用于治疗家族性自主神经功能障碍的噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺化合物

文档序号:1966500 发布日期:2021-12-14 浏览:31次 >En<

阅读说明:本技术 用于治疗家族性自主神经功能障碍的噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺化合物 (Thieno [3,2-B ] pyridin-7-amine compounds for the treatment of familial autonomic nervous dysfunction ) 是由 张南京 M·A·阿诺德 A·达卡 G·M·卡普 T·T·梁 J·纳拉辛汉 N·A·纳雷什 于 2020-02-10 设计创作,主要内容包括:本说明书涉及用于改善细胞中的前体-mRNA剪接的式(I)化合物。特别地,本说明书的另一方面涉及取代噻吩并[3,2-b]吡啶化合物、其形式和药物组合物以及用于治疗或改善家族性自主神经功能障碍的方法。(The present specification relates to compounds of formula (I) for use in improving the splicing of a precursor-mRNA in a cell. In particular, another aspect of the present description relates to substituted thieno [3,2-b ]]Pyridine compounds, forms and pharmaceutical compositions thereof and methods for treating or ameliorating familial autonomic nerve dysfunction.)

用于治疗家族性自主神经功能障碍的噻吩并[3,2-B]吡啶-7- 胺化合物

相关申请的交叉引用

本申请要求2019年2月13日提交的美国临时申请号62/805,283的优先权。

联合研究协议声明

所公开的主题以及所要求保护的发明由联合研究协议的一方或多方完成或代表联合研究协议的一方或多方,该联合研究协议在所要求保护发明的有效申请日期当天或之前生效。所要求保护的发明是执行该联合研究协议范围内活动的结果。该联合研究协议的各方是PTC医疗公司和综合医院公司(General Hospital Corporation),经营别称:麻省总医院。

技术领域

本发明的一方面涉及用于改善细胞中前体-mRNA剪接的化合物。特别地,本发明的另一方面涉及取代噻吩并[3,2-b]吡啶化合物、其形式和药物组合物以及用于治疗或改善家族性自主神经功能障碍的方法。

背景技术

家族性自主神经功能障碍(FD)是中枢和周围神经系统的先天性感觉和自主神经病变(HSAN),其特征在于广泛的感觉和可变的自主神经功能障碍。FD影响神经元发育,并与进行性神经元变性有关。多个系统受到影响,导致生活质显著下降和过早死亡。FD是由IKBKAP(也称为ELP1)基因突变引起的,在迄今为止描述的所有病例中,至少有一个等位基因在内含子20的第6位携带T到C突变,导致独特的组织-特定性外显子跳跃模式。

可用于治疗性靶向前体-mRNA剪接机制和治疗FD的激动素衍生物已在国际专利申请号WO2016/115434中进行了描述,其公开内容通过引用整体并入本发明中。

本文提及的所有其他文献都通过引用而并入本申请中,如同本文完全阐述的一样。

发明内容

本发明的一方面包括包含式(I)化合物的化合物:

或其形式,其中R1、R3、R4、R5和R6在本文定义。

本发明的一方面包括使用式(I)化合物或其形式或组合物治疗或改善有需要的受试者中的FD的方法,包括向受试者施用有效剂量的式(I)化合物或其形式或组合物。

本发明的一方面包括式(I)化合物或其形式治疗或改善有需要的受试者中的FD的用途,包括向受试者施用有效剂量的式(I)化合物或其形式。

本发明的一方面包括式(I)化合物或其形式在制备用于治疗或改善有需要的受试者中的FD的药物中的用途,包括向受试者施用有效剂量的所述药物。

具体实施方式

本发明的一方面涉及包含式(I)化合物的化合物:

或其形式,其中:

R1是苯基或杂芳基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R1a取代基取代,

其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团;

R1a是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基或C1-6烷氧基;

R3是氢、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基和C1-6烷基-氨基,

其中C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,及

其中C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基的每个实例可任选地含有(R)或(S)构型的手性碳;

R3a是氰基、卤素、羟基、氧代、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、卤代-C1-6烷氧基、羧基、氨基、C1-6烷氧基-羰基、C1-6烷基-氨基、卤代-C1-6烷基-氨基、(C1-6烷基)2-氨基、苯基-氨基、杂环基-氨基、杂芳基-氨基、苯基-(C1-6烷基)-氨基、杂环基-(C1-6烷基)-氨基、杂芳基-(C1-6烷基)-氨基、C1-6烷基-硫基、C1-6烷基-亚硫酰基(sulfoxyl)和C1-6烷基-磺酰基,

