具体实施方式

本公开文本提供了一种用于治疗患有肿瘤的人类受试者的方法，所述方法包括(i)鉴定展现出高炎症标签得分的受试者；和(ii)向所述受试者施用PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体。本公开文本还提供了一种用于治疗患有肿瘤的人类受试者的方法，所述方法包括施用PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体，其中在所述施用之前所述受试者被鉴定为具有高炎症标签得分。本公开文本还提供了一种用于鉴定患有适于PD-1抑制剂(例如，抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体)治疗的肿瘤的人类受试者的方法，所述方法包括：(i)测量从所述受试者获得的肿瘤样品中的炎症标签得分，和(ii)如果所述受试者具有高炎症标签得分，则向所述受试者施用PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体。

I.术语

为了可以更容易地理解本公开文本，首先定义某些术语。如本申请中所使用的，除非本文另外明确提供，否则以下术语中的每一个应当具有下文所阐述的含义。另外的定义贯穿本申请进行阐述。

“施用”是指使用本领域技术人员已知的多种方法和递送系统中的任何一种将包含治疗剂的组合物物理引入受试者。用于免疫疗法(例如，抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体)的优选施用途径包括静脉内、肌肉内、皮下、腹膜内、脊柱或其他肠胃外施用途径，例如通过注射或输注。如本文所用的短语“肠胃外施用”意指除了肠施用和局部施用之外，通常通过注射的施用方式，并且包括但不限于静脉内、肌肉内、动脉内、鞘内、淋巴管内、病灶内、囊内、眼眶内、心脏内、皮内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、囊下、蛛网膜下、脊柱内、硬膜外和胸骨内注射和输注以及体内电穿孔。其他非肠胃外途径包括口服、局部、表皮或粘膜施用途径，例如鼻内地、阴道地、直肠地、舌下地或局部地。施用还可以例如进行一次、多次和/或经一个或多个延长的时间段。

如本文所用的“不良事件”(AE)是与医学治疗的使用相关的任何不利的并且通常是无意的或不希望的体征(包括异常的实验室发现)、症状或疾病。例如，不良事件可能与响应于治疗的免疫系统的激活或免疫系统细胞(例如，T细胞)的扩增相关。医学治疗可能具有一种或多种相关的AE，并且每种AE可能具有相同或不同级别的严重程度。对能够“改变不良事件”的方法的提及意指降低与不同治疗方案的使用相关的一种或多种AE的发生率和/或严重程度的治疗方案。

“抗体”(Ab)应当包括但不限于糖蛋白免疫球蛋白(其与抗原特异性结合并包含通过二硫键相互连接的至少两条重(H)链和两条轻(L)链)或其抗原结合部分。每条H链包含重链可变区(本文缩写为V_H)和重链恒定区。重链恒定区包含三个恒定结构域，即C_H1、C_H2和C_H3。每条轻链包含轻链可变区(本文缩写为V_L)和轻链恒定区。轻链恒定区包含一个恒定结构域，即C_L。V_H和V_L区可以进一步细分为高变性区域，称为互补决定区(CDR)，散布有更保守的区域，称为框架区(FR)。每个V_H和V_L包含三个CDR和四个FR，按照以下顺序从氨基末端到羧基末端排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3和FR4。重链和轻链的可变区含有与抗原相互作用的结合结构域。抗体的恒定区可以介导免疫球蛋白与宿主组织或因子的结合，所述宿主组织或因子包括免疫系统的各种细胞(例如，效应细胞)和经典补体系统的第一组分(C1q)。因此，术语“抗PD-1抗体”包括特异性结合PD-1的具有两条重链和两条轻链的全抗体和全抗体的抗原结合部分。抗原结合部分的非限制性例子显示在本文的其他地方。

免疫球蛋白可以源自任何公知的同种型，包括但不限于IgA、分泌型IgA、IgG和IgM。IgG亚类也是本领域技术人员熟知的，并且包括但不限于人IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。“同种型”是指由重链恒定区基因编码的抗体类别或亚类(例如，IgM或IgG1)。举例来说，术语“抗体”包括天然存在的抗体和非天然存在的抗体二者；单克隆抗体和多克隆抗体；嵌合抗体和人源化抗体；人抗体或非人抗体；全合成抗体；和单链抗体。可以通过重组方法将非人抗体人源化以降低其在人体中的免疫原性。在没有明确说明的情况下，除非上下文另有指示，否则术语“抗体”还包括任何上述免疫球蛋白的抗原结合片段或抗原结合部分，并且包括单价和二价片段或部分以及单链抗体。

“分离的抗体”是指基本上不含具有不同抗原特异性的其他抗体的抗体(例如，与PD-1特异性结合的分离的抗体基本上不含与PD-1以外的抗原特异性结合的抗体)。然而，与PD-1特异性结合的分离的抗体可能与其他抗原(诸如来自不同物种的PD-1分子)具有交叉反应性。此外，分离的抗体可以基本上不含其他细胞材料和/或化学物质。

术语“单克隆抗体”(mAb)是指具有单一分子组成的抗体分子的非天然存在的制剂，即其一级序列基本上相同并且对特定表位展现出单一结合特异性和亲和力的抗体分子。单克隆抗体是分离的抗体的例子。单克隆抗体可以通过杂交瘤、重组、转基因或本领域技术人员已知的其他技术产生。

“人抗体”(HuMAb)是指具有这样的可变区的抗体，其中框架区和CDR区二者均源自人种系免疫球蛋白序列。此外，如果所述抗体含有恒定区，则所述恒定区也源自人种系免疫球蛋白序列。本公开文本的人抗体可以包括不是由人种系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基(例如，通过体外随机或位点特异性诱变或通过体内体细胞突变引入的突变)。然而，如本文所用，术语“人抗体”不旨在包括其中衍生自另一种哺乳动物物种(诸如小鼠)的种系的CDR序列已经被移植到人框架序列上的抗体。术语“人抗体”和“完全人抗体”同义使用。

“人源化抗体”是指非人抗体的CDR外的一些、大部分或所有氨基酸被源自人免疫球蛋白的相应氨基酸替代的抗体。在人源化形式的抗体的一个实施方案中，CDR外的一些、大部分或所有氨基酸已经被来自人免疫球蛋白的氨基酸替代，而一个或多个CDR内的一些、大部分或所有氨基酸未改变。氨基酸的少量添加、缺失、插入、取代或修饰是被允许的，只要它们不消除抗体结合特定抗原的能力即可。“人源化抗体”保留与原始抗体相似的抗原特异性。

“嵌合抗体”是指可变区源自一种物种并且恒定区源自另一种物种的抗体，诸如可变区源自小鼠抗体并且恒定区源自人抗体的抗体。

“抗抗原抗体”是指与抗原特异性结合的抗体。例如，抗PD-1抗体与PD-1特异性结合，抗PD-L1抗体与PD-L1特异性结合，并且抗CTLA-4抗体与CTLA-4特异性结合。

抗体的“抗原结合部分”(也称为“抗原结合片段”)是指抗体的一个或多个片段，其保留与完整抗体结合的抗原特异性结合的能力。已经显示抗体的抗原结合功能可以通过全长抗体的片段来执行。包含在抗体(例如，本文所述的抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体)的术语“抗原结合部分”内的结合片段的例子包括(i)Fab片段(来自木瓜蛋白酶裂解的片段)或由V_L、V_H、LC和CH1结构域组成的相似单价片段；(ii)F(ab')2片段(来自胃蛋白酶裂解的片段)或包含由铰链区的二硫键连接的两个Fab片段的相似二价片段；(iii)由V_H和CH1结构域组成的Fd片段；(iv)由抗体单臂的V_L和V_H结构域组成的Fv片段；(v)dAb片段(Ward等人,(1989)Nature 341:544-546)，其由V_H结构域组成；(vi)分离的互补决定区(CDR)和(vii)两个或更多个分离的CDR的组合，所述两个或更多个分离的CDR可以任选地通过合成接头来连接。此外，尽管Fv片段的两个结构域V_L和V_H由单独的基因编码，但是它们可以使用重组方法通过合成接头进行连接，所述合成接头能够将它们制成单一蛋白质链，在所述单一蛋白质链中V_L和V_H区配对形成单价分子(称为单链Fv(scFv)；参见例如，Bird等人(1988)Science 242:423-426；和Huston等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883)。此类单链抗体也旨在涵盖在抗体的“抗原结合部分”术语内。这些抗体片段是使用本领域技术人员已知的常规技术获得的，并且以与完整抗体相同的方式针对效用筛选所述片段。抗原结合部分可以通过重组DNA技术或通过完整免疫球蛋白的酶促或化学切割来产生。

“癌症”是指一组广泛的不同疾病，其特征在于体内异常细胞的不受控制的生长。不受调节的细胞分裂和生长导致恶性肿瘤的形成，恶性肿瘤侵入邻近组织并且还可以通过淋巴系统或血流转移到身体的远端部分。

术语“免疫疗法”是指通过包括诱导、增强、抑制或以其他方式修饰免疫反应的方法治疗患有疾病或者有感染疾病或遭受疾病复发风险的受试者。受试者的“治疗”或“疗法”是指对受试者进行的任何类型的干预或处理，或者向受试者施用活性剂，目的是逆转、减轻、改善、抑制、减缓或预防症状、并发症或病症的发作、进展、发展、严重程度或复发或者与疾病相关的生化指标。

“程序性死亡因子-1”(PD-1)是指属于CD28家族的免疫抑制性受体。PD-1主要在体内先前激活的T细胞上表达，并且与两种配体即PD-L1和PD-L2结合。如本文所用，术语“PD-1”包括人PD-1(hPD-1)，hPD-1的变体、亚型和物种同源物，以及与hPD-1具有至少一个共同表位的类似物。完整的hPD-1序列可以在GenBank登录号U64863下找到。

“程序性死亡因子配体-1”(PD-L1)是PD-1的两种细胞表面糖蛋白配体之一(另一种是PD-L2)，其在与PD-1结合后下调T细胞激活和细胞因子分泌。如本文所用的术语“PD-L1”包括人PD-L1(hPD-L1)，hPD-L1的变体、亚型和物种同源物，以及与hPD-L1具有至少一个共同表位的类似物。完整的hPD-L1序列可以在GenBank登录号Q9NZQ7下找到。人PD-L1蛋白由人CD274基因(NCBI基因ID：29126)编码。

如本文所用，PD-1或PD-L1“抑制剂”是指能够阻断、减少或以其他方式限制PD-1与PD-L1之间的相互作用和/或PD-1和/或PD-L1的活性的任何分子。在一些方面，所述抑制剂是抗体或抗体的抗原结合片段。在其他方面，所述抑制剂包含小分子。

如本文所用，“T细胞表面糖蛋白CD8α链”或“CD8A”是指参与免疫反应并且在针对外部和内部进攻的反应中起多种功能的整体膜糖蛋白。在T细胞中，CD8a主要起针对MHC I类分子/肽复合物的共受体的功能。CD8A同时与T细胞受体(TCR)和由抗原呈递细胞(APC)呈递的MHC I类蛋白相互作用。进而，CD8a将Src激酶LCK募集到TCR-CD3复合物附近。然后，LCK通过磷酸化多种底物来启动不同的细胞内信号传导通路，最终导致细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的淋巴因子产生、运动、粘附和激活。这种机制使CTL能够识别和消除受感染的细胞和肿瘤细胞。在NK细胞中，在细胞表面上CD8A同源二聚体的存在提供了一种存活机制，其允许多个靶细胞的结合和裂解。CD8A同源二聚体分子还促进激活的淋巴细胞存活和分化为记忆CD8 T细胞。完整的CD8a氨基酸序列可以在UniProtKB识别号P01732下找到。人CD8a蛋白由人CD8a基因(NCBI基因ID：925)编码。

