teff、黑小麦和小麦。假谷物的实例可包括面包果(breadnut)、荞麦、香蒲、芡欧鼠尾草(chia)、亚麻、籽粒苋(grain amaranth)、hanza、藜麦和芝麻。在一些实例中，种子可以是遗传修饰的生物体(GMO)、非GMO、有机的或常规的。

可以另外使用诸如微肥、PGR、除草剂、杀虫剂和杀真菌剂等添加剂来处理作物。添加剂的实例包括作物保护剂，如杀虫剂、杀线虫剂、杀真菌剂、增强剂如着色剂、聚合物、造粒剂、引发剂和消毒剂，以及其它试剂如孕育剂、PGR、软化剂和微量营养物。PGR可以是影响根生长、开花或茎伸长的天然或合成的植物激素。PGR可包括生长素、赤霉素、细胞***素、乙烯和脱落酸(ABA)。

所述组合物可以与液体肥料组合施加于犁沟中。在一些实例中，液体肥料可以容纳在罐中。NPK肥料含有钠、磷和钾的巨量营养素。

所述组合物可以改良植物性状，例如促进植物生长，保持叶中的高叶绿素含量，增加果实或种子数量，以及增加果实或种子单位重量。可以使用本公开的方法来引入或改良多种期望性状中的一种或多种。可引入或改良的性状的实例包括：根生物量、根长度、高度、枝条长度、叶数、水分利用效率、总生物量、产率、果实大小、粒度、光合作用速率、耐旱性、耐热性、耐盐性、对低氮胁迫的耐受性、氮利用效率、对线虫胁迫的抗性、对真菌病原体的抗性、对细菌病原体的抗性、对病毒病原体的抗性、代谢物的水平、代谢物水平的调节、蛋白质组表达。期望的性状，包括高度、总生物量、根和/或枝条生物量、种子萌发、幼苗存活、光合效率、蒸腾速率、种子/果实数量或质量、植物谷粒或果实产量、叶片叶绿素含量、光合作用速率、根长度或其任何组合，可用来测量生长，并与在相同条件下生长的参考农业植物(例如，没有引入和/或改良性状的植物)的生长速率进行比较。在一些实例中，期望的性状，包括高度、总生物量、根和/或枝条生物量、种子萌发、幼苗存活、光合作用效率、蒸腾速率、种子/果实数量或质量、植物谷粒或果实产量、叶绿素含量、光合作用速率、根长度或其任何组合，可用来测量生长，并与在相似条件下生长的参考农业植物(例如，没有引入和/或改良性状的植物)的生长速率进行比较。

宿主植物的农艺性状可包括但不限于以下：与从未使用所述种子处理制剂的种子生长的等同植物相比，改变的油含量，改变的蛋白质含量，改变的种子碳水化合物组成，改变的种子油组成和改变的种子蛋白质组成，化学耐受性，耐寒性，延迟衰老，抗病性，耐旱性，穗重，生长改善，健康增强，耐热性，除草剂耐受性，食草动物抗性，改善的固氮，提高的氮利用率，改善的根系结构，提高的水分利用效率，增加的生物量，增加的根长度，增加的种子重量，增加的枝条长度，增加的产率，限水条件下增加的产率，籽粒质量，籽粒含水量，金属耐受性，穗数，籽粒数，豆荚数，营养强化，病原菌抗性，抗虫性，光合能力提高，耐盐性，保持绿色，活力提高，成熟种子的干重增加，成熟种子的鲜重增加，每株成熟种子数增加，叶绿素含量增加，每株豆荚数增加，每株豆荚长度增加，每株枯萎叶数减少，每株严重枯萎叶数减少及每株非枯萎叶数增加，可检测的代谢物水平调节，可检测的转录物水平调节及可检测的蛋白质组调节。

在一些情况下，从与接种植物的植物元素相同种的植物中分离细菌或细菌群体，用来接种植物。例如，通常在一个品种的玉米(Zea mays)中发现的细菌或细菌群体与另一个品种的玉米植物的植物元素相关，所述另一个品种的玉米在其天然状态下缺乏所述细菌和细菌群体。在一个实施方案中，细菌和细菌群体来源于与接种植物的植物元素相关的植物种的植物。例如，将通常在大刍草(Zea diploperennis)(litis等人)(diploperennialteosinte)中发现的细菌和细菌群体施加至玉米(Zea mays)，或反之亦然。在一些情况下，用与接种植物的植物元素异源的细菌和细菌群体接种植物。在一个实施方案中，细菌和细菌群体来源于另一个种的植物。例如，将通常在双子叶植物中发现的细菌和细菌群体施加至单子叶植物(例如，用大豆来源的细菌和细菌群体接种玉米)，或反之亦然。在其它情况下，待接种到植物上的细菌和细菌群体来源于正在接种的植物的相关物种。在一个实施方案中，细菌和细菌群体来源于相关的分类群，例如来自相关物种。另一物种的植物可以是农业植物。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体是接种到任何宿主植物元素中的设计组合物的一部分。

在一些实例中，细菌或细菌群体是外源的，其中该细菌和细菌群体从与接种植物不同的植物中分离。例如，在一个实施方案中，细菌或细菌群体可以从与接种植物相同物种的不同植物中分离。在一些情况下，细菌或细菌群体可以从与接种植物相关的物种中分离。

在一些实例中，本文所述的细菌和细菌群体能够从一种组织类型移动到另一组织类型。例如，本发明在种子外部涂覆后检测并分离植物成熟组织内的细菌和细菌群体，证明了它们从种子外部移动到成熟植物的营养组织中的能力。因此，在一个实施方案中，细菌和细菌群体能够从种子外部移动到植物的营养组织中。在一个实施方案中，涂覆在植物种子上的细菌和细菌群体在种子萌发成营养状态后能够定位于植物的不同组织。例如，细菌和细菌群体能够定位于植物中的任何一种组织，包括：根、不定根、种子根、根毛、枝条、叶、花、芽、穗、分生组织、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实、匍匐茎、根茎、结节、块茎、毛状体、保卫细胞、排水器、花瓣、萼片、颖片、轴、维管形成层、韧皮部和木质部。在一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的根和/或根毛。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于光合组织，例如植物的叶和芽。在其它情况下，细菌和细菌群体定位于植物的维管组织，例如，木质部和韧皮部。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的生殖组织(花、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实)。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的根、芽、叶和生殖组织。在又一个实施方案中，细菌和细菌群体定植于植物的果实或种子组织。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定植于植物，使其存在于植物表面(即，其可检测地存在于植物外部或植物的后球上)。在其它实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的所有或基本上所有组织。在某些实施方案中，细菌和细菌群体不定位于植物的根。在其它情况下，细菌和细菌群体不定位于植物的光合组织。

还可以通过测量作物或作物加热单元(CHU)的相对成熟度来评估组合物的有效性。例如，可以将细菌群体施加至玉米，并且可以根据玉米粒的相对成熟度或玉米粒处于最大重量时的时间来评估玉米生长。作物加热单元(CHU)也可用来预测玉米作物的成熟。CHU通过测量作物生长的每日最高温度来确定热量积累的量。

在实例中，细菌可定位于植物中的任何一种组织，包括：根、不定根、种子根、根毛、枝条、叶、花、芽、穗、分生组织、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实、匍匐茎、根茎、结节、块茎、毛状体、保卫细胞、排水器、花瓣、萼片、颖片、轴、维管形成层、韧皮部和木质部。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于光合组织，例如植物的叶和芽。在其它情况下，细菌和细菌群体定位于植物的维管组织，例如，木质部和韧皮部。在另一个实施方案中，细菌或细菌群体能够定位于植物的生殖组织(花、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实)。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的根、芽、叶和生殖组织。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体定植于植物的果实或种子组织。在又一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定植于植物，使其存在于植物表面。在另一个实施方案中，细菌和细菌群体能够定位于植物的所有或基本上所有组织。在某些实施方案中，细菌和细菌群体不定位于植物的根。在其它情况下，细菌和细菌群体不定位于植物的光合组织。

施加于作物的细菌组合物的有效性可以通过测量作物生长的各种特征来评估，包括但不限于种植率、播种活力、根强度、耐旱性、植物高度、干燥和测试重量。

植物种

本文所述的方法和细菌适用于多种植物中的任何一种，如大麦属(Hordeum)、稻属(Oryza)、玉米属(Zea)和小麦属(Triticeae)的植物。合适的植物的其它非限制性实例包括苔藓、地衣和藻类。在一些情况下，诸如粮食作物、纤维作物、油料作物、林业或造纸工业中的植物、生物燃料生产的原料和/或观赏植物等植物具有经济、社会和/或环境价值。在一些实例中，植物可用于生产经济上有价值的产品，如谷物、面粉、淀粉、糖浆、粗粉、油、薄膜、包装、营养品、纸浆、动物饲料、鱼饲料、工业化学品的散装材料、谷物产品、加工的人类食品、糖、酒精和/或蛋白质。作物的非限制性实例包括玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑小麦、荞麦、甜玉米、甘蔗、洋葱、番茄、草莓和芦笋。

在一些实例中，可使用本文公开的方法和组合物获得或改善的植物可包括对农业、园艺、用于生产生物燃料分子和其它化学品的生物质和/或林业至关重要或有意义的植物。这些植物的一些实例可包括菠萝、香蕉、椰子、百合、grasspeas和禾草；以及双子叶植物，如豌豆、苜蓿、绿番茄、甜瓜、鹰嘴豆、菊苣、三叶草、羽衣甘蓝、小扁豆、大豆、烟草、土豆、甘薯、萝卜、卷心菜、油菜(rape)、苹果树、葡萄、棉花、向日葵、拟南芥、油菜(canola)、柑橘(包括橙、橘、金橘、柠檬、酸橙、葡萄柚、橘子、橘柚、香橼和柚子)、胡椒、豆、莴苣、柳枝稷(枝条)、双色高粱(高粱、sudan)、芒草(Miscanthus giganteus)、甘蔗(Saccharum sp.)(energycane)、杨树(Populus balsamifera)、玉米(Zea mays)、大豆(Glycine max)、油菜(Brassica napus)、小麦(Triticum aestivum)、棉花(Gossypium hirsutum)、稻(Oryzasativa)、向日葵(Helianthus annuus)、紫花苜蓿(Medicago sativa)、甜菜(Betavulgaris)、狼尾草(Pennisetum glaucum)、黍属(Panicum)植物、高粱属(Sorghum)植物、芒草属(Miscanthus)植物、甘蔗属(Saccharum)植物、蔗茅属(Erianthus)植物、杨属(Populus)植物、黑麦(Secale cereale)、柳属(Salix)植物、桉属(Eucalyptus)植物(桉树)、小黑麦属(Triticosecale)植物(小麦属-25小麦X黑麦)、竹子、红花(Carthamustinctorius)、麻风树(Jatropha curcas)、蓖麻(Ricinus communis)、油棕(Elaeisguineensis)、枣椰树(Phoenix dactylifera)、国王棕榈(Archontophoenixcunninghamiana)、女王棕榈(Syagrus romanzoffiana)、亚麻(Linum usitatissimum)、芥菜(Brassica juncea)、木薯(Manihot esculenta)、番茄(Lycopersicon esculentum)、莴苣(Lactuca saliva)、香蕉(Musa paradisiaca)、马铃薯(Solanum tuberosum)、甘蓝(Brassica oleracea)(西兰花、花椰菜、抱子甘蓝)、茶(Camellia sinensis)、草莓(Fragaria ananassa)、可可树(Theobroma cacao)、咖啡树(Coffea arabica)、葡萄(Vitisvinifera)、菠萝(Ananas comosus)、辣椒(Capsicum annum)、洋葱(Allium cepa)、甜瓜(Cucumis melo)、黄瓜(Cucumis sativus)、笋瓜(Cucurbita maxima)、南瓜(Cucurbitamoschata)、菠菜(Spinacea oleracea)、西瓜(Citrullus lanatus)、秋葵(Abelmoschusesculentus)、茄子(Solanum melongena)、罂粟(Papaver somniferum)、Papaverorientale、欧洲紫杉(Taxus baccata)、短叶红豆杉(Taxus brevifolia)、青蒿(Artemisiaannua)、***(Cannabis saliva)、喜树(Camptotheca acuminate)、长春花(Catharanthusroseus)、蔓长春花(Vinca rosea)、金鸡纳树(Cinchona officinalis)、Coichicumautumnale、藜芦(Veratrum californica)、毛地黄(Digitalis lanata)、洋地黄(Digitalis purpurea)、薯蓣属(Dioscorea)植物、穿心莲(Andrographis paniculata)、颠茄(Atropa belladonna)、曼陀罗(Datura stomonium)、小檗属(Berberis)植物、三尖杉属(Cephalotaxus)植物、草麻黄(Ephedra sinica)、麻黄属(Ephedra)植物、古柯(Erythroxylum coca)、Galanthus wornorii、赛莨菪属(Scopolia)植物、石松(Lycopodiumserratum)、石松属(Lycopodium)植物、蛇根木(Rauwolfia serpentina)、萝芙木属(Rauwolfia)植物、血根草(Sanguinaria canadensis)、莨菪属(Hyoscyamus)植物、金盏花(Calendula officinalis)、小白菊(Chrysanthemum parthenium)、毛喉鞘蕊花(Coleusforskohlii)、艾菊(Tanacetum parthenium)、银胶菊(Parthenium argentatum)、橡胶树属(Hevea)植物、绿薄荷(Mentha spicata)(薄荷)、欧薄荷(Mentha piperita)(薄荷)、红木(Bixa orellana)、六出花属(Alstroemeria)植物、蔷薇属(Rosa)植物(玫瑰)、康乃馨(Dianthus caryophyllus)、矮牵牛属(Petunia)植物(矮牵牛花)、一品红(Poinsettiapulcherrima)、烟草(Nicotiana tabacum)、羽扇豆(Lupinus albus)、燕麦(Uniolapaniculata)、大麦(Hordeum vulgare)和黑麦草属(Lolium)植物(黑麦)。

在一些实例中，可以使用单子叶植物。单子叶植物属于泽泻目(Alismatales)、天南星目(Arales)、槟榔目(Arecales)、凤梨目(Bromeliales)、鸭跖草目(Commelinales)、环花目(Cyclanthales)、莎草科(Cyperales)、谷精草目(Eriocaulales)、水鳖目(Hydrocharitales)、灯芯草目(Juncales)、Lilliales、茨藻目(Najadales)、兰目(Orchidales)、露兜树目(Pandanales)、禾本目(Poales)、帚灯草目(Restionales)、霉草目(Triuridales)、香蒲目(Typhales)和姜目(Zingiberales)。属于裸子植物纲(Gymnospermae)的植物有苏铁目(Cycadales)、银杏目(Ginkgoales)、麻黄目(Gnetales)和松目(Pinales)。在一些实例中，单子叶植物可选自玉米、稻、小麦、大麦和甘蔗。

在一些实例中，可以使用双子叶植物，包括属于以下目的植物：Aristochiales、菊目(Asterales)、肉穗果目(Batales)、桔梗目(Campanulales)、白花菜目(Capparales)、石竹目)(Caryophyllales)、木麻黄目(Casuarinales)、卫矛目(Celastrales)、山茱萸目(Cornales)、岩梅目(Diapensales)、五桠果目(Dilleniales)、川续断目(Dipsacales)、柿树目(Ebenales)、欧石楠目(Ericales)、Eucomiales、大戟目(Euphorbiales)、豆目(Fabales)、壳斗目(Fagales)、龙胆目(Gentianales)、牻牛儿苗目(Geraniales)、小二仙草目(Haloragales)、金缕梅目(Hamamelidales)、Middles、胡桃目(Juglandales)、唇形目(Lamiales)、樟目(Laurales)、玉蕊目(Lecythidales)、塞子木科(Leitneriales)、Magniolales、锦葵目(Malvales)、杨梅目(Myricales)、桃金娘目(Myrtales)、睡莲目(Nymphaeales)、Papeverales、胡椒目(Piperales)、车前草目(Plantaginales)、Plumbaginales、川苔草目(Podostemales)、花葱目(Polemoniales)、远志目(Polygalales)、蓼目(Polygonales)、报春花目(Primulales)、山龙眼目(Proteales)、大花草目(Rafflesiales)、毛茛目(Ranunculales)、鼠李目(Rhamnales)、蔷薇目(Rosales)、茜草目(Rubiales)、杨柳目(Salicales)、檀香目(Santales)、无患子目(Sapindales)、瓶子草科(Sarraceniaceae)、玄参目(Scrophulariales)、山茶目(Theales)、昆栏树目(Trochodendrales)、伞形目(Umbellales)、荨麻目(Urticales)和Violates。在一些实例中，双子叶植物可选自棉花、大豆、胡椒和番茄。

在一些情况下，待改良的植物不易适合实验条件。例如，作物可能花费太长的时间生长以实际上在多次迭代中连续评估改良的性状。因此，最初分离细菌的第一植物和/或施加了基因操作细菌的多种植物可以是模式植物，如在所需条件下更易于评价的植物。模式植物的非限制性实例包括狗尾草属、短柄草属和拟南芥属。然后可根据本公开的方法将使用模式植物分离细菌的能力应用于另一类型的植物(例如，作物)，以确认赋予的改良性状。

可通过本文公开的方法改良的性状包括植物的任何可观察特征，包括例如生长速率、高度、重量、颜色、味道、气味、由植物产生的一种或多种化合物的变化(包括例如，代谢物、蛋白质、药物、碳水化物、油和其它任何化合物)。也设想基于基因型信息选择植物(例如，包括响应于细菌的植物基因表达模式，或鉴定诸如与固氮提高相关的那些遗传标记物的存在)。也可以基于与某种特征或性状(诸如不希望的特征或性状)的存在相反的某种特征或性状(诸如期望的特征或性状)的缺乏、抑制或限制来选择植物。

农业组合物的浓度和施用量

如上所述，包含教导的微生物的本公开的农业组合物可以以多种方式施加至植物。在两个特定方面，本公开考虑了犁沟内处理或种子处理。

对于种子处理实施方案，本公开的微生物可以以多种浓度存在于种子上。例如，微生物可以以如下的每个种子的cfu浓度存在于种子处理物中：1×10¹、1×10²、1×10³、1×10⁴、1×10⁵、1×10⁶、1×10⁷、1×10⁸、1×10⁹、1×10¹⁰或更多。在特定方面，种子处理组合物包含每个种子约1×10⁴至约1×10⁸cfu。在其它特定方面，种子处理组合物包含每个种子约1×10⁵至约1×10⁷cfu。在其它方面，种子处理组合物包含每个种子约1×10⁶cfu。

在美国，大约10％的玉米种植面积以每英亩多于大约36,000粒种子的种子密度进行种植；1/3的种植面积以每英亩约33,000至36,000粒种子的种子密度进行种植；1/3的种植面积以每英亩约30,000至33,000粒种子的种子密度进行种植，其余的种植面积是可变的。参见Steve Butzen撰写的“Com Seeding Rate Considerations”，网址为：https://www.pioneer.com/home/site/us/agronomy/library/corn-seeding-rate-considerations/。

以下表B在预期的种子处理实施方案中使用各种每个种子的cfu浓度(各行)和各种种子种植面积种植密度(第1列：15K-41K)来计算每英亩的cfu总量，其将应用在各种农业场景中(即，每个种子的种子处理浓度×每英亩种植的种子密度)。因此，如果要利用每个种子1×10⁶cfu的种子处理物并且每英亩种植30,000粒种子，则每英亩的总cfu含量为3×10¹⁰(即30K*1×10⁶)。

表B：种子处理实施方案的每英亩的总CFU计算

对于犁沟内实施方案，本公开的微生物可以以如下的每英亩的cfu浓度施加：1×10⁶、3.20×10¹⁰、1.60×10¹¹、3.20×10¹¹、8.0×10¹¹、1.6×10¹²、3.20×10¹²或更多。因此，在一些方面，液体犁沟内组合物可以以每英亩约1×10⁶至约3×10¹²cfu的浓度施加。

在一些方面，犁沟内组合物包含在液体制剂中。在液体犁沟内实施方案中，微生物可以以如下的每毫升cfu浓度存在：1×10¹、1×10²、1×10³、1×10⁴、1×10⁵、1×10⁶、1×10⁷、1×10⁸、1×10⁹、1×10¹⁰、1×10¹¹、1×10¹²、1×10¹³或更多。在某些方面，液体犁沟内组合物包含浓度为每毫升约1×10⁶至约1×10¹¹cfu的微生物。在其它方面，液体犁沟内组合物包含浓度为每毫升约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu的微生物。在其它方面，液体犁沟内组合物包含浓度为每毫升约1×10⁸至约1×10⁹cfu的微生物。在其它方面，液体犁沟内组合物包含浓度为至多每毫升约1×10¹³cfu的微生物。

实施例

本文提供的实施例描述了细菌分离、细菌和植物分析以及植物性状改良的方法。这些实施例仅用于说明的目的，无论如何不应被解释为对本发明的限制。

实施例1：从植物组织中分离微生物

表土是从加利福尼亚州中部的各个农业区获得的。收集了20块具有不同质地特征的土壤，包括重粘土、泥炭粘土壤土、粉质粘土和砂壤土。如表1所示，将各种田间玉米、甜玉米、传统玉米和番茄的种子种植到每种土壤中。

表1：种植在具有不同特征的土壤中的作物类型和品种

在生长2-4周后将植物拔除，并且用去离子水除去根表面上的过量土壤。去除土壤后，用漂白剂对植物进行表面灭菌，并在无菌水中猛力冲洗。从植物上切下清洁过的1厘米根段，并置于含有3mm钢珠的磷酸盐缓冲盐水溶液中。通过用Qiagen TissueLyser II剧烈摇动溶液产生浆液。

将根部和盐水浆液稀释并接种到各种类型的生长培养基上以分离根际的、内生植物的、附生植物的和其它植物相关的微生物。使用R2A和Nfb琼脂培养基获得单菌落，并且使用半固体Nfb培养基斜面来获得固氮细菌群体。在半固体Nfb培养基斜面中孵育2-4周后，收集微生物群体并划线，以获得R2A琼脂上的单菌落，如图1A-B所示。将单菌落重悬于R2A和甘油的混合物中，进行PCR分析，并在-80℃下冷冻以备后续分析。获得大约1000个单菌落，并指定为“分离的微生物”。

然后对分离物进行菌落PCR筛选以检测nifH基因的存在以鉴定固氮生物。上述引物集Ueda 19F/388R(已经显示在筛选中检测到90％以上的固氮生物)用于探测每个分离物中nif簇的存在(Ueda等人1995；J.Bacteriol.177：1414-1417)。如图2所示，挑取纯化的分离物的单菌落，重悬于PBS中，并用作菌落PCR的模板。给出阳性PCR条带的分离物的菌落被重新划线，重复菌落PCR和重复划线过程两次以防止固氮生物的假阳性鉴定。然后将纯化的分离物命名为“候选微生物”。

实施例2：分离的微生物的表征

测序、分析和系统发育表征

使用用515f-806r引物集进行的16S rDNA测序以产生分离的微生物和候选微生物的初步系统发育特性(参见例如Vernon等人；BMC Microbiol.2002 Dec 23；2：39)。如表2所示，微生物包括不同的属，包括：肠杆菌属、伯克霍尔德氏菌属、克雷伯氏菌属、慢生根瘤菌属、拉恩氏菌属、黄单胞菌属、拉乌尔菌属(Raoultella)、泛菌属、假单胞菌属、短波单胞菌属、土壤杆菌属和类芽孢杆菌属。

表2：通过深16S rDNA测序确定的从番茄植物中分离的微生物的多样性。

随后，使用Illumina Miseq平台对39个候选微生物的基因组进行测序。使用QIAmpDNA微型试剂盒(QIAGEN)提取来自纯培养物的基因组DNA，并且通过第三方供应商(SeqMatic，Hayward)制备用于测序的总DNA文库。然后通过A5管线进行基因组组装(Tritt等人，2012；PLoS One 7(9)：e42304)。鉴定且注释基因，并且将与固氮调节和表达相关的基因指定为诱变的靶标。

候选微生物的转录物组概况分析

进行菌株CI010的转录物组概况分析来鉴定在环境氮存在下有活性的启动子。在补充有10mM谷氨酰胺的确定的无氮培养基中培养菌株CI010。从这些培养物(QIAGENRNeasy试剂盒)中提取总RNA并通过Illumina HiSeq(SeqMatic，Fremont CA)进行RNAseq测序。使用Geneious将测序读取映射到CI010基因组数据，并鉴定在近端转录启动子控制下的高表达基因。

表3A-C列出了通过总RNA的RNASeq测序测量的基因及其相对表达水平。记录近端启动子的序列用于nif途径、氮利用相关途径或其它具有所需表达水平的基因的诱变。

表3A

表3B

表3C

菌株表

菌株序列表

遗传可追溯性的评估

基于可转化性和遗传性对候选微生物进行表征。首先，通过在相关培养基的小板上生长以及在无氮培养基和富培养基中的生长曲线来确定最佳的碳源利用率。其次，每种菌株的天然抗生素抗性通过点滴板及在含有一组用作诱变的选择性标记物的抗生素的液体培养基中生长来确定。第三，通过质粒集合的电穿孔测试每个菌株的可转化性。质粒集合包括七个复制起点(即，p15a、pSC101、CloDF、colA、RK2、pBBR1和pRO1600)和四个抗生素抗性标记物(即，CmR、KmR、SpecR和TetR)的组合扩增。对来源和抗性标记物相容性的这种系统性评估用于鉴定候选微生物中基于质粒诱变的载体。

实施例3：候选微生物的诱变

λ-Red介导的敲除

使用质粒pKD46或含有卡那霉素抗性标记物的衍生物产生候选微生物的几种突变体(Datsenko等人，2000；PNAS 97(12)：6640-6645)。敲除盒用靶基因侧翼的250bp同源进行设计，并通过重叠延伸PCR产生。用pKD46转化候选微生物，在***糖存在下培养以诱导λ-Red机器表达，准备用于电穿孔，并用敲除盒转化以产生候选诱变菌株。如表4所示，使用四种候选微生物和一种实验室菌株产酸克雷伯氏菌M5A1以产生固氮调节基因nifL、glnB和amtB的十三种候选突变体。

表4：通过λ-Red诱变产生的单个敲除突变体的列表

用Cas9选择的寡核苷酸指导的诱变

寡核苷酸指导的诱变用于靶向大肠杆菌DH10B中rpoB基因的基因组变化，并用CRISPR-Cas系统选择突变体。将诱变的寡核苷酸(ss1283：“G*T*T*G*ATCAGACCGATGTTCGGACCTTCcaagGTTTCGATCGGACATACGCGACCGTAGTGGGTCGGGTGTACGTCTCGAACTTCAAAGCC”，其中*表示硫代磷酸键)设计成通过4-bp突变赋予rpoB基因利福平抗性。诱导含有编码Cas9的质粒的细胞用于Cas9表达，准备用于电穿孔，然后用诱变寡核苷酸和编码靶向WT rpoB序列的Cas9切割的指导RNA(gRNA)的组成型表达的质粒两者进行电穿孔。电穿孔的细胞在非选择性培养基中回收过夜，以使得到的突变体染色体充分分离。在选择编码gRNA的质粒上进行平板接种后，筛选的十个菌落中有两个显示出含有所需的突变，而其余显示为通过gRNA质粒中的前间隔区(protospacer)突变或Cas9质粒丢失产生的逃逸突变体。

用Cas9选择的λ-Red诱变

候选微生物CI006和CI010的突变体通过具有CRISPR-Cas选择的λ-Red诱变来产生。敲除盒含有通过转录概况分析(如实施例2中所述及表3A-C中所述)鉴定的内源性启动子和位于缺失靶标侧翼的约250bp同源性区域。用在***糖诱导型启动子控制下编码λ-Red重组系统(exo、β、gam基因)和在IPTG诱导型启动子控制下编码Cas9的质粒转化CI006和CI010。在所得到的转化体中诱导Red重组和Cas9系统，并制备用于电穿孔的菌株。随后将敲除盒和质粒编码的选择gRNA转化到感觉态细胞中。如图3所示，在对Cas9质粒和gRNA质粒均有选择性的抗生素上进行平板接种后，筛选的10个菌落中有7个显示出预期的敲除突变。

实施例4：候选分子的体外表型

评估了外源氮对各种突变体中固氮酶生物合成和活性的影响。乙炔还原分析(ARA)(Temme等人2012；109(18)：7085-7090)用于测量纯培养条件下的固氮酶活性。菌株在气密测试管中生长，并用Agilent 6890气相色谱仪对乙炔还原成乙烯进行定量。在补充有0至10mM谷氨酰胺的固氮培养基中生长的候选微生物和对应候选突变体的ARA活性示于图4A-4B和图10A-10C中。

在厌氧培养条件下，测试一系列谷氨酰胺和氨浓度以量化对固氮活性的影响。在野生型细胞中，随着谷氨酰胺浓度增加，活性迅速降低。然而，在一系列初始敲除突变中，确认了一类突变，从而能够在谷氨酰胺的浓度下表达固氮基因，否则会关闭野生型中的活性。如图4C所示，对四种不同的固氮生物物种生成了图谱。此外，通过使用已经确定的遗传部分重新连接调节网络，可预期调整固氮活性水平。这在图4B中可见，其图示了菌株CM023、CM021、CM015和CI006。菌株CM023是低级进化菌株；菌株CM021是高级进化菌株；菌株CM015是中级进化菌株；菌株CI006则为野生型(菌株2)。使用基于酶的试验(MEGAZYME)测试排出到培养上清液中的氨。该试验测量在340nm的吸光度下消耗的NADPH的量。该试验是在无氮、厌氧环境下生长的细菌培养物以1E9 CFU/ml的起始密度进行的。如图4D所示，在一组六个进化菌株中，一个菌株在48小时期间内排出高达100μM的氨。此外，如图11所示，双突变体显示出比其衍生的单突变体更高的氨排出量。这证明了产生超过其生理需求的氨的微生物生产力。

纯培养物的转录概况分析

使用Nanostring Elements平台测定CI006的转录活性。细胞在无氮培养基中生长，并且孵育4小时后收集10⁸个细胞。使用Qiagen RNeasy试剂盒提取总RNA。如图5所示，将纯化的RNA提交给位于加利福尼亚州帕洛阿尔托的Core Diagnostics进行探针杂交和数字分析仪分析。

实施例5：候选微生物的植物中表型分析

候选微生物对植物的定植

通过短期植物生长实验定量候选微生物对所需宿主植物的定植。玉米植物用表达来自质粒或来自Tn5整合的RFP表达盒的RFP的菌株接种。植物在灭菌的沙子和有菌泥炭培养基中生长，并且通过在萌发后三天将1mL细胞培养物直接移液到正在出芽的植物胚芽鞘上进行接种。通过用含有适当抗生素的溶液浇灌植物来维持质粒。三周后，收集植物根部，在无菌水中冲洗三次以除去可见的土壤，并分成两个样品。通过荧光显微镜分析一个根样品以鉴定候选微生物的定位模式。如图6所示，在10mm长的最细的完整植物根上进行显微镜检查。

开发第二种定量评估定植的方法。对来自接种内生菌的植物的根的全部DNA制剂进行定量PCR测定。玉米种子(Dekalb DKC-66-40)在先前高压灭菌的沙中在2.5英寸×2.5英寸×10英寸的罐中发芽。种植一天后，将1ml内生菌过夜培养物(SOB培养基)在种子所在的地方浸透。1mL该过夜培养物大约相当于约10^9cfu，取决于使用哪种菌株，在彼此的3倍内变化。用补充有2.5mM或0.25mM硝酸铵的50mL改良Hoagland溶液，每周给每株幼苗施肥3次。种植四周后，收集根部样品进行DNA提取。使用加压水喷雾将土壤碎片冲走。然后使用QIAGEN Tissuelyzer使这些组织样品匀浆化，然后使用QIAmp DNA微型试剂盒(QIAGEN)根据推荐的方案来提取DNA。使用Stratagene Mx3005P RT-PCR，在这些DNA提取物上利用对每种内生菌基因组中的基因座特异性的经设计的引物(使用NCBI的Primer BLAST)进行qPCR测定。定量内生菌的基因组拷贝的存在。为了进一步确认内生菌的身份，对PCR扩增产物进行测序并证实具有正确的序列。表5中显示了来自候选微生物的菌株CI006和CI008的定植概况。在菌株CI008中证实了根的定植率高达10^7x cfu/g fw。

菌株	定植率(CFU/g fw)
		CI006	1.45x10^5
CI008	1.24x10^7

表5：通过qPCR测定的玉米的定植

植物中RNA的概况分析

通过测量nif基因的转录来估计植物中nif途径组分的生物合成。从接种CI006的植物(如前所述的种植方法)的根部植物组织中获得总RNA。根据推荐方案(QIAGEN)使用RNEasy微型试剂盒进行RNA提取。然后使用Nanostring Elements试剂盒(NanoStringTechnologies，Inc.)利用对菌株CI006的基因组中的nif基因特异性的探针来测定来自这些植物组织的总RNA。植物中nif基因表达的数据总结在表6中。在由CM013菌株接种的植物中检测到nifH基因的表达，而在接种CI006的植物中则未检测到nifH的表达。菌株CM013是菌株CI006的衍生物，其中nifL基因已被敲除。

在施肥条件下在植物中测量高度表达的CM011基因，其按照每百万个千碱基的转录物(TPM)进行排序。控制这些高度表达的基因中的一些表达的启动子用作同源重组到靶向固氮和同化基因座的模板。从温室生长的、接种CM011的植物提取RNA样品，使用Ribo-Zero试剂盒去除rRNA，使用Illumina的Truseq平台进行测序并将其映射回CM011的基因组。表7中列出了来自CM011的高度表达的基因。

菌株	相对转录物表达
		CI006	9.4
CM013	103.25

表6：nifH在植物中的表达

表7

¹⁵N测定

显示固氮的主要方法是使用氮同位素15N，它在大气中以相对于14N的设定比率而被发现。通过补充富含15N的肥料或气氛，可以直接观察到在15N2(Yoshida 1980)气体补充的大气中固定的15N的固氮提高量，或者相反，通过将富集肥料用大气N₂气体在植物组织中稀释(Iniguez 2004)而固氮。稀释法允许在植物生长过程中观察累积的固定氮，而15N₂气体法限于测量植物在所含气氛中生长的短时间间隔内出现的固定(比率测量)。因此，气体法在特异性方面较优越(因为植物中高于大气比率的任何升高的15N₂水平都可以毫无疑义地归因于固定)，但无法显示累积活性。

已经进行了两种类型的测定来测量相对于野生型和未接种的玉米植物的改良菌株的固定活性，并且针对几种改良菌株在植物中观察到升高的固定率(图12、图14A和图14B)。这些测定有助于证明体外观察到的菌株的活性转化为体内结果。此外，这些测定方法允许测量肥料对菌株活性的影响，表明在农业环境中具有适宜的功能。当狗尾草属植物接种野生型和改良菌株时观察到类似的结果(图13)。在图14A-14C中显示的植物中的固定活性进一步由转录物组数据支持。相对于野生型对应物，进化菌株则表现出增加的nifH转录物水平。此外，植物中的微生物衍生的氮水平也与植物基础上植物的定植水平相关。这些结果(图12、图13、图14A-14C、图15A和图15B)支持此类假设，即通过nif基因簇的改善调节，微生物是在植物组织中所见的大气衍生的氮增加的可能原因。除了直接测量固定之外，还测量了在氮应激植物生物量测定中接种具有改良菌株的植物的影响。虽然植物生物量可能与许多可能的微生物与植物的相互作用相关，但是人们预期，当氮限制时，添加固定氮将影响植物表型。接种的植物在完全不存在氮的情况下生长，并且相对于未处理的对照组，观察到接种植物的叶面积、枝条鲜重和干重以及根鲜重和干重显著增加(图14C)。尽管这些差异不能完全归因于固氮，但它们支持这样的结论，即改良菌株向植物积极提供氮。如上所述使玉米和狗尾草属植物生长并接种。含有1.2％¹⁵N的肥料通过浇灌定期供给植物。通过测量植物组织中的¹⁵N水平来量化通过微生物的固氮。在种植后4周收集第四片叶组织并进行干燥。将干燥的叶样品用珠(QIAGEN Tissuelyzer)匀浆，并等分到用于IRMS(MBL Stable IsotopeLaboratory at The Ecosystems Center，Woods Hole，MA)的锡胶囊中。计算来自大气(NDFA)的氮，并且由CI050和CM002得到的氮产量示于图7中。

植物激素产生试验

矮小的番茄(番茄)栽培品种“Micro-Tom”以前已经用于通过体外试验来研究吲哚-3-乙酸对果实成熟的影响(Cohen 1996；J Am Soc Hortic Sci 121：520-524)。为了评估候选微生物的植物激素产生和分泌，开发了使用未成熟的Micro-Tom果实的基于平板的筛选试验。如图8所示，12孔组织培养测试板通过用琼脂培养基填充孔使其固化，并将10μL过夜微生物培养物点在琼脂表面上来制备得到。将含有增加量的赤霉酸(GA)但不含细菌培养物的琼脂培养皿用作阳性对照和标准。开花后一天，将从生长的Micro-Tom植物中脱落的花于细菌性斑点培养点处***(先插茎)到琼脂中。监测这些花2-3周，之后收获果实并称重。如图9所示，若干次重复的植物果实质量的增加表明接种微生物产生植物激素。

实施例6：周期性宿主-微生物的进化

用CM013接种玉米植物并生长4周至大约V5生长阶段。连根拔出经由¹⁵N分析证实来自微生物源的氮积累得到改善的那些植物，并且使用加压水清洗根部以除去大块土壤。切割0.25g根段并用PBS溶液冲洗以除去细土壤颗粒和非粘附微生物。使用QIAGENTissueLyser II中的3mm钢珠将组织样品匀浆。将匀浆稀释并铺在SOB琼脂培养基上。将单菌落重悬于液体培养基中，并对16s rDNA和对接种菌株特有的突变进行PCR分析。微生物分离、诱变、接种和再分离的过程可以重复进行以改良微生物性状、植物性状和微生物的定植能力。

实施例7：跨地理的相容性

改良的微生物定植接种植物的能力对于在田间条件下植物的成功至关重要。尽管所描述的分离方法被设计用于从与玉米等作物密切相关的土壤微生物中进行选择，但许多菌株可能不能有效地在一定范围的植物基因型、环境、土壤类型或接种条件下定植。由于定植是一个复杂的过程，需要微生物菌株与宿主植物之间的一系列相互作用，因此筛选定植能力已经成为选择优先菌株以进一步开发的核心方法。评估定植的早期努力使用了菌株的荧光标记，这是有效的，但耗时且不能在每株菌株基础上扩展。由于定植活动不适合简单的改进，所以从自然定植菌株中选择潜在的候选产品势在必行。

将测定设计为使用qPCR及设计成在群落样品中具有菌株特异性的引物来测试任何给定宿主植物中野生型菌株的稳定定植。该测定旨在快速测量来自玉米组织样品的微生物定植率。使用荧光显微镜和基于平板的技术评估为可能定植的菌株的初始测试表明qPCR方法将是定量和可扩展的。

典型的测定如下进行：植物，主要为玉米和小麦品种，在温室中的泥炭盆栽混合物中生长，每种菌株6个副本。在种植后的第四天或第五天，吸取1mL稀释至OD590为0.6-1.0(约5E+08CFU/mL)的细菌早期固定相培养物浸液到新出芽的胚芽鞘上。植物只用自来水浇灌，并生长达四周时采样，其时将植物连根拔起，并且彻底清洗根部以除去大部分泥炭残留物。将干净的根样品切下并匀浆化以产生植物细胞碎片和相关细菌细胞的浆液。我们开发了高通量的DNA提取方案，有效地产生了用作qPCR模板的植物和细菌DNA的混合物。基于细菌细胞刺突实验，该DNA提取过程提供了相对于根鲜重的定量细菌DNA样品。使用PrimerBLAST(Ye 2012)设计的菌株特异性引物评估每个菌株，并与来自未接种植物的背景扩增进行比较。由于一些引物在未接种的植物中表现出脱靶扩增，因此通过扩增的存在或与背景水平相比正确产物增加的扩增来确定定植。

该试验用于测量微生物产物在不同土壤地理学上的相容性。田间土壤质量和田间条件可以对微生物产品的效果具有巨大的影响。土壤的pH、保水能力和竞争性微生物只是土壤中可影响接种物存活和定植能力的几个示例而已。使用从加利福尼亚的农田采样的三种不同的土壤类型作为植物生长培养基来进行定植试验(图16A)。使用中间接种密度来接近现实农业条件。在3周内，菌株5以1E+06到1E+07CFU/g FW定植所有植物。植物生长7周后，进化型菌株1在所有土壤类型中表现出高定植率(1E+06CFU/g FW)。(图16B)。

此外，为了评估田间条件复杂度的定植，2015年6月在圣路易斯奥比斯波开始1英亩田间试验，以评估7种野生型菌株在两种玉米田中的影响和定植情况。试验的农艺设计和执行由合同田间研究机构Pacific Ag Research进行。为了接种，采用在接种方法实验中测试的相同的泥炭培养种子包衣技术。在生长季期间，收集植物样品以评估在根和茎内部的定植。在种植后四周和八周，从每次处理的三块重复土地中收集样品，在16周收获前不久，从每次处理的所有六个重复土地中收集样品。在12周时从用菌株1和菌株2接种的处理的所有六块重复土地中以及未处理的对照组中收集另外的样品。与用qPCR和菌株特异性引物进行的其它定植试验一起评估每克经洗涤的根鲜重的细胞数目。两个菌株，菌株1和菌株2表现出一致且大面积的根部定植，其在12周时达到峰值，然后急剧下降(图16C)。虽然菌株2出现的数量比菌株1的数量低一个数量级，但发现植物之间的数量较为一致。似乎没有菌株有效地定植于茎内部。为了支持qPCR定植数据，使用平板接种和16S测序从根样品成功地重新分离两种菌株以鉴定匹配序列的分离。

实施例8；微生物育种

微生物育种的实例可以总结在图17A的示意图中。图17A描绘了微生物育种，其中可以首先测量微生物组的组成并鉴定感兴趣的物种。微生物组的代谢可以被定位并与遗传相关联。然后，可以使用包括但不限于缀合和重组、化学诱变、适应性进化和基因编辑的方法引入靶向遗传变异。用衍生微生物接种作物。在一些实例中，选择具有最佳表型的作物。

如图17A中所提供的，可以首先测量微生物组的组成并鉴定感兴趣的物种。图17B描绘了微生物组测量步骤的展开图。微生物组的代谢可以被定位并与遗传相关联。氮的代谢可涉及氨(NH₄ ⁺)从根际通过AmtB转运蛋白进入细菌的胞质溶胶中。氨和L-谷氨酸(L-Glu)由谷氨酰胺合成酶和ATP催化成谷氨酰胺。谷氨酰胺可以导致生物质的形成(植物生长)，并且它还可以抑制nif操纵子的表达。然后，可以使用包括但不限于缀合和重组、化学诱变、适应性进化和基因编辑的方法引入靶向遗传变异。用衍生微生物接种作物。选择具有最佳表型的作物。

实施例9：采用本公开的微生物的田间试验-2016年夏季

为了评价本公开的菌株在不同氮气方案下对玉米生长和生产力的功效，进行了田间试验。

用(1)6个菌株加上对照的7个子地块处理进行试验-四个主要地块包含最大氮回报(MRTN)的0％、15％、85％和100％和局部验证。对照(仅UTC)使用10个100％MRTN加上5、10或15磅进行。处理进行四次重复。

玉米地块(最小)为4行，长30英尺，每个地点有124个地块。所有观测结果均来自中心两行植物，所有破坏性采样均来自***行。将种子样品冷藏至使用前1.5至2小时。

当地农业实践：种子是没有常规杀真菌剂和杀虫剂处理的商业玉米。所有种子处理物均由一名种子处理专家施加以确保均匀性。种植日期、播种率、杂草/昆虫管理等按照当地的农业实践。除杀菌剂应用外，遵循标准管理规范。

土壤表征：评价土壤质地和土壤肥力。对于每次重复预先种植土壤样品，以确保残留的硝酸盐水平低于50lbs/Ac。土壤核心取自0cm至30cm。进一步表征土壤的pH、CEC、总K和P。

评估：在种植后14天(DAP)/英亩评估初始植物群体，并进一步评估：(1)14DAP和V10的活力(1至10级，10＝优异)；(2)在症状明显的任何时间记录地块中的病害评分；(3)如果在地块中发生倒伏，则记录倒伏的任何差异；(4)产率(Bu/英亩)，针对标准水分百分比进行调整；(5)测试重量；和(6)谷粒含水百分比。

采样要求：在三个时间点(试验开始前，V10-VT，收获后1周)对土壤进行采样。所有六个地点和所有地块均以每个样品10克进行采样(124个地块×3个时间点×6个地点)。

定植采样：对五个地点和六个时间点(V4、V8、V10、VT、R5和收获后)，在两个时间点(VI 0和VT)收集定植样品。如下收集样品：(1)0％至100％MRTN，每个地点60个地块；(2)每个地块从***行中随机选择4株植物；(3)5克根、8英寸茎和顶部三片叶子-分开装袋并标记-每个地块12个/袋；(4)五个地点(60个地块×2个时间点×12个袋/地块)；和一个位置(60个地块×6个时间点×12个袋/地块。参见图17C，其示出了定植采样。

在两个时间点(V4-V6和VT)使用Greenseeker仪器进行归一化差异植生指数(NDV1)确定。评估所有六个地点的每个地块(124个地块×2个时间点×6个地点)。

使用Win Rhizo从最能说明处理差异的一个地点进行根分析。每个地块随机采样10株植物(每个外侧行5个相邻的；优选V3-V4期植物)，并轻轻洗涤以适当地除去泥垢。将十个根放入塑料袋中并贴上标签。使用WinRhizo Root Analysis进行分析。

在R2与R5之间在所有六个地点测量茎特征。记录每个地块10株植物在6”高度处的茎直径，以及6”标记上方第一个节间的长度。监测10株植物；从两个内部行的中心起连续五株植物。评价了六个地点(124个地块×2个测量×6个地点)。

分析所有地块和所有地点的组织硝酸盐。当玉米黑色层形成后一至三周之间，土壤上方6”开始的8”的茎节段；去除叶鞘。评价了所有地点和地块(6个地点×124个地块)。

所有地点都记录了从种植到收获的以下天气数据：每日最高和最低气温，播种时的土壤温度，每日降雨加灌溉(如果使用)，以及任何异常天气事件，如雨、风、冷或热。

表8列出了所有六个地点的产率数据。氮用量对产率有显著影响，但氮用量之间的菌株则没有。然而，在最低氮用量下，菌株CI006、CM029和CI019在数值上超出UTC 4至6bu/英亩。在15％MRTN下菌株CM029、CI019和CM081的产率也在数值上增加2至4bu/英亩。

表8：所有六个地点的产率数据

表9列出了另一种分析方法。该表包括对氮的响应最大的四个地点，这表明可用的残余氮最低。这种方法不会改变氮用量显著影响产率的评价，当在所有氮用量中平均时，菌株没有这种影响。然而，对于所有菌株，尤其是CI006、CM029和CM029/CM081，在最低N用量下的数值产率优势更明显，其中产率从8增加到10bu/英亩。在15％MRTN时，菌株CM081超过UTC5 bu。

表9：四个地点的产率数据

4个地点的平均值-SGS、AgIdea、Bennett、RFR

田间试验的结果也在图21-27中示出。结果表明，本公开的微生物能够提高植物产率，这说明了所教导的微生物在重要的农作物即玉米中增加固氮的能力。

基于田间试验的结果进一步验证了所公开的非属间修饰所选微生物菌株基因组的方法，以便在将所述工程菌株施加至作物时在田间设置中产生农业相关的结果。

图18描绘了衍生自菌株CI006(WT Kosakonia sacchari)的修饰菌株的谱系。田间数据证明了CI006 WT菌株的工程衍生物，即CM029，能够在田间设置中产生数值相关的结果。例如，表8说明在0％MRTN下，与未处理对照的141.2bu/英亩相比，CM029产生147.0bu/英亩(增加了5.8bu/英亩)。表8还说明在15％MRTN下，与未处理对照的165.1bu/英亩相比，CM029产生167.3bu/英亩(增加了2.2bu/英亩)。表9支持这些结论，并说明在0％MRTN下，与未处理对照的131.9bu/英亩相比，CM029产生140.7bu/英亩(增加了8.8bu/英亩)。表9还说明在15％MRTN下，与未处理对照的161.3bu/英亩相比，CM029产生164.1bu/英亩(增加了2.8bu/英亩)。

图19描绘了衍生自菌株C1019(WT水生拉恩氏菌)的修饰菌株的谱系。田间数据证明了CI019 WT菌株的工程衍生物，即CM081，能够在田间设置中产生数值相关的结果。例如，表8说明在15％MRTN下，与未处理对照的165.1bu/英亩相比，CM081产生169.3bu/英亩(增加了4.2bu/英亩)。表9支持这些结论，并说明在0％MRTN下，与未处理对照的131.9bu/英亩相比，CM081产生136.3bu/英亩(增加了4.4bu/英亩)。表9还说明在15％MRTN下，与未处理对照的161.3bu/英亩相比，CM081产生166.8bu/英亩(增加了5.5bu/英亩)。

此外，在表9中可以看出，在0％MRTN下，与未处理对照的131.9bu/英亩相比，CM029/CM081的组合产生141.4bu/英亩(增加了9.5bu/英亩)。

实施例10：采用本公开的微生物的田间试验

在自然界中，包括在农业土壤中，可以发现多种固氮细菌。然而，微生物为作物提供足够氮以减少肥料使用的潜力可能受限于施肥土壤中固氮酶基因的抑制以及与作物根密切相关的低丰度。与主要商业作物密切相关的微生物的鉴定、分离和育种可能会破坏和改善连接氮传感和固氮的调节网络，并解锁与作物相关的微生物的显著氮贡献。为此，鉴定了与玉米根系结合并定植的固氮微生物。

收集来自在农艺学相关的土壤中生长的玉米植物的根样品，并从根际和内生物中提取微生物群体。提取来自这些样品的基因组DNA，然后进行16S扩增子测序以分析群落组成。分离Kosakonia sacchari微生物(菌株PBC6.1)，并通过16S rRNA和全基因组测序对其进行分类。这是一种特别令人感兴趣的氮固定剂，其能够定植为根相关微生物群的近21％(图30)。为了评估菌株对外源氮的敏感性，用经典的乙炔还原试验(ARA)和不同水平的谷氨酰胺补充来测量纯培养物中的固氮率。该物种在无氮培养基中表现出高水平的固氮活性，而外源固定氮抑制了nif基因表达和固氮酶活性(菌株PBC6.1，图28C和28D)。另外，当在固氮条件下生长的PBC6.1的上清液中测量释放的氨时，可以检测到非常少的固定氮释放(图28E)。

我们假设PBC6.1可能是施肥田间固定氮的重要贡献者，如果控制氮代谢的调节网络被重新连接以允许在固定氮的存在下有最佳的固氮酶表达和氨释放。PBC6.1基因组中应存在足够的遗传多样性，以实现广泛的表型重塑，而无需***转基因或合成的调节元件。分离的菌株具有至少5.4Mbp的基因组和经典的固氮基因簇。PBC6.1中相关的氮代谢途径与用于固氮的模型生物产酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytoca m5al)相似。