其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团,

其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团,

其中苯基、杂环基和杂芳基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代;

R3a′是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基或氨基;

R4是氢、氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、卤代-C1-6烷氧基、氨基、C1-6烷基-氨基、(C1-6烷基)2-氨基、C3-10环烷基、苯基、杂环基或杂芳基,

其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团,

其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团,及

其中C1-6烷基、C3-10环烷基、苯基、杂环基和杂芳基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代;

R4a是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基或C1-6烷氧基;

R5是氢、氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、氨基甲酰基、C3-10环烷基或杂环基,

其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团;及

R6是氢、卤素或C1-6烷基;

其中所述化合物的形式选自由其盐、水合物、溶剂化物和互变异构体形式组成的组。

一方面包括式(I)化合物,其中R1是苯基或杂芳基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R1a取代基取代,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是苯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R1a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是苯基,任选地被1个R1a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R1a取代基取代,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,任选地被1个R1a取代基取代,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,选自呋喃基、噻吩基、1H-吡唑基、1H-咪唑基、异恶唑基、1,3-噻唑基、1,3-恶唑基、四唑基、1,2,3-三唑基、1,2,4-恶二唑基、1,3,4-恶二唑基、1,2,3-噻二唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、苯并呋喃基和喹啉基,其中杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立的R1a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,选自呋喃基、噻吩基、1,3-噻唑基和吡啶基,其中杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立的R1a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,选自呋喃-2-基、呋喃-3-基、噻吩-2-基、噻吩-3-基、1H-吡唑-1-基、1H-吡唑-3-基、1H-吡唑-4-基、1H-吡唑-5-基、1H-咪唑-1-基、1H-咪唑-4-基、异恶唑-3-基、异恶唑-4-基、异恶唑-5-基、1,3-噻唑-2-基、1,3-噻唑-4-基、1,3-噻唑-5-基、1,3-恶唑-2-基、1,3-恶唑-4-基、1,3-恶唑-5-基、1,2,4-恶二唑-3-基、1,3,4-恶二唑-2-基、四唑-5-基、1,2,3-三唑-4-基、1,2,3-三唑-5-基、1,2,3-噻二唑-4-基、1,2,3-噻二唑-5-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、嘧啶-4-基、吡嗪-2-基、哒嗪-3-基、哒嗪-4-基、苯并呋喃-2-基、苯并呋喃-5-基和喹啉-4-基,其中,杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立的R1a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1是杂芳基,选自呋喃-2-基、噻吩-2-基、1,3-噻唑-2-基和吡啶-4-基,其中杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立的R1a取代基取代。

一方面包括式(I)化合物,其中R1a是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基或C1-6烷氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1a是卤素。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1a是卤素,选自氟、氯、溴和碘。

另一方面包括式(I)化合物,其中R1a是氟。

一方面包括式(I)化合物,其中R3是氢、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基或C1-6烷基-氨基,

其中C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,及

其中C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基的每个实例可任选地含有(R)或(S)构型的手性碳;

