一种扩展景深的光场显微成像系统及光学设备
阅读说明：本技术 一种扩展景深的光场显微成像系统及光学设备 (Light field microscopic imaging system and optical equipment with extended depth of field ) 是由 季向阳 张亿 吴嘉敏 戴琼海 于 2021-08-11 设计创作，主要内容包括：本发明公开了一种扩展景深的光场显微成像系统,包括样本、物镜、微透镜阵列和相机,物镜和微透镜阵列之间设置反射镜和套筒透镜,微透镜阵列和相机之间设置4f系统,利用物镜与样本之间的介质与样本的折射率不匹配,在光路中引入球差,使得不同角度的光线聚焦在样本不同的深度；同时充分利用光场角度的冗余性,使用传统的解卷积算法,达到了扩展光场景深的技术效果,实现了大轴向范围、高分辨率的三维显微成像效果。本发明还公开了一种包含扩展景深的光场显微成像系统的光学设备。(The invention discloses a light field microscopic imaging system with extended depth of field, which comprises a sample, an objective lens, a micro lens array and a camera, wherein a reflector and a sleeve lens are arranged between the objective lens and the micro lens array, a 4f system is arranged between the micro lens array and the camera, and spherical aberration is introduced into a light path by utilizing the mismatch of the refractive index of a medium between the objective lens and the sample and the refractive index of the sample, so that light rays with different angles are focused at different depths of the sample; meanwhile, the redundancy of the angle of the light field is fully utilized, the technical effect of expanding the depth of field of the light field is achieved by using the traditional deconvolution algorithm, and the three-dimensional microscopic imaging effect with large axial range and high resolution is realized. The invention also discloses optical equipment comprising the light field microscopic imaging system with the extended depth of field.)
技术领域
本发明属于光场三维成像技术领域，尤其涉及一种扩展景深的光场显微成像系统及光学设备。
背景技术
光场成像是一种快速三维成像方法。相较于其它显微成像技术，光场成像具有高通量、高并行化、低光毒性的特点。由于光场系统在单曝光时间内采集到了样本的三维信息，光场成像非常适用于活体样本的长时三维观测。
光场系统通过在光路中加入一个微透镜阵列来同时采集样本荧光的空间和角度信息。因此，对于三维成像而言，光场采集到的大量角度信息是冗余的。相比于传统的宽场显微技术，光场系统的景深已经扩展了1-2个数量级，但是对于一些活体样本，当前光场的景深范围还不足够覆盖整个样本。
发明内容
针对上述现有技术中存在的光场的景深不足够大的技术问题，本发明的目的在于提供一种扩展景深的光场显微成像系统及光学设备。
为达到上述目的，本发明提出了一种扩展景深的光场显微成像系统，包括样本、物镜、微透镜阵列和相机，物镜和微透镜阵列之间设置反射镜和套筒透镜，微透镜阵列和相机之间设置4f系统，利用物镜与样本之间的介质与样本的折射率不匹配，在光路中引入球差，使得不同角度的光线聚焦在样本不同的深度。
本发明利用物镜与样本之间的介质与样本的折射率不匹配，在光路中引入较大的球差，使得不同角度的光线聚焦在样本不同的深度，同时利用光场角度的冗余性，使用传统的解卷积算法，获得两倍的景深扩展，实现大轴向范围、高分辨率的三维显微成像结果。
进一步地，物镜为空气镜时，球差的引入方式为：在空气镜和样本之间设置透明玻璃片或者将空气镜浸没在水或油溶液中；物镜为油镜或水镜时，球差的引入方式为：在使用时去掉水镜或油镜的成像介质。
本发明引入球差的方法不限于上述方法，能够改变物镜与样本之间介质的折射率的方法均可引入球差。
通过在空气镜和样本之间设置透明玻璃引入球差时，透明玻璃的厚度根据实际需要选择不同的厚度。
进一步地，将空气镜浸没在水或油溶液中的具体步骤为：将样本放置在培养皿中，将水或油溶液倒入培养皿至液面没过样本。
进一步地，去掉水镜或油镜的成像介质的操作方法为：在使用水镜或油镜时分别不添加水或油溶液。
进一步地，油溶液为香柏油或石蜡油。
进一步地，4f系統包括两个焦距为f的透镜，两个透镜之间的距离为2f，透镜的物距和相距均为f。
进一步地，微透镜阵列包括若干个透镜单元，用于采集样本荧光的空间和角度信息。
本发明还提供了一种包含扩展景深的光场显微成像系统的光学设备。
相对于现有技术，本发明的技术效果为：本发明涉及的扩展景深的光场显微成像系统通过改变物镜与样本之间介质的折射率，在光路中引入较大的球差，使得不同角度的光线聚焦在样本不同的深度；同时充分利用光场角度的冗余性，使用传统的解卷积算法，达到了扩展光场景深的技术效果，实现了大轴向范围、高分辨率的三维显微成像效果。相比传统光场显微成像，本方法可以将景深扩展2倍，实现毫米级景深。
附图说明