如本文所用，“淋巴细胞激活基因-3”、“LAG3”、“LAG-3”或“CD223”是指在激活的CD4+和CD8+ T细胞以及NK和树突状细胞亚群的细胞表面上表达的I型跨膜蛋白。LAG-3蛋白与作为T辅助细胞激活的辅助受体的CD4密切相关。两种分子均具有四个细胞外Ig样结构域，并且需要与它们的配体(主要组织相容性复合物(MHC)II类)结合来发挥其功能活性。LAG-3蛋白仅在激活的T细胞的细胞表面上表达，并且其从细胞表面的裂解终止LAG-3信号传导。LAG-3也可以被发现作为一种可溶性蛋白，其不与MHC II类结合。LAG-3在促进调节性T细胞(Treg)活性和负调节T细胞激活和增殖方面也起着重要作用。自然和诱导的Treg均表达增加的LAG-3，这是其最大抑制功能所需的。完整的人LAG-3氨基酸序列可以在UniProtKB识别号P18627下找到。人LAG3蛋白由人LAG3基因(NCBI基因ID：3902)编码。

如本文所用，“信号转导子和转录激活子1-α/β”或“STAT1”是指介导对干扰素(IFN)、细胞因子KITLG/SCF和其他细胞因子和其他生长因子的细胞反应的信号转导子和转录激活子。在I型IFN(IFN-α和IFN-β)与细胞表面受体结合后，经由蛋白质激酶的信号传导导致Jak激酶(TYK2和JAK1)的激活并且导致STAT1和STAT2的酪氨酸磷酸化。磷酸化的STAT二聚化并且与ISGF3G/IRF-9结合以形成称为ISGF3转录因子的复合物，所述复合物进入细胞核。ISGF3与IFN刺激的反应元件(ISRE)结合以激活IFN刺激的基因(ISG)的转录，从而驱动细胞处于抗病毒状态。响应于II型IFN(IFN-γ)，STAT1被酪氨酸磷酸化和丝氨酸磷酸化。然后它形成称为IFN-γ激活因子(GAF)的同二聚体，迁移到细胞核中并且与IFN-γ激活序列(GAS)结合以驱动靶基因的表达，从而诱导细胞抗病毒状态。STAT1响应于KITLG/SCF和KIT信号传导而被激活。STAT1也可以介导对激活的FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4的细胞反应。完整的人STAT1氨基酸序列可以在UniProtKB识别号P42224下找到。人STAT1蛋白由人STAT1基因(NCBI基因ID：6772)编码。

“细胞毒性T淋巴细胞抗原-4”(CTLA-4)是指属于CD28家族的免疫抑制性受体。CTLA-4在体内仅在T细胞上表达，并且与两种配体(即，CD80和CD86(也分别称为B7-1和B7-2))结合。如本文所用的术语“CTLA-4”包括人CTLA-4(hCTLA-4)，hCTLA-4的变体、亚型和物种同源物，以及与hCTLA-4具有至少一个共同表位的类似物。完整的hCTLA-4序列可以在GenBank登录号AAB59385下找到。

“受试者”包括任何人或非人动物。术语“非人动物”包括但不限于脊椎动物，如非人灵长类动物、绵羊、狗和啮齿动物(诸如小鼠、大鼠和豚鼠)。在优选的实施方案中，受试者是人。术语“受试者”和“患者”在本文可互换使用。

关于本公开文本的方法和剂量的术语“平剂量”的使用意指在不考虑患者的体重或体表面积(BSA)的情况下向患者施用的剂量。因此，所述平剂量不以mg/kg剂量提供，而是以药剂(例如，抗PD-1抗体)的绝对量提供。例如，60kg的人和100kg的人将接受相同剂量的抗体(例如，240mg的抗PD-1抗体)。

关于本公开文本的方法的术语“固定剂量”的使用意指单一组合物中的两种或更多种不同的抗体(例如，抗PD-1抗体和抗CTLA-4抗体或抗PD-L1抗体和抗CTLA-4抗体)以与彼此特定的(固定的)比率存在于组合物中。在一些实施方案中，固定剂量基于抗体的重量(例如，mg)。在某些实施方案中，固定剂量基于抗体的浓度(例如，mg/ml)。在一些实施方案中，所述比率为至少约1:1、约1:2、约1:3、约1:4、约1:5、约1:6、约1:7、约1:8、约1:9、约1:10、约1:15、约1:20、约1:30、约1:40、约1:50、约1:60、约1:70、约1:80、约1:90、约1:100、约1:120、约1:140、约1:160、约1:180、约1:200、约200:1、约180:1、约160:1、约140:1、约120:1、约100:1、约90:1、约80:1、约70:1、约60:1、约50:1、约40:1、约30:1、约20:1、约15:1、约10:1、约9:1、约8:1、约7:1、约6:1、约5:1、约4:1、约3:1或约2:1的mg第一抗体(例如，抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体)比mg第二抗体(例如，抗CTLA-4抗体)。例如，抗PD-1抗体与抗CTLA-4抗体的3:1比率可以意指小瓶可以含有约240mg的抗PD-1抗体和80mg的抗CTLA-4抗体或约3mg/ml的抗PD-1抗体和1mg/ml的抗CTLA-4抗体。

如本文所提及的术语“基于体重的剂量”意指基于患者的体重计算的向患者施用的剂量。例如，当体重为60kg的患者需要3mg/kg的抗PD-1抗体时，人们可以计算并使用适当量的抗PD-1抗体(即，180mg)进行施用。

药物或治疗剂的“治疗有效量”或“治疗有效剂量”是药物的当单独地或与另一种治疗剂组合地使用时保护受试者免受疾病的发作或促进通过疾病症状的严重程度的降低、无疾病症状期的频率和持续时间的增加或由于疾病困扰引起的损伤或残疾的预防所证实的疾病消退的任何量。可以使用熟练的从业人员已知的多种方法评价治疗剂促进疾病消退的能力，如在临床试验期间的人受试者中，在预测人体中功效的动物模型系统中，或者通过测定药剂在体外测定中的活性进行评价。

举例来说，“抗癌剂”促进受试者的癌症消退。在优选的实施方案中，治疗有效量的药物促进癌症消退至消除癌症的程度。“促进癌症消退”意指单独地或与抗肿瘤剂组合地施用有效量的药物导致肿瘤生长或尺寸的减小、肿瘤的坏死、至少一种疾病症状的严重程度的降低、无疾病症状期的频率和持续时间的增加或由于疾病困扰引起的损伤或残疾的预防。另外，关于治疗的术语“有效的”和“有效性”包括药理学有效性和生理学安全性。药理学有效性是指药物促进患者中癌症消退的能力。生理学安全性是指由药物的施用引起的在细胞、器官和/或生物体水平的毒性水平或其他不利生理效应(不利效应)。

对于肿瘤的治疗，举例来说，相对于未治疗的受试者，治疗有效量的抗癌剂优选抑制细胞生长或肿瘤生长至少约20％、更优选至少约40％、甚至更优选至少约60％、以及再更优选至少约80％。在本公开文本的其他优选的实施方案中，可以观察到肿瘤消退并且持续至少约20天、更优选地至少约40天或甚至更优选地至少约60天的时间。尽管有这些治疗有效性的最终测量，免疫治疗药物的评价还必须考虑免疫相关的反应模式。

“免疫反应”是如本领域所理解的，并且通常是指脊椎动物内针对外来因子(agent)或异常例如癌细胞的生物学反应，所述反应保护生物体免受这些因子和由其引起的疾病的侵害。免疫反应是由免疫系统的一种或多种细胞(例如，T淋巴细胞、B淋巴细胞、自然杀伤(NK)细胞、巨噬细胞、嗜酸性粒细胞、肥大细胞、树突细胞或嗜中性粒细胞)和通过这些细胞或肝脏中的任何一种产生的可溶性大分子(包括抗体、细胞因子和补体)的作用介导的，所述作用导致选择性靶向、结合、损伤、破坏和/或消除脊椎动物体中侵入的病原体、感染病原体的细胞或组织、癌性或其他异常细胞，或者在自身免疫性或病理性炎症的情况下导致选择性靶向、结合、损伤、破坏和/或消除正常的人细胞或组织。免疫反应包括例如T细胞(例如，效应T细胞、Th细胞、CD4⁺细胞、CD8⁺ T细胞或Treg细胞)的激活或抑制，或免疫系统的任何其他细胞(例如，NK细胞)的激活或抑制。

“免疫相关的反应模式”是指在用免疫治疗剂治疗的癌症患者中通常观察到的临床反应模式，所述免疫治疗剂通过诱导癌症特异性免疫反应或通过修饰天然免疫过程而产生抗肿瘤作用。此反应模式的特征在于在肿瘤负担初始增加或新病变出现之后的有益治疗效果，其在传统化学治疗剂的评价中将被分类为疾病进展并且将与药物失效同义。因此，对免疫治疗剂的适当评价可能需要长期监测这些药剂对目标疾病的影响。

如本文所用，术语“治疗”(“treat”、“treating”和“treatment”)是指对受试者进行的任何类型的干预或过程，目的是逆转、减轻、缓解、抑制或减缓或防止症状、并发症、病症或与疾病有关的生化指标的进展、发展、严重程度或复发，或提高总存活期。治疗可以是对患有疾病的受试者或没有疾病的受试者(例如，用于预防)。

将术语“有效剂量”(“effective dose”或“effective dosage”)定义为足以实现或至少部分实现所希望的效果的量。“治疗有效量”或“治疗有效剂量”的药物或治疗剂是当单独使用或与另一种治疗剂组合使用时促进通过疾病症状的严重程度的降低、无疾病症状时期的频率和持续时间的增加、总存活期的增加(从诊断日期或开始治疗疾病(诸如癌症，被诊断为患有所述疾病的患者仍然存活)的日期开始的时间长度)、或由于疾病困扰引起的损伤或残疾的预防所证实的疾病消退的任何量的药物。治疗有效量或剂量的药物包括“预防有效量”或“预防有效剂量”，所述治疗有效量或剂量的药物是当单独使用或与另一种治疗剂组合施用至有患上疾病或发生疾病复发风险的受试者时，抑制疾病的发展或复发的任何量的药物。治疗剂促进疾病消退或抑制疾病发展或复发的能力可以使用熟练从业者已知的各种方法来评价，如在临床试验期间在人受试者中，在预测于人体中的功效的动物模型系统中，或者通过在体外测定中测定药剂的活性来评价。

举例来说，抗癌剂是在受试者中促进癌症消退的药物。在一些实施方案中，治疗有效量的药物促进癌症消退至消除癌症的程度。“促进癌症消退”意指单独施用或与抗肿瘤剂组合施用有效量的药物导致肿瘤生长或尺寸的减小、肿瘤坏死、至少一种疾病症状的严重程度降低、无疾病症状时期的频率和持续时间的增加、总存活期的增加、由于疾病困扰引起的损伤或伤残的预防、或者患者中疾病症状以其他方式的改善。另外，关于治疗的术语“有效的”和“有效性”包括药理学有效性和生理学安全性。药理学有效性是指药物促进患者中癌症消退的能力。生理学安全性是指由药物的施用引起的在细胞、器官和/或生物体水平的毒性水平或其他不利生理效应(不利效应)。

对于肿瘤的治疗，举例来说，相对于未治疗的受试者，治疗有效量或剂量的药物抑制细胞生长或肿瘤生长至少约20％、至少约40％、至少约60％或至少约80％。在一些实施方案中，治疗有效量或剂量的药物完全抑制细胞生长或肿瘤生长，即，100％抑制细胞生长或肿瘤生长。可以使用本文所述的测定来评价化合物抑制肿瘤生长的能力。可替代地，可以通过检查化合物抑制细胞生长的能力来评价组合物的这种特性，可以通过熟练从业者已知的测定在体外测量这种抑制。在本文所述的一些实施方案中，可以观察到肿瘤消退并且持续至少约20天、至少约40天或至少约60天的时间。

如本文所用，术语“生物样品”是指从受试者分离的生物材料。所述生物样品可以含有适合于例如通过对肿瘤(或循环肿瘤细胞)中的核酸测序并且鉴定所测序的核酸中的基因组改变来确定靶基因表达的任何生物材料。所述生物样品可以是任何合适的生物组织或流体，如例如肿瘤组织、血液、血浆和血清。在一个实施方案中，所述样品是肿瘤组织活检样品，例如福尔马林固定的石蜡包埋的(FFPE)肿瘤组织或新鲜冷冻的肿瘤组织等。在另一个实施方案中，所述生物样品是液体活检样品，在一些实施方案中，其包括血液、血清、血浆、循环肿瘤细胞、外泌体RNA、ctDNA和cfDNA中的一种或多种。