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是氢、C1-6烷基、C2-6烯基或C2-6炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基、C2-6烯基或C2-6炔基可任选含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是氢。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中,C1-6烷基任选地含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基和戊基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基和戊基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基和戊基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中,C2-6烯基任选地含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6烯基,选自乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基和庚烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6烯基,选自乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基和庚烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6烯基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6烯基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中,C2-6炔基任选地含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6烯基,选自乙烯基、丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基和庚烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6烯基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁烯基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6烯基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6炔基,选自乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基和庚炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6炔基,选自乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基和庚炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6炔基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6炔基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C2-6炔基,选自乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基和庚炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6炔基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是丁炔基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C2-6炔基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中,C1-6烷基任选地含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基是丙基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基是丙基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(R)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基是丙基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中C1-6烷基任选地含有(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是C3-10环烷基,选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是环丙基或环戊基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是杂环基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代,其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团,其中杂环基任选地含有(R)或(S)构型的手性碳。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是杂环基,选自氮杂环丁烷基、氧杂环丁烷基、吡唑烷基、四氢呋喃基、恶唑烷基、噻唑烷基、异噻唑烷基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、2H-吡喃基、四氢吡喃基、吗啉基、1,3-恶嗪基(oxazinanyl)和氮杂环庚烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是氮杂环丁烷基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是杂环基,选自氮杂环丁烷-2-基、氮杂环丁烷-3-基、氧杂环丁烷-2-基、氧杂环丁烷-3-基、吡唑烷-1-基、吡唑烷-2-基、吡唑烷-3-基、吡唑烷-4-基、吡唑烷-5-基、四氢呋喃-1-基、四氢呋喃-2-基、恶唑烷-2-基、恶唑烷-4-基、恶唑烷-5-基、噻唑烷-2-基、噻唑烷-4-基、噻唑烷-5-基、异噻唑烷-3-基、异噻唑烷-4-基、异噻唑烷-5-基、吡咯烷-2-基、吡咯烷-3-基、哌啶-1-基、哌啶-2-基、哌啶-3-基、哌啶-4-基、哌嗪-1-基、哌嗪-2-基、哌嗪-3-基、2H-吡喃-2-基、2H-吡喃-3-基、2H-吡喃-4-基、2H-吡喃-5-基、2H-吡喃-6-基、四氢吡喃-2-基、四氢吡喃-3-基、四氢吡喃-4-基、吗啉-2-基、吗啉-3-基、吗啉-4-基、1,3-恶嗪-2-基、1,3-恶嗪-3-基、1,3-恶嗪-4-基、氮杂环庚烷-1-基、氮杂环庚烷-2-基、氮杂环庚烷-3-基和氮杂环庚烷-4-基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3是氮杂环丁烷-3-基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a取代基取代。

一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氰基、卤素、羟基、氧代、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、卤代-C1-6烷氧基、羧基、氨基、C1-6烷氧基-羰基、C1-6烷基-氨基、卤代-C1-6烷基-氨基、(C1-6烷基)2-氨基、苯基-氨基、杂环基-氨基、杂芳基-氨基、苯基-(C1-6烷基)-氨基、杂环基-(C1-6烷基)-氨基、杂芳基-(C1-6烷基)-氨基、C1-6烷基-硫基、C1-6烷基-亚硫酰基或C1-6烷基-磺酰基,其中C3-10环烷基、苯基、杂环基和杂芳基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氰基、卤素、羟基、氧代、C1-6烷基、C1-6烷氧基、卤代-C1-6烷氧基、羧基、氨基、C1-6烷氧基-羰基、C1-6烷基-氨基、卤代-C1-6烷基-氨基、(C1-6烷基)2-氨基、苯基-氨基、杂芳基-氨基、苯基-(C1-6烷基)-氨基、杂环基-(C1-6烷基)-氨基、杂芳基-(C1-6烷基)-氨基、C1-6烷基-硫基、C1-6烷基-亚硫酰基或C1-6烷基-磺酰基,其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团,其中C3-10环烷基、苯基、杂环基和杂芳基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氰基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤素,选自氟、氯、溴和碘。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氟。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是羟基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氧代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基,选自C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基,选自甲基和异丙基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷氧基,选自甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、仲丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、戊氧基和己氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是甲氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤代-C1-6烷氧基,其中C1-6烷氧基选自甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、仲丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、戊氧基和己氧基,在可用价数允许的情况下,其被1个或多个卤原子部分或全部取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤代-C1-6烷氧基,其中C1-6烷氧基是被3个氟原子取代的甲氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是羧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是氨基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷氧基-羰基,其中C1-6烷氧基选自甲氧基、甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、仲丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、戊氧基和己氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷氧基-羰基,其中C1-6烷氧基是甲氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤代-C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基,在可用价数允许的情况下,其被1个或多个卤原子部分或全部取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤代-C1-6烷基-氨基,其中C1-6烷基是被3个氟原子取代的甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是(C1-6烷基)2-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是(C1-6烷基)2-氨基,其中C1-6烷基是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是苯基-氨基,其中苯基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是苯基-氨基,其中苯基任选地被1个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是杂芳基-氨基,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团,其中杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是杂芳基-氨基,其中杂芳基选自呋喃基、噻吩基、1H-吡唑基、1H-咪唑基、异恶唑基、1,3-噻唑基、1,3-恶唑基、四唑基、1,2,3-三唑基、1,2,4-恶二唑基、1,3,4-恶二唑基、1,2,3-噻二唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、苯并呋喃基和喹啉基,其中杂芳基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是杂芳基-氨基,其中杂芳基选自1H-吡唑基、吡啶基和吡嗪基,其中每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是苯基-(C1-6烷基)-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,其中苯基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R3a′取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是苯基-(C1-6烷基)-氨基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,其中苯基是任选地被1个独立选择的R3a′取代基取代的苯基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是苯基-(C1-6烷基)-氨基,其中C1-6烷基是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-硫基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-硫基,其中C1-6烷基是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-亚硫酰基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-亚硫酰基,其中C1-6烷基是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-磺酰基,其中C1-6烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是C1-6烷基-磺酰基,其中C1-6烷基是甲基。

