本发明公开了一种自动化小麦脱粒机,包括：喂料机构、脱粒机、扫码机构、打码机构、存储机构和控制器；喂料机构、扫码机构、打码机构和存储机构均与控制器连接；扫码机构设置于脱粒机的进料口处,打码机构设置于脱粒机的出料口处。本发明的脱粒机仅需在控制器的控制下将装有小麦的喂料机构移动至进料口上方,在控制器的控制下即可实现自动喂料、自动打码和自动存储的功能,在喂料、脱粒和存储的整个流程中均不需要人员看管,大大解放了人力。且设置扫码机构和打码机构,使得喂料机构和存储机构一一对应,避免了不同小麦的麦粒之间的混杂。