如本文所用的术语“约每周一次”、“约每两周一次”或任何其他类似的给药间隔术语意指近似数。“约每周一次”可以包括每七天±一天，即每六天至每八天。“约每两周一次”可以包括每十四天±三天，即每十一天至每十七天。例如，类似的近似适用于约每三周一次、约每四周一次、约每五周一次、约每六周一次和约每十二周一次。在一些实施方案中，约每六周一次或约每十二周一次的给药间隔分别意指可以在第一周的任何一天施用第一剂量，并且然后可以在第六周或第十二周的任何一天施用下一剂量。在其他实施方案中，约每六周一次或约每十二周一次的给药间隔分别意指在第一周的特定日子(例如，星期一)施用第一剂量，并且然后在第六周或第十二周的同一天(即，星期一)施用下一剂量。

替代方案(例如，“或”)的使用应当理解为意指替代方案之一、两者或其任何组合。如本文所用，不定冠词“一个/种”(“a”或“an”)应当理解为是指任何所列举或枚举的组分中的“一个/种或多个/种”。

术语“约”或“基本上由……构成”是指在如通过本领域普通技术人员确定的特定值或组成的可接受误差范围内的值或组成，其将部分取决于如何测量或确定所述值或组成，即测量系统的限制。例如，根据本领域的实践，“约”或“基本上包含……”可以意指在1个或多于1个标准差内。可替代地，“约”或“基本上包含……”可以意指多达10％的范围。此外，特别是关于生物系统或过程，所述术语可以意指某值的多达一个数量级或多达5倍。当在本申请和权利要求中提供特定值或组成时，除非另有说明，否则应假定“约”或“基本上由……构成”的含义在该特定值或组成的可接受误差范围内。

如本文所述，除非另有指示，否则任何浓度范围、百分比范围、比率范围或整数范围应理解为包括所述范围内的任何整数的值以及在适当时所述值的得分(如整数的十分之一和百分之一)。

本文使用的缩写在整个本公开文本中定义。表1提供了另外的缩写列表。

表1：缩写列表

在以下小节中进一步详细地描述本公开文本的各个方面。

II.本公开文本的方法

本公开文本涉及治疗人类受试者的肿瘤的方法，所述方法包括向所述受试者施用PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体，其中所述肿瘤在所述施用之前展现出高炎症标签得分。在一些实施方案中，所述炎症标签得分是通过测量从所述受试者获得的肿瘤样品中的一组炎症基因(“炎症基因组”)的表达来确定的；并且其中所述炎症基因组包含CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1。

在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于约20、小于约19、小于约18、小于约17、小于约16、小于约15、小于约14、小于约13、小于约12、小于约11、小于约10、小于约9、小于约、小于约8、小于约7、小于约6或小于约5个炎症基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于20个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于19个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于18个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于17个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于16个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于15个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于14个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于13个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于12个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于11个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于10个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于9个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于8个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于7个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于6个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由小于5个基因组成。在某些实施方案中，所述炎症基因组由4个基因组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1组成。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)和CD8A，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)和LAG3，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)和STAT1，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD8A和LAG3，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD8A和STAT1，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)LAG3和STAT1，和(ii)2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、16个另外的炎症基因、或17个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A和LAG3，和(ii)1个另外的炎症基因、2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、或16个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A和STAT1，和(ii)1个另外的炎症基因、2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、或16个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、LAG3和STAT1，和(ii)1个另外的炎症基因、2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、或16个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)1个另外的炎症基因、2个另外的炎症基因、3个另外的炎症基因、4个另外的炎症基因、5个另外的炎症基因、6个另外的炎症基因、7个另外的炎症基因、8个另外的炎症基因、9个另外的炎症基因、10个另外的炎症基因、11个另外的炎症基因、12个另外的炎症基因、13个另外的炎症基因、14个另外的炎症基因、15个另外的炎症基因、或16个另外的炎症基因。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)1个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)2个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)3个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)4个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)5个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)6个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)7个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)8个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)9个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)10个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)11个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)12个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)13个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成(或由以下组成)：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)14个另外的炎症基因。在一些炎症基因组中，主要由以下组成：(i)CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1，和(ii)15个另外的炎症基因。

与炎症相关的多种基因是本领域已知的，并且可以包括在本文公开的炎症基因组中。例如，所述另外的炎症基因可以选自：CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCR5、CD27、CD274、CD276、CMKLR1、CXCL10、CXCL11、CXCL9、CXCR6、GZMA、GZMK、HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOA、HLA-DOB、HLA-DQA1、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-E、ICOS、IDO1、IFNG、IRF1、NKG7、PDCD1LG2、PRF1、PSMB10、TIGIT、及其任何组合。

在一些实施方案中，所述炎症基因组主要由CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1组成。在一些实施方案中，所述炎症基因组由CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1组成。

II.A.炎症标签得分

如本文所用，炎症标签得分是在从受试者获得的样品中的炎症基因组(例如，包含CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1、基本上由其组成或由其组成)中存在的基因的组合表达水平的测量。包含一种或多种肿瘤细胞的任何生物样品可以用于本文公开的方法中。在一些实施方案中，所述样品选自肿瘤活检样品、血液样品、血清样品或其任何组合。在某些实施方案中，所述样品是在施用抗PD-1抗体之前从受试者收集的肿瘤活检样品。在特定实施方案中，从受试者获得的样品是福尔马林固定的肿瘤活检样品。在一些实施方案中，从受试者获得的样品是石蜡包埋的肿瘤活检样品。在一些实施方案中，从受试者获得的样品是新鲜冷冻的肿瘤活检样品。

本领域中已知用于测量特定基因或一组基因的表达的任何方法均可以用于本公开文本的方法中。在一些实施方案中，在所述炎症基因组中的一种或多种炎症基因的表达是通过检测从炎症基因转录的mRNA的存在、由所述炎症基因编码的蛋白质的存在或二者确定的。

在一些实施方案中，一种或多种炎症基因的表达是通过测量从受试者获得的样品中的炎症基因mRNA的水平，例如通过测量LAG3 mRNA、PD-L1 mRNA、CD8A mRNA和STAT1 mRNA中的一种或多种的水平确定的。在某些实施方案中，炎症基因得分是通过测量从受试者获得的样品中的LAG3 mRNA、PD-L1 mRNA、CD8A mRNA和STAT1 mRNA水平确定的。本领域已知的任何方法均可以用于测量炎症基因mRNA的水平。在一些实施方案中，所述炎症基因mRNA是使用逆转录酶PCR测量的。在一些实施方案中，所述炎症基因mRNA是使用RNA原位杂交测量的。

在一些实施方案中，一种或多种炎症基因的表达是通过测量从受试者获得的样品中的炎症基因蛋白的水平，例如通过测量PD-L1、CD8A、LAG-3和STAT1中的一种或多种的水平确定的。在某些实施方案中，炎症基因得分是通过测量从受试者获得的样品中的PD-L1、CD8A、LAG-3和STAT1的水平确定的。本领域已知的任何方法均可以用于测量炎症基因蛋白水平。在一些实施方案中，所述炎症基因蛋白是使用免疫组织化学(IHC)测定测量的。在某些实施方案中，所述IHC测定是自动化IHC测定。

在一些实施方案中，所述炎症基因组的一种或多种炎症基因的表达相对于一种或多种管家基因的表达而被归一化。在一些实施方案中，所述一种或多种管家基因由在多种受试者中跨多种肿瘤类型具有相对一致表达的基因组成。

在一些实施方案中，原始基因表达值根据标准基因表达特征(GEP)方案而被归一化。在这些实施方案中，可以将基因表达标签得分计算为标签中所有靶基因的log2-转化的归一化和标度的表达值的中值或平均值，并且以线性标度呈现。在某些实施方案中，得分具有正值或负值，这取决于在特定条件下基因表达是上调还是下调。

在某些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于大于参考炎症标签得分的炎症标签得分。在一些实施方案中，参考炎症标签得分是平均炎症标签得分。在一些实施方案中，平均炎症标签得分是通过以下方式确定的：测量在从受试者群体获得的肿瘤样品中的炎症基因组中存在的基因的表达并且计算受试者群体的平均值。在一些实施方案中，受试者群体的每个成员均患有与施用抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗CTLA-4抗体或其任何组合的受试者相同的肿瘤。在特定实施方案中，所述平均炎症标签得分为约-0.07、约-0.06、-0.05、约-0.04、约-0.03或约-0.02。在特定实施方案中，所述平均炎症标签得分为约-0.04。在某些实施方案中，所述平均炎症标签得分为约-0.0434。

在一些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约25％、至少约30％、至少约35％、至少约40％、至少约45％、至少约50％、至少约55％、至少约60％、至少约65％、至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约100％、至少约125％、至少约150％、至少约175％、至少约200％、至少约225％、至少约250％、至少约275％、或至少约300％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约25％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约30％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约35％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约40％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约45％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约50％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约55％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约60％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约65％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约70％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约75％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约80％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约85％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约90％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约95％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约100％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约125％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约150％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约175％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约200％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约225％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约250％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约275％的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于高于平均炎症标签得分至少约300％的炎症标签得分。

在一些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.25倍、至少约1.30倍、至少约1.35倍、至少约1.40倍、至少约1.45倍、至少约1.50倍、至少约1.55倍、至少约1.60倍、至少约1.65倍、至少约1.70倍、至少约1.75倍、至少约1.80倍、至少约1.85倍、至少约1.90倍、至少约1.95倍、至少约2倍、至少约2.25倍、至少约2.50倍、至少约2.75倍、至少约3倍、至少约3.25倍、至少约3.50倍、至少约3.75倍、或至少约400倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.25倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.30倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.35倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.40倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.45倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.50倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.55倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.60倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.65倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.70倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.75倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.80倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.85倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.90倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约1.95倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约2倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约2.25倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约2.50倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约2.75倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约3倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约3.25倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约3.50倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约3.75倍的炎症标签得分。在某些实施方案中，高炎症得分的特征在于平均炎症标签得分的至少约4倍的炎症标签得分。

在某些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约0.5的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约0.75的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约1.0的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约1.25的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约1.50的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约1.75的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约2.0的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约2.25的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约2.5的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约2.75的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。在一些实施方案中，高炎症标签得分的特征在于至少约3.0的炎症标签得分，其中所述炎症标签得分是根据本文公开的方法确定的。

II.B.抗体

本公开文本涉及一种用于治疗患有癌症的人类受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用PD-1抑制剂，例如抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体。在一些实施方案中，所述受试者被施用抗PD-1单一疗法，例如，其中所述受试者不被施用一种或多种另外的抗癌剂。在一些实施方案中，受试者被施用组合疗法，例如，其中受试者被施用抗PD-1抗体和一种或多种另外的抗癌剂。在某些实施方案中，所述受试者被施用包含抗PD-1抗体和抗CTLA-4抗体的组合疗法。

在本公开文本的其他方面，抗PD-L1抗体替代抗PD-1抗体。在某些实施方案中，所述方法包括向受试者施用抗PD-L1抗体。在一些实施方案中，所述受试者被施用抗PD-L1单一疗法。在一些实施方案中，所述受试者被施用包含抗PD-L1抗体和第二抗癌剂(例如，抗CTLA-4抗体)的组合疗法。

II.B.1.可用于本公开文本的抗PD-1抗体

本领域已知的抗PD-1抗体可以用于本发明所述的组合物和方法中。以高亲和力与PD-1特异性结合的多种人单克隆抗体已经公开在美国专利号8,008,449中。已经证明美国专利号8,008,449中公开的抗PD-1人抗体展现出以下特征中的一种或多种：(a)以1×10^-7M或更小的K_D与人PD-1结合，如使用Biacore生物传感器系统通过表面等离子体共振确定的；(b)基本上不与人CD28、CTLA-4或ICOS结合；(c)在混合淋巴细胞反应(MLR)测定中增加T细胞增殖；(d)在MLR测定中增加干扰素-γ产生；(e)在MLR测定中增加IL-2分泌；(f)与人PD-1和食蟹猴PD-1结合；(g)抑制PD-L1和/或PD-L2与PD-1的结合；(h)刺激抗原特异性记忆反应；(i)刺激抗体反应；以及(j)抑制体内肿瘤细胞生长。可用于本公开文本中的抗PD-1抗体包括与人PD-1特异性结合并且展现出前述特征中的至少一种、在一些实施方案中至少五种的单克隆抗体。

