本发明公开了一种柑橘类果实皮渣中不同功能性成分的联合提取方法。操作为:柑橘果实皮渣加水,调节pH为酸性,恒温搅拌提取,将提取果胶液离心收集上清液,所得上清液经醇沉,沉淀干燥,得到果胶;所得残渣加水,搅拌,先进行物理预处理,然后均质处理,再醇沉,沉淀干燥,得到柑橘纤维;醇沉废液进行酒精回收,纯化,浓缩,得到柠檬苦素和黄酮类物质。本发明通过连续分步分离和提取工艺,联合化学和物理修饰工艺,得到果胶、柠檬苦素和黄酮类提取物和柑橘纤维三种不同领域应用的功能性产品,通过产业化路线的合理安排和规划,真正实现“吃干榨尽”。作为低污染的新型农产品生物环保加工方案,该联合提取工艺路线具有很好的转化应用预期。