阅读说明：本技术 新缩肽类及其用途 (Novel depsipeptides and their use ) 是由 D·休斯 A·斯波林 A·J·皮普尔斯 L·L·玲 A·尼蒂 W·米利特 A·祖洛 K 于 2018-03-30 设计创作，主要内容包括：本发明一般性涉及新缩肽类、用于制备所述新缩肽类的方法、包含所述新缩肽类的药物组合物；以及使用所述新缩肽类治疗或抑制各种病症的方法。(The present invention relates generally to novel depsipeptides, processes for preparing said novel depsipeptides, pharmaceutical compositions comprising said novel depsipeptides; and methods of using the novel depsipeptides to treat or inhibit various disorders.)

新缩肽类及其用途

相关申请

本申请要求于2017年4月4日提交的美国临时申请号62/481,412的优先权益。前述申请的全部内容以引用方式并入本文。

政府支持

本发明是在美国国立卫生研究院授予的批准号R43AI1136137-01和R44AI091224-03下伴随政府支持完成的。美国政府享有本发明的某些权利。

背景技术

在现代医学中，开发且成功使用对抗引起疾病的微生物的抗微生物剂是伟大的成就。抗微生物剂挽救了无数生命，并且减少了许多疾病和感染的并发症。然而，目前可用的抗微生物剂并不如它们曾经使用时那么有效。

随时间推移，许多微生物发展出了规避已知抗微生物剂的抗微生物作用的多种方式，且近年来，由抗多种抗微生物剂的微生物引起的感染出现了世界性增长。随着全球旅行的可行性和方便性增加，耐药性微生物在全世界的快速扩散将会变成一个严重的问题。在社区中，微生物抗性可以由以下原因导致：医院获得耐药性病原体(例如，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、耐万古霉素肠球菌(VRE))、由于在社区内使用抗生素而出现耐药性(例如，青霉素和喹诺酮耐受性奈瑟***)、由于旅行而获得抗性病原体(例如，抗生素耐受性志贺氏杆菌)或者由于在动物中使用抗微生物剂而接着抗性病原体传播到人(例如，抗生素耐受性沙门氏菌)。医院中的抗生素耐受性通常是由过度使用抗生素引起，且已经由于MRSA、VRE和多药耐药性革兰氏阴性芽胞杆菌(MDR-GNB)(例如，肠杆菌属、克雷伯杆菌属、沙雷氏菌属、柠檬酸杆菌属、假单胞菌属和大肠杆菌属)而成为一个严重的问题。特别地，细菌引起的导管相关血流感染及皮肤和软组织感染(SSTI)正成为日益严重的问题。

细菌、病毒、真菌和寄生虫均发展了对已知的抗微生物剂的抗性。抗性通常由三种机制引起：(i)改变药物靶标而使得抗微生物剂结合性差，从而控制感染的作用减弱；(ii)由于药物渗透性遭破坏或药物主动流出而导致达到靶标的药物减少；和(iii)药物被微生物产生的酶进行酶促灭活。抗微生物剂抗性给微生物提供了生存优势，并使得更难从机体消除微生物感染。对抗微生物感染的困难增加导致在医院及其他环境中发生感染的风险增大。现在，疾病比如结核病、疟疾、淋病和儿童期耳部感染比仅仅几十年前更难治疗。对于收治在无抗生素帮助的情况下几乎不能抵御感染的重症患者的医院而言，耐药性是一个重大的问题。令人遗憾的是，在这些患者中抗生素的大量使用选择出了带有耐药性的微生物的变化。这些耐药性细菌能抵抗我们最强的抗生素，并继续困扰着易感的医院患者。已经报道接受住院的5至10％的患者在其住院期间获得感染，且在近十年中该风险稳步上升。

鉴于这些问题，迫切需要抵抗微生物感染和日益增加的耐药性问题的新的抗微生物剂。再度聚焦抗微生物剂药物的发现是很关键的，因为病原体正对现在可用的药物发展出抗性。

尽管结合了组合合成、高通量筛选、高级药物化学、基因组学和蛋白组学及合理药物设计的成果，合成化合物迄今仍未能替代天然抗生素并产生新的广谱化合物类型。获得新合成抗生素存在的问题可能部分地与合成抗生素总是被多药耐药泵(MDR)跨细菌外膜屏障泵出相关。细菌外膜是两亲性化合物(基本上所有的药物是两亲性化合物)的屏障，且MDR跨该屏障将药物逐出。生物进化已经产生了可以很大程度上绕过该双重屏障/逐出机制的抗生素，但是合成化合物几乎总是失败。

发明内容

因此，本发明提供了能够抵抗微生物感染的新型抗微生物化合物，以克服日益增长的耐药性问题。在一些实施方式中，本发明提供了一种式(I)所示的分离的化合物：

或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体或药学上可接受的盐，其中：

每个立体中心用“*”表示，并且可以独立地为R或S构型；

每个R_1’、R_2’、R_3’、R_4’、R_5’和R_6’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基、取代或未取代的芳基、-NR_bR_b’、-COR_c、-COOR_d、–CONR_eR_e’和氨基酸侧链；

其中每个R_a、R_a’、R_b、R_b’、R_c、R_d、R_e和R_e’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基和取代或未取代的芳基；

X是–O-、-S-或–N-；且

n是1至5的整数。在一些实施方式中，n是2至4的整数。

在一个特定的实施方式中，X是–O-。在另一个特定的实施方式中，X是–N-。在又一个特定的实施方式中，X是–S-。

在一些方面中，分离的化合物是式(II)所示的化合物：

或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体或药学上可接受的盐，其中

每个立体中心用“*”表示，并且可以独立地为R或S构型；

每个R₁、R₂、R₃、R₄、R₅、R₆、R₇和R₈独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基、取代或未取代的芳基、-NR_bR_b’、-COR_c、-COOR_d、–CONR_eR_e’和氨基酸侧链；

其中每个R_b、R_b’、R_c、R_d、R_e、R_e’、R_f和R_f’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基和取代或未取代的芳基；且

X是–O-、-S-或–N-。

在一个特定的实施方式中，X是–O-。在另一个特定的实施方式中，X是–N-。在又一个特定的实施方式中，X是–S-。

在一些方面中，R₁是苄基。在一些方面中，R_a和R_a’均是氢。在一些方面中，R₂是取代或未取代的烷基。在一个特定的方面中，取代或未取代的烷基是异丁基。

在一些实施方式中，R₃是取代或未取代的烷基，例如，氨基取代的丁基。在一些实施方式中，R₄是取代或未取代的烷基，例如羟基取代的甲基。在一些方面中，R₅是–CONR_eR_e’。在进一步的方面中，R_e和R_e’均是氢。在一些实施方式中，R₆是取代或未取代的烷基，例如甲基。在一些方面中，R₇是取代或未取代的烷基，例如异丁基。在一些方面中，R₈是取代或未取代的烷基，例如异丁基。

在一些实施方式中，分离的化合物是式(III)所示的化合物：

在一些实施方式中，本发明的分离的化合物选自由下述化合物组成的组：

在一些方面中，本发明提供了一种包含如上所述的本发明化合物的培养基。在进一步的方面中，所述培养基还包含属于β-变形菌纲的细菌细胞。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种包含如上所述的本发明化合物的细菌裂解物。在进一步的方面中，所述细菌裂解物由属于β-变形菌纲的细菌细胞所产生。在一些方面中，所述细菌细胞是培养的细菌细胞。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种药物组合物，其包含如上所述的本发明化合物以及药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂。在一些实施方式中，所述药物组合物还包含选自以下的药剂：抗生素、抗真菌剂、抗病毒剂、抗原生动物剂、驱虫剂、抗肿瘤剂、免疫调节剂、抗高胆固醇血症剂及其组合。

在一些实施方式中，本发明还包含一种生产如上所述的本发明化合物的方法，其在培养基中培养属于β-变形菌纲的细菌细胞，其中所述培养基在有氧条件下包含可吸收的碳源、氮源和无机盐，从而生产所述化合物。在进一步的实施方式中，所述方法还包括分离所述化合物。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种根据如上所述的方法制备的化合物，例如式(I)所示的化合物。

在一些方面中，本发明还提供了一种在有需要的受试者中治疗病症的方法，其包括向所述受试者施用有效量的如上所述的本发明化合物，从而在所述受试者中治疗所述病症。

在一些实施方式中，所述受试者选自动物和植物。在进一步的方面中，所述动物是哺乳动物。例如人或家畜。

在一些方面中，所述病症由选自以下的病原体引起：细菌、真菌、病毒、原生动物、蠕虫、寄生虫及其组合。

在一个方面中，所述病原体是细菌。在进一步的方面中，所述细菌是***，例如属于选自以下的属的***：链球菌属(Streptococcus)，葡萄球菌属(Staphylococcus)，肠球菌属(Enterococcuss)，棒状杆菌属(Corynebacteria)，李斯特菌属(Listeria)，芽胞杆菌属(Bacillus)，丹毒丝菌属(Erysipelothrix)，分枝杆菌属(Mycobacterium)，梭菌属(Clostridium)和放线菌属(Actinomycetes)。在一些方面中，所述***属于选自以下的属或种：甲氧西林敏感性和甲氧西林耐受性的葡萄球菌(包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcusepidermidis)、溶血性葡萄球菌(Staphylococcus haemolyticus)、人型葡萄球菌(Staphylococcus hominis)、腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus)和凝固酶阴性葡萄球菌)，糖肽类中间体敏感性的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)(GISA)，青霉素敏感性和青霉素耐受性的链球菌(包括肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)、化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)、无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)、停乳链球菌(Streptococcus dysgalactiae)、鸟链球菌(Streptococcus avium)、牛链球菌(Streptococcus bovis)、乳酸链球菌(Streptococcus lactis)、血链球菌(Streptococcussangius)、咽峡炎链球菌(Streptococcus anginosus)、中间链球菌(Streptococcusintermedius)、星座链球菌(Streptococcus constellatus)以及C群链球菌、G群链球菌和绿色链球菌(Viridans streptococci))，肠球菌(包括万古霉素敏感性和万古霉素耐受性的菌株，如粪肠球菌(Enterococcus faecalis)和屎肠球菌(Enterococcus faecium))，艰难梭菌(Clostridium difficile)，梭状梭菌(Clostridium clostridiiforme)，无毒梭菌(Clostridium innocuum)，产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)，破伤风梭菌(Clostridium tetani)，结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)，鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium)，胞内分枝杆菌(Mycobacterium intracellulare)，关西分枝杆菌(Mycobacterium kansaii)，戈氏分枝杆菌(Mycobacterium gordonae)，分枝杆菌子孢子(Mycobacteria sporozoites)，单核细胞增生性李斯特菌(Listeria monocytogenes)，枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)，炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)，白喉棒状杆菌(Corynebacterium diphtheriae)，杰氏棒状杆菌(Corynebacterium jeikeium)，棒状杆菌子孢子(Corynebacterium sporozoites)，红斑丹毒丝菌(Erysipelothrixrhusiopathiae)，沃氏葡萄球菌(Staphylococcus warneri)和衣氏放线菌(Actinomycesisraelli)。