其他抗PD-1单克隆抗体已经描述于例如以下文献中：美国专利号6,808,710、7,488,802、8,168,757和8,354,509，美国公开号2016/0272708，以及PCT公开号WO 2012/145493、WO 2008/156712、WO 2015/112900、WO 2012/145493、WO 2015/112800、WO 2014/206107、WO 2015/35606、WO 2015/085847、WO 2014/179664、WO 2017/020291、WO 2017/020858、WO 2016/197367、WO 2017/024515、WO 2017/025051、WO 2017/123557、WO 2016/106159、WO 2014/194302、WO 2017/040790、WO 2017/133540、WO 2017/132827、WO 2017/024465、WO 2017/025016、WO 2017/106061、WO 2017/19846、WO 2017/024465、WO 2017/025016、WO 2017/132825和WO 2017/133540，将其中的每一篇均通过引用以其整体并入。

在一些实施方案中，所述抗PD-1抗体选自纳武单抗(也称为5C4、BMS-936558、MDX-1106和ONO-4538)、派姆单抗(Merck；也称为帕博利珠单抗和MK-3475；参见WO 2008/156712)、PDR001(Novartis；参见WO 2015/112900)、MEDI-0680(AstraZeneca；也称为AMP-514；参见WO 2012/145493)、西米普利单抗(Regeneron；也称为REGN-2810；参见WO 2015/112800)、JS001(TAIZHOU JUNSHI PHARMA；也称为特瑞普利单抗(toripalimab)；参见Si-Yang Liu等人,J.Hematol.Oncol.10:136(2017))、BGB-A317(Beigene；也称为替雷利珠单抗；参见WO 2015/35606和US 2015/0079109)、INCSHR1210(Jiangsu Hengrui Medicine；也称为SHR-1210；参见WO 2015/085847；Si-Yang Liu等人,J.Hematol.Oncol.10:136(2017))、TSR-042(Tesaro Biopharmaceutical；也称为ANB011；参见WO 2014/179664)、GLS-010(Wuxi/Harbin Gloria Pharmaceuticals；也称为WBP3055；参见Si-Yang Liu等人,J.Hematol.Oncol.10:136(2017))、AM-0001(Armo)、STI-1110(Sorrento Therapeutics；参见WO 2014/194302)、AGEN2034(Agenus；参见WO 2017/040790)、MGA012(Macrogenics，参见WO 2017/19846)、BCD-100(Biocad；Kaplon等人,mAbs10(2):183-203(2018)、和IBI308(Innovent；参见WO 2017/024465、WO 2017/025016、WO2017/132825和WO 2017/133540)。

在一个实施方案中，所述抗PD-1抗体是纳武单抗。纳武单抗是完全人IgG4(S228P)PD-1免疫检查点抑制剂抗体，其选择性地阻止与PD-1配体(PD-L1和PD-L2)的相互作用，从而阻断抗肿瘤T细胞功能的下调(美国专利号8,008,449；Wang等人,2014Cancer ImmunolRes.2(9):846-56)。

在另一个实施方案中，所述抗PD-1抗体是派姆单抗。派姆单抗是针对人细胞表面受体PD-1(程序性死亡因子-1或程序性细胞死亡因子-1)的人源化单克隆IgG4(S228P)抗体。派姆单抗描述于例如美国专利号8,354,509和8,900,587中。

可用于所公开的组合物和方法中的抗PD-1抗体还包括分离的抗体，其与人PD-1特异性结合并且与本文公开的任何抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)交叉竞争与人PD-1的结合(参见例如，美国专利号8,008,449和8,779,105；WO 2013/173223)。在一些实施方案中，所述抗PD-1抗体与本文所述的任何抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)结合相同的表位。抗体交叉竞争结合抗原的能力指示这些单克隆抗体结合抗原的相同表位区域并且在空间上阻碍其他交叉竞争抗体与这个特定表位区域的结合。预期这些交叉竞争抗体由于它们结合PD-1的相同表位区域而具有与参考抗体(例如，纳武单抗)的那些非常相似的功能特性。在标准PD-1结合测定(如Biacore分析、ELISA测定或流式细胞术)中可以基于交叉竞争抗体与纳武单抗交叉竞争的能力容易地鉴定它们(参见例如，WO 2013/173223)。

在某些实施方案中，与纳武单抗交叉竞争与人PD-1的结合或与纳武单抗结合人PD-1抗体的相同表位区域的抗体是单克隆抗体。对于施用于人类受试者，这些交叉竞争抗体是嵌合抗体、工程化抗体或者人源化抗体或人抗体。可以通过本领域熟知的方法来制备和分离此类嵌合、工程化、人源化或人单克隆抗体。

可用于所公开的公开文本的组合物和方法中的抗PD-1抗体还包括上述抗体的抗原结合部分。已经充分地证明，抗体的抗原结合功能可以通过全长抗体的片段来执行。

适用于所公开的组合物和方法的抗PD-1抗体是以高特异性和亲和力与PD-1结合、阻断PD-L1和或PD-L2的结合并抑制PD-1信号传导通路的免疫抑制作用的抗体。在本文公开的任何组合物或方法中，抗PD-1“抗体”包括与PD-1受体结合并且在抑制配体结合和上调免疫系统方面展现出与全抗体的那些相似的功能特性的抗原结合部分或片段。在某些实施方案中，抗PD-1抗体或其抗原结合部分与纳武单抗交叉竞争与人PD-1的结合。

在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以在从0.1mg/kg至20.0mg/kg体重的范围内的剂量每2、3、4、5、6、7或8周一次施用，例如以0.1mg/kg至10.0mg/kg体重每2、3或4周一次施用。在其他实施方案中，将抗PD-1抗体以约2mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约9mg/kg或10mg/kg体重的剂量每2周一次施用。在其他实施方案中，将抗PD-1抗体以约2mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约9mg/kg或10mg/kg体重的剂量每3周一次施用。在一个实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约5mg/kg体重的剂量约每3周一次施用。在另一个实施方案中，将所述抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)以约3mg/kg体重的剂量约每2周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-1抗体(例如，派姆单抗)以约2mg/kg体重的剂量约每3周一次施用。

可以将可用于本公开文本的抗PD-1抗体以平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以从约100至约1000mg、从约100mg至约900mg、从约100mg至约800mg、从约100mg至约700mg、从约100mg至约600mg、从约100mg至约500mg、从约200mg至约1000mg、从约200mg至约900mg、从约200mg至约800mg、从约200mg至约700mg、从约200mg至约600mg、从约200mg至约500mg、从约200mg至约480mg或从约240mg至约480mg的平剂量施用。在一个实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10周的给药间隔以至少约200mg、至少约220mg、至少约240mg、至少约260mg、至少约280mg、至少约300mg、至少约320mg、至少约340mg、至少约360mg、至少约380mg、至少约400mg、至少约420mg、至少约440mg、至少约460mg、至少约480mg、至少约500mg、至少约520mg、至少约540mg、至少约550mg、至少约560mg、至少约580mg、至少约600mg、至少约620mg、至少约640mg、至少约660mg、至少约680mg、至少约700mg或至少约720mg的平剂量施用。在另一个实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约1、2、3或4周的给药间隔以约200mg至约800mg、约200mg至约700mg、约200mg至约600mg、约200mg至约500mg的平剂量施用。

在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每3周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每2周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约240mg的平剂量约每2周一次施用。在某些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约480mg的平剂量约每4周一次施用。

在一些实施方案中，将纳武单抗以约240mg的平剂量约每2周一次施用。在一些实施方案中，将纳武单抗以约240mg的平剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将纳武单抗以约360mg的平剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将纳武单抗以约480mg的平剂量约每4周一次施用。

在一些实施方案中，将派姆单抗以约200mg的平剂量约每2周一次施用。在一些实施方案中，将派姆单抗以约200mg的平剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将派姆单抗以约400mg的平剂量约每4周一次施用。

在一些方面，所述PD-1抑制剂是小分子。在一些方面，所述PD-1抑制剂包含millamolecule。在一些方面，所述PD-1抑制剂包含大环肽。在某些方面，所述PD-1抑制剂包含BMS-986189。在一些方面，所述PD-1抑制剂包含国际申请号WO 2014/151634中公开的抑制剂，将所述申请通过引用以其整体并入本文。在一些方面，所述PD-1抑制剂包含INCMGA00012(Incyte Corporation)。在一些方面，所述PD-1抑制剂包含本文公开的抗PD-1抗体与PD-1小分子抑制剂的组合。

II.B.2.可用于本公开文本的抗PD-L1抗体

在某些实施方案中，在本文公开的任何方法中，用抗PD-L1抗体替代抗PD-1抗体。本领域已知的抗PD-L1抗体可以用于本公开文本的组合物和方法中。可用于本公开文本的组合物和方法中的抗PD-L1抗体的例子包括美国专利号9,580,507中公开的抗体。已经证明美国专利号9,580,507中公开的抗PD-L1人单克隆抗体展现出以下特征中的一种或多种：(a)以1×10^-7M或更小的K_D与人PD-L1结合，如使用Biacore生物传感器系统通过表面等离子体共振确定的；(b)在混合淋巴细胞反应(MLR)测定中增加T细胞增殖；(c)在MLR测定中增加干扰素-γ产生；(d)在MLR测定中增加IL-2分泌；(e)刺激抗体反应；以及(f)逆转T调节细胞对T细胞效应细胞和/或树突细胞的作用。可用于本公开文本中的抗PD-L1抗体包括与人PD-L1特异性结合并且展现出前述特征中的至少一种、在一些实施方案中至少五种的单克隆抗体。

在某些实施方案中，所述抗PD-L1抗体选自BMS-936559(也称为12A4，MDX-1105；参见例如，美国专利号7,943,743和WO 2013/173223)、阿特珠单抗(Roche；也称为MPDL3280A、RG7446；参见US 8,217,149；还参见Herbst等人(2013)JClin Oncol 31(增刊):3000)、度伐单抗(AstraZeneca；也称为IMFINZI^TM、MEDI-4736；参见WO 2011/066389)、阿维鲁单抗(Pfizer；也称为MSB-0010718C；参见WO2013/079174)、STI-1014(Sorrento；参见WO 2013/181634)、CX-072(Cytomx；参见WO 2016/149201)、KN035(3D Med/Alphamab；参见Zhang等人,Cell Discov.7:3(2017年3月)、LY3300054(Eli Lilly Co.；参见例如，WO 2017/034916)、BGB-A333(BeiGene；参见Desai等人,JCO 36(15增刊):TPS3113(2018))和CK-301(Checkpoint Therapeutics；参见Gorelik等人,AACR:Abstract 4606(2016年4月))。

在某些实施方案中，PD-L1抗体是阿特珠单抗阿特珠单抗是完全人源化IgG1单克隆抗PD-L1抗体。

在某些实施方案中，PD-L1抗体是度伐单抗(IMFINZI^TM)。度伐单抗是人IgG1κ单克隆抗PD-L1抗体。

在某些实施方案中，所述PD-L1抗体是阿维鲁单抗阿维鲁单抗是人IgG1λ单克隆抗PD-L1抗体。

可用于所公开的组合物和方法中的抗PD-L1抗体还包括分离的抗体，其与人PD-L1特异性结合并且与本文公开的任何抗PD-L1抗体(例如，阿特珠单抗、度伐单抗和/或阿维鲁单抗)交叉竞争与人PD-L1的结合。在一些实施方案中，所述抗PD-L1抗体与本文所述的任何抗PD-L1抗体(例如，阿特珠单抗、度伐单抗和/或阿维鲁单抗)结合相同的表位。抗体交叉竞争结合抗原的能力指示这些抗体结合抗原的相同表位区域并且在空间上阻碍其他交叉竞争抗体与这个特定表位区域的结合。预期这些交叉竞争抗体由于它们结合PD-L1的相同表位区域而具有与参考抗体(例如，阿特珠单抗和/或阿维鲁单抗)的那些非常相似的功能特性。在标准PD-L1结合测定(诸如Biacore分析、ELISA测定或流式细胞术)中可以基于交叉竞争抗体与阿特珠单抗和/或阿维鲁单抗交叉竞争的能力容易地鉴定它们(参见例如，WO2013/173223)。