本发明上述的和/或附加的方面和优点从下面结合附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：
图1为本发明光场显微成像系统结构图；
图2为光场景深与宽场景深对比图；
图3为球差示意图；
图4为介质折射率对光路聚焦能力的示意图；
图5为本发明实施例扩展景深的重建结构示例对比图。
具体实施方式
下面详细描述本发明的实施例，所述实施例的示例在附图中示出，其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的，旨在用于解释本发明，而不能理解为对本发明的限制。
下面参照附图描述根据本发明实施例提出的扩展景深的光场显微成像系统及光学设备。
如图1所示，该扩展景深的光场显微成像系统包括：包括样本、物镜、微透镜阵列和相机，物镜和微透镜阵列之间设置反射镜和套筒透镜，微透镜阵列和相机之间设置4f系统，在物镜的后焦面引入球差，使得不同角度的光线聚焦在不同深度。4f系統包括两个焦距为f的透镜，两个透镜之间的距离为2f，透镜的物距和相距均为f，微透镜阵列包括若干个透镜单元，用于采集样本荧光的空间和角度信息，透镜单元的直径为100μm。
与宽场成像相比，光场系统天然地扩展了系统的景深范围。以15×15的系统为例，由于系统加入了微透镜阵列来采集不同视角的信息，系统的孔径被分成了15×15份，每个视角得到的图像对应其中一个子孔径。对于同数值孔径(NA)的宽场系统，光场系统子孔径图像的NA大小为宽场的十五分之一。由于系统的景深范围与NA的倒数的平方成正比，因此相较于宽场，光场系统的景深已经扩展了1到2个数量级。光场景深扩展的示意如图2所示。其中Z1、Z2、Z3、Z4、Z5代表不同的深度位置。图2中第一横行为宽场显微镜在不同轴向位置的点扩散函数示意图，可以看到在Z1和Z5位置上，四个样本点的信号互相混叠，无法分开。图2中第二横行为宽场和不同视角下光场点扩散函数的yz投影示意图，可以看出到随着轴向位置的变化，宽场的点扩散函数快速扩散；在一个比较大的轴向范围上内，不同视角下的光场的点扩散函数仍能保持一定的分辨能力。相比宽场，光场的景深被扩展了1-2个数量级。在图2中，在景深范围外的光强是背景光。图2中第三横行和第四横行，分别对应第二横行中第一视角光场和第二视角光场光线，表示在不同子孔径(不同视角)下，光场的点扩散函数的扩散情况。以15×15的系统为例，每个微透镜阵列对应15×15个传感器像素，最终可以得到225个子孔径图像。以中心角度作为相位域的原点I(u0,v0)，则所有角度下的图像可以用I(ux,uy)来表示，其中x,y分别是范围在-7到7之内的整数。图2中第三横行和第四横行分别展示的是不同深度下的I(u7,v7)和I(u3,v3)。
对于同一个三维样本，在多视角光线聚焦在同一深度的情况下，光场的角度数据有冗余。以15×15的光场采集系统为例：在使用三维子孔径迭代重建方法的过程中，设定比较合适的迭代更新率和子孔径迭代顺序，在轴向分辨率要求不高的情况下，通常只需要十几个角度就能使重建算法收敛，而不需要使用225张子孔径图像。在冗余性的前提下，如果使不同角度的光线聚焦在不同深度，通过不同深度聚焦的子孔径图像重建得到的三维体，其最高分辨率的范围相较于原聚焦面有所偏移。假设相空间上以原点为圆心，同半径的圆上的子孔径图像聚焦在同一深度，即同半径圆上的子孔径图像重建得到的三维体，在一段特定的轴向范围内可以达到最高分辨率。按照需求设定不同的同心圆半径间隔，等间隔选取同心圆，例如选取间隔为1，则至少可以从15×15个角度中获取7个同心圆，重建得到7个聚焦在不同深度的三维体。也可以按照轴向分辨率的要求，非等间隔地选取同心圆，再进行重建。
为了达到上述高分辨率效果，本发明改变了物镜与样本间介质的折射率，进而在显微成像系统中引入了球差，球差的示意图如图3所示。物镜为空气镜时，球差的引入方式为在空气镜和样本之间设置透明玻璃片或者将空气镜浸没在水或油溶液中，将空气镜浸没在水或油溶液中的具体步骤为：将样本放置在培养皿中，将水或油溶液倒入培养皿至液面没过样本。物镜为油镜或水镜时，球差的引入方式为在使用时去掉水镜或油镜的成像介质，具体操作方法为在使用水镜或油镜时不添加水或油溶液，其中，油溶液为香柏油或石蜡油。引入球差的方法使通过物镜的不同角度的光线，聚焦在不同的深度。通过这种方法，光场采集得到的子孔径图像是样本不同深度真值的投影。如图4所示，如果物镜与样本之间的介质折射率匹配，则光线会沿着虚线传播，最终汇聚成一个焦点。而在折射率不匹配的情况下，不同入射角度的光线最终会聚焦在不同深度。
图5为一个实施例的成像结果对比图。采用10x/0.28NA的空气镜，使该空气镜浸没在水中，由于水的折射率为1.33，与空气的折射率不匹配，相当于改变了样本和物镜之间的折射率。在折射率匹配的情况下，10x/0.28NA，15×15子孔径的光场采集系统的景深范围在500μm以内，改变介质的折射率后，选择合适的角度进行重建，可以将景深范围扩展至1mm。图5为离焦500μm的成像结果。在系统中加入球差后，即有球差时。USAF分辨率板的第五组的线条仍能被准确分辨，而在无球差的情况下，第五组的内容几乎不可分辨。
另外，本发明还提供了一种包含扩展景深的光场显微成像系统的光学设备。
在本说明书的描述中，参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中，对上述术语的示意性表述不必须针对的是相同的实施例或示例。而且，描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。此外，在不相互矛盾的情况下，本领域的技术人员可以将本说明书中描述的不同实施例或示例以及不同实施例或示例的特征进行结合和组合。
此外，术语“第一”、“第二”仅用于描述目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性或者隐含指明所指示的技术特征的数量。由此，限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括至少一个该特征。在本发明的描述中，“多个”的含义是至少两个，例如两个，三个等，除非另有明确具体的限定。
尽管已经示出和描述了本发明的实施例，本领域的普通技术人员可以理解：在不脱离本发明的原理和宗旨的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型，本发明的范围由权利要求及其等同物限定。