在一个特定的实施方式中，所述细菌是炭疽杆菌(Bacillus anthracis)。

在一些实施方式中，所述细菌是革兰氏阴性细菌，例如属于选自以下的属或种的革兰氏阴性细菌：幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)，嗜肺军团菌(Legionellapneumophilia)，淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae)，脑膜炎奈瑟菌(Neisseriameningitidis)，致病性弯曲杆菌子孢子(Campylobacter sporozoites)，流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)，铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)，产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)，阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)，肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)，产酸克雷伯氏杆菌(Klebsiella oxytoca)，多杀巴斯德菌(Pasteurella multocida)，拟杆菌子孢子(Bacteroides sporozoites)，脆弱拟杆菌(Bacteriodes fragilis)，多形拟杆菌(Bacteriodes thetaiotaomicron)，单形拟杆菌(Bacteriodes uniformis)，普通拟杆菌(Bacteriodes vulgatus)，具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum)，念珠状链杆菌(Streptobacillus moniliformis)，钩端螺旋体(Leptospira)，大肠杆菌(Escherichia coli)，肠道沙门氏菌(Salmonella enterica)，萨拉曼沙门氏菌(Salmonella salamae)，亚利桑那沙门氏菌(Salmonella arizonae)，双亚利桑那沙门氏菌(Salmonella diarizonae)，豪顿沙门氏菌(Salmonella houtenae)，邦戈尔沙门氏菌(Salmonella bongori)，印度沙门氏菌(Salmonella indica)，肠炎沙门氏菌(Salmonella Enteritidis)，伤寒沙门氏菌(Salmonella typhi)和弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)。

在一些方面中，所述病原体是病毒，例如选自以下的病毒：逆转录病毒科(Retroviridae)，小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)，杯状病毒科(Calciviridae)，披膜病毒科(Togaviridae)，黄病毒科(Flaviridae)，冠状病毒科(Coronaviridae)，弹状病毒科(Rhabdoviridae)，丝状病毒科(Filoviridae)，副粘病毒科(Paramyxoviridae)，正粘病毒科(Orthomyxoviridae)，布尼亚病毒科(Bungaviridae)，沙粒病毒科(Arenaviridae)，呼肠病毒科(Reoviridae)，双RNA病毒科(Birnaviridae)，嗜肝DNA病毒科(Hepadnaviridae)，细小病毒科(Parvoviridae)，乳多空病毒科(Papovaviridae)，腺病毒科(Adenoviridae)，疱疹病毒科(Herpesviridae)，痘病毒科(Poxviridae)和彩虹病毒科(Iridoviridae)。在进一步的实施方式中，所述病毒选自：流感病毒、人免疫缺陷病毒和单纯疱疹病毒。

在一些方面中，所述病原体是原生动物，例如选自以下的原生动物：***毛滴虫(Trichomonas vaginalis)，兰伯氏贾第虫(Giardia lamblia)，溶组织内阿米巴虫(Entamoeba histolytica)，结肠小袋虫(Balantidium coli)，微细隐孢球虫(Cryptosporidium parvum)和贝氏等孢子球虫(Isospora belli)，克氏锥虫(Trypansomacruzi)，冈比亚锥虫(Trypanosoma gambiense)，杜氏利什曼虫(Leishmania donovani)和福氏耐格里变形虫(Naegleria fowleri)。

在一些实施方式中，所述病原体是蠕虫，例如选自以下的蠕虫：曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni)，血吸虫尾蚴(Schistosoma cercariae)，日本血吸虫(Schistosoma japonicum)，湄公血吸虫(Schistosoma mekongi)，埃及血吸虫(Schistosoma hematobium)，人蛔虫(Ascaris lumbricoides)，粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)，细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)，多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)，广州管圆线虫(Angiostrongylus cantonensis)，脊形管圆线虫(Angiostrongylus constaricensis)，布氏姜片虫(Fasciolopis buski)，菲律宾毛线虫(Capillaria philippinensis)，卫氏并殖吸虫(Paragonimus westermani)，十二指肠钩口线虫(Ancylostoma dudodenale)，美洲钩虫(Necator americanus)，旋毛线虫(Trichinella spiralis)，班氏吴策丝虫(Wuchereria bancrofti)，马来丝虫(Brugiamalayi)和帝纹丝虫(Brugia timori)，犬弓蛔虫(Toxocara canis)，猫弓蛔虫(Toxocaracati)，牛弓首蛔虫(Toxocara vitulorum)，秀丽隐杆线虫(Caenorhabiditis elegans)和异尖线虫(Anisakis)的种。

在一些方面中，所述病原体是寄生虫，例如选自以下的寄生虫：恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)，约氏疟原虫(Plasmodium yoelli)，短膜壳绦虫(Hymenolepisnana)，华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)，罗阿丝虫(Loa loa)，卫氏并殖吸虫(Paragonimus westermani)，肝片吸虫(Fasciola hepatica)和刚地弓形虫(Toxoplasmagondii)。在进一步的方面中，所述病原体是疟原虫。

在一些实施方式中，所述病原体是真菌，例如选自以下的真菌：新型隐球菌(Cryptococcus neoformans)，荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum)，粗球孢子菌(Coccidioides immitis)，皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)，沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)，白色念珠菌(Candida albicans)，热带假丝酵母(Candidatropicalis)，光滑念珠菌(Candida glabrata)，克鲁斯假丝酵母(Candida krusei)，***滑念珠菌(Candida parapsilosis)，都柏林假丝酵母(Candida dubliniensis)，葡萄牙假丝酵母(Candida lusitaniae)，絮状表皮癣菌(Epidermophyton floccosum)，奥氏小孢子菌(Microsporum audouinii)，犬小孢子菌(Microsporum canis)，犬小孢子菌扭曲变种(Microsporum canis var.distortum)，库克小孢子菌(Microsporum cookei)，马类小孢子菌(Microsporum equinum)，铁锈色小孢子菌(Microsporum ferrugineum)，粉小孢子菌(Microsporum fulvum)，鸡小孢子菌(Microsporum gallinae)，石膏样小孢子菌(Microsporum gypseum)，矮小孢子菌(Microsporum nanum)，桃色小孢子菌(Microsporumpersicolor)，埃泽楼发癣菌(Trichophyton ajelloi)，同心性发癣菌(Trichophytonconcentricum)，马发癣菌(Trichophyton equinum)，淡黄发癣菌(Trichophytonflavescens)，光辉发癣菌(Trichophyton gloriae)，麦格发癣菌(Trichophytonmegnini)，人类须毛癣菌(Trichophyton mentagrophytes var.erinacei)，须癣发癣菌趾间变种(Trichophyton mentagrophytes var.interdigitale)，豆形须毛癣菌(Trichophyton phaseoliforme)，红色发癣菌(Trichophyton rubrum)，红色发癣菌绒毛菌株，红色发癣菌粒状菌株，许兰氏发癣菌(Trichophyton schoenleinii)，猴毛癣菌(Trichophyton simii)，苏丹发癣菌(Trichophyton soudanense)，土生毛癣菌(Trichophyton terrestre)，断发毛癣菌(Trichophyton tonsurans)，范氏毛癣菌(Trichophyton vanbreuseghemii)，疣状发癣菌(Trichophyton verrucosum)，堇色发癣菌(Trichophyton violaceum)，赤非发癣菌(Trichophyton yaoundei)，烟曲霉(Aspergillusfumigatus)，黄曲霉(Aspergillus flavus)和棒状曲霉(Aspergillus clavatus)。

在一些方面中，本发明还提供了一种抑制传染源生长的方法，其包括将所述传染源与如上所述的本发明化合物接触。在一些方面中，所述传染源是在体外培养的。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种在细菌细胞中抑制肽聚糖合成的方法，其包括将所述细菌细胞与如上所述的本发明化合物接触。

附图说明

图1是柱状图，其显示了在感染金黄色葡萄球菌ATCC 33591并使用本发明化合物和万古霉素治疗的中性白细胞减少性小鼠大腿感染模型中的平均细菌菌落数(以平均log₁₀CFU/克大腿表示)。

具体实施方式

本发明一般性涉及新缩肽类、用于制备所述新缩肽类的方法、包含所述新缩肽类的药物组合物以及使用所述新缩肽类治疗或抑制各种病症(例如，细菌感染)的方法。本发明涉及对很多细菌病原体具有广泛活性的新型抗生素，所述细菌病原体包括对其他抗生素具有抗性的菌株，特别是革兰氏阳性病原体。本文公开的化合物具有有利的生物利用度和较低毒性。