在某些实施方案中，与阿特珠单抗、度伐单抗和/或阿维鲁单抗交叉竞争与人PD-L1的结合或与阿特珠单抗、度伐单抗和/或阿维鲁单抗结合人PD-L1抗体的相同表位区域的抗体是单克隆抗体。对于施用于人类受试者，这些交叉竞争抗体是嵌合抗体、工程化抗体或者人源化抗体或人抗体。可以通过本领域熟知的方法来制备和分离此类嵌合、工程化、人源化或人单克隆抗体。

可用于所公开的公开文本的组合物和方法中的抗PD-L1抗体还包括以上抗体的抗原结合部分。已经充分地证明，抗体的抗原结合功能可以通过全长抗体的片段来执行。

适用于所公开的组合物和方法的抗PD-L1抗体是以高特异性和亲和力与PD-L1结合、阻断PD-1的结合并且抑制PD-1信号传导通路的免疫抑制作用的抗体。在本文公开的任何组合物或方法中，抗PD-L1“抗体”包括与PD-L1结合并且在抑制受体结合和上调免疫系统方面展现出与全抗体的那些相似的功能特性的抗原结合部分或片段。在某些实施方案中，所述抗PD-L1抗体或其抗原结合部分与阿特珠单抗、度伐单抗和/或阿维鲁单抗交叉竞争与人PD-L1的结合。

可用于本公开文本的抗PD-L1抗体可以是与PD-L1特异性结合的任何PD-L1抗体，例如与度伐单抗、阿维鲁单抗或阿特珠单抗交叉竞争与人PD-1的结合的抗体，例如与度伐单抗、阿维鲁单抗或阿特珠单抗结合相同表位的抗体。在特定实施方案中，所述抗PD-L1抗体是度伐单抗。在其他实施方案中，所述抗PD-L1抗体是阿维鲁单抗。在一些实施方案中，所述抗PD-L1抗体是阿特珠单抗。

在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以在从约0.1mg/kg至约20.0mg/kg体重范围内、约2mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约9mg/kg、约10mg/kg、约11mg/kg、约12mg/kg、约13mg/kg、约14mg/kg、约15mg/kg、约16mg/kg、约17mg/kg、约18mg/kg、约19mg/kg或约20mg/kg的剂量约每2、3、4、5、6、7或8周一次施用。

在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约15mg/kg体重的剂量约每3周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约10mg/kg体重的剂量约每2周一次施用。

在其他实施方案中，可用于本公开文本的抗PD-L1抗体是平剂量。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约200mg至约1600mg、约200mg至约1500mg、约200mg至约1400mg、约200mg至约1300mg、约200mg至约1200mg、约200mg至约1100mg、约200mg至约1000mg、约200mg至约900mg、约200mg至约800mg、约200mg至约700mg、约200mg至约600mg、约700mg至约1300mg、约800mg至约1200mg、约700mg至约900mg或约1100mg至约1300mg的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以至少约240mg、至少约300mg、至少约320mg、至少约400mg、至少约480mg、至少约500mg、至少约560mg、至少约600mg、至少约640mg、至少约700mg、至少720mg、至少约800mg、至少约840mg、至少约880mg、至少约900mg、至少960mg、至少约1000mg、至少约1040mg、至少约1100mg、至少约1120mg、至少约1200mg、至少约1280mg、至少约1300mg、至少约1360mg或至少约1400mg的平剂量以约1、2、3或4周的给药间隔施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约1200mg的平剂量约每3周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约800mg的平剂量约每2周一次施用。在其他实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约840mg的平剂量约每2周一次施用。

在一些实施方案中，将阿特珠单抗以约1200mg的平剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将阿特珠单抗以约800mg的平剂量约每2周一次施用。在一些实施方案中，将阿特珠单抗以约840mg的平剂量约每2周一次施用。

在一些实施方案中，将阿维鲁单抗以约800mg的平剂量约每2周一次施用。

在一些实施方案中，将度伐单抗以约10mg/kg的剂量约每2周一次施用。在一些实施方案中，将度伐单抗以约800mg/kg的平剂量约每2周一次施用。在一些实施方案中，将度伐单抗以约1200mg/kg的平剂量约每3周一次施用。

在一些方面，所述PD-L1抑制剂是小分子。在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含millamolecule。在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含大环肽。在某些方面，所述PD-L1抑制剂包含BMS-986189。

在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含具有式(I)中所示的式的millamolecule：

其中R¹-R¹³是氨基酸侧链，R^a-Rⁿ是氢、甲基、或形成具有邻位R基团的环，并且R¹⁴是-C(O)NHR¹⁵，其中R¹⁵是氢、或任选地被另外的甘氨酸残基和/或可以改善药代动力学特性的尾取代的甘氨酸残基。在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含国际申请号WO 2014/151634中公开的化合物，将所述申请通过引用以其整体并入本文。在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含国际申请号WO 2016/039749、WO 2016/149351、WO 2016/077518、WO 2016/100285、WO2016/100608、WO 2016/126646、WO 2016/057624、WO 2017/151830、WO 2017/176608、WO2018/085750、WO 2018/237153、或WO 2019/070643中公开的化合物，将所述国际申请中的每一个通过引用以其整体并入本文。

在某些方面，所述PD-L1抑制剂包含国际申请号WO 2015/034820、WO 2015/160641、WO 2018/044963、WO 2017/066227、WO 2018/009505、WO 2018/183171、WO 2018/118848、WO 2019/147662、或WO 2019/169123中公开的小分子PD-L1抑制剂，将所述国际申请中的每一个通过引用以其整体并入本文。

在一些方面，所述PD-L1抑制剂包含本文公开的抗PD-L1抗体和本文公开的PD-L1小分子抑制剂的组合。

II.B.3.抗CTLA-4抗体

本领域已知的抗CTLA-4抗体可以用于本公开文本的组合物和方法中。本公开文本的抗CTLA-4抗体与人CTLA-4结合，从而破坏CTLA-4与人B7受体的相互作用。由于CTLA-4与B7的相互作用转导导致携带CTLA-4受体的T细胞失活的信号，因此相互作用的破坏有效地诱导、增强或延长此类T细胞的激活，从而诱导、增强或延长免疫反应。

以高亲和力与CTLA-4特异性结合的人单克隆抗体已经公开在美国专利号6,984,720中。其他抗CTLA-4单克隆抗体已经描述于例如以下文献中：美国专利号5,977,318、6,051,227、6,682,736和7,034,121，以及国际公开号WO 2012/122444、WO 2007/113648、WO2016/196237和WO 2000/037504，将其中的每一篇通过引用以其整体并入本文。已经证明在美国专利号6,984,720中公开的抗CTLA-4人单克隆抗体展现出以下特征中的一种或多种：(a)以至少约10⁷M^-1、或约10⁹M^-1、或约10¹⁰M^-1至10¹¹M^-1或更高的平衡缔合常数(K_a)所反映的结合亲和力与人CTLA-4特异性结合，如通过Biacore分析确定的；(b)动力学缔合常数(k_a)为至少约10³、约10⁴或约10⁵m^-1s^-1；(c)动力学解离常数(k_d)为至少约10³、约10⁴或约10⁵m^-1s^-1；以及(d)抑制CTLA-4与B7-1(CD80)和B7-2(CD86)的结合。可用于本公开文本的抗CTLA-4抗体包括与人CTLA-4特异性结合并展现出前述特征中的至少一种、至少两种或至少三种的单克隆抗体。

在某些实施方案中，所述CTLA-4抗体选自伊匹单抗(也称为MDX-010、10D1；参见美国专利号6,984,720)、MK-1308(Merck)、AGEN-1884(Agenus Inc.；参见WO2016/196237)以及曲美木单抗(AstraZeneca；也称为替西木单抗(ticilimumab)、CP-675,206；参见WO 2000/037504和Ribas,Update Cancer Ther.2(3):133-39(2007))。在特定实施方案中，所述抗CTLA-4抗体是伊匹单抗。

在特定实施方案中，所述CTLA-4抗体是用于本文公开的组合物和方法的伊匹单抗。伊匹单抗是完全人IgG1单克隆抗体，所述抗体阻断CTLA-4与其B7配体的结合，从而刺激T细胞激活并改善患有晚期黑素瘤的患者的总存活期(OS)。

在特定实施方案中，所述CTLA-4抗体是曲美木单抗。

在特定实施方案中，所述CTLA-4抗体是MK-1308。

在特定实施方案中，所述CTLA-4抗体是AGEN-1884。

可用于所公开的组合物和方法中的抗CTLA-4抗体还包括分离的抗体，其与人CTLA-4特异性结合并与本文公开的任何抗CTLA-4抗体(例如，伊匹单抗和/或曲美木单抗)交叉竞争与人CTLA-4的结合。在一些实施方案中，所述抗CTLA-4抗体与本文所述的任何抗CTLA-4抗体(例如，伊匹单抗和/或曲美木单抗)结合相同的表位。抗体交叉竞争结合抗原的能力指示这些抗体结合抗原的相同表位区域并且在空间上阻碍其他交叉竞争抗体与这个特定表位区域的结合。预期这些交叉竞争抗体由于它们结合CTLA-4的相同表位区域而具有与参考抗体(例如，伊匹单抗和/或曲美木单抗)的那些非常相似的功能特性。在标准CTLA-4结合测定(如Biacore分析、ELISA测定或流式细胞术)中可以基于交叉竞争抗体与伊匹单抗和/或曲美木单抗交叉竞争的能力容易地鉴定它们(参见例如，WO 2013/173223)。

在某些实施方案中，与伊匹单抗和/或曲美木单抗交叉竞争与人CTLA-4的结合或与伊匹单抗和/或曲美木单抗结合人CTLA-4抗体的相同表位区域的抗体是单克隆抗体。对于施用于人类受试者，这些交叉竞争抗体是嵌合抗体、工程化抗体或者人源化抗体或人抗体。可以通过本领域熟知的方法来制备和分离此类嵌合、工程化、人源化或人单克隆抗体。

可用于所公开的公开文本的组合物和方法中的抗CTLA-4抗体还包括以上抗体的抗原结合部分。已经充分地证明，抗体的抗原结合功能可以通过全长抗体的片段来执行。

适用于所公开的方法或组合物的抗CTLA-4抗体是以高特异性和亲和力与CTLA-4结合、阻断CTLA-4的活性并破坏CTLA-4与人B7受体的相互作用的抗体。在本文公开的任何组合物或方法中，抗CTLA-4“抗体”包括与CTLA-4结合并且在抑制CTLA-4与人B7受体的相互作用和上调免疫系统方面展现出与全抗体的那些相似的功能特性的抗原结合部分或片段。在某些实施方案中，所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分与伊匹单抗和/或曲美木单抗交叉竞争与人CTLA-4的结合。

在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以在从0.1mg/kg至10.0mg/kg体重的范围内的剂量每2、3、4、5、6、7或8周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以1mg/kg或3mg/kg体重的剂量每3、4、5或6周施用一次。在一个实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以3mg/kg体重的剂量每2周一次施用。在另一个实施方案中，将所述抗PD-1抗体或其抗原结合部分以1mg/kg体重的剂量每6周一次施用。

在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体以约10至约1000mg、约10mg至约900mg、约10mg至约800mg、约10mg至约700mg、约10mg至约600mg、约10mg至约500mg、约100mg至约1000mg、约100mg至约900mg、约100mg至约800mg、约100mg至约700mg、约100mg至约100mg、约100mg至约500mg、约100mg至约480mg或约240mg至约480mg的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以至少约60mg、至少约80mg、至少约100mg、至少约120mg、至少约140mg、至少约160mg、至少约180mg、至少约200mg、至少约220mg、至少约240mg、至少约260mg、至少约280mg、至少约300mg、至少约320mg、至少约340mg、至少约360mg、至少约380mg、至少约400mg、至少约420mg、至少约440mg、至少约460mg、至少约480mg、至少约500mg、至少约520mg至少约540mg、至少约550mg、至少约560mg、至少约580mg、至少约600mg、至少约620mg、至少约640mg、至少约660mg、至少约680mg、至少约700mg或至少约720mg的平剂量施用。在另一个实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体或其抗原结合部分以平剂量约每1、2、3、4、5、6、7或8周一次施用。

