本发明公开了一种全基因组甲基化单链DNA建库方法,其步骤包括：重亚硫酸盐处理待建库的基因组DNA,获得单链DNA；加入引物1,引物1的随机引物与单链DNA互补,在DNA聚合酶1的作用下合成第一链；产物纯化后先高温解链,然后在新合成的第一链的3’端添加2～4个ATP,形成一个核糖核苷酸的尾巴；RNA连接酶催化下,在第一链的核糖核苷酸的尾巴后连接上引物2；加入与引物2互补的引物3,在DNA聚合酶2的作用下合成第二链,获得双链DNA；文库扩增。本发明的单链DNA建库方法,可以有效利用重亚硫酸盐处理后的DNA样本,将处理后的单链DNA顺利扩增,文库转化率比传统方法高,要求的初始DNA用量可低至1ng。

本发明涉及cDNA文库技术领域,且公开了一种高效构建cDNA文库的方法,该高效构建cDNA文库的方法,将寡脱氧胸苷酸引物和总RNA混合物注入低盐缓冲液中退火,然后加入以链霉亲和素包被的磁性球珠,通过质粒和噬菌体载体制作克隆RNA的载体,使用末端转移酶对S2中获得的两条cRNA的端口添加均聚物(A)或(G),然后对载体的端口添加均聚物(T)或(C),cRNA和末端和载体RNA末端退火后粘连,转化为重组分子。将S3中获得的重组分子经过基因培养转化后成为宿主细胞,将宿主细胞放置在琼脂平板上,通过琼脂平板中添加相应的筛选物质,直接鉴别筛选所含重组子的菌落,直接鉴别筛选所含重组子的菌落,更简便容易的确定出现在文库中的重组子。

本发明公开一种单细胞文库的构建方法。所述方法采用高密度溶液作为单细胞标记微珠的悬浮液,采用具有一定高度的细长管路作为微珠悬液的储液池；所述高密度溶液极大地降低了大比重标记微珠在贮存池中的沉降速率,达到了在微流控过程中维持微珠均匀分散的目的；在形成油包水微液滴过程中,所述高密度溶液以一定比例与细胞/细胞核悬液混合,其溶质被稀释至低浓度,使下游文库标记和扩增反应得以进行。本发明解决了单细胞标记微珠在微流控过程中易发生沉降,进而影响文库制备的问题；所述方案适用于一系列密度和尺寸的标记微珠,扩展了选择范围。本发明结构简单、操作方便,可选择合适的容积而避免浪费；其易于更换的特性适合连续制备多个文库。

本发明公开了一种样本的自动化处理方法及装置、样本的自动化处理系统。其中,该方法包括：将放置有样本的耗材放置于生产系统；对耗材进行识别,以得到耗材的标识信息；基于标识信息选择目标生产方式,其中,目标生产方式为用于对样本进行处理的方式；基于目标生产方式对样本进行处理,得到处理结果。本发明解决了相关技术中对于NGS产品从核酸提取到完成建库需要人工参与完成,效率较低的技术问题。

提供了一种核酸序列以及RNA目标区域测序文库的构建方法及应用。该核酸序列包含相连的位于5’端的第一测序通用序列和位于3’端的随机引物序列,随机引物序列含有6～10个随机核苷酸。利用该序列对RNA进行随机的逆转录,得到cDNA的第一链,然后通过该核酸序列上的第一测序通用序列以及上下游特异性引物对逆转录得到的cDNA第一条链进行2步巢式PCR,得到高通量靶向测序文库。

本发明公开了一种利用福尔马林固定石蜡包埋样本快速构建RRBS测序文库的方法,属于分子生物学领域,本发明包括如下步骤：步骤一,取石蜡包埋的组织样本,获得基因组DNA；用末端修饰酶加ddATP修复；步骤二,采用限制性内切酶消化基因组DNA的CpG岛；步骤三,用末端修饰酶对基因组DNA进行末端修复并在3’端加A-Tailing；步骤四,用DNA连接酶进行甲基化接头连接,混合样本；步骤五,采用亚硫酸氢盐转化非甲基化胞嘧啶；步骤六,甲基化文库PCR富集；步骤七,切胶回收；本发明解决了现有技术福尔马林浸泡造成的RRBS构建FFPE DNA文库失败率高的问题,具有广大的应用前景和市场价值。

本发明涉及合成生物学技术领域,尤其涉及酵母有丝分裂重组热点的检测方法。本发明提供的PCRTag标签组合能够用于快速检测真核生物基因组有丝分裂重组热点。利用该标签组合能够通过特异性水印标签快速鉴定同源染色体的有丝分裂重组热点,为研究真核生物有丝分裂重组事件提供了便利方法。

提供了基于DNA样本构建测序文库的方法及应用。该方法包括：基于DNA样本,利用内切酶酶切,以便获得带有单链切口的DNA样本；基于该带有单链切口的DNA样本,利用聚合酶、dATP、dTTP、dGTP和甲基化修饰的dCTP进行聚合反应,以便获得混合DNA,所述混合DNA包括反向互补的两条链,每一条链的5’端为所述DNA样本的原始序列,每一条链的3’端为合成序列,每一条链3’端上碱基C是经甲基化修饰的；基于所述混合DNA,进行亚硫酸氢盐处理或其他方法处理,以便获得经转化后的混合DNA；基于所述经转化的混合DNA,扩增获得测序文库。由此可以用于全基因组甲基化测序或者多重PCR靶向测序和探针捕获测序。

本发明提供一种古DNA文库构建的方法,涉及超低浓度DNA文库构建技术领域。所述古DNA文库构建的方法主要包括：对DNA短片段的脱氨基位点进行切割、去磷酸化和热变性、连接第一个接头、固定连接产物到磁珠、平末端修复、连接第二个接头以及文库的纯化和洗脱、确定文库制备效率、文库浓度等步骤。本发明弥补了现有商用DNA建库试剂盒中超低浓度DNA文库构建的空白,通过对DNA单链进行建库能够有效对古DNA以及其他高度降解的DNA序列进行高效的文库构建,适宜在痕量DNA测序,以及法医学中的应用。

本发明属于基因突变检测技术领域,公开了一种遗传性肥厚型心肌病的通用基因检测文库的构建方法及其试剂盒。本申请的技术方式是采用多重PCR扩增子建库技术,对肥厚型心肌病检出率最高的5个致病基因MYH7、MYBPC3、TNNT2、TNNI3、TPM1突变进行捕获建库,捕获区域包括5个基因的全部外显子区域及其上下游各20bp碱基序列,能够兼容于多种测序平台,同时具有建库步骤简洁、成本节约、应用范围广和显著降低了检测数据量等诸多优势。