定义

为方便起见，此处汇集了在说明书、实施例和所附权利要求书中使用的一些术语。除非另有定义，否则本文使用的所有技术术语和科学术语具有与本发明所属领域普通技术人员所通常理解的相同的含义。除非另有说明，否则为本文中的基团或术语所提供的初始定义适用于在整个说明书中单独的或作为另一基团的部分的基团或术语。

本文使用的冠词“一(a)”和“一个(an)”是指一个或超过一个(即，至少一个)该冠词的语法对象。例如，“一要素”指一个要素或超过一个要素。

除非上下文另有清楚指示，否则本文使用的术语“或”是指术语“和/或”，且可与其互换地使用。

本文使用的术语“基本上相同”是指两个比较对象具有至少90％的共同特征。在某些实施方式中，两个对象的共同特征为至少95％。在某些其他实施方式中，两个对象的共同特征为至少99％。

本文使用的术语“分离的”是指基本上不含与其在其天然环境中相关的其他物质的本发明化合物。例如，分离的化合物可以基本上不含污染物质，例如来自化合物所来源的细胞的细胞物质或污染物质，或者当化学合成时基本上不含化学前体或其他化学物质。基本上不含其他物质通常是指例如少于约30％、或20％、或15％、或10％、或5％、或2％(以干重计)的杂质。在一些实施方式中，分离的化合物是基本上纯的。在一些实施方式中，具有少于约10％(以干重计)的来自细胞的污染物质或化学前体的化合物制品被认为是基本上纯的。在其他实施方式中，具有少于约5％、约4％、约3％、约2％、约1％(以干重计)的来自细胞的污染物质或化学前体的化合物制品被认为是基本上纯的。

除非另有说明，否则具有不满足化合价的任何杂原子都被认为具有足以满足化合价的氢原子。

术语“加热”包括但不限于通过常规加热(例如，电加热、蒸汽加热、气体加热等)以及微波加热而进行升温。

如本文使用的术语“药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂”是指参与携带或转运对象药剂从机体的一个器官或部分到机体的另一个器官或部分的药学上可接受的材料、组合物或媒介，例如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料。每种载体必须在与制剂中的其他组分相容以及对患者无害的意义上是“可接受的”。

对于受试者而言的术语“治疗”是指改善受试者病症的至少一个症状。治疗可以是治愈病症或病况，或者改善病症或病况。

除非上下文另有清楚指示，苟泽本文使用的术语“病症(disorder)”是指术语疾病(disease)、病况(condition)或病态(illness)，且与其可互换使用。

本文使用的术语“微生物”是指生物体，比如细菌、病毒、原生动物或真菌，尤其是传播疾病的生物体。

本文使用的短语“药学上可接受的”是指在合理的医学判断范围内，适用于与人类、动物和植物的组织接触而不具有过度的毒性、刺激性、过敏反应或其他问题或并发症，与合理的收益/风险比相应的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。

在整个说明书中，可以选择基团及其取代基以提供稳定的部分和化合物。

本发明的化合物

在一些实施方式中，本发明教导涉及一种式(I)所示的分离的化合物：

或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体或药学上可接受的盐，其中：

每个立体中心用“*”表示，并且可以独立地为R或S构型；

每个R_1’、R_2’、R_3’、R_4’、R_5’和R_6’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基、取代或未取代的芳基、-NR_bR_b’、-COR_c、-COOR_d、–CONR_eR_e’和氨基酸侧链；

其中每个R_a、R_a’、R_b、R_b’、R_c、R_d、R_e和R_e’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基和取代或未取代的芳基；

X是–O-、-S-或–N-；且

n是1至5的整数。

在一个特定的实施方式中，X是–O-。在另一个特定的实施方式中，X是–N-。在又一个特定的实施方式中，X是–S-。

在一个实施方式中，n是1至2的整数。在一个实施方式中，n是2至3的整数。在另一个实施方式中，n是3至4的整数。在又一个实施方式中，n是4至5的整数。在一些实施方式中，n是1、2、3、4或5。

在一些实施方式中，氨基酸侧链是天然氨基酸侧链。在其他实施方式中，氨基酸侧链是非天然氨基酸侧链。

在一些实施方式中，R_a和R_a’均是氢。

在一些实施方式中，R_b和R_b’均是氢。

在一些实施方式中，R_e和R_e’均是氢。

在一些实施方式中，本发明教导涉及一种式(II)所示的分离的化合物：

或其对映异构体、非对映异构体、互变异构体或药学上可接受的盐，其中：

每个立体中心用“*”表示，并且可以独立地为R或S构型；

每个R₁、R₂、R₃、R₄、R₅、R₆、R₇和R₈独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的烯基、取代或未取代的炔基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基、取代或未取代的芳基、-NR_bR_b’、-COR_c、-COOR_d、–CONR_eR_e’和氨基酸侧链；

其中每个R_b、R_b’、R_c、R_d、R_e、R_e’、R_f和R_f’独立地选自：氢、取代或未取代的烷基、取代或未取代的环烷基、取代或未取代的环烯基和取代或未取代的芳基；且

X是–O-、-S-或–N-。

在一个特定的实施方式中，X是–O-。在另一个特定的实施方式中，X是–N-。在又一个特定的实施方式中，X是–S-。

在一些实例中，X是–O-且R_f和R_f’均是氢。

在一些实例中，R₁可以是苄基。在一些实例中，R₂可以是取代或未取代的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或异丁基。在一个特定的实施方式中，R₂是异丁基。

在一些实例中，R₃可以是取代或未取代的烷基，例如氨基取代的丁基。在一些实例中，R₄可以是取代或未取代的烷基，例如羟基取代的甲基。在一些实例中，R₅可以是取代或未取代的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或异丁基、或者–CONR_eR_e’。在一个方面中，R₅是甲基。在另一个方面中，R₅是–CONR_eR_e’，且R_e和R_e’均是氢。

在一些方面中，R₆可以是取代或未取代的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或异丁基。在一个特定的实施方式中，R₂是甲基。在一些实例中，R₇可以是取代或未取代的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或异丁基。在一个特定的实施方式中，R₇是异丁基。在一些实例中，R₈可以是取代或未取代的烷基，例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基或异丁基。在一个特定的实施方式中，R₈是异丁基。

在一些实施方式中，R₁、R₂、R₃、R₄、R₅、R₆、R₇和R₈各自可以独立地是氨基酸侧链，例如D-氨基酸侧链或L-氨基酸侧链。氨基酸侧链可以是天然氨基酸链，例如丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸、组氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、丝氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸或缬氨酸侧链。氨基酸侧链也可以是非天然氨基酸侧链，例如本领域公知的任何非天然氨基酸的侧链。非天然氨基酸侧链的非限制性实例包括例如在Sigma-Aldrich目录中列出的非天然氨基酸侧链，其全部内容通过引用并入本申请。在一个实施方式中，非天然氨基酸侧链可以是β-羟基谷氨酰胺。

例如，在一些实施方式中，R₁可以是苯丙氨酸(例如，D-苯丙氨酸或L-苯丙氨酸)侧链。在一些实例中，R₂、R₇或R₈可以是亮氨酸(例如，D-亮氨酸或L-亮氨酸)侧链。在一些实例中，R₃可以是赖氨酸(例如，D-赖氨酸或L-赖氨酸)侧链。在一些实例中，R₄可以是丝氨酸(例如，D-丝氨酸或L-丝氨酸)侧链。在一些实例中，R₆可以是丙氨酸(例如，D-丙氨酸或L-丙氨酸)侧链。

在一些实施方式中，R_b和R_b’均是氢。在一些实施方式中，R_e和R_e’均是氢。在一些实施方式中，R_f和R_f’均是氢。

术语“烷基”是指含有1至12个碳原子(例如，对于直链为1至6个碳原子或对于支链为3至6个碳原子)的直链或支链脂肪族基团。示例性的“烷基”包括甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、叔丁基、异丁基、戊基、己基、异己基、庚基、4,4-二甲基戊基、辛基、2,2,4-三甲基戊基、壬基、癸基、十一烷基、十二烷基等。

术语“烯基”是指含有2至12个碳原子(例如，对于直链为2至6个碳原子或对于支链为3至6个碳原子)和至少一个碳-碳双键的直链或支链烃基。示例性的“烯基”基团包括乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基、庚烯基、辛烯基、壬烯基、癸烯基等。

术语“炔基”是指含有2至12个碳原子(例如，对于直链为2至6个碳原子或对于支链为3至6个碳原子)和至少一个碳-碳三键的直链或支链烃基。示例性的此类基团包括乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基、庚炔基、辛炔基、壬炔基、癸炔基等。

术语“环烷基”是指含有1至4个环且每个环3至8个碳的完全饱和的环状烃基。示例性的此类基团包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基等。术语“环烷基”还包含可以进一步包含取代烃骨架上的一个或多个碳的氧、氮、硫或磷原子的环烷基基团。

术语“环烯基”是指含有1至4个环且每个环3至8个碳的部分不饱和的环状烃基。示例性的此类基团包括环丁烯基、环戊烯基、环己烯基等。

术语“芳基”是指含有1至5个芳香环的环状芳香烃基，尤其是单环或二环基团例如苯基、联苯基或萘基。当含有两个或更多个芳香环(例如，二环或三环)时，芳基的芳香环可以在单一点结合(例如，联苯基)或稠合(例如，萘基、菲基等)。术语“芳基”亦指例如5元和6元单环芳香基团的基团，其可以包含0至4个杂原子，如吡咯、呋喃、噻吩、噻唑、异噻唑、咪唑、***、四唑、吡唑、噁唑、异噁唑、吡啶、吡嗪、哒嗪和嘧啶等。此外，术语“芳基”包括多环芳基，例如三环、双环，例如萘、苯并噁唑、苯并二噁唑、苯并噻唑、苯并咪唑、苯并噻吩、亚甲基二氧苯基、喹啉、异喹啉、萘啶、吲哚、苯并呋喃、嘌呤、苯并呋喃、脱氮嘌呤或吲哚嗪。还可以将在环结构中具有杂原子的那些芳基称为“芳基杂环”、“杂环”、“杂芳基”或“芳香杂环”。