在一些实施方案中，将伊匹单抗以约3mg/kg的剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将伊匹单抗以约10mg/kg的剂量约每3周一次施用。在一些实施方案中，将伊匹单抗以约10mg/kg的剂量约每12周一次施用。在一些实施方案中，将伊匹单抗施用四个剂量。

II.B.4.组合疗法

在某些实施方案中，将所述抗PD-1抗体、所述抗PD-L1抗体和/或所述抗CTLA-4抗体以治疗有效量施用。在一些实施方案中，所述方法包括施用治疗有效量的抗PD-1抗体和抗CTLA-4抗体。在其他实施方案中，所述方法包括施用治疗有效量的抗PD-L1抗体和抗CTLA-4抗体。本文公开的任何抗PD-1、抗PD-L1或抗CTLA-4抗体均可以用于所述方法中。在某些实施方案中，所述抗PD-1抗体包括纳武单抗。在一些实施方案中，所述抗PD-1抗体包括派姆单抗。在一些实施方案中，所述抗PD-L1抗体包括阿特珠单抗。在一些实施方案中，所述抗PD-L1抗体包括度伐单抗。在一些实施方案中，所述抗PD-L1抗体包括阿维鲁单抗。在一些实施方案中，所述抗CTLA-4抗体包括伊匹单抗。在一些实施方案中，所述抗CTLA-4抗体包含伊匹单抗曲美木单抗。

在一些实施方案中，将(a)抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体和(b)抗CTLA-4抗体各自约每2周一次、约每3周一次、约每4周一次、约每5周一次或约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体或所述抗PD-L1抗体约每2周一次、约每3周一次或约每4周一次施用，并且将所述抗CTLA-4抗体约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体与所述抗CTLA-4抗体在同一天施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体或所述抗PD-L1抗体与所述抗CTLA-4抗体在不同的日子施用。

在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体以在从约0.1mg/kg至约20.0mg/kg体重的范围内的剂量约每2、3、4、5、6、7或8周一次施用。在一些实施方案中，将抗CTLA-4抗体以约0.1mg/kg、约0.3mg/kg、约0.6mg/kg、约0.9mg/kg、约1mg/kg、约3mg/kg、约6mg/kg、约9mg/kg、约10mg/kg、约12mg/kg、约15mg/kg、约18mg/kg或约20mg/kg的剂量施用。在某些实施方案中，将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每4周一次施用。在一些实施方案中，将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。

在一些实施方案中，将抗CTLA-4抗体以平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体以在从至少约40mg至至少约1600mg的范围内的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体以至少约40mg、至少约50mg、至少约60mg、至少约70mg、至少约80mg、至少约90mg、至少约100mg、至少约110mg、至少约120mg、至少约130mg、至少约140mg、至少约150mg、至少约160mg、至少约170mg、至少约180mg、至少约190mg、或至少约200mg的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述CTLA-4抗体以至少约220mg、至少约230mg、至少约240mg、至少约250mg、至少约260mg、至少约270mg、至少约280mg、至少约290mg、至少约300mg、至少约320mg、至少约360mg、至少约400mg、至少约440mg、至少约480mg、至少约520mg、至少约560mg、或至少约600mg的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述CTLA-4抗体以至少约640mg、至少约720mg、至少约800mg、至少约880mg、至少约960mg、至少约1040mg、至少约1120mg、至少约1200mg、至少约1280mg、至少约1360mg、至少约1440mg、或至少约1600mg的平剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗CTLA-4抗体以平剂量约每2、3、4、5、6、7或8周至少一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约2mg/kg的剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约3mg/kg的剂量约每2周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约6mg/kg的剂量约每4周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每2周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约240mg的平剂量约每2周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约480mg的平剂量约每4周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约80mg的平剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约200mg的平剂量约每2周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约80mg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约240mg的平剂量约每2周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约80mg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以约480mg的平剂量约每4周一次施用并且将抗CTLA-4抗体以约80mg的剂量约每6周一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约10mg/kg的剂量约每2周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约15mg/kg的剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约800mg的平剂量约每2周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约1200mg的平剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量约每6周一次施用。

在某些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约800mg的平剂量约每2周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约80mg的平剂量约每6周一次施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以约1200mg的平剂量约每3周一次施用并且将所述抗CTLA-4抗体以约80mg的剂量约每6周一次施用。

在一些实施方案中，将抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)以约3mg/kg的剂量施用并且将抗CTLA-4抗体以约1mg/kg的剂量在同一天施用，约每3周一次施用，持续4个剂量，然后将抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)以240mg的平剂量约每2周一次施用或以480mg的平剂量约每4周一次施用。在一些实施方案中，将抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)以约1mg/kg的剂量施用并且将抗CTLA-4抗体以约3mg/kg的剂量在同一天施用，约每3周一次施用，持续4个剂量，然后将抗PD-1抗体(例如，纳武单抗)以240mg的平剂量约每2周一次施用或以480mg的平剂量约每4周一次施用。

II.B.5.另外的抗癌疗法

在本公开文本的一些方面，本文公开的方法进一步包括施用抗PD-1抗体(或抗PD-L1抗体)和另外的抗癌疗法。在某些实施方案中，所述方法包括施用抗PD-1抗体(或抗PD-L1抗体)、抗CTLA-4抗体和另外的抗癌疗法。所述另外的抗癌疗法可以包括本领域已知用于治疗受试者的肿瘤的任何疗法和/或如本文所公开的任何标准照护疗法。在一些实施方案中，所述另外的抗癌疗法包含手术、放射疗法、化学疗法、免疫疗法或其任何组合。在一些实施方案中，所述另外的抗癌疗法包含化学疗法，包括本文公开的任何化学疗法。在一些实施方案中，所述另外的抗癌疗法包含免疫疗法。在一些实施方案中，所述另外的抗癌疗法包括施用特异性结合以下的抗体或其抗原结合部分：LAG-3、TIGIT、TIM3、NKG2a、OX40、ICOS、MICA、CD137、KIR、TGFβ、IL-10、IL-8、B7-H4、Fas配体、CXCR4、间皮素、CD27、GITR或其任何组合。

II.C.肿瘤

在一些实施方案中，所述肿瘤源自选自以下的癌症：肝细胞癌、胃食管癌、黑素瘤、膀胱癌、肺癌、肾癌、头颈癌、结肠癌、及其任何组合。在某些实施方案中，所述肿瘤源自肝细胞癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自胃食管癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自黑素瘤，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自膀胱癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自肺癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自肾癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自头颈癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。在某些实施方案中，所述肿瘤源自结肠癌，其中所述肿瘤具有高炎症标签得分。

在某些实施方案中，所述受试者已经接受了一种、两种、三种、四种、五种或更多种先前的癌症治疗。在其他实施方案中，所述受试者是治疗幼稚的。在一些实施方案中，所述受试者在其他癌症治疗方面取得进展。在某些实施方案中，所述先前的癌症治疗包含免疫疗法。在其他实施方案中，所述先前的癌症治疗包含化学疗法。在一些实施方案中，所述肿瘤是复发的。在一些实施方案中，所述肿瘤是转移性的。在其他实施方案中，所述肿瘤不是转移性的。在一些实施方案中，所述肿瘤是局部晚期的。

在一些实施方案中，所述受试者已经接受了治疗所述肿瘤的先前疗法，并且所述肿瘤是复发的或难治的。在某些实施方案中，所述至少一种先前疗法包含标准照护疗法。在一些实施方案中，所述至少一种先前疗法包含手术、放射疗法、化学疗法、免疫疗法或其任何组合。在一些实施方案中，所述至少一种先前疗法包含化学疗法。在一些实施方案中，所述受试者已经接受了治疗所述肿瘤的先前免疫肿瘤学(I-O)疗法，并且所述肿瘤是复发的或难治的。在一些实施方案中，所述受试者已经接受了治疗所述肿瘤的多于一种先前疗法，并且所述受试者是复发的或难治的。在其他实施方案中，所述受试者已经接受抗PD-1或抗PD-L1抗体疗法。

在一些实施方案中，所述先前的治疗线包含化学疗法。在一些实施方案中，所述化学疗法包括基于铂的疗法。在一些实施方案中，基于铂的疗法包括基于铂的抗肿瘤药，所述基于铂的抗肿瘤药选自顺铂、卡铂、奥沙利铂、萘达铂、四硝酸三铂、菲铂(phenanthriplatin)、吡铂(picoplatin)、沙铂(satraplatin)及其任何组合。在某些实施方案中，基于铂的疗法包含顺铂。在一个特定实施方案中，基于铂的疗法包含卡铂。

在一些实施方案中，所述至少一种先前疗法选自包括施用抗癌剂的疗法，所述抗癌剂选自铂药剂(例如，顺铂、卡铂)、紫杉烷类药剂(例如，紫杉醇、白蛋白结合型紫杉醇、多西他赛)、长春瑞滨、长春碱、依托泊苷、培美曲塞、吉西他滨、贝伐单抗厄洛替尼克唑替尼西妥昔单抗及其任何组合。在某些实施方案中，所述至少一种先前疗法包括基于铂的双药化学疗法。

在一些实施方案中，所述受试者在所述至少一种先前疗法之后经历了疾病进展。在某些实施方案中，所述受试者已经接受至少两种先前疗法、至少三种先前疗法、至少四种先前疗法或至少五种先前疗法。在某些实施方案中，所述受试者已经接受至少两种先前疗法。在一个实施方案中，所述受试者在所述至少两种先前疗法之后经历了疾病进展。在某些实施方案中，所述至少两种先前疗法包括第一先前疗法和第二先前疗法，其中受试者在第一先前疗法和/或第二先前疗法之后经历了疾病进展，并且其中第一先前疗法包括手术、放射疗法、化学疗法、免疫疗法或其任何组合；并且其中第二先前疗法包括手术、放射疗法、化学疗法、免疫疗法或其任何组合。在一些实施方案中，所述第一先前疗法包括基于铂的双药化学疗法，并且第二先前疗法包括单一药剂化学疗法。在某些实施方案中，所述单一药剂化学疗法包括多西他赛。

II.E.药物组合物和剂量

本公开文本的治疗剂可以构成组合物，例如含有抗体和/或细胞因子和药学上可接受的载体的药物组合物。如本文所用，“药学上可接受的载体”包括生理上可相容的任何和所有溶剂、分散介质、包衣剂、抗细菌剂和抗真菌剂、等张剂和吸收延迟剂等。优选地，用于含有抗体的组合物的载体适合于静脉内、肌肉内、皮下、肠胃外、脊柱或表皮施用(例如，通过注射或输注)，而用于含有抗体和/或细胞因子的组合物的载体适合于非肠胃外(例如，口服)施用。在一些实施方案中，所述皮下注射是基于Halozyme Therapeutics的药物递送技术(参见美国专利号7,767,429，将其通过引用以其整体并入本文)。使用抗体与重组人透明质酸酶(rHuPH20)的共配制品，其消除了由于细胞外基质而对可皮下递送的生物制剂和药物的体积的传统限制(参见美国专利号7,767,429)。本公开文本的药物组合物可以包括一种或多种药学上可接受的盐、抗氧化剂、水性和非水性载体、和/或佐剂，诸如防腐剂、润湿剂、乳化剂和分散剂。因此，在一些实施方案中，用于本公开文本的药物组合物可以进一步包含重组人透明质酸酶(例如，rHuPH20)。

在一些实施方案中，所述方法包括施用抗PD-1抗体(或抗PD-L1抗体)和抗CTLA-4抗体，其中所述抗PD-1抗体(或所述抗PD-L1抗体)在单一组合物中与所述抗CTLA-4抗体一起以固定剂量施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-1抗体以固定剂量与抗CTLA-4抗体一起施用。在一些实施方案中，将所述抗PD-L1抗体以固定剂量与抗CTLA-4抗体在单一组合物中施用。在一些实施方案中，所述抗PD-1抗体(或所述抗PD-L1抗体)与所述抗CTLA-4抗体的比率为至少约1:1、约1:2、约1:3、约1:4、约1:5、约1:6、约1:7、约1:8、约1:9、约1:10、约1:15、约1:20、约1:30、约1:40、约1:50、约1:60、约1:70、约1:80、约1:90、约1:100、约1:120、约1:140、约1:160、约1:180、约1:200、约200:1、约180:1、约160:1、约140:1、约120:1、约100:1、约90:1、约80:1、约70:1、约60:1、约50:1、约40:1、约30:1、约20:1、约15:1、约10:1、约9:1、约8:1、约7:1、约6:1、约5:1、约4:1、约3:1或约2:1。