鉴定了几个遗传调节网络节点，其它们以增加固氮并随后转移至宿主植物，特别是在高外源固定氮浓度下(图28A)。nifLA操纵子通过NifA的转录激活和NifL对NifA的氮和氧依赖性抑制直接调节nif簇的其余部分。破坏nifL可以消除NifA的抑制，并且在氧和外源固定氮的存在下改善nif表达。此外，在氮不依赖性启动子的控制下表达nifA可以使固氮酶生物合成与NtrB/NtrC氮传感复合物的调节解耦。微生物通过谷氨酰胺合成酶(GS)对固定氮向谷氨酰胺的同化被双结构域腺苷酰转移酶(ATase)酶GlnE通过GS的腺苷酰化和去腺苷酰化可逆地调节，以分别减弱和恢复活性。截短GlnE蛋白以删除其腺苷酰基去除(AR)结构域可导致组成型腺苷酰化的谷氨酰胺合成酶，从而限制微生物的氨同化并增加细胞内和细胞外氨。最后，减少负责摄取氨的转运蛋白AmtB的表达可导致更大的细胞外氨。为了在不使用转基因的情况下产生合理设计的微生物表型，采用两种方法：产生编码蛋白质结构域或完整基因的基因组序列的无标记缺失，以及通过基因组内启动子重排重新连接调节网络。通过迭代诱变过程，产生了PBC6.1的几种非转基因衍生菌株(表10)。

表10.本研究中使用的分离和衍生K.sacchari菌株的列表。Prm，来源于PBC6.1基因组的启动子序列；ΔglnE_AR1和ΔglnE_AR2，不同截短形式的glnE基因，其中去除了腺苷酰基去除结构域序列。

菌株ID	基因型
		PBC6.1	WT
PBC6.14	ΔnifL::Prm1
		PBC6.15	ΔnifL::Prm5
PBC6.22	ΔnifL::Prm3
		PBC6.37	ΔnifL::Prm1 ΔglnE<sub>AR</sub>2
PBC6.38	ΔnifL::Prm1 ΔglnE<sub>AR</sub>1
		PBC6.93	ΔnifL::Prm1 ΔglnE<sub>AR</sub>2 ΔamtB
PBC6.94	ΔnifL::Prm1 ΔglnE<sub>AR</sub>1 ΔamtB

进行了几种体外试验以表征衍生菌株的特定表型。ARA用于评估菌株对外源氮的敏感性，其中PBC6.1在高谷氨酰胺浓度下表现出对固氮酶活性的抑制(图28D)。相反，大多数衍生菌株显示出去抑制的表型，在高谷氨酰胺浓度下观察到不同水平的乙炔还原。通过qPCR分析的样品中nifA的转录率与乙炔还原率良好相关(图31)，从而支持nifL破坏和***不依赖氮的启动子以驱动nifA可导致nif簇去阻遏的假设。与野生型或没有这些突变的衍生菌株相比，具有改变的GlnE或AmtB活性的菌株显示出显著增加的铵排出速率(图28E)，说明了这些基因型对氨同化和再摄取的影响。

进行了两个实验以研究PBC6.1衍生物与玉米植物的相互作用并量化固定氮向植物组织中的掺入。首先，在使用同位素示踪剂的温室研究中量化微生物固氮速率。简而言之，用15N标记的肥料使植物生长，并且植物组织中15N的稀释浓度表明来自微生物的固定氮的贡献。用选择的微生物菌株接种玉米幼苗，并使植物生长至V6生长阶段。随后解构植物以测量微生物定植和基因表达，以及通过同位素比质谱法(IRMS)测量植物组织中的15N/14N比。对空气组织的分析显示PBC6.38对植物氮水平的贡献很小，没有显著性，而PBC6.94的显著贡献(p＝0.011)。在地上玉米叶中发现的大约20％的氮是由PBC6.94产生的，其余的来自种子、盆栽混合物或其它土壤携带微生物的“背景”固定(图29C)。这说明我们的微生物育种路线可以产生能够在氮肥的存在下对植物产生显著氮贡献的菌株。测量植物组织内的微生物转录，在衍生菌株中观察到nif基因簇的表达，而在野生型菌株中未观察到(图29B)，表明nif去阻遏对于施肥条件下BNF对作物的贡献的重要性。通过qPCR测量的根定植表明，对于每种测试的菌株，定植密度是不同的(图29A)。在PBC6.38与PBC6.94之间观察到50倍的定植差异。这种差异可表明，PBC6.94由于高水平的固定和排出而相对于PBC6.38降低了根际适应性。

方法

培养基

基本培养基含有(每升)25g Na₂HPO₄、0.1g CaCL₂-2H₂O、3gKH₂PO₄、0.25g MgSO₄·7H₂O、1g NaCl、2.9mg FeCl₃、0.25mg Na₂MoO₄·2H₂O和20g蔗糖。生长培养基被定义为每升补充50ml 200mM谷氨酰胺的基本培养基。

固氮生物的分离

在从San Joaquin County，CA采集的土壤中，在22℃(夜晚)至26℃(白天)的温室环境中，玉米幼苗从种子(DKC 66-40，DeKalb，IL)生长两周，并暴露于16小时光照周期。收获根并用无菌去离子水洗涤以除去大块土壤。将根组织用组织裂解器(TissueLyser II，Qiagen P/N 85300)中的2mm不锈钢珠在设定30下匀浆3分钟，并将样品以13,000rpm离心1分钟，以从根相关细菌中分离组织。将上清液分成两部分，一部分用于通过16S rRNA扩增子测序表征微生物组，将另一部分稀释并接种在补充有1.5％琼脂的无氮肉汤(NfB)培养基上。将板在30℃下孵育5-7天。使用引物Ueda19f和Ueda406r，通过菌落PCR测试出现的菌落中nifH基因的存在。从nifH菌落PCR呈阳性的菌株中分离基因组DNA(QIAamp DNA MiniKit，目录号51306，QIAGEN，Germany)并测序(Illumina MiSeq v3，SeqMatic，Fremont，CA)。序列装配并注释后，含有固氮基因簇的分离物用于下游研究。

分离幼苗的微生物组概况分析

使用ZR-96基因组DNA I试剂盒(Zymo Research P/N D3011)从根相关细菌中分离基因组DNA，并使用靶向799f和1114r的nextera条形码化的引物产生16S rRNA扩增子。纯化扩增子文库，并用Illumina MiSeq v3平台(SeqMatic，Fremont，CA)测序。使用minikraken数据库使用Kraken对读数进行分类学分类(图30)。

乙炔还原试验(ARA)

使用乙炔还原试验的修改形式来测量纯培养条件下的固氮酶活性。菌株在SOB(RPI，P/N S25040-1000)中在30℃下以200RPM振摇24小时从单菌落繁殖，然后以1∶25传代培养至生长培养基中，并在需氧条件下生长24小时(30℃，200转)。然后将1ml的基本培养基培养物加入到4ml在气密的Hungate管中补充有0至10mM谷氨酰胺的基本培养基中，并在厌氧条件下生长4小时(30℃，200RPM)。除去10％顶部空气，然后通过注射用等体积的乙炔代替，并继续孵育1小时。随后，通过气密注射器除去2ml顶部空气，以便使用配备有火焰离子化检测器(FID)的Agilent 6850气相色谱仪量化乙烯产生。

铵排出试验

在厌氧生物反应器中使用分批发酵测量氨形式的固定氮的排出。菌株在96孔DeepWell板中在1ml/孔SOB中从单菌落繁殖。将板在30℃下以200RPM振摇孵育24小时，然后1∶25稀释到含有1ml/孔生长培养基的新板中。将细胞孵育24小时(30℃，200RPM)，然后1∶10稀释到含有基本培养基的新板中。将板转移至厌氧室，其中含有＞98.5％氮气、1.2-1.5％氢气和＜30ppM氧气的气体混合物，并在室温下以1350RPM孵育66-70小时。通过测量590nm处的光密度将初始培养物生物量与结束时的生物量进行比较。然后通过离心分离细胞，并在每个时间点使用针对生物量归一化的Megazyme Ammonia Assay试剂盒(P/N K-AMIAR)测定来自反应器肉汤的上清液的游离氨。

根相关微生物组的提取

轻轻摇动根以除去松散的颗粒，分离根系并浸泡在RNA稳定化溶液(ThermoFisher P/N AM7021)中30分钟。然后用无菌去离子水短时冲洗根。在组织裂解器(TissueLyser II，Qiagen P/N 85300)中使用1/2英寸不锈钢球轴承在2ml裂解缓冲液(Qiagen P/N 79216)中进行珠磨，以将样品均质化。用ZR-96 Quick-gDNA试剂盒(ZymoResearch P/N D3010)进行基因组DNA提取，并使用RNeasy试剂盒(Qiagen P/N 74104)进行RNA提取。

根定植试验

种植后4天，将1ml细菌过夜培养物(约10⁹cfu)施加至播种种子上方的土壤。每周用25ml补充有0.5mM硝酸铵有改良Hoagland溶液对幼苗施肥三次。种植四周后，收集根样品并提取总基因组DNA(gDNA)。采用设计用于扩增野生型或衍生菌株基因组的独特区域的引物，通过qPCR对根定植进行定量。使用由来自靶基因组的已知量的gDNA生成的标准曲线测量QPCR反应效率。使用组织重量和提取体积将数据对每g鲜重的基因组拷贝进行归一化。对于每个实验，将定植数与未处理的对照幼苗进行比较。

植物中的转录物组学

如在根定植试验中所述，在生长和加工的幼苗中测量根相关微生物的转录概况。使用Illumina NextSeq平台(SeqMatic，Fremont，CA)对纯化的RNA进行测序。使用bowtie2，使用′-非常敏感-局部′参数和最小比对评分30，将读数定位到接种菌株的基因组。使用samtools计算整个基因组的覆盖率。将差异覆盖度对管家基因表达进行归一化，并使用Circos在整个基因组中可视化，并使用DNAplotlib在整个nif基因簇中可视化。另外，通过靶向Nanostring分析量化植物中转录谱。在nCounter Sprint(Core Diagnostics，Hayward，CA)上处理纯化的RNA。

15N稀释温室研究

进行15N肥料稀释实验以评估植物中优化的菌株活性。使用蛭石和洗过的沙子(在DI H₂O中漂洗5次)的混合物制备含有最小背景N的种植培养基。将沙子混合物在122℃下高压灭菌1小时，并称量约600g置于40立方英寸(656mL)的罐中，将其用无菌DI H₂O饱和并在种植前24小时排出。将玉米种子(DKC 66-40)在0.625％次氯酸钠中表面灭菌10分钟，然后在无菌蒸馏水中漂洗5次，并种植在1cm深处。将植物在荧光灯下维持4周，室温下每天16小时白昼长度，平均22℃(夜晚)至26℃(白天)。

种植后5天，用1ml细胞悬浮液通过直接浸透在新出现的胚芽鞘上接种幼苗。从SOB中的5ml过夜培养物制备接种物，将其旋转沉淀并在5ml PBS中重悬浮两次以除去残留的SOB，然后最终稀释至OD为1.0(约10⁹CFU/ml)。用无菌PBS处理对照植物，并将每种处理物请回至10株重复植物。

植物在种植后5、9、14和19天用含有2％15N富集的2mM KNO₃的25ml肥料溶液施肥，并且在种植后7、12、16和18天用不含KNO₃的相同溶液施肥。肥料溶液含有(每升)3mmolCaCl₂、0.5mmol KH₂PO₄、2mmol MgSO₄、17.9μtmol FeSO₄、2.86mg H₃BO₃、1.81mg MnCl₂·4H₂O、022mg ZnSO₄·7H₂O、51μg CuSO₄·5H₂O、0.12mg Na₂MoO₄·2H₂O和0.14nmol NiCl₂。根据需要，用无菌DI H₂O对所有罐浇水，以保持一致的土壤水分而不会产生径流。

在四周时，收获植物，并在最低节点分离成用于根gDNA和RNA提取的样品以及用于IRMS的空气组织。根据需要擦拭空气组织以除去沙子，将其整个放入纸袋中并在60℃下干燥至少72小时。一旦完全干燥，即通过珠磨将全部空气组织均质化，并由MBL StableIsotope Laboratory(The Ecosystems Center，Woods Hole，MA)通过同位素比质谱法(IRMS)分析5-7mg样品的δ15N。使用以下公式计算NDFA百分比：％NDFA＝(UTC的δ15N平均值-样品的δ15N)/(UTC的δ15N平均值average)x100

实施例11：采用本公开的微生物的田间试验-2017年夏季

为了评价本公开的菌株在不同氮气方案下对玉米生长和生产力的功效，进行了田间试验。以下田间数据表明，在氮限制环境下以及非氮限制环境下，本公开的非属间微生物能够固定大气氮并将所述氮输送至植物-导致产率增加。

试验在美国的七个地点进行，有六个地理位置不同的中西部地点。五种氮方案用于肥料处理：地点/区域的标准农业实践的100％，100％减去25磅，100％减去50磅，100％减去75磅，和0％；全部为每英亩。100％方案的每英亩的氮磅数取决于地点/区域的标准农业实践。上述氮方案的范围从约153磅/英亩到约180磅/英亩，平均每英亩约164磅氮。

在每种肥料方案中，有14种处理。每种方案重复六次，并使用分割地块设计。14种处理包括：12种不同的微生物，1种是UTC加上与主要地块相同的肥料用量，1种是UTC与100％氮。在100％氮方案中，第二个UTC是100加25磅。

玉米地块至少是4行，长30英尺(行间30英寸)，每个地点有420个地块。除非另有说明，否则所有观测结果均来自中心两行地块，所有破坏性采样均来自***行。将种子样品冷藏至使用前1.5至2小时。

当地农业实践：种子是施加商业种子处理、没有生物共同施加的商业玉米。除杀菌剂应用(如果需要)外，播种率、种植日期、杂草/昆虫管理、收获时间和其它标准管理实践按照该地区的当地农业实践。遵循标准管理规范。

微生物施加：在已经接受正常化学处理的种子上，在种子处理物中将微生物施加至种子。用包含微生物的发酵液涂覆种子。

土壤表征：评价土壤质地和土壤肥力。采用标准土壤采样程序，其中包括深度为0-30cm和30-60cm的土壤核心。标准土壤采样包括测定硝态氮、铵态氮、总氮、有机物和CEC。标准土壤采样还包括测定pH、总钾和总磷。为了确定氮肥水平，取每个地点的种植前土壤样品以确保0-12”和可能12”至24”土壤区域的硝态氮。

在种植和施肥之前，从UTC的0到6-12”收集2ml土壤样品。使用中间的一行，每个氮区域每次重复收集一个样品。(5种肥料方案×6次重复＝30个土壤样品)。

种植后(V4-V6)，从UTC的0至6-12”收集2ml土壤样品。使用该行的中间，每个氮区域每次重复收集一个样品。(5种肥料方案×6次重复＝30个土壤样本)。

收获后(V4-V6)，从UTC的0至6-12”收集2ml土壤样品。使用该行的中间，每个氮区域每次重复收集一个样品。在UTC的0-12”处和可能UTC的12-24”处收集另外的收获后土壤样品(5种肥料方案×6次重复＝30个土壤样品)。

来自每种肥料方案的V6-V10土壤样品(不包括100％和100％+25磅[在100％区块中])处理，对于所有肥料方案，在0-12“和12-24”。(5种肥料方案x2个深度＝每个地点10个样品)。

来自每种肥料方案的收获后土壤样品(不包括100％和100％+25磅[在100％区块中])处理，对于所有肥料方案，在0-12“和12-24”。(5种肥料方案x2个深度＝每个地点10个样品)。

评估：在约50％UTC评估初始植物群体，并在收获前评估最终植物群体。评估包括(1)潜在温度(温度探头)；(2)V4和V8-V10时的活力(1-10级，10＝优异)；(3)V8-V10和V14时的株高；(4)产率(蒲式耳/英亩)，针对标准水分百分比进行调整；(5)测试重量；(6)谷粒含水百分比；(7)黑色层处的茎硝酸盐检测(420个地块×7个地点)；(8)在V4-V6，在0％和100％肥料下，拉链锁袋中每个地块1株植物的定植(1株植物×14种处理×6次重复×2种肥料方案＝168株植物)；(9)在V4-V6，在0％和100％肥料下，拉链锁袋中每个地块1株植物的转录物组学(1株植物×14种处理×6次重复×2种肥料方案＝168个植物)；(10)在两个时间点(V4-V6和VT)使用Greenseeker仪器进行归一化差异植生指数(NDVI)或归一化差异红边(NDRE)确定，以评估所有7个地点的每个地块(420个地块×2个时间点×7个地点＝5,880个数据点)；(11)在R2与R5之间，在所有7个地点测量茎特征，包括记录每个地块10株植物在6”高度处的茎直径，记录6”标记上方第一个节间的长度，监测10株植物(从两个内部行的中心起连续五株植物)(420个地块×10株植物×7个地点＝29,400个数据点)。

监测时间表：从业者参观了V3-V4阶段的所有试验，以评估季节早期对处理的反应以及在生殖生长阶段监测成熟度。当地合作者持续参观了研究试验。

天气信息：收集从种植到收获的天气数据，包括每日最低和最高气温，播种时的土壤温度，每日降雨加灌溉(如果使用)，以及异常天气事件，如风、雨、冷、热。

数据报告：包括上述数据，田间试验产生的数据点包括土壤质地；行间距；地块大小；灌溉；耕作；以前的作物；播种率；植物群体；季节性肥料投入，包括来源、用量、时间选择和布置；收获区域尺寸，收获方法，如手工或机器，以及使用的测量工具(秤、产量监测器等)

结果：图32和图33报告了从上述田间试验的选择结果。

在图32中，可以看出，本公开的微生物(即6-403)导致比野生型菌株(WT)更高的产率和比未处理的对照(UTC)更高的产率。“-25lbs N”处理比该地区的标准农业实践使用少25磅的氮/英亩。“100％N”UTC处理旨在描述该地区的标准农业实践，其中由农民部署100％的标准N利用。微生物“6-403”以NCMA 201708004保藏，并且可以在表A中找到。这是突变Kosakonia sacchari(也称为CM037)，并且是来自CI006 WT的后代突变株。

在图33中，获得的产率结果证明，本公开的微生物在不同地点一致地发挥作用。此外，产率结果表明，本公开的微生物在氮胁迫环境(即氮限制环境)以及具有充足氮供应的环境(即非氮限制条件)下均表现良好。微生物“6-881”(也称为CM094，PBC6.94)是来自CI006 WT的后代突变Kosakonia sacchari菌株，以NCMA 201708002保藏，并且可以在表A中找到。微生物“137-1034”是来自CI137 WT的后代突变变栖克雷伯氏菌菌株，以NCMA201712001保藏，可以在表A中找到。微生物“137-1036”是来自CI137 WT的后代突变变栖克雷伯氏菌菌株，以NCMA 201712002保藏并且可以在表A中找到。微生物“6-404”(也称为CM38，PBC6.38)是来自CI006 WT的后代突变Kosakonia sacchari菌株，以NCMA 201708003保藏，并且可以在表A中找到。

实施例12：对农业系统有益的非属间微生物的属

评价本公开的微生物并相互比较其在整个季节每英亩产生的氮产量。参见图20、图40和图41。

本发明人假设，为了使工程化非属间微生物群体在现代行间作物农业系统中有益，微生物群体需要每季每英亩产生至少一磅或更多的氮。

对此，本发明人惊奇地发现了一种微生物功能属，其尤其能够有助于：提高非豆科作物的产率；和/或减轻农民对外源氮施用的依赖；和/或即使在非氮限制环境中，也具有每季每英亩产生至少一磅氮的能力，所述属通过每小时每个微生物产生的定植能力×mmol N来定义(即线分割，图20、40和41)。

关于图20、40和41，汇集了利用本公开的微生物的某些数据，以描绘本公开的微生物每英亩-季节递送的氮的磅数的热图，其被记录为每g-鲜重的微生物相对于mmol氮/微生物-hr的函数。横切较大图像的细线下方是每英亩-季节递送不到一磅氮的微生物，而在线的上方是每英亩-季节递送超过一磅氮的微生物。

田间数据和野生型定植热图：测定图20热图中使用的微生物在玉米中的N产量。对于WT菌株CI006和CI019，从单个田间地点获取玉米根定植数据。对于其余的菌株，假定定植与WT田间水平相同。在5mM谷氨酰胺的存在下使用体外ARA试验测定N-固定活性。图20中的热图下方的表格给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及热图中显示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。

田间数据热图：图40热图中使用的数据来源于在田间条件下测定玉米中的N产量的微生物菌株。每个点代表由微生物产生的lb N/英亩，其利用来自单个田间地点的玉米根定植数据。在谷氨酰胺或磷酸铵形式的5mM N的存在下使用体外ARA试验测定N-固定活性。以下表C给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及图40的热图中所示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。

温室和实验室数据热图：图41热图中使用的数据来源于在实验室和温室条件下测定玉米中的N产量的微生物菌株。每个点代表由单个菌株产生的lb N/英亩。白点代表在温室条件下收集玉米根定植数据的菌株。黑点代表玉米根定植水平来源于野生型亲本菌株的平均田间根定植水平的突变菌株。带阴影线的点代表处于其平均田间玉米根定植水平的野生型亲本菌株。在所有情况下，在谷氨酰胺或磷酸铵形式的5mM N的存在下通过体外ARA试验测定N-固定活性。以下表D给出了每个微生物每小时产生的mmol N的精确值(mmol N/微生物hr)以及图41的热图中所示的每种微生物的精确CFU/g鲜重(CFU/g fw)。

表C：图40-田间数据热图

表D：图41-温室和实验室数据热图

结论：图20、40、41和表C和D中的数据示出了所述属的超过一打代表性成员(即图中线右侧的微生物)。此外，这些众多的代表性成员来自多个分类学属，可以在上面的表C和D中找到。此外，发明人已经发现了许多遗传属性，这些属性描述了在许多微生物中发现的结构/功能关系。这些遗传关系可以在本公开的许多表格中找到，这些表格中列出了本发明人引入的遗传修饰，其包括将至少一个遗传变异引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中。

因此，新发现的属得到以下方面的支持：(1)强大的数据集，(2)超过一打代表性成员，(3)来自不同分类学属的成员，和(4)在属成员的基础遗传结构中定义结构/功能关系的遗传修饰类别。

实施例13：用于检测非属间工程化微生物的方法和测定

本公开教导了可用于检测各种前述实施例中使用的微生物的引物、探针和测定。该测定能够检测衍生/突变非属间微生物中的非天然核苷酸“连接”序列。这些非天然存在的核苷酸连接可用作一种类型的诊断物，其指示微生物中存在特定的遗传改变。

本技术能够通过利用专门的定量PCR方法(包括独特设计的引物和探针)检测这些非天然存在的核苷酸连接。探针可以与非天然存在的核苷酸连接序列结合。即，可以使用由用荧光报道分子标记的寡核苷酸组成的序列特异性DNA探针，其仅在该探针与其互补序列杂交后允许检测。该定量方法可确保仅有非天然存在的核苷酸连接会通过教导的引物扩增，因此可以通过非特异性染料或通过利用特异性杂交探针进行检测。该方法的另一个方面是选择引物，使得引物位于连接序列的任一侧，使得如果发生扩增反应，则存在所述连接序列。

因此，可以从样品中提取基因组DNA，并用来通过使用qPCR来量化本公开的微生物的存在。在qPCR反应中使用的引物可以是由Primer Blast(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast)设计的引物，用来扩增野生型基因组的独特区域或工程化非属间突变株的独特区域。qPCR反应可以使用SYBR GreenER qPCR SuperMixUniversal(Thermo Fisher P/N 11762100)试剂盒来进行，其中仅使用正向和反向扩增引物；或者，Kapa Probe Force试剂盒(Kapa Biosystems P/N KK4301)可与扩增引物和含有5′端的FAM染料标记物、内部ZEN猝灭剂和小沟结合剂和3′端的荧光猝灭剂的TaqMan探针(Integrated DNA Technologies)一起使用。

可以在qPCR方法中使用的某些引物、探针和非天然连接序列在以下表E中列出。具体地，非天然连接序列可以在SEQ ID NO：372-405中找到。

表F：工程化非属间微生物

表G：工程化非属间微生物

表H

除非本文另外说明或明显与上下文矛盾，否则在描述本发明的上下文(特别是在下面的权利要求的上下文中)中使用的术语“一”、“一个”和“该”以及类似的指代应解释为涵盖单数和复数两者。除非另有说明，否则术语“包含”、“具有”、“包括”和“含有”将被解释为开放式术语(即，意指“包括但不限于”)。除非本文另外说明，否则本文中数值范围的叙述仅仅旨在作为个别引用落入该范围内的每个单独值的简写方法，并且每个单独的值并入说明书，犹如其在本文中单独列举一样。例如，如果公开了范围10-15，则还公开了11、12、13和14。除非本文另外说明或者与上下文明显矛盾，否则本文描述的所有方法可以以任何合适的顺序执行。除非另外声明，否则本文提供的任何和所有示例或示例性语言(例如，“如”)的使用仅旨在更好地说明本发明，而不是对本发明的范围进行限制。说明书中的任何表述都不应被解释为将任何未要求保护的元素指示为实施本发明所必需的。

条目

1.一种增加非豆科植物中的固氮的方法，其包括：

向所述植物施加多种非属间细菌，所述多种非属间细菌包含以下非属间细菌，其：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且

其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生1％或更多的固定氮，并且

其中所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

2.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力。

3.根据权利要求1的方法，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

4.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

5.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的引入的控制序列。

6.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的启动子。

7.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的诱导型启动子。

8.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌不包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的基因可操作地连接的组成型启动子。

9.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌不包含与nif基因簇中的基因可操作地连接的组成型启动子。

10.根据条目1的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

11.根据条目1的方法，其中施加于所述植物的所述多种非属间细菌不刺激外源非大气氮的摄取的增加。

12.根据条目1的方法，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮。

13.根据条目1的方法，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮，并且其中所述含氮肥料包含铵或含铵分子。

14.根据条目1的方法，其中所述外源氮选自包含谷氨酰胺、氨、铵、尿素、硝酸盐、亚硝酸盐、含铵分子、含硝酸盐分子和含亚硝酸盐分子中的一种或多种的肥料。

15.根据条目1的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生5％或更多的固定氮。

16.根据条目1的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生10％或更多的固定氮。

17.根据条目1的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在非氮限制条件下固定大气氮。

18.根据条目1的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

19.根据条目1的方法，其中由所述多种非属间细菌产生的固定氮通过在植物组织中用大气N₂气稀释富集肥料来测量。

20.根据条目1的方法，其中所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因或非编码多核苷酸选自：nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、gln4、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

21.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是导致以下一种或多种结果的突变：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

22.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异选自：(A)敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***；或(D)结构域缺失。

23.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

24.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

25.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

26.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异选自：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

27.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

28.根据条目1的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，以及突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

29.根据条目1的方法，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

30.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成组合物。

31.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

32.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌施加至种植所述植物的种子的犁沟中。

33.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

34.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌施加到所述植物的种子上。

35.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成种子包衣，并施加到所述植物的种子上。

36.根据条目1的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成种子包衣，并以约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的浓度施加到所述植物的种子上。

37.根据条目1的方法，其中所述植物是谷类作物。

38.根据条目1的方法，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

39.根据条目1的方法，其中所述植物是玉米。

40.根据条目1的方法，其中所述植物是农作物植物。

41.根据条目1的方法，其中所述植物是遗传修饰的生物体。

42.根据条目1的方法，其中所述植物不是遗传修饰的生物体。

43.根据条目1的方法，其中所述植物已经进行了遗传工程化或培育以用于有效的氮利用。

44.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含至少两种不同种的细菌。

45.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含相同细菌种的至少两种不同的菌株。

46.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacterspiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyveraintermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

47.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

48.根据条目1的方法，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：以PTA-122293保藏的细菌，以PTA-122294保藏的细菌，以NCMA 201701002保藏的细菌，以NCMA 201708004保藏的细菌，以NCMA 201708003保藏的细菌，以NCMA 201708002保藏的细菌，以NCMA201712001保藏的细菌，以NCMA 201712002保藏的细菌，及其组合。

49.一种细菌组合物，其包含：

至少一种基因工程细菌菌株，所述细菌菌株在已经用每英亩超过20磅氮施肥的农业系统中固定大气氮。

50.一种细菌组合物，其包含：

至少有一种细菌菌株，所述细菌菌株已被培育为在已经用每英亩超过20磅氮施肥的农业系统中固定大气氮。

51.根据条目49或50所述的细菌组合物，其中所述肥料是选自无水氨、硫酸铵、尿素、磷酸二铵、尿素形式、UAN(尿素硝酸铵)磷酸一铵、硝酸铵、氮溶液、硝酸钙、硝酸钾和硝酸钠的化学肥料。

52.一种细菌组合物，其包含：

至少一种固定大气氮的基因工程细菌菌株，所述至少一种基因工程细菌菌株包含外源添加的DNA，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少80％的同一性。

53.根据条目52的细菌组合物，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少85％的同一性。

54.根据条目52的细菌组合物，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少90％的同一性。

55.根据条目52的细菌组合物，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少95％的同一性。

56.根据条目52的细菌组合物，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少99％的同一性。

57.根据条目52的细菌组合物，其中所述外源添加的DNA来源于与所述相应的天然细菌菌株相同的细菌菌株。

58.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其中所述细菌组合物是施肥组合物。

59.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其中所述至少一种基因工程细菌菌株在选自下组的基因的10，000bp内的基因或基因间区中包含至少一个变异：nifA、nifL、ntrB、ntrC、glnA、glnB、glnK、draT、amtB、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB和nifQ。

60.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其进一步包含至少一种选自增粘剂、微生物稳定剂、杀真菌剂、抗菌剂、防腐剂、稳定剂、表面活性剂、抗复合剂、除草剂、杀线虫剂、杀虫剂、植物生长调节剂、肥料、灭鼠剂、干燥剂、杀细菌剂和营养物的额外组分。

61.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其进一步包含至少一种选自着色剂、引发剂(primer)、微丸、消毒剂、植物生长调节剂、安全剂和杀线虫剂的额外组分。

62.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其中所述细菌组合物被配制成施加至田间。

63.根据条目62所述的细菌组合物，其中所述细菌组合物被配制成在犁沟中施加。

64.根据条目62所述的细菌组合物，其中所述细菌组合物被配制成作为种子包衣、种衣剂或种子处理物来施加。

65.根据条目61或条目62的细菌组合物，其中所述细菌组合物被配制成在种子播种之时、之前或之后施加。

66.一种种子组合物，其包含以任何前述条目的细菌组合物接种的植物种子。

67.一种使用具有条目66的种子组合物的多个种子种植作物的方法。

68.根据条目67的方法，其进一步包括收获所述作物。

69.一种将前述任一条目的细菌组合物施加至田间的方法。

70.根据条目69的方法，其中所述细菌组合物以选自液体形式、干燥形式、颗粒、粉末和微丸的形式施加至所述田间。

71.根据条目69的方法，其中所述细菌组合物作为种子包衣、种衣剂或种子处理物施加至所述田间。

72.根据条目69的方法，其中所述细菌组合物作为犁沟内处理施加至所述田间。

73.根据条目69的方法，其中所述细菌组合物在种子播种之时、之前或之后施加至所述田间。

74.一种肥料组合物，其包含任何前述条目的细菌组合物。

75.根据条目74的肥料组合物，其中所述肥料组合物是种子包衣、种衣剂或种子处理组合物。

76.根据条目74的肥料组合物，其中所述肥料组合物是犁沟内组合物。

77.根据第74项所述的肥料组合物，其中所述肥料组合物在种植之时、之前或之后提供给作物。

78.根据条目74的肥料组合物，其进一步包含多孔载体。

79.根据条目74的肥料组合物，其进一步包含另外的协同组分，当与所述细菌组合物组合时，所述另外的协同组分增加所述肥料组合物对作物的施肥益处，其超出其各个组分的累积益处。

80.一种维持土壤氮水平的方法，其包括：

在田间土壤中种植以固定大气氮的基因工程细菌接种的作物；以及

收获所述作物，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过90％。

81.根据条目80的方法，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过80％。

82.根据条目80的方法，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过70％。

83.根据条目80的方法，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过60％。

84.根据条目80的方法，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过50％。

85.条目80的方法，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过40％。

86.根据条目80的方法，其中所述基因工程细菌包含任何前述条目的细菌组合物。

87.根据条目80的方法，其中所述基因工程细菌由任何前述条目的细菌组合物组成。

88.一种向作物植物递送益生菌补充剂的方法，其包括：

用种子包衣、种子处理物或种衣剂涂覆作物种子，其中所述种子包衣、种衣剂或种子处理物包含所述益生菌的活体代表；以及

在田间土壤中施加所述作物种子。

89.根据条目88的方法，其中所述种子包衣、种衣剂或种子处理物以单层施加至所述作物种子。

90.根据条目88的方法，其中所述种子包衣以多层施加至所述作物种子。

91.根据条目88的方法，其中所述种子包衣以混合物形式施加至所述作物种子。

92.根据条目88的方法，其中所述作物种子是非结瘤的。

93.根据条目88的方法，其中所述种子包衣包含任何前述条目的细菌组合物。

94.根据任何前述条目的方法，其中所述基因工程细菌菌株是基因工程***菌株。

95.根据条目94的方法，其中所述基因工程***菌株具有改变的Nif簇调节物的表达水平。

96.根据条目94的方法，其中所述基因工程***菌株表达减少量的Nif簇的负调节物。

97.根据条目94的方法，其中所述基因工程菌株表达减少量的GlnR。

98.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。

99.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。

100.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。

101.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。

102.一种培育微生物菌株以改良农艺相关性的特定性状的方法，其包括：

提供具有定植于所需作物能力的多种微生物菌株；

通过基因组内重排来改良影响该性状的调节网络；

评估所述多种微生物菌株内的微生物菌株，以确定该性状的量度；以及

选择所述多种微生物菌株中的一种或多种微生物菌株，其在所需作物的存在下产生性状的改良。

103.根据条目102的方法，其中所述改良的特定性状是微生物菌株固定氮的能力。

104.根据条目103的方法，其中所述改良的特定性状是微生物菌株在N-施肥生长条件的存在下固定大气氮的能力。

105.一种培育微生物菌株以改良农艺相关性的特定性状的方法，其包括：

提供具有定植于所需作物能力的多种微生物菌株；

将遗传多样性引入所述多种微生物菌株中；

评估所述多种微生物菌株内的微生物菌株，以确定该性状的量度；以及

选择所述多种微生物菌株中的一种或多种微生物菌株，其在所需作物的存在下产生性状的改良。

106.根据条目105的方法，其中所述改良的特定性状是微生物菌株固定氮的能力。

107.条目106的方法，其中所述改良的特定性状是微生物菌株在N-施肥生长条件的存在下固定大气氮的能力。

108.一种增加非豆科植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述非豆科植物暴露于工程化非属间微生物，所述工程化非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异或至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

109.根据条目108的方法，其中所述工程化非属间微生物包含至少一个引入所述固氮遗传调节网络中的遗传变异。

110.根据条目108的方法，其中所述工程化非属间微生物包含至少一个引入所述氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

111.根据条目108的方法，其中所述工程化非属间微生物包含至少一个引入所述固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入所述氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

112.根据条目108的方法，其中将所述工程化非属间微生物施加至种植所述非豆科植物的种子的犁沟中。

113.根据条目108的方法，其中将所述工程化非属间微生物涂覆在所述非豆科植物的种子上。

114.根据条目108的方法，其中所述非豆科植物是选自高粱、油菜、番茄、草莓、大麦、稻、玉米、小麦、马铃薯、粟、谷类、谷物和玉米的非豆科农作物植物。

115.根据条目108的方法，其中所述工程化非属间微生物至少定植于所述非豆科植物的根，使得所述工程化非属间微生物以每克组织鲜重至少10⁵个菌落形成单位的量存在于所述非豆科植物中。

116.根据条目108的方法，其中所述工程化非属间微生物能够在非氮限制条件下固定大气氮。

117.根据条目108的方法，其中植物中的所述工程化非属间微生物排出含氮的固氮产物。

118.根据条目108的方法，其中所述至少一个遗传变异被引入选自下组的基因中：nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

119.根据条目108的方法，其中植物中的所述工程化非属间微生物在所述非豆科植物中产生至少1％的固定氮。

120.根据条目119的方法，其中由所述工程化非属间微生物产生的在所述非豆科植物中的所述固定氮通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N来测量。

121.根据条目119的方法，其中植物中的所述工程化非属间微生物在所述非豆科植物中产生5％或更多的固定氮。

122.根据条目108的方法，其中使用选自定向诱变、随机诱变和定向进化的至少一种类型的工程化对所述非属间微生物进行工程化。

123.一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述玉米植物暴露于工程化非属间微生物，所述微生物在选自nifL、glnB、glnE和amtB的至少两种基因内包含工程化遗传变异。

124.根据条目123的方法，其中植物中的所述工程化非属间微生物排出含氮的固氮产物。

125.根据条目123的方法，其中将所述工程化非属间微生物施加至种植所述玉米植物的种子的犁沟中。

126.根据条目123的方法，其中将所述工程化非属间微生物涂覆到所述玉米植物的种子上。

127.一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述玉米植物暴露于工程化非属间微生物，所述微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异，其中如通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N所测量的，植物中的所述工程化非属间微生物在所述玉米植物中产生至少5％的固定氮。

128.一种增加非豆科植物中的固氮的方法，其包括：

a.向植物施加多种非属间细菌，所述多种非属间细菌包含以下非属间细菌，其

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且

其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.5×10^-8mmol N，并且

其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生1％或更多的固定氮，并且

其中所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

129.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因可操作地连接的引入的控制序列。

130.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的启动子。

131.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的诱导型启动子。

132.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌不包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的基因可操作地连接的组成型启动子。

133.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌不包含与nif基因簇中的基因可操作地连接的组成型启动子。

134.根据条目128的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

135.根据条目128的方法，其中施加于所述植物的所述多种非属间细菌不刺激外源非大气氮的摄取的增加。

136.根据条目128的方法，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮。

137.根据条目128的方法，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮，并且其中所述含氮肥料包含铵或含铵分子。

138.根据条目128的方法，其中所述外源氮选自包含谷氨酰胺、氨、铵、尿素、硝酸盐、亚硝酸盐、含铵分子、含硝酸盐分子和含亚硝酸盐分子中的一种或多种的肥料。

139.根据条目128的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生5％或更多的固定氮。

140.根据条目128的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生10％或更多的固定氮。

141.根据条目128的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在非氮限制条件下固定大气氮。

142.根据条目128的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

143.根据条目128的方法，其中由所述多种非属间细菌产生的固定氮通过在植物组织中用大气N₂气稀释富集肥料来测量。

144.根据条目128的方法，其中所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因或非编码多核苷酸选自：nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

145.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是导致以下一种或多种结果的突变：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

146.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异选自：(A)敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***：或(D)结构域缺失。

147.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

148.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

149.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

150.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异选自：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

151.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

152.根据条目128的方法，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，以及突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

153.根据条目128的方法，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

154.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成组合物。

155.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

156.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌施加至种植所述植物的种子的犁沟中。

157.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

158.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌施加到所述植物的种子上。

159.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成种子包衣，并施加到所述植物的种子上。

160.根据条目128的方法，其中将所述多种非属间细菌配制成种子包衣，并以约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的浓度施加到所述植物的种子上。

161.根据条目128的方法，其中所述植物是谷类作物。

162.根据条目128的方法，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

163.根据条目128的方法，其中所述植物是玉米。

164.根据条目128的方法，其中所述植物是农作物植物。

165.根据条目128的方法，其中所述植物是遗传修饰的生物体。

166.根据条目128的方法，其中所述植物不是遗传修饰的生物体。

167.根据条目128的方法，其中所述植物已经进行了遗传工程化或培育以用于有效的氮利用。

168.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌包含至少两种不同种的细菌。

169.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌包含相同细菌种的至少两种不同的菌株。

170.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacterspiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyveraintermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

171.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

172.根据条目128的方法，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：以PTA-122293保藏的细菌，以PTA-122294保藏的细菌，以NCMA 201701002保藏的细菌，以NCMA201708004保藏的细菌，以NCMA 201708003保藏的细菌，以NCMA 201708002保藏的细菌，以NCMA 201712001保藏的细菌，以NCMA 201712002保藏的细菌，及其组合。

173.一种增加非豆科植物中的固氮的方法，其包括：

a.向所述植物施加多种细菌，所述多种细菌包含以下细菌，其：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且

其中植物中的所述多种细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。

174.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力。

175.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

176.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

177.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.5×10^-8mmol N。

178.根据条目173的方法，其中植物中的所述多种细菌排出含氮的固氮产物。

179.根据条目173的方法，其中施加于所述植物的所述多种细菌不刺激外源非大气氮的摄取的增加。

180.条目173的方法，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

181.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌配制成组合物。

182.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

183.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌施加至种植所述植物的种子的犁沟中。

184.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

185.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌施加到所述植物的种子上。

186.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌配制成种子包衣，并施加到所述植物的种子上。

187.根据条目173的方法，其中将所述多种细菌配制成种子包衣，并以约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的浓度施加到所述植物的种子上。

188.根据条目173的方法，其中所述植物是谷类作物。

189.根据条目173的方法，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

190.根据条目173的方法，其中所述植物是玉米。

191.根据条目173的方法，其中所述植物是农作物植物。

192.根据条目173的方法，其中所述植物是遗传修饰的生物体。

193.根据条目173的方法，其中所述植物不是遗传修饰的生物体。

194.根据条目173的方法，其中所述植物已经进行了遗传工程化或培育以用于有效的氮利用。

195.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含至少两种不同种的细菌。

196.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含相同细菌种的至少两种不同的菌株。

197.根据条目173的方法，其中所述多种细菌包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacterspiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyveraintermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

198.根据条目173的方法，其中所述多种细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

199.根据条目173的方法，其中所述多种细菌选自：以NCMA 201701003保藏的细菌，以NCMA 201701001保藏的细菌，和以NCMA 201708001保藏的细菌。

200.一种能够增加非豆科植物的固氮的非属间细菌群体，其包含：

a.多种非属间细菌，其：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且

其中植物中的所述多种非属间细菌在所述多种非属间细菌的存在下生长的植物中产生1％或更多的固定氮，并且

其中所述多种非属间细菌的每个成员包含至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮。

201.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力。

202.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

203.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

204.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的引入的控制序列。

205.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的启动子。

206.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的诱导型启动子。

207.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌不包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的基因可操作地连接的组成型启动子。

208.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌不包含与nif基因簇中的基因可操作地连接的组成型启动子。

209.根据条目200的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

210.根据条目200的非属间细菌群体，其中施加于所述植物的所述多种非属间细菌不刺激外源非大气氮的摄取的增加。

211.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮。

212.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物在来自田间的土壤中生长，所述田间已经每英亩施用至少约50磅的含氮肥料，并且其中所述含氮肥料包含至少约5重量％的氮，并且其中所述含氮肥料包含铵或含铵分子。

213.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述外源氮选自包含谷氨酰胺、氨、铵、尿素、硝酸盐、亚硝酸盐、含铵分子、含硝酸盐分子和含亚硝酸盐分子中的一种或多种的肥料。

214.根据条目200的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生5％或更多的固定氮。

215.根据条目200的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在所述植物中产生10％或更多的固定氮。

216.根据条目200的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在非氮限制条件下固定大气氮。

217.根据条目200的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌排出含氮的固氮产物。

218.根据条目200的非属间细菌群体，其中由所述多种非属间细菌产生的固定氮通过在植物组织中用大气N₂气稀释富集肥料来测量。

219.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因或非编码多核苷酸选自：nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

220.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是导致以下一种或多种结果的突变：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

221.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异选自：(A)敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***；或(D)结构域缺失。

222.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

223.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

224.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

225.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异选自：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

226.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

227.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，以及突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

228.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

229.根据条目200的非属间细菌群体，其中将所述多种非属间细菌配制成组合物。

230.根据条目200的非属间细菌群体，其中将所述多种非属间细菌配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

231.根据条目200的非属间细菌群体，其中将所述多种非属间细菌配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

232.根据条目200的非属间细菌群体，其中将所述多种非属间细菌配制成种子包衣。

233.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物是谷类作物。

234.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

235.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物是玉米。

236.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物是农作物植物。

237.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物是遗传修饰的生物体。

238.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物不是遗传修饰的生物体。

239.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述植物已经进行了遗传工程化或培育以用于有效的氮利用。

240.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含至少两种不同种的细菌。

241.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含相同细菌种的至少两种不同的菌株。

242.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacter spiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyvera intermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

243.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

244.根据条目200的非属间细菌群体，其中所述多种非属间细菌包含选自以下的细菌：以PTA-122293保藏的细菌，以PTA-122294保藏的细菌，以NCMA 201701002保藏的细菌，以NCMA 201708004保藏的细菌，以NCMA 201708003保藏的细菌，以NCMA 201708002保藏的细菌，以NCMA 201712001保藏的细菌，以NCMA 201712002保藏的细菌，及其组合。

245.一种能够增加非豆科植物中的固氮的细菌群体，其包含：

a.多种细菌，其：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且

其中植物中的所述多种细菌在植物中产生1％或更多的固定氮。

246.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力。

247.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

248.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含以下细菌，其具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

249.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含以下细菌，其：具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.5×10^-8mmol N。

250.根据条目245的细菌群体，其中植物中的所述多种细菌排出含氮的固氮产物。

251.根据条目245的细菌群体，其中施加于所述植物的所述多种细菌不刺激外源非大气氮的摄取的增加。

252.根据条目245的细菌群体，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

253.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌配制成组合物。

254.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

255.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌施加至种植所述植物的种子的犁沟中。

256.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

257.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌施加到所述植物的种子上。

258.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌配制成种子包衣，并施加到所述植物的种子上。

259.根据条目245的细菌群体，其中将所述多种细菌配制成种子包衣，并以约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的浓度施加到所述植物的种子上。

260.根据条目245的细菌群体，其中所述植物是谷类作物。

261.根据条目245的细菌群体，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

262.根据条目245的细菌群体，其中所述植物是玉米。

263.根据条目245的细菌群体，其中所述植物是农作物植物。

264.根据条目245的细菌群体，其中所述植物是遗传修饰的生物体。

265.根据条目245的细菌群体，其中所述植物不是遗传修饰的生物体。

266.根据条目245的细菌群体，其中所述植物已经进行了遗传工程化或培育以用于有效的氮利用。

267.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含至少两种不同种的细菌。

268.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含相同细菌种的至少两种不同的菌株。

269.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacterspiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyveraintermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

270.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

271.根据条目245的细菌群体，其中所述多种细菌选自：以NCMA 201701003保藏的细菌，以NCMA 201701001保藏的细菌，和以NCMA 201708001保藏的细菌。

272.一种细菌，其：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

273.一种非属间细菌，其包含：至少一个引入固氮或氮同化遗传调节网络的至少一个基因或非编码多核苷酸中的遗传变异，使得所述非属间细菌能够在外源氮的存在下固定大气氮，并且其中所述细菌：

i.具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力；并且/或者

ii.每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

274.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力。

275.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

276.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

277.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌具有每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的每单位植物根组织平均定植能力，并且每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N，并且其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.5×10^-8mmol N。

278.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的引入的控制序列。

279.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的启动子。

280.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因可操作地连接的诱导型启动子。

281.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌不包含与所述固氮或氮同化遗传调节网络的基因可操作地连接的组成型启动子。

282.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌不包含与nif基因簇中的基因可操作地连接的组成型启动子。

283.根据条目273的非属间细菌，其中植物中的所述细菌排出含氮的固氮产物。

284.根据条目273的非属间细菌，其中所述固氮或氮同化遗传调节网络的所述至少一个基因或非编码多核苷酸选自：nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

285.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是导致以下一种或多种结果的突变：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

286.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异选自：(A)敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***；或(D)结构域缺失。

287.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

288.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

289.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

290.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异选自：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

291.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

292.根据条目273的非属间细菌，其中所述至少一个遗传变异是突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，以及突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

293.根据条目273的非属间细菌，其被配制成组合物。

294.根据条目273的非属间细菌，其被配制成包含农业上可接受的载体的组合物。

295.根据条目273的非属间细菌，其被配制成液体犁沟内组合物。

296.根据条目273的非属间细菌，其被配制成种子包衣。

297.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌选自：水生拉恩氏菌(Rahnellaaquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacter spiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyvera intermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

298.根据条目273的非属间细菌，其中所述多种非属间细菌是内生细菌、附生细菌或根际细菌。

299.根据条目273的非属间细菌，其中所述细菌选自：以PTA-122293保藏的细菌，以PTA-122294保藏的细菌，以NCMA 201701002保藏的细菌，以NCMA 201708004保藏的细菌，以NCMA 201708003保藏的细菌，以NCMA 201708002保藏的细菌，以NCMA 201712001保藏的细菌，以NCMA 201712002保藏的细菌，及其组合。

300.一种增加植物中的固氮的方法，其包括向该植物施用有效量的组合物，该组合物包含：

i.纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269、277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列的细菌；

ii.纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276、284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌；和/或

iii.纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌；并且

其中与未施用该组合物的植物相比，施用有效量的该组合物的植物表现出固氮的增加。

301.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列的细菌。

302.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的核酸序列至少约99％相同的16S核酸序列的细菌。

303.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有选自SEQID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的16S核酸序列的细菌。

304.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌。

305.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约95％相同的核酸序列的细菌。

306.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约99％相同的核酸序列的细菌。

307.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有选自SEQID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、

137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列的细菌。

308.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列的细菌。

309.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约95％相同的核酸序列的细菌。

310.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约99％相同的核酸序列的细菌。

311.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有选自SEQID NO：177-260、296-303的核酸序列的细菌。

312.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有至少一个引入基因中的遗传变异的细菌，该基因选自nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、hifJ、nifH、nifD、hifK、nifY、nifE、nifN、hifU、nifS、hifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因。

313.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有至少一个引入基因中的遗传变异的细菌，该基因选自nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、hifJ、nifH、nifD、hifK、nifY、nifE、nifN、hifU、nifS、hifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因，其中所述遗传变异(A)是敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***；或(D)结构域缺失。

314.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有至少一个突变的细菌，该突变导致以下一种或多种结果：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

315.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有突变的nifL基因的细菌，所述nifL基因已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

316.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有突变的glnE基因的细菌，所述突变的glnE基因导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

317.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有突变的amtB基因的细菌，所述突变的amtB基因导致所述amtB基因的表达缺乏。

318.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有至少一个以下遗传改变的细菌：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

319.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有突变的nifL基因和突变的glnE基因的细菌，所述nifL基因已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，所述突变的glnE基因导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

320.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有突变的nifL基因和突变的glnE基因和突变的amtB基因的细菌，所述nifL基因已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，所述突变的glnE基因导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，所述突变的amtB基因导致所述amtB基因的表达缺乏。

321.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有nifL修饰的细菌，所述具有nifL修饰的细菌以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白。

322.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有nifL修饰的细菌，所述具有nifL修饰的细菌以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，其中所述修饰是破坏、敲除或截断。

323.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有nifL修饰的细菌，所述具有nifL修饰的细菌以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，并且其中所述细菌进一步包含与nifA序列可操作地连接的启动子。

324.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有nifL修饰的细菌，所述具有nifL修饰的细菌以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，并且其中所述细菌缺乏nifL同源物。

325.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有glnE修饰的细菌，所述具有glnE修饰的细菌以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白。

326.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有glnE修饰的细菌，所述具有glnE修饰的细菌以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，其中所述修饰是破坏、敲除或截断。

327.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有glnE修饰的细菌，所述具有glnE修饰的细菌以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，并且其中所述GlnE蛋白序列缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域。

328.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：纯化的细菌群体，其包含具有glnE修饰的细菌，所述具有glnE修饰的细菌以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，并且其中所述GlnE蛋白序列缺乏腺苷酰基去除(AR)活性。

329.根据条目300的方法，其中植物中的所述纯化的细菌群体为植物提供至少1％的固定氮。

330.根据条目300的方法，其中植物中的所述纯化的细菌群体为植物提供至少5％的固定氮。

331.根据条目300的方法，其中植物中的所述纯化的细菌群体为植物提供至少10％的固定氮。

332.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体能够在非氮限制条件下固定大气氮。

333.根据条目300的方法，其中植物中的所述纯化的细菌群体排出含氮的固氮产物。

334.根据条目300的方法，其中植物中的所述纯化的细菌群体向植物提供至少1％的固定氮，并且其中所述固定氮通过在植物组织中用大气N₂气稀释富集肥料来测量。

335.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体定植于所述植物的根，并且以每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的量存在。