如在本发明教导中所述的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基或芳基可以是未取代的或取代的。术语“取代的”是指具有取代烃骨架上的一个或多个碳上的氢的至少一个(例如，1、2、3、4个或更多个)取代基的烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基或芳基。此类取代基可以包括例如烷基、烯基、炔基、乙酰基、芳基、羟基、卤素(例如，-Br、-Cl、-I或–F)、-OR、SR、NR₂、COOH、COOR或COR，其中R是氢或含有1至6个碳的烷基。

在一些实例中，本发明的分离的化合物是式(III)所示的化合物：

其中每个立体中心用“*”表示，并且可以独立地为R或S构型。

在一些实施方式中，分离的化合物是具有如下表1中所示结构的化合物。

表1：本发明的化合物

在一些实施方式中，可以将本发明的化合物(例如，式(III)所示的化合物)称为Novo29。Novo29是一种分子量为902g/摩尔的缩肽。不希望受到理论的束缚，据信Novo29可能是一种肽聚糖合成抑制剂，其可能通过结合脂质II和脂质III而发挥其抗细菌性质。

在一些实施方式中，当加至血清中高达500μg/mL时，本发明的化合物未显示出胶凝。

在一些实施方式中，还可以分别使用¹³C或²H替代本发明化合物(例如，式(I)、式(II)、式(III)化合物，或表1的化合物)中的任何碳或氢。

如本文使用的短语“本发明化合物”、“式(I)化合物”、“式(II)化合物”、“式(III)化合物”或“表1的化合物”意在包括其对映异构体、非对映异构体、互变异构体和药学上可接受的盐。本发明的缩肽类化合物及其盐可以以其互变异构体形式(例如，作为酰胺或胍)存在。所有此类互变异构体形式均作为本发明的一部分包括在本文中。还可以将本发明的化合物(例如，从β-变形菌中分离的化合物)称为“Novo29”。在一些实施方式中，本发明教导涉及立体异构体的混合物。在其他实施方式中，本发明教导具体涉及本发明化合物的单一立体异构体。

在一些实施方式中，本发明化合物是细菌物种的经分离天然产物。例如，在一些实施方式中，本发明化合物是此前未经过培养的β-变形菌的经分离天然产物。

本发明的缩肽类化合物的所有立体异构体(例如，由于各种取代基上的不对称碳而可能存在的那些)包括对映体形式和非对映体形式，且均包括在本发明的范围内。在一个实施方式中，本发明化合物是混合物。或者，然而，本发明化合物是基本上不含其他立体异构体的单一立体异构体(例如，具有特定活性的纯的或基本上纯的光学异构体)。在一些实施方式中，本发明涉及存在少于约10％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在少于约5％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在少于约2％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在少于约1％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在约5％(以干重计)至约10％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在约1％(以干重计)至约5％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在约1％(以干重计)至约10％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。在一些实施方式中，本发明涉及存在约5％(以干重计)至约10％(以干重计)的其他异构体的单一立体异构体。无关化合物占比少于2％(以干重计)。在其他实施方式中，本发明教导涉及立体异构体的混合物。本发明化合物的手性中心可以具有如IUPAC 1974推荐命名法所定义的S或R构型。可以通过物理方法解析立体异构形式，所述物理方法例如分级结晶、非对映异构体衍生物的分离或结晶或者通过手性柱层析分离。可以通过任意适宜的方法从立体异构体的混合物获得单独的光学异构体，所述方法包括但不限于常规方法例如与光学活性的酸形成盐，随后结晶。

发明的缩肽类化合物可以在其制备之后例如经分离和纯化以获得包含等于或大于90％(以干重计)的量的组合物，然后将其如本文所述进行使用或配制。发明的缩肽类化合物可以在其制备之后例如经分离和纯化以获得包含等于或大于95％(以干重计)的量的组合物，然后将其如本文所述进行使用或配制。发明的缩肽类化合物可以在其制备之后例如经分离和纯化以获得包含约90％(以干重计)至约95％(以干重计)的量的组合物，然后将其如本文所述进行使用或配制。发明的缩肽类化合物可以在其制备之后例如经分离和纯化以获得包含约85％(以干重计)至约95％(以干重计)的量的组合物，然后将其如本文所述进行使用或配制。发明的缩肽类化合物可以在其制备之后例如经分离和纯化以获得包含约95％(以干重计)至约99％(以干重计)的量的组合物，然后将其如本文所述进行使用或配制。

包括本发明化合物的所有构型异构体，其可以是混合物，也可以是纯的或基本上纯的形式。

在另一实施方式中，本发明涉及一种药物组合物，其包含本教导中所述的化合物以及药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂。在某些实施方式中，组合物还包含选自以下的药剂：抗生素、抗真菌剂、抗病毒剂、抗原生动物剂、驱虫剂、抗肿瘤剂、免疫调节剂、抗高胆固醇血症剂及其组合。

本发明的缩肽类化合物可以成盐，其也在本发明的范围内。除非另有说明，否则应将本文中提及的本发明化合物理解为包括提及其盐。如在本文中所使用的术语“盐”表示与无机和/或有机酸形成的酸性盐。药学上可接受的(即，无毒的、生理学上可接受的)盐是优选的，但是也可以使用其他盐，例如在制备过程中使用的分离或纯化步骤中。例如，可以通过将本发明的化合物与一定量的酸(如等量的酸)在介质(如在其中盐发生沉淀的介质)中或者在水性或水性和有机介质中反应，然后冻干而形成本发明化合物的盐。

含有碱性部分(比如，但不限于胺)的本发明的缩肽类化合物可以与各种有机酸和无极酸成盐。示例性的酸加成盐包括乙酸盐(例如与乙酸或三卤乙酸例如三氟乙酸形成的那些)、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、柠檬酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、富马酸盐、葡糖庚酸盐(glucoheptanoate)、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、羟基乙磺酸盐(例如2-羟基乙磺酸盐)、乳酸盐、马来酸盐、甲磺酸盐、萘磺酸盐(例如2-萘磺酸盐)、烟酸盐、硝酸盐、草酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、苯基丙酸盐(例如3-苯基丙酸盐)、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、水杨酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐(例如与硫酸形成的那些)、磺酸盐、酒石酸盐、硫代氰酸盐、甲苯磺酸盐如对甲苯磺酸盐(tosylate)、十一酸盐等。

制备本发明化合物的方法

本教导还涉及用于生产本发明化合物(例如，式(I)、式(II)、式(III)化合物或者表1的化合物，如上所述)的方法。

所述方法包括在需氧条件下在含有可吸收的碳源、氮源和无机盐的培养基中培养(cultivating)或培养(culturing)β-变形菌，并且能够产生可测定量的本发明化合物。

在某些实施方式中，所述方法还包括分离和/或纯化本发明化合物。可以通过离心发酵液(例如，以10,000rpm离心20分钟)并且例如通过反相色谱分离和/或纯化本发明化合物而分离本发明化合物。

在一些实施方式中，所述方法还包括分离和/或纯化本发明化合物至至少约75％纯度(以干重计)，例如至至少约80％纯度(以干重计)、至少约85％纯度(以干重计)、至少约90％纯度(以干重计)、至少约95％纯度(以干重计)、至少约97％纯度(以干重计)或至少约99％纯度(以干重计)。

在又一个实施方式中，本发明涉及一种根据本文所述的方法制备的本发明化合物。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种培养基，其包含本发明化合物，例如式(I)、式(II)、式(III)化合物，或者表1的化合物。所述培养基可以是适于培养细菌细胞(例如，属于β-变形菌纲的细菌细胞)的培养基。

在一些实施方式中，本发明还提供了一种细胞裂解物(例如，细菌细胞裂解物)，其包含本发明化合物，例如式(I)、式(II)、式(III)化合物，或者表1的化合物。可以使用细菌细胞(例如，属于β-变形菌纲的经培养细菌细胞)制备该细菌细胞裂解物。

或者，可以使用本领域已知的合成方法合成本发明化合物，例如式(I)、式(II)、式(III)化合物，或者表1的化合物。

使用本发明化合物的治疗方法

本发明还提供了抑制病原体生长的方法。所述方法包括将病原体与有效量的一种或多种本发明的缩肽类化合物接触，从而与在不存在使用所述化合物治疗的情况下病原体的生长相比抑制病原体的生长。在某些实施方式中，与在不存在使用所述化合物治疗的情况下病原体的生长相比，所述方法减少病原体的生长。在其他情况下，治疗导致杀灭病原体。病原体的非限制性实例包括，但不限于细菌、真菌、病毒、原生动物、蠕虫、寄生虫及其组合。这些方法可以在体内或体外实施。