尽管已经达到了高达每两周一次10mg/kg的较高纳武单抗单一疗法给药而未达到最大耐受剂量(MTD)，但在检查点抑制剂加抗血管生成疗法的其他试验中报告的显著毒性(参见例如，Johnson等人,2013；Rini等人,2011)支持选择低于10mg/kg的纳武单抗剂量。

只要观察到临床益处就继续治疗或直到出现不可接受的毒性或疾病进展。然而，在某些实施方案中，所施用的抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体和/或抗CTLA-4抗体的剂量显著低于所述药剂的批准剂量，即亚治疗剂量。可以将所述抗PD-1抗体、所述抗PD-L1抗体和/或所述抗CTLA-4抗体以这样的剂量施用，已经显示其在临床试验中作为单一疗法产生最高功效，例如每三周一次施用的约3mg/kg纳武单抗(Topalian等人,2012a；Topalian等人,2012)；或者以显著更低的剂量即以亚治疗剂量施用。

剂量和频率根据受试者体内抗体的半衰期而变化。通常，人抗体显示出最长的半衰期，其次是人源化抗体、嵌合抗体和非人抗体。施用的剂量和频率可以根据治疗是预防性的还是治疗性的而变化。在预防性应用中，通常以相对不频繁的间隔长时间施用相对低的剂量。一些患者在其余生持续接受治疗。在治疗性应用中，有时需要以相对短的间隔相对高的剂量，直到疾病的进展减少或终止，并且优选直到患者显示疾病症状的部分或完全改善。此后，可以向患者施用预防性方案。

本公开文本的药物组合物中活性成分的实际剂量水平可以改变以便获得对于特定患者、组合物和施用方式有效实现所需治疗反应而不会对患者造成过度毒性的量的活性成分。所选择的剂量水平将取决于多种药代动力学因素，包括所采用的本公开文本的特定组合物的活性，施用途径，施用时间，所采用的特定化合物的排泄速率，治疗持续时间，与所采用的特定组合物组合使用的其他药物、化合物和/或材料，所治疗患者的年龄、性别、体重、病症、一般健康状况和既往病历，以及医学领域熟知的类似因素。可以使用本领域熟知的多种方法中的一种或多种，通过一种或多种施用途径来施用本公开文本的组合物。如技术人员所理解的，施用途径和/或模式将根据所希望的结果而变化。

III.试剂盒

用于治疗用途的试剂盒也在本公开文本的范围内，所述试剂盒包含(a)抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体。试剂盒典型地包括标签，其指示试剂盒内容物的预期用途和使用说明书。术语标签包括在试剂盒上或与试剂盒一起提供或者以其他方式伴随试剂盒的任何书写或记录材料。因此，本公开文本提供了一种用于治疗患有肿瘤的受试者的试剂盒，所述试剂盒包含：(a)在从0.1至10mg/kg体重范围内的剂量的抗PD-1抗体或在从0.1至20mg/kg体重范围内的剂量的抗PD-L1抗体；和(b)用于在本文公开的方法中使用抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体的说明书。本公开文本进一步提供了一种用于治疗患有肿瘤的受试者的试剂盒，所述试剂盒包含：(a)在从约4mg至约500mg范围内的剂量的抗PD-1抗体或在从约4mg至约2000mg范围内的剂量的抗PD-L1抗体；和(b)用于在本文公开的方法中使用抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体的说明书。在一些实施方案中，本公开文本提供了一种用于治疗患有肿瘤的受试者的试剂盒，所述试剂盒包含：(a)在从200mg至800mg范围内的剂量的抗PD-1抗体或在从200mg至1800mg范围内的剂量的抗PD-L1抗体；和(b)用于在本文公开的方法中使用抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体的说明书。

在用于治疗人类患者的某些实施方案中，所述试剂盒包含本文公开的抗人PD-1抗体，例如纳武单抗或派姆单抗。在用于治疗人类患者的某些实施方案中，所述试剂盒包含本文公开的抗人PD-L1抗体，例如阿特珠单抗、度伐单抗或阿维鲁单抗。

在一些实施方案中，所述试剂盒进一步包含抗CTLA-4抗体。在用于治疗人类患者的某些实施方案中，所述试剂盒包含本文公开的抗人CTLA-4抗体，例如伊匹单抗、曲美木单抗、MK-1308或AGEN-1884。

在一些实施方案中，所述试剂盒进一步包括本文公开的炎症基因组测定。在一些实施方案中，所述试剂盒进一步包括根据本文公开的方法向被鉴定为具有高炎症标签得分的受试者施用抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体的说明书。在其他实施方案中，所述试剂盒进一步包括抗CTLA-4抗体和根据本文公开的方法向被鉴定为具有高炎症标签得分的受试者施用(a)抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体和(b)抗CTLA-4抗体的说明书。

将以上引用的所有参考文献以及本文引用的所有参考文献均通过引用以其整体并入本文。

通过说明的方式而不是通过限制的方式，提供以下实施例。

实施例

实施例1：与纳武单抗治疗的患有晚期肝细胞癌的患者的临床结局相关的炎症生物标记物的评估

肝癌是全球癌症相关死亡率的第四主要原因，其中大多数肝癌是肝细胞癌(HCC)。患有晚期HCC的患者几乎没有有效的治疗选择，并且能够实现稳健且持久的反应的药剂在肝细胞中仍然是未满足的需求。用于批准的一线和二线靶向疗法的临床试验分别报道了在从10.7-13.6个月和10.2-10.6个月范围内的中值总存活期(参见，Abou-Alfa等人,N EnglJ Med.379(1):54-63(2018)；Bruix等人,Lancet 389(10064):56-66(2017)；Llovet等人,NEngl J Med.359(4):378-90(2008)；和Kudo等人,Lancet.391(10126):1163-73(2018))。纳武单抗(“NIVO”)与主要在激活的T细胞上表达的PD-1受体结合，并且因此预防PD-L1和在肿瘤细胞上表达的PD-L2配体的结合。在临床试验NCT01658878中，纳武单抗展示了在患有晚期HCC的患者中持久的反应、可管理的安全性和长期存活，而不论病因如何，有/没有先前的索拉非尼(SOR)治疗(参见，El-Khoueiry等人,Lancet.389:2492-2502(2017))。基于来自临床试验NCT01658878的结果，NIVO在许多国家(包括美国)中被批准用于经历SOR的患有HCC的患者中。

本实施例涉及来自临床试验NCT01658878的来自纳武单抗治疗的患有晚期HCC患者的探索性生物标记物分析。

研究设计

本数据与临床试验NCT01658878的队列1和2相关，它们总共具有262个受试者(图1)。队列1包含80名SOR幼稚受试者，并且队列2包含182名经历SOR的受试者。作为剂量递增分析的一部分，队列1中的十一名受试者和队列2中的37名受试者被施用0.1-10mg/kg纳武单抗。作为剂量扩展分析的一部分，队列1中的六十九名受试者和队列2中的145名受试者被施用3mg/kg纳武单抗。初始治疗后，队列2中的154名受试者(来自剂量递增研究的9名受试者和来自剂量扩展研究的145名受试者)被施用以3mg/kg的维持纳武单抗。

临床试验NCT01658878的主要终点是安全性和耐受性(剂量递增)以及客观反应率(ORR；剂量扩展)。次要终点包括ORR(剂量递增)、疾病控制率、反应时间、反应持续时间和总存活期。探索性终点包括生物标记物评估，所述生物标记物评估在这里此讨论。

从临床试验NCT01658878产生的数据，包括在50％的受试者中14.3％的ORR和至少12个月的反应持续时间(DOR)，有助于USFDA批准纳武单抗用于治疗患有HCC的经历SOR的患者。

有资格的受试者具有(i)不适合根治性切除的组织学证实的晚期HCC；(ii)Child–Pugh得分≤7(递增)或≤6(扩展)；(iii)在至少一个先前的系统性治疗线或不耐受或拒绝SOR上进展；(iv)AST和ALT≤5×正常上限并且胆红素≤3mg/dL；(v)对于受HBV感染的患者，病毒载量小于100IU/mL并且伴有的有效的抗病毒疗法；以及(vi)对于受HCV感染的患者，如由可检测的HCV RNA或抗体证明的活动性感染或消退的感染。排除具有任何肝性脑病史、先前或当前临床上显著的腹水、或活动性HBV和HCV共感染的受试者。

从接受3mg/kg纳武单抗(保存用于IHC)或0.1-10mg/kg纳武单抗(保存用于RNA测序)的递增和扩展阶段的患者获得预处理肿瘤样品(新鲜的或存档的)。

生物标记物评估

使用(i)IHC分析样品以评估PD-L1、PD-1、T细胞标记物(CD3、CD4、CD8、FOXP3)和巨噬细胞标记物(CD68、CD163)；和(ii)RNA测序分析样品以评估肿瘤炎症标签。评估生物标记物以通过设盲的独立审查委员会(根据RECIST v1.1)评估与临床结局(包括BOR)的相关性和总存活期。使用标准Limma和Cox回归框架进行分析。

生物标记物分析

PD-L1

在总群体中，195名受试者具有可评估的PD-L1数据(SOR幼稚的，n＝58；经历SOR的，n＝137；表2)。在所有受试者(包括具有PD-L1<1％的那些受试者)中观察到临床有意义的反应，并且6名受试者具有完全反应。在总群体中，在重叠95％置信区间的PD-L1≥1％与PD-L1<1％的受试者中观察到数值较高的客观反应率。经历SOR的群体具有与总群体的那些相当的ORR。

在总群体中，不论PD-L1状态如何，都观察到深度反应(图2A-2B)。在至少1％肿瘤细胞中的肿瘤细胞PD-L1表达与总存活期显著相关(图2C；P＝0.032)。通常，在经历SOR的受试者中，至少1％的肿瘤细胞中的阳性PD-L1表达与更高的总存活率相关，然而这种差异在统计学上不显著(图2D)。

表2.肿瘤细胞PD-L1状态的最佳总反应。

当按地理区域分层时，未发现肿瘤PD-L1表达有显著差异(亚洲人与非亚洲人；数据未示出)。

T细胞标记物

在施用纳武单抗之前，分析在从受试者获得的肿瘤样品中T细胞标记物CD3、CD8、CD4和FOX-3的表达谱。观察到CD3阳性细胞频率与反应相关(CR/PR，与SD相比；P＝0.03；图3A)。在CD4、CD8或FOXP3阳性细胞频率与反应之间未观察到显著的相关性(图3B-3D)。在肿瘤微环境中，CD3阳性细胞频率高于评估的其他T细胞标记物(数据未示出)。当按病毒病因(HBV或HCV感染，或未感染；数据未示出)或地理区域(亚洲人与非亚洲人；数据未示出)分层时，未发现T细胞标记物分布有显著差异。

肿瘤炎症(如通过CD3或CD8表达测量的)具有倾向于改善的总存活期(图4A-4B；P＝0.08)和较小程度的CD4或FOXP3表达(图4C-4D)的非显著趋势。

巨噬细胞标记物

在施用纳武单抗之前，分析在从受试者获得的肿瘤样品中巨噬细胞标记物CD68和CD163的表达谱。未观察到CD68和CD163表达与临床结局之间的相关性(图5A-5B和图6A-6B)。此外，当按病毒病因(受HBV或HCV感染，或未感染；数据未示出)或地理区域(亚洲人与非亚洲人；数据未示出)分层时，未发现巨噬细胞标记物分布有显著差异。

肿瘤免疫基因标签

对于可获得数据的受试者子集(n＝37)，使用RNA测序进行基因表达谱分析以评价肿瘤免疫浸润和炎症标签(表3)。特别地，几种炎症标签(诸如本公开文本的4基因炎症标签(包含CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1)、Gajewski 13基因炎症标签、Merck 6基因干扰素γ标签、NanoString干扰素γ生物学标签和NanoString T细胞耗竭标签)与改善的反应和总存活期显著相关(表3)。特别地，与稳定的疾病相比，在经历部分反应的患者中观察到如本文所述的平均4基因炎症标签得分显著更高(p＝0.05；图7A)。此外，平均中值4基因炎症得分与改善的总存活期显著相关(p＝0.01；图7B)。