336.根据条目300的方法，其中所述植物包含种子、茎、花、果实、叶或根茎。

337.根据条目300的方法，其中所述组合物包含：农业上可接受的载体。

338.根据条目300的方法，其中将包含所述纯化的细菌群体的组合物施用到种植所述植物的种子的犁沟内。

339.根据条目300的方法，其中将包含所述纯化的细菌群体的组合物配制成液体犁沟内组合物，所述液体犁沟内组合物包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

340.根据条目300的方法，其中将包含所述纯化的细菌群体的组合物施用到所述植物的种子上。

341.根据条目300的方法，其中将包含所述纯化的细菌群体的组合物配制成种子包衣，并施用到所述植物的种子上。

342.根据条目300的方法，其中将包含所述纯化的细菌群体的组合物配制成种子包衣，并以约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的浓度施用到所述植物的种子上。

343.根据条目300的方法，其中所述植物是非豆科的。

344.根据条目300的方法，其中所述植物是谷类作物。

345.根据条目300的方法，其中所述植物选自：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

346.根据条目300的方法，其中所述植物是玉米。

347.根据条目300的方法，其中所述植物是豆科植物。

348.根据条目300的方法，其中所述植物是谷类作物。

349.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含选自以下的细菌：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacterspiritinus、Achromobacter marplatensis、Microbacterium murale、Kluyveraintermedia、Kosakonia pseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillum lipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

350.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含拉恩氏菌属的细菌。

351.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含水生拉恩氏菌种的细菌。

352.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以PTA-122293保藏的细菌。

353.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201701003保藏的细菌。

354.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含Kosakonia属的细菌。

355.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含Kosakonia sacchari种的细菌。

356.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以PTA-122294保藏的细菌。

357.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201701001保藏的细菌。

358.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201701002保藏的细菌。

359.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201708004保藏的细菌。

360.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201708003保藏的细菌。

361.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201708002保藏的细菌。

362.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含克雷伯氏菌属的细菌。

363.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含变栖克雷伯氏菌种的细菌。

364.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201708001保藏的细菌。

365.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201712001保藏的细菌。

366.根据条目300的方法，其中所述纯化的细菌群体包含以NCMA 201712002保藏的细菌。

367.一种分离的细菌，其包含：

i.与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269、277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列；

ii.与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276、284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列；和/或

iii.与选自SEQ ID NO：177-260、296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列。

368.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的核酸序列至少约97％相同的16S核酸序列。

369.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的核酸序列至少约99％相同的16S核酸序列。

370.根据条目367的分离的细菌，其包含：选自SEQ ID NO：85、96、111、121、122、123、124、136、149、157、167、261、262、269和277-283的16S核酸序列。

371.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约90％相同的核酸序列。

372.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约95％相同的核酸序列。

373.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列至少约99％相同的核酸序列。

374.根据条目367的分离的细菌，其包含：选自SEQ ID NO：86-95、97-110、112-120、125-135、137-148、150-156、158-166、168-176、263-268、270-274、275、276和284-295的核酸序列。

375.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：177-260和296-303的核酸序列至少约90％相同的核酸序列。

376.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：177-260和296-303的核酸序列至少约95％相同的核酸序列。

377.根据条目367的分离的细菌，其包含：与选自SEQ ID NO：177-260和296-303的核酸序列至少约99％相同的核酸序列。

378.根据条目367的分离的细菌，其包含：选自SEQ ID NO：177-260和296-303的核酸序列。

379.根据条目367的分离的细菌，其包含：至少一个引入基因中的遗传变异，该基因选自nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、hifK、nifY、nifE、hifN、hifU、nifS、hifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因

380.根据条目367的分离的细菌，其包含：至少一个引入基因中的遗传变异，该基因选自nifA、nifL、ntrB、ntrC、编码谷氨酰胺合成酶的多核苷酸、glnA、glnB、glnK、drat、amtB、编码谷氨酰胺酶的多核苷酸、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、hifN、hifU、nifS、hifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB、nifQ以及与固氮酶的生物合成相关的基因，其中所述遗传变异(A)是敲除突变；(B)改变或消除靶基因的调节序列；(C)包含异源调节序列的***；或(D)结构域缺失。

381.根据条目367的分离的细菌，其包含：至少一个突变，该突变导致以下一种或多种结果：NifA或谷氨酰胺酶的表达或活性增加；NifL、NtrB、谷氨酰胺合成酶、GlnB、GlnK、DraT、AmtB的表达或活性降低；GlnE的腺苷酰基去除活性降低；或GlnD的尿苷酰基去除活性降低。

382.根据条目367的分离的细菌，其包含：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子。

383.根据条目367的分离的细菌，其包含：突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

384.根据条目367的分离的细菌，其包含：突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

385.条目367的分离的细菌，其包含：至少一个下列遗传改变：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子；突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白；突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏；及其组合。

386.根据条目367的分离的细菌，其包含：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白。

387.根据条目367的分离的细菌，包含：突变的nifL基因，其已被改变为包含***所述nifL基因中的异源启动子，以及突变的glnE基因，其导致缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域的截短的GlnE蛋白，以及突变的amtB基因，其导致所述amtB基因的表达缺乏。

388.根据条目367的分离的细菌，其包含：nifL修饰，其以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白。

389.根据条目367的分离的细菌，其包含：nifL修饰，其以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，其中所述修饰是破坏、敲除或截断。

390.根据条目367的分离的细菌，其包含：nifL修饰，其以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，并且其中所述细菌进一步包含与nifA序列可操作地连接的启动子。

391.根据条目367的分离的细菌，其包含：nifL修饰，其以缺乏该nifL修饰的细菌的不到约50％表达NifL蛋白，并且其中所述细菌缺乏nifL同源物。

392.根据条目367的分离的细菌，包含：glnE修饰，其以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白。

393.根据条目367的分离的细菌，其包含：glnE修饰，其以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，其中所述修饰是破坏、敲除或截断。

394.根据条目367的分离的细菌，其包含：glnE修饰，其以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，并且其中所述GlnE蛋白序列缺乏腺苷酰基去除(AR)结构域。

395.根据条目367的分离的细菌，其包含：glnE修饰，其以缺乏该glnE修饰的细菌的不到约50％表达GlnE蛋白，并且其中所述GlnE蛋白序列缺乏腺苷酰基去除(AR)活性。

396.根据条目367的分离的细菌，其中植物中的所述细菌向暴露于所述细菌的植物提供至少1％的固定氮。

397.根据条目367的分离的细菌，其中植物中的所述细菌向暴露于所述细菌的植物提供至少5％的固定氮。

398.根据条目367的分离的细菌，其中植物中的所述细菌向暴露于所述细菌的植物提供至少10％的固定氮。

399.根据条目367的分离的细菌，其中所述细菌能够在非氮限制条件下固定大气氮。

400.根据条目367的分离的细菌，其中植物中的所述细菌排出含氮的固氮产物。

401.根据条目367的分离的细菌，其中植物中的所述细菌向暴露于所述细菌的植物提供至少1％的固定氮，并且所述固定氮通过在植物组织中用大气N₂气稀释富集肥料来测量。

402.根据条目367的分离的细菌，其中所述细菌定植于暴露于所述细菌的植物的根，至每克植物根组织鲜重至少约1.0×10⁴个细菌细胞的浓度。

403.根据条目367的分离的细菌，其被配制成农业组合物。

404.根据条目367的分离的细菌，其被配制成犁沟内组合物。

405.根据条目367的分离的细菌，其被配制成液体犁沟内组合物，其包含浓度为约1×10⁷至约1×10¹⁰cfu/毫升的细菌。

406.根据条目367的分离的细菌，其被配制成种子处理物或种子包衣。

407.根据条目367的分离的细菌，其被配制成种子处理物或种子包衣，其包含包含浓度为约1×10⁵至约1×10⁷cfu/种子的细菌。

408.根据条目367的分离的细菌，其中所述细菌与植物接触并增加所述植物中的固氮。

409.根据条目367的分离的细菌，其布置于非豆科植物上。

410.根据条目367的分离的细菌，其布置于谷类作物上。

411.根据条目367的分离的细菌，其布置于选自下组的植物上：玉米、稻、小麦、大麦、高粱、粟、燕麦、黑麦和黑小麦。

412.根据条目367的分离的细菌，其布置于玉米上。

413.根据条目367的分离的细菌，其布置于豆科植物上。

414.根据条目367的分离的细菌，其布置于谷物作物上。

415.根据条目367的分离的细菌，其选自：水生拉恩氏菌(Rahnella aquatilis)、变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)、Achromobacter spiritinus、Achromobactermarplatensis、Microbacterium murale、Kluyvera intermedia、Kosakoniapseudosacchari、肠杆菌属的种(Enterobacter sp.)、生脂固氮螺菌(Azospirillumlipoferum)、Kosakonia sacchari及其组合。

416.根据条目367的分离的细菌，其中所述细菌属于拉恩氏菌属。

417.根据条目367的分离的细菌，其中所述细菌属于水生拉恩氏菌种。

418.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为PTA-122293。

419.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201701003。

420.根据条目367的分离的细菌，其中该细菌属于Kosakonia属。

421.根据条目367的分离的细菌，其中该细菌属于Kosakonia sacchari种。

422.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为PTA-122294。

423.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201701001。

424.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201701002。

425.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201708004。

426.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201708003。

427.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201708002。

428.根据条目367的分离的细菌，其中该细菌属于克雷伯氏菌属。

429.根据条目367的分离的细菌，其中该细菌属于变栖克雷伯氏菌种。

430.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201708001。

431.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201712001。

432.根据条目367的分离的细菌，其被保藏为NCMA 201712002。

433.一种组合物，其包含根据条目415至432的任何一种或多种细菌。

434.一种检测非天然连接序列的方法，其包括：扩增与SEQ ID NO：372-405共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列。

435.根据条目434的方法，其中所述扩增是通过进行聚合酶链反应。

436.根据条目434的方法，其中所述扩增是通过进行定量聚合酶链反应。

437.一种检测非天然连接序列的方法，其包括：扩增与SEQ ID NO：372-405中包含的至少10个连续碱基对片段共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列，所述连续碱基对片段由以下序列的交叉点处的核苷酸组成：包含SEQ ID NO：304-337的上游序列和包含SEQ IDNO：338-371的下游序列。

438.根据条目437的方法，其中所述扩增是通过进行聚合酶链反应。

439.根据条目437的方法，其中所述扩增是通过进行定量聚合酶链反应。

440.一种非天然连接序列，其包含与SEQ ID NO：372-405共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列。

441.一种非天然连接序列，其包含与SEQ ID NO：372-405中包含的至少10个连续碱基对片段共有至少约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同一性的核苷酸序列，所述连续碱基对片段由以下序列的交叉点处的核苷酸组成：包含SEQ ID NO：304-337的上游序列和包含SEQ ID NO：338-371的下游序列。

442.一种细菌组合物，其包含：

至少一种固定大气氮的重塑细菌菌株，所述至少一种重塑细菌菌株包含外源添加的DNA，其中所述外源添加的DNA与相应的天然细菌菌株共有至少80％的同一性。

443.一种维持土壤氮水平的方法，其包括：

在田间土壤中种植以固定大气氮的重塑细菌接种的作物；以及

收获所述作物，其中在种植与收获之间向所述田间的所述土壤施用生产所述作物所需的氮剂量的不超过90％。

444.一种向作物植物递送益生菌补充剂的方法，其包括：

用种子包衣、种子处理物或种衣剂涂覆作物种子，其中所述种子包衣、种衣剂或种子处理物包含所述益生菌的活体代表；以及

在田间土壤中施加所述作物种子。

445.一种增加非豆科植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述非豆科植物暴露于重塑的非属间微生物，所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异或至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

446.一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述玉米植物暴露于重塑的非属间微生物，所述微生物在选自nifL、glnB、glnE和amtB的至少两种基因内包含重塑的遗传变异。

447.一种增加玉米植物中大气来源氮的量的方法，其包括：

将所述玉米植物暴露于重塑的非属间微生物，所述微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异，其中如通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N所测量的，植物中的所述重塑的非属间微生物在所述玉米植物中产生至少5％的固定氮。

448.根据前述条目中任一项的方法，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

449.根据前述条目中任一项的细菌，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

450.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

451.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

452.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

453.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中在外源氮的存在下，所述细菌每小时每个细菌细胞产生至少约1×10^-17mmol N的固定N。

454.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

455.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

456.根据前述条目中任一项的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

457.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

458.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

459.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

460.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生5％或更多的固定氮。

461.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

462.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

463.根据前述条目中任一项的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

464.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

465.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

466.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

467.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生10％或更多的固定氮。

468.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

469.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

470.根据前述条目中任一项的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

471.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

472.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

473.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

474.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生15％或更多的固定氮。

475.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

476.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

477.根据前述条目中任一项的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

478.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

479.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中植物中的所述多种细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

480.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

481.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中植物中的所述多种非属间细菌在植物中产生20％或更多的固定氮。

482.根据前述条目中任一项的方法，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

483.根据前述条目中任一项的细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

484.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

485.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

486.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

487.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-7mmol N。

488.根据前述条目中任一项的方法，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

489.根据前述条目中任一项的细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

490.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

491.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

492.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

493.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中(i)每单位植物根组织的平均定植能力与(ii)每小时每个细菌细胞产生的固定N的乘积为每小时每克植物根组织鲜重至少约2.0x10^-6mmol N。

494.根据前述条目中任一项的方法，其中所述植物已被重塑或培育以用于有效的氮利用。

495.根据前述条目中任一项的细菌组合物，其中所述至少一种重塑的细菌菌株在选自下组的基因的10,000bp内的基因或基因间区中包含至少一个变异：nifA、nifL、ntrB、ntrC、glnA、glnB、glnK、draT、amtB、glnD、glnE、nifJ、nifH、nifD、nifK、nifY、nifE、nifN、nifU、nifS、nifV、nifW、nifZ、nifM、nifF、nifB和nifQ。

496.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌包含前述条目中任一项的细菌组合物。

497.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌由前述条目中任一项的细菌组合物组成。

498.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株是重塑的***菌株。

499.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的***菌株具有改变的Nif簇调节物的表达水平。

500.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的***菌株表达减少量的Nif簇的负调节物。

501.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株表达减少量的GlnR。

502.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。

503.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株的基因组编码与来自Zehr lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。

504.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少75％同一性的多肽。

505.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的细菌菌株的基因组编码与来自Buckley lab NifH数据库的序列具有至少85％同一性的多肽。

506.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入所述固氮遗传调节网络中的遗传变异。

507.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入所述氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

508.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入所述固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入所述氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

509.根据前述条目中任一项的方法，其中将所述重塑的非属间微生物施加至种植所述非豆科植物的种子的犁沟中。

510.根据前述条目中任一项的方法，其中将所述重塑的非属间微生物涂覆在所述非豆科植物的种子上。

511.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物至少定植于所述非豆科植物的根，使得所述重建的非属间微生物以每克组织鲜重至少10⁵个菌落形成单位的量存在于所述非豆科植物中。

512.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物能够在非氮限制条件下固定大气氮。

513.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述重塑的非属间微生物排出含氮的固氮产物。

514.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述重塑的非属间微生物在所述非豆科植物中产生至少1％的固定氮。

515.根据前述条目中任一项的方法，其中由所述重塑的非属间微生物产生的在所述非豆科植物中的所述固定氮通过在用含有1.2％15N的肥料处理的田间生长的作物中稀释15N来测量。

516.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述重塑的非属间微生物在所述非豆科植物中产生5％或更多的固定氮。

517.根据前述条目中任一项的方法，其中使用选自定向诱变、随机诱变和定向进化的至少一种类型的工程化对所述非属间微生物进行重塑。

518.根据前述条目中任一项的方法，其中植物中的所述重塑的非属间微生物排出含氮的固氮产物。

519.根据前述条目中任一项的方法，其中将所述重塑的非属间微生物施加至种植所述玉米植物的种子的犁沟中。

520.根据前述条目中任一项的方法，其中将所述重塑的非属间微生物涂覆到所述玉米植物的种子上。

521.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

522.根据前述条目中任一项的方法，其中所述非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

523.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程非属间微生物包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

524.根据前述条目中任一项的方法，其中所述重塑的非属间细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

525.根据前述条目中任一项的方法，其中所述非属间细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

526.根据前述条目中任一项的方法，其中所述基因工程非属间细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

527.根据前述条目中任一项的细菌，其中所述细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

528.根据前述条目中任一项的细菌群体，其中所述细菌群体内的细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

529.根据前述条目中任一项的分离的细菌，其中所述分离的细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

530.根据前述条目中任一项的非属间细菌群体，其中所述非属间细菌群体内的非属间细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

531.根据前述条目中任一项的非属间细菌，其中所述非属间细菌包含至少一个引入固氮遗传调节网络中的遗传变异和至少一个引入氮同化遗传调节网络中的遗传变异。

532.一种组合物，其包含前述条目中任一项的任何一种或多种细菌。

尽管本文中已经示出并描述了本发明的优选实施方案，但对于本领域技术人员显而易见的是，这些实施方案仅以示例的方式提供。本领域技术人员在不脱离本发明的情况下现将想到多种变化、改变和替代。应当理解，本文所述的本发明实施方案的各种替代方案均可用于实施本发明。旨在由以下权利要求来限定本发明的范围，由此涵盖这些权利要求范围内的方法和结构及其等同物。

序列表

<110> 皮沃特生物公司

<120> 用于改良植物性状的方法及组合物

<130> 47736-707.601

<140>

<141>

<150> 62/577,147

<151> 2017-10-25

<150> 62/566,199

<151> 2017-09-29

<150> 62/467,032

<151> 2017-03-03

<150> 62/447,889

<151> 2017-01-18

<150> 62/445,557

<151> 2017-01-12

<150> 62/445,570

<151> 2017-01-12

<160> 424

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 9

<212> PRT

<213> 未知

<220>

<223> “未知”的描述:

"LAGLIDADG"家族肽基序序列

<400> 1

Leu Ala Gly Leu Ile Asp Ala Asp Gly

1 5

<210> 2

<211> 90

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

寡核苷酸

<400> 2

gttgatcaga ccgatgttcg gaccttccaa ggtttcgatc ggacatacgc gaccgtagtg 60

ggtcgggtgt acgtctcgaa cttcaaagcc 90

<210> 3

<211> 257

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 3

gcctctcggg gcgctttttt ttattccggc actagccgct attaataaaa atgcaaatcg 60

gaatttacta tttaacgcga gattatctaa gatgaatccg atggaagcgc gctgttttca 120

ctcgcctttt taaagttacg tgatgatttc gatgcttctt tgagcgaacg atcaaaaata 180

agcgtattca ggtaaaaaaa tattctcatc acaaaaaagt ttgtgtaata cttgtaacgc 240

tacatggaga ttaactc 257

<210> 4

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 4

ggttcacata aacataatta tcgccacggc gatagccgta cgctttttgc gtcacaacat 60

ccatggtgaa gccggctttt tcaagaacac gcgccacctc atcgggtctt aaatacatac 120

tcattcctca ttatctttta ccgcacgtta accttacctt attcattaaa ggcaacgctt 180

tcggaatatt ccataaaggg ctatttacag cataattcaa aatcttgtcc tacacttata 240

gactcaatgg aattaaggga 260

<210> 5

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 5

gcgcggaaaa tcgacgcata gcgcattctc agaagccggc ctggtctcgg tggaaaagcg 60

aatctttccc acgaccgccg ggcctttaac aaaagaatca atgacctgat taatgtcgct 120

atccattctc tctccgcgta atgcgatctt ttttcatcat acctaacaaa ctggcagagg 180

gaaaagccgc gcggtttttc tgcgaagtgt attgtaagat ttgtttgata tgttatatcg 240

taacatatta ttgcaaacat 260

<210> 6

<211> 259

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 6

ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga atgtatatgg 60

tctgaccgag atttgcgcaa aacgctcagg aaccgcgcag tctgtgcggt tcactgtaat 120

gttttgtaca aaatgatttg cgttatgagg gcaaacagcc gcaaaatagc gtaaaatcgt 180

ggtaagacct gccgggattt agttgcaaat ttttcaacat tttatacact acgaaaacca 240

tcgcgaaagc gagttttga 259

<210> 7

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 7

acgcctgggg cgccgaccag cgggaagagt gatttggcca acgaggcgcc gctctgaatg 60

gaaatcatgg cgattaaaat aaccagtatc ggcaaccatg ccggtacctt acgagacgag 120

ccgggcatcc tttctcctgt caattttgtc aaatgcggta aaggttccag tgtaattgaa 180

ttaccccgcg ccggttgagc taatgttgaa aaaaagggtc ttaaaagcag tacaataggg 240

cgggtctgaa gataatttca 260

<210> 8

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 8

tctgattcct gatgaaaata aacgcgacct tgaagaaatt ccggataacg ttatcgccga 60

tttagatatc catccggtga aacgaatcga ggaagttctg gcacttgcgc tacagaacga 120

accgtttgga atggaagtcg tcacggcaaa atagtgattt cgcgcaaata gcgctaagaa 180

aaatagggct ggtaagtaaa ttcgtacttg ccagcctttt tttgtgtagc taacttagat 240

cgctggcagg ggggtcaatt 260

<210> 9

<211> 259

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 9

gtaagaaagt cggcctgcgt aaagcacgtc gtcgtcctca gttctccaaa cgttaattgt 60

tttctgctca cgcagaacaa tttgcgaaaa aacccgcttc ggcgggtttt tttatggata 120

aatttgccat tttccctcta caaacgcccc attgttacca ctttttcagc atttccagaa 180

tcccctcacc acaacgtctt caaaatctgg taaactatca tccaattttc tgcccaaatg 240

caggtgattg ttcattttt 259

<210> 10

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 10

gtcaaagccg tattatcgac cccttaggga caacgcttgc cggggcggga gagcggccgc 60

agttgatttt tgccgaactt tcagctgatt atattcagca ggtacgcgag cgcctgccgg 120

tgttgcgcaa tcgccgcttt gcgccaccgc aattattatg acgttttttt aaacaaggct 180

tgattcacct tgttacagat tgctattgtg tccgcgcgtc aaatagccgt taattgtatg 240

cgtgtatgat ggcgtattcg 260

<210> 11

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 11

gaggcggtgg ttgaccgtat cggtcccgag catcatgagc tttcggggcg agcgaaagat 60

atgggatcgg cggcggtact gctggcgatt atcatcgcgc tgatcgcgtg gggaacgctg 120

ctgtgggcga actaccgcta agtcttgtcg tagctgctcg caaaacggaa agaaactcct 180

gatttttgtg tgaaatgtgg ttccaaaatc accgttagct gtatatactc acagcataac 240

tgtatataca cccagggggc 260

<210> 12

<211> 260

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 12

taagaaaagc ggcctgtacg aagacggcgt acgtaaagac aggctggata acgacgatat 60

gatcgatcag ctggaagcgc gtattcgcgc taaagcatcg atgctggatg aggcgcgtcg 120

tatcgatatc cagcaggttg aagcgaaata acgtgttggg aagcgatacg cttcccgtgt 180

atgattgaac ctgcgggcgc gaggcgccgg ggttcatttt tgtatatata aagagaataa 240

acgtggcaaa gaacattcaa 260

<210> 13

<211> 237

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 13

atgaatcgta ctaaactggt actgggcgcg gtaatcctgg gttctactct gctggctggt 60

tgctccagca atgctaaaat cgatcagctg tcttctgacg ttcagactct gaacgctaaa 120

gttgaccagc tgagcaacga cgtgaacgca atgcgttccg acgttcaggc tgctaaagat 180

gacgcagctc gcgctaacca gcgtctggac aacgcagcta ctaaataccg taagtaa 237

<210> 14

<211> 327

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 14

atggccaacc gagcaaaccg caacaacgta gaagagagcg ctgaagatat ccataacgat 60

gtcagccaat tagcggatac gctggaagag gtgctgaaat cgtggggcag cgacgccaaa 120

gacgaagcgg aggccgcgcg caaaaaagcg caggcgctgc tgaaagagac ccgcgcccgg 180

cttaacggca acaaccgcgt ccagcaggcg gcgtgcgacg ccatgggctg cgctgacagc 240

tacgtgcgcg acaaaccgtg gcaaagcgtc ggcgccgcag cagccgttgg ggtatttatt 300

ggcgtattac tgaatttacg tcgataa 327

<210> 15

<211> 648

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 15

atgaccaaaa agatttccgc cctagcgttt ggcattggca tggtaatggc gagcagccag 60

gcttttgccc acggtcacca tagtcatggc ccggcgctga ccgaagcgga acaaaaggcg 120

agtgaaggca tttttgctga ccaggacgta aaggacaggg cgctgagcga ctgggagggg 180

atctggcagt cggttaaccc ctatctgctg aacggggatt tagatccggt tctggagcag 240

aaggccaaaa aggccggtaa aagcgtggcg gaatatcggg aatattataa gaagggctac 300

gctaccgatg tcgaccagat tggtatcgag gataacgtca tggagtttca cgtcgggaaa 360

accgtcaacg cctgtaagta cagctattcc ggttacaaaa ttctgaccta cgcatccggt 420

aaaaaaggcg tgcgctacct gttcgaatgc cagcaggcgg attcaaaagc gccgaagttt 480

gttcagttta gcgatcacac catcgcgcca cgcaagtccc agcatttcca catctttatg 540

ggcaatgagt cccaggaagc gctgctgaaa gagatggata actggccaac ctactatcct 600

tatgcgctgc ataaagagca gattgtcgac gaaatgctgc accactaa 648

<210> 16

<211> 237

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 16

atgagcacta tcgaagaacg cgttaagaaa attatcggcg aacagctggg cgttaagcag 60

gaagaagtta ccaacaatgc ttccttcgtt gaagacctgg gcgctgattc tcttgacacc 120

gttgagctgg taatggctct ggaagaagag tttgatactg agattccgga cgaagaagct 180

gagaaaatca ctactgttca ggctgccatt gattacatca acggccacca ggcgtaa 237

<210> 17

<211> 513

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 17

atgaataaaa ttgcacgttt ttcagcactg gccgttgttc tggctgcatc cgtaggtacc 60

actgctttcg ctgcgacttc taccgttacc ggtggctacg cgcagagcga catgcagggt 120

gaagcgaaca aagctggcgg tttcaacctg aagtaccgct acgagcaaga caacaacccg 180

ctgggtgtta tcggttcttt cacctacacc gaaaaagatc gttctgaatc tggcgtttac 240

aaaaaaggcc agtactacgg catcaccgca ggtccggctt accgtctgaa cgactgggct 300

agcatctacg gcgtagtggg tgttggttac ggtaaattcc aggacaacag ctacccgaac 360

aaatctgata tgagcgacta cggtttctct tacggcgctg gtctgcagtt caacccgatc 420

gaaaacgttg ccctggactt ctcctacgag cagtctcgca ttcgtaacgt tgacgttggc 480

acctggattg ctggcgtagg ttaccgcttc taa 513

<210> 18

<211> 273

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 18

gtgaataaat ctcaactgat tgacaaaatt gctgccggtg cggacatttc taaagccgca 60

gctggacgtg cgttagatgc tttaatcgct tctgttactg aatctctgca ggctggagat 120

gacgttgcgc tggtagggtt tggtactttt gctgttaaag agcgcgctgc ccgtactggt 180

cgcaatccgc aaacaggcaa agaaatcacc attgctgctg ctaaagttcc gggtttccgc 240

gcaggtaaag cgctgaaaga cgcggtaaac tga 273

<210> 19

<211> 639

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 19

atggctgtcg ctgccaacaa acgttcggta atgacgctgt tttctggtcc tactgacatc 60

tatagccatc aggtccgcat cgtgctggcc gaaaaaggtg ttagttttga gatagagcac 120

gtggagaagg acaacccgcc tcaggatctg attgacctca acccgaatca aagcgtaccg 180

acgcttgtgg atcgtgagct cactctgtgg gaatctcgca tcattatgga atatctggat 240

gagcgtttcc cgcatccgcc gctcatgccg gtttacccgg tggcgcgtgg ggaaagccgt 300

ctgtatatgc agcgtatcga aaaggactgg tattcgttga tgaataccat tcagaccggt 360

accgctgcgc aggctgatac tgcgcgtaag cagctgcgtg aagaactaca ggcgattgcg 420

ccagttttca cccagaagcc ctacttcctg agcgatgagt tcagcctggt ggactgctac 480

ctggcaccac tgctgtggcg tctgccggtt ctcggcgtag agctggtcgg cgctggcgcg 540

aaagagctta aaggctatat gactcgcgta tttgagcgcg actctttcct cgcttcttta 600

actgaagccg aacgtgaaat gcgtctcggt cggggctaa 639

<210> 20

<211> 204

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 20

atgggtgaga ttagtattac caaactgctg gtagtcgcag cgctgattat cctggtgttt 60

ggtaccaaaa agttacgcac gctgggtgga gacctgggct cggctatcaa aggctttaaa 120

aaagccatga gcgatgacga tgacagtgcg aagaagacca gtgctgaaga agcgccggca 180

cagaagctct ctcataaaga gtaa 204

<210> 21

<211> 609

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 21

atgaaagcgt taacgaccag gcagcaagag gtgtttgatc tcattcggga tcatatcagc 60

cagacgggca tgccgccgac gcgtgcggag attgctcagc gcttggggtt tcgctcccca 120

aacgcggcgg aagagcatct gaaagcgctg gcgcgtaaag gcgcaatcga gatcgtttcc 180

ggcgcctccc gcggtattcg tctgctgacg gaagaagaaa ccggtctgcc gcttattggc 240

cgcgtcgcgg caggtgagcc gctgctagcg cagcagcaca ttgaaggcca ctaccaggtg 300

gacccggcca tgtttaagcc gaacgccgat tttctgctgc gtgttagcgg tatgtcgatg 360

aaggatatcg gtattctcga tggcgacctg ctggctgtcc ataaaacgca ggatgtgcgc 420

aatggtcagg tggttgtggc gcgtatcgac gaagaagtga ccgtgaagcg tctgaaaaaa 480

cagggtaacg tcgtggaatt gctgccggaa aacagcgaat tctcgccgat cgtggtcgac 540

cttcgcgaac aaagctttac tattgaaggc ctggccgtcg gcgttatccg caacggcaac 600

tggcaataa 609

<210> 22

<211> 1245

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 22

atgaacgatt atctgccggg cgaaaccgct ctctggcagc gcattgaagg ctcactgaag 60

caggtgcttg gtagctacgg ttacagcgaa atccgtttgc cgattgtaga gcagaccccg 120

ttattcaaac gcgctatcgg cgaagtgacc gacgtggttg aaaaagagat gtacaccttt 180

gaggaccgta acggcgatag cctgactcta cgtccggaag gcacggctgg ctgcgtacgc 240

gccggtatcg aacatggtct cctgtacaat caagaacagc gcctgtggta cattgggccg 300

atgttccgcc acgaacgtcc gcaaaaaggc cgctaccgtc agttccacca gattggcgcc 360

gaagcgtttg gcctgcaggg gccggatatc gatgccgagc tgattatgct gaccgcccgc 420

tggtggcgcg agctgggcat ctccggccac gttgcgctgg agctgaactc tatcggttcg 480

ctggaggctc gcgctaacta tcgcgacgcg ctggtggcct atcttgagca gtttaaagat 540

aagctggacg aagactgcaa acgccgcatg tacaccaacc cgctgcgcgt gctggattct 600

aaaaacccgg acgtccaggc gctgctgaac gacgccccga cgctgggcga ctatcttgat 660

gaagagtcca aaacgcattt tgccgggctg tgcgcgctgc tggatgatgc cggtattcgc 720

tataccgtga atcagcgtct ggtacgcggt ctcgactact acaaccgcac cgtgtttgag 780

tgggtcacca ccagcctcgg ttcccagggc accgtctgcg ccggaggccg ttacgatggt 840

ctggttgagc agcttggcgg tcgcgctacc cctggcgtcg gctttgcgat ggggctggaa 900

cgtcttgttt tactggttca ggcagtgaat ccggaattta aagccgatcc tgttgtcgat 960

atatacctgg tagcctccgg aactgacacc cagtccgcag caatgcgtct ggctgaacag 1020

gtacgcgatg cgttacccgg cgttaagctg atgaccaacc atggcggcgg caactttaag 1080

aagcagtttg cgcgcgctga taaatggggc gctcgcgttg cgctggtgct gggcgaatca 1140

gaaatcgccg acggaaacgt ggtagtgaaa gatttacgct caggtgagca aactaccgta 1200

acgcaggata gcgttgctgc gcatttgcgc acacttctgg gttaa 1245

<210> 23

<211> 1413

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 23

atgaaaaaga ccaaaattgt ttgcaccatc ggtccgaaaa ccgaatccga agagatgttg 60

accaaaatgc tggacgcggg catgaacgtt atgcgtctga acttctctca cggtgactat 120

gcggaacacg gtcagcgcat ccagaatctg cgcaatgtga tgagtaaaac cggtaagaaa 180

gcggcaatcc tgctggacac caaaggtccg gaaatccgta ccattaagct ggaaggcggc 240

aacgacgtct ccctgaaagc gggccagacc ttcaccttca ccaccgataa atccgttgtc 300

ggtaataacg aaatcgttgc ggtgacctat gaaggcttca ccagcgacct gagcgttggc 360

aacacggtac tggttgacga tggtctgatc ggtatggaag tgaccgctat cgaaggcaac 420

aaagttgttt gtaaagtgct gaacaacggc gacctcggcg agaacaaagg cgttaacctg 480

ccgggcgtat ctatcgcgct gccggcgctg gctgaaaaag acaaacagga tctgatcttc 540

ggttgcgaac agggcgttga ctttgttgcg gcatccttta tccgtaagcg ttctgacgtt 600

gttgaaatcc gtgagcacct gaaagcccac ggcggcgaga agatccagat catctccaaa 660

atcgaaaacc aggaaggcct gaacaacttc gacgaaatcc tcgaagcctc tgacggcatc 720

atggtagccc gtggcgacct gggcgttgaa atcccggttg aagaagttat cttcgcgcag 780

aagatgatga tcgagaaatg tatccgcgcg cgtaaagtcg ttatcaccgc gacccagatg 840

ctggattcca tgatcaaaaa cccgcgtccg acccgtgcgg aagcaggcga cgtggccaac 900

gccatcctcg acggcaccga cgcagttatg ctgtccggcg aatccgcgaa aggtaaatac 960

ccgctggaag cggtcaccat catggcgacc atctgcgaac gtaccgaccg cgtcatgacc 1020

agccgtcttg agtacaacaa cgacaaccgt aagctgcgca tcaccgaagc ggtgtgccgc 1080

ggtgcggtag aaacggctga aaaactggaa gcgccgctga tcgttgtggc aacccagggc 1140

ggtaaatccg cgcgcgccgt acgtaaatac ttcccggatg ccactatcct ggcgctgacc 1200

accaacgaaa ccaccgcgcg tcagctggtg ctgagcaaag gcgttgtggc acagctggtt 1260

gaagatatct cctctaccga tgcgttctac atccagggta aagaactggc gctgcagagc 1320

ggtctggcgc gtaaaggcga cgtggttgtt atggtttccg gcgcgttagt cccgagcgga 1380

accaccaata ccgcttccgt gcacgtgctg taa 1413

<210> 24

<211> 351

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 24

atgtatttaa gacccgatga ggtggcgcgt gttcttgaaa aagccggctt caccatggat 60

gttgtgacgc aaaaagcgta cggctatcgc cgtggcgata attatgttta tgtgaaccgt 120

gaagctcgta tggggcgtac cgcgttaatt attcatccgg ctttaaaaga gcgcagcaca 180

acgcttgcgg agcccgcgtc ggatatcaaa acctgcgatc attatgagca gttcccgctc 240

tatttagcgg gggatgctca acagcattat ggtattccac acgggttcag ttcgcgaatg 300

gcgcttgagc gttttctgag tggcctgttt ggcgaaacgc agtatagctg a 351

<210> 25

<211> 864

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 25

atggatagcg acattaatca ggtcattgat tcttttgtta aaggcccggc ggtcgtggga 60

aagattcgct tttccaccga gaccaggccg gcttctgaga atgcgctatg cgtcgatttt 120

ccgcgcctcg aaatcatgct tgcgggtcag cttcacgatc cggcgattaa agccgatcgc 180

gcccagctca tgccgcacga tgtgctgtat attcccgctg gcggatggaa tgacccgcaa 240

tggctggcgc cctccactct gctcactatc ttatttggta aacagcagct ggaattcgtc 300

ctgcgccact gggacggcag cgcgcttaac gtgctggata aacagcaggt tccgcgccgc 360

ggtccccggg tcggctcttt tctgctgcag gcgctgaatg aaatgcagat gcagccgcgg 420

gagcagcaca cggcccgctt tattgtcacc agcctgctca gccactgtgc cgatctgctg 480

ggcagccagg tacaaacctc atcgcgcagc caggcgcttt ttgaagcgat tcgtaagcat 540

attgacgccc actttgccga cccgttaacc cgggagtcgg tggcgcaggc gttttacctc 600

tcgccaaact atctatccca cctgttccag aaatgcgggc caatgggctt taacgagtat 660

ctgaatcaca tccgcctgga gcaggccaga atgctgttaa aaggccacga tatgaaagtg 720

aaagatatcg cccacgcctg cggtttcgcc gacagcaact acttctgccg cctgtttcgc 780

aaaaacaccg aacgctcgcc gtcggagtat cgccgtcaat atcacagcca gctgacggaa 840

aaaacagccc cggcaaaaaa ctag 864

<210> 26

<211> 735

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 26

atgagttttg aaggaaaaat cgcgctggtt accggtgcaa gtcgcgggat tggccgcgca 60

atcgctgaaa cgctcgttgc ccgtggcgcg aaagttatcg ggactgcgac cagcgaaagc 120

ggcgcgcagg cgatcagcga ttatttaggt gctaacggta aaggtctgct gctgaatgtg 180

accgatcctg catctattga atctgttctg ggaaatattc gcgcagaatt tggtgaagtt 240

gatatcctgg tgaacaatgc cgggatcact cgtgataacc tgttaatgcg catgaaagat 300

gatgagtgga acgatattat cgaaaccaac ctgtcatctg ttttccgtct gtcaaaagcg 360

gtaatgcgcg ctatgatgaa aaagcgtcat ggacgtatta tcactatcgg ttctgtggtt 420

ggtaccatgg gaaatgcggg tcaggccaac tacgctgcgg cgaaagcggg tctgattggc 480

ttcagtaaat cactggctcg cgaagttgcg tcccgcggta ttactgtaaa cgttgttgct 540

ccgggcttta ttgaaacgga catgacgcgt gcgctgaccg atgagcagcg tgcgggtacg 600

ctggcggcag ttcctgcggg gcgcctcggc tctccaaatg aaatcgccag tgcggtggca 660

tttttagcct ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga 720

atgtatatgg tctga 735

<210> 27

<211> 71

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

寡核苷酸

<400> 27

atgcccggct cgtctcgtaa ggtaccggca tggttgccga tactggttat tttaatcgcc 60

atgatttcca t 71

<210> 28

<211> 2355

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 28

atgaatcctg agcgttctga acgcattgaa atccccgtat tgccgttgcg cgatgtggtg 60

gtttatccgc acatggtcat acccctgttt gtagggcggg aaaaatctat ccgttgtctc 120

gaagcagcca tggaccatga taaaaaaatc atgctggttg cgcagaaaga agcctcgacg 180

gatgagccgg gtgtaaacga tcttttcacc gtcgggaccg tggcgtctat tttgcaaatg 240

ctgaagctac cggacggtac tgttaaagtg ctggtcgaag gtttgcagcg cgcgcgcatc 300

tctgcgctgt ctgataatgg cgaacatttt tcggcgaagg cggaatacct tgaatcgccg 360

gcgattgacg aacgcgagca ggaagtgctg gttcgtaccg ctatcagcca gtttgaaggc 420

tacatcaagc tgaacaaaaa aatccctccg gaagtgctga cgtcgctgaa tagcatcgac 480

gatccggcgc gtctggcgga taccatcgct gcgcatatgc cgctgaagct ggcggacaaa 540

cagtccgtgc tggagatgtc cgacgttaac gagcgtctgg aatatctgat ggcgatgatg 600

gagtcggaaa tcgatctgct gcaggtggag aagcgtattc gcaaccgcgt gaaaaagcag 660

atggagaaat ctcagcgcga gtactatctg aatgagcaaa tgaaagccat tcaaaaagag 720

ctcggcgaga tggacgacgc cccggacgag aacgaagcgc tgaagcgtaa gatcgacgcg 780

gcgaaaatgc cgaaagaggc aaaagagaaa accgaagcgg aactgcaaaa actgaaaatg 840

atgtccccga tgtcggcgga agcgaccgtc gttcgcggct acatcgactg gatggtgcag 900

gtaccgtgga acgctcgcag caaggttaaa aaagacctgc gtcaggctca ggagatcctc 960

gataccgatc actacggcct tgagcgcgtg aaggatcgca ttcttgagta cctcgcggtg 1020

cagagccgtg ttaacaagct caaagggccg atcctgtgcc tggttgggcc tccgggggta 1080

ggtaaaacct ctctcggcca atccatcgcc aaagcaactg gacgcaaata tgtgcgtatg 1140

gcgctgggcg gcgtgcgtga tgaagcggaa atccgcggtc accgccgtac ctatattggc 1200

tcaatgccgg gcaaactgat ccagaaaatg gctaaagtgg gcgttaaaaa cccgctgttc 1260

ttgctggatg agatcgacaa gatgtcttct gacatgcgcg gcgatccggc ctcggcgctg 1320

ctggaggtgt tggatccgga acagaacgtg gcctttaacg accactatct ggaagtggat 1380

tacgatctca gcgacgtgat gttcgttgcg acctctaact ccatgaacat cccggcgccg 1440

ctgctggatc gtatggaagt gatccgcctc tccggctata ccgaagatga gaagctaaac 1500

atcgccaaac gccatctgct gtcaaaacag attgagcgta acgcgctcaa gaaaggcgag 1560

ctgacggtgg atgacagcgc gattatcggc atcattcgct actacacccg tgaagcaggc 1620

gtgcgtggtc tggagcgtga aatctcgaaa ctgtgccgca aagcggtgaa acagctgctg 1680

ctggataagt cgctgaaaca catcgagatt aacggcgaca acctgcacga tttccttggc 1740

gtgcagcgct acgactatgg tcgtgcggat agcgaaaacc gcgtaggtca ggtgaccgga 1800

ctggcgtgga cggaagtggg cggcgatctg ctgaccattg aaaccgcctg cgttccgggt 1860

aaaggcaaac tgacctacac cggttcactg ggtgaagtca tgcaggaatc catccaggcg 1920

gcgctgacgg tggttcgttc acgtgcggat aagctgggta ttaactcaga cttttacgaa 1980

aaacgtgata ttcacgttca cgtgccggaa ggcgcgacgc cgaaggatgg tccaagcgcc 2040

ggtatcgcga tgtgcaccgc gctggtttcc tgtctgacgg gtaatccggt acgcgccgac 2100

gtggcgatga ccggtgagat taccctccgt ggccaggtat tgccgattgg tggtctgaag 2160

gaaaaactgt tggccgcgca tcgcggcggc attaagactg ttctgattcc tgatgaaaat 2220

aaacgcgacc ttgaagaaat tccggataac gttatcgccg atttagatat ccatccggtg 2280

aaacgaatcg aggaagttct ggcacttgcg ctacagaacg aaccgtttgg aatggaagtc 2340

gtcacggcaa aatag 2355

<210> 29

<211> 393

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 29

atggctgaaa atcaatacta cggcaccggt cgccgcaaaa gttccgcagc tcgcgttttc 60

atcaaaccgg gcaacggtaa aatcgttatc aaccagcgtt ctctggaaca gtacttcggt 120

cgtgaaactg cccgcatggt agttcgtcag ccgctggaac tggtcgacat ggttgagaaa 180

ttagatctgt acatcaccgt taaaggtggt ggtatctctg gtcaggctgg tgcgatccgt 240

cacggtatca cccgcgctct gatggagtac gacgagtccc tgcgtggcga actgcgtaaa 300

gctggtttcg ttactcgtga tgctcgtcag gttgaacgta agaaagtcgg cctgcgtaaa 360

gcacgtcgtc gtcctcagtt ctccaaacgt taa 393

<210> 30

<211> 789

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 30

atgtttgttg ctgccggaca atttgccgta acgccggact ggacgggaaa cgcgcagacc 60

tgcgtcagca tgatgcgcca ggccgcggag cggggggcgt cgcttctggt tctgcctgag 120

gcgttgctgg cgcgagacga taacgatgcg gatttatcgg ttaaatccgc ccagcagctg 180

gatggcggct tcttacagct cttgctggcg gagagcgaaa acagcgcttt gacgacggtg 240

ctgaccctgc atatcccttc cggcgaaggt cgagcgacga atacgctggt ggccctgcgt 300

caggggaaga ttgtggcgca atatcagaaa ctgcatctct atgatgcgtt caatatccag 360

gaatccaggc tggtcgatgc cgggcggcaa attccgccgc tgatcgaagt cgacgggatg 420

cgcgtcgggc tgatgacctg ctacgattta cgtttccctg agctggcgct gtcgttagcg 480

ctcagcggcg cgcagctcat agtgttgcct gccgcgtggg taaaagggcc gctgaaggaa 540

catcactggg cgacgctgct ggcggcgcgg gcgctggata caacctgcta tattgtcgcc 600

gcaggagagt gcgggacgcg taatatcggt caaagccgta ttatcgaccc cttagggaca 660

acgcttgccg gggcgggaga gcggccgcag ttgatttttg ccgaactttc agctgattat 720

attcagcagg tacgcgagcg cctgccggtg ttgcgcaatc gccgctttgc gccaccgcaa 780

ttattatga 789

<210> 31

<211> 369

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 31

atggccaata ataccactgg gttaacccga attattaaag cggccgggta ttcctggaaa 60

ggattccgtg cggcgtgggt caatgaggcc gcatttcgtc aggaaggcat cgcggccgtt 120

attgccgtgg cgatcgcctg ctggttggac gtcgatgcca tcacgcgggt gctgctcatt 180

agctcggtcc tgttagtgat gatagttgaa attatcaata gcgcgattga ggcggtggtt 240

gaccgtatcg gtcccgagca tcatgagctt tcggggcgag cgaaagatat gggatcggcg 300

gcggtactgc tggcgattat catcgcgctg atcgcgtggg gaacgctgct gtgggcgaac 360

taccgctaa 369

<210> 32

<211> 1122

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 32

atgcataacc aggctccgat tcaacgtaga aaatcaaaac gaatttacgt tgggaatgtg 60

ccgattggcg atggcgcccc catcgccgta cagtcgatga caaacacgcg caccaccgat 120

gtggcggcga cggtaaatca aattaaagcc ctcgagcgcg ttggcgcgga tatcgtgcgc 180

gtttcggtgc cgacgatgga tgcggcggaa gcgttcaaac ttatcaaaca gcaggttaac 240

gtcccgctgg ttgccgatat ccacttcgat taccgcattg cgctgaaggt agcggaatac 300

ggcgttgatt gcctgcgtat taacccgggc aatatcggca acgaagagcg tatccgcatg 360

gtggtggact gcgctcgcga taaaaatatt cctatccgta tcggggtaaa cgccggttct 420

ctggaaaaag atctccagga aaaatacggc gaaccgactc cgcaggcgct gctggaatcg 480

gcaatgcgcc atgttgatca tctcgatcgt ctcaacttcg atcagtttaa agtcagcgta 540

aaagcctccg atgtgttcct cgcggttgaa tcctatcgcc tgttggcgaa acagatcgat 600

cagcctctgc acctcgggat caccgaagcg ggcggcgcgc gcagcggcgc ggtgaagtcc 660

gcgatcggcc tcggcctgct gctgtctgaa gggattggcg atacgctgcg cgtctctctg 720

gcggcggatc ccgttgaaga gatcaaagtg ggcttcgata ttctcaagtc gctgcgtatt 780

cgctctcgcg ggatcaactt tattgcctgc ccgacctgtt cacgtcagga gtttgacgtt 840

atcggtaccg ttaacgcgct ggagcagcgc ctggaagata tcattacgcc gatggatatt 900

tcgatcattg gctgcgtggt aaacggtccc ggcgaggcgc tggtttccac cctcggcgta 960

accggcggca ataagaaaag cggcctgtac gaagacggcg tacgtaaaga caggctggat 1020

aacgacgata tgatcgatca gctggaagcg cgtattcgcg ctaaagcatc gatgctggat 1080

gaggcgcgtc gtatcgatat ccagcaggtt gaagcgaaat aa 1122

<210> 33

<211> 876

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 33

atgagccata ttcaacggga aacgtcttgc tccaggccgc gattaaattc caacatggat 60

gctgatttat atgggtataa atgggctcgc gataatgtcg ggcaatcagg tgcgacaatc 120

tatcgattgt atgggaagcc cgatgcgcca gagttgtttc tgaaacatgg caaaggtagc 180

gttgccaatg atgttacaga tgagatggtc agactaaact ggctgacgga atttatgcct 240

cttccgacca tcaagcattt tatccgtact cctgatgatg catggttact caccactgcg 300

atccccggga aaacagcatt ccaggtatta gaagaatatc ctgattcagg tgaaaatatt 360

gttgatgcgc tggcagtgtt cctgcgccgg ttgcattcga ttcctgtttg taattgtcct 420

tttaacagcg atcgcgtatt tcgtctcgct caggcgcaat cacgaatgaa taacggtttg 480

gttgatgcga gtgattttga tgacgagcgt aatggctggc ctgttgaaca agtctggaaa 540

gaaatgcata agcttttgcc attctcaccg gattcagtcg tcactcatgg tgatttctca 600

cttgataacc ttatttttga cgaggggaaa ttaataggtt gtattgatgt tggacgagtc 660

ggaatcgcag accgatacca ggatcttgcc atcctatgga actgcctcgg tgagttttct 720

ccttcattac agaaacggct ttttcaaaaa tatggtattg ataatcctga tatgaataaa 780

ttgcagtttc atttgatgct cgatgagttt ttctaataag cctgcctggt tctgcgtttc 840

ccgctcttta ataccctgac cggaggtgag caatga 876

<210> 34

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 34

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 35

<211> 1021

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 35

ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60

tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120

ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180

caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240

taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300

gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360

actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420

tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480

agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540

gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600

ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660

tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720

ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780

aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840

cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900

tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960

ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020

a 1021

<210> 36

<211> 1071

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 36

atgaagatag caacaatgaa aacaggtctg ggagcgttgg ctcttcttcc ctgatccttc 60

aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120

tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180

agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240

ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300

caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360

aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420

ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480

tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540

gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600

cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660

cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720

gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780

actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840

attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900

tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960

aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020

tgtgaagggc tggacgtaaa cagccacggc gaaaacgcct acaacgcctg a 1071

<210> 37

<211> 1071

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 37

atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60

aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120

tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180

agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240

ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300

caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360

aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420

ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480

tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540

gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600

cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660

cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720

gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780

actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840

attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900

tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960

aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020

ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071

<210> 38

<211> 426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 38

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60

cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120

tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180

aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240

aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300

ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360

gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420

aaatga 426

<210> 39

<211> 446

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 39

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tcaccacggc gataaccata ggttttcggc 60