本发明缩肽类化合物对于特定细菌的抗细菌活性可以通过体外测定如监测抑菌圈和最小抑菌浓度(MIC)测定而进行评估。本发明缩肽类化合物的抗真菌活性例如可以通过追踪目标真菌病原体(如白色念珠菌(Candida albicans)和曲霉属(Aspergillus)物种)的存活力来测定，例如如在Sanati等，A new triazole,voriconazole(UK-109,496),blocks sterol biosynthesis in Candida albicans and Candida krusei,Antimicrob.Agents Chemother.,1997年11月；41(11):2492–2496中所描述的，其全部内容通过引用并入本文。本发明缩肽类化合物的抗病毒性质例如可以通过监测流感神经氨酸酶的抑制情况或通过测定病毒存活力来测定，如在Tisdale M.,Monitoring of viralsusceptibility:new challenges with the development of influenza NAinhibitors,Rev.Med.Virol.,2000Jan-Feb；10(1):45-55中所描述的，其全部内容通过引用并入本文。本发明缩肽类化合物的抗-原生动物活性可以通过追踪原生动物寄生虫如***毛滴虫(Trichomonas vaginalis)和兰伯氏贾第虫(Giardia lamblia)的存活力来测定，如在Katiyar等，Antiprotozoal activities of benzimidazoles and correlationswith beta-tubulin sequence,Antimicrob.Agents Chemother.,1994年9月；38(9):2086–2090中所描述的，其全部内容通过引用并入本文。本发明缩肽类化合物的驱虫活性例如可以通过追踪所述化合物对线虫类如曼氏血吸虫(Schistosoma mansoni)、血吸虫尾蚴(Schistosoma cercariae)和秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的存活力的作用来测定，如在P.等，Traditional herbal remedies used for the treatmentof urinary schistosomiasis in Zimbabwe,J.Ethnopharmacol.,1994年4月；42(2):125-32中所描述的，其全部内容通过引用并入本文。

在其他实施方式中，本发明涉及通过向有需要的受试者施用有效量的一种或多种本文所述的缩肽类化合物而在所述受试者中治疗病症(例如，病原体感染)的方法。在某些实施方式中，所述病症是由病原体引起的，所述病原体例如但不限于细菌、真菌、病毒、原生动物、蠕虫、寄生虫或其组合。

在一些实施方式中，所述病症是由细菌引起的。本文所述的缩肽类化合物可以用于抗***和革兰氏阴性细菌。特别地，所述病症可以由***引起。或者，所述病症可以由革兰氏阴性细菌引起。***的非限制性实例包括属于选自以下属的细菌：链球菌属(Streptococcus)，葡萄球菌属(Staphylococcus)，肠球菌属(Enterococcuss)，棒状杆菌属(Corynebacteria)，李斯特菌属(Listeria)，芽胞杆菌属(Bacillus)，丹毒丝菌属(Erysipelothrix)和放线菌属(Actinomycetes)。在一些实施方式中，本发明化合物用于治疗由下述一种或多种引起的感染：幽门螺旋杆菌(Helicobacterpylori)、嗜肺军团菌(Legionella pneumophilia)、结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)、鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium)、胞内分枝杆菌(Mycobacteriumintracellulare)、堪萨斯分支杆菌(Mycobacterium kansaii)、戈登分枝杆菌(Mycobacterium gordonae)、分枝杆菌子孢子、金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、淋病奈瑟氏菌(Neisseriagonorrhoeae)、脑膜炎奈瑟氏菌(Neisseria meningitidis)、单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes)、酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)(A群链球菌属)、产脓无乳链球菌(Streptococcus agalactiae pyogenes)(B群链球菌属)、停乳链球菌(Streptococcus dysgalactiae)、粪链球菌(Streptococcus faecalis)、牛链球菌(Streptococcus bovis)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)、病原性弯曲杆菌(Campylobacter)孢子体、肠球菌(Enterococcus)孢子体、流感嗜血杆菌(Haemophilusinfluenzae)、绿脓假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、炭疽杆菌(Bacillusanthracis)、枯草杆菌(Bacillus subtilis)、大肠杆菌(Escherichia coli)、白喉棒杆菌(Corynebacterium diphtheriae)、杰氏棒状杆菌(Corynebacterium jeikeium)、棒状杆菌(Corynebacterium)孢子体、红斑丹毒丝菌(Erysipelothrix rhusiopathiae)、产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)、破伤风杆菌(Clostridium tetani)、艰难梭菌(Clostridium difficile)、产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)、多杀巴斯德菌(Pasturella multocida)、Bacteroidesthetaiotamicron、单形拟杆菌(Bacteroides uniformis)、普通拟杆菌(Bacteroidesvulgatus)、具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum)、念珠状链杆菌(Streptobacillusmoniliformis)、钩端螺旋体(Leptospira)和衣氏放线菌(Actinomyces israelli)。在特定的实施方式中，本文描述的化合物用于治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)或耐万古霉素肠球菌(VRE)的感染。在美国，每年MRSA导致大约19,000例死亡。尽管这些死亡的大部分归因于医院获得性MRSA(HA-MRSA)，但是社区获得性MRSA(CA-MRSA)实际上是毒力更高的且已知对此前健康的个体可能是致命的。CA-MRSA的毒力部分是由于苯酚可溶性调控蛋白或PSM肽的表达引起。因此，在治疗CA-MRSA中，可以使用本发明的化合物与调节毒力因子例如但不限于PSM肽的表达和/或活性的试剂组合。在某些实施方式中，本发明缩肽类化合物可用于治疗螺旋体，如伯氏疏螺旋体(Borelia burgdorferi)、苍白密螺旋体(Treponemapallidium)和细弱密螺旋体(Treponema pertenue)。

在一个特定的实施方式中，***可以选自葡萄球菌属(Staphylococcus)(包括例如S.aureus spp.、S.epidermidis spp.、S.warneri spp.和S.haemolyticus spp.)；链球菌属(Streptococcus)(包括例如S.viridans spp.、S.pneumoniae spp.、S.agalactiae spp.和S.pyogenes spp.)；芽孢杆菌属(Bacillus)(包括例如B.anthracis spp.和B.subtilis,spp.)；梭菌属(Clostridium)(包括例如C.difficile spp.)；丙酸杆菌属(Propionibacterium)(包括例如P.acnes spp.)；肠球菌属(Enterococcus)(包括例如E.faecium spp.、E.faecalis spp.、耐万古霉素E.faeciumspp.和耐万古霉素E.faecalis spp.)；和分枝杆菌属(Mycobacterium)(包括例如M.smegmatis spp.和M.tuberculosis spp.)。本文所述的化合物用于治疗由这些细菌引起的病症。此类病症的实例包括急性细菌性皮肤和皮肤结构感染、艰难梭菌(C.difficile)相关性腹泻、炭疽、败血症、肉毒杆菌中毒、***、菌血症、细菌性心内膜炎、憩室炎、脑膜炎、肺炎和结核病。

在一个特定的实施方式中，革兰氏阴性细菌选自嗜血杆菌属(Haemophilus)(包括例如H.influenzae spp.)；克雷伯菌属(Klebsiella)(包括例如K.pneumoniae spp.)；假单胞菌属(Pseudomonas)(包括例如P.aeruginosa spp.)；大肠杆菌属(Escherichia)(包括例如E.coli spp.)；耶尔森氏菌属(Yersinia)(包括例如Y.pestis spp.)；奈瑟菌属(Neisseria)(包括例如N.gonorrhoeae spp.)；拟杆菌属(Bacteriodes)(包括例如B.fragilis spp.)；变形菌纲(Proteus)(包括例如P.mirabilis spp.和P.vulgarisspp.)；肠杆菌属(Enterobacter)(包括例如E.cloacae spp.和E.aerogenes spp.)；沙雷氏菌属(Serratia)(包括例如S.marcescens spp.)；不动杆菌属(Acinetobacter)(包括例如A.baumannii spp.)；和莫拉氏菌属(Moraxella)(包括例如M.catarrhalis spp.)。在一个特定的实施方式中，革兰氏阴性细菌是嗜血杆菌属(Haemophilus)并且特别地是流感嗜血杆菌(H.influenzae)；或者莫拉氏菌属(Moraxella)并且特别地是M.catarrhalis spp。本文所述化合物用于治疗由这些细菌引起的病症。此类病症的实例包括流感、菌血症、肺炎、急性细菌性脑膜炎、淋病、***、呼吸道感染、导管相关菌血症、伤口感染、中耳炎、支气管炎、鼻窦炎和喉炎。

在其他实施方式中，本文所述缩肽类化合物可以用于治疗病毒性病症。可以引起由本发明化合物治疗的病症的感染性病毒的非限制性实例包括：逆转录病毒科(Retroviridae)(例如，人类免疫缺陷病毒，如HIV-1(也称为HTLV-III、LAV或HTLV-III/LAV)或HIV-III；以及其他分离株如HIV-LP)；小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)(例如，脊髓灰质炎病毒、甲型肝炎病毒；肠病毒、人柯萨奇病毒、鼻病毒、埃可病毒)；杯状病毒科(Calciviridae)(例如，引起胃肠炎的病毒株)；披膜病毒科(Togaviridae)(例如，马脑炎病毒、风疹病毒)；黄病毒科(Flaviridae)(例如，登革热病毒、脑炎病毒、黄热病毒)；冠状病毒科(Coronaviridae)(例如，冠状病毒、重度急性呼吸性综合征(SARS)病毒)；弹状病毒科(Rhabdoviridae)(例如，水泡性口炎病毒、狂犬病病毒)；丝状病毒科(Filoviridae)(例如，埃博拉病毒)；副粘病毒科(Paramyxoviridae)(例如，副流感病毒、腮腺炎病毒、麻疹病毒、呼吸道合胞体病毒)；正粘病毒科(Orthomyxoviridae)(例如，流感病毒)；布尼亚病毒科(Bungaviridae)(例如，汉坦病毒、布尼亚病毒、白蛉病毒和内罗病毒)；沙粒病毒科(Arenaviridae)(出血热病毒)；呼肠病毒科(Reoviridae)(例如，呼肠孤病毒、环状病毒和轮状病毒)；双核糖核酸病毒科(Birnaviridae)；嗜肝病毒科(Hepadnaviridae)(例如，乙型肝炎病毒)；细小病毒科(Parvoviridae)(细小病毒)；乳多空病毒科(Papovaviridae)(***状瘤病毒、多形瘤病毒)；腺病毒科(Adenoviridae)(大多数腺病毒)；疱疹病毒科(Herpesviridae)(例如，单纯疱疹病毒(HSV)1和2、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒(CMV)、疱疹病毒)；痘病毒科(Poxviridae)(例如，天花病毒、痘苗病毒、痘病毒)；和虹彩病毒科(Iridoviridae)(例如，非洲猪瘟病毒)；和未分类的病毒(例如，海绵状脑病的致病物，丁型肝炎的致病物(认为是乙型肝炎病毒的有缺陷的附属物)、非甲非乙型肝炎的致病物(1类＝肠内传播的；2类＝胃肠外传播的，即丙型肝炎)；Norwalk和相关病毒及星状病毒)。在特定的实施方式中，本发明化合物用于治疗流感病毒、人免疫缺陷病毒和单纯疱疹病毒。