表3.在总群体中肿瘤免疫基因标签与临床反应的关系。

1.Danilova L,等人Proc Natl Acad Sci.2016；113:E7769–E7777；2.SprangerS,等人Nature.2015；523:231-235；3.Ayers M,等人J Clin Invest.2017；127:2930-2940。

当按病毒病因(HBV或HCV感染，或未感染；数据未示出)或地理区域(亚洲人与非亚洲人；数据未示出)分层时，未发现4基因炎症标签得分有显著差异。

在临床试验NCT01658878队列1和2中，无论肿瘤细胞PD-L1状态如何，在SOR幼稚患者和经历SOR的患者中均观察到持久的反应。在对来自患有晚期HCC的患者的预处理肿瘤样品的此回顾性分析中，肿瘤细胞PD-L1表达与OS相关；然而，这种相关性在经历SOR的患者中不显著。CD3⁺T细胞频率与对纳武单抗的反应相关，其中在CD3和CD8阳性的情况下具有改善的存活期的趋势。几种炎症标签(包括4基因炎症标签)的较高得分与改善的反应和总存活期相关。

实施例2：PD-L1组合阳性得分和免疫基因标签与纳武单抗±伊匹单抗在患有转移性胃食管癌的患者中的功效的相关性

包含纳武单抗(NIVO)和伊匹单抗(IPI)的组合疗法在1/2期(NCT01928394；Janjigian YY,等人J Clin Oncol.2018；36:2836-2844)中的患有化学疗法难治的胃食管癌的患者中展示了临床有意义的抗肿瘤活性和可管理的安全性特征。在临床试验NCT01928394的当前探索性分析中，评价选定的免疫基因标签的表达以确定是否存在与具有伊匹单抗的组合疗法的纳武单抗单一疗法的功效的相关性。

研究设计

将对≥1种先前化学疗法难治的患有局部晚期或转移性胃/食管/GEJ癌症的患者随机分配以下中的一种：纳武单抗3mg/kg(NIVO3)静脉内每2周一次(n＝59)；纳武单抗1mg/kg加伊匹单抗3mg/kg(NIVO1+IPI3)每3周一次持续四个循环(n＝49)；或纳武单抗3mg/kg加伊匹单抗1mg/kg(NIVO3+IPI1)每3周一次持续四个循环(n＝52)(图8)。所有的组合方案均遵循每2周接受NIVO3直到疾病进展或不可接受的不良事件(AE)。

主要终点是客观反应率(ORR)，定义为完全反应或部分反应的最佳反应除以所治疗的患者数量，根据RECIST版本1.1。次要终点包括总存活期(OS)、无进展存活期(PFS)、反应时间、反应的持续时间(DOR)、和安全性。使用成像每6周评估一次肿瘤反应，持续24周，然后每12周评估一次直到疾病进展或治疗中止。在患者接受治疗期间和治疗中止后每3个月持续监测存活期。探索性终点包括肿瘤PD-L1表达与功效和安全性之间的相关性。

食管胃癌队列的关键资格标准包括在服用或不耐受至少一种化学疗法方案的同时具有疾病进展的局部晚期或转移性胃、食管或GEJ腺癌的诊断；如通过实体瘤反应评价标准(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors，RECIST)版本1.118评估的可测量疾病；东部肿瘤协作组(Eastern Cooperative Oncology Group)体能状态为0或1；和足够的器官功能。如果患有人表皮生长因子受体2阳性肿瘤的患者先前接受过用曲妥珠单抗的治疗，则他们符合条件。关键排除标准包括疑似自身免疫性疾病；乙型肝炎病毒或人类免疫缺陷病毒感染；需要皮质类固醇或其他免疫抑制药物的病症；和先前的免疫检查点抑制剂疗法。

生物标记物分析

PD-L1表达

在免疫疗法之前从受试者收集生物样品，并且受试者样品的子集可用于PD-L1表达分析(表4)。

表4.基线特征和反应：总群体和PD-L1评价的群体。

^a在NIVO1+IPI1的剂量递增阶段的三名患者也包括在分析中。CR，完全反应；ECOG，东部肿瘤协作组；NE，不可评价；PD，进行性疾病；PR，部分反应；SD，稳定的疾病。

PD-L1免疫组织化学(IHC)用于评价在肿瘤和肿瘤相关免疫细胞上的PD-L1表达。如在本实施例中使用的肿瘤PD-L1表达表示显示部分或完全膜PD-L1染色的活肿瘤细胞的百分比。根据式II计算肿瘤PD-L1表达：

组合阳性得分(CPS)包括肿瘤和肿瘤相关免疫细胞PD-L1表达二者。根据式III计算CPS：

观察到与肿瘤细胞上的PD-L1表达(图9A)相比，由CPS表示的PD-L1表达(图9B)与反应具有更好的相关性。与肿瘤细胞上的PD-L1表达相比，由CPS表示的PD-L1表达具有更高的患病率(不论截断值如何)并且与在更高截断值处的反应具有更好的相关性(表5)。在更高的截断值处，与肿瘤PD-L1表达相比，由CPS表示的PD-L1表达展示了与总存活率更强的相关性(图10A-10F)。

表5.按肿瘤细胞上的PD-L1表达和按CPS的患病率和反应率：所有方案

^a肿瘤细胞上的PD-L1表达；^b由CPS表示的PD-L1表达；^c对于肿瘤PD-L1表达，截断值以百分比呈现。对于CPS，截断值以得分呈现。NA，不适用；ORR，客观反应率。

在纳武单抗1mg/kg+伊匹单抗3mg/kg治疗小组中，与肿瘤细胞上的PD-L1表达相比，由CPS表示的PD-L1表达具有更高的患病率(不论截断值如何)并且与在更高截断值处的反应具有更好的相关性。此外，由CPS表示的PD-L1表达展示了在较高的截断值处与总存活率较强的相关性(图11A-11D)。在用纳武单抗1mg/kg+伊匹单抗3mg/kg治疗的患者中，这种相关性与在所有组合方案中的患者中一致且更明显(参见图10D-10F)。

表6.按肿瘤细胞上的PD-L1表达和按CPS的患病率和反应率：纳武单抗1mg/kg+伊匹单抗3mg/kg。

^a肿瘤细胞上的PD-L1表达；^b由CPS表示的PD-L1表达；^c对于肿瘤PD-L1表达，截断值以百分比呈现。对于CPS，截断值以得分呈现；^d仅1名患者具有肿瘤PD-L1≥5％并且≥10％。

基因谱分析

在免疫疗法之前从受试者收集生物样品，并且受试者样品的子集可用于基因表达谱分析(表7)。

表7.基线特征和反应：总群体和基因表达谱分析群体。

在可用样品上分析多种基因表达标签(表8)。所有基因表达标签均显示出与反应相关的趋势(表8)。值得注意的是，观察到本公开文本的4基因炎症标签(包含CD274(PD-L1)、CD8A、LAG3和STAT1；图12D)、CD8 T细胞标签(图12A)、PD-L1转录物(图12B)和Ribas 10基因干扰素γ标签(图12C)之间的显著相关性，其中4基因炎症标签示出了与反应的最强相关性(具有CR/PR的患者，n＝4；表8)。尽管对于此分析，反应的患者的数量小(n＝4)，但是证明了对AUC的良好区分(90％[95％CI，77-100])(图13)。

表8.基因表达标签和反应。

^aP值和错误发现率源自使用9个预先指定的标签和基因的测试。错误发现率调整的P值。^b对于给定数量的检验/假设，错误发现率的估计。^c鉴于样本量小，探索性P值旨在描述不同标签对于与反应的相关的相对表现。1.Siemers NO,等人PLoS One.2017；12:e0179726；2.Spranger S,等人Nature.2015；523:231-235；3.Ayers M,等人J ClinInvest.2017；127:2930-2940。

在这项探索性分析中，观察到炎症基因标签表达与对纳武单抗单一疗法和与伊匹单抗的组合疗法的反应相关。这种相关性指示存在可以被免疫肿瘤学药剂靶向的可作用的生物学因素。

实施例3：在晚期黑素瘤中的基因组分析和免疫疗法

纳武单抗(NIVO)和伊匹单抗(IPI)是具有独特但互补的活性的免疫检查点抑制剂。包含纳武单抗和伊匹单抗的组合疗法以及纳武单抗和伊匹单抗单一疗法被批准用于治疗不可切除的黑素瘤或转移性黑素瘤。

在包括黑素瘤在内的多种肿瘤的研究中，显示对抗PD-1疗法的反应与T细胞发炎的基因表达谱相关。

此实施例报告了在黑素瘤中对纳武单抗/伊匹单抗组合疗法以及纳武单抗和伊匹单抗单一疗法的新型炎症基因标签与临床结局的相关性的探索性分析的结果。

研究设计

本实施例报告了从临床试验NCT01844505收集的数据。在此试验中，将945名先前未经治疗的患有不可切除的III期或IV期黑素瘤的患者以1:1:1的比率随机分配以接受以下方案之一：(i)每2周3mg纳武单抗/千克体重(加伊匹单抗匹配的安慰剂)(n＝316，313名接受治疗)；(ii)每3周1mg纳武单抗/千克加每3周3mg伊匹单抗/千克，持续4个剂量，然后每2周3mg纳武单抗/千克，持续3个周期和更多(n＝314，313名接受治疗)；或每3周3mg伊匹单抗/千克，持续4个剂量(加纳武单抗匹配的安慰剂)(n＝315，311名接受治疗)(图14)。纳武单抗和伊匹单抗均借助静脉输注施用。

根据肿瘤PD-L1状态(阳性与阴性或不确定)、BRAF突变状态(V600突变阳性与野生型)和美国癌症转移联合委员会分期(M0、M1a或M1b与M1c)进行随机分层。继续治疗直到疾病进展(如通过RECIST版本1.1所定义)、发展为不可接受的毒性事件、或撤回同意为止。

无进展存活期和总存活期是共同的主要终点。次要终点包括客观反应率、肿瘤PD-L1表达、和健康相关的生活质量。探索性终点包括安全性、药代动力学、和生物标记物分析。

NCT01844505的4年随访证明，一线纳武单抗/伊匹单抗组合疗法和纳武单抗单一疗法在患有晚期黑素瘤的患者中的持久的、持续的存活益处(ORRb，％(95％CI)：58％(52.6-63.8)NIVO+IPI；45％(39.1-50.3)NIVO；19％(14.9-23.8)IPI；中值PFS，月(95％CI)：11.5(8.7-19.3)NIVO+IPI；6.9(5.1-10.2)NIVO；2.9(2.8-3.2)IPI；和中值OS，月(95％CI)：NR(38.2-NR)NIVO+IPI；36.9(28.3-NR)NIVO；19.9(16.9-24.6)IPI)(图15A-15B)。NCT01844505不能用于纳武单抗/伊匹单抗组合疗法与纳武单抗单一疗法之间的正式统计比较。

目的

此分析的目的是评估炎症标签与用基于纳武单抗的免疫肿瘤学(I-O)疗法的临床反应、PFS和OS的相关性。对于炎症标签分析，使用RNAseq分析预处理肿瘤样品，以使用4个关键基因-CD274(PD-L1)、CD8a、LAG3和STAT1-的表达(包含本文所述的4基因炎症标签得分)来估计相对肿瘤炎症。在NCT01844505样品中使用相对中值得分来评估PFS和OS与4基因炎症标签得分的相关性，以定义高4基因炎症标签得分与低4基因炎症标签得分(中值＝-0.0434)。样品处置的汇总在表9和图16中提供。

表9.样品处置NCT01844505。

结果

4基因炎症标签得分的分布在对用纳武单抗/伊匹单抗组合疗法、纳武单抗单一疗法和伊匹单抗单一疗法的治疗有反应的患者中更高(图17)。在所有治疗小组中，具有高炎症标签得分与低炎症标签得分的患者观察到较长的PFS(图18A-18D)。在所有治疗小组中，具有高炎症标签得分与低炎症标签得分的患者也观察到较长的OS(图19A-19D)。

在先前未经治疗的转移性黑素瘤中，观察到高4基因炎症标签得分与免疫肿瘤学疗法的临床反应和增加的存活期相关。