一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法

本发明公开了一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法,包括,在训练阶段,iDBP-DEP利用四种表示方法对蛋白质序列进行编码,得到3240维的特征向量作为初始特征；根据特征选择算法选择最优的特征子集；所述iDBP-DEP将所述子集输入SVM分类器进行训练,得到预测模型；测试集中的每个蛋白质通过相同的步骤进行编码,得到对应的最佳特征子集,并输入所述预测模型中进行预测,最终获得相应的预测结果。本发明方法提供的iDBP-DEP在各项评估指标上均展现了优越的性能,具有较良好的有效性和稳定性。

2021-10-26

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一种基于SNP芯片的阈性状基因组育种值估计方法及应用

本发明的基于SNP芯片的阈性状基因组育种值估计方法,包括以下步骤：步骤S1,获取数据文件,并对所述数据文件进行预处理,获得可靠的预处理数据；步骤S2,对步骤S1获得的预处理数据进行SNP效应值估计,选择贝叶斯方法LD-BayesT进行估计SNP效应,获得单个性状的所有SNP效应值；步骤S3,根据SNP效应值和候选群SNP基因型,获得单个阈性状的个体基因组育种值。本发明整合了SNP芯片信息、SNP位置信息、表型信息,根据动物的SNP信息即可对动物具有经济价值的阈性状进行基因组育种估计,用于动物的精准选种。

2021-10-26

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一种基于编码链发卡结构添加与移除的DNA杂交信息存储加密方法

本发明公开了一种基于编码链发卡结构特异性移除的DNA存储加密方法,包括一套带发卡结构与限制性内切酶识别位点的DNA编码链和限制性内切酶组合。其中,特定的限制性内切酶可将特定编码链的发卡结构切断,使编码区暴露而将其激活。在信息读取过程中,如果DNA编码链未经正确激活,则因发卡结构阻碍杂交而导致信息无法有效读取。该方法实施时,发送方从编码链组合中选取一组进行数据写入,将存储盘发给接收方,并用另一保密途径将密钥(即正确的内切酶信息)发送。接收方在收到密钥后方能对编码链做正确处理而将其激活,而错误处理将无法激活,甚至可能导致存储盘自毁。本发明实现了DNA杂交存储技术的硬加密,促进该存储技术的应用。

2021-10-22

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高热稳定性酶的蛋白序列生成方法、装置、介质和设备

本发明公开了一种高热稳定性酶的蛋白序列生成方法、装置、介质和设备。所述蛋白序列生成方法包括：获取训练样本,所述训练样本包括耐受温度大于预定值的特定类酶的蛋白序列数据；利用训练样本对预先构建好的生成式对抗网络模型进行训练,获得蛋白序列生成模型；利用所述蛋白序列生成模型生成批量蛋白序列数据。本方法利用现有的耐受温度大于预定值的特定类酶的蛋白序列数据训练生成式对方模型,得到蛋白序列生成模型,可以批量生成高热稳定的特定类酶的序列,生成方法简单,仅从蛋白序列出发且在计算机上完成设计,并可进一步按相似性分布进行实验验证,结果可靠性更强且容易分析。

2021-10-22

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用于早期诊断心脑血管疾病的甲基化标志物

本发明公开了用于早期诊断心脑血管疾病的甲基化标志物。本发明提供了甲基化MGRN1基因作为标志物在制备产品中的应用,所述产品的用途为如下至少一种：辅助诊断心脑血管疾病或在临床症状之前预警心脑血管疾病；辅助诊断冠心病或在临床症状之前预警冠心病；辅助诊断脑卒中或在临床症状之前预警脑卒中；辅助区分冠心病和脑卒中；辅助诊断不同临床特征的冠心病或在临床症状之前预警不同临床特征的冠心病；辅助诊断不同临床特征的脑卒中或在临床症状之前预警不同临床特征的脑卒中。本发明对提高心脑血管疾病早期诊疗效果和降低死亡率均有重要的科学意义和临床应用价值。