在一些实施方式中，本发明缩肽类化合物可以用于治疗由真菌引起的病症。可以由本发明化合物抑制的真菌的非限制性实例包括但不限于新型隐球菌(Cryptococcusneoformans)、荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum)、粗球孢子菌(Coccidioidesimmitis)、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)、沙眼衣原体(Chlamydiatrachomatis)、白色念珠菌(Candida albicans)、热带假丝酵母(Candida tropicalis)、光滑念珠菌(Candida glabrata)、克鲁斯假丝酵母(Candida krusei)、***滑念珠菌(Candida parapsilosis)、都柏林假丝酵母(Candida dubliniensis)、葡萄牙假丝酵母(Candida lusitaniae)、絮状表皮癣菌(Epidermophyton floccosum)、奥氏小孢子菌(Microsporum audouinii)、犬小孢子菌(Microsporum canis)、犬小孢子菌扭曲变种(Microsporum canis var.distortum)、库克小孢子菌(Microsporum cookei)、马类小孢子菌(Microsporum equinum)、铁锈色小孢子菌(Microsporum ferrugineum)、粉小孢子菌(Microsporum fulvum)、鸡小孢子菌(Microsporum gallinae)、石膏样小孢子菌(Microsporum gypseum)、矮小孢子菌(Microsporum nanum)、桃色小孢子菌(Microsporumpersicolor)、埃泽楼发癣菌(Trichophyton ajelloi)、同心性发癣菌(Trichophytonconcentricum)、马发癣菌(Trichophyton equinum)、淡黄发癣菌(Trichophytonflavescens)、光辉发癣菌(Trichophyton gloriae)、麦格发癣菌(Trichophytonmegnini)、人类须毛癣菌(Trichophyton mentagrophytes var.erinacei)、须癣发癣菌趾间变种(Trichophyton mentagrophytes var.interdigitale)、豆形须毛癣菌(Trichophyton phaseoliforme)、红色发癣菌(Trichophyton rubrum)、红色发癣菌绒毛菌株、红色发癣菌粒状菌株、许兰氏发癣菌(Trichophyton schoenleinii)、猴毛癣菌(Trichophyton simii)、苏丹发癣菌(Trichophyton soudanense)、土生毛癣菌(Trichophyton terrestre)、断发毛癣菌(Trichophyton tonsurans)、范氏毛癣菌(Trichophyton vanbreuseghemii)、疣状发癣菌(Trichophyton verrucosum)、堇色发癣菌(Trichophyton violaceum)、赤非发癣菌(Trichophyton yaoundei)、烟曲霉(Aspergillusfumigatus)、黄曲霉(Aspergillus flavus)和棒状曲霉(Aspergillus clavatus)。

在其他的实施方式中，本文所述缩肽类化合物可以用于治疗由原生动物引起的病症。可以由本发明化合物抑制的原生动物的非限制性实例包括但不限于***毛滴虫(Trichomonas vaginalis)、兰伯氏贾第虫(Giardia lamblia)、溶组织内阿米巴虫(Entamoeba histolytica)、结肠小袋虫(Balantidium coli)、微细隐孢球虫(Cryptosporidium parvum)和贝氏等孢子球虫(Isospora belli)、克氏锥虫(Trypansomacruzi)、冈比亚锥虫(Trypanosoma gambiense)、杜氏利什曼虫(Leishmania donovani)和福氏耐格里变形虫(Naegleria fowleri)。

在某些实施方式中，本文所述缩肽类化合物可以用于治疗由蠕虫引起的病症。可以由本发明化合物抑制的蠕虫的非限制性实例包括但不限于：曼氏血吸虫(Schistosomamansoni)、血吸虫尾蚴(Schistosoma cercariae)、日本血吸虫(Schistosoma japonicum)、湄公血吸虫(Schistosoma mekongi)、埃及血吸虫(Schistosoma hematobium)、人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、粪类圆线虫(Strongyloides stercoralis)、细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)、多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)、广州管圆线虫(Angiostrongylus cantonensis)、脊形管圆线虫(Angiostrongylusconstaricensis)、布氏姜片虫(Fasciolopis buski)、菲律宾毛线虫(Capillariaphilippinensis)、卫氏并殖吸虫(Paragonimus westermani)、十二指肠钩口线虫(Ancylostoma dudodenale)、美洲钩虫(Necator americanus)、旋毛线虫(Trichinellaspiralis)、班氏吴策丝虫(Wuchereria bancrofti)、马来丝虫(Brugia malayi)和帝纹丝虫(Brugia timori)、犬弓蛔虫(Toxocara canis)、猫弓蛔虫(Toxocara cati)、牛弓首蛔虫(Toxocara vitulorum)、秀丽隐杆线虫(Caenorhabiditis elegans)和异尖线虫(Anisakis)种。

在一些实施方式中，本文所述缩肽类化合物可以用于治疗由寄生虫引起的病症。可以由本发明化合物抑制的寄生虫的非限制性实例包括但不限于恶性疟原虫(Plasmodiumfalciparum)、约氏疟原虫(Plasmodium yoelli)、短膜壳绦虫(Hymenolepis nana)、华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)、罗阿丝虫(Loa loa)、卫氏并殖吸虫(Paragonimuswestermani)、肝片吸虫(Fasciola hepatica)和刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)。在特定的实施方式中，寄生虫是疟原虫。

在其他实施方式中，与不使用所述化合物治疗的情况下传染源的生长相比，缩肽类化合物可以用于抑制传染源的生长。传染源的非限制性实例包括但不限于细菌、真菌、病毒、原生动物、蠕虫、寄生虫及其组合。可以将缩肽类化合物用于在体内或体外抑制传染源。

包含本发明化合物的药物组合物

本发明还提供药物组合物，其包含至少一种本发明的缩肽类化合物以及药学上可接受的载体，例如可溶解本发明缩肽类化合物的载体。这些缩肽类组合物适于向受试者(例如，哺乳动物如人类)施用。所述药物组合物可以用于治疗病症。上文中提供了此类病症的非限制性实例，并且其包括由病原体(例如，细菌)的感染。

在一个实施方式中，在药学上可接受的载体中施用缩肽类化合物。可以使用本领域已知的任何适宜载体。有效溶解本发明化合物的载体是优选的。载体包括但不限于固体、液体或者固体和液体的混合物。载体可以采取胶囊、片剂、丸剂、粉末、锭剂、混悬剂、乳剂或糖浆剂的形式。载体可以包括充当矫味剂、润滑剂、增溶剂、助悬剂、粘合剂、稳定剂、片剂崩解剂及包封材料的物质。本文使用的短语“药学上可接受的”指在合理医学判断范围内，适用于与人类和动物的组织接触而不具有过度的毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症的，与合理的受益/风险比相称的那些化合物、材料、组合物和/或剂型。

可以充当药学上可接受的载体的材料的非限制性实例包括：(1)糖，例如乳糖、葡萄糖和蔗糖；(2)淀粉，例如玉米淀粉和马铃薯淀粉；(3)纤维素及其衍生物，例如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素；(4)粉末状西黄蓍胶；(5)麦芽；(6)明胶；(7)滑石；(8)赋形剂，例如可可脂和栓剂蜡；(9)油类，例如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油；(10)二醇类，例如丙二醇；(11)多元醇类，例如甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇；(12)酯类，例如油酸乙酯和月桂酸乙酯；(13)琼脂；(14)缓冲剂，例如氢氧化镁和氢氧化铝；(15)海藻酸；(16)无热原水；(17)等渗盐水，(18)林格溶液，(19)乙醇；(20)磷酸盐缓冲液；和(21)在药物制剂中使用的其他无毒相容性物质。

剂型可以方便地以单位剂型存在，并且可以通过药物领域众所周知的任何方法制备。可以与载体材料组合以生产单一剂型的活性成分的量将根据待治疗的受试者、特定施用方式、待治疗的特定病症等变化。可以与载体材料组合以生产单一剂型的活性成分的量将通常为产生治疗效果的化合物的量。通常，以百分数计，该量为约1％至约99％的活性成分，优选约5％至约70％，最优选约10％至约30％。

制备这些制剂或组合物的方法包括使本发明的化合物与载体和任选地一种或多种辅助成分相联合的步骤。通常，所述制剂是通过如下方式制备的：将本发明的缩肽类化合物与液体载体或即时粉碎的固体载体或者两者均匀切密切地联合，然后，如有必要，将产品加工成形。

