本发明提供一种阿加曲班中间体的连续流合成方法,所述的合成工艺是以阿加曲班中间体Ⅰ为原料,经钯炭加氢步骤得到阿加曲班中间体Ⅱ,所述的合成工艺在微通道反应器中进行。该方法包括将化合物Ⅰ与催化剂和溶剂的混合溶液作为物料一,将氢气作为物料二,通过微通道反应器,连续流氢化合成中间体Ⅱ,反应温度为80至200℃,反应时间为84至140秒,压力为5至15bar。其中,X代表氢原子、甲基、乙基。与现有的常规釜式反应器相比,该工艺反应时间短,反应持液体积小,无放大效应,不需要加压氢化釜,提高了反应的安全性,目标产物转化率在90%以上,纯度在99%以上,有利于工业化生产。