2021-10-22

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一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法

本发明公开了一种深度神经网络框架预测蛋白质磷酸化的方法,包括(1)搭建集成深度神经网络框架：由ACNet和多尺度CapsNet两种网络集成得到深度神将网络框架；(2)数据集的选取：磷酸化数据集PhosphoData1训练集、多个独立测试集；(3)使用信息增益方法优化过的融合特征作为网络输入特征；(4)使用步骤(1)搭建的集成深度神经网络框架在数据集上预测模型；(5)模型参数设置；(6)将待测蛋白质序列输入模型,预测出该蛋白是否有磷酸化位点及其位置。该方法对研究蛋白质翻译后修饰位点、分析蛋白质的功能以及药物研究等方面具有重要的指导意义。

2021-10-22

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一种基于探针封闭与解封的DNA杂交信息存储加密方法

本发明公开了一种基于探针封闭与解封的DNA杂交信息存储加密方法,属于DNA存储技术领域。所述的基于探针封闭与解封的DNA杂交信息存储加密方法,包括一套带荧光基团、淬灭基团与限制性内切酶识别位点的DNA寡核苷酸探针组合和一套限制性内切酶组合；其中,特定的限制性内切酶可将特定探针的淬灭基团切除,从而将该探针激活；在DNA杂交存储信息读取的DNA杂交过程中,如果直接使用未经正确激活的探针,则由于淬灭基团的存在,使得杂交后无法得到有效的荧光检测信号,亦无法读取存储信息。本发明实现了DNA杂交信息存储技术的硬加密,能有效提高DNA杂交存储技术的安全性,促进该技术在军事、政务和商业加密存储领域中的应用。

2021-10-22

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一种用于预测肝癌患者术后晚期复发风险的生物标志物及检测试剂盒

本发明属于医药生物技术领域,具体公开了一种用于预测肝癌患者术后晚期复发风险的生物标志物,所述标志物为ANGPT4基因、FAM78B基因、COLEC12基因、TRABD2A基因、AMFR基因和LMTK3基因的组合；所述试剂盒含有用于检测上述生物标志物表达量的试剂。通过检测HCC患者肝癌组织中ANGPT4基因、FAM78B基因、COLEC12基因、TRABD2A基因、AMFR基因和LMTK3基因的表达水平,能够实现肝癌患者术后晚期复发风险的预测。

2021-10-22

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一种快速准确的动物基因组选配分析方法

本发明提供一种快速准确的动物基因组选配的分析方法,涉及动物育种技术领域。该方法主要采用KAML模型计算个体之间最优的加性亲缘关系矩阵(G矩阵)和显性亲缘关系矩阵(D矩阵),利用反向求解方法计算基因芯片中每个SNP标记的加性遗传效应和显性遗传效应,根据特定交配对的公畜、母畜的基因型数据计算后代可能的基因型概率,进而计算特定交配对后代的基因型值(genotypic values)及期望后裔值(expected progeny values),根据期望后裔值优化待配母畜与候选公畜之间的交配组合,最终给出待配母畜最优的候选公畜交配列表,从而实现更快速、准确的基因组选配。

2021-10-19

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一种人类和恒河猴大脑发育差异系统的分析方法

本发明公开了一种人类和恒河猴大脑发育差异系统的分析方法,涉及生物基因研究分析技术领域,该分析方法包括以下步骤：S1、基因表达数据处理；S2、利用主成分的分析方法对基因表达数据进行处理；S3、蛋白质互作网络的选取；S4、利用基因表达数据结合蛋白质互作网络信息构建无向网络；S5、利用旅行商问题进行子网络的提取,本发明基于最短路径的差异网络构建方法,构建了最短路差异网络,并利用最短旅行商问题的方法,对大规模的基因差异网络进行子网络的提取,通过对子网络进行系统分析,识别出人类与恒河猴大脑发育过程中的关键基因,挖掘出大脑发育差异的核心模块,揭示两个物种大脑发育差异的背后机制。

2021-10-01

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