在用于口服施用的固体剂型(例如，胶囊、片剂、丸剂、锭剂、粉剂、颗粒剂等)中，将活性成分与一种或多种另外的成分如柠檬酸钠或磷酸二钙和/或任何下述成分混合：填充剂或增量剂，例如但不限于淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和/或硅酸；粘合剂，例如但不限于羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和/或***胶；保湿剂，例如但不限于甘油；崩解剂，例如但不限于琼脂、碳酸钙、马铃薯淀粉或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠；溶解阻滞剂，例如但不限于石蜡；吸收促进剂，例如但不限于季铵化合物；润湿剂，例如但不限于鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯；吸附剂，例如但不限于高岭土和膨润土；润滑剂，例如但不限于滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、十二烷基硫酸钠及其混合物；和着色剂。在胶囊、片剂和丸剂的情况下，药物组合物还可以包含缓冲剂。也可采用类似类型的固体组合物作为在软和硬填充明胶胶囊中的填充剂，其使用赋形剂如乳糖或乳液糖类(milk sugar)以及高分子量聚乙二醇等。

在粉剂中，载体为精细粉碎的固体，将其与有效量的精细粉碎的药剂混合。粉剂和喷雾剂除了包含本发明的化合物之外，还可以包含赋形剂如乳糖、滑石、硅酸、氢氧化铝、硅酸钙和聚酰胺粉末或这些物质的混合物。喷雾剂可以另外包含常规抛射剂，例如氯氟烃类和挥发性的未取代烃，例如丁烷和丙烷。

用于全身性口服施用的片剂可以包括如本领域已知的一种或多种赋形剂，例如碳酸钙、碳酸钠、糖类(例如，乳糖、蔗糖、甘露醇、山梨醇)、纤维素(例如，甲基纤维素、羧甲基纤维素钠)、树胶(例如，***胶、西黄蓍胶)以及一种或多种崩解剂(例如，玉米淀粉或海藻酸)、粘合剂(例如明胶、胶原或***胶)、润滑剂(例如，硬脂酸镁、硬脂酸或滑石)、惰性稀释剂、防腐剂、崩解剂(例如，淀粉羟乙酸钠)、表面活性剂和/或分散剂。片剂可以通过任选地与一种或多种辅助成分一起压制或模压而制备。

在溶液剂、混悬剂、乳剂或糖浆剂中，将有效量的缩肽类化合物溶解或悬浮在载体如无菌水或有机溶剂如水性丙二醇中。其他组合物可以通过将化合物分散在淀粉或羧甲基纤维素钠的水溶液中或本领域已知的合适的油中来制备。液体剂型可以含有本领域常用的惰性稀释剂例如水或其他溶剂、增溶剂和乳化剂，例如但不限于乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、油类(特别是棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇和脱水山梨醇脂肪酸酯，及其混合物。

除了惰性稀释剂之外，口服组合物也可以包含助剂，例如润湿剂、乳化剂和助悬剂、甜味剂、调味剂、着色剂、芳香剂和防腐剂。

混悬剂除了含有活性化合物之外，还可以含有助悬剂，例如乙氧基化异硬脂醇、聚氧乙烯山梨醇和脱水山梨糖醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝(aluminum metahydroxide)、膨润土、琼脂和西黄蓍胶及其混合物。

用于直肠或***施用的药物组合物的制剂可以呈栓剂，其可以通过混合本发明的一种或多种化合物与一种或多种合适的非刺激性赋形剂或载体来制备，所述合适的非刺激性赋形剂或载体包括例如可可脂、聚乙二醇、栓剂蜡或水杨酸酯，并且其可以在室温下为固体但在体温下为液体，因此在直肠或***腔中融化且释放药剂。适于***施用的制剂还包括***栓、卫生栓、乳膏剂、凝胶剂、糊剂、泡沫剂或喷雾剂，其含有如本领域已知的合适的此类载体。

用于局部或透皮施用本发明的化合物的剂型包括粉剂、喷雾剂、软膏、糊剂、乳膏、洗剂、凝胶剂、溶液剂、滴剂、贴剂和吸入剂。可以在无菌条件下将活性缩肽类化合物与药学上可接受的载体及可能需要的任何防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。

所述软膏、糊剂、乳膏和凝胶剂除了含有活性成分之外，还可以含有赋形剂如动物和植物脂肪、油、蜡、石蜡、淀粉、西黄蓍胶、纤维素衍生物、聚乙二醇、硅氧烷、膨润土、硅酸、滑石和氧化锌或其混合物。

透皮贴剂具有向机体提供本发明的化合物的控制递送的附加优点。这样的剂型可以通过将药剂溶解或分散在合适的介质中来制备。吸收促进剂也可以用于增加药剂透过皮肤的流量。可以通过提供速率控制膜或将缩肽类化合物分散在聚合物基质或凝胶中来控制这种流量速率。

缩肽类化合物以对于需要这种治疗的患者而言的有效量施用。如本文使用的短语“有效量”是指有效地在动物中产生一些所需作用的本发明化合物或包含本发明化合物的组合物的量。应当认识到的是，当将药剂用于达到治疗作用时，包含“有效量”的实际剂量将根据一些条件而变化，所述条件包括但不限于所治疗的特定病况、疾病的严重程度、患者的体型和健康情况、施用途径。熟练的医学从业人员可以使用医学领域熟知的方法容易地确定合适的剂量。在一些实施方式中，有效量是在有需要的受试者中有效治疗病症的量。而且，本领域技术人员将意识到，可以通过微调(fine-tuning)和/或通过施用一种以上缩肽类化合物，或者通过将缩肽类化合物与第二种药剂(例如，抗生素、抗真菌剂、抗病毒剂、NSAIDS、DMARDS、类固醇等)一起施用来降低或增加缩肽类化合物的有效量。有效量可以例如通过以相对低的量开始且随着有益作用(例如，症状减轻)的同步评价逐步递增而凭经验确定。实际有效量将使用本领域的标准方法通过剂量/应答测定来确定(Johnson等，Diabetes.42:1179,(1993))。如本领域那些技术人员已知的，有效量将取决于缩肽类化合物的生物利用度、生物活性和生物降解能力。

在一些实施方式中，有效量是能够在受试者中减少病症的症状的量。因此，所述量可以随着所治疗的受试者而变化。例如，缩肽类化合物的有效量可以包含约1μg/kg体重至约100mg/kg体重。在一个实施方式中，化合物的有效量包含约1μg/kg体重至约50mg/kg体重。在进一步的实施方式中，化合物的有效量包含约10μg/kg体重至约10mg/kg体重。当一种或多种缩肽类化合物或药剂与载体组合时，其存在量可以为约1重量％至约99重量％，余量由药学上可接受的载体组成。在一些实施方式中，有效量在每剂约1mg和约10g之间，例如每剂约10mg和约1g之间。上文所述范围中间的值和范围旨在包括在本教导中。

缩肽类化合物的施用可以为每小时、每天、每周、每月、每年一次或者单次施用。此外，施用的持续时间可以为一天至一年或更长时间。在一些实施方式中，施用是指在一段时间内(例如，约1周、2周、3周、1个月、3个月、6个月或1年)每天施用一次。在一些实施方式中，施用是指在一段时间内(例如，约1个月、3个月、6个月、1年或更长时间)每周施用一次。

本发明还提供了包含至少一种本发明的缩肽类化合物的试剂盒。所述试剂盒可以含有至少一个容器，并且还可以包含指导使用这些材料的说明书。在另一个实施方式中，试剂盒可以包含用于治疗考虑中的病症的试剂，含或不含可以存在以确定受试者是否具有炎性疾病的此类上述物质。

本发明的药物组合物的施用

包含本文所述的本发明缩肽类化合物的本发明制剂的施用方法可以是本领域熟知的多种方法中的任一种。这些方法包括局部施用或全身施用。示例性的施用途径包括口服、肠胃外、透皮、皮内、肌内、腹膜内、静脉内、皮下、鼻内(例如，喷雾器、吸入器、气雾剂分配器)、眼内(例如，用于治疗结膜炎)、耳内(例如，用于治疗耳部感染)、结直肠、直肠、***内及其任意组合。此外，将本发明的药物组合物通过任何适宜的途径(包括脑室内和鞘内注射)引入中枢神经系统可能是所需要的。可以由心室内导管，例如连接至储库如Ommaya储库来帮助心室内注射。引入方法也可以由可重填充的或可生物降解的装置(例如，储库)来提供。此外，可以通过涂布装置、植入物、支架或假体来实现施用。本发明的化合物也可以用于在导管***机体的任何情况下涂布导管。

在另一个实施方式中，所述主题缩肽类化合物可以作为与其他药物联合治疗的一部分施用。联合治疗是指联合两种或更多种不同治疗化合物的任何施用形式，以使得当之前施用的治疗化合物在体内仍然有效时施用第二化合物(例如，两种化合物在患者中同时有效，其可以包括两种化合物的协同效应)。例如，可以以相同的制剂或单独的制剂同时或顺序施用不同的治疗化合物。因此，接受这种治疗的个体可以具有不同治疗化合物的组合效应。

例如，缩肽类化合物可以与其他已知的抗生素联合使用。本发明的缩肽类化合物可以顺序施用或基本上同时施用。改变抗生素可以有助于降低病原体发展对药物耐药性的能力。抗生素的非限制性实例包括青霉素类(例如，天然青霉素、耐青霉素酶的青霉素、抗假单胞菌青霉素类、氨基青霉素)、四环素类、大环内酯类(例如，红霉素)、林可酰胺类(例如，克林霉素)、链阳菌素类(例如，Synercid)、氨基糖苷类和磺酰胺类。在一些实施方式中，本发明的缩肽类化合物与靶向毒力因子(例如但不限于苯酚可溶性调控蛋白)的化合物联合使用。在一些实施方式中，本发明的缩肽类化合物与靶向病原体外排泵的化合物联合使用。