gtggccacat ccatggtgaa tcccactttt tccagcacgc gcgccacttc atcgggtctt 120

aaatacatag attttcctcg tcatctttcc aaagcctcgc caccttacat gactgagcat 180

ggaccgtgac tcagaaaatt ccacaaacga acctgaaagg cgtgattgcc gtctggcctt 240

aaaaattatg gtctaaacta aaatttacat cgaaaacgag ggaggatcct atgtttaaca 300

aaccgaatcg ccgtgacgta gatgaaggtg ttgaggatat taaccacgat gttaaccagc 360

tcgaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 420

attcactgac cggaggttca aaatga 446

<210> 40

<211> 452

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 40

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60

cctgcacgtc aatggcggaa tgtatatggt ttaaccacga tgaaaattat ttgcgttatt 120

agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180

aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240

ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300

ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360

ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420

tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452

<210> 41

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 41

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 42

<211> 463

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 42

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atattgacac catgacgcgc gtaatgctga 60

ttggttctgt gacgctggta atgattgtcg aaattctgaa cagtgccatc gaagccgtag 120

tagaccgtat tggtgcagaa ttccatgaac tttccgggcg ggcgaaggat atggggtcgg 180

cggcggtgct gatgtccatc ctgctggcga tgtttacctg gatcgcatta ctctggtcac 240

attttcgata acgcttccag aattcgataa cgccctggtt ttttgcttaa atttggttcc 300

aaaatcgcct ttagctgtat atactcacag cataactgta tatacaccca gggggcggga 360

tgaaagcatt aacggccagg aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct 420

acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tga 463

<210> 43

<211> 428

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 43

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atcatattgc gctccctggt tatcatttgt 60

tactaaatga aatgttataa tataacaatt ataaatacca catcgctttc aattcaccag 120

ccaaatgaga ggagcgccgt ctgacatagc cagcgctata aaacatagca ttatctatat 180

gtttatgatt aataactgat ttttgcgttt tggatttggc tgtggcatcc ttgccgctct 240

tttcgcagcg tctgcgtttt tgccctccgg tcagggcatt taagggtcag caatgagttt 300

ttacgcaatt acgattcttg ccttcggcat gtcgatggat gctttaactc acttcacacc 360

ccgaaggggg aagttgcctg accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt 420

caaaatga 428

<210> 44

<211> 452

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 44

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60

tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120

aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180

ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240

agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300

ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360

ccggtcgata actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420

tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452

<210> 45

<211> 410

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 45

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cctgtatgaa gatggcgtgc gcaaagatcg 60

cctggataac agcgatatga ttagccagct tgaagcccgc attcgcgcga aagcgtcaat 120

gctggacgaa gcgcgtcgta tcgatgtgca acaggtagaa aaataaggtt gctgggaagc 180

ggcaggcttc ccgtgtatga tgaacccgcc cggcgcgacc cgttgttcgt cgcggccccg 240

agggttcatt ttttgtatta ataaagagaa taaacgtggc aaaaaatatt caagccattc 300

gcggcatgaa cgattatctg cctggcgaac tcacttcaca ccccgaaggg ggaagttgcc 360

tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccggagg ttcaaaatga 410

<210> 46

<211> 1071

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 46

atgaaaaaga ttgatgcgat tattaaacct ttcaaactgg atgacgtgcg ctgatccttc 60

aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120

tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180

agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240

ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300

caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360

aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420

ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480

tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540

gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600

cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660

cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720

gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780

actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840

attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900

tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960

aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020

tcgcgcgtga ttcgtatccg caccggcgaa gaagacgacg cggcgattta a 1071

<210> 47

<211> 1295

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 47

atgaccatga acctgatgac ggatgtcgtc tcagccaccg ggatcgccgg gttgctttca 60

cgacaacacc cgacgctgtt ttttacacta attgaacagg cccccgtggc gatcacgctg 120

acggataccg ctgcccgcat tgtctatgcc aacccgggcg tgttgagtca tcctgactag 180

ctgagatgag ggctcgcctg atccttcaac tcagcaaaag ttcgatttat tcaacaaagc 240

cacgttgtgt ctcaaaatct ctgatgttac attgcacaag ataaaaatat atcatcatga 300

acaataaaac tgtctgctta cataaacagt aatacaaggg gtgttatgag ccatattcaa 360

cgggaaacgt cttgctccag gccgcgatta aattccaaca tggatgctga tttatatggg 420

tataaatggg ctcgcgataa tgtcgggcaa tcaggtgcga caatctatcg attgtatggg 480

aagcccgatg cgccagagtt gtttctgaaa catggcaaag gtagcgttgc caatgatgtt 540

acagatgaga tggtcagact aaactggctg acggaattta tgcctcttcc gaccatcaag 600

cattttatcc gtactcctga tgatgcatgg ttactcacca ctgcgatccc cgggaaaaca 660

gcattccagg tattagaaga atatcctgat tcaggtgaaa atattgttga tgcgctggca 720

gtgttcctgc gccggttgca ttcgattcct gtttgtaatt gtccttttaa cagcgatcgc 780

gtatttcgtc tcgctcaggc gcaatcacga atgaataacg gtttggttga tgcgagtgat 840

tttgatgacg agcgtaatgg ctggcctgtt gaacaagtct ggaaagaaat gcataagctt 900

ttgccattct caccggattc agtcgtcact catggtgatt tctcacttga taaccttatt 960

tttgacgagg ggaaattaat aggttgtatt gatgttggac gagtcggaat cgcagaccga 1020

taccaggatc ttgccatcct atggaactgc ctcggtgagt tttctccttc attacagaaa 1080

cggctttttc aaaaatatgg tattgataat cctgatatga ataaattgca gtttcatttg 1140

atgctcgatg agtttttcta ataagcctga ccggtggtga atttaatctc gctgacgtgt 1200

agacattcat cgatctgcat ccacggtccg gcggcggtac ctgcctgacg ctacgtttac 1260

cgctctttta tgaactgacc ggaggcccaa gatga 1295

<210> 48

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 48

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 49

<211> 1021

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 49

ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60

tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120

ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180

caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240

taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300

gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360

actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420

tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480

agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540

gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600

ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660

tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720

ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780

aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840

cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900

tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960

ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020

a 1021

<210> 50

<211> 1071

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 50

atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60

aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120

tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180

agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240

ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300

caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360

aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420

ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480

tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540

gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600

cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660

cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720

gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780

actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840

attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900

tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960

aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020

ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071

<210> 51

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 51

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 52

<211> 426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 52

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60

cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120

tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180

aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240

aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300

ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360

gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420

aaatga 426

<210> 53

<211> 452

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 53

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60

cctgcacgtc aatggcggaa tgtatatggt ttaaccacga tgaaaattat ttgcgttatt 120

agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180

aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240

ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300

ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360

ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420

tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452

<210> 54

<211> 426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 54

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60

cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120

tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180

aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240

aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300

ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360

gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420

aaatga 426

<210> 55

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 55

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 56

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 56

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 57

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 57

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 58

<211> 1021

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 58

ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60

tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120

ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180

caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240

taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300

gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360

actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420

tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480

agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540

gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600

ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660

tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720

ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780

aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840

cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900

tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960

ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020

a 1021

<210> 59

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 59

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 60

<211> 1491

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 60

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120

agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180

atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240

gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300

gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360

aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420

gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480

ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540

accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600

gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660

gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720

aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780

ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840

gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900

tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960

tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020

cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080

gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140

ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200

ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260

actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320

ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380

ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440

ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491

<210> 61

<211> 1563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<400> 61

atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60

agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120

catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180

ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240

ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300

ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360

gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420

cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480

atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540

gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600

gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660

gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720

cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780

ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840

ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900

ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960

gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020

ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080

cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140

ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200

atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260

ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320

ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380

atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440

ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500

gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 1560

taa 1563

<210> 62

<211> 1536

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 16S rDNA - 叠连群5, 株CI006

<400> 62

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180

cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480

tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660

gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720

cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840

ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020

gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga 1140

actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200

ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260

gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg 1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440

aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500

taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536

<210> 63

<211> 1537

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 16S rDNA - 叠连群8, 株CI006

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (450)..(450)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (452)..(452)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (455)..(455)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (473)..(473)

<223> a、c、g或t

<400> 63

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180

cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660

agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840

aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960

tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020

tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140

aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200

tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260

cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 1320

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440

taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500

gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537

<210> 64

<211> 1540

<212> DNA

<213> 拉恩氏菌

<220>

<223> 16S rDNA, 株CI019

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (70)..(70)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (267)..(267)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (455)..(455)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (458)..(458)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (473)..(473)

<223> a、c、g或t

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1135)..(1135)

<223> a、c、g或t

<400> 64

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancanac ttaatacgtg tgntgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

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<213> Kosakonia sacchari

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<213> Kosakonia sacchari

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ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat ccagacgctg 1380

atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440

acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488

<210> 74

<211> 1557

<212> DNA

<213> 拉恩氏菌

<220>

<223> nifA, 株CI019

<400> 74

atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60

acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 120

gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180

tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240

aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300

agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360

ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 420

cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 480

agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540

cccccggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600

ttcgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660

gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720

atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780

tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840

ttcaccggcg ctatccgtac ccgtaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900

ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960

caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020

attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaagag gaagtgcgtg ccgggaattt tcgcgaagac 1080

ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140

gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200

ctgcgcatca gcgacggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260

cgtgaactgg aaaactgtct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320

cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgaa tccccggcgc tgtccgtcaa acccggcctg 1380

ccgctcgcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440

gccgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500

ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557

<210> 75

<211> 1314

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 具有500bp侧翼区的Prm5, 株CI006

<400> 75

aaaactaccg ccgcaattaa tgaacccaac gctactgttg ccgggccatg ctcttccccg 60

gcgcgctgcc cggaaaggat atagattgcc cagcacgcgc cagcaccaag cgcgaacgcc 120

gcgccagtga gatcaacatg tgaaacattt tcgcccagcg gcagcagata caagaggcca 180

agtaccgcca ggatcaccca gatgaaatcc accgggcggc gtgaggcaaa aagcgccacc 240

gccagcgggc cggtaaattc cagcgccacc gcaacgccga gcggtatcgt ctggatcgat 300

aaatagaaca tatagttcat ggcgccgagc gacaggccat aaaacagcag tggcaggcgt 360

tgttcacggg taaaatgtaa acgccagggc ttgaacacta cgaccaaaat aagggtgcca 420

agtgcgagac gcagcgcggt gacgccgggt gcgccaacaa tcggaaacag tgatttcgcc 480

agcgacgcgc ctccctgaat ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac 540

accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 600

taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta 660

actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat 720

tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc 780

ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aactttctgt tacatcaaat ggcgctttag 840

accccaattc ccgcaaagag tttcttaact aattttgata tatttaaacg cgtaggacgt 900

aggatttact tgaagcacat ttgaggtgga ttatgaaaaa aattgcatgt ctttcagcac 960

tggccgcact tctggcggtt tctgcaggtt ccgcagtagc agcaacttca accgtaactg 1020

gcggctacgc tcagagcgac gctcagggta ttgctaacaa aactaacggt ttcaacctga 1080

aatatcgcta cgagcaggac aacaacccgc tgggtgttat cggttccttt acttacactg 1140

aaaaagatcg caccgaaagc agcgtttata acaaagcgca gtactacggc atcaccgcag 1200

gcccggctta ccgcatcaac gactgggcga gcatctacgg tgttgtgggt gtaggttacg 1260

gtaaattcca gcagactgta gacaccgcta aagtgtctga caccagcgac tacg 1314

<210> 76

<211> 3413

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifLA操纵子 - 基因间区上游+nifL和

nifA CDSs、株CI006

<400> 76

aacacacgct cctgttgaaa aagagatccc gccgggaaat gcggtgaacg tgtctgatat 60

tgcgaagagt gtgccagttt tggtcgcggg caaaacctgc accagtttgg ttattaatgc 120

accagtctgg cgcttttttt cgccgagttt ctcctcgcta atgcccgcca ggcgcggctt 180

tggcgctgat agcgcgctga ataccgatct ggatcaaggt tttgtcgggt tatcagccaa 240

aaggtgcact ctttgcatgg ttatacgtgc ctgacatgtt gtccgggcga caaacggcct 300

ggtggcacaa attgtcagaa ctacgacacg actaactgac cgcaggagtg tgcgatgacc 360

ctgaatatga tgatggatgc cggcgcgccc gaggcaatcg ccggtgcgct ttcgcgacac 420

catcctgggc tgttttttac catcgttgaa gaagcgcccg tcgccatttc gctgactgat 480

gccgacgcac gcattgtcta tgccaacccg gctttctgcc gccagaccgg ctatgaacta 540

gaagcgttgt tgcagcaaaa tccccgcctg cttgcaagtc gccaaacccc acgggaaatc 600

tatcaggata tgtggcacac cttgttacaa cgccgaccgt ggcgcgggca attgattaac 660

cgccaccgcg acggcagcct gtatctggtc gagatcgata tcaccccggt gattaacccg 720

tttggcgaac tggaacacta cctggcaatg cagcgcgata tcagcgccag ttatgcgctg 780

gagcagcggt tgcgcaatca catgacgctg accgaagcgg tgctgaataa cattccggcg 840

gcggtggttg tagtggatga acgcgatcat gtggttatgg ataaccttgc ctacaaaacg 900

ttctgtgccg actgcggcgg aaaagagctc ctgagcgaac tcaatttttc agcccgaaaa 960

gcggagctgg caaacggcca ggtcttaccg gtggtgctgc gcggtgaggt gcgctggttg 1020

tcggtgacct gctgggcgct gccgggcgtc agcgaagaag ccagtcgcta ctttattgat 1080

aacaggctga cgcgcacgct ggtggtgatc accgacgaca cccaacaacg ccagcagcag 1140

gaacagggcc gacttgaccg ccttaaacag cagatgacca acggcaaact actggcagcg 1200

atccgcgaag cgcttgacgc cgcgctgatc cagcttaact gccccatcaa tatgctggcg 1260

gcggcgcgac gtttaaacgg cagtgataac aacaatgtgg cgctcgacgc cgcgtggcgc 1320

gaaggtgaag aggcgatggc gcggctgaaa cgttgccgcc cgtcgctgga actggaaagt 1380

gcggccgtct ggccgctgca accctttttt gacgatctgc gcgcgcttta tcacacccgc 1440

tacgagcagg ggaaaaattt gcaggtcacg ctggattccc atcatctggt gggatttggt 1500

cagcgtacgc aactgttagc ctgcctgagt ctgtggctcg atcgcacgct ggatattgcc 1560

gccgggctgg gtgatttcac cgcgcaaacg cagatttacg cccgcgaaga agagggctgg 1620

ctctctttgt atatcactga caatgtgccg ctgatcccgc tgcgccacac ccactcgccg 1680

gatgcgctta acgctccggg aaaaggcatg gagctgcgcc tgatccagac gctggtggca 1740

caccaccacg gcgcaataga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta 1800

cgattcccgc tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga accgagtcgg 1860

gtaataccgt ctggcgcttc gatttgtccc agcagttcac tgcgatgcag cgcataagcg 1920

tggtactcag ccgggcgacc gaggtcgatc agacgctcca gcaagtgctg tgcgtattgc 1980

acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag caggcgattt 2040

tgaatattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttaat ccccggcagc tcgcaaatcc 2100

gctatcgtcc gggcgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcagggccaa tcattagtgc 2160

tggcgcgcgt tgctgacgat cagcgctttc ttgaccggct cgggttgtat gattacaacc 2220

tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cagatgcgca gactttcggt gtgctgacgg 2280

cacaacccat ggcgcgttac gaagagcgat tacccgcctg cacccgcttt ctggaaacgg 2340

tcgctaacct ggtcgcgcaa accgtgcgtt tgatggcacc accggcagtg cgcccttccc 2400

cgcgcgccgc cataacacag gccgccagcc cgaaatcctg cacggcctca cgcgcatttg 2460

gttttgaaaa tatggtcggt aacagtccgg cgatgcgcca gaccatggag attatccgtc 2520

aggtttcgcg ctgggacacc accgttctgg tacgcggcga gagtggcacc ggcaaggagc 2580

tgattgccaa cgccatccac caccattcgc cgcgtgccgg tgcgccattt gtgaaattca 2640

actgtgcggc gctgccggac acactgctgg aaagcgaatt gttcggtcac gagaaagggg 2700

catttaccgg cgcggtacgc cagcgtaaag gccgttttga gctggccgat ggcggcacgc 2760

tgtttcttga cgagatcggc gagagtagcg cctcgtttca ggctaagctg ctgcgcattt 2820

tgcaggaagg cgaaatggaa cgcgtcggcg gcgacgagac attgcaagtg aatgtgcgca 2880

ttattgccgc gacgaaccgc aatcttgaag atgaagtccg gctggggcac tttcgcgaag 2940

atctctatta tcgcctgaat gtgatgccca tcgccctgcc gccactacgc gaacgccagg 3000

aggacattgc cgagctggcg cactttctgg tgcgtaaaat cgcccataac cagagccgta 3060

cgctgcgcat tagcgagggc gctatccgcc tgctgatgag ctacaactgg cccggtaatg 3120

tgcgcgaact ggaaaactgc cttgagcgct cagcggtgat gtcggagaac ggtctgatcg 3180

atcgggatgt gattttgttt aatcatcgcg accagccagc caaaccgcca gttatcagcg 3240

tctcgcatga tgataactgg ctcgataaca accttgacga gcgccagcgg ctgattgcgg 3300

cgctggaaaa agcgggatgg gtacaagcca aagccgcgcg cttgctgggg atgacgccgc 3360

gccaggtcgc ctatcgtatt cagacgatgg atataaccct gccaaggcta taa 3413

<210> 77

<211> 495

<212> PRT

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> NifL, 株CI006

<400> 77

Met Thr Leu Asn Met Met Met Asp Ala Gly Ala Pro Glu Ala Ile Ala

1 5 10 15

Gly Ala Leu Ser Arg His His Pro Gly Leu Phe Phe Thr Ile Val Glu

20 25 30

Glu Ala Pro Val Ala Ile Ser Leu Thr Asp Ala Asp Ala Arg Ile Val

35 40 45

Tyr Ala Asn Pro Ala Phe Cys Arg Gln Thr Gly Tyr Glu Leu Glu Ala

50 55 60

Leu Leu Gln Gln Asn Pro Arg Leu Leu Ala Ser Arg Gln Thr Pro Arg

65 70 75 80

Glu Ile Tyr Gln Asp Met Trp His Thr Leu Leu Gln Arg Arg Pro Trp

85 90 95

Arg Gly Gln Leu Ile Asn Arg His Arg Asp Gly Ser Leu Tyr Leu Val

100 105 110

Glu Ile Asp Ile Thr Pro Val Ile Asn Pro Phe Gly Glu Leu Glu His

115 120 125

Tyr Leu Ala Met Gln Arg Asp Ile Ser Ala Ser Tyr Ala Leu Glu Gln

130 135 140

Arg Leu Arg Asn His Met Thr Leu Thr Glu Ala Val Leu Asn Asn Ile

145 150 155 160

Pro Ala Ala Val Val Val Val Asp Glu Arg Asp His Val Val Met Asp

165 170 175

Asn Leu Ala Tyr Lys Thr Phe Cys Ala Asp Cys Gly Gly Lys Glu Leu

180 185 190

Leu Ser Glu Leu Asn Phe Ser Ala Arg Lys Ala Glu Leu Ala Asn Gly

195 200 205

Gln Val Leu Pro Val Val Leu Arg Gly Glu Val Arg Trp Leu Ser Val

210 215 220

Thr Cys Trp Ala Leu Pro Gly Val Ser Glu Glu Ala Ser Arg Tyr Phe

225 230 235 240

Ile Asp Asn Arg Leu Thr Arg Thr Leu Val Val Ile Thr Asp Asp Thr

245 250 255

Gln Gln Arg Gln Gln Gln Glu Gln Gly Arg Leu Asp Arg Leu Lys Gln

260 265 270

Gln Met Thr Asn Gly Lys Leu Leu Ala Ala Ile Arg Glu Ala Leu Asp

275 280 285

Ala Ala Leu Ile Gln Leu Asn Cys Pro Ile Asn Met Leu Ala Ala Ala

290 295 300

Arg Arg Leu Asn Gly Ser Asp Asn Asn Asn Val Ala Leu Asp Ala Ala

305 310 315 320

Trp Arg Glu Gly Glu Glu Ala Met Ala Arg Leu Lys Arg Cys Arg Pro

325 330 335

Ser Leu Glu Leu Glu Ser Ala Ala Val Trp Pro Leu Gln Pro Phe Phe

340 345 350

Asp Asp Leu Arg Ala Leu Tyr His Thr Arg Tyr Glu Gln Gly Lys Asn

355 360 365

Leu Gln Val Thr Leu Asp Ser His His Leu Val Gly Phe Gly Gln Arg

370 375 380

Thr Gln Leu Leu Ala Cys Leu Ser Leu Trp Leu Asp Arg Thr Leu Asp

385 390 395 400

Ile Ala Ala Gly Leu Gly Asp Phe Thr Ala Gln Thr Gln Ile Tyr Ala

405 410 415

Arg Glu Glu Glu Gly Trp Leu Ser Leu Tyr Ile Thr Asp Asn Val Pro

420 425 430

Leu Ile Pro Leu Arg His Thr His Ser Pro Asp Ala Leu Asn Ala Pro

435 440 445

Gly Lys Gly Met Glu Leu Arg Leu Ile Gln Thr Leu Val Ala His His

450 455 460

His Gly Ala Ile Glu Leu Thr Ser His Pro Glu Gly Gly Ser Cys Leu

465 470 475 480

Thr Leu Arg Phe Pro Leu Phe His Ser Leu Thr Gly Gly Ser Lys

485 490 495

<210> 78

<211> 524

<212> PRT

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> NifA, 株CI006

<400> 78

Met Thr Gln Arg Thr Glu Ser Gly Asn Thr Val Trp Arg Phe Asp Leu

1 5 10 15

Ser Gln Gln Phe Thr Ala Met Gln Arg Ile Ser Val Val Leu Ser Arg

20 25 30

Ala Thr Glu Val Asp Gln Thr Leu Gln Gln Val Leu Cys Val Leu His

35 40 45

Asn Asp Ala Phe Leu Gln His Gly Met Ile Cys Leu Tyr Asp Ser Gln

50 55 60

Gln Ala Ile Leu Asn Ile Glu Ala Leu Gln Glu Ala Asp Gln Gln Leu

65 70 75 80

Ile Pro Gly Ser Ser Gln Ile Arg Tyr Arg Pro Gly Glu Gly Leu Val

85 90 95

Gly Thr Val Leu Ser Gln Gly Gln Ser Leu Val Leu Ala Arg Val Ala

100 105 110

Asp Asp Gln Arg Phe Leu Asp Arg Leu Gly Leu Tyr Asp Tyr Asn Leu

115 120 125

Pro Phe Ile Ala Val Pro Leu Ile Gly Pro Asp Ala Gln Thr Phe Gly

130 135 140

Val Leu Thr Ala Gln Pro Met Ala Arg Tyr Glu Glu Arg Leu Pro Ala

145 150 155 160

Cys Thr Arg Phe Leu Glu Thr Val Ala Asn Leu Val Ala Gln Thr Val

165 170 175

Arg Leu Met Ala Pro Pro Ala Val Arg Pro Ser Pro Arg Ala Ala Ile

180 185 190

Thr Gln Ala Ala Ser Pro Lys Ser Cys Thr Ala Ser Arg Ala Phe Gly

195 200 205

Phe Glu Asn Met Val Gly Asn Ser Pro Ala Met Arg Gln Thr Met Glu

210 215 220

Ile Ile Arg Gln Val Ser Arg Trp Asp Thr Thr Val Leu Val Arg Gly

225 230 235 240

Glu Ser Gly Thr Gly Lys Glu Leu Ile Ala Asn Ala Ile His His His

245 250 255

Ser Pro Arg Ala Gly Ala Pro Phe Val Lys Phe Asn Cys Ala Ala Leu

260 265 270

Pro Asp Thr Leu Leu Glu Ser Glu Leu Phe Gly His Glu Lys Gly Ala

275 280 285

Phe Thr Gly Ala Val Arg Gln Arg Lys Gly Arg Phe Glu Leu Ala Asp

290 295 300

Gly Gly Thr Leu Phe Leu Asp Glu Ile Gly Glu Ser Ser Ala Ser Phe

305 310 315 320

Gln Ala Lys Leu Leu Arg Ile Leu Gln Glu Gly Glu Met Glu Arg Val

325 330 335

Gly Gly Asp Glu Thr Leu Gln Val Asn Val Arg Ile Ile Ala Ala Thr

340 345 350

Asn Arg Asn Leu Glu Asp Glu Val Arg Leu Gly His Phe Arg Glu Asp

355 360 365

Leu Tyr Tyr Arg Leu Asn Val Met Pro Ile Ala Leu Pro Pro Leu Arg

370 375 380

Glu Arg Gln Glu Asp Ile Ala Glu Leu Ala His Phe Leu Val Arg Lys

385 390 395 400

Ile Ala His Asn Gln Ser Arg Thr Leu Arg Ile Ser Glu Gly Ala Ile

405 410 415

Arg Leu Leu Met Ser Tyr Asn Trp Pro Gly Asn Val Arg Glu Leu Glu

420 425 430

Asn Cys Leu Glu Arg Ser Ala Val Met Ser Glu Asn Gly Leu Ile Asp

435 440 445

Arg Asp Val Ile Leu Phe Asn His Arg Asp Gln Pro Ala Lys Pro Pro

450 455 460

Val Ile Ser Val Ser His Asp Asp Asn Trp Leu Asp Asn Asn Leu Asp

465 470 475 480

Glu Arg Gln Arg Leu Ile Ala Ala Leu Glu Lys Ala Gly Trp Val Gln

485 490 495

Ala Lys Ala Ala Arg Leu Leu Gly Met Thr Pro Arg Gln Val Ala Tyr

500 505 510

Arg Ile Gln Thr Met Asp Ile Thr Leu Pro Arg Leu

515 520

<210> 79

<211> 2850

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> glnE, 株CI006

<400> 79

atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60

tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120

gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180

cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240

gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300

gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360

ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420

tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatgggc 480

aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540

gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600

cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660

gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720

ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780

cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840

tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900

atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960

gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020

cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080

ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140

aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag acacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200

cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260

gaagcgcata tgtcggcggt gcgtcagata tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 1320

gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 1380

gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440

gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500

caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560

ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620

cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680

tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740

ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800

ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860

caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920

gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980

tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040

ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100

ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160

atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220

cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280

gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340

tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400

gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460

accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520

cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgaca tcgagtttat cgcccaatat 2580

ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640

attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700

ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760

catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820

tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850

<210> 80

<211> 1563

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> glnE_KO1, 株CI006

<400> 80

atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60

agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120

catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180

ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240

ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300

ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360

gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420

cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480

atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540

gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600

gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660

gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720

cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780

ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840

ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900

ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960

gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020

ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080

cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140

ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200

atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260

ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320

ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380

atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440

ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500

gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 1560

taa 1563

<210> 81

<211> 949

<212> PRT

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> glnE, 株CI006

<400> 81

Met Pro His His Ala Gly Leu Ser Gln His Trp Gln Thr Val Phe Ser

1 5 10 15

Arg Leu Pro Glu Ser Leu Thr Ala Gln Pro Leu Ser Ala Gln Ala Gln

20 25 30

Ser Val Leu Thr Phe Ser Asp Phe Val Gln Asp Ser Ile Ile Ala His

35 40 45

Pro Glu Trp Leu Ala Glu Leu Glu Ser Ala Pro Pro Pro Ala Asn Glu

50 55 60

Trp Gln His Tyr Ala Gln Trp Leu Gln Ala Ala Leu Asp Gly Val Thr

65 70 75 80

Asp Glu Ala Ser Leu Met Arg Ala Leu Arg Leu Phe Arg Arg Arg Ile

85 90 95

Met Val Arg Ile Ala Trp Ser Gln Ala Leu Gln Leu Val Ala Glu Glu

100 105 110

Asp Ile Leu Gln Gln Leu Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Ile Val Ala

115 120 125

Ala Arg Asp Trp Leu Tyr Glu Ala Cys Cys Arg Glu Trp Gly Thr Pro

130 135 140

Ser Asn Pro Gln Gly Val Ala Gln Pro Met Leu Val Leu Gly Met Gly

145 150 155 160

Lys Leu Gly Gly Gly Glu Leu Asn Phe Ser Ser Asp Ile Asp Leu Ile

165 170 175

Phe Ala Trp Pro Glu Asn Gly Ala Thr Arg Gly Gly Arg Arg Glu Leu

180 185 190

Asp Asn Ala Gln Phe Phe Thr Arg Leu Gly Gln Arg Leu Ile Lys Val

195 200 205

Leu Asp Gln Pro Thr Gln Asp Gly Phe Val Tyr Arg Val Asp Met Arg

210 215 220

Leu Arg Pro Phe Gly Asp Ser Gly Pro Leu Val Leu Ser Phe Ala Ala

225 230 235 240

Leu Glu Asp Tyr Tyr Gln Glu Gln Gly Arg Asp Trp Glu Arg Tyr Ala

245 250 255

Met Val Lys Ala Arg Ile Met Gly Asp Asn Asp Gly Asp His Ala Arg

260 265 270

Glu Leu Arg Ala Met Leu Arg Pro Phe Val Phe Arg Arg Tyr Ile Asp

275 280 285

Phe Ser Val Ile Gln Ser Leu Arg Asn Met Lys Gly Met Ile Ala Arg

290 295 300

Glu Val Arg Arg Arg Gly Leu Lys Asp Asn Ile Lys Leu Gly Ala Gly

305 310 315 320

Gly Ile Arg Glu Ile Glu Phe Ile Val Gln Val Phe Gln Leu Ile Arg

325 330 335

Gly Gly Arg Glu Pro Ala Leu Gln Ser Arg Ser Leu Leu Pro Thr Leu

340 345 350

Ala Ala Ile Asp Gln Leu His Leu Leu Pro Asp Gly Asp Ala Thr Arg

355 360 365

Leu Arg Glu Ala Tyr Leu Trp Leu Arg Arg Leu Glu Asn Leu Leu Gln

370 375 380

Ser Ile Asn Asp Glu Gln Thr Gln Thr Leu Pro Gly Asp Glu Leu Asn

385 390 395 400

Arg Ala Arg Leu Ala Trp Gly Met Gly Lys Asp Ser Trp Glu Ala Leu

405 410 415

Cys Glu Thr Leu Glu Ala His Met Ser Ala Val Arg Gln Ile Phe Asn

420 425 430

Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp Ala Leu Ser

435 440 445

Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu Glu Asp Ser

450 455 460

Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg Arg Val Val

465 470 475 480

Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg Thr Ile Gly

485 490 495

Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His Leu Leu Ser

500 505 510

Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser Arg Leu Thr

515 520 525

Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu Glu Leu Leu

530 535 540

Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu Cys Ala Ala

545 550 555 560

Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile Leu Leu Asp

565 570 575

Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala Met Asn Ala

580 585 590

Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro Glu Asp Asp

595 600 605

Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu

610 615 620

Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys

625 630 635 640

Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val

645 650 655

Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr

660 665 670

His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly

675 680 685

Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val

690 695 700

Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu

705 710 715 720

Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His

725 730 735

Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala

740 745 750

Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu

755 760 765

Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln

770 775 780

Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala

785 790 795 800

Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly

805 810 815

Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala

820 825 830

His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu

835 840 845

Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg

850 855 860

Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg

865 870 875 880

Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala

885 890 895

Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His

900 905 910

Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val

915 920 925

Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu

930 935 940

Pro Cys Ala Pro Ala

945

<210> 82

<211> 520

<212> PRT

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> GlnE_KO1, 株CI006

<400> 82

Met Phe Asn Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp

1 5 10 15

Ala Leu Ser Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu

20 25 30

Glu Asp Ser Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg

35 40 45

Arg Val Val Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg

50 55 60

Thr Ile Gly Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His

65 70 75 80

Leu Leu Ser Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser

85 90 95

Arg Leu Thr Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu

100 105 110

Glu Leu Leu Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu

115 120 125

Cys Ala Ala Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile

130 135 140

Leu Leu Asp Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala

145 150 155 160

Met Asn Ala Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro

165 170 175

Glu Asp Asp Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln

180 185 190

Ala Gln Leu Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro

195 200 205

Val Met Lys Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile

210 215 220

Asp Ala Val Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly

225 230 235 240

Gln Pro Thr His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val

245 250 255

Gly Tyr Gly Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu

260 265 270

Asp Leu Val Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly

275 280 285

Glu Arg Glu Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg

290 295 300

Val Met His Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu

305 310 315 320

Val Asp Ala Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr

325 330 335

Thr Thr Glu Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp

340 345 350

Glu His Gln Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln

355 360 365

Leu Thr Ala Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro

370 375 380

Arg Asp Gly Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys

385 390 395 400

Met Arg Ala His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys

405 410 415

Ala Asp Glu Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu

420 425 430

Val Leu Arg Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp

435 440 445

Asn Val Arg Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu

450 455 460

Gln Glu Ala Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu

465 470 475 480

Leu His His Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser

485 490 495

Cys Phe Val Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp

500 505 510

Leu Val Glu Pro Cys Ala Pro Ala

515 520

<210> 83

<211> 341

<212> PRT

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> GlnE ATase结构域, 株CI006

<400> 83

Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu

1 5 10 15

Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys

20 25 30

Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val

35 40 45

Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr

50 55 60

His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly

65 70 75 80

Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val

85 90 95

Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu

100 105 110

Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His

115 120 125

Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala

130 135 140

Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu

145 150 155 160

Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln

165 170 175

Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala

180 185 190

Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly

195 200 205

Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala

210 215 220

His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu

225 230 235 240

Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg

245 250 255

Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg

260 265 270

Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala

275 280 285

Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His

290 295 300

Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val

305 310 315 320

Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu

325 330 335

Pro Cys Ala Pro Ala

340

<210> 84

<211> 1342

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> ***nifL区中的Prm5, 株CI006, 现为株CM029

<400> 84

ccgagcgtcg gggtgcctaa tatcagcacc ggatacgaga gaaaagtgtc tacatcggtt 60

cggttgatat tgaccggcgc atccgccagc ccgcccagtt tctggtggat ctgtttggcg 120

attttgcggg tcttgccggt gtcggtgccg aaaaaaatac caatatttgc cataacacac 180

gctcctgttg aaaaagagat cccgccggga aatgcggtga acgtgtctga tattgcgaag 240

agtgtgccag ttttggtcgc gggcaaaacc tgcaccagtt tggttattaa tgcaccagtc 300

tggcgctttt tttcgccgag tttctcctcg ctaatgcccg ccaggcgcgg ctttggcgct 360

gatagcgcgc tgaataccga tctggatcaa ggttttgtcg ggttatcagc caaaaggtgc 420

actctttgca tggttatacg tgcctgacat gttgtccggg cgacaaacgg cctggtggca 480

caaattgtca gaactacgac acgactaact gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata 540

tgatgatgga tgccggcgga catcatcgcg acaaacaata ttaataccgg caaccacacc 600

ggcaatttac gagactgcgc aggcatcctt tctcccgtca atttctgtca aataaagtaa 660

aagaggcagt ctacttgaat tacccccggc tggttgagcg tttgttgaaa aaaagtaact 720

gaaaaatccg tagaatagcg ccactctgat ggttaattaa cctattcaat taagaattat 780

ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga aaactgcttt 840

tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt 900

gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg 960

aaccgagtcg ggtaataccg tctggcgctt cgatttgtcc cagcagttca ctgcgatgca 1020

gcgcataagc gtggtactca gccgggcgac cgaggtcgat cagacgctcc agcaagtgct 1080

gtgcgtattg cacaatgacg cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca 1140

gcaggcgatt ttgaatattg aagcgttgca ggaagccgat cagcagttaa tccccggcag 1200

ctcgcaaatc cgctatcgtc cgggcgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcagggcca 1260

atcattagtg ctggcgcgcg ttgctgacga tcagcgcttt cttgaccggc tcgggttgta 1320

tgattacaac ctgccgttta tc 1342

<210> 85

<211> 1270

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (186)..(186)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (458)..(458)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1041)..(1041)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1131)..(1132)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1135)..(1135)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1139)..(1140)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 85

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgnaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcanac ttaatacgtg tggtgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgcgcttaa cgtgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccacg gaattcgcca gagatggctt 1020

agtgccttcg ggaaccgtga nacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc nngtnatgnn 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgagg 1270

<210> 86

<211> 876

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifH

<400> 86

atggcaatgc gtcaatgcgc aatctacggg aaagggggta ttgggaaatc caccactacc 60

caaaaccttg tagcggctct ggccgaaatg aataagaagg tcatgatcgt cggctgtgac 120

cctaaggctg attcaacccg cctcattctg catgcgaaag cacagaacac catcatggaa 180

atggccgctg aagtgggctc cgtggaagat ctggagctgg aagatgtgat gcaaatcggc 240

tatggcggcg tgcgctgtgc ggaatcaggc ggccctgagc ctggtgtggg ttgtgccgga 300

cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaagaagaag gcgcgtatgt gccggatctg 360

gattttgtgt tttacgacgt attgggcgat gtggtctgtg gcggtttcgc gatgccaatt 420

cgcgaaaaca aagcgcagga aatctacatc gtgtgctccg gtgaaatgat ggcgatgtat 480

gccgccaaca acatttccaa aggcatcgtg aaatacgcga aatcgggcaa agttcgcctg 540

gccgggctga tctgtaactc ccgccagacg gatcgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600

gctgaaaaac ttggcacgca aatgatccac ttcgtgccgc gtgacaacat tgtgcaacgc 660

gctgaaatcc gccgcatgac ggtcatcgaa tacgacccga cttgtgcgca ggcagatcag 720

tatcgtgcac tggcgaacaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc gacaccggtc 780

accatggatg agctggaagc cctgttaatg gaatttggca ttatggaaga agaagacctg 840

gccatcgtcg gtcgtaccgc cgccgaagag gcgtga 876

<210> 87

<211> 1374

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifD1

<400> 87

atgaaggcaa aagagattct ggcgctgatt gatgagccag cctgtgagca taaccacaag 60

cagaagtcgg gttgcagcct gccgaaaccg ggcgcgacgg caggcggttg tgcgtttgat 120

ggcgcgcaga ttgcgctgct gccggtcgcg gacgtcgcgc atctggtgca cggcccgatt 180

ggctgtaccg gcagttcatg ggacaaccgt ggcagccgca gttccgggcc ttccatcaac 240

cgcatgggct tcaccaccga catgagcgag caggatgtga ttatggggcg cggcgagcga 300

cgcttatttc acgccgtgca gcacatcgtc agccattacc atccggtggc ggtctttatt 360

tacaacacct gcgtacccgc gatggaaggg gatgacgttg aagccgtgtg tcgcgccgca 420

tcggccgctg ccggtgtgcc ggttatttca gtcgatgccg ccggtttcta cggcagcaaa 480

aatctcggta accgcattgc cggggacgtg atggtcaaaa aggtgatcgg ccagcgcgaa 540

cccgcgccgt ggccggaaaa ctcaccgatc cccgccggac accgccacag catcagcctg 600

attggcgaat tcaatattgc cggcgagttc tggcacgttc tgccgctgct cgatgagctc 660

gggatccgcg tgctgtgcag cctttccggg gattcccgtt ttgctgaaat ccagactatg 720

caccgtggcg aagccaacat gctggtgtgc tcgcgggcgc tgatcaacgt cgcccgaaaa 780

atggaagagc gttaccagat cccatggttt gaaggcagtt tttatggcct gcgttccatg 840

gctgattccc tgcgcacgat cgccgtgctg ctcaaagacc cggatttaca ggcgcgcaca 900

gaacgtctga ttgagcgcga ggaggcggcg acacatcttg cgcttgcgcc ttaccgtgcg 960

cggctcagcg ggcgcaaggc gctgctgtat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020

tcggcgttac aggatttagg catcacggtg gtggcgaccg gcacccgaaa atcaaccgaa 1080

gaagacaagc agcgtattcg cgaactgatg ggtgaagacg tgctgatgct cgacgaaggc 1140

aatgccagaa ccttgctcga caccctctat cgtttcggcg gcgacatcat gatcgccggg 1200

ggccgcaaca tgtataccgc gtacaaagcc cgcctgccgt tcctggatat caatcaggag 1260

cgcgagcatg cgtttgccgg atatcacggg ctggtaaatc tggccgaaca gttgtgtatc 1320

accctggaaa gcccggtctg ggcgcaggtc aaccgtctgg cgccgtggcg ctaa 1374

<210> 88

<211> 1449

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifD2

<400> 88

atgaccagtg aaacacgcga acgtaacgag gcattgatcc aggaagtgct ggagatcttc 60

cccgagaagg cgcttaaaga tcgtaagaaa cacatgatga ccaccgaccc ggcgatggaa 120

tctgtcggca agtgtattgt ctcaaaccgc aaatcacagc cgggcgtgat gaccgtgcga 180

ggctgcgctt acgccggttc caaaggcgtg gtctttggcc cgatcaaaga catggcgcat 240

atctcccacg gcccggttgg ttgcggccag tattcccgtg ccggacgccg taactattac 300

accggctgga gcggcgtgaa cagctttggc accctcaact tcaccagtga ttttcaggaa 360

cgggacatcg tatttggcgg cgataaaaag ctcgacaaat tgatcgatga actggagatg 420

ttgttcccgc tgagcaaagg catttcggtg cagtcggaat gtccggtcgg tctgatcggc 480

gatgacattt ctgccgtcgc caaagccagc agcgccaaaa tcggtaagcc ggtcgtgccg 540

gtacgctgcg aggggttccg cggtgtgtcg caatcgctcg gccatcacat tgctaacgat 600

gtcatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaatg aatttgaaac cacgccttac 660

gacgtggcga ttatcggcga ctacaacatc ggcggtgacg cctgggcctc acgtattctg 720

ctcgaagaaa tggggctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggtggag 780

atggaaaaca ccccgaaagt cgcgctcaat ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840

atctcccgtc atatggaaga aaaacacggc attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900

ccgaccaaaa ttgcggaatc tctgcgcgaa atcgcggcgc gttttgacga taccatccgg 960

aaaaacgccg aagcggtgat tgaaaaatat caggcgcaaa cgcaggcggt gatcgacaaa 1020

taccgtccgc gtctggaagg caaaaaggtg ctgttgtatc tcggcggttt acgtccgcgc 1080

cacatcatcg gggcgtatga agatctggga atggaaatca tcggtaccgg ctatgaattc 1140

ggtcataacg atgattacga ccgcacctta ccgatgctca aagaaggcac gttgctgttc 1200

gatgacctga gcagttatga gctggaagcg ttcgttaaag cgctgaaacc ggatcttgtc 1260

gggtcaggta tcaaagaaaa atacattttc cagaaaatgg gcgtgccgtt ccgccagatg 1320

cactcctggg attattccgg cccttatcac ggctacgacg gtttcggcat ttttgcccgt 1380

gacatggaca tgacgctgaa caatccgggc tggagtcagc tgaccgcccc ctggttgaaa 1440

acggcctga 1449

<210> 89

<211> 1386

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifK1

<400> 89

atggctcaaa ttctgcgtaa tgccaagccg cttgccacca cgcctgtcaa aagcgggcaa 60

ccgctcgggg cgatcctggc cagtcagggg ctggaaaatt gcatcccgct ggttcacggc 120

gcgcaaggtt gtagcgcgtt cgccaaagtt ttcttcatcc agcattttca cgatccgatc 180

ccgttgcagt ccacggcgat ggaatcgacc acgactatca tgggctcgga tggcaacgtc 240

agtactgcgt tgaccacgtt gtgtcagcgc agtaatccaa aagccattgt gattttgagc 300

accggactgt cagaagcgca gggcagtgat ttgtcgatgg cgctgcgtga gtttcgcgac 360

aaagaaccgc gctttaatgc catcgctatt ctgaccgtta acacgccgga tttttacggc 420

tcgctggaaa acggctacag cgcgctgatg gaaagcgtga tcactcagtg ggtgccggaa 480

aagccgccga ccggcatgcg taacaagcgc gtgaacctgc tggtgagcca tctgctgacg 540

ccgggggatc tggaattact gcgcagctat gtcgaagcct ttggcctgca accggtgatc 600

ctgccggatt tatcacagtc gctggacgga catctggcga atggcgattt caatccggtc 660

acgcagggcg gcacgtcgca acgccagatt gaacaaatgg ggcagagcct gaccaccatt 720

accattggca gttcgctcaa ctgcgccgcc agtctgatgg cgatgcgcag ccgtggcatg 780

gcgctgaacc tgccgcacct gatgacgctg gaaaacatgg acagtctgat ccgccatctg 840

catcaggtgt caggccgcga ggtaccggca tggattgagc gccagcgcgg gcaactgctg 900

gacgccatga tcgactgcca tacctggctg cagtcacagc gtattgcgct ggcggcagaa 960

gcggatttgc tggtggcgtg gtgcgatttc gctcagagcc agggaatgcg cgtcgggccg 1020

gtgattgcgc cggttaatca gcagtcactg gccgggctgc cggtcgaaca ggtggtgatc 1080

ggcgatctgg aagatttaca aacccggctc gacagctacc cggtttcact gctggtggcg 1140

aactcccacg ctgcaccact ggcggaaaaa aacggtatcg cgctggtacg tgccggtttc 1200

ccgctttacg accgtctcgg ggaatttcgc cgcgtgcggc agggctatgc gggtattcgc 1260

gacaccttgt tcgaactcgc gaacctgatg caggcgcgcc atcacatgct gacggcgtat 1320

cactcaccgc ttaggcaggt gttcggcctg agcccggtac cggaggccag tcatgaggcg 1380

cgctaa 1386

<210> 90

<211> 1569

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifK2

<400> 90

atgagtcaag atcttggcac cccaaaatcc tgtttcccgc tgttcgagca ggatgaatac 60

cagaatatgt ttacccacaa acgcgcgctg gaagaagcac acggcgaggc gaaagtgcgg 120

gaagtgtttg aatggaccac cacgcaggaa tatcaggatc tgaacttctc gcgtgaagcg 180

ctgaccgtcg acccggcgaa agcctgccag ccgttaggcg cggtactttg cgcgctgggt 240

tttaccaaca cgttgccgta tgtccatggt tcacaaggct gtgtggcgta tttccgtacc 300

tattttaatc gtcatttcaa agagccggtg gcctgtgttt ccgactcaat gaccgaagat 360

gccgccgttt ttggcggaaa taacaacatg aatgtcggtc tggaaaacgc cagcgcgctg 420

tacaagccgg aaattattgc ggtctccacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgac 480

ctgcaggctt ttatcgccaa cgccaaaaaa gacggatttg tggatgccgg tatgccaatc 540

ccgtatgccc atacaccgag ttttctgggc agtcatgtca ccggctggga caacatgttt 600

gaaggcttcg cccgtacctt taccaccgac gccacgcggg aatatcagcc gggcaaactt 660

gccaaactga acgtggtgac cggttttgaa acttatctcg gcaactaccg ggttattcac 720

cgcatgatga gccagatggg ggtcgaatgc agcgtcttgt ccgatccgtc tgaagtgctc 780

gacaccccgg ctgacggcca ataccgcatg tatgccggcg gcaccacgca aaccgaaatg 840

cgtgatgcac cggatgccat cgacaccttg ctgctgcaac cgtggcaatt acagaaaacc 900

aaaaaggtgg tgcagggcga ctggaatcag ccgggcaccg aagtcagtgt accgattggc 960

ctggcggcga ccgatgcctt gctgatgacg gtaagcgaac tgaccggcaa accgatagct 1020

gacgcgctgg cgactgaacg tggccgtctg gtggacatga tgctcgattc tcacacctgg 1080

ctgcacggca agcgtttcgg tctctacggt gacccggatt ttgtgatggg catgaccgca 1140

ttcctgctgg aactgggctg tgaaccgacc accattctca gccataacgg caacaaacgc 1200

tggcagaaag ccatgaagaa aatgctggct gattcgcctt acggacagga cagcgaagtg 1260

tatgtgaact gcgatctgtg gcatttccgc tcgctgatgt ttacccgtaa accggacttt 1320

atgatcggca actcttacgg aaaattcatt cagcgtgaca cgctggccaa aggcgaacag 1380

ttcgaagtgc cgctgatccg tatcggattc ccgatttttg accggcacca tttgcaccgt 1440

cagaccacct ggggatacga gggcgcgatg agcatcctga cgcaactggt gaatgcggtg 1500

ctcgaacagc tggatcgcga aaccatgaag ctcggcaaaa ccgactacaa cttcgatctg 1560

atccgctaa 1569

<210> 91

<211> 1488

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifL

<400> 91

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat catcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ccagccagca gacgccgaaa 240

catatctatg acgaaatgtg gcgcactttg ttgcagggca aatcctggaa cggccaactg 300

atcaaccggc gtaataaccg ttcgctttat ctggcggatg tcactatcac gcctgtttta 360

ggcgcggacg ggcaggtgga gcattacctc ggcatgcaca aagatatcag cgagaaatac 420

gcgctggagc agcggttgcg caaccacatc accttgttca cggaggtgct gaacaatatt 480

cccgccgccg tggtggtggt ggatgagcag gacaatgtgg tgatggacaa tctggcctac 540

aaaaccctgt gcgctgactg cggcggaaaa gagctgttgg ccgaaatggg ctatccgcaa 600

ctcaaagaga tgctcaacag tggcgaaccg gtgccggttt ccatgcgcgg caacgtacgc 660

tggttttctt tcggtcagtg gtcattgcag ggcgttaatg aagaggccag ccgctttttt 720

accggcatta ccgcgccggg aaaactgatt gttctcaccg actgcaccga tcagcatcac 780

cggcagcagc agggttatct tgaccggctc aagcaaaaac ttaccaacgg caaattgctg 840

gcagccatcc gcgagtcgct tgatgccgcg ctgattcagc tcaacgggcc aattaatatg 900

ctggcggctg cgcgtcgtct taacggcgaa gaaggcaaca acatggcgct ggaattcgcc 960

tggcgcgaag gcgagcaggc ggtgagtcgc ttacaggcct gccgtccgtc gctggatttt 1020

gagccgcagg cagaatggcc ggtcagtgaa ttcttcgacg atctgagcgc gctgtacgac 1080

agccattttc tcagtgacgg tgaattgcgt tacgtggtca tgccatctga tctgcacgct 1140

gtcgggcaac gaacgcaaat ccttaccgcg ctgagcttat ggattgatca cacgctgtca 1200

caggcgcagg ccatgccgtc tctgaagctc tcggtgaaca ttgttgcgaa gcaggatgcg 1260

agctggttgt gttttgacat taccgataat gtgccgcgtg aacgggtgcg ttatgcccgc 1320

ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat ccagacgctg 1380

atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440

acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488

<210> 92

<211> 1557

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifA

<400> 92

atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60

acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaataccgc gcgcgcactg 120

gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180

ttcgataaag aacgcaatgc actgtttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240

aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300

agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360

ctgaatattt acgattacag cctgccgctg attggtgtgc cgatccccgg tgcggataat 420

cagcctgcgg gtgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctggctgcc 480

agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540

cccccggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600

tttgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660

gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720

atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780

tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840

ttcaccggcg ctatacgcac ccgaaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900

ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960

caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020

attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaggag gaagtgcgtg ccgggaattt tcgcgaagac 1080

ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140

gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200

ctgcgcatca gtgatggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260

cgtgaactgg aaaactgcct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320

cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgag tccccggcgc tgtccgtcaa acccggtctg 1380

ccgctggcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440

gctgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500

ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557

<210> 93

<211> 2838

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> glnE

<400> 93

atgttgccac tttcttctgt tttgcaaagc cacgcgcaga gtttgcctga acgctggcat 60

gaacatcctg aaaacctgcc cctccccgat gatgaacagc tggctgtgct gagcagcagt 120

gaattcatga cggacagttt gctggctttt ccgcagtggt ggcatgaaat tgtccaaaat 180

ccccctcagg cgcaggagtg gcaactttac cgtcagtggc tggatgaatc gctgacgcag 240

gtgactgacg aagccgggtt aatgaaagct ttgcgtctgt tccgccgccg tattctgacc 300

cgcattgcgt ggtcacagtc cgcgcaaacc agcgaagcaa aagatacgct tcaccagctg 360

agtgaactgg cggaattatt gattgtcagc gcccgtgact ggctgtatgc cgcttgctgt 420

cgcgagttcg gtacgccggt caatgccgca ggggaaccgc agagaatgct gatcctcggg 480

atgggcaaac tcggcggtgg cgagctgaat ttctcatcgg acatcgacct gatttttgct 540

tatccggaaa atggccagac acgcggcggt cggcgtgaac tggataacgc acaatttttc 600

acccggctcg gccagcgtct gatcaaagcg ctggatcagc ccactatcga cggttttgtc 660

tatcgcgtgg acatgcgttt gcgtccgttc ggcgacagtg gcccgctggt gatgagcttc 720

ccggcactgg aagattatta tcaggaacag gggcgcgact gggaacgcta cgcaatggtg 780

aaagcgcgtc tgatgggcgg cgcggaggac atcagcagtc aggaattgcg taaaatgctg 840

atgccttttg tcttccgccg ttatatcgat ttcagtgtga tccagtccct gcgtaacatg 900

aaaggcatga tcgcccgcga agtacgccgc cgtggtctga aagacaacat caaactcggc 960

gcaggcggta ttcgtgaaat tgaatttatc gtgcaggtat ttcagctgat ccgtggcggt 1020

cgtgaaccgg cattgcagca gcgtgcgttg ttgccaacgc ttcaggcgct ggaaaatctg 1080

gggctgctgc cggtagagca ggtgttgcag ttgcgtaaca gctatctgtt cctgcgacgt 1140

ctggaaaacc tgttgcaggc cattgctgac gagcaaacgc aaaccttacc gtccgatgag 1200

ctgaatcagg cgcgtctggc gtgggggatg aattacgctg gctggccgca gcttctggat 1260

gcagtgaatg ctcacatgca ggccgtacgc gcggtattta acgatctgat tggcgatgac 1320

acgccagatg ccgaagatga cgtgcaactc tcccggttca gcagtttatg gattgatacg 1380

cttgagcctg acgagctggc tccgctggtg ccgcaacttg acgaaaatgc gcaacggcat 1440

gttttacatc agattgctga ttttcgccgt gacgtggata aacgcacgat agggccacgt 1500

gggcgtgatc agttggattt gctgatgccg cgtttactgg cccaggtctg cacctataaa 1560

aatgcggatg tgacgttaca gcgcctgatg cagttgctgc tcaatatcgt cacgcgcacg 1620

acgtatatcg agctgctggt ggaatatccc ggtgcgctca aacagttaat acgtctgtgc 1680

gctgcctcgc cgatggtggc gacgcaactt gcgcgtcatc ctttattgct cgacgaactg 1740

ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cgtaccgtga tgaactgcgg 1800

caatatctga tgcgggtgcc aaccgaagac gaagaacaac agcttgaagc cgtgcgccag 1860

ttcaaacagg cacagcattt acgtattgcg gccggggata tttccggtgc gttgccggtg 1920

atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt gcggaggcca ttctcgacgt tgtggtgcaa 1980

caggcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac ggtcagccaa cccatcttca gcaccgtaaa 2040

gggcgcggtt ttgccgtggt gggttacgga aaactcggtg gctgggagct gggttacagc 2100

tcggatctgg atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aagtcatgac cgacggcgaa 2160

cgcagcattg acgggcgtca gttttatctg cggctggcgc agcgcatcat gcatttattc 2220

agcacccgta cgtcgtcagg cattctttat gaggttgacc cgcgtctgcg gccttccggt 2280

gcttccggca tgctggtcag caccatcgaa gcttttgcgg attatcaggc caacgaagcc 2340

tggacatggg agcatcaggc gctggttcgc gcgcgtgtgg tttatggtga tccgcaactg 2400

acgcagcaat ttaatgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tgccgacggc 2460

ttgcgtaagg aagtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg cagcaaaaga 2520

gccgacgagt ttgatctgaa agccgatccg ggtggcataa cggatattga attcatcgca 2580

caatatctgg ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacccgctg gtctgataac 2640

gtgcggattt tcgaactgat ggcgcgacat gacatcatgc cggaagagga agcacgccat 2700

ctgacgcagg cttacgtgac attgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac 2760

agcgggaaag tggccgcaga cagctttgcc actgagcgcg cgcaaatccg cgccagctgg 2820

gcaaactggc ttggctga 2838

<210> 94

<211> 1290

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> amtB

<400> 94

atgaaaaaac ttttatccat gatggggctt ggtgcagtgg ctttgctacc ttcgcttgcc 60

atggcagcag caccagcagc ggcaaacggt gctgataacg cctttatgat gatttgtacc 120

gcgctggtat tgttcatgac cgtacccggt gtggcgttgt tctacggcgg cttactgcgt 180

tctaaaaacg ttttgtccat gctgactcag gttattgtta cctttgctct ggtctgcgtc 240

ctgtggatcc tctacggtta cagccttgcc ttcagtgaag gtaacgcgtt cttcggtggt 300

ttcagcaacg taatgatgaa aggcattggc ctggattctg tgactggcac cttctcgcag 360

atgatccacg ttgcattcca gtgttcattt gcctgcatca ctgtagcgct gatcgtaggt 420

ggtattgctg aacgtgtgcg tttctcagca gttctgattt tcactgtgat ctggctgact 480

ttctcttata ttccgatggc tcacatggta tgggcaggcg gtttcctggc tgctgacggt 540

gcgctggact ttgccggtgg taccgttgtt catatcaatg ccgcaattgc tggcctggta 600

ggggcttatc tgctgggtaa acgcgccggt tttggcaaag aagctttcaa accacacaac 660

ctgccaatgg tcttcactgg cgcctcaatc ctgtatgtgg gctggttcgg cttcaatgcg 720

ggttcagcaa gtgccgcaag ctctgttgcc gcgctggctt tcctgaacac tgtcattgct 780

actgctggcg caatcctgtc ctggacgctg gttgagtgga tggtgcgcgg taagccctca 840

ctgctgggcg caagctccgg tgctatcgca ggtctggtgg ctatcacgcc tgcatgtggt 900

acggtcggcg taggtggtgc tctgattatc ggtctggtag gcggtatcac tggtctgtgg 960

ggggttgtta ccctgaaaaa atggctgcgt gttgatgaca cctgtgatgt gttcggtgtt 1020

catggcgtgt gcggtatcgt aggttgtctg ctgacgggtg tattcacgtc cagttcactt 1080

ggcggcgtgg gctacgcaga aggcgtgacc atgggccatc aggtttgggt gcagttcttc 1140

agcgtgtgcg taacattggt ctggtcaggc gttgttgcct tcatcggtta caaagtggct 1200

gacatgatcg taggtctgcg tgttcctgaa gaacaagaac gcgaaggtct ggacgttaac 1260

agccacggcg aaaacgctta caaccaataa 1290

<210> 95

<211> 500

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> PinfC

<400> 95

tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120

acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180

aagttgctgt tcgtactcgt cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240

ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcatca tcaactggag gaataaagta 300

ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360

cgcaagaagt tcgcctcacc ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420

aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480

agccgccagt ttgtcgaatc 500

<210> 96

<211> 1085

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> 16S

<400> 96

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagcg gcggacgggt gagtaatgtc 120

tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180

tcgcaagacc aaagtggggg accttcgggc ctcatgccat cagatgtgcc cagatgggat 240

tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300

gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420

gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cggtgaggtt aataacctca ccgattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggctag agtcttgtag 660

aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg atttggaggt tgtgcccttg 840

aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900

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gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800

tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860

aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920

aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980

gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040

cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100

gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160

gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220

acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280

gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340

acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400

gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460

cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520

gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580

tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 2640

cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700

acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760

ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820

aagtggctga tggcttaa 2838

<210> 106

<211> 500

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> PinfC

<400> 106

agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60

gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg gattgcacca gtgcaggtag 120

tggtcatgaa tattaccgat tctcaggctg aatacgttaa cgaattgacg cgtaaactac 180

aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaatga gaagattggc tttaaaatcc 240

gcgagcacac tttacgtcgt gtcccgtata tgttggtctg tggcgacaaa gaagtcgaag 300

ccggcaaagt ggccgtgcgc acccgtcgcg ggaaagacct cggcagcatg gacgtaagtg 360

aagtgattga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat 420

aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc gaatcgtatc aatggcgaga 480

ttcgcgccct ggaagttcgc 500

<210> 107

<211> 1287

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> amtB

<400> 107

atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60

atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120

ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180

aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240

tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagtttt 300

gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360

atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420

ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgatttttg tggtggtgtg gatgacgctc 480

tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540

ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600

gcgtacatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660

ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720

tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ttggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780

gcggctgcca tcctggcgtg gacctttggc gaatgggccc tgcgcggtaa accttcactg 840

ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900

atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960

gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020

ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080

ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140

atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200

atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260

catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287

<210> 108

<211> 299

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> Prm8.2

<400> 108

cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60

ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa cgcgcacagc ttttatatga 120

gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta gcgcgaaatg atttttcaca 180

agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat tacttaggca tttacttaac 240

gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat tctgtacttg agcttgatc 299

<210> 109

<211> 300

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> Prm6.2

<400> 109

gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60

tttgatgccc tttttgcacg ctttcatacc agaacctggc tcatcagtga ttttttttgt 120

cataatcatt gctgagacag gctctgaaga gggcgtttat acaccaaacc attcgagcgg 180

tagcgcgacg gcaagtcagc gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc 240

cagcgttgaa gcagtttgaa cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 300

<210> 110

<211> 400

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> Prm1.2

<400> 110

gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60

gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc attggcgtca ataggttacg 120

gtccggcgac tttccagatg acctatattc ccggcaccta caataacggt aacgtttact 180

tcgcctgggc tcgtatacag ttttaattcg ctaagtctta gcaataaatg agataagcgg 240

tgtgtcttgt ggaaaaacaa ggactaaagc gttacccact aaaaaagata gcgactttta 300

tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 360

cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 400

<210> 111

<211> 1536

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (245)..(245)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (452)..(452)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (454)..(454)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1131)..(1132)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 111

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gagcggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct 120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180

cgcaagacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt 240

agctngtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggc gntnaggtta ataaccttgt cgattgacgt 480

tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga 660

ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720

cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780

gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggaggtt gtgcccttga 840

ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020

gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt nnggccggga 1140

actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200

ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc 1260

gcgagagcaa gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg 1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440

aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500

taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536

<210> 112

<211> 882

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifH

<400> 112

atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60

cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120

ccgaaagcgg actccacccg tctgatcctt cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180

atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240

tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300

cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga ggaagatttg 360

gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtagtctgcg gcggcttcgc catgccgatc 420

cgcgaaaaca aagcccagga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480

gccgccaaca atatctccaa ggggatcgtg aagtacgcga aatctggcaa ggtgcgcctc 540

ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600

gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660

gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720

tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc aacgccgtgc 780

accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840

agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882

<210> 113

<211> 1449

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifD1

<400> 113

atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60

cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120

agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgt 180

ggctgcgcct atgcgggctc gaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240

atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tactcgcgcg ccggacggcg caactactat 300

accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360

cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420

ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480

gatgacatca gcgccgtggc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540

gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600

gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtat 660

gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720

ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780

atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840

atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccgtgga tggaatataa cttcttcggc 900

ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960

gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020

tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080

cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140

gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200

gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260

ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320

cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380

gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440

tctgcgtga 1449

<210> 114

<211> 1374

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifD2

<400> 114

atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60

caaaaatccg gctgcagcgc tcctaagccc ggcgcaaccg ccggcggctg cgccttcgac 120

ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180

ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240

cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatgggccg cggcgaacgc 300

cgcctgttcc acgccgtccg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360

tacaacacct gcgtaccggc gatggagggg gatgacctgg aggccgtctg ccaggccgca 420

cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgcc attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480

aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540

ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600

attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660

gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720

caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780

ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840

tccgacgcct tgcgccagct ggcggcgctg ctgggggatg acgacctgtg ccgccgcacc 900

gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg cgctggcgcc gtggcgcgag 960

cagctccgtg ggcgcaaagt gttgctctac accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020

tcagccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcggaa atccaccgag 1080

gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140

aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200

ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260

cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320

accctcgcca gtcccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374

<210> 115

<211> 1386

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifK1

<400> 115

atggcagaca ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60

ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtccacggc 120

gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttctttattc agcatttcca tgacccggtg 180

ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240

ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300

accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgtgag 360

gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccgga tttttttggc 420

tcgatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480

acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540

ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600

ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660

acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720

gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780

gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840

gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgcgg ccagctgcag 900

gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960

ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020

ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgatca ggtcgtgccg 1080

ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140

aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200

cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260

gatacgctgt ttgagctggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320

cgctcgccgc ttcgccaggg cgccgacccc ctgccggctt caggagacgc ttatgccgcc 1380

cattaa 1386

<210> 116

<211> 183

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifK2

<400> 116

gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 60

acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 120

aaactggacc acgacaccag ccagttgggc aaaaccgatt acagcttcga cctcgttcgt 180

taa 183

<210> 117

<211> 1485

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifL

<400> 117

atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcaccggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60

caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catatccctc 120

accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccagcgt tttgccgcca gaccggctat 180

tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240

gcgatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300

attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtgc ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360

agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420

accctcgaac aacggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480

cccgccgccg tggtggtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540

aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600

ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtag cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660

tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720

atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780

cagcaggagc aaggacgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840

gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900

ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960

tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020

gaaaaccccg ccgtctggcc gctgcagccc tttttcgacg atctgtgcgc cctctaccgt 1080

acccgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140

ggccagcgca ccccgctgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgaccgcac cctggccctc 1200

gccgccgaat tgccctccgt gccgctggcg atgcagctct atgccgagga gaacgacggc 1260

tggctgtcgc tgtacctgac tgataacgta ccgctgttgc aggtgcgcta cgcccactcc 1320

cccgacgcgc tgaactcgcc gggtaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380

gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440

ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485

<210> 118

<211> 1575

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> nifA

<400> 118

atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60

accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccgggcca ccgaggccag caaaacgctg 120

caggaggtac tcactgtatt gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180

tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240

ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300

gcccaggggc agtcgctggt gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360

ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420

cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480

tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540

cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600

tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660

cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgcggt 720

gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780

ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840

ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900

gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960

caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcgggtcgg cggcgatgag 1020

accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080

cggctgggcc atttccgcga ggatctctat tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140

cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200

atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260

gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320

atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380

gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440

gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500

cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttaccgga tccagatcat ggatatcacc 1560

ctgccgcgtc tgtag 1575

<210> 119

<211> 2838

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> glnE

<400> 119

atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60

gcggattttc ccattgcaga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120

tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180

ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240

actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300

atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agaccctgca gcagctgagc 360

gccctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tctacgccgc ctgctgtaag 420

gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480

ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540

cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600

cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660

cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagctttgcg 720

gcactggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780

gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840

cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900

ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960

ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc agctgatccg cggtggtcgc 1020

gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080

ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140

gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgaa cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200

aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260

ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320

gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380

gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440

ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500

cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgtgccgat 1560

gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620

tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680

gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740

gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800

tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860

aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920

aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980

gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggt cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040

cgcggcttcg ccgttgtcgg ctacggtaag ctcggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100

gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160

gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220

acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280

gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340

acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400

gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gacgaccctg 2460

cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520

gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580

tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 2640

cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700

acgcatgcat acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760

ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820

aagtggctga tggcttaa 2838

<210> 120

<211> 1287

<212> DNA

<213> 变栖克雷伯氏菌

<220>

<223> amtB

<400> 120

atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60

atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120

ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180

aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240

tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagcttt 300

gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360

atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420

ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgattttcg tggtggtgtg gatgacgctc 480

tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540

ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600

gcgtatatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660

ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720

tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ctggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780

gcggcagcca tcctggcctg gacctttggc gaatgggctc tgcgcggcaa accttcactg 840

ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900

atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960

gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020

ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080

ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140

atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200

atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260

catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287

<210> 121

<211> 1435

<212> DNA

<213> Achromobacter spiritinus

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (255)..(255)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (454)..(454)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 121

ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60

gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120

acgtgcctag tagcggggga taactacgcg aaagcgtagc taataccgca tacgccctac 180

gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240

agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360

gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420

aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggntaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480

tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600

tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660

ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720

ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780

agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840

tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960

gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattctg aagagattcg gaagtgctcg 1020

caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140

agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200

gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgaggggg 1260

agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320

tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taacc 1435

<210> 122

<211> 1528

<212> DNA

<213> Achromobacter marplatensis

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (255)..(255)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (999)..(999)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1009)..(1009)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1437)..(1437)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 122

ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60

gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120

acgtgcctag tagcggggga taactacgcg aaagcgtagc taataccgca tacgccctac 180

gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240

agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300

gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360

gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420

aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggttaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480

tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540

gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600

tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660

ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720

ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780

agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840

tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900

tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960

gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattcng aagagattng gaagtgctcg 1020

caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080

gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140

agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200

gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgaggggg 1260

agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320

tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380

cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taaccgnaag 1440

gggggcgatt accacggtag gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat 1500

cggaaggtgc ggctggatca cctccttt 1528

<210> 123

<211> 1522

<212> DNA

<213> Microbacterium murale

<220>

<223> 16S

<400> 123

tacggagagt ttgatcctgg ctcaggatga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt 60

cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg gatcagtggc gaacgggtga gtaacacgtg 120

agcaacctgc ccctgactct gggataagcg ctggaaacgg cgtctaatac tggatatgtg 180

acgtggccgc atggtctgcg tctggaaaga atttcggttg gggatgggct cgcggcctat 240

cagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt 300

gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag caacgccgcg tgagggatga cggccttcgg 420

gttgtaaacc tcttttagca gggaagaagc gaaagtgacg gtacctgcag aaaaagcgcc 480

ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggcg caagcgttat ccggaattat 540

tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaatccgg aggctcaacc 600

tccggcctgc agtgggtacg ggcagactag agtgcggtag gggagattgg aattcctggt 660

gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag atctctgggc 720

cgtaactgac gctgaggagc gaaagggtgg ggagcaaaca ggcttagata ccctggtagt 780

ccaccccgta aacgttggga actagttgtg gggtccattc cacggattcc gtgacgcagc 840

taacgcatta agttccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg 900

acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt 960

accaaggctt gacatatacg agaacgggcc agaaatggtc aactctttgg acactcgtaa 1020

acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac 1080

gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca cgtaatggtg ggaactcatg ggatactgcc 1140

ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg 1200

cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcaat accgcgaggt ggagcgaatc 1260

ccaaaaagcc ggtcccagtt cggattgagg tctgcaactc gacctcatga agtcggagtc 1320

gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg 1380

cccgtcaagt catgaaagtc ggtaacacct gaagccggtg gcctaaccct tgtggaggga 1440

gccgtcgaag gtgggatcgg taattaggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag 1500

gtgcggctgg atcacctcct tt 1522

<210> 124

<211> 1537

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (455)..(455)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1004)..(1004)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 124

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120

tgggaaactg cccgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataatg 180

tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cggatgtgcc cagatgggat 240

tagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300

gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420

gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cgatncggtt aataaccgtg ttgattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggcttg agtcttgtag 660

aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg 840

aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960

tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacgga attnggcaga gatgccttag 1020

tgccttcggg aaccgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140

aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200

tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggca tatacaaaga gaagcgacct 1260

cgcgagagca agcggacctc ataaagtatg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 1320

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440

taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500

gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537

<210> 125

<211> 882

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifH

<400> 125

atgaccatgc gtcaatgcgc catttatggc aaaggtggga tcggcaaatc caccaccacg 60

caaaacctcg tcgccgctct cgcggaaatg ggtaaaaaag tgatgatcgt cggctgcgac 120

ccgaaagcgg actccacccg tctgatcctg catgcgaaag cacagaacac cattatggag 180

atggccgccg aagtgggttc agtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240

tacggcggcg tgcgttgtgc agaatccggc ggcccggagc caggcgtggg ttgtgcaggc 300

cgcggcgtta ttaccgccat taacttcctt gaagaagaag gcgcctatgt cagcgacctc 360

gactttgtct tctatgacgt cctcggtgac gtggtctgcg gcgggttcgc catgccgatt 420

cgtgaaaaca aagcgcaaga gatctatatc gtctgctccg gggaaatgat ggcgatgtat 480

gccgctaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcta aatccggcaa ggtgcgcctg 540

ggcgggctga tttgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600

gcagaaaaac tgggcaccca gatgattcac tttgtgccac gcgacaacat cgtccagcgc 660

gcggaaattc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga aatgcaacca ggccgacgaa 720

taccgcgcgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccctga tggtcgtccc gaccccttgc 780

accatggatg aactggaaga gctgctgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840

agcatcatcg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgcggcct ga 882

<210> 126

<211> 660

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> 固氮酶铁-钼辅因子CDS

<400> 126

atgaacgata acgatgtcct tttctggcgc atgctggcgc tatttcagtg tctgccggaa 60

ctgcaacccg cgcagatcct ggcctggctg acaggagaac gcgacgacgc cttaaccccg 120

gcgtacctcg ataagcttaa cgtccgcgaa ctggaagcga ccttcccgtc tgaaacggcg 180

atgatgtcgc ccgcacgctg gagccgcgtt aacgcgtgcc ttcacggtac gctgcccgca 240

cacctgcagg taaaaagcac cactcgtcag gggcaattac gggtagcctt ttgttcacag 300

gatggattgc tgatcaatgg tcattttggt caggggcggc tgttttttat ctacgccttt 360

gatgaacagg gcggatggct acacgcgtta cgccgtcttc cctcggcccc gcaaacccag 420

gagccgaatg aagttcgcgc gcagctcctg agtgattgcc acctgctgtt ttgtgaagcc 480

attggcggcc ctgcggcggc ccggctgatt cgtcacaata tccacccgat gaaagtgtcg 540

ccagggatgt ccattgccgc ccagtgtgat gccattaccg cactgctgag cggacgtctg 600

ccaccgtggc tggcaaaacg tcttgagaaa gccaacccgc tggaagagcg ggtgttttaa 660

<210> 127

<211> 1374

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifD1

<400> 127

atgaagggaa atgacattct cgcgctgctg gatgaacccg cctgcgaaca caatcacaaa 60

cagaaatccg gctgtagcgc ccctaaaccc ggtgccacgg cgggcggttg cgcgttcgac 120

ggcgcgcaaa tcaccctgtt gccgctgtcg gatgtggcgc acctggtcca cggaccgatt 180

ggctgcacgg gaagctcctg ggataaccgg ggcagtatga gctccggccc cagtctcaac 240

cggctcggct ttaccaccga cctgaacgag caggatgtca ttatggggcg cggcgaacgg 300

cggcttttcc acgcggtgcg tcatatcgtc aaccgttatc accctgccgc cgtgtttatc 360

tataacacct gcgttccggc gatggagggt gatgatattg acgccgtctg tcaggcggcg 420

gaaaccgcca ccggcgtgcc agtgattgcc gttgatgccg ccgggttcta tggcagcaaa 480

aaccttggca accgtctcgc gggtgaagtg atggttaaca aggtcattgg acggcgcccg 540

cccgccccct ggccggacga tacccccttc gcgccggaac accgccacga tatcggcctg 600

attggcgaat ttaatatcgc cggggagttc tggcacgttc agccgctgct cgatgagctg 660

ggtattcgcg tgctgggcag cctttccggg gatggccgtt ttagtgaaat ccagaccctg 720

caccacgcgc aggtcaatat gctggtctgc tcaagagcgc tgatcaatgt tgcccgcacc 780

ctggaacagc gctatggcac cccctggttt gagggcagtt tttacggcgt gcgcgctacc 840

tccgatgccc tgcgtcaact ggcatccctg cttggcgaca gcgatctgat tgcccgcacc 900

gaagccgtta ttgcccgcga agaagccacg gcaaatcagg cgctcgcccc gtggcgcgaa 960

cggctacagg gtcgcaaagt gctgctctat accggtgggg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020

tccgcattgc aggatttagg gatgaccgtc gtggcgactg gcacccgcaa atctaccgaa 1080

gaagataagc agcgtattcg cgaattaatg ggcgatgacg cgctaatgct ggaagaaggc 1140

aacgcccgca ccctgctgga tgtggtgtac cgctatcagg cggatttgat gatcgctggg 1200

gggcgtaaca tgtataccgc gtacaaagcg cggctgccgt ttctggatat caaccaggag 1260

cgtgaacacg cctttgcggg ttatcgcggc atcgtcaccc tcgcccaaca gctttgccag 1320

actattgaaa gccccgtctg gccgcaaaca cacgcccgcg cgccgtggca ataa 1374

<210> 128

<211> 1449

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifD2

<400> 128

atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gaaattatcc aggaagtgct ggagatcttt 60

cccgaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgaccgaccc ggagatggaa 120

agcgtcggga aatgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggtgtgat gactgtccgc 180

ggctgctcct acgccgggtc gaaaggcgtg gtttttgggc cgattaaaga tatggcccac 240

atctcccacg gcccgatcgg ctgtgggcag tactcccgtg ccgggcggcg caactactac 300

accggggtca gcggcgttga ttccttcggg acgctgaact ttacctctga ttttcaggag 360

cgcgatatcg tcttcggcgg cgataaaaag ctcaccaaac tgattgagga gatggaggaa 420

ctgttcccgc tgaccaaagg catctccatt cagtcggagt gcccggtagg tttaatcggt 480

gacgatatcg aagcggtggc gaatgccagt aaaaaagcgc tcaacaagcc ggtgatcccg 540

gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg cagtcgctcg gtcaccatat cgccaacgac 600

gttatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaagggaagc ccttcgaatc taccccctat 660

gacgtggcca tcatcggcga ttacaacatc gggggggatg cctgggcgtc gcgcattctg 720

cttgaagaga tggggttacg cgtggtggcg cagtggtccg gtgacggcac gctggtagag 780

atggaaaaca ccccgttcgt caagctgaac ctggtgcact gctaccgctc tatgaactac 840

atctctcgcc atatggaaga gaaacacggt atcccgtgga tggagtacaa cttcttcggc 900

ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgtaag atcgccgatc aatttgacga caccatccgc 960

gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaaa acgatgcgat tatcgccaaa 1020

taccgcccgc gtctcgaagg ccgcaaggtg ctgctctata tgggtggcct gcgtcctcgc 1080

cacgtgattg gcgcgtatga ggatttgggc atggagattg tcgccgccgg gtatgaattt 1140

gcccataacg acgattacga ccgcaccctg ccggacctca aagagggcac gctgttgttc 1200

gacgatgcca gcagttatga actggaagcc ttcgtgaagg cgattaagcc ggacctcatt 1260

ggctcaggca tcaaggaaaa atacattttc cagaaaatgg gggtaccgtt tcgccagatg 1320

cactcctggg attactccgg cccgtatcac ggctatgacg gctttgccat ctttgcccgc 1380

gatatggaca tgacgctcaa caatcccgcc tggggcgagt tgaccgcacc ctggctgaaa 1440

tcagcctga 1449

<210> 129

<211> 1383

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifK1

<400> 129

atggcagata tcatccgtaa tcagaaaccg ctggcggtaa gcccggtaaa aagcggccag 60

ccgttaggcg ccattctggc gagcctcggc tttgagcaca gtattccact ggtgcacggt 120

gcgcagggat gcagcgcgtt cgccaaagtg ttttttatcc aacattttca tgaccctatt 180

ccgctgcaat ccacggcgat ggaccccacc tcaacggtca tgggggcgga cggcaatatc 240

cttgccgcgc tcaatacgct gtgccagcgc aacaccccga aagctatcgt cctgttgagt 300

accggcctgt ctgaggcgca gggcagcgat atcagccgcg tggtacgtca gtttcgtgag 360

gattttcccc gccacaaaaa tatcgccctc ctgacggtca acaccccgga tttttacggc 420

acgctggaga acggctttag tgcggtggtg gaaagcgtca tcgaacagtg ggtgccggaa 480

aagcctcagc atggcctgcg taaccggcgg gtcaacttgt tgttaagtca cctgctgacg 540

cccggtgatg ttgagttgct gcgcagctac gtggaggctt ttggcctgca accggtgatc 600

gtgccggatc tttcacagtc gctggatggt cacctggcaa gcggtgattt ttcgccggtc 660

actcaggggg gaacgcccct gcgcattatc gaacagatgg gacagagcct gtgcacgttt 720

gctattggcg tgtcgctgtc ccgtgcggca tcgctgctgg cacagcgtag ccgtggcgag 780

gtgatcgtgc ttccccatct gatgaccatg gaacattgcg accgttttat tcatcaactg 840

aagatcattt ccgggcgcga ggttcccgcc tggattgagc gccagcgcgg acaattgcag 900

gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg caggataccc ggctcgcgct ggccgccgag 960

ggcgatctgc tggcgggctg gtgtgatttc gcccgtagcc agggcatgct ccccggcccc 1020

gttgtggcgc cggtcagcca gccgggcctg caacagcttc ccgtggagaa agtggtcatt 1080

ggcgatctgg aagatatgca ggatttactc tgcgctatgc ctgctgacct gctggtcgcc 1140

aactcccatg ccgcagacct ggccgaacaa ttctccatcc cgctgatccg cgccgggttc 1200

cctatcttcg acaggcttgg cgaatttcgt cgcgtgcgtc agggataccc cggcattcgc 1260

gacacgctgt ttgagctggc gaacctgatg cgcgaacgtc atcaccacct gcccgtctac 1320

cgctcccccc tgcgccagca atttgcccag gacgctgacg gaggccgcta tgcaacatgt 1380

taa 1383

<210> 130

<211> 1563

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifK2

<400> 130

atgagccaaa ctgctgagaa aattgtcacc tgtcatccgc tgtttgaaca ggacgaatac 60

cagacgctgt ttcgcaataa gcgcggtctg gaagaggcgc acgacccgca gcgcgtgcaa 120

gaggtttttg aatggaccac cacggcggag tatgaagcgc tgaactttaa gcgtgaagcg 180

ttaaccgtcg atccggcaaa ggcctgccag cctttaggat cggtactctg ctcgctgggt 240

tttgccaata cgctgcctta tgtgcacggt tcccagggct gtgtggccta tttccgcacc 300

tattttaacc gtcatttcaa agagccgatc gcttgcgttt ccgactctat gacagaggat 360

gcggcggtct tcggcggcaa caacaacctt aacaccgggt tgcaaaatgc cagcgccctg 420

tacaaaccgg aaattgtcgc tgtctccact acctgtatgg cggaggtcat cggcgatgac 480

ctgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaag gacgggttta ttgatgccgc cattccggtg 540

ccctacgccc atacgccaag ttttatcggt agccacatca ccggctggga caacatgttt 600

gaaggtttcg cccgggcatt taccgccgat cacgtggcgc aaccgggcaa actggcgaag 660

ctaaacctgg tgaccggttt tgaaacctat cttggcaatt accgcgtgct caaacgcatg 720

atggcccaga tggaggtgcc ctgtagcctg ctgtctgacc cgtctgaggt gttagatacg 780

ccagccgacg gccactatcg catgtatgcg ggcggcacaa cgcaacaaga gatgcgcgac 840

gcccccgatg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc atctggtgaa gagtaaaaaa 900

gtggtgcagg agtcctgggg ccagcccgcc acagaagtgt ccatcccaat gggactgacc 960

gggaccgacg aactgctgat ggcagtcagt cagttaaccg gcaaaccggt ggccgatgaa 1020

ctgacgctgg agcgtgggcg cctggtggat atgattctcg attcacacac ctggctgcac 1080

ggtaagaaat tcggtctcta cggcgatccg gattttgtga tggggctgac gcgtttcctg 1140

ctggaactgg gctgcgagcc gacggttatc ctctgtcata acggtagcaa gcgctggcag 1200

aaagcgatga agaaaatgct tgaggcatcg ccctacggtc aggagagcga agtgttcatc 1260

aactgcgatc tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gcaaaccgga ctttatgatc 1320

ggcaactcgt acgccaaatt catccagcgt gacacgctgg cgaaaggcga acagtttgaa 1380

gttccgctga tccgtcttgg cttcccgttg ttcgaccgcc accacctgca tcgccagacc 1440

acatggggtt atgaaggggc gatgaatatc gtcaccaccc tggtcaacgc cgtgctggaa 1500

aaagtcgacc gcgataccat caaactgggc aaaacggact acagcttcga ccttgtccgc 1560

taa 1563

<210> 131

<211> 1488

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifL

<400> 131

atgaccttta atatgatgct ggagaccagc gcaccgcagc acattgcggg caacctctca 60

cttcaacatc ccggactgtt ttccacgatg gttgaacagg ctccgatcgc gatttcgctg 120

accgacccgg acgcgaggat tctgtacgct aatccggcct tttgtcgcca gaccggttat 180

agcctggaag agctgctcaa ccagaaccat cgcatactgg caagccaaca gacgccgcgc 240

agcatttatc aggaactgtg gcaaacgctg ctgcaacaga tgccctggcg cggtcagctc 300

atcaatcgcc gtcgggatgg cagcctttat ctggctgagg tcgatatcac cccggtcgtc 360

aacaaacagg gcgaactgga acactacctc gccatgcaac gtgatatcag cgccagctat 420

gcgctcgaac agcgattgcg caatcacacc accatgagcg aggcggtgct gaacaacatt 480

cctgccgccg tggtggtggt caacgagcag gaccaggtag tcatggacaa cctcgcctac 540

aaaaccttct gtgccgactg cggtggcaag gagctgctca ccgaactgga tttctcccgg 600

cgcaaaagcg atctctatgc cgggcaaata ctgcctgtgg tgctgcgcgg cgccgtgcgc 660

tggctctctg tcacctgctg gaccttgccg ggggtgagcg aagaagccag ccgctacttt 720

attgataccg cgctgccccg caccctggtg gtgatcaccg actgcaccca gcaacaacaa 780

caggccgaac agggccgtct cgatcgtctc aaacaggaga tgaccaccgg gaagctgctg 840

gccgcgatcc gtgaatcgtt ggatgccgcg ctggttcagc taaactgccc catcaatatg 900

ctggcggcgg cgcgacgtct caacggtgaa gataaccata acgtggcgct ggatgccgcg 960

tggcgcgagg gggaagaggc gctggcccgc ctgcaacgct gccgcccttc tctcgatctg 1020

gaagagagcg cgctgtggcc tctgcaaccg ctgtttgacg acctgcgcgc cctttaccat 1080

acccgctata acaatggcga aaatctgcac gttgaaatgg cctctccgca tctggcgggg 1140

tttggtcagc gcacgcagat ccttgcctgt ctcagtttgt ggctcgaccg tacgctggcc 1200

ctcgccgccg cgctaccgga cagaacgctg catacccagc tttacgcccg tgaagaagat 1260

ggctggctgt ccatttggct gacagataat gtgccgctca tccatgtgcg atacgcccac 1320

tcccccgatg ccctgaacgc ccccggcaaa gggatggagc tgcgattgat tcaaaccctg 1380

gttgcccatc atcgcggcgc aatagaacta actacccgcc ctgaaggcgg tacctgcctg 1440

accctgcgat tcccgttatt tcattcactg accggaggcc cacgatga 1488

<210> 132

<211> 1572

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> nifA

<400> 132

atgacccagc gacccgagtc gggcaccacc gtctggcgtt ttgatctctc acagcaattt 60

accgccatgc agcgcatcag cgtggtgttg agtcgcgcaa ccgagataag ccagacgctg 120

caggaggtgc tgtgtgttct gcataatgac gcatttatgc aacacggcat gctgtgtctg 180

tatgacaacc agcaggaaat tctgagtatt gaagccttgc aggaggcaga ccaacatctg 240

atccccggca gctcgcaaat tcgctatcgc cctggcgaag ggctggtagg agccgtactg 300

tcccagggac aatctcttgt gctgccgcgt gtcgccgacg atcaacgctt tctcgacagg 360

cttggcatct atgattacaa cctgccgttt atcgccgtcc ccttaatggg gccaggcgcg 420

cagacgattg gcgtgctcgc cgcgcagccg atggcgcgtc tggaggagcg gcttccttcc 480

tgtacgcgct ttctggaaac cgtcgccaat ctggtcgcac agacagtccg gctgatgacc 540

ccgcctgccg ccgccacacc gcgcgccgcg attgcccaga ccgaacgcca gcgcaactgt 600

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acaatggaca ttatccgcca ggtttcgcgc tgggatacca cggtactggt gcgcggcgaa 720

agcggcaccg gtaaagaact tatcgccaat gctattcatc acaactcccc tcgcgccgcc 780

gcgccctttg tgaaatttaa ctgcgcggcg ctaccggata cgctactgga gagcgaattg 840

ttcggccatg aaaaaggggc gttcaccggc gcggttcgcc agcgtaaagg acgttttgaa 900

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gccaaactgc tgcgtatttt gcaggagggt gaaatggagc gcgttggcgg cgacgaaacc 1020

ctgcgcgtca atgtgcgtat catcgccgcc accaaccgga atctggaaga agaggtgcgg 1080

atgggcaatt tccgcgagga tctctattat cgcctcaacg taatgcccat ctccctgccc 1140

ccgctgcgtg aacgtcagga ggacattgcc gagctggcgc actttctggt gcgcaaaatc 1200

gcccataacc aggggcgtac gctgcgcatc agtgatggcg ccatccgtct gctgatgggt 1260

tacaactggc ccggtaacgt gcgtgagctg gaaaattgcc tggaacgttc ggcagtgatg 1320

tcagaaaacg gcctgatcga ccgcgatgtg gtgctcttta accaccgtga gaacacgcca 1380

aaactcgcta tcgccgccgc gccaaaagag gatagctggc ttgatcaaac gctggatgaa 1440

cgtcaacggc tgattgccgc gctggaaaaa gccgggtggg tgcaggccaa agcggcgcgt 1500

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cccaggatgt ga 1572

<210> 133

<211> 2853

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> glnE

<400> 133

atgatgccgc actctccaca gctacagcag cactggcaaa ctgtactggc ccgcttgcct 60

gagtcattca gtgaaacacc gcttagtgaa caagcgcagt tagtgcttac tttcagtgat 120

tttgtgcagg atagccttgc cgcgcatcct gactggctgg ctgagctgga aagcgcaccg 180

ccacaggcgg acgagtggaa gcagtatgcg caaacccttc gcgaatcgct ggaaggtgtg 240

ggagatgagg catcattaat gcgtgcgctg cgcctgttcc gtcgccatat gatggtgcgc 300

attgcctggg cgcagtcgct ggcgctggtg gcagaagatg agacgttgca gcagttgagc 360

gtactggcgg agaccctgat cgtcgctgca cgcgactggc tttacgatgc ctgctgtcgc 420

gagtggggaa cgccgtgcaa tcagcagggg gaaccgcagc cgttgctgat cctgggcatg 480

ggcaagctgg gtggcgggga gcttaacttt tcgtccgata tcgatctgat ttttgcctgg 540

ccggaaaacg gttcaacgcg cggtgggcga cgcgaacttg ataacgccca gttttttact 600

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gcgctggaag attattatca ggagcagggg cgcgactggg aacgttatgc gatggtgaaa 780

gcccgcatta tgggcgataa ggacgatgtt tacgctggcg aattacgggc catgctgcgg 840

ccgttcgtct tccgtcgcta tatcgatttc agcgttattc agtctctgcg taacatgaaa 900

gggatgattg cccgcgaagt gcgccgccgt ggtctgaaag ataacattaa gctgggcgcg 960

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cttgaaaagc agatgtctgc cgtacgaggg atattcaaca ccctgattgg cgatgacgaa 1320

gccgaagagc agggggatgc gctctgcggg caatggagtg agttgtggca ggatgcgttt 1380

caggaagatg acagcacgcc tgtgctggcg cacctttctg acgatgatcg ccgccgcgtg 1440

gtcgcgatga ttgctgattt tcgcaaagag ctggataaac gcaccattgg cccacgcggc 1500

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tatcttgagc tgctcagcga gtttcctggt gcgcgtaagc atctgatttc actctgtgcc 1680

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gatccgaata ccctttatca gcccacggcg atgaatgcct accgggatga gctacgtcag 1800

tatctgctgc gtgtgccgga tgacgatgaa gagcagcaac tggaggcgtt acgccagttt 1860

aaacaggctc aattgttgcg tgtggcggca gcagatctgg caggcacact ccccgtgatg 1920

aaagtgagcg atcacttaac atggcttgcc gaagccatca ttgaagccgt ggtacaacag 1980

gcgtggagcc tgatggtatc gcgttatggg cagccgaaac acttacgcga ccgtgaaggc 2040

cgtgggtttg cagtggtcgg ttacggcaaa ctgggcggtt gggagctggg ctatagttcc 2100

gatctggatt tgattttcct tcatgactgt ccggtggacg tgatgactga cggcgagcgg 2160

gaaatcgatg gccgccaatt ttatctgcgc cttgcccagc gcgtgatgca cctgttcagt 2220

acgcgcacct catccgggat cctgtatgag gtagacgcgc gcttgcgccc gtccggtgcg 2280

gcgggaatgc tggtgacctc aaccgaatcc tttgccgact accagcgcac cgaagcctgg 2340

acctgggaac atcaggcgct ggttcgcgcc cgcgttgtct atggcgatcc acaattaaac 2400

gcgcaatttg atgccatccg ccgcgatatc accatgaccg tgcgtaatgg tgcaacgtta 2460

caaaccgagg tgcgcgagat gcgcgaaaaa atgcgcgccc acttgagcaa taagcacaag 2520

gatcgctttg atattaaagc cgatgagggt ggaattaccg atatcgaatt tatcacccag 2580

tatctggtgc tgcgttatgc ccatgccaaa ccgaaactga cgcgctggtc ggacaatgtc 2640

cgcattctgg aagggctggc gcaaaacggc attatggaag agcaggaagc gcaggcactt 2700

accaccgcct atacaacgtt gcgtgatgag ctgcatcacc tggcgctaca ggagctgcca 2760

ggacatgttc cggaggcatg ttttgtcgct gaacgcgcga tggtgcgagc ctgctggaac 2820

aagtggttgg tggagccgtg cgaggacgcg taa 2853

<210> 134

<211> 1290

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> amtB

<400> 134

atgaagaaag cactattaaa agcgggtctg gcctcgctgg cattactgcc gtgtctggct 60

atggcagccg atccggttgt cgtcgataaa gccgacaatg cctttatgat gatttgcacc 120

gcgctggtgc tgtttatgtc aattccgggc atcgccctgt tctatggtgg tttaatccgc 180

ggtaaaaacg tcctttctat gctgacacag gttgcggtta cgttcgcact ggtgtgcgtg 240

ctgtgggtgg tttacggcta ctctctggcc tttggcactg gcggcagctt cttcggtagc 300

ttcgactggg tgatgctgaa aaatattgag ctgaaagcgc tgatgggcac catctatcag 360

tacattcacg ttgcgttcca gggctcgttt gcctgtatta ccgtcggcct gattgtcggt 420

gcgctggcag aacgtatccg tttctccgca gtactgattt tcgtcgtggt atggctgacg 480

ctgtcctacg tgccgatcgc acacatggtc tggggcggcg gtctgctggc aacccatggc 540

gccatggatt ttgcgggcgg tacagtcgtt cacatcaacg cagccgttgc aggcctggtg 600

ggtgcttacc tgattggcaa acgtgtcggt ttcggtaaag aagcgtttaa accgcacaac 660

ctgccgatgg tgtttaccgg tacggcaatc ctctactttg gctggttcgg attcaacgcg 720

ggttctgcaa gcgcggcgaa cgaaattgcg ggtctggctt ttgttaacac cgtcgtggca 780

acagcgggtg caatcctctc ctgggtcttc ggtgagtggg cgctgcgcgg caaaccgtct 840

ctgttgggtg cctgttctgg tgcgattgct ggcctcgtgg gtatcacccc ggcgtgtggt 900

tacgttggtg tgggtggcgc gctgatcgtg ggcatcgttg caggcctggc gggtctgtgg 960

ggcgttaccg cgctgaaacg ctggctgcgt gttgacgacc cgtgtgatgt cttcggtgtt 1020

cacggcgtgt gcggtatcgt aggttgtatc atgacaggta tcttcgcagc cacttcactg 1080

ggcggcgtgg gttatgccga aggcgtgacc atgggccatc aggttctggt acaactggaa 1140

agtatcgcca ttactatcgt atggtctggt atcgtcgcct ttatcggtta caaactggct 1200

gatatgacag tgggtctgcg tgttccggaa gatcaggaac gcgaagggct ggacgtcaac 1260

agccacggcg agaacgccta caacgcctga 1290

<210> 135

<211> 498

<212> DNA

<213> Kluyvera intermedia

<220>

<223> PinfC

<400> 135

ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60

acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca ctgattctca agctgaatat 120

gtcaacgaat tgacccgtaa attgcaaaat gcgggcattc gtgtaaaagc ggacttgaga 180

aacgagaaga ttggctttaa aatccgcgag cacactttac gtcgtgtccc ttatatgttg 240

gtctgtggtg ataaagaggt ggaagcaggc aaagtggccg ttcgcacccg ccgcggtaaa 300

gacctgggca gcctggacgt aagtgaagtg attgagaagc tgcaacaaga gattcgcagc 360

cgcagtcttc aacaactgga ggaataaggt attaaaggcg gaaaacgagt tcaaacggca 420

cgtccgaatc gtatcaatgg cgagattcgc gcccaggaag ttcgcttaac tggtctggaa 480

ggtgagcagc tgggtatt 498

<210> 136

<211> 1537

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (454)..(454)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 136

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120

tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180

tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240

tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300

gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtatgaaga aggccttcgg 420

gttgtaaagt actttcagcg gggaggaagg cganacggtt aataaccgtg ttgattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660

agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840

aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960

tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttgccaga gatggcttgg 1020

tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140

aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200

tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260

cgcgagagca agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 1320

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440

taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500

gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537

<210> 137

<211> 882

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifH

<400> 137

atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggtaaatc gaccaccaca 60

cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaagaaag tcatgatcgt cggctgcgat 120

ccgaaagccg actccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180

atggccgccg aagtcggctc cgtcgaagac ctggaattag aagacgtgct gcaaatcggt 240

tacggcggcg tgcgctgcgc ggaatccggt ggcccggagc caggtgtggg ttgtgccggt 300

cgtggcgtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctg 360

gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420

cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480

gccgccaata acatctccaa aggcatcgtg aaatatgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540

ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgcgaag atgaactcat cattgcgctg 600

gcggaaaaac tcggcacgca aatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660

gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggccaacgaa 720

tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtacc aaccccctgc 780

accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840

agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882

<210> 138

<211> 1449

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifD1

<400> 138

atgagcaatg caacaggcga acgtaacctg gaaatcatcg agcaggtgct ggaggttttc 60

ccggaaaaga cgcgcaaaga gcgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggag 120

agcgtcggca agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggcgtgat gaccgtgcgt 180

ggctgctcgt atgccggatc aaaaggggtg gtatttgggc caatcaaaga tatggcgcat 240

atctcccacg gcccgatcgg ctgcgggcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactat 300

accggcgtca gcggcgtgga cagtttcggc acgctcaact tcacctccga tttccaggag 360

cgcgacatcg tgtttggcgg cgacaaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagaa 420

ctgtttccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480

gatgatattg aagccgtggc gaacgccagc cgcaaagcga tcaacaaacc ggttattccg 540

gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600

gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaaac cgtttgaatc caccccttac 660

gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggtggcgacg cctgggcctc gcgcattttg 720

ctcgaagaga tggggttgcg ggtggtcgcg cagtggtccg gcgacggtac gctggtggag 780

atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840

atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900

ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc tgttcgacga caccattcgc 960

gccaacgccg aagcggtgat cgcccgatac caggcgcaga acgacgccat tatcgccaaa 1020

tatcgcccac gtctggaggg tcgcaaagtg ttgctctata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080

catgtgattg gcgcctatga agatctggga atggagatca tcgccgccgg ttatgagttt 1140

ggtcataacg acgattacga ccgcaccctg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200

gatgacgcca gcagctatga gctggaggcg tttgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260

ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320

cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380

gatatggata tgacgctcaa caaccccgcc tggggtcagt tgaccgcgcc gtggcttaaa 1440

tccgcctga 1449

<210> 139

<211> 1374

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifD2

<400> 139

atgaagggga acgacatcct ggctctgctc gatgaaccag cctgcgagca taaccataaa 60

cagaaaaccg gctgtagcgc gccaaaaccc ggcgccaccg ccggaggctg cgccttcgac 120

ggcgcacaga tcaccctgct gccactttcc gatgtggcgc atctggtaca tggcccgatt 180

ggctgcgccg gcagctcatg ggataaccgt ggcagcctga gttctggccc gctgattaac 240

cgactcggat tcaccactga tttgaacgaa caggatgtca tcatggggcg cggcgagcgg 300

cggttgtttc acgcggtgcg ccatattgtc gagcgctatc acccggcggc ggtatttatt 360

tacaacacct gcgttccggc tatggaaggc gatgacattg acgcggtctg ccaggccgcc 420

gcgaccgcca ccggtgtgcc cgtgattgcc gtagatgtgg ccggttttta cggtagcaaa 480

aacctgggta accgcctcgc gggcgaggtg atggtgaaaa aagttatcgg cgggcgcgaa 540

cccgcgccgt ggccggacaa tacacctttt gccccggcgc accgccatga cataggcctg 600

attggcgaat ttaacatcgc cggcgagttc tggcatatcc agccgctgct tgatgagctg 660

ggtattcgcg tccttggctc cctttccggc gacgggcgct ttgccgagat ccagacgttg 720

caccgcgcgc aggtcaatat gctggtgtgc tccagggcgc tgattaatgt cgccagatcg 780

cttgaacaac gttatggcac accctggttt gaaggcagtt tttatggcgt tcgcgccacc 840

tccgatgccc tgcgccagct ggcaacactc accggcgata gcgatttaat ggcgcgaacc 900

gaacggctga tcgcacgtga agagcaagcc acagaacagg cgctagcacc gctgcgtgaa 960

cggttacacg gccggaaagt gctgctctat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020

tcggcgctgc aggatctcgg catgacggtc gttgctaccg gaacgcgcaa atccaccgaa 1080

gaggataaac aacgcatccg tgaactgatg ggcgatgacg ccatcatgct ggatgaaggc 1140

aatgcccgcg ccttgctgga tgtggtctat cgctacaaag ccgacatgat gatcgcgggc 1200

gggcgcaaca tgtacaccgc ctataaagcg cgtctgccct ttctggatat caaccaggag 1260

cgtgaacacg cgtttgccgg ttatcgcggc atcatcacgc ttgccgaaca actttgtcag 1320

acgctggaaa gcccggtctg gccgcaaaca catgcccgcg ccccgtggca ataa 1374

<210> 140

<211> 1563

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifK1

<400> 140

atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggacgcctac 60

cagacactat ttgccggtaa acgggcactc gaagaggctc actcgccgga gcgggtgcag 120

gaagtgtttc aatggaccac caccccggaa tacgaagcgc tgaacttcaa acgcgaagcg 180

ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctggggg cggtgctctg ttcgctgggg 240

tttgccaaca ccctgccgta tgtgcacggt tcacagggtt gtgtggccta tttccgtacg 300

tactttaacc gccacttcaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcgat gacggaagac 360

gcggccgtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccgggt tacaaaacgc cagcgcactg 420

tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480

ttacaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540

ccctacgccc acacccccag ttttatcggt agccatatca ccggctggga caacatgttt 600

gaaggttttg cccgtacctt taccgcaaac catcagccac agcccggtaa actttcacgc 660

ctgaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720

atggaacaaa tggaggtgca ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaggt gctggacacc 780

cccgccaatg gccattacca gatgtacgcg ggcggtacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840

gcaccggatg ccatcgacac cctgctgctg caaccgtggc agctggtgaa aagcaaaaaa 900

gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttg ccattcccgt cgggctggca 960

ggcacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaagccat tcccgattcg 1020

ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg actcccacac ctggttacac 1080

ggtaaaaaat tcggtctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgcttcctg 1140

ctggaactgg gctgtgaacc tgccgtcatc ctctgccata acggtaacaa acgctggcaa 1200

aaagcgatga agaaaatgct cgatgcttca ccgtacggcc aggagagcga agtgtttatc 1260

aactgcgact tgtggcattt ccgctcgctg atgttcaccc gccagccgga ttttatgatt 1320

ggcaactcgt acgccaagtt tattcagcgc gacaccttag ccaagggcga acagtttgaa 1380

gtcccgctga tccgcctcgg ttttccgctg ttcgaccgtc accatctgca ccgccagacc 1440

acctggggct acgagggcgc gatgagcatt ctcacgacgc tggtgaatgc ggtactggag 1500

aaagtggaca aagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 1560

taa 1563

<210> 141

<211> 1386

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifK2

<400> 141

atggctgata ttgttcgtag taaaaaaccg ctggcggtga gcccgataaa aagcggccag 60

ccgctggggg cgatcctggc aagcctgggt ttcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120

gctcaggggt gcagcgcgtt cgcgaaagtg ttctttattc aacattttca cgacccgatc 180

ccgctgcaat cgacggcgat ggacccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240

tttaccgcgc tcaatgttct ctgccagcgc aacgccgcga aagccatcgt gctgctcagc 300

accgggctgt cagaagccca gggcagcgat atttcacgag tggtgcgcca gtttcgtgat 360

gactttccgc ggcataaaaa cgtggcgctg ctcaccgtca acaccccgga tttctacggc 420

tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtgcccgcg 480

cagcccgccg ccagcctgcg caaccgtcgc gtcaacctgc tggtcagcca tttactgacg 540

ccgggcgata tcgaactgtt acgcagttat gtggaagcat tcggtctgca accggtgatt 600

gtgccggatc tatcgcagtc gctggacgga catctggcca acggtgattt ttcgcccgtc 660

acccaggggg gaacaccgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccactttt 720

gtgattggcc actcgctggg gcgggcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag 780

gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gatgcgtgcg acacctttat ccatcgcctg 840

aaaaccctct ccgggcgcga cgtgcccgcg tggattgagc gccagcgcgg gcaagtgcag 900

gatgcgatga tcgattgcca tatgtggttg cagggcgcgg ctatcgccat ggccgcagaa 960

ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020

gttgtcgcgc cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaat ggtggtcatc 1080

ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140

aattctcatg ccgccgatct cgccacgcag tttgatatgt cgcttatccg cgccgggttt 1200

ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cggctgcgcc aggggtatag cggcattcgt 1260

gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgaacgcc attgcccgct tgcaacctac 1320

cgctcgccgc tgcgtcagcg cttcggcgac aacgttacgc caggagatcg gtatgccgca 1380

tgttaa 1386

<210> 142

<211> 1488

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifL

<400> 142

atgaccctga atatgatgat ggatgccagc gcgcccgagg ccatcgccgg tgcgctttcg 60

caacaacatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cccccgtcgc tatttcacta 120

accgatgccg aggcacgtat tgtctatgcc aacccggcat tctgccgcca gaccggctat 180

gagcttgagg agttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg ccagtcagca gaccccacgg 240

gaaatctacc aggatatgtg gcacaccctg ttacaacgtc gaccatggcg cgggcaattg 300

atcaaccgcc accgtgacgg cagccttttt ctggttgaga tcgatatcac cccggtgatt 360

aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gccatgcagc gcgatatcag cgccggttat 420

gcgctggagc agcggttgcg taatcacatg gcgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480

ccggcggcgg tggtcgtggt cgatgaacgc gatcgtgtgg ttatggataa cctcgcctat 540

aaaactttct gtgctgattg cggcggaaaa gagctactga gcgaactcca tttttcagcc 600

cgtaaagcgg agctggcaaa cggccaggtc ttaccggtgg tgctgcgcgg cgcggtgcgc 660

tggttgtcgg tcacctgctg ggcgctgcca ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720

attgataata ccttgacgcg cacgctggtg gtcatcaccg acgacaccca gcagcgccag 780

cagcaagagc aaggacggct tgaccgcctt aaacagcaga tgaccagcgg caaactgctg 840

gcggcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900

ctggcggcgg cgcggcgttt aaacggcagt gataacagca acgtagcgct ggacgccgcg 960

tggcgcgaag gtgaagaagc gatggcgcgg ctgaaacggt gccgcccgtc gctggagctg 1020

gaaagtgccg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg acttgcgcgc gctttatcac 1080

acccgctacg agcagggtaa aaatttgcag gtcacgctgg attcgacgca tctggtggga 1140

tttggtcagc gaacccaact gctggcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200

attgccgtcg ggctgcgtga tttcaccgcc caaacgcaga tttacgcccg ggaagaagcg 1260

ggctggctct cgttgtatat cactgacaat gtgccgttga ttccgctgcg ccatacccat 1320

tcgccggatg cgcttaacgc accgggaaaa ggtatggagt tgcggctgat ccagacgctg 1380

gtagcgcatc acaacggcgc gatagaactc acttcacgcc ccgaaggggg aagctgcctg 1440

accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488

<210> 143

<211> 1575

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> nifA

<400> 143

atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttatc ccagcagttc 60

accgcgatgc agcggataag cgtggttctc agccgggcga ccgaggttga acagacactc 120

cagcaggtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gcctttttgc agcacggcat gatctgtctg 180

tacgacagcc agcaggcgat tttgactatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagttg 240

atccccggca gctcgcaaat tcgctaccgt ccgggtgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300

tcgcaggggc aatcgttagt gctggcgcgt gtggctgacg atcagcgctt tcttgaccgc 360

ctgggactgt atgattacaa cctgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccggatgcg 420

cagacttttg gcgtgctgac ggcgcaaccg atggcgcgtt acgaagagcg gttacccgcc 480

tgcacccgct ttctggaaac ggtcgcgaat ctggtggcgc agaccgtgcg tttgatgacg 540

ccgccggctg cacgcccttc cccacgcgct gccatcacgc caaccgccag cccgaaatcg 600

tgcagtactt cacgcgcgtt cggcttcgaa aatatggtcg gcaacagccc ggcaatgcgc 660

cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggata ccaccgttct ggtgcgcggc 720

gagagcggca ccggcaagga actgattgcc aacgccatcc atcacaattc gccgcgcgcc 780

agtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacattgct tgaaagcgaa 840

ttatttggtc atgaaaaagg cgcctttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900

gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgaaattg gggaaagcag cgcctcgttt 960

caggctaagc tgctgcgtat tttgcaggag ggcgaaatgg aacgcgtcgg tggtgacgag 1020

acattgcaag tgaatgtgcg catcattgcc gcgacgaacc gcaaccttga agatgaagta 1080

cgcctgggac attttcgcga agatctctat taccgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140

ccgccgctgc gcgaacgcca ggacgacatc gccgaactgg cacattttct ggtgcgtaaa 1200

atcgcccaca accagaaccg cacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260

agctacagct ggcccggcaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctctgcggtg 1320

atgtcggaaa acggtctgat cgatcgggac gtgattttat ttaatcatcg cgaccagcca 1380

gccaaaccgc cggttatcag cgtcacgccc gacgataact ggctcgataa cacccttgac 1440

gagcgccagc ggctgattgc cgcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcc 1500

cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgta ttcagaccat ggatatcacc 1560

ctgccaaggc tataa 1575

<210> 144

<211> 2850

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> glnE

<400> 144

atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg ttttttctcg tctgccggaa 60

gcgctcaccg cgcaaccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120

gttcaggaca gcatcatcgt gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcaccgccg 180

ccagcgaacg agtggcaaca ctacgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga gggcgtcacc 240

gatgaaacct cgctgatgcg cacgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcattat ggtgcgcatc 300

gcctggagtc aggcgctaca gttggtggcg gaagaggata tcctgcaaca gctcagcgtg 360

ctggcggaaa ctctgatcgt cgccgcgcgc gactggctct atgacgcctg ctgccgtgag 420

tggggaacgc cgtgcaatcc gcaaggcgtc gcgcagccga tgctggtgct cggcatgggc 480

aaacttggcg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt tgcctggccg 540

gaaaatggca ccacgcgcgg cggacgccgt gaactggata acgcgcagtt ttttacccgc 600

cttggtcaac ggctaattaa agtcctcgac cagcccacgc aggatggctt tgtctaccgc 660

gtcgatatgc gcttgcgtcc ctttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ttttgccgcg 720

ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gactgggaac gatacgcgat ggtgaaagcg 780

cgcattatgg gggacaacga cggcgaccat gcgcgagagt tgcgcgccat gctgcgcccg 840

ttcgttttcc gccgctatat cgacttcagc gtgatccagt ctctgcgcaa catgaaaggc 900

atgattgccc gcgaagtgcg gcgtcgcggc ctgaaggaca acataaaact cggcgcgggc 960

ggtattcgcg aaatagagtt tatcgtgcag gttttccagt tgattcgcgg cggtcgcgag 1020

cctgcgctgc aatcgcgttc gctgttgccg acgcttgctg ccattgatca actacatctg 1080

ctgccggatg gtgatgcacc ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggaa 1140

aacttgctgc aaagcattaa tgacgaacag acacagacgc tgccggccga tgatttgaat 1200

cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gagagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260

gaagcgcata tgtcggcggt gcggcagatt ttcaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 1320

gattcgccgg aagatgcgct ttctgagggc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 1380

gaagaggact ctacgcccgt gctggcgcat ctttccgagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440

gcgctgattg ctgattttcg caaagagctg gataaacgca ccattggccc gcgcgggcga 1500

caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg tgacgatgcg 1560

ccagtgccgc tgtcgcgtct gacgccgctg ctcaccggta ttattacgcg caccacttac 1620

cttgagctgc tgagtgaatt ccccggtgcg ctgaaacacc tcatttccct gtgcgccgcg 1680

tcgccgatgg tggccagcca actggcgcgc tacccgatcc tgctcgatga actgctcgac 1740

ccgaacacgc tctatcaacc gacggcgatg aacgcctatc gcgatgaact gcgacaatac 1800

ctgttgcgcg tgccggaaga ggatgaagag cagcaactgg aggcgctacg gcagtttaag 1860

caggcgcagt tgttgcgcgt agcggcggcg gatatcgccg gtacgttacc cgtcatgaaa 1920

gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattatcg atgcggtggt gcagcaagcc 1980

tggaaccaga tggtggcgcg ttacggccag ccgacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040

ggtttcgccg tggtcggtta cggcaaactt ggcggctggg aattaggtta cagctccgat 2100

ctggatctgg tgttcctgca cgactgcccc atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160

atcgatggcc gccagttcta tttgcgcctc gcgcagcgcg tgatgcacct gttcagcacg 2220

cgcacgtcgt ccggcattct ttatgaagtc gatgcgcgtt tgcgcccgtc cggcgcggcc 2280

ggaatgctgg tgaccactgc ggaagcgttc gccgattatc aaaaaaatga agcctggaca 2340

tgggagcatc aggcgctggc gcgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400

gaatttgacg ccattcgccg cgatatcctg atgacctccc gcgatgccgc taccctgcaa 2460

accgaagtgc gggaaatgcg tgagaaaatg cgcgcccatc ttggtaacaa gcacaaagac 2520

cgtttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgata ttgagtttat cgctcagtat 2580

ctggtgctgc gctttgccca tgagaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640

atcctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggatgagc aggaagcgca ggcattgacg 2700

ctggcgtaca ccacgttgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gctgccagga 2760

catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta tcaaaaccag ctgggacaag 2820

tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850

<210> 145

<211> 1287

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> amtB

<400> 145

atgaaaaaca caacattaaa aacggctctt gcttcgctgg cgttgctgcc aggcctggcg 60

atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120

ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180

aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgctctggt gtgcatcctg 240

tgggtggttt acggctactc tctggcattt ggcgagggca acagcttctt cggcagtttc 300

aactgggcga tgttgaaaaa catcgaattg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtac 360

atccacgtgg cgttccaggg ctcctttgct tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgcg 420

ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480

tcttatgtgc cgattgcgca catggtctgg ggtggcggtc tgctggcaac ccacggcgcg 540

ctggatttcg cgggcggtac ggttgttcac atcaacgccg cgatcgcagg tctggtgggg 600

gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cgttcaaacc gcataacctg 660

ccgatggtct tcaccggcac cgcgatcctc tatgttggct ggtttggctt caacgccggc 720

tctgcaagct cggcgaacga aatcgctgcg ctggctttcg tgaacacggt tgttgccact 780

gcggccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gagtgggcaa tgcgcggtaa gccgtctctg 840

ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcaccccggc gtgcggttat 900

gtgggtgtcg gcggcgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggcagg gctgtggggc 960

gttactgcac tgaaacgtat gttgcgtgtt gatgacccat gcgatgtctt cggtgtgcac 1020

ggcgtgtgcg gcatcgtggg ttgtatcctg accggtatct tcgcgtctac gtcgctgggc 1080

ggtgtcggtt tcgctgaagg ggtgaccatg ggccatcagg tactggtaca gctggaaagc 1140

gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta tcggttacaa actggcggat 1200

atgacggtag gcctgcgcgt accggaagag caagagcgtg aagggctgga tgtgaacagc 1260

cacggcgaaa atgcgtataa cgcctga 1287

<210> 146

<211> 500

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> PinfC

<400> 146

ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60

caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat cactgattcg caggctgaat 120

acgttaacga attgacccgt aaactgcaaa atgcgggcat tcgtgtaaaa gcagacttga 180

gaaacgagaa gattggcttt aaaatccgcg agcacacttt acgtcgtgtc ccttatatgc 240

tggtttgtgg tgacaaagag gtcgaagccg gcaaagttgc tgtgcgtacc cgtcgcggta 300

aagacctggg tagcctggac gtaaatgatg ttatcgagaa gctgcaacaa gagattcgca 360

gccgcagtct tcaacaactg gaggaataag gtattaaagg cggaaaacga gttcaaacgg 420

cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga agttcgctta acaggtctgg 480

aaggcgagca gcttggtatt 500

<210> 147

<211> 348

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> Prm1

<400> 147

cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60

ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120

gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180

ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240

aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300

aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348

<210> 148

<211> 339

<212> DNA

<213> Kosakonia pseudosacchari

<220>

<223> Prm7

<400> 148

cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60

ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc 120

gggttttttt atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt 180

ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca 240

attttctgcc caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca 300

gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga ccggtcgat 339

<210> 149

<211> 1538

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (62)..(62)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (265)..(265)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (457)..(457)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (469)..(469)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (539)..(539)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (551)..(552)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (559)..(559)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (561)..(561)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (576)..(576)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (587)..(587)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (591)..(591)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (655)..(657)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (665)..(665)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (678)..(678)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (706)..(706)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (710)..(710)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (714)..(714)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (718)..(718)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (735)..(735)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (755)..(755)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (759)..(759)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (796)..(796)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1006)..(1007)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1016)..(1017)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1133)..(1133)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 149

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gngcggaagc acaggagagc ttgctctctg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt 120

ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac 180

gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga 240

ttagctagta ggtggggtaa cggcncacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga 300

tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga 360

atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg 420

ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gtgttgnggt taataaccnc agcaattgac 480

gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggnt 540

gcaagcgtta nncggaatna ntgggcgtaa agcgtncgca ggcggtntgt naagtcggat 600

gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtnnngta 660

gaggngggta gaattccngg tgtagcggtg aaatgcgtag agatcnggan gaanaccngt 720

ggcgaaggcg gcccnctgga caaagactga cgctnaggng cgaaagcgtg gggagcaaac 780

aggattagat accctngtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt 840

gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg 900

ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg 960

atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttnncag agatgnnttg 1020

gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat 1080

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtncggccgg 1140

gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc 1200

atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag agaagcgacc 1260

tcgcgagagc aagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg 1320

actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc 1380

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc 1440

ttaaccttcg ggagggcgct taccactttg tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1500

ggtaaccgta ggggaacctg cggttggatc acctcctt 1538

<210> 150

<211> 882

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifH

<400> 150

atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60

caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120

ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180

atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240

tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300

cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360

gatttcgtct tttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420

cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480

gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540

ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600

gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660

gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720

taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780

accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840

agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882

<210> 151

<211> 1449

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifD1

<400> 151

atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60

ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120

agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180

ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240

atttcccacg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300

accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360

cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420

ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480

gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540

gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600

gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660

gacgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcgtc gcgcattttg 720

ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780

atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840

atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900

ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960

gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020

taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080

catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140

gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200

gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260

ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320

cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380

gatatggata tgacgatcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440

tccgcctga 1449

<210> 152

<211> 1092

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifD2

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (709)..(709)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 152

atgggacgcg gcgagcgccg cctgttccat gccgtgcgcc acatcgtcaa ccgctaccac 60

ccggccgccg tctttatcta taacacctgc gttcccgcga tggagggcga cgatatcgaa 120

gccgtctgcc aggcggcaga aaccgccatc ggcgtaccgg tgattgccgt tgatgtcgcc 180

gggttttacg gcagcaaaaa tctcggcaac cggttggccg gtgaagtgat ggtgaaaaag 240

gtgattggcg ggcgtgaacc cgcgccgtgg ccggaagata ccccttttgc cccggcgcac 300

cgccacgata tcgggctgat tggcgaattc aatattgccg gagagttctg gcatattcag 360

ccgctgctcg atgagctggg tattcgcgtg ctcggcagcc tctccggcga cgggcgcttc 420

agtgaaatcc agacgctgca ccgggcgcag gtcaatatgc tggtctgctc cagggcgctg 480

atcaacgtcg cccgctcgct ggagcagcgc tacggcacgc cgtggtttga aggcagtttt 540

tatggtgttc gcgccacctc tgacgccctg cgccaactgg cggcgctgac cggagaccgc 600

gatctgatgc agcgcaccga acagctcatt gcccgcgaag agcagcaaac agagcaggcg 660

ctggccccgc tgcgcgagcg cctgcgcggg cgcaaagcgc tgctctatnc cggcggcgtg 720

aaatcctggt cggtggtttc ggcgcttcag gatctgggca tggaagtggt ggcgaccggc 780

acgcgcaaat ccaccgaaga ggataaacag cgcatccgcg aactgatggg cgccgacgcg 840

ctgatgcttg atgaaggtaa cgcccgctcg ctgctggacg tggtttaccg ctacaaggcg 900

gacatgatga tcgccggggg acgcaatatg tacaccgcct acaaagcgcg gctgccgttc 960

ctcgatatca atcaggagcg cgagcacgcc tttgccggct accgcggcat tgtcaccctg 1020

gccgaacagc tctgcctgac catggaaagc ccggtctggc cgcaaaccca ttcccgcgca 1080

ccgtggcaat aa 1092

<210> 153

<211> 846

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifK

<400> 153

atgatggagc aaatggacgt gccgtgcagc ctgctttccg atccctccga agtgctggat 60

accccggctg acgggcatta ccacatgtat gcgggcggta cgacccagca ggagatgcgc 120

gaagcgcctg acgctatcga caccctgctg ctgcaaccct ggcaactggt gaaaaccaaa 180

aaagtggtgc aggaaagctg gaaccagccc gctaccgagg tgcaaatccc aatggggctg 240

gccggaaccg acgagctgct gatgacggta agccagttaa ccggcaaagc cattccggat 300

agcttagcgc tggaacgcgg tcggctggtg gatatgatgc tcgactccca cacctggctg 360

cacggcaaga aattcggcct gttcggtgac ccggattttg tcatggggct gacccgcttc 420

ctgctggaac tgggctgcga accgacggtg attctgtgcc ataacggcag caagcgctgg 480

cagaaagcga tgaagaaaat gcttgaagcc tcgccgtacg ggaaagagag cgaagtcttt 540

atcaactgcg atttgtggca tttccgctcg ctgatgttta cccgtcagcc ggactttatg 600

atcggcaact cctacgccaa gtttatccag cgcgatacgc tggcgaaggg tgagcagttt 660

gaagtgccgc tgatccgcct ggggttcccg ctgttcgatc gccaccatct gcaccgccag 720

accacctggg gttacgaagg ggccatgagt atcctcacca cgctggttaa tgcggtgctg 780

gagaaagtcg acagagagac catcaagctc ggcaaaaccg actacagctt cgatcttatc 840

cgttaa 846

<210> 154

<211> 1095

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifL

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (942)..(942)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 154

atgcagcgcg acatcagcac cagctacgcg ctggaacaac ggctgcgcaa tcatatgacg 60

ctgaccgaag ccgtcttgaa taacattccg gcggcggttg tagtggtgga tgaacgcgat 120

cgggtggtga tggataacct cgcctacaaa accttttgcg ccgattgcgg cggtaaagaa 180

ctactcaccg aaatcaactt ttccgcccat aaggcggagc tggcgcaggg cctggtactg 240

ccggtagtgc tgcgcggcac cgtgcgctgg ttgtccgtta cctgttgggc gctgccgggc 300

gtcagcgaag aagcaggccg ctactttatt gatagcgccg tgccgcgcac gctggtggtg 360

atcaccgata atactcagca gcagcaacaa caggagcagg ggcgtcttga tcgtctgaag 420

cagcagataa ccagcggtaa attgctggcg gcgatccgcg aatcgctgga cgccgcgctg 480

gtacaactca attgcccaat taatatgctg gccgccgcac gccgcttaaa tggcgacgag 540

catagcaatc tggcgctgga tgccgcatgg cgtgaaggcg aagaagcgat ggcgcggttg 600

cagcgctgcc gcccgtcgct ggaactggaa agcccggcag tctggccgct ccagccgttc 660

cttgacgatc tgcgtgccct gtatcacacc cgatataacc agggcgaaaa cctgcaaatt 720

gagctggaat cccccgacct ggtgggcttt ggccagcgaa cacaactgct tgcctgcctg 780

agcctgtggc tcgacagaac cctggatatt gccgcggagc tacgtgattt cacggtacag 840

actcaacttt acgcccgcga agagagcggc tggctgtcgt tctatttaaa cgacaatgtg 900

ccgctgattc aggtgcgcta cacccattca cccgatgcac tnaatgcgcc cggtaaaggc 960

atggagctgc ggctgatcca gacgctggtc gcccaccatc gaggcgcaat agaactgacc 1020

tcacgccctc agggaggcac ctgtctgatc ctgcgtttcc cattatttta ctcgctgaca 1080

ggaggctcac tatga 1095

<210> 155

<211> 219

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifA部分基因

<400> 155

atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60

acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120

caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtccg 180

tacgcgcggg tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttga 219

<210> 156

<211> 1635

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> glnE

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (234)..(234)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (274)..(274)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (1535)..(1535)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 156

atgcgcgtgg aagactggtc aacgctgacc gaacggctcg atgcccatat ggcaggcgtg 60

cgccgaatct ttaacgaact gatcggtgat gacgaaagtg agtcgcagga cgatgcgctc 120

tccgagcact ggcgcgagct gtggcaggac gcgcttcagg aagatgacac cacgccggtg 180

ctgacgcact taaccgacga cgcgcgccat cgcgtggtgg cgctgatcgc tganttccgt 240

cttgagctga acaaacgcgc catcggcccg cgtngtcgcc aggtgctgga tcacctgatg 300

ccgcacctgc tgagcgaagt ctgctcgcgt gccgatgcgc cggtgccgct gtcgcggatg 360

atgcccctgc tgagcgggat tatcacccgt actacctacc ttgaactcct gagcgagttc 420

cctggcgcgc ttaagcacct gatttcactc tgcgccgcgt cgccgatggt ggccaacaag 480

ctggcgcgtt acccgctgct gctggatgag ctgctcgatc cgaataccct ttatcaaccg 540

acggcgaccg acgcctaccg ggacgaactg cgtcagtatc tgctgcgcgt gccggaagaa 600

gacgaagagc aacagctgga ggcgctgcgt cagtttaagc aggcccagat gctgcgcgtg 660

gcggccgcag atattgccgg aacgctgccg gtgatgaaag tgagcgatca cttaacctgg 720

cttgcggaag cgattatcga cgcggtggtg catcaggcct gggtgcagat ggtggcgcgc 780

tatggccagc cgaaacatct ggctgaccgt gatggtcgcg gcttcgcggt ggtgggttac 840

ggtaagctcg gcggttggga gctgggctat agctccgatc tggatttaat cttcctccac 900

gactgcccgg ttgatgtgat gaccgacggc gagcgcgaga ttgacgggcg tcagttctac 960

ctgcgcctgg cgcagcgcat catgcacctg ttcagcaccc gcacctcgtc gggcattttg 1020

tatgaagtgg atgcccgtct gcgcccgtcc ggcgcggcgg gcatgctggt cacctcgacg 1080

gagtccttcg ctgattacca gaagaatgaa gcctggacgt gggagcatca ggcgctggtg 1140

cgcgcccgtg tggtgtatgg cgatccgctg ctgaaaacgc agtttgacgt gattcgtaag 1200

gaagtcatga ccaccgtgcg cgatggcagc acgctgcaaa cggaagtgcg cgaaatgcgc 1260

gagaaaatgc gcgcgcactt aggcaataaa catcgcgatc gctttgatat taaagccgat 1320

gagggcggta ttaccgatat tgagtttatt acccagtatc tggtgttgct gcacgcgcat 1380

gacaagccga agctgacgcg ctggtcggat aacgtgcgca ttctggaact gctggcgcaa 1440

aacgacatta tggacgagca ggaggcgcag gccttaaccc gtgcctatac aacgcttcgc 1500

gatgagctcc atcatctggc gttgcaggag cagcngggac acgtggcgct ggactgtttc 1560

accgctgaac gcgctcaggt aacggccagc tggcagaagt ggctggtgga accgtgcgta 1620

acaaatcaag tgtga 1635

<210> 157

<211> 1316

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (43)..(43)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (247)..(247)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (784)..(785)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (794)..(795)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 157

agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaacg gcncacctag gcgacgatcc 60

ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac 120

gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt 180

gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta ctttcagcgg ggaggaaggt gttgtggtta 240

ataaccncag caattgacgt tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc 300

cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg 360

cggtctgtca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg 420

gcaggctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag 480

atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg 540

aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga 600

cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg 660

gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg 720

agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa 780

cttnncagag atgnnttggt gccttcggga actctgagac aggtgctgca tggctgtcgt 840

cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt 900

tgccagcggt ccggccggga actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg 960

ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc 1020

atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg 1080

attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg 1140

ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt 1200

gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact 1260

ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1316

<210> 158

<211> 882

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifH

<400> 158

atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60

caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120

ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180

atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240

tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300

cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360

gatttcgtct tttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420

cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480

gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540

ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600

gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660

gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720

taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780

accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840

agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882

<210> 159

<211> 1449

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifD1

<400> 159

atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60

ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120

agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180

ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240

atttcccacg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300

accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360

cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420

ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480

gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540

gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600

gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660

gacgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcgtc gcgcattttg 720

ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780

atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840

atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900

ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960

gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020

taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080

catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140

gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200

gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260

ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320

cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380

gatatggata tgacgatcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440

tccgcctga 1449

<210> 160

<211> 1374

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifD2

<400> 160

atgaagggga acgagatcct ggctttgctc gatgaacctg cctgcgagca caaccataaa 60

cagaaatccg gctgcagcgc gccgaaaccc ggcgcgacag cgggcggctg cgcctttgac 120

ggtgcgcaga tcaccctgct gccactctcc gatgttgccc acctggtaca cggccccatt 180

ggttgtaccg gtagctcatg ggataaccgt ggcagcttca gttccggccc gacgatcaac 240

cggctgggtt ttaccaccga tctgagcgaa caggatgtga tcatgggacg cggcgagcgc 300

cgcctgttcc atgccgtgcg ccacatcgtc aaccgctacc acccggccgc cgtctttatc 360

tataacacct gcgttcccgc gatggagggc gacgatatcg aagccgtctg ccaggcggca 420

gaaaccgcca tcggcgtacc ggtgattgcc gttgatgtcg ccgggtttta cggcagcaaa 480

aatctcggca accggttggc cggtgaagtg atggtgaaaa aggtgattgg cgggcgtgaa 540

cccgcgccgt ggccggaaga tacccctttt gccccggcgc accgccacga tatcgggctg 600

attggcgaat tcaatattgc cggagagttc tggcatattc agccgctgct cgatgagctg 660

ggtattcgcg tgctcggcag cctctccggc gacgggcgct tcagtgaaat ccagacgctg 720

caccgggcgc aggtcaatat gctggtctgc tccagggcgc tgatcaacgt cgcccgctcg 780

ctggagcagc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagtt tttatggtgt tcgcgccacc 840

tctgacgccc tgcgccaact ggcggcgctg accggagacc gcgatctgat gcagcgcacc 900

gaacagctca ttgcccgcga agagcagcaa acagagcagg cgctggcccc gctgcgcgag 960

cgcctgcgcg ggcgcaaagc gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020

tcggcgcttc aggatctggg catggaagtg gtggcgaccg gcacgcgcaa atccaccgaa 1080

gaggataaac agcgcatccg cgaactgatg ggcgccgacg cgctgatgct tgatgaaggt 1140

aacgcccgct cgctgctgga cgtggtttac cgctacaagg cggacatgat gatcgccggg 1200

ggacgcaata tgtacaccgc ctacaaagcg cggctgccgt tcctcgatat caatcaggag 1260

cgcgagcacg cctttgccgg ctaccgcggc attgtcaccc tggccgaaca gctctgcctg 1320

accatggaaa gcccggtctg gccgcaaacc cattcccgcg caccgtggca ataa 1374

<210> 161

<211> 1563

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifK1

<400> 161

atgagccaaa gtgctgagaa aattcaaaac tgtcatccgc tgtttgaaca ggatgcgtac 60

cagatgctgt ttaaagataa acggcaactg gaagaggccc acgatccggc gcgcgtgcag 120

gaggtctttc aatggaccac caccgccgag tatgaagcgc ttaactttca acgcgaagcg 180

ctgactatcg atccggccaa agcctgccag ccgctgggtg cggtactgtg ctcgctgggc 240

tttgccaata ccctgcccta tgttcacggc tcccaggggt gcgtggccta tttccgcacc 300

tattttaacc gtcactttaa agagccgatt gcctgtgttt ctgactcgat gacggaagat 360

gcggcagtat tcggcggcaa caacaacctg aacaccgggt tgcagaacgc cagcgccctc 420

tacaagccgg aaatcattgc cgtctccacc acctgtatgg cggaggtcat cggcgacgac 480

ctgcaggcgt ttattgctaa cgccaaaaaa gacggcttta tcgacgcggc gatcccggtg 540

ccttacgcgc acacgccaag ctttatcggc agccatatca ccggctggga caatatgttt 600

gagggcttcg cccgtacctt taccgccgat tacagcggac aaccgggcaa attaccgcgt 660

atcaatctgg tcagcggatt tgaaacctat ctcggtaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720

atggagcaaa tggacgtgcc gtgcagcctg ctttccgatc cctccgaagt gctggatacc 780

ccggctgacg ggcattacca catgtatgcg ggcggtacga cccagcagga gatgcgcgaa 840

gcgcctgacg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc aactggtgaa aaccaaaaaa 900

gtggtgcagg aaagctggaa ccagcccgct accgaggtgc aaatcccaat ggggctggcc 960

ggaaccgacg agctgctgat gacggtaagc cagttaaccg gcaaagccat tccggatagc 1020

ttagcgctgg aacgcggtcg gctggtggat atgatgctcg actcccacac ctggctgcac 1080

ggcaagaaat tcggcctgtt cggtgacccg gattttgtca tggggctgac ccgcttcctg 1140

ctggaactgg gctgcgaacc gacggtgatt ctgtgccata acggcagcaa gcgctggcag 1200

aaagcgatga agaaaatgct tgaagcctcg ccgtacggga aagagagcga agtctttatc 1260

aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320

ggcaactcct acgccaagtt tatccagcgc gatacgctgg cgaagggtga gcagtttgaa 1380

gtgccgctga tccgcctggg gttcccgctg ttcgatcgcc accatctgca ccgccagacc 1440

acctggggtt acgaaggggc catgagtatc ctcaccacgc tggttaatgc ggtgctggag 1500

aaagtcgaca gagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 1560

taa 1563

<210> 162

<211> 1386

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifK2

<400> 162

atggcagaaa ttatccgtag taaaaagccg ctggccgtca gcccggtaaa aagtggccag 60

ccgctgggcg cgattctggc gagcatgggc tttgaacaga gcattccgct ggttcatggc 120

gctcaggggt gcagcgcctt cgcgaaggtc ttttttatcc agcattttca cgatccgatc 180

ccgctgcaat cgacggcaat ggacccgaca tcgaccatta tgggtgccga tgagaacatc 240

tttaccgcgc tgaatgtgct gtgttcacgc aacaacccga aagcgattgt tctgctgagc 300

actggccttt ccgaggcgca gggcagcgat atttcgcgcg tggtgcgcca gttccgcgat 360

gaatatccgc gccataaagg ggtggcgctg ctgaccgtca acacgccgga tttttacggc 420

agcctggaaa acggctacag cgcggtgctg gagagcatgg ttgaacagtg ggtgccggaa 480

aaaccgcagc cgggcgtgcg caatcgccgc gtgaacctgc tgctcagcca tttgcttacg 540

ccgggcgaca ttgagctgct gcgaagttat gtcgaggcat ttggcctgca gccggtgatg 600

gtgccggatc tttcccagtc gctggatggc catctcgcca gcggggattt ctcgccaatt 660

acccagggcg gcagcagcct gcggctgatt gaacagatgg gacagagtct tggcacgttc 720

gccattggcg tatccctctc ccgcgccgcg caattgctgg cgcagcgcag ccatgcggaa 780

gtggtcaccc tgccgcatct gatgaccatg agccagtgcg atacgtttat tcatcaactg 840

aagcgcctct ccgggcgcga tgttccggcg tggatcgaac gccagcgcgg gcaactgcag 900

gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg cagggcgcgc ctgtcgcgct ggccgccgag 960

ggcgatctgc tcgccgcctg gtgcgatttc gcctgcgata tgggcatggt gcccggcccg 1020

gtggtggcgc cggtgagcca gaaagggttg caggatctgc cggtcgaaaa agtcattatc 1080

ggcgatctgg aggatatgca ggatctgttg tgtgaaacgc ctgcatcgct gctcgtctct 1140

aattctcacg ccgctgattt ggccgggcag ttcgacattc cgctggtgcg cgccggtttc 1200

cccctgttcg accgtctggg cgagtttcgc cgcgtgcgcc agggttacgc cgggatgcgc 1260

gacaccttgt ttgagctggc gaatgcgctg cgcgatcgcc atcatcatct tgccgcttat 1320

cactcgccgc tgcgccagcg tttttacgaa cccgcatctt cgggaggtga ctatgcaaca 1380

tgttaa 1386

<210> 163

<211> 1488

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifL

<400> 163

atgaccctga atatgatgat ggacgccacc gcgcccgccg agatcgccgg agcgctctca 60

caacagcatc ccgggttgtt tttcaccatg gttgaacagg cgcccgtcgc gatttcactg 120

accgatgccg atgcccacat tctctacgcc aaccccgcgt tttgtcgcca gtcggggtat 180

gaactggaag agttgttgca gcaaaacccg cgcctgcttg ccagtaagca gacgccgcgt 240

gaaatctacc aggaaatgtg gcacaccctg ctgcaacacc gtccgtggcg cggacaactg 300

atcaaccgtc gccgcgacgg cagcctgttt ctggtggaaa tcgacatcac cccactgttt 360

gatgcgttcg gcaaactcga acattacctg gccatgcagc gcgacatcag caccagctac 420

gcgctggaac aacggctgcg caatcatatg acgctgaccg aagccgtctt gaataacatt 480

ccggcggcgg ttgtagtggt ggatgaacgc gatcgggtgg tgatggataa cctcgcctac 540

aaaacctttt gcgccgattg cggcggtaaa gaactactca ccgaaatcaa cttttccgcc 600

cataaggcgg agctggcgca gggcctggta ctgccggtag tgctgcgcgg caccgtgcgc 660

tggttgtccg ttacctgttg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagcagg ccgctacttt 720

attgatagcg ccgtgccgcg cacgctggtg gtgatcaccg ataatactca gcagcagcaa 780

caacaggagc aggggcgtct tgatcgtctg aagcagcaga taaccagcgg taaattgctg 840

gcggcgatcc gcgaatcgct ggacgccgcg ctggtacaac tcaattgccc aattaatatg 900

ctggccgccg cacgccgctt aaatggcgac gagcatagca atctggcgct ggatgccgca 960

tggcgtgaag gcgaagaagc gatggcgcgg ttgcagcgct gccgcccgtc gctggaactg 1020

gaaagcccgg cagtctggcc gctccagccg ttccttgacg atctgcgtgc cctgtatcac 1080

acccgatata accagggcga aaacctgcaa attgagctgg aatcccccga cctggtgggc 1140

tttggccagc gaacacaact gcttgcctgc ctgagcctgt ggctcgacag aaccctggat 1200

attgccgcgg agctacgtga tttcacggta cagactcaac tttacgcccg cgaagagagc 1260

ggctggctgt cgttctattt aaacgacaat gtgccgctga ttcaggtgcg ctacacccat 1320

tcacccgatg cactcaatgc gcccggtaaa ggcatggagc tgcggctgat ccagacgctg 1380

gtcgcccacc atcgaggcgc aatagaactg acctcacgcc ctcagggagg cacctgtctg 1440

atcctgcgtt tcccattatt ttactcgctg acaggaggct cactatga 1488

<210> 164

<211> 1575

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> nifA

<400> 164

atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60

acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120

caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtctg 180

tacgacagta agcaagcgat cctttccatt gaagccttgc atgaggccga tcagcagtta 240

attcccggca gttcacagat tcgctaccgt ccgggcgaag ggctggtagg cacggtgctt 300

tcacagggac agtcgctggt actgccctgt gtctccgacg atcggcgttt tctcgatcgc 360

ctgggattgt atgattacag cttgccgttt atcgccgtgc cgctgatggg gccaaactcg 420

cagcctatcg gcgtgctggc cgcccagcct atggcgcgtt acgaggagcg gctgcccgcc 480

tgcacgcgtt ttcttgaaac cgtcgccaat ctggtggcgc aaaccgttcg cctgatgaca 540

ccgcccagcg tcgcgtctcc accccgtgct gctgccgcgc agattgccag ccagcgcggg 600

tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttgaa aacatggtcg gtaaaagcgc ggctatgcgt 660

cagacgctgg aaattattcg ccaggtatca cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgtggc 720

gaaagcggaa ccggtaaaga gttgatagcc aacgctatcc accacaattc accgcgcgcc 780

gccgcgccgt ttgtcaaatt caactgcgcg gcgctgcccg atacgctgct ggagagtgaa 840

ctcttcggtc atgaaaaagg cgcgtttacc ggcgcggtgc gccagcgcaa aggccgtttc 900

gaactggcgg atggcggtac gctgtttctt gatgagatcg gcgaaagtag cgcctcgttt 960

caggcgaaat tgctgcgtat cttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgaa 1020

acgctgcggg tgaatgtacg gatcattgcc gccaccaacc gcaatctgga agaggaagtg 1080

cggctgggta attttcgcga agatctctac tatcgcctta atgtgatgcc gatctccctg 1140

cccccgctcc gcgagcgtca ggaggacatc gtcgagctgg cgcattttct ggtgcgcaaa 1200

atcgcgcaaa accagaaccg cacgctgcgc atcagcgatg gcgcgatccg tttgttgatg 1260

agctatagct ggcctggaaa cgtgcgtgag ctggaaaact gccttgagcg atcggcggtg 1320

atgtcggaaa acgggctgat cgatcgcgac gtgattttgt ttcaccacag ggaaaatctg 1380

ccaaaaacgc cacagaccag tgcgccgcgc gaagagagct ggctcgatca gaacctcgat 1440

gagcgacaaa gattgatcgc cgcgctggag aaagccggtt gggtacaggc aaaagccgcg 1500

cgcctgctgg gaatgacccc gcgccaggtg gcctatcgta ttcagacgat ggacattgcc 1560

atgccgagat tgtag 1575

<210> 165

<211> 2856

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> glnE

<400> 165

atgccgcttt cttcgcagtt acagcagcag tggcagaccg tttgcgaacg tctgcctgag 60

tcattaccgg cgtcatcgtt aagcgagcag gcaaagagcg tgctcgtctt cagtgatttt 120

gtgcaggaaa gtatcaccgc caacccgaac tggctggcgg aacttgagaa cgcaccaccg 180

caggcagaag agtggcggca ctatgctggc tggctgcaaa ctgtactcga agacgttacg 240

gatgaggcca cgctgatgcg cgtcctgcgc cagttccgtc gtcgggtgat ggtgcgcatt 300

gcctgggctc aggcgctgga actggtgagc gaagagagta cgctgcagca gttaagcgag 360

ctggcgcaaa cgttgattgt cgccgcgcga gactggctct atgccgcctg ctgtaaagag 420

tggggcacgc cgtgcagcga ggaaggggtt cctcagccgc tgttgattct ggggatggga 480

aagctgggcg gctgcgagct gaacttctcc tctgatatcg acctgatttt tgcctggccg 540

gagaacggct ccacgcgcgg aggccgccgc gagctggaca acgcgcagtt ctttacccgt 600

ctcggccagc gcctgattaa agcgctggat cagcccacgc aggacggttt tgtttaccgc 660

gtggacatgc gcctgcgtcc gtttggcgac agcgggccgc tggtgctgag ctttgcggcg 720

ctggaagatt attaccagga gcaaggtcgc gactgggagc gttacgcgat ggtcaaagcg 780

cggatcatgg gcgacagcga cgacgcttat gccaacgagc tgcgcgccat gctgcgtccg 840

ttcgtgttcc gtcgctatat cgacttcagc gtcatccagt ccctgcgaaa tatgaaaggg 900

atgattgccc gcgaggtgcg ccgccgtggg ctgaaagaca atatcaagct cggtgcgggc 960

ggcatccgcg aaatcgaatt tatcgtccag gtcttccagc ttattcgcgg cggacgcgag 1020

ccgtcgctgc agtcccgttc cttattaccg acgctgagcg ccattgcgca gctgcatctc 1080

ctgccggacg gcgacgcgca aaccctgcgc gaggcctatc ttttcctgcg tcgtctggaa 1140

aacctgctgc aaagcattaa tgacgaacag acccaaaccc tgccgggcga cgaccttaac 1200

cgggcgcgtc tggcctgggg aatgcgcgtg gaagactggt caacgctgac cgaacggctc 1260

gatgcccata tggcaggcgt gcgccgaatc tttaacgaac tgatcggtga tgacgaaagt 1320

gagtcgcagg acgatgcgct ctccgagcac tggcgcgagc tgtggcagga cgcgcttcag 1380

gaagatgaca ccacgccggt gctgacgcac ttaaccgacg acgcgcgcca tcgcgtggtg 1440

gcgctgatcg ctgatttccg tcttgagctg aacaaacgcg ccatcggccc gcgtggtcgc 1500

caggtgctgg atcacctgat gccgcacctg ctgagcgaag tctgctcgcg tgccgatgcg 1560

ccggtgccgc tgtcgcggat gatgcccctg ctgagcggga ttatcacccg tactacctac 1620

cttgaactcc tgagcgagtt ccctggcgcg cttaagcacc tgatttcact ctgcgccgcg 1680

tcgccgatgg tggccaacaa gctggcgcgt tacccgctgc tgctggatga gctgctcgat 1740

ccgaataccc tttatcaacc gacggcgacc gacgcctacc gggacgaact gcgtcagtat 1800

ctgctgcgcg tgccggaaga agacgaagag caacagctgg aggcgctgcg tcagtttaag 1860

caggcccaga tgctgcgcgt ggcggccgca gatattgccg gaacgctgcc ggtgatgaaa 1920

gtgagcgatc acttaacctg gcttgcggaa gcgattatcg acgcggtggt gcatcaggcc 1980

tgggtgcaga tggtggcgcg ctatggccag ccgaaacatc tggctgaccg tgatggtcgc 2040

ggcttcgcgg tggtgggtta cggtaagctc ggcggttggg agctgggcta tagctccgat 2100

ctggatttaa tcttcctcca cgactgcccg gttgatgtga tgaccgacgg cgagcgcgag 2160

attgacgggc gtcagttcta cctgcgcctg gcgcagcgca tcatgcacct gttcagcacc 2220

cgcacctcgt cgggcatttt gtatgaagtg gatgcccgtc tgcgcccgtc cggcgcggcg 2280

ggcatgctgg tcacctcgac ggagtccttc gctgattacc agaagaatga agcctggacg 2340

tgggagcatc aggcgctggt gcgcgcccgt gtggtgtatg gcgatccgct gctgaaaacg 2400

cagtttgacg tgattcgtaa ggaagtcatg accaccgtgc gcgatggcag cacgctgcaa 2460

acggaagtgc gcgaaatgcg cgagaaaatg cgcgcgcact taggcaataa acatcgcgat 2520

cgctttgata ttaaagccga tgagggcggt attaccgata ttgagtttat tacccagtat 2580

ctggtgttgc tgcacgcgca tgacaagccg aagctgacgc gctggtcgga taacgtgcgc 2640

attctggaac tgctggcgca aaacgacatt atggacgagc aggaggcgca ggccttaacc 2700

cgtgcctata caacgcttcg cgatgagctc catcatctgg cgttgcagga gcagccggga 2760

cacgtggcgc tggactgttt caccgctgaa cgcgctcagg taacggccag ctggcagaag 2820

tggctggtgg aaccgtgcgt aacaaatcaa gtgtga 2856

<210> 166

<211> 1290

<212> DNA

<213> 肠杆菌

<220>

<223> amtB

<400> 166

atgaagatag caacacttaa aacgggtctg ggttcgctgg cactgctgcc gggcctggcg 60

ctggctgctg cacctgcggt ggcagacaaa gccgataacg cctttatgat gatcagcacc 120

gcgctggtgc tgttcatgtc cattccgggc attgcgctgt tctatggcgg cctgatccgt 180

ggcaaaaacg ttctctccat gctgacgcag gttgccgtaa cgttcgcgct ggtctgcgta 240

ctgtgggtgg tttacggtta ctcgctggct ttcggcacgg gcaacgcgtt ctttggtaac 300

ttcgactggg tgatgctgaa aaatattgaa ctgaccgcgc tgatgggcag tttctaccag 360

tatattcacg ttgctttcca gggctcgttc gcctgcatta ccgtcgggct gattgtaggc 420

gcgcttgccg agcgtattcg tttctctgcg gtcctgatct tcgtggtggt ctggctgacg 480

ctctcctatg tgccgattgc gcacatggtc tggggtggcg gtctgctggc gacgcatggc 540

gcgctggact tcgcgggcgg taccgttgtg cacattaacg ccgcggtagc gggtctggtt 600

ggcgcatacc tgattggcaa acgcgtgggc ttcggtaaag aagcgttcaa accgcacaac 660

ctgccgatgg tcttcaccgg taccgcgatc ctctactttg gctggtttgg tttcaacgcc 720

ggctcagcaa gtgccgcgaa cgaaatcgcc gcgctggcct tcgtgaatac cgttgtggcc 780

acggcaggtg caatcctctc ctgggtcttt ggcgagtggg ctgtgcgcgg taaaccttct 840

ctgctgggtg cctgttcggg ggcgattgct ggtctggtcg gtatcacccc agcatgtggt 900

tatgtcggtg tgggtggcgc gctgctggtc ggcctggtgt caggtctggc gggtctgtgg 960

ggcgtgacgg cgctgaaacg tattctgcgc gttgatgacc cttgcgatgt gtttggcgtg 1020

cacggcgtgt gcggcatcgt cggctgtatc atgaccggta tctttgcagc gaaatcgctg 1080

ggtggcgtgg gctacgcaga aggcgtcacc atggcccatc aggtgctggt gcagctggaa 1140

agtattgctg tcaccgtggt gtggtctgcc gttgtcgctt tcattggcta caaactggcg 1200

gacatgacgg ttggtctgcg cgtgccggaa gagcaggaac gcgaaggtct ggacgtcaac 1260

agccacggcg agaatgcgta taacgcatga 1290

<210> 167

<211> 1299

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> 16S

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (294)..(294)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (299)..(299)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (302)..(302)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (309)..(310)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (332)..(332)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (346)..(346)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (351)..(351)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (438)..(438)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (445)..(445)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (454)..(454)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (469)..(469)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (477)..(477)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (492)..(492)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (504)..(504)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (555)..(555)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (775)..(775)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 167

gccgagagag gggcccgcgt cggattaggt agttggtgag gtaatggctc accaagcctt 60

cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac 120

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagcaatg 180

ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt cgcacgcgac gatgatgacg 240

gtagcgtgag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgnagggng 300

cnagcgttnn tcggaattac tgggcgtaaa gngcgcgtag gcggcntgtt nagtcagaag 360

tgaaagcccc gggctcaacc tgggaatagc ttttgatact ggcaggcttg agttccggag 420

aggatggtgg aattcccngt gtagnggtga aatncgtaga tattgggang aacaccngtg 480

gcgaaggcgg cnatctggac gganactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 540

ggattagata ccctngtagt ccacgccgta aacgatgaat gctagacgtc ggggtgcatg 600

cacttcggtg tcgccgctaa cgcattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 660

aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa 720

gcaacgcgca gaaccttacc aacccttgac atgtccactt tgggctcgag agatngggtc 780

cttcagttcg gctgggtgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag 840

atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctaccgt cagttgccat cattcagttg 900

ggcactctgg tggaaccgcc ggtgacaagc cggaggaagg cggggatgac gtcaagtcct 960

catggccctt atgggttggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacagt gggaagcgaa 1020

gtcgcgagat ggagcaaatc cccaaaagcc gtctcagttc ggatcgcact ctgcaactcg 1080

agtgcgtgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc 1140

cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttacccga aggtggtgcg 1200

ctaaccgcaa ggaggcagcc aaccacggta aggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1260

ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctccttt 1299

<210> 168

<211> 897

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifH

<400> 168

atggccaaag cgcctctgcg tcagatcgcc ttttacggca agggcggtat cggcaagtcc 60

accacctctc agaacacgct ggccgcgctg gtcgagctgg atcagaggat cctgatcgtc 120

ggctgcgacc cgaaggccga ctcgacccgc ctgatcctgc acgcaaaggc ccaggacacc 180

gtcctgcatc tggccgccga ggccggctcg gtcgaggatc tggagctcga ggacgttctc 240

aagatcggct acaagaacat caagtgcgtc gagtccggcg gtccggagcc gggggtcggc 300

tgcgccggcc gcggcgtcat cacctcgatc aacttcctgg aagagaacgg cgcctacgac 360

gacgtggact atgtgtccta cgacgtgctg ggcgacgtgg tctgcggcgg cttcgccatg 420

ccgatccgcg agaacaaggc ccaggaaatc tacatcgtca tgtccggcga gatgatggcg 480

ctgtacgccg ccaacaacat cgccaagggc atcctgaagt acgcgcacag cggcggcgtc 540

cgtctcggcg gcctgatctg caacgagcgc cagaccgaca aggaatggga tctggccgac 600

gcgctggcca agcgcctggg ctccaagctg atccacttcg tgccgcgcga caacatcgtc 660

cagcacgccg agctgcgccg catgacggtc atcgagtacg ccccggacag caagcaggcc 720

ggcgaatacc gcgcgctcgc caacaagatc catgcgaact ccggccaggg ttgcatcccg 780

accccgatca ccatggaaga gctggaagag atgctgatgg acttcggcat catgaagacc 840

gaggagcagc agctcgccga gctcgccgcc aaggaagcgg cgaaggccgg cgcctga 897

<210> 169

<211> 1440

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifD1

<400> 169

atgagcctgt ccgagaacac cacggtcgac gtcaagaacc tcgtcaacga agtcctcgaa 60

gcctatcccg aaaaatcccg caagcgccgc gccaagcacc tgaacgtgct ggaggccgag 120

gccaaggact gcggcgtcaa gtcgaacgtc aagtccatcc ccggcgtcat gaccatccgc 180

ggctgcgcct atgccggctc caagggcgtg gtgtggggtc cgatcaagga catgatccac 240

atctcccacg gtccggtcgg ctgcggctac tactcctggt ccggccgccg caactactac 300

atcggcgaca ccggtgtgga cagctggggc acgatgcact tcacctccga cttccaggag 360

aaggacatcg tcttcggcgg cgacaagaag ctgcacaagg tcatcgagga aatcaacgag 420

ctgttcccgc tggtgaacgg catctcgatc cagtcggaat gcccgatcgg cctgatcggc 480

gacgacatcg aggctgtcgc ccgcgccaag tcggcggaaa tcggcaagcc ggtcatcccc 540

gtgcgctgcg aaggcttccg cggcgtgtcc cagtcgctgg gccaccacat cgccaacgac 600

gccatccgag actgggtgtt cgagaagacg gaacccaagg ccggcttcgt ctccaccccc 660

tatgacgtca ccatcatcgg cgactacaac atcggcggcg acgcctggtc gtcccgcatc 720

ctgctggagg agatcggcct gcgcgtgatc gcccagtggt cgggcgacgg cacgctcgcc 780

gaactggaga acacgccgaa ggccaaggtc aacctgatcc actgctaccg ctcgatgaac 840

tacatcgcgc gccacatgga agagaagttc aacattcctt ggatggaata caacttcttc 900

ggcccgagcc agatcgccga atccctgcgc aagatcgccg ctctcttcga cgacaagatc 960

aaggagaacg ccgagaaggt catcgcccgc taccagccga tggtcgatgc ggtcatcgcc 1020

aagtacaagc cgcggctcga aggcaagaag gtcatgatct acgtcggcgg cctgcgtccc 1080

cgccacgtcg tcgatgccta ccatgacctc ggcatggaga tcaccggcac cggctacgag 1140

ttcgcccaca acgacgacta tcagcgcacg cagcactacg tgaaggaagg cacgctgatc 1200

tacgacgacg tcaccgcgtt cgaactggag aagttcgtcg aggcgatgcg tcccgacctc 1260

gtcgcgtcgg gcatcaagga aaagtacgtg ttccagaaga tgggcctgcc gttccgccag 1320

atgcacagct gggactactc cggcccgtac cacggctatg acggcttcgc gatcttcgcc 1380

cgcgacatgg acctggccat caacaacccc gtctggggcg tgatgaaggc cccgttctga 1440

<210> 170

<211> 1419

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifD2

<400> 170

atgctccagg acaagatcca ggatgtcttc aacgaaccgg gctgcgcgac caaccaagcc 60

aaatcggcca aggagaagaa gaagggctgc accaagtcgc tgaaaccggg ggcggcagcc 120

ggcggctgcg cctatgacgg ggcgatgatc gtgctccagc cgatcgccga cgccgcccat 180

ctggtccatg gccccatcgc ctgcctcgga aacagttggg acaaccgcgg ctccaaatcc 240

tccggctcgc agctctaccg caccggcttc accaccgatc tgtcggaact ggacgtcatc 300

ggcggcggcg agaagaagct ctaccgcgcc atcaaggaga tcgttcagca atacgacccg 360

ccggccgtct tcgtctatca gacctgcgtg cccgccatga ccggcgacga catcgccgcg 420

gtctgcaagt tcgccacgca gaagctgggc aagccggtga tcccggtgga ctcgccgggc 480

ttcgtcgggt cgaagaatct cggcaacaag ctggccggcg aagccctgct ggagcatgtc 540

atcggcacgg tcgaaccgga ctacaccacc ccgaccgacg tctgcatcat cggcgaatac 600

aaccttgccg gcgagctgtg gctggtcaag ccgctgctgg acgagatcgg catccgcctc 660

ctgtcctgca tttccggcga cggccgctac cgggaggtgg cgcaggccca ccgcgcccgc 720

gtcaccatga tggtgtgcag ccaggcgctg gtgaatgtcg ggcgcaagat ggaggagcgc 780

tacggcatcc cctatttcga ggggtccttc tacggcgtgt ccgacatgtc ggacaccctg 840

cgcaccatga cccgcatgct ggtggagcgc ggcgccgaca agggcctgat cgaccgggcg 900

gagggcgtga tcgcgcggga ggaaagccgg gtctggcgcc ggctggaacc ctacaagccg 960

cgcttcgacg gcaagcgcgt ccttctcttc accggcggcg tcaagagctg gtcgatggtc 1020

agcgcgctgg agggtgcggg gctgaccatc ctcggcacct ccaccaagaa atcgaccagg 1080

gaggacaagg agcgcatcaa gaagatgaag ggcgaagagt tccaccagtg ggacgatttg 1140

aagccgcgcg acatctacag gatgctggcc gacgatcagg ccgacatcat gatgtccggc 1200

ggccgctcgc agttcatctc gctgaaggcc aaggttccct ggctcgacat caaccaggag 1260

cgccaccacg cctatgccgg ctatgacggc atcgtcaatc tctgcgagga gatcgacaaa 1320

acgctgtcga atccgatctg gcgtcaggtg cgtcagccgg caccgtggga gtccggcgcg 1380

tcctccaccc ttctggcttc ctcgatggcg gcggagtga 1419

<210> 171

<211> 1383

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifK

<400> 171

atgtcccaca tccagcgctt cccctccgcc gccaaggccg cctccaccaa cccgctgaag 60

atgagccagc cgctgggtgc ggctctggcc tatctcggcg tcgaccgctg cctgccgctg 120

ttccatggct cgcagggctg caccgccttc gggctggtcc tgctggtgcg ccatttccgc 180

gaggcgatcc cgctccagac cacggcgatg gatcaggtcg ccaccatcct cggcggctac 240

gacaatctgg agcaggcgat ccgcaccatc gtcgagcgca accagcccgc catgatcggc 300

gtcgccacca ccggcgtcac cgagaccaag ggcgaggata tggccggaca gtacacgctg 360

ttccgccagc gcaaccccga cttggccgac acggccctgg tcttcgccaa cacccccgac 420

ttcgccggcg gcttcgagga cggcttcgcc gccgcggtca ccgcgatggt cgagcggttg 480

gtcgaaccgt cgccggtgcg catcccgacc caggtcaacg tgctggccgg ctgccatctg 540

tcccccggcg acgtggagga actgcgcgac atcatcgaag gcttcggcct gtcgccgatc 600

ttcctgcccg acctgtcgct gtcgatggcg ggccgccagc cggccgactt caccgccacc 660

tcgctgggcg gcgtgaccgt cgatcagatc cgcgccatgg gcgcttcggc cctcaccatc 720

gtggtcggtg agcatatgcg ggtggccggt aacgcgctgg agctgaagac cgacgtgccc 780

agccatttct tcaaccgcct gaccgggctg gaggcgacgg acaagctggt ccggctgctg 840

atggagttgt cgggcaagcc ggcgcccgcc cggctgcggc gccagcgcga aagcctggtc 900

gatgccatgc tcgacgggca tttcttctac agccgcaagc gcatcgccgt cgcgctggag 960

cccgacctgc tctatgccgt caccggcttc ctcgccgaca tgggggccga ggtgatcgcc 1020

gcggtgtccc cgacgcagag cccggtgctg gagcggttga aggccgccac catcatggtc 1080

ggcgatcatt ccgacgtgga gacgctggcc cgcgacgccg acctgatcgt ctccaactcg 1140

cacgggcggc agggagccgc gcggatcggc gtggctctgc accgcatggg cctgccgctg 1200

ttcgaccggc tgggggccgg cctgcgcgtc caggtcggct accgcggcac gcgggaactg 1260

ctgtgcgaca tcggcaacct gttcctcgcc cgcgagatgg accacgagca cgggcacgag 1320

agccacgacc acggggaatc ccacggctgc ggaggcggat catgcggatg caacgccgtc 1380

tga 1383

<210> 172

<211> 1560

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifK1

<400> 172

atgaccgaca agctttcgca gagcgccgac aaggtcctcg accactacac cctcttccgg 60

cagcccgaat acgcggcgat gttcgagaag aagaagaccg agttcgagta cggccattcg 120

gacgaggaag tcgcccgcgt gtccgaatgg accaagtccg aggactacaa ggcgaagaac 180

ttcgcccgtg aagcggtcgt catcaacccg accaaggcct gccagccgat cggcgcaatg 240

ttcgccgccc agggcttcga aggcaccctg cccttcgtcc acggctccca gggctgcgtc 300

gcctattacc gcacccacct gacccgtcac ttcaaggagc cgaacagcgc ggtctcctcg 360

tcgatgacgg aggacgcggc ggtgttcggc ggcctgaaca acatgatcga cggcctggcg 420

aacgcctatg cgctctacaa gccgaagatg atcgcggtga tgaccacctg catggccgaa 480

gtcatcggcg acgatttgca gggcttcatc gccaatgcga agaccaagga cagcgtcccg 540

gccgacttcc cggtccccta cgcccacacc ccggccttcg tcggcagcca catcgtcggc 600

tacgacaaca tgatcaaggg gatcctgacc aacttctggg gtacgtcgga gaatttcgac 660

acacccaaga ccgagcagat caacctgatc ccgggcttcg acggcttcgc cgtcggcaac 720

aaccgcgaac tgaagcgcat cgccggcgaa ttcggcgtga agctgcaaat cctgtccgac 780

gtgtccgaca atttcgacac gccgatggat ggcgagtacc gcatgtatga cggcggcacc 840

accatcgagg agaccaagga ggccctgcac gccaaggcca ccatctccat gcaggagtac 900

aacacgaccc agaccctgca attctgcaag gagaagggtc aggaagtcgc caagttcaac 960

tacccgatgg gcgtcaccgg caccgacgag ctgctgctga agctcgccga actgtcgggc 1020

aagccggtcc cggccagcct gaagctggag cgcggccgtc tggtcgacgc catcgccgac 1080

agccacaccc acatgcacgg caagcgcttc gccgtctatg gcgacccgga cttctgcctg 1140

ggcatgtcca agttcctgct ggagctgggt gcggagccgg tgcacatcct gtcgacgtcg 1200

ggctccaaga agtgggagaa gcaggtccag aaggtgctgg acggctcgcc cttcggcgcc 1260

tcgggcaagg cccatggcgg caaggatctg tggcacctgc gttcgctgat cttcaccgac 1320

aaggtggact acatcatcgg caacagctac ggcaagtatc tggagcgcga caccaaggtt 1380

ccgctgatcc gcctgaccta cccgatcttc gaccgccacc accaccaccg ctacccgacc 1440

tggggctacc agggcgcgct gaacgtgctg gtacggatcc tggaccggat cttcgaggac 1500

atcgacgcca acaccaacat cgtcggccag accgactact cgttcgacct gatccgctga 1560

<210> 173

<211> 1530

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> nifA

<400> 173

atgttgacct ctgatattgt tggcaaattg cgctgcatcg cagcagaccc caaagcgggc 60

atcgcaaggg gcctcgacac cgggacgacg aagatcggtc ccgtttggga gggtgacgtg 120

ggcgacaccg tggatttcga agcgctgcgc cagcgggcgg tccactccct gttcgaacat 180

ctggaatcca tgtgcgtcgg cgccgtcgcc gtcgaccaca ccggccgcat cgcctggatg 240

gacgagaagt acaaggctct gctgggcgtt cccgacgacc cgcgcggccg gcaggtggag 300

gacgtcatcc ccaacagcca gctgcgccgg gtgatcgaca gcggccagcc gcagccgctg 360

gacatcatgg agttcgacga ccggtccttc gtggtgacgc ggatgccgct gttcggcacc 420

gacggttcga tcatcggcgc catcggcttc gtgctgttcg accgcgccga atatctccgc 480

ccgctggtcc gcaaatacga gaagatgcag gaggagctgg cccgcaccca gcaggagctg 540

gcgcatgagc gccgcgccaa atactccttc tcgcagttcc tgggcgccag cgaatcgatc 600

cgcgagatca agcggctggg gcgccgcgcc gcccagatgg attcgaccgt cctgctgctg 660

ggcgaaaccg ggaccggcaa ggagctgctg gcccaggcca tccattccgc cagcccgcgg 720

gcgtccaagc ccttcgtcgg cgtcaatgtc gccgccattc cggaaaccct gctggaggcg 780

gagttcttcg gcgtcgcccc cggcgccttc accggcgccg accgccgcca ccgcgacggc 840

aagttccagc tcgccaacgg cggcaccctg ttcctcgacg agatcggcga catgccgctg 900

ccggtgcagg ccaagcttct gcgcgtgctg caggagcggg agatcgagcc gctcggctcc 960

aacaaggtgg tgcgggtcga tgtccgcatc atcgccgcca ccagccgtga cctgcacgcc 1020

ctggtgcgtg agaagcagtt ccgcgccgac ctctattacc ggctgaatgt ggtgccgatc 1080

accctgccgc cgctgcgcga ccggccggag gacatcgaga gcatcgccga ccgcatcctg 1140

gaacagctgg cgatccagca gggcacgccg ccgcgcgagc tgctggaatc ggcggtgcag 1200

gtgctgcgcg actatgactg gcccggcaat gtgcgcgagc tttacaacac gctggaacgg 1260

gtggtggcgc tgaccgatgc gccgatcctg accgcgccgc acatccgcag cgtgctgccc 1320

ggccagcatc cggccggcgc gtcggccctg ccgctggcgg ccggcgcgcg gccgttgcag 1380

gaggtgctgc acgccgccga gcgccacgcc atcgccgcgg cgcttgagga ggcgaacggc 1440

gtcaaggcgc gggcggcgaa gctgctgggc atttcgcgcg cgtcgctgta cgaacgcatg 1500

gtgacgctgg ggttgggggc gacgcagtag 1530

<210> 174

<211> 3030

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> glnE

<400> 174

atgccgagtc ccatcgcgtt ctcaagcccc ttgccgaagc ctttcgacag cgcgcaggcg 60

gcgctgggga tggagcgctg gcgccagcag gccgccgcgg cggagccgga gacccgcgcc 120

tgggcggaag ccttcgccga ttcggagacc ggccgggcgc tgatcggggc ggtgtgcggc 180

aacagcccgt atctcggcca cagcctgacg cgggagttgc ccttcgtcgc ccgtacagtg 240

caggacggct tcgacgacac cttcgccgcg ctgatcgccg ctctccatgc cgagcatggc 300

gaggagaaat cgatggaccg gctgatggcc ggcctgcggg tggcgaagcg gcgggcggcg 360

ctgctgatcg cgctggccga catcgccggc gcgtggccgc tgttccgcgt caccggcgcc 420

ctgtcggagc tggcggagac gggggtgcag ctggccgcga atttcctgct gcgccgcgcc 480

agggaggcgg ggacgctgac gctgccggat ccgcagcgac cgtgggtcgg ttcgggcctg 540

atcgttttgg gcatgggtaa gcttggcggg cgcgaactca actattccag cgacatcgac 600

ctgatcgtcc tgtatgacga cgctgttgtg cagacgcccc agccggacaa cctcgcgcga 660

accttcatca ggctcgcacg cgatcttgtc cgcattatgg atgaacggac caaggacggc 720

tacgtcttcc gcaccgacct tcggcttagg cccgatcccg gcgccacgcc gctggcggtt 780

tccgtctccg cagccgaaat ttattacggc agcgtcggtc agaactggga acgcgcggcg 840

atgatcaagg cccgtcccat cgccggcgat ctggaggcgg gcgcctcctt tgtccgcttc 900

ctggagccct tcgtctggcg ccgcaacctg gatttcgccg ccatccagga catccattcg 960

atcaaacgcc agatcaacgc ccacaagggc caccgcgagg tgacggtcaa cggccacgac 1020

atcaaggtcg gccgcggcgg catccgcgag atcgagttct tcgcccagac ccagcagctg 1080

atcttcggcg ggcgcgaccc gcgcgtgcga atcgctccga ccctgatggc gaacgaggcg 1140

ctgcgcgacg tcggccgcgt gccgccgcag acggtggaag agcttgccgg ggcctatcat 1200

ttcctgcgcc gtgtcgaaca tcgcatccag atgatcgacg accagcagac ccatcgtatt 1260

cccgccgacg atgccggggt ggcgcatttg gccaccttcc tcggctatga cgaccccgcc 1320

gccttccggg cggaactgct ggcgacgctg gggcaggtgg aggaccgcta tgccgagctg 1380

ttcgaggagg cgccgtcgct ttccggcccc ggcaatctgg tcttcaccgg caccgacccc 1440

gatccgggca cgatggagac gctgaagggc atgggcttcg ccgatccggc ccgcgtcatc 1500

agcgtggtgt cggcctggca tcgcggccgc taccgcgcca cccggtcggg ccgggcgcgg 1560

gagctgctga cggagctgac gccggccctg ctgagtgcgc tgaccaagac cccggccccc 1620

gattcggcgc tgatgaactt cgacgatttc ctcggcaagc tgccggccgg cgtcggtctg 1680

ttctcgctgt tcgtcgccaa tccctggctc ctggagctgg tggcggagat catgggcatc 1740

gcgccgcaga tggcgcagac gctgtcgcgc aacccgtcgc tgctcgacgc cgtgctgtcg 1800

ccggacttct tcgacccgct gccgggcaag gaggacgggc tggccgacga ccacgcccgc 1860

gtgatggcgc cggcccgcga tttcgaggat gcgctgaccc tgtcgcggcg ctggaccaac 1920

gaccagcgct tccgcgccgg ggtgcatatc ctgcgcggca tcaccgatgg cgaccgctgc 1980

ggcgccttcc tggccgatct ggccgacatc gtcgtccccg accttgcccg ccgggtggag 2040

gaggagttcg cccagcgcca cggccatatt cccggcggcg cctgggtggt ggtggcgatg 2100

ggcaagctcg gcagccggca gctgaccatc acgtccgaca tcgacctgat cgtcatctac 2160

gatgtggcgc cgggccaagg gggcgggggc ggtccccgct tgtcggatgg tgccaagccg 2220

ctgtcgccca acgagtatta catcaagctg actcagcgtc tgaccaacgc cattaccgcg 2280

ccgatgggcg acggccggct ctacgaggtc gacatgcggc tgcgcccgtc gggcaacgcc 2340

gggccgctcg ccacctcgct ggacgctttc ctgaaatatc aggcgaccga tgcctggacc 2400

tgggagcata tggccctgac ccgcgcccgg gtgatcggcg gtgatgcgga gctggccggg 2460

cgggtgtcgg cagcgatccg ctcggtgctg acggcgccgc gcgatgccga ccggctgctg 2520

tgggacgtgg ccgacatgcg gcggcggatc gagaaggagt tcgggacgac caatgtctgg 2580

aacgtcaaat acgcccgcgg cggcctgatc gacatcgagt tcatcgccca gtacctgcaa 2640

ctgcgccatg gtcacgagcg gccggacatc ctgcacatcg gcaccgccaa ggcgctgggc 2700

tgcgccgccc ggacgggcgc gctggcgccg gaggtggcgg aggatctgga gacgacgctg 2760

cggctgtggc ggcgggtgca gggctttctg cggttgacca ccgccggggt gctcgatccc 2820

aatcaggtgt cgcccagcct gctggccggg ctggtccgcg ccgcctttcc tgctgacttt 2880

cagggcgagc gtgagcctgg cactgttgac ttccccgaac tggaccacaa aatccgtgcc 2940

gtcgccgccc gcgcccatgg tcatttcaag accctggtcg aggaaccggc gggccgtctg 3000

gccccacccg ccaccacgcc tccagcctga 3030

<210> 175

<211> 1440

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> amtB1

<400> 175

atgaaccgtc tgttccttat ggccgcaccg atgatggcgg ttgctctggg cgcggtcggc 60

atgccggccg cagcccttgc ccaggatccg gcggctgccg ccgctgccgc ggctgcggct 120

gcggctgccg ccgctgctgc cgcaccggcg gctccggcgc tgaatggcgg cgacaccgcc 180

tggatgctca tctccaccgc gctggtgctg atgatgacca tccccggcct ggcgctgttc 240

tacggcggca tggtccgcaa gatgaacgtg ctgtcgacgg tgatgcagag cttcgccatc 300

acctgcctga tcagcgtcct gtggtacgtc atcggctaca gcctggcctt caccggcacc 360

ggtgcctatg tcggcggtct cgaccggctg ttcctcaacg ggctcgactt cacgaaggcc 420

ttcgtgctgg gcgaggcgac cgggtcgggc gtcccgacga ccatccccga gccggtcttc 480

atgatgttcc agatgacctt tgcgatcatc accccggccc tgatcaccgg cgccttcgcc 540

gaccgcatga agttctcctc cctgctggtc ttcaccgcgc tgtggtcgat cgtggtctat 600

gcgccgatcg cccactgggt ctggtacccg tcgggcttcc tgttcggcct gggcgtgctg 660

gacttcgccg gcggcacggt cgtgcacatc aacgccggcg tcgccggcct ggtcgccgcg 720

ctggtgatcg gcaagcgcaa gggctacccg aaggaagcct tcatgccgca caacctggtg 780

ctgtcgctga tcggcgcctc gctgctgtgg gtcggctggt tcggcttcaa cgccggttcg 840

gccctgaccg ccggtccgcg tgccggcatg gcgctggccg ccacgcacat cgccaccgcc 900

ggtgccgcca tgggctggct gttcgcggag tggatcgtca agggcaagcc gtcgatcctc 960

ggcatcatct ccggcgccgt cgccggcctg gtcgcggtga ccccggccgc cggcttcgtc 1020

gacccgacgg gcgccatcgt catcggcatc gtcgccggcg tggtctgctt ctggtcggcc 1080

accagcctca agcacatgct gggctatgac gacagcctgg acgccttcgg cgtgcacggc 1140

gtcggcggcc tgatcggcgc catcctgacc ggcgtcttcg ccaagatgtc ggtgtccaac 1200

agcgaaggcg gcttcgcctc cgtcctgcag gccgacccga aggccacgct gggcctgctg 1260

gaaggcaacg ccgccgccgt ctggatccag gtccagggcg tcctctacac catggtctgg 1320

tgcgccatcg ccaccttcgt cctgctgaag atcgtcgatg tggtcatggg cctgcgcgtc 1380

gaagaggatg tggagcgcga cggtctcgac ctcgccctgc atggcgagag catccactaa 1440

<210> 176

<211> 1227

<212> DNA

<213> 生脂固氮螺菌

<220>

<223> amtB2

<400> 176

atggatgcgg caaagacggg tggcgacgtc cttttcgtgc tgatgggcgc ggtgatggtg 60

ctggcgatgc attgcggctt cgccctgctg gaggtcggga cggtccggcg caagaatcag 120

gtcaacgcgc tggtgaagat cctgtcggac ttcgccatgt cgaccatcgc ctattttttc 180

gtcggttatg ccgtggccta cggcatcgac ttcttcgccg acgcccacac gctggtcggc 240

aagggaagcg gcgggttcgc ggcctatggc tacgatctgg tgaagttctt cttcctggcg 300

accttcgccg ccgcggtgcc ggccatcgtc tcgggcggca tcgccgagcg tgctaggttc 360

tggccgcagg ccgccgccac gctggcgctg atcgcgctgt tctatccatt gctggaaggc 420

acggtctggg gcacccgctt cggcctgcaa agctggatgg ccgcgacctt cggccagcct 480

ttccacgact tcgccggatc tgtggtggtg catgccttcg gcggctgggt ggcgctgggt 540

gccgtgctga acctcggcaa ccgccgcggc cgctaccgtc cgaacggctc gctgatcgcc 600

attccgccgt cgaacatccc cttcctggcg ctgggcgcct gggtgctgtg cgtggggtgg 660

ttcggcttca acgtgatgag cgcccaggtg ctggatggcg tgacgggtct ggtggcgctg 720

aactcgctga tggcgatggt cggcggcatc gtcacctcgc tggtgatcag ccgcaccgat 780

cccggcttcg tccacaacgg cgcgctggcc ggtctggtgg cggtctgcgc cgggtccgac 840

gtgatgcacc cgctgggcgc gctggtcacc ggcggcatcg ccgggctgct gttcgtctgg 900

gccttcaaca aatgccagat cgactggaag atcgacgacg tgctgggcgt ctggccgctg 960

cacggtctgt gcggcctgac cggcggcctg ctggccggcg tcttcgggca ggaggcactg 1020

ggcggccttg gcggcgtgtc gatcctcagc cagatcgtcg gcacggcaag cggcgccagc 1080

ttcggattcg tctcgggtct ggcggtctac ggcctgctgc gcgtcaccgt cggcatccgc 1140

ctcgatcccg agcaggagta caagggcgcc gacttgtcgt tgcaccatat caccgcgtac 1200

ccggaagagg acgcgccgac cctgtaa 1227

<210> 177

<211> 613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::PinfC

<400> 177

atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag cgctttatcg gcatcctgac 60

tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc gtgcaggtag ttgtgatgaa 120

catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc cgtaaactgc aaaatgcggg 180

cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc tttaaaatcc gcgagcacac 240

tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa gaggtcgaag ccggcaaagt 300

tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg gacgtaaatg atgttatcga 360

gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa 420

aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt aatggcgaga ttcgcgccac 480

ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt attgcgatag aactcacttc 540

acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg 600

aggttcaaaa tga 613

<210> 178

<211> 1613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::PinfC

<400> 178

accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180

ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240

aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300

ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360

tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420

acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag 540

cgctttatcg gcatcctgac tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc 600

gtgcaggtag ttgtgatgaa catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc 660

cgtaaactgc aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc 720

tttaaaatcc gcgagcacac tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa 780

gaggtcgaag ccggcaaagt tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg 840

gacgtaaatg atgttatcga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa 900

ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt 960

aatggcgaga ttcgcgccac ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt 1020

attgcgatag aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg 1080

ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg ggtaataccg 1140

tctggcgctt cgatttatcc cagcagttca ccgcgatgca gcggataagc gtggttctca 1200

gccgggcgac cgaggttgaa cagacactcc agcaggtgct gtgcgtattg cacaatgacg 1260

cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca gcaggcgatt ttgactattg 1320

aagcgttgca ggaagccgat cagcagttga tccccggcag ctcgcaaatt cgctaccgtc 1380

cgggtgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcaggggca atcgttagtg ctggcgcgtg 1440

tggctgacga tcagcgcttt cttgaccgcc tgggactgta tgattacaac ctgccgttta 1500

tcgccgtgcc gctgataggg ccggatgcgc agacttttgg cgtgctgacg gcgcaaccga 1560

tggcgcgtta cgaagagcgg ttacccgcct gcacccgctt tctggaaacg gtc 1613

<210> 179

<211> 1185

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 179

tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60

gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120

gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180

ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240

ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300

gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360

gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420

ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480

gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540

cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600

ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660

aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720

ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780

gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840

aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900

tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960

tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020

gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080

caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 1140

accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185

<210> 180

<211> 2085

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 180

taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60

cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120

cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180

tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240

aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300

tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360

gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420

acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480

acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540

cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600

cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660

aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720

cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780

cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840

gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900

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gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020

gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080

aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140

cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200

cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260

tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320

aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380

gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440

agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500

gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560

agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620

ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680

cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740

acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800

tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860

gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920

ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980

aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040

atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085

<210> 181

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 181

atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 182

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 182

accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180

ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240

aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300

ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360

tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420

acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600

tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660

aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900

gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960

acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020

gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080

caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200

cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260

caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320

ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380

acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 183

<211> 1185

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 183

tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60

gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120

gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180

ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240

ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300

gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360

gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420

ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480

gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540

cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600

ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660

aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720

ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780

gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840

aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900

tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960

tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020

gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080

caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 1140

accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185

<210> 184

<211> 2085

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 184

taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60

cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120

cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180

tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240

aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300

tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360

gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420

acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480

acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540

cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600

cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660

aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720

cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780

cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840

gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900

aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact 960

gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020

gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080

aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140

cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200

cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260

tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320

aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380

gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440

agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500

gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560

agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620

ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680

cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740

acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800

tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860

gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920

ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980

aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040

atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085

<210> 185

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 185

atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 186

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 186

accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180

ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240

aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300

ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360

tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420

acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600

tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660

aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900

gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960

acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020

gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080

caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200

cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260

caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320

ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380

acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 187

<211> 1185

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 187

tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60

gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120

gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180

ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240

ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300

gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360

gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420

ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480

gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540

cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600

ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660

aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720

ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780

gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840

aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900

tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960

tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020

gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080

caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 1140

accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185

<210> 188

<211> 2085

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 188

taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60

cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120

cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180

tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240

aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300

tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360

gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420

acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480

acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540

cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600

cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660

aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720

cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780

cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840

gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900

aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact 960

gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020

gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080

aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140

cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200

cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260

tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320

aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380

gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440

agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500

gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560

agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620

ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680

cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740

acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800

tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860

gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920

ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980

aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040

atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085

<210> 189

<211> 452

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm7

<400> 189

atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60

tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120

aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180

ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240

agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300

ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360

ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg cctgacccta cgattcccgc 420

tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452

<210> 190

<211> 1451

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm7

<400> 190

accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180

ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240

aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300

ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360

tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420

acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt 540

tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta 600

attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt 660

atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt 720

ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc 780

caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg 840

gtagttaact caacatctga ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg 900

cctgacccta cgattcccgc tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga 960

accgagtcgg gtaataccgt ctggcgcttc gatttatccc agcagttcac cgcgatgcag 1020

cggataagcg tggttctcag ccgggcgacc gaggttgaac agacactcca gcaggtgctg 1080

tgcgtattgc acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag 1140

caggcgattt tgactattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttgat ccccggcagc 1200

tcgcaaattc gctaccgtcc gggtgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcaggggcaa 1260

tcgttagtgc tggcgcgtgt ggctgacgat cagcgctttc ttgaccgcct gggactgtat 1320

gattacaacc tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cggatgcgca gacttttggc 1380

gtgctgacgg cgcaaccgat ggcgcgttac gaagagcggt tacccgcctg cacccgcttt 1440

ctggaaacgg t 1451

<210> 191

<211> 1191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 191

atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60

gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120

gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180

gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240

gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300

gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360

ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420

aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480

tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540

cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600

gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660

gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720

gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780

atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840

aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900

ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960

aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020

gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080

gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140

cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191

<210> 192

<211> 2191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 192

cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60

gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120

actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180

atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240

cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300

cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360

ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420

tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480

tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540

cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600

acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720

cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780

gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840

ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900

tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960

atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020

acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080

cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140

tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200

aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260

ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320

aggttcgcga gatgcgcgag aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt 1380

ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440

tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500

ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560

cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620

tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680

tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740

gagagagtca tgaaagtaac gctgccggag tttgaacgtg caggagtgtt ggtggtgggt 1800

gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860

gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920

atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980

gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040

gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100

cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160

cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191

<210> 193

<211> 613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::PinfC

<400> 193

atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60

cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120

ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180

taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240

tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300

ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360

cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420

cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480

tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540

ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600

aggtgaagca tga 613

<210> 194

<211> 1613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::PinfC

<400> 194

ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60

gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120

ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180

tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240

ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300

tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360

tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420

ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480

ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540

atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600

ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660

gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720

gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780

cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840

cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900

caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960

aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020

cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 1080

ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140

tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200

gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260

cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320

aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380

ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440

tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500

tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560

tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613

<210> 195

<211> 1155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 195

atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60

gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120

gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180

gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240

gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300

tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360

ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420

ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480

attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540

cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600

gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660

tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720

cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780

accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840

cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900

ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960

attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020

catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080

cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140

tggctgatgg cttaa 1155

<210> 196

<211> 2155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 196

cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60

gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120

actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180

atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240

cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300

cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360

ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420

tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480

tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540

cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600

acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720

gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780

acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840

tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900

agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960

tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020

tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080

tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140

agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200

gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260

gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320

ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 1380

ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440

gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500

aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560

ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620

tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680

gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740

cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800

agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 1860

cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920

gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980

aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040

ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100

ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155

<210> 197

<211> 412

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm8.2

<400> 197

atgaccctga atatgatgct cgacgccgtc ctcgcagtac cattgcaacc gactttacag 60

caagaagtga ttctggcacg catggaacaa attcttgcca gtcgggcttt atccgatgac 120

gaacgcgcac agcttttata tgagcgcgga gtgttgtatg atagtctcgg tctgagggca 180

ttagcgcgaa atgatttttc acaagcgctg gcaatccgac ccgatatgcc tgaagtattc 240

aattacttag gcatttactt aacgcaggca ggcaattttg atgctgccta tgaagcgttt 300

gattctgtac ttgagcttga tcgccattga gctggcttcc cgaccgcagg gcggcacctg 360

cctgaccctg cgtttcccgc tgtttaacac cctgaccgga ggtgaagcat ga 412

<210> 198

<211> 1389

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm8.2

<400> 198

cccaacagca gggccgggta ggccagcagg tccgccagcg tggcgcggtt aatattgacc 60

ggggcggcgg cggcctcccc cagctgcttg tggatcattt tcgcgatctt gcgggtttta 120

ccggtatcgg taccaaagaa aatgccaatg ttcgccatag tacgctcctg tcggaatggt 180

gttgaaaaaa ggaatgacga cagaggtatt gcgaaggctg tgccaggttg ccctgcaccg 240

cgacggccca tccctgcccc atcaggatcg cttcgcatca cgatgccgcg cgccaaaggc 300

gcacccggcg gggcgaaagg taaaaatccg tgaattttcc ccctgtcgga tcaatgtttc 360

gcgtggtcgt tccgataagg gcgcacactt tgcatggtta tccgggttcg gcttaccccg 420

ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg cgacacagga gtttgcgatg 480

accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa 540

gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 600

cgcgcacagc ttttatatga gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta 660

gcgcgaaatg atttttcaca agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat 720

tacttaggca tttacttaac gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat 780

tctgtacttg agcttgatcg ccattgagct ggcttcccga ccgcagggcg gcacctgcct 840

gaccctgcgt ttcccgctgt ttaacaccct gaccggaggt gaagcatgat ccctgaatcc 900

gacccggaca ccaccgtcag acgcttcgac ctctctcagc agttcaccgc catgcagcgg 960

ataagcgtgg tgctgagccg ggccaccgag gccagcaaaa cgctgcagga ggtgctcagc 1020

gtattacaca acgatgcctt tatgcagcac gggatgatct gcctgtacga cagcgagcag 1080

gagatcctca gtatcgaagc gctgcagcaa accggccagc agcccctccc cggcagcacg 1140

cagatccgct atcgccccgg cgagggactg gtggggaccg tgctggccca ggggcagtcg 1200

ctggtgctgc cccgggtcgc cgacgatcag cgttttctcg accgcctgag cctctacgat 1260

tacgatctgc cgtttatcgc cgtaccgttg atggggccca acgcccggcc aataggggtg 1320

ctggcggccc agccgatggc gcgccaggaa gagcggctgc cggcctgcac ccgttttctc 1380

gaaaccgtc 1389

<210> 199

<211> 1155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 199

atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60

gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120

gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180

gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240

gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300

tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360

ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420

ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480

attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540

cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600

gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660

tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720

cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780

accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840

cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900

ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960

attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020

catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080

cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140

tggctgatgg cttaa 1155

<210> 200

<211> 2155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 200

cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60

gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120

actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180

atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240

cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300

cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360

ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420

tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480

tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540

cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600

acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720

gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780

acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840

tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900

agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960

tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020

tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080

tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140

agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200

gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260

gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320

ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 1380

ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440

gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500

aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560

ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620

tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680

gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740

cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800

agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 1860

cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920

gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980

aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040

ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100

ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155

<210> 201

<211> 413

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm6.2

<400> 201

atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta atcgctgata acatttgacg 60

caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc acgctttcat accagaacct 120

ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga caggctctga agagggcgtt 180

tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc agcgttctcc tttgcaatag 240

cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt gaacgcgttc agtgtataat 300

ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 360

gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 413

<210> 202

<211> 1413

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm6.2

<400> 202

ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60

gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120

ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180

tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240

ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300

tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360

tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420

ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480

ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta 540

atcgctgata acatttgacg caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc 600

acgctttcat accagaacct ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga 660

caggctctga agagggcgtt tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc 720

agcgttctcc tttgcaatag cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt 780

gaacgcgttc agtgtataat ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc 840

ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 900

aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct 960

cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc 1020

aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg 1080

atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc 1140

cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg 1200

accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt 1260

ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg 1320

cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg 1380

ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1413

<210> 203

<211> 513

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1.2

<400> 203

atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag aacttccacc ttggactcgg 60

ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac atccccattc cggtgatctt 120

accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag atgacctata ttcccggcac 180

ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata cagttttaat tcgctaagtc 240

ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa caaggactaa agcgttaccc 300

actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt tgcactggac aaaaggtacc 360

acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga tttttcatat aaaggtaatt 420

ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 480

ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 513

<210> 204

<211> 1513

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1.2

<400> 204

ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60

gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120

ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180

tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240

ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300

tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360

tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420

ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480

ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag 540

aacttccacc ttggactcgg ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac 600

atccccattc cggtgatctt accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag 660

atgacctata ttcccggcac ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata 720

cagttttaat tcgctaagtc ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa 780

caaggactaa agcgttaccc actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt 840

tgcactggac aaaaggtacc acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga 900

tttttcatat aaaggtaatt ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 960

gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga 1020

atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca 1080

gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct 1140

cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga 1200

gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag 1260

cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca 1320

gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta 1380

cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg 1440

ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt 1500

tctcgaaacc gtc 1513

<210> 205

<211> 1155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 205

atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60

gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120

gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180

gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240

gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300

tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360

ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420

ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480

attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540

cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600

gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660

tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720

cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780

accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840

cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900

ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960

attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020

catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080

cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140

tggctgatgg cttaa 1155

<210> 206

<211> 2155

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2 36bp缺失

<400> 206

cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60

gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120

actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180

atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240

cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300

cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360

ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420

tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480

tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540

cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600

acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720

gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780

acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840

tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900

agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960

tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020

tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080

tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140

agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200

gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260

gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320

ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 1380

ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440

gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500

aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560

ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620

tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680

gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740

cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800

agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 1860

cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920

gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980

aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040

ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100

ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155

<210> 207

<211> 613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::PinfC

<400> 207

atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60

cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120

ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180

taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240

tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300

ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360

cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420

cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480

tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540

ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600

aggtgaagca tga 613

<210> 208

<211> 1613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::PinfC

<400> 208

ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60

gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120

ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180

tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240

ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300

tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360

tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420

ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480

ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540

atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600

ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660

gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720

gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780

cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840

cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900

caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960

aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020

cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 1080

ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140

tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200

gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260

cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320

aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380

ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440

tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500

tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560

tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613

<210> 209

<211> 1191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 209

atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60

gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120

gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180

gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240

gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300

gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360

ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420

aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480

tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540

cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600

gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660

gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720

gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780

atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840

aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900

ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960

aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020

gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080

gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140

cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191

<210> 210

<211> 2191

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 210

cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60

gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120

actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180

atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240

cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300

cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360

ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420

tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480

tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540

cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600

acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720

cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780

gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840

ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900

tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960

atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020

acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080

cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140

tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200

aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260

ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320

aggttcgcga gatgcgcgag aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt 1380

ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440

tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500

ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560

cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620

tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680

tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740

gagagagtca tgaaagtaac gctgccggag tttgaacgtg caggagtgtt ggtggtgggt 1800

gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860

gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920

atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980

gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040

gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100

cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160

cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191

<210> 211

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 211

atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60

gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120

gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180

gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240

gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300

gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360

gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420

aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480

tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540

cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600

gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660

gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720

gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780

attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840

aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900

ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960

gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020

gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080

gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140

actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188

<210> 212

<211> 2188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 212

cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60

agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120

ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180

gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240

atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300

ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360

agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420

ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480

tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540

cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600

gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660

tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720

cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780

gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840

aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900

ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960

atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020

acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080

catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140

tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200

agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260

ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320

aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 1380

ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440

ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500

ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560

cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620

tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680

tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740

tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800

accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860

ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920

ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980

tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040

tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100

ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160

atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188

<210> 213

<211> 635

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm6.1

<400> 213

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg aatttttttt cacaaagcgt 240

agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300

ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360

ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420

ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480

tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540

gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600

cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635

<210> 214

<211> 1635

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm6.1

<400> 214

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780

ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840

acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900

ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960

tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020

gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080

cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140

ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200

tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260

ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa 1320

gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380

acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440

caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500

tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560

ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620

tttttagaaa tggtc 1635

<210> 215

<211> 635

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm6.1

<400> 215

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg aatttttttt cacaaagcgt 240

agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300

ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360

ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420

ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480

tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540

gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600

cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635

<210> 216

<211> 1635

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm6.1

<400> 216

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780

ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840

acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900

ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960

tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020

gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080

cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140

ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200

tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260

ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa 1320

gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380

acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440

caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500

tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560

ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620

tttttagaaa tggtc 1635

<210> 217

<211> 786

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm7.1

<400> 217

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaaaacgt gaccacgagc 240

attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa aagtatcttc tttcataaaa 300

agtgctaaat gcagtagcag caaaattggg ataagtccca tggaatacgg ctgttttcgc 360

tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg agcgaacgat caaaatatag 420

cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt gtgtaatact tgtaacgcta 480

catggagatt aacttaatct agagggtttt ataccgtctc tgaagctctc ggtgaacatt 540

gttgcgaggc aggatgcgag ctggttgtgt tttgacatta ccgataatgt gccgcgtgaa 600

cgggtgcgtt atgcccgccc ggaagcggcg ttttcccgtc cggggaatgg catggagctg 660

cgccttatcc agacgctgat cgcccatcat cgcggttctt tagatctctc ggtccgccct 720

gatggcggca ccttgctgac gttacgcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta 780

aaatga 786

<210> 218

<211> 1786

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm7.1

<400> 218

gtttcgtctc gaggccgggc aactgagcgg ccccgttgaa accgacctgg gctggcatct 60

gttgttgtgc gaacaaattc gcctgccgca acccttgccg aaagccgaag ccttaacgcg 120

ggtgcgtcag caactgattg cccggcaaca gaaacattat cagcgccagt ggctgcaaca 180

actgatcaac gcctgagcct gttctccttc ttgttgatgc agacgggtta atgcccgttt 240

tgcacgaaaa atgcacataa attgcctgcg ttgccttata acagcgcagg gaaatcctgc 300

ctccggcctt gtgccacacc gcgctttgcc tggtttgtgg taaaaactgg cccgctttgc 360

atcctgatgc ttaaaacacc ccgttcagat caacctttgg gcagataagc ccgcgaaagg 420

cctgcaaatt gcacggttat tccgggtgag tatatgtgtg atttgggttc cggcattgcg 480

caataaaggg gagaaagaca tgagcatcac ggcgttatca gcatcatttc ctgaggggaa 540

tatcgccagc cgcttgtcgc tgcaacatcc ttcactgttt tataccgtgg ttgaacaatc 600

ttcggtggcg atttcgctga ccgatccgca ggcgcgcatt tgttatgcca atccggcatt 660

ctgccgccag acgggttttg cacttgagac acttttgggc gagaaccacc gtctgctggt 720

taaaaacgtg accacgagca ttaataaacg ccacgaaatg tggcgtttat ttattcaaaa 780

agtatcttct ttcataaaaa gtgctaaatg cagtagcagc aaaattggga taagtcccat 840

ggaatacggc tgttttcgct gcaattttta actttttcgt aaaaaaagat gtttctttga 900

gcgaacgatc aaaatatagc gttaaccggc aaaaaattat tctcattaga aaatagtttg 960

tgtaatactt gtaacgctac atggagatta acttaatcta gagggtttta taccgtctct 1020

gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac 1080

cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc 1140

ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt 1200

agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca 1260

ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc 1320

tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa 1380

agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg 1440

caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg 1500

catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag acccgccatg tccgttaccg catgggggaa 1560

ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac 1620

gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg 1680

ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg 1740

cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg tttttagaaa tggtcg 1786

<210> 219

<211> 993

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1.2

<400> 219

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 240

gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300

gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac acacgctacg ccgtgttcct 360

tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420

cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480

atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540

caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600

ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660

gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720

ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780

gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt 840

tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900

ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960

gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993

<210> 220

<211> 1993

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1.2

<400> 220

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840

acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900

aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960

ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020

ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080

cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140

aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200

agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260

atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320

cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380

cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440

tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500

acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560

tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620

cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680

acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740

ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800

ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta 1860

cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920

cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980

tttagaaatg gtc 1993

<210> 221

<211> 993

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1.2

<400> 221

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 240

gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300

gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac acacgctacg ccgtgttcct 360

tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420

cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480

atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540

caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600

ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660

gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720

ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780

gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt 840

tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900

ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960

gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993

<210> 222

<211> 1993

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1.2

<400> 222

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840

acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900

aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960

ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020

ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080

cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140

aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200

agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260

atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320

cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380

cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440

tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500

acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560

tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620

cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680

acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740

ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800

ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta 1860

cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920

cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980

tttagaaatg gtc 1993

<210> 223

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 223

atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60

gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120

gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180

gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240

gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300

gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360

gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420

aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480

tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540

cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600

gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660

gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720

gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780

attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840

aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900

ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960

gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020

gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080

gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140

actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188

<210> 224

<211> 2188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 224

cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60

agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120

ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180

gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240

atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300

ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360

agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420

ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480

tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540

cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600

gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660

tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720

cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780

gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840

aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900

ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960

atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020

acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080

catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140

tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200

agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260

ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320

aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 1380

ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440

ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500

ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560

cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620

tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680

tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740

tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800

accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860

ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920

ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980

tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040

tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100

ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160

atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188

<210> 225

<211> 663

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm3.1

<400> 225

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 240

atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc tacccataat cgggaaccgg 300

tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc tgggtcctaa 360

agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 420

gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 480

gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 540

cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 600

ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 660

tga 663

<210> 226

<211> 1663

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm3.1

<400> 226

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 780

tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 840

tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga 900

agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg 960

ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg 1020

ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag 1080

atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg 1140

ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt 1200

tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag 1260

caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca 1320

atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca 1380

tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg 1440

cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga 1500

tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc 1560

gatccccggt gcggataatc agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca 1620

cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1663

<210> 227

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 227

atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60

gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120

gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180

gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240

gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300

gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360

gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420

aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480

tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540

cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600

gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660

gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720

gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780

attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840

aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900

ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960

gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020

gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080

gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140

actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188

<210> 228

<211> 2188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 228

cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60

agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120

ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180

gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240

atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300

ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360

agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420

ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480

tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540

cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600

gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660

tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720

cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780

gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840

aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900

ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960

atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020

acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080

catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140

tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200

agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260

ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320

aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 1380

ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440

ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500

ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560

cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620

tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680

tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740

tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800

accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860

ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920

ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980

tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040

tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100

ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160

atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188

<210> 229

<211> 613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::PinfC

<400> 229

atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca caagctacct atgtcgaaga 60

attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa gccgacttga gaaatgagaa 120

gattggcttt aaaattcgcg aacacacgct acgccgtgtt ccttatatgt tagtttgtgg 180

cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact cgtcgcggca aagacttagg 240

aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg gaaatccgca gcagaagtca 300

tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga gttcaaccgg cgcgtcctaa 360

tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc accggcgtcg atggcgagca 420

gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct gaggaagcgg gcgtcgattt 480

agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga atctctttag atctctcggt 540

ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg 600

aggcttaaaa tga 613

<210> 230

<211> 1613

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::PinfC

<400> 230

tgtttcgtct cgaagccggg caactgagca gccccgttga aaccgaactg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgag gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaatcatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttggtg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aactgccttc gctgccttat aacagcgcat ggaaatcctg 300

cctcctgcct tgtgccacgc cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg tttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca 540

caagctacct atgtcgaaga attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa 600

gccgacttga gaaatgagaa gattggcttt aaaattcgcg aacacacgct acgccgtgtt 660

ccttatatgt tagtttgtgg cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact 720

cgtcgcggca aagacttagg aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg 780

gaaatccgca gcagaagtca tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga 840

gttcaaccgg cgcgtcctaa tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc 900

accggcgtcg atggcgagca gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct 960

gaggaagcgg gcgtcgattt agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga 1020

atctctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 1080

gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta 1140

tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga 1200

gtcaggaaag caataccgcg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg 1260

catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt tcgataaaga acgcaatgca ctgtttgtgg 1320

aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagaaac ccgccatgtc cgttaccgca 1380

tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca 1440

tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgctga 1500

ttggtgtgcc gatccccggt gcggataatc agcctgcggg tgtgctggtg gcacagccga 1560

tggcgttgca cgaagaccgg ctggctgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1613

<210> 231

<211> 426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm5

<400> 231

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60

cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120

tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180

aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240

aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300

ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360

gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420

aaatga 426

<210> 232

<211> 1426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm5

<400> 232

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540

gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600

ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660

ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720

gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780

gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840

aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900

attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960

cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020

gaccgaggtc gatcagacgc tccagcaagt gctgtgcgta ttgcacaatg acgccttttt 1080

gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag ccagcaggcg attttgaata ttgaagcgtt 1140

gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200

agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260

cgatcagcgc tttcttgacc ggctcgggtt gtatgattac aacctgccgt ttatcgccgt 1320

gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380

ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426

<210> 233

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 233

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 234

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 234

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600

ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660

aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900

gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960

acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020

gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080

caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200

cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260

cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320

gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380

actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 235

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 235

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 236

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 236

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

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acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600

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tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900

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caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200

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gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380

actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 237

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 237

atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60

gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120

gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180

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gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300

gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg ggcagatggt ggcgcgttat 360

ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420

aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480

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cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600

gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660

tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720

gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780

attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840

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<210> 238

<211> 2206

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 238

gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60

tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120

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cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140

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tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560

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gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040

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atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206

<210> 239

<211> 1563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-1

<400> 239

atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60

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catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180

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ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300

ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360

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cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480

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gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600

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cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780

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ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900

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taa 1563

<210> 240

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 240

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

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atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 241

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 241

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540

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aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

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acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020

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<210> 242

<211> 2563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-1

<400> 242

gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60

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gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360

atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420

cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480

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cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600

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cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020

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agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260

cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320

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gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440

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atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620

acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680

tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740

atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800

tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860

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cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040

tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100

gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160

gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220

gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280

atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340

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cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520

agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563

<210> 243

<211> 1563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-1

<400> 243

atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60

agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120

catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180

ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240

ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300

ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360

gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420

cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480

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gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660

gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720

cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780

ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840

ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900

ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960

gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020

ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080

cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140

ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200

atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260

ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320

ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380

atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440

ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500

gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 1560

taa 1563

<210> 244

<211> 2563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-1

<400> 244

gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60

tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120

caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180

attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240

gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300

gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360

atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420

cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480

ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540

cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600

attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660

ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720

tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780

cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840

tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900

tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960

cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020

gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080

agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140

atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200

agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260

cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320

tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380

gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440

cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500

tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560

atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620

acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680

tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740

atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800

tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860

aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920

acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980

cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040

tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100

gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160

gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220

gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280

atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340

gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400

gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460

cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520

agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563

<210> 245

<211> 426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm5

<400> 245

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60

cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120

tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180

aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240

aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300

ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360

gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420

aaatga 426

<210> 246

<211> 1426

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm5

<400> 246

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540

gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600

ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660

ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720

gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780

gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840

aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900

attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960

cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020

gaccgaggtc gatcagacgc tccagcaagt gctgtgcgta ttgcacaatg acgccttttt 1080

gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag ccagcaggcg attttgaata ttgaagcgtt 1140

gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200

agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260

cgatcagcgc tttcttgacc ggctcgggtt gtatgattac aacctgccgt ttatcgccgt 1320

gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380

ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426

<210> 247

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 247

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 248

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 248

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600

ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660

aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900

gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960

acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020

gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080

caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200

cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260

cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320

gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380

actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 249

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 249

atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60

gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120

gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180

gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg cgcagttgct gcgcgtggcg 240

gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300

gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg ggcagatggt ggcgcgttat 360

ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420

aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480

tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg atggtcgcca gttctatttg 540

cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600

gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660

tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720

gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780

attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840

aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct tcgatctgaa agccgatgaa 900

ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg tgctgcgctt tgcccatgac 960

aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc tcgaagggct ggcgcaaaac 1020

ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg cgtacaccac attgcgtgat 1080

gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg tggcgctctc ctgttttgtc 1140

gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc tggtggaa 1188

<210> 250

<211> 2206

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 250

gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60

tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120

caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180

attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240

gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300

gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360

atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420

cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480

ttaacgaaag gatatttcgc atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc 540

cgatggttgc cagtcagctg gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga 600

atacgctcta tcaaccgacg gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc 660

tgcgcgtgcc ggaagatgat gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg 720

cgcagttgct gcgcgtggcg gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga 780

gcgatcactt aacctggctg gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg 840

ggcagatggt ggcgcgttat ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt 900

ttgcggtggt cggttatggc aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg 960

atctggtatt cctgcacgac tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg 1020

atggtcgcca gttctatttg cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca 1080

cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140

tgctggtcac tactacggaa tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg 1200

aacatcaggc gctggcccgt gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat 1260

ttgacgccat tcgccgcgat attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg 1320

acgtgcgaga aatgcgcgag aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct 1380

tcgatctgaa agccgatgaa ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg 1440

tgctgcgctt tgcccatgac aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc 1500

tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560

cgtacaccac attgcgtgat gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg 1620

tggcgctctc ctgttttgtc gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc 1680

tggtggaacc gtgcgccccg gcgtaagtgt ggtatcatcg cgcgcaaatt ttgtatctct 1740

caggagacag gaatgaaagt gacgctgcca gagtttaagc aagccggtgt aatggtggtg 1800

ggtgatgtga tgctggatcg ttactggtat ggcccaacca gccgtatctc tccggaagcg 1860

ccagtcccgg ttgttaaagt cgataccatt gaagagcgtc ctggcggcgc ggcaaacgtg 1920

gcgatgaata tcgcctcact gggcgccacg gcgcgtctgg ttggcctgac tggcattgac 1980

gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040

tctgttccga cgcatcccac catcactaag ctgcgcgtgc tgtcgcgtaa ccagcagctg 2100

attcgcctgg actttgaaga gggttttgaa ggagtcgatc cgcaaccgat gcatgaacgc 2160

atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206

<210> 251

<211> 199

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-amtB

<400> 251

tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60

cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120

aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg gatgtaaaca gccacggcga 180

aaacgcctat aacgcctga 199

<210> 252

<211> 1199

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-amtB

<400> 252

tttcctttct gactctgccc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc cctcttttca 60

ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120

ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa gccattcaaa cttgaagacg 180

tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240

ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300

tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360

tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420

tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480

cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540

cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600

aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660

gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720

gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt ctttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780

cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840

aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900

agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960

tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020

aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080

tttgcgcgga tccatacctg gcgggtggga tcggcaacgt ggcctttcag cgggttatga 1140

aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199

<210> 253

<211> 1563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-1

<400> 253

atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60

agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120

catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180

ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240

ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300

ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360

gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420

cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480

atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540

gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600

gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660

gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720

cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780

ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840

ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900

ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960

gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020

ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080

cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140

ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200

atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260

ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320

ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380

atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440

ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500

gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 1560

taa 1563

<210> 254

<211> 2563

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-1

<400> 254

gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60

tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120

caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180

attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240

gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300

gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360

atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420

cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480

ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540

cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600

attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660

ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720

tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780

cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840

tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900

tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960

cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020

gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080

agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140

atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200

agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260

cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320

tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380

gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440

cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500

tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560

atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620

acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680

tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740

atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800

tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860

aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920

acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980

cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040

tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100

gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160

gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220

gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280

atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340

gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400

gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460

cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520

agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563

<210> 255

<211> 461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm1

<400> 255

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60

ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120

aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180

tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240

cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300

atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360

taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420

gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461

<210> 256

<211> 1461

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm1

<400> 256

accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60

agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120

ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180

ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240

acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300

tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360

caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420

catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480

actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540

taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600

ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660

aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720

tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780

aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840

gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900

gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960

acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020

gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080

caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140

gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200

cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260

cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320

gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380

actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440

acccgctttc tggaaacggt c 1461

<210> 257

<211> 199

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-amtB

<400> 257

tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60

cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120

aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg gatgtaaaca gccacggcga 180

aaacgcctat aacgcctga 199

<210> 258

<211> 1199

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-amtB

<400> 258

tttcctttct gactctgccc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc cctcttttca 60

ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120

ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa gccattcaaa cttgaagacg 180

tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240

ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300

tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360

tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420

tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480

cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540

cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600

aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660

gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720

gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt ctttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780

cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840

aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900

agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960

tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020

aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080

tttgcgcgga tccatacctg gcgggtggga tcggcaacgt ggcctttcag cgggttatga 1140

aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199

<210> 259

<211> 607

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::PinfC

<400> 259

atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt atcggcatcc tgaccgaaga 60

atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag gttgtggtga tgaatatcac 120

tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa ttgcaaaatg cgggcattcg 180

tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa atccgcgagc acactttacg 240

tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg gaagcaggca aagtggccgt 300

tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta agtgaagtga ttgagaagct 360

gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag gaataaggta ttaaaggcgg 420

aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc gagattcgcg cccaggaagt 480

tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca atagaactaa ctacccgccc 540

tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt cattcactga ccggaggccc 600

acgatga 607

<210> 260

<211> 1607

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::PinfC

<400> 260

ggtacgacaa aaacgtctcc agcgacgtgc ggttaatatt gactggcgca tccgccacat 60

cccccagttt ttgctggatc agtttggcga ttttgcgggt ttttcccgtg tcactgccaa 120

aaaaaatacc aatgttagcc atgtcgcgct cctgttgaga aagaataagg ccgcctgcaa 180

acggcggata tcccttctcc tgttgcgaag gctgtgccag gtttttttaa ggccttctgt 240

gcactgaaat gggtgaaaaa atgactcttt tttgtgcagg caccgtcctc tctccgctat 300

ccagacctgc tttgaaggcc tctgagggcc aaatcagggc caaaacacga atcaggatca 360

atgtttcggc gcgttacctg ttcgaaaggt gcactctttg catggttaat cacacccaat 420

cagggctgcg gatgtcgggc gtttcacaac acaaaatgtt gtaaatgcga cacagccggg 480

cctgaaacca ggagcgtgtg atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt 540

atcggcatcc tgaccgaaga atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag 600

gttgtggtga tgaatatcac tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa 660

ttgcaaaatg cgggcattcg tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa 720

atccgcgagc acactttacg tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg 780

gaagcaggca aagtggccgt tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta 840

agtgaagtga ttgagaagct gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag 900

gaataaggta ttaaaggcgg aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc 960

gagattcgcg cccaggaagt tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca 1020

atagaactaa ctacccgccc tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt 1080

cattcactga ccggaggccc acgatgaccc agcgacccga gtcgggcacc accgtctggc 1140

gttttgatct ctcacagcaa tttaccgcca tgcagcgcat cagcgtggtg ttgagtcgcg 1200

caaccgagat aagccagacg ctgcaggagg tgctgtgtgt tctgcataat gacgcattta 1260

tgcaacacgg catgctgtgt ctgtatgaca accagcagga aattctgagt attgaagcct 1320

tgcaggaggc agaccaacat ctgatccccg gcagctcgca aattcgctat cgccctggcg 1380

aagggctggt aggagccgta ctgtcccagg gacaatctct tgtgctgccg cgtgtcgccg 1440

acgatcaacg ctttctcgac aggcttggca tctatgatta caacctgccg tttatcgccg 1500

tccccttaat ggggccaggc gcgcagacga ttggcgtgct cgccgcgcag ccgatggcgc 1560

gtctggagga gcggcttcct tcctgtacgc gctttctgga aaccgtc 1607

<210> 261

<211> 1536

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 16S-1

<400> 261

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180

cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480

tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540

aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600

gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660

gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720

cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780

gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840

ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900

aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960

gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020

gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080

tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga 1140

actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200

ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260

gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320

tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg 1380

ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440

aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500

taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536

<210> 262

<211> 1537

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 16S-2

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (450)..(450)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (452)..(452)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (455)..(455)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (473)..(473)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 262

ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60

gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120

gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180

cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240

agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300

accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360

attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420

ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660

agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840

aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900

taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960

tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020

tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140

aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200

tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260

cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 1320

ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380

gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440

taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500

gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537

<210> 263

<211> 882

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifH

<400> 263

atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60

cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120

ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180

atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240

tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300

cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360

gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420

cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480

gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540

ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600

gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660

gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720

tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780

accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840

agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882

<210> 264

<211> 1449

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifD2

<400> 264

atgagcaatg caacaggcga acgcaacctg gagataatcg agcaggtgct cgaggttttc 60

ccggagaaga cgcgcaaaga acgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggaa 120

agcgtcggta agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc caggcgtgat gaccgtgcgc 180

ggctgctcgt atgccggttc gaaaggggtg gtatttgggc caatcaagga tatggcgcat 240

atctcgcatg gcccaatcgg ctgcggccaa tactcccgcg ccgggcggcg gaactactac 300

accggcgtca gcggcgtgga cagcttcggc acgctcaact tcacctccga ttttcaggag 360

cgcgacatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagag 420

ctgttcccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480

gatgacattg aggccgtcgc gaacgccagc cgcaaagcca tcaacaaacc ggttattccg 540

gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600

gtgatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaaac cgttcgaatc caccccttac 660

gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcttc gcgcattttg 720

ctcgaagaga tgggcttgcg ggtggtggca cagtggtctg gcgacggtac gctggtggag 780

atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcatt gttaccgctc aatgaactac 840

atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggt 900

ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc agtttgacga caccattcgc 960

gccaacgccg aagcggtgat cgccagatac caggcgcaaa acgacgccat tatcgccaaa 1020

tatcgcccgc gtctggaggg gcgcaaagtg ctgctttata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080

catgtgattg gcgcctatga agacctggga atggagatca tcgctgccgg ttatgagttc 1140

ggtcataacg atgattacga ccgcaccttg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200

gatgatgcca gcagttatga gctggaggcg ttcgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260

ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320

cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380

gatatggata tgacgctcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440

tccgcctga 1449

<210> 265

<211> 1563

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifK2

<400> 265

atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggatgcttac 60

cagacgctgt ttgccggtaa acgggcactc gaagaggcgc actcgccgga gcgggtgcag 120

gaagtgtttc aatggaccac taccccggaa tatgaagcgc tgaactttaa acgcgaagcg 180

ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctgggcg cggtgctctg ttcgctgggg 240

tttgccaata ccctaccgta tgtgcacggt tcacagggtt gcgtggccta tttccgcacg 300

tactttaacc gccactttaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcaat gacggaagac 360

gcggcggtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccggct tacaaaacgc cagcgcgctg 420

tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480

ttgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540

ccctacgcgc acacccccag ttttatcggc agccatatca ccggctggga taacatgttt 600

gaaggttttg cccggacctt tacggcagac catgaagctc agcccggcaa actttcacgc 660

atcaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720

atggaacaaa tggaggtgcc ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaagt gctggatact 780

cccgccaacg ggcattacca gatgtacgcg ggcgggacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840

gcgccggatg ctatcgacac cctgttgctg cagccctggc aactggtgaa aagcaaaaaa 900

gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttt ctgttcccgt tgggctggca 960

ggaacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaggccat tcccgattca 1020

ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg attcccacac ctggttgcac 1080

ggtaaaaaat tcggcctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgtttcctg 1140

ctggagctgg gctgcgaacc gaccgttatc ctctgccaca acggtaacaa acgctggcag 1200

aaagcaatga agaaaatgct tgacgcctcg ccgtacggcc aggagagcga agtgtttatc 1260

aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gccagccgga ttttatgatt 1320

ggcaactcgt acggcaagtt cattcagcgc gacaccttag ccaaaggcga gcagtttgaa 1380

gttccgctga tccgcctcgg ttttcccctg ttcgaccgcc accatctgca ccgccagacc 1440

acctggggct acgagggcgc catgagcatt ctcactaccc ttgtgaatgc ggtactggag 1500

aaagtggaca aagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 1560

taa 1563

<210> 266

<211> 1488

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifL

<400> 266

atgaccctga atatgatgat ggatgccggc gcgcccgagg caatcgccgg tgcgctttcg 60

cgacaccatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cgcccgtcgc catttcgctg 120

actgatgccg acgcacgcat tgtctatgcc aacccggctt tctgccgcca gaccggctat 180

gaactagaag cgttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg caagtcgcca aaccccacgg 240

gaaatctatc aggatatgtg gcacaccttg ttacaacgcc gaccgtggcg cgggcaattg 300

attaaccgcc accgcgacgg cagcctgtat ctggtcgaga tcgatatcac cccggtgatt 360

aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gcaatgcagc gcgatatcag cgccagttat 420

gcgctggagc agcggttgcg caatcacatg acgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480

ccggcggcgg tggttgtagt ggatgaacgc gatcatgtgg ttatggataa ccttgcctac 540

aaaacgttct gtgccgactg cggcggaaaa gagctcctga gcgaactcaa tttttcagcc 600

cgaaaagcgg agctggcaaa cggccaggtc ttaccggtgg tgctgcgcgg tgaggtgcgc 660

tggttgtcgg tgacctgctg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720

attgataaca ggctgacgcg cacgctggtg gtgatcaccg acgacaccca acaacgccag 780

cagcaggaac agggccgact tgaccgcctt aaacagcaga tgaccaacgg caaactactg 840

gcagcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900

ctggcggcgg cgcgacgttt aaacggcagt gataacaaca atgtggcgct cgacgccgcg 960

tggcgcgaag gtgaagaggc gatggcgcgg ctgaaacgtt gccgcccgtc gctggaactg 1020

gaaagtgcgg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg atctgcgcgc gctttatcac 1080

acccgctacg agcaggggaa aaatttgcag gtcacgctgg attcccatca tctggtggga 1140

tttggtcagc gtacgcaact gttagcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200

attgccgccg ggctgggtga tttcaccgcg caaacgcaga tttacgcccg cgaagaagag 1260

ggctggctct ctttgtatat cactgacaat gtgccgctga tcccgctgcg ccacacccac 1320

tcgccggatg cgcttaacgc tccgggaaaa ggcatggagc tgcgcctgat ccagacgctg 1380

gtggcacacc accacggcgc aatagaactc acttcacacc ccgaaggggg aagttgcctg 1440

accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488

<210> 267

<211> 1575

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifA

<400> 267

atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttgtc ccagcagttc 60

actgcgatgc agcgcataag cgtggtactc agccgggcga ccgaggtcga tcagacgctc 120

cagcaagtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gcctttttgc agcacggcat gatctgtctg 180

tacgacagcc agcaggcgat tttgaatatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagtta 240

atccccggca gctcgcaaat ccgctatcgt ccgggcgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300

tcgcagggcc aatcattagt gctggcgcgc gttgctgacg atcagcgctt tcttgaccgg 360

ctcgggttgt atgattacaa cctgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccagatgcg 420

cagactttcg gtgtgctgac ggcacaaccc atggcgcgtt acgaagagcg attacccgcc 480

tgcacccgct ttctggaaac ggtcgctaac ctggtcgcgc aaaccgtgcg tttgatggca 540

ccaccggcag tgcgcccttc cccgcgcgcc gccataacac aggccgccag cccgaaatcc 600

tgcacggcct cacgcgcatt tggttttgaa aatatggtcg gtaacagtcc ggcgatgcgc 660

cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgttct ggtacgcggc 720

gagagtggca ccggcaagga gctgattgcc aacgccatcc accaccattc gccgcgtgcc 780

ggtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacactgct ggaaagcgaa 840

ttgttcggtc acgagaaagg ggcatttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900

gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgagatcg gcgagagtag cgcctcgttt 960

caggctaagc tgctgcgcat tttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgag 1020

acattgcaag tgaatgtgcg cattattgcc gcgacgaacc gcaatcttga agatgaagtc 1080

cggctggggc actttcgcga agatctctat tatcgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140

ccgccactac gcgaacgcca ggaggacatt gccgagctgg cgcactttct ggtgcgtaaa 1200

atcgcccata accagagccg tacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260

agctacaact ggcccggtaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctcagcggtg 1320

atgtcggaga acggtctgat cgatcgggat gtgattttgt ttaatcatcg cgaccagcca 1380

gccaaaccgc cagttatcag cgtctcgcat gatgataact ggctcgataa caaccttgac 1440

gagcgccagc ggctgattgc ggcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcg 1500

cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcctatcgta ttcagacgat ggatataacc 1560

ctgccaaggc tataa 1575

<210> 268

<211> 2850

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> glnE

<400> 268

atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60

tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120

gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180

cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240

gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300

gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360

ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420

tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatgggc 480

aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540

gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600

cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660

gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720

ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780

cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840

tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900

atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960

gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020

cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080

ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140

aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag acacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200

cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260

gaagcgcata tgtcggcggt gcgtcagata tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 1320

gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 1380

gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440

gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500

caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560

ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620

cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680

tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740

ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800

ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860

caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920

gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980

tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040

ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100

ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160

atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220

cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280

gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340

tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400

gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460

accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520

cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgaca tcgagtttat cgcccaatat 2580

ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640

attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700

ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760

catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820

tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850

<210> 269

<211> 1536

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> 16S-3

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (766)..(776)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (905)..(905)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 269

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120

tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180

tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240

tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300

gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360

tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420

gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg gagtaaggtt aataaccttg ctcattgacg 480

ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540

caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600

tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660

agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720

gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagnnnnn nnnnnnaaca 780

ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg 840

aggctttagt ggcgcagcta acgcgataag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac 900

taaanctcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960

tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga catagtaaga attttccaga gatggattgg 1020

tgccttcggg aacttacata caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg 1080

ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgctacatt tagttgggca 1140

ctctaatgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg 1200

gcccttatag gtggggctac acacgtcata caatggctgg tacaaagggt tgccaacccg 1260

cgagggggag ctaatcccat aaaaccagtc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact 1320

gcgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgt cacggtgaat acgttcccgg 1380

gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagcgggttc tgccagaagt agttagctta 1440

accgcaagga gggcgattac cacggcaggg ttcgtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt 1500

agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tccttt 1536

<210> 270

<211> 882

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifD1

<400> 270

atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60

cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120

ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180

atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240

tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300

cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360

gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420

cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480

gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540

ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600

gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660

gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720

tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780

accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840

agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882

<210> 271

<211> 1386

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> nifK1

<400> 271

atggccgaaa ttctgcgcag taaaaaaccg ctggcggtca gcccgataaa aagcggccag 60

ccgctggggg cgatcctcgc aagcctgggt gtcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120

gcacagggat gtagcgcgtt cgcgaaggtg ttctttattc aacattttca cgatccgatc 180

ccgctgcaat cgacggcgat ggatccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240

tttaccgcgc tcaatgtgct ctgccagcgc aacgccgcga aagccattgt gctgctcagc 300

accgggcttt cagaagccca gggcagcgac atttcgcggg tggtgcgcca gtttcgtgat 360

gattttcccc ggcataaagg cgttgcgctg ctcaccgtca acacacccga tttctacggc 420

tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtacccgca 480

cagcccgccg ccagcctgcg caaccgccgt gtcaacctgc tggtcagcca tttactgaca 540

ccaggcgata tcgaactgtt gcgcagttat gttgaagcct tcggcctgca accggtgatt 600

gtgccggatc tgtcgctgtc gctggacggg catctggcag acggtgattt ttcgcctgtt 660

acccaagggg gaacatcgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccaccttt 720

gtgattggcg cctcgctggg ccgtgcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag 780

gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gcagcctgcg acacgtttat tcatcgactg 840

aaaaccctct ccgggcgcga tgtccccgcg tggattgagc gccagcgcgg ccaagttcag 900

gatgcgatga tcgattgcca tatgtggctg cagggtgcgg ctatcgccat ggcagcagaa 960

ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020

attgtcgcac cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaac cgtggttatc 1080

ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140

aattctcatg ccgccgatct cgccacgcag tttgatttgt cacttatccg cgccgggttc 1200

ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cgcctgcgcc aggggtacag cggcattcgt 1260

gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgagcgcc atcacccgct tgcaacctac 1320

cgctcgccgc tgcgccagca cgccgacgac aacgttacgc ctggagatct gtatgccgca 1380

tgttaa 1386

<210> 272

<211> 1287

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> amtB

<400> 272

atgaaaaaca caacattaaa aacagcgctt gcttcgctgg cgttactgcc tggcctggcg 60

atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120

ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180

aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgcactggt gtgcattctg 240

tgggtggtgt atggctactc gctggcattt ggcgagggca acagcttctt cgggagtttt 300

aactgggcga tgttgaaaaa catcgaactg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtat 360

atccacgtgg cgttccaggg ttccttcgcc tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgca 420

ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480

tcttacgtgc cgattgcaca catggtgtgg ggcggcggtc tgctggcaac ccacggtgcg 540

ctggatttcg caggcggtac ggttgttcac atcaacgctg cgattgcagg tctggtgggg 600

gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cattcaaacc gcataacctg 660

ccgatggtct tcactggcac cgctatcctg tatgttggct ggtttggttt caacgccggc 720

tccgcaagct cggcgaacga aattgctgcg ctggccttcg tgaacactgt cgttgccact 780

gctgccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gaatgggcaa tgcgcggcaa gccgtctctg 840

ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcacccccgc ctgtggttat 900

gtgggtgtcg gcggtgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggctgg gctgtggggc 960

gttactgcgc tgaaacgtat gttgcgtgtc gatgacccgt gtgacgtatt cggtgtgcac 1020

ggcgtgtgcg gcatcgtggg ctgtatcctg acgggtatct tcgcctctac gtcgctgggt 1080

ggtgtcggtt tcgctgaagg tgtgaccatg ggccatcagg tgctggtgca gctggaaagt 1140

gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta ttggttacaa actggcggac 1200

atgacggtag gcctgcgcgt accggaagaa caagaacgtg aagggctgga tgtaaacagc 1260

cacggcgaaa acgcctataa cgcctga 1287

<210> 273

<211> 348

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> Prm1

<400> 273

cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60

ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120

gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180

ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240

aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300

aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348

<210> 274

<211> 313

<212> DNA

<213> Kosakonia sacchari

<220>

<223> Prm5

<400> 274

ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60

cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg 120

aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata 180

gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat 240

taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt 300

cagtagcgga aac 313

<210> 275

<211> 1485

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifL

<400> 275

atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcgccggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60

caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catctccctc 120

accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccggcgt tttgccgcca gaccggctat 180

tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240

gagatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300

attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtac ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360

agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420

accctcgaac agcggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480

cccgccgccg tggtagtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540

aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600

ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtgg cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660

tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720

atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780

cagcaggagc aagggcgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840

gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900

ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960

tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020

gaaaaccccg ccgtctggcc gctgcagccc tttttcgacg atctgtgcgc cctctaccgt 1080

acacgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140

ggccagcgca ccccactgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgatcgcac cctggccctc 1200

gccgccgaac tcccctccgt gccgctggcg atgcagctct acgccgagga gaacgacggc 1260

tggctgtcgc tgtatctgac tgacaacgta ccgctgctgc aggtgcgcta cgctcactcc 1320

cccgacgcgc tgaactcgcc gggcaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380

gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440

ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485

<210> 276

<211> 1575

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifA

<400> 276

atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60

accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccgggcca ccgaggccag caaaacgctg 120

caggaggtgc tcagcgtatt acacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180

tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240

ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300

gcccaggggc agtcgctggt gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360

ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420

cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480

tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540

cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600

tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660

cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtacgcggc 720

gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780

ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840

ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900

gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960

caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcgggtcgg cggcgatgag 1020

accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080

cggctgggcc atttccgcga ggatctctac tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140

cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200

atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260

gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320

atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380

gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440

gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500

cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgga tccagatcat ggatatcacc 1560

ctgccgcgtc tgtag 1575

<210> 277

<211> 1540

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-1

<400> 277

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020

agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtaatggt 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540

<210> 278

<211> 1540

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-2

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (267)..(267)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 278

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcat cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020

agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540

<210> 279

<211> 1540

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-3

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (455)..(455)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 279

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancatac ttaatacgtg tggtgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020

agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540

<210> 280

<211> 1540

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-4

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (70)..(70)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 280

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggcttacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tggtgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020

agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540

<210> 281

<211> 1540

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-5

<400> 281

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180

cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240

attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300

atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360

aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420

gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tgttgattga 480

cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540

tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600

tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660

agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720

tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780

caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840

tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900

gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960

gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020

agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080

tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 1140

gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200

tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260

actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320

cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440

gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500

aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540

<210> 282

<211> 1009

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-6

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (296)..(296)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (311)..(311)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<220>

<221> 修饰的碱基

<222> (973)..(973)

<223> a、c、t、g、未知或其它

<400> 282

gtagctaata ccgcatgacc tcgaaagagc aaagtggggg atcttcggac ctcacgccat 60

cggatgtgcc cagatgggat tagctagtag gtgaggtaat ggctcaccta ggcgacgatc 120

cctagctggt ctgagaggat gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta 180

cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg 240

tgtgtgaaga aggccttagg gttgtaaagc actttcagcg aggaggaagg catcanactt 300

aatacgtgtg ntgattgacg ttactcgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag 360

ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag 420

gcggtttgtt aagtcagatg tgaaatcccc gagcttaact tgggaactgc atttgaaact 480

ggcaagctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga 540

gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc 600

gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg 660

acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct 720

ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg 780

gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctactcttga catccagaga 840

atttgccaga gatggcgaag tgccttcggg aactctgaga caggtgctgc atggctgtcg 900

tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg 960

ttgccagcac gtnatggtgg gaactcaaag gagactgccg gtgataaac 1009

<210> 283

<211> 1519

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> 16S-7

<400> 283

attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60

cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120

tcctgatgga ggggataact actggaacgg tagctaatac cgcacctcga aagagcaaag 180

tgggggatct tcggacctca cgccatcgga tgtgcccaga tgggattagc tagtaggtga 240

ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc agccacactg 300

gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg 360

cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttagggttg taaagcactt 420

tcagcgagga ggaaggcatc atacttaata cgtgtggtga ttgacgttac tcgcagaaga 480

agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cttaatcgga 540

attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt tgttaagtca gatgtgaaat ccccgagctt 600

aacttgggaa ctgcatttga aactggcaag ctagagtctt gtagaggggg gtagaattcc 660

aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc ggtggcgaag gcggccccct 720

ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta ataccctggt 780

agtccacgct gtaacgatgt cgacttggag gttgtgccct gaggcgtggc ttccggagct 840

aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga 900

cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta 960

cctactcttg acatccagag aatttgccag agatggcgaa gtgccttcgg gaactctgag 1020

acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac 1080

gagcgcaacc cttatccttt gttgccagca cgtaatggtg ggaactcaaa ggagactgcc 1140

ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg 1200

ctacacacgt gctacaatgg catatacaaa gagaagcgaa ctcgcgagag caagcggacc 1260

tcataaagta tgtcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc 1320

gctagtaatc gtagatcaga atgctacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc 1380

ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaaaag aagtaggtag cttaaccttc gggagggcgc 1440

ttaccacttt gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtaaccgt aggggaacct 1500

gcggttggat cacctcctt 1519

<210> 284

<211> 882

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifH1

<400> 284

atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60

cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120

ccgaaagcgg attccacccg tctgatcctc cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180

atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240

tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300

cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga agaagatttg 360

gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtggtctgcg gcggcttcgc tatgccgatc 420

cgcgaaaaca aagcccagga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480

gccgccaaca atatctccaa agggatcgtg aagtacgcca aatccggcaa ggtgcgcctc 540

ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600

gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660

gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720

tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc gacgccgtgc 780

accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840

agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882

<210> 285

<211> 1113

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifH2

<400> 285

atggttagga aaagtagaag taaaaataca aatatagaac taactgaaca tgaccattta 60

ttaataagtc aaataaaaaa gcttaaaaca caaaccactt gcttttttaa taataaagga 120

ggggttggga agactacatt agtagcaaat ttaggagcag agctatcaat aaactttagt 180

gcaaaagttc ttattgtgga tgccgaccct caatgtaatc tcacgcagta tgtattaagt 240

gatgaagaaa ctcaggactt atatgggcaa gaaaatccag atagtattta tacagtaata 300

agaccactat cctttggtaa aggatatgaa agtgacctcc ctataaggca tgtagagaat 360

ttcggttttg acataattgt cggtgaccct agacttgctt tacaggaaga ccttttagct 420

ggagactggc gagatgccaa aggcggtggg atgcgaggaa ttaggacaac ttttgtattt 480

gcagagttaa ttaagaaagc tcgtgagcta aattatgatt ttgttttctt tgacatggga 540

ccatcattag gcgcaatcaa cagggcagta ttactggcaa tggaattctt tgtcgtccca 600

atgtcaatcg atgtattttc actatgggct attaaaaata ttggctccac ggtttcaata 660

tggaaaaaag aattagacac agggattcgg ctctcagagg aacctagcga attatcacaa 720

ttatcacctc aaggaaaact aaagtttctc ggttacgtca cccaacaaca taaagaacgc 780

tctggatacg atacaattca gcttgagaat actgaggaag aaataaaatc gaaacgtcgg 840

gtaaaggcgt atgaagacat tggagaggtg tttccttcta aaattactga gcatctttct 900

aaactttatg catcaaaaga tatgaaccca caccttggag atatacgtca tttaggtagt 960

ttagctccga aatcacaatc acaacacgtt ccgatgatat cagtgtctgg tacaggaaat 1020

tacaccagac ttagaaaaag cgcgcgtgaa ctttatcgag atattgcaag aagatactta 1080

gagaacattc agactgctaa tggcgagaaa tag 1113

<210> 286

<211> 1374

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifD1

<400> 286

atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60

caaaaatccg gctgcagcgc ccctaagccc ggcgctaccg ccggcggttg cgccttcgac 120

ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180

ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240

cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatgggccg cggcgaacgc 300

cgcctgttcc acgccgtgcg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360

tacaacacct gcgtaccggc gatggagggc gatgacatcg aggcggtctg ccaggccgca 420

cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgct attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480

aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540

ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600

attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660

gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720

caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780

ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840

tccgacgcct tgcgccagct ggcgacgctg ctgggggatg acgacctgcg ccgccgcacc 900

gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg ctcttgcgcc gtggcgtgag 960

cagctccgcg ggcgcaaagt gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020

tcggccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcgcaa atccaccgag 1080

gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140

aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200

ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260

cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320

accctcgcca gccccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374

<210> 287

<211> 1449

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifD2

<400> 287

atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60

cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120

agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgc 180

ggctgcgcct atgcgggctc gaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240

atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tattcccgcg ccggacggcg caactactat 300

accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360

cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420

ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480

gatgacatca gcgccgtagc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540

gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600

gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtac 660

gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720

ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780

atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840

atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccatgga tggaatataa cttcttcggc 900

ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960

gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020

tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080

cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140

gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200

gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260

ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320

cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380

gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440

tctgcgtga 1449

<210> 288

<211> 1386

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifK1

<400> 288

atggcagata ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60

ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtccacggc 120

gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttctttattc agcatttcca tgacccggtg 180

ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240

ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300

accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgcgag 360

gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccgga tttttttggc 420

tctatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480

acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540

ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600

ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660

acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720

gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780

gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840

gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgtgg ccagctgcag 900

gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960

ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020

ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgagca agtcgtgccg 1080

ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140

aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200

cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260

gatacgctgt ttgaactggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320

cgctcgccgc ttcgccaggg cgccgacccc cagccggctt caggagacgc ttatgccgcc 1380

cattaa 1386

<210> 289

<211> 1563

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> nifK2

<400> 289

atgagccaaa cgatcgataa aattcacagc tgttatccgc tgtttgaaca ggatgaatac 60

cagaccctgt tccagaataa aaagaccctt gaagaggcgc acgacgcgca gcgtgtgcag 120

gaggtttttg cctggaccac caccgccgag tatgaagcgc tgaacttcca gcgcgaggcg 180

ctgaccgtcg acccggccaa agcctgccag ccgctcggcg ccgtactctg cgcgctgggg 240

ttcgccggca ccctgcccta cgtgcacggc tcccagggct gcgtcgccta ttttcgcacc 300

tactttaacc gccattttaa agagccggtc gcctgcgtct ccgactccat gaccgaggac 360

gcggcggtgt tcggcggcaa caacaacatg aatctgggcc tgcagaatgc cagcgcgctg 420

tataaacccg agattatcgc cgtctccacc acctgtatgg ccgaggtgat cggcgacgat 480

ctgcaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gagggatttg ttgacgaccg catcgccatt 540

ccttacgccc atacccccag ctttatcggc agccatgtca ccggctggga caatatgttc 600

gaagggttcg cgaagacctt taccgctgac tacgccgggc agccgggcaa acagcaaaag 660

ctcaatctgg tgaccggatt tgagacctat ctcggcaact tccgcgtgct gaagcggatg 720

atggcgcaga tggatgtccc gtgcagcctg ctctccgacc catcagaggt gctcgacacc 780

cccgccgacg gccattaccg gatgtacgcc ggcggcacca gccagcagga gatcaaaacc 840

gcgccggacg ccattgacac cctgctgctg cagccgtggc agctggtgaa aagcaaaaag 900

gtggttcagg agatgtggaa ccagcccgcc accgaggtgg ccgttccgct gggcctggcc 960

gccaccgacg cgctgctgat gaccgtcagt cagctgaccg gcaaaccgat cgccgacgct 1020

ctgaccctgg agcgcggccg gctggtcgac atgatgctgg attcccacac ctggctgcat 1080

ggcaaaaaat tcggcctcta cggcgatccg gatttcgtga tggggctgac gcgcttcctg 1140

ctggagctgg gctgcgagcc gacggtgatc ctcagtcata acgccaataa acgctggcaa 1200

aaagcgatga agaaaatgct cgatgcctcg ccgtacggtc aggaaagcga agtgttcatc 1260

aactgcgacc tgtggcactt ccggtcgctg atgttcaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320

ggtaactcct acggcaagtt tatccagcgc gataccctgg caaagggcaa agccttcgaa 1380

gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 1440

acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 1500

aaactggacc acgacaccag ccagttgggc aaaaccgatt acagcttcga cctcgttcgt 1560

taa 1563

<210> 290

<211> 2838

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> glnE

<400> 290

atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60

gcggattttc ccattgccga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120

tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180

ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240

actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300

atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agactctgca gcagctgagc 360

gtcctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tgtacgccgc ctgctgtaag 420

gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480

ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540

cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600

cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660

cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagttttgcg 720

gcgctggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780

gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840

cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900

ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960

ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc aactgatccg cggtggtcgc 1020

gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080

ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140

gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgag cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200

aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260

ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320

gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380

gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440

ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500

cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgcgccgat 1560

gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620

tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680

gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740

gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800

tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860

aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920

aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980

gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040

cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100

gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160

gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220

acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280

gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340

acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400

gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460

cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520

gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580

tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 2640

cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700

acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760

ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820

aagtggctga tggcttaa 2838

<210> 291

<211> 449

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> Prm4

<400> 291

agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60

tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 120

tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 180

catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 240

caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 300

taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 360

caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 420

cgtgccttat gtcatgcgat gggggctgg 449

<210> 292

<211> 500

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> Prm1.2

<400> 292

tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120

acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180

aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240

ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 300

ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360

cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420

aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480

agccgccagt ttgtcgaatc 500

<210> 293

<211> 170

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> Prm3.1

<400> 293

tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 60

tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 120

tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 170

<210> 294

<211> 142

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> Prm6.1

<400> 294

aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 60

ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 120

acaaagttaa tatgcgcgcc ct 142

<210> 295

<211> 293

<212> DNA

<213> 水生拉恩氏菌

<220>

<223> Prm7.1

<400> 295

ttaaaaacgt gaccacgagc attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa 60

aagtatcttc tttcataaaa agtgctaaat gcagtagcag caaaattggg ataagtccca 120

tggaatacgg ctgttttcgc tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg 180

agcgaacgat caaaatatag cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt 240

gtgtaatact tgtaacgcta catggagatt aacttaatct agagggtttt ata 293

<210> 296

<211> 1188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> glnE-delta-AR-2

<400> 296

atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60

gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120

gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180

gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240

gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300

gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360

gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420

aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480

tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540

cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600

gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660

gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720

gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780

attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840

aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900

ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960

gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020

gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080

gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140

actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188

<210> 297

<211> 2188

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的glnE-delta-AR-2

<400> 297

cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60

agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120

ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180

gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240

atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300

ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360

agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420

ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480

tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540

cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600

gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660

tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720

cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780

gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840

aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900

ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960

atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020

acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080

catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140

tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200

agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260

ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320

aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 1380

ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440

ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500

ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560

cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620

tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680

tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740

tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800

accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860

ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920

ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980

tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040

tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100

ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160

atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188

<210> 298

<211> 524

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::null-v1

<400> 298

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcga 240

tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt tgcgaggcag gatgcgagct 300

ggttgtgttt tgacattacc gataatgtgc cgcgtgaacg ggtgcgttat gcccgcccgg 360

aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg ccttatccag acgctgatcg 420

cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga tggcggcacc ttgctgacgt 480

tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa atga 524

<210> 299

<211> 1524

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::null-v1

<400> 299

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

agtctgaact catcctgcga tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt 780

tgcgaggcag gatgcgagct ggttgtgttt tgacattacc gataatgtgc cgcgtgaacg 840

ggtgcgttat gcccgcccgg aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg 900

ccttatccag acgctgatcg cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga 960

tggcggcacc ttgctgacgt tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa 1020

atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 1080

acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 1140

gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 1200

tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 1260

aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 1320

agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 1380

ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 1440

cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 1500

agtacgcggt ttttagaaat ggtc 1524

<210> 300

<211> 266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::null-v2

<400> 300

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaagcctg ccggtacagc 240

aggttatcac cggaggctta aaatga 266

<210> 301

<211> 1266

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::null-v2

<400> 301

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

ttaaagcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta aaatgaccca gttacctacc 780

gcgggcccgg ttatccggcg ctttgatatg tctgcccagt ttacggcgct ttatcgcatc 840

agcgtggcgc tgagtcagga aagcaacacc gggcgcgcac tggcggcgat cctcgaagtg 900

cttcacgatc atgcatttat gcaatacggc atggtgtgtc tgtttgataa agaacgcaat 960

gcactctttg tggaatccct gcatggcatc gacggcgaaa ggaaaaaaga gacccgccat 1020

gtccgttacc gcatggggga aggcgtgatc ggcgcggtga tgagccagcg tcaggcgctg 1080

gtgttaccgc gcatttcaga cgatcagcgt tttctcgacc gcctgaatat ttacgattac 1140

agcctgccgt tgattggcgt gccgatcccc ggtgcggata atcagccatc gggcgtgctg 1200

gtggcacagc cgatggcgtt gcacgaagac cggctgactg ccagtacgcg gtttttagaa 1260

atggtc 1266

<210> 302

<211> 943

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> delta-nifL::Prm4

<400> 302

atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60

ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 240

cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca tcacggaatt ttgtggttgt 300

tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt tatatcaggg ggattcagag 360

agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat catgataacg ccatgtaaaa 420

caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag caaggcattt tcttatccaa 480

ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg taatatacgc gcccttgcgg 540

acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac caccagctta caaattgcct 600

gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat 660

gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg 720

gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga 780

agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc 840

ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt 900

acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 943

<210> 303

<211> 1943

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 具有500bp侧翼的delta-nifL::Prm4

<400> 303

tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60

tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120

gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180

aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240

ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300

cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360

catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420

gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480

gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540

atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600

cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660

tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720

agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 780

tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 840

tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 900

catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 960

caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 1020

taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 1080

caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 1140

cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 1200

gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 1260

gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 1320

cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 1380

ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 1440

tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta 1500

cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg 1560

cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt 1620

ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga 1680

aaaaagagac ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga 1740

gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc 1800

tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc 1860

agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca 1920

gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1943

<210> 304

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 304

tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60

gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga 100

<210> 305

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 305

cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga 60

agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt 100

<210> 306

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 306

cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100

<210> 307

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 307

cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100

<210> 308

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 308

tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60

gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100

<210> 309

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 309

cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100

<210> 310

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 310

aattttctgc ccaaatggct gggattgttc attttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60

agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat 100

<210> 311

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 311

gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60

caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa 100

<210> 312

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 312

tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60

agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100

<210> 313

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 313

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100

<210> 314

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 314

cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60

tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 100

<210> 315

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 315

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100

<210> 316

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 316

tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60

gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100

<210> 317

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 317

gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100

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<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 318

gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100

<210> 319

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 319

taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60

aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac 100

<210> 320

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 320

cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100

<210> 321

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 321

cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100

<210> 322

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 322

gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60

aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg 100

<210> 323

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 323

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100

<210> 324

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 324

catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60

ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg 100

<210> 325

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 325

tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60

gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc 100

<210> 326

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 326

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100

<210> 327

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 327

atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60

atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg 100

<210> 328

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 328

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100

<210> 329

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 329

tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60

cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 100

<210> 330

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 330

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100

<210> 331

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 331

gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60

cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 100

<210> 332

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 332

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100

<210> 333

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 333

gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60

gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc 100

<210> 334

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 334

tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60

agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100

<210> 335

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 335

tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60

ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc 100

<210> 336

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 336

tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60

gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc 100

<210> 337

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处的100 bp上游

<400> 337

cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgcccagga 60

agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt 100

<210> 338

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 338

ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60

caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat 100

<210> 339

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 339

gcgatagaac tcacttcacg ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta 60

tttcattcac tgaccggagg ttcaaaatga cccagcgaac 100

<210> 340

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 340

tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60

gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 100

<210> 341

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 341

cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60

ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc 100

<210> 342

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 342

aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60

cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100

<210> 343

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 343

cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60

ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc 100

<210> 344

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 344

aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60

cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100

<210> 345

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 345

ccgatcccca tcactgtgtg tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg 60

aatacgaatg acgcgttgca gctcagcaac gaaaattttg 100

<210> 346

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 346

ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60

gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100

<210> 347

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 347

tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100

<210> 348

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 348

ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60

gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100

<210> 349

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 349

tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 60

tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc 100

<210> 350

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 350

aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60

cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100

<210> 351

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 351

cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60

ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc 100

<210> 352

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 352

ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60

cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 100

<210> 353

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 353

aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60

cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100

<210> 354

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 354

tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc 60

tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag gaggaggatt 100

<210> 355

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 355

gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 60

cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 100

<210> 356

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 356

gcgctcaaac agttaatccg tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca 60

cgtcatcctt tattgctcga tgaactgctc gacccgcgca 100

<210> 357

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 357

agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60

tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat 100

<210> 358

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 358

ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60

gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100

<210> 359

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 359

gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 60

tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100

<210> 360

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 360

agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60

gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg 100

<210> 361

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 361

gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg 60

cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg gatcccaaca 100

<210> 362

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 362

gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60

gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc 100

<210> 363

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 363

gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 60

tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100

<210> 364

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 364

gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60

tttgatgccc tttttgcacg ctttcatacc agaacctggc 100

<210> 365

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 365

gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 60

tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100

<210> 366

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 366

cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60

ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 100

<210> 367

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 367

gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 60

tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100

<210> 368

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 368

tctttagatc tctcggtccg ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta 60

cagcaggtta tcaccggagg cttaaaatga cccagttacc 100

<210> 369

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 369

tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60

caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100

<210> 370

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 370

ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60

acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca 100

<210> 371

<211> 100

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 连接处下游100 bp

<400> 371

gcaatagaac taactacccg ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta 60

tttcattcac tgaccggagg cccacgatga cccagcgacc 100

<210> 372

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ PinfC

<400> 372

tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60

gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga ttcttggttc tctggagcgc 120

tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc caacctggct tgcacccgtg 180

caggtagttg tgatgaacat 200

<210> 373

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> PinfC / 破坏的nifL基因

<400> 373

cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga 60

agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt gcgatagaac tcacttcacg 120

ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccggagg 180

ttcaaaatga cccagcgaac 200

<210> 374

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR和ATG / 截短的glnE基因

<400> 374

cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc 120

gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa 180

cacgctctat caaccgacgg 200

<210> 375

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm1

<400> 375

cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg 120

acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat 180

ttaaaataaa aaatccaatc 200

<210> 376

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm1 / 破坏的nifL基因

<400> 376

tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60

gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acgccccgaa 120

gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180

tgacccagcg aaccgagtcg 200

<210> 377

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm7

<400> 377

cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa 120

aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct 180

gcttcggcag aacgattggc 200

<210> 378

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm4 / 破坏的nifL基因

<400> 378

aattttctgc ccaaatggct gggattgttc attttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60

agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat aactcacttc acgccccgaa 120

gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180

tgacccagcg aaccgagtcg 200

<210> 379

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR直到amtB基因的ATG-4bp / 破坏的amtB基因

<400> 379

gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60

caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa ccgatcccca tcactgtgtg 120

tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg aatacgaatg acgcgttgca 180

gctcagcaac gaaaattttg 200

<210> 380

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm1.2 / 破坏的nifL基因

<400> 380

tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60

agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt 120

gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180

gcgtgaacgg gtgcgttatg 200

<210> 381

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm1.2

<400> 381

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 120

gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180

gacttgagaa atgagaagat 200

<210> 382

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm3.1 / 破坏的nifL基因

<400> 382

cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60

tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt 120

gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180

gcgtgaacgg gtgcgttatg 200

<210> 383

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm3.1

<400> 383

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 120

atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc tacccataat cgggaaccgg 180

tgttataatg ccgcgccctc 200

<210> 384

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm1 / 破坏的nifL基因

<400> 384

tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60

gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acaccccgaa 120

gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180

tgacccagcg aaccgagtcg 200

<210> 385

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm1

<400> 385

gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg 120

acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat 180

ttaaaataaa aaatccaatc 200

<210> 386

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm5

<400> 386

gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60

ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca 120

atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg 180

tcaatttctg tcaaataaag 200

<210> 387

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm5 / 破坏的nifL基因

<400> 387

taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60

aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa 120

gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180

tgacccagcg aaccgagtcg 200

<210> 388

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR和ATG / 截短的glnE基因

<400> 388

cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tttaacgatc tgattggcga 120

tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga 180

tgcgttgcag gaggaggatt 200

<210> 389

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR和ATG / 截短的glnE基因

<400> 389

cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60

ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg gcactgaaac acctcatttc 120

cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga 180

tgaattgctc gacccgaata 200

<210> 390

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR和ATG / 截短的glnE基因

<400> 390

gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60

aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg gcgctcaaac agttaatccg 120

tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca cgtcatcctt tattgctcga 180

tgaactgctc gacccgcgca 200

<210> 391

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm4

<400> 391

accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60

gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 120

cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca tcacggaatt ttgtggttgt 180

tgctgcttaa aagggcaaat 200

<210> 392

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm4 / 破坏的nifL基因

<400> 392

catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60

ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt 120

gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180

gcgtgaacgg gtgcgttatg 200

<210> 393

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> PinfC / 破坏的nifL基因

<400> 393

tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60

gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc gccattgagc tggcttcccg 120

accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180

tgaagcatga tccctgaatc 200

<210> 394

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ PinfC

<400> 394

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga agcgtcaggt accggtcatg 120

attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg gcatcctgac cgaagagttc 180

gctggcttct tcccaacctg 200

<210> 395

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 5' UTR和ATG / 截短的glnE 基因

<400> 395

atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60

atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg gcgctgaagc acctgatcac 120

gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga 180

tgagctgctg gatcccaaca 200

<210> 396

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm1.2

<400> 396

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gcccgctgac cgaccagaac 120

ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc gcgataactg ggactacatc 180

cccattccgg tgatcttacc 200

<210> 397

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm1.2 / 破坏的nifL基因

<400> 397

tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60

cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg gccattgagc tggcttcccg 120

accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180

tgaagcatga tccctgaatc 200

<210> 398

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm6.2

<400> 398

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gctaaagttc tcggctaatc 120

gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca tttgatgccc tttttgcacg 180

ctttcatacc agaacctggc 200

<210> 399

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm6.2 / 破坏的nifL基因

<400> 399

gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60

cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga gccattgagc tggcttcccg 120

accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180

tgaagcatga tccctgaatc 200

<210> 400

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ Prm8.2

<400> 400

tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60

cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat 120

tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc 180

gggctttatc cgatgacgaa 200

<210> 401

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> Prm8.2 / 破坏的nifL基因

<400> 401

gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60

gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc gccattgagc tggcttcccg 120

accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180

tgaagcatga tccctgaatc 200

<210> 402

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> PinfC / 破坏的nifL基因

<400> 402

tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60

agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc tctttagatc tctcggtccg 120

ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta cagcaggtta tcaccggagg 180

cttaaaatga cccagttacc 200

<210> 403

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ PinfC

<400> 403

tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60

ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc tgaatatcac tgactcacaa 120

gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180

gacttgagaa atgagaagat 200

<210> 404

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> 破坏的nifL基因/ PinfC

<400> 404

tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60

gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc ctggggtcac tggagcgctt 120

tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg acctggctgg cccctgttca 180

ggttgtggtg atgaatatca 200

<210> 405

<211> 200

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

多核苷酸

<220>

<223> PinfC / 破坏的nifL基因

<400> 405

cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgcccagga 60

agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt gcaatagaac taactacccg 120

ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta tttcattcac tgaccggagg 180

cccacgatga cccagcgacc 200

<210> 406

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 406

caagaagttc gcctcacagg 20

<210> 407

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 407

tgcctcgcaa caatgttcac 20

<210> 408

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 408

cgccctcata ttgtggggat 20

<210> 409

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 409

ggcataacgc acccgttca 19

<210> 410

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

探针

<400> 410

tctgaagctc tcggt 15

<210> 411

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 411

taaactggta ctgggcgcaa ct 22

<210> 412

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 412

caaatcgaag cgccagacgg tat 23

<210> 413

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

探针

<400> 413

gaccctacga ttccc 15

<210> 414

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 414

ggtgcactct ttgcatggtt 20

<210> 415

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 415

gcgcagtctc gtaaattgcc 20

<210> 416

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

探针

<400> 416

gcgatgaccc tgaat 15

<210> 417

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 417

ctcggcagca tggacgtaa 19

<210> 418

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 418

agggtgttaa acagcgggaa a 21

<210> 419

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

探针

<400> 419

tccgaatcgt atcaa 15

<210> 420

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 420

gagccgttct ggctgcatag 20

<210> 421

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 421

gccgtcggct gatagagg 18

<210> 422

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

探针

<400> 422

tgaagcacct gatca 15

<210> 423

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 423

ggaaaacgag ttcaaccggc 20

<210> 424

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 人工序列的描述：合成

引物

<400> 424

gggcggaccg agagatctaa 20