本发明公开了一种舱底水控制系统,包括污水井高低液位起停开关、舱底泵起动器、污水井排放电磁阀、系统控制屏、AMS报警监控装置,所述污水井高低液位起停开关设置于污水井壁,用于监测最高和最低液位,并设置独立工作电源和信号回路,信号回路接入AMS报警监控装置输入模块,所述舱底泵起动器设置于污水井外井壁,泵体叶轮通过联轴器伸入污水井,所述舱底泵起动器设置接口接入AMS报警监控系统装置的,所述污水井排放电磁阀设置于污水井排水口,控制线接入AMS报警监控装置信号输出模块,所述系统控制屏设置于主控场合,通过这种改善系统,使整个系统的控制设备,如主控箱、采集模块、模块控制屏、CPU、接口电缆等,使系统变得简洁易操作,更丰富功能。