包含本发明化合物的药物组合物的试剂盒和制品

包含本发明的化合物或其药学上可接受的盐以及使用说明书的试剂盒也在本发明范围内。如本文使用的术语“试剂盒”指包含用于治疗由病原体引起的疾病的成分的包装产品，使用其以施用包含本发明化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物。试剂盒优选地包含容纳试剂盒成分的盒子或容器。盒子或容器上贴有标签或美国食品和药物管理局批准的方案。盒子或容器容纳本发明的成分，所述成分优选地包含在塑料、聚乙烯、聚丙烯、乙烯或丙烯容器中。所述容器可以是加盖的管或瓶或含有滴管的瓶，所述滴管适于滴加施用含有本发明化合物的溶液(例如，向受试者的耳或眼中)。所述试剂盒还可以包含用于施用包含本发明化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物的说明书。在一个特定的实施方式中，所述试剂盒可以包含(a)含有本发明化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其中所述药物组合物在容器中；和(b)描述使用所述药物组合物的方法的说明书。

试剂盒可以另外含有一种或多种另外的药剂，如抗生素、抗真菌剂、抗病毒剂、抗原生动物剂、驱虫剂、抗肿瘤剂、免疫调节剂、抗高胆固醇血症剂及其组合。试剂盒通常包含标明试剂盒内容物预期用途的标签。术语标签包括在试剂盒上或与试剂盒一起提供的或者以其他方式伴随试剂盒提供的任何文字或记录材料。

本发明还提供了一种药物包装或试剂盒，其包含一个或多个装有药物组合物的液体制剂的容器，所述药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐。在另一个实施方式中，装有本发明液体制剂的容器是预充式注射器。在一个特定的实施方式中，本发明制剂在单剂量药瓶中作为无菌液体配制。例如，可以在3cc ISP I型硼硅酸盐琥珀色小瓶(West Pharmaceutical Services–部件品编号6800-0675)中提供制剂，目标体积为1.2mL。任选地，与此类容器相关联的可以是政府机构规定的用于规范药品或生物制品的生产、使用或销售的通知，所述通知反映了该机构对供人用产品的生产、使用或销售的审批。

可以将本领域技术人员已知的任何预充式注射器与本发明的液体制剂联合使用。在例如但不限于PCT公开WO05032627、WO08094984、WO9945985、WO03077976、US专利US6792743、US5607400、US5893842、US7081107、US7041087、US5989227、US6807797、US6142976、US5899889、US专利公开US20070161961A1、US20050075611A1、US20070092487A1、US20040267194A1、US20060129108A1中对可以使用的预充式注射器进行了描述。预充式注射器可以由各种材料制成。在一个实施方式中，预充式注射器是玻璃注射器。在另一个实施方式中，预充式注射器是塑料注射器。本领域技术人员将理解的是，用于生产注射器的材料的性质和/或质量可能会影响存储在注射器中的化合物制剂的稳定性。例如，应当理解的是，沉积在注射器腔室内表面上的硅基润滑剂可能会影响化合物制剂中的颗粒形成。在另一个实施方式中，预充式注射器包含硅基润滑剂。在另一个实施方式中，预充式注射器包含烘焙硅酮。在另一个实施方式中，预充式注射器不含硅基润滑剂。本领域技术人员还应理解的是，少量污染元素从注射器针筒、注射器针盖、柱塞或塞子浸入制剂中也可能影响制剂的稳定性。例如，应当理解的是，在生产过程中引入的钨可能会对制剂的稳定性产生不利影响。在另一个实施方式中，预充式注射器可以包含水平高于500ppb的钨。在另一个实施方式中，预充式注射器是低钨注射器。在另一个实施方式中，预充式注射器可以含有水平约500ppb至约10ppb之间、约400ppb至约10ppb之间、约300ppb至约10ppb之间、约200ppb至约10ppb之间、约100ppb至约10ppb之间、约50ppb至约10ppb之间、约25ppb至约10ppb之间的钨。

本发明还包含完成包装和贴签的药物产品。该制品包括在适宜小瓶或容器(如玻璃小瓶)、预充式注射器或密封的其他容器中的适当的单位剂型。在一个实施方式中，单位剂型以无菌无颗粒溶液的形式提供，所述溶液包含含有本发明化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其适于胃肠外施用。在另一个实施方式中，单位剂型以无菌冻干粉形式提供，所述无菌冻干粉包含含有本发明化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物，其适于重构。

在一个实施方式中，单位剂型适于静脉内、肌内、鼻内、口服、局部或皮下递送。因此，本发明包含适于每种递送途径的无菌溶液。本发明还包含适于重构的无菌冻干粉。

与任何药物产品一样，将包装材料和容器设计为在贮存和运输过程中保护产品的稳定性。此外，本发明的产品包括使用说明书和其他信息材料，其向医师、技术人员或患者建议如何适当地预防或治疗所讨论的疾病或病症，以及如何以及多久施用一次药物。换言之，制品包括指示或建议给药方案的指导手段，其包括但不限于实际剂量、监测程序和其他监测信息。

具体而言，本发明提供了一种制品，其包含包装材料如盒子、瓶子、管、小瓶、容器、预充式注射器、喷雾器、吸入器、静脉(i.v.)输液袋、信封等；以及包含在包装材料中的至少一种本发明化合物的单位剂型，其中所述化合物包括含有抗生素的液体制剂。包装材料包括指导手段，其指示所述化合物如何能够用于预防、治疗和/或管理与疾病或病症相关的一种或多种症状。

通过以下实施例进一步说明本发明，不应以任何方式将这些实施例解释为限制性的。在整个申请书中，引用了各种专利、专利申请和公开。这些专利、专利申请和公开所公开的内容全部通过引用并入本申请。在所述专利、专利申请和公开与本公开内容之间存在任何不一致的情况下，以本公开内容为准。

实施例

实施例1：本发明化合物的分离和化学结构

自由此前未经培养的β-变形菌生产的提取物中分离出式(III)的化合物。在琼脂板上生长β-变形菌的分离株，然后使用一个菌落以接种培养基(broth)。发酵后，将培养基离心，并将上清液吸附在反相树脂上。经洗涤后，自树脂洗脱本发明的化合物并使用HPLC进一步纯化。使用NMR和质谱确定本发明化合物的结构。

实施例2：本发明化合物的抗细菌活性

确定式(III)化合物的抗细菌活性谱且如表2中所示。

表2：抗细菌测试板

表2中的结果表明式(III)化合物对革兰氏阳性病原体具有优异的活性，包括对其他肽聚糖抑制剂具有抗性的菌株，但对大多数革兰氏阴性细菌的活性较低。存在10％的血清未影响最小抑制MIC值。式(III)化合物对金黄色葡萄球菌显示出优异的抗菌活性，其最低杀菌浓度(MBC)为2xMIC。

实施例3：抗性频率

产生金黄色葡萄球菌自发抗性突变体的尝试未成功(在直至1.2x10¹⁰ CFU下检测)。这表明<10^-10的优异的自发抗性频率(在4xMIC下检测)。

实施例4：作用的特异性：大分子合成研究

为了深入了解式(III)化合物的作用机制和特异性，采用金黄色葡萄球菌进行了大分子合成研究。将氚代胸腺嘧啶、尿嘧啶、亮氨酸或N-乙酰基-葡糖胺掺入DNA、RNA、蛋白或肽聚糖显示式(III)化合物强烈抑制肽聚糖的合成(与万古霉素相当)并且没有其他主要途径。

实施例5：细胞毒性和溶血活性

64μg/mL(所检测的最高剂量)下的本发明化合物对两种哺乳动物细胞系NIH3T3和HepG2未显示出细胞毒性。在高达64μg/mL(所检测的最高剂量)下，式(III)化合物对人红细胞也未显示出溶血活性。加入DNA未影响MIC，表明本发明化合物不结合DNA。

实施例6：本发明化合物在小鼠败血症模型中的体内有效性

在小鼠败血症模型中检测了式(III)化合物的体内有效性。对于该研究，通过腹腔注射采用7.8x10⁷ CFU的MRSA ATCC 33591感染6只CD-1雌性小鼠。感染1小时后，向小鼠静脉内施用剂量为2.5mg/kg、5.0mg/kg、10.0mg/kg或20.0mg/kg的式(III)化合物，或者剂量为2.5mg/kg的万古霉素作为对照。施用式(III)化合物的小鼠显示出5.2mg/kg的50％保护性剂量(PD₅₀)。施用2.5mg/kg剂量万古霉素的对照小鼠全部存活，相比之下未经治疗的小鼠仅显示出17％的存活率。

实施例7：本发明化合物在小鼠大腿感染模型中的体内有效性

接下来，在针对金黄色葡萄球菌ATCC 33591的中性白细胞减少症小鼠大腿感染模型中对式(III)化合物进行评价。对于该研究，在感染后2小时和4小时向经金黄色葡萄球菌ATCC 33591挑战的小鼠静脉内施用两个5mg/kg、10mg/kg、20mg/kg和30mg/kg剂量的式(III)化合物，或者单剂量施用50mg/kg的万古霉素作为对照。在感染后26小时检测大腿中的细菌负荷。

如图1中所示，感染对照表明在治疗时(2小时)生物负荷为6.07log₁₀ CFU/克大腿。26小时感染对照表明与治疗时相比生物负荷增加了3.11log₁₀ CFU。在式(III)化合物全部四个研究剂量中观察到了与26小时感染对照相比呈剂量依赖方式的CFU减少。分两剂间隔2小时递送30mg/kg式(III)化合物导致与26小时感染对照相比3.59log₁₀ CFU的减少，以及与治疗开始时(T＝2小时)相比0.48log₁₀CFU的减少。接受万古霉素的小鼠与2小时感染对照和26小时感染对照相比分别显示出0.54和3.65log₁₀ CFU的减少。

图1中所示的结果表明式(III)化合物显示出良好的组织穿透作用以及治疗耐药性皮肤感染的潜力。

等同物

本领域技术人员将认识到或者仅仅使用常规实验能够确定本文特别描述的具体实施方式的许多等同物。这样的等同物均旨在涵盖于随附权利要求的范围内。