背景技术

人类肠道在子宫内被认为是无菌的，但其在出生后立即暴露于各种各样的母体和环境微生物中。此后，出现微生物定殖和演替的动态期，其受多种因素的影响，如分娩方式、环境、饮食和宿主基因型，所有这些都会影响肠道微生物群的组成，特别是在生命早期。随后，微生物群稳定，并且变得像成体一样[1]。人类肠道微生物群含有超过1500种不同的种系型，在丰度水平上占主导的是两种主要的细菌分类(门)，即拟杆菌门和厚壁菌门[2-3]。由人类肠道的细菌定殖产生的成功共生关系已经产生了多种多样的代谢功能、结构功能、保护功能及其它有益功能。定殖肠道的代谢活性增强确保了原本难消化的膳食组分随着副产物的释放而降解，从而为宿主提供了重要的营养来源和额外的健康益处。类似地，肠道微生物群的免疫学重要性是众所周知的，并且在免疫系统受损的无菌动物中得到例证，在引入共生细菌后，受损的免疫系统在功能上得以重建[4-6]。

在胃肠道病症如炎症性肠病(IBD)中已经记录了微生物群组成的显著变化。例如，在IBD患者中梭菌簇XIVa细菌和梭菌簇XI(普拉梭菌)的水平降低，而大肠杆菌数增多，表明肠道内共生体和致病有机体的平衡发生改变[7-11]。

认识到某些细菌菌株可能对动物肠道及其它组织有潜在的积极作用，已经提出将各种菌株用于治疗各种疾病(参见例如[12-15])。已经提出许多菌株用于治疗各种肠道病症，主要包括乳杆菌和双歧杆菌菌株(综述参见[16])。也已经提出将嗜氢布劳特氏菌(Blautia hydrogenotrophica)种的菌株用于治疗肠道病症[17-19]。也已经提出将布劳特氏菌属(Blautia)的菌株用于调节消化生态系统的微生物平衡[20]，并且也已经提出将特定的菌种用于治疗远离肠道的全身性疾病[21]。然而，不同细菌菌株与不同疾病之间的关系以及特定细菌菌株在全身水平上对肠道及其它组织和对任何特定类型疾病的确切作用尚未得到充分表征。

需要表征肠道细菌的潜在作用，以便可以开发利用肠道细菌的新疗法。