一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基或氨基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是卤素或C1-6烷基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是氰基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是卤素,选自氟、氯、溴和碘。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是氟或氯。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是C1-6烷氧基,选自甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、仲丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、戊氧基和己氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是甲氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a′是氨基。

一方面包括式(I)化合物,其中R4是氢、氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、卤代-C1-6烷氧基、氨基、C1-6烷基-氨基、(C1-6烷基)2-氨基、C3-10环烷基、苯基、杂环基或杂芳基,其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团,其中杂芳基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的5-8元单环或双环芳族碳原子环结构基团,其中C1-6烷基、C3-10环烷基、苯基、杂环基或杂芳基的每个实例任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是氢、氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷氧基或C3-10环烷基,其中C1-6烷基或C3-10环烷基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是氢。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是氰基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是卤素,选自氟、氯、溴和碘。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是卤素,选自氯和溴。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是羟基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基,其中C1-6烷基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是甲基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是卤代-C1-6烷氧基,其中C1-6烷氧基选自甲氧基、甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、仲丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、戊氧基和己氧基,在可用价数允许的情况下,其被1个或多个卤原子部分或全部取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R3a是卤代-C1-6烷氧基,其中C1-6烷氧基是被2个氟原子取代的甲氧基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是C3-10环烷基,其中C3-10环烷基任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是C3-10环烷基,选自环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基和环辛基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

另一方面包括式(I)化合物,其中R4是环丙基,任选地被1个、2个、3个或4个独立选择的R4a取代基取代。

一方面包括式(I)化合物,其中R4a是氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基或C1-6烷氧基。

一方面包括式(I)化合物,其中R5是氢、氰基、卤素、羟基、C1-6烷基、卤代-C1-6烷基、C1-6烷氧基、氨基甲酰基、C3-10环烷基或杂环基,其中杂环基是含有1-3个选自N、O和S的杂原子的3-7元单环碳原子环结构基团。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是氢、氰基、卤素或C1-6烷基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是氢。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是氰基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是卤素,选自氟、氯、溴和碘。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是氯。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是C1-6烷基,选自甲基、乙基、丙基、丁基、戊基和己基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R5是甲基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R6是氢、卤素或C1-6烷基。

另一方面包括式(I)化合物,其中R6是氢。

式(I)化合物或其形式的一方面包括选自以下组成的组的化合物:

其中所述化合物的形式选自由其盐、水合物、溶剂化物和互变异构体形式组成的组。

一方面,式(I)化合物或其形式(其中化合物编号(#1)表示分离出盐形式)包括选自由以下组成的组的化合物:

其中所述化合物的形式选自由其盐、水合物、溶剂化物和互变异构体形式组成的组。

式(I)化合物或其形式的另一方面是选自由以下组成的组的化合物的盐:

其中所述化合物的形式选自由其盐、水合物、溶剂化物和互变异构体形式组成的组。

本申请进一步提供一种药物组合物,其包含本文提供的化合物或其药学上可接受的盐以及至少一种药学上可接受的载体。

本申请进一步提供治疗有需要的受试者的家族性自主神经功能障碍(与一种或多种前体-mRNA剪接缺陷相关的中枢和外周神经系统疾病)的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效剂量的本文提供的化合物或其药学上可接受的盐。

除非特别规定,本文使用的所有技术和科学术语的意思与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的意思相同。本文描述了用于本发明的方法和材料;也可以使用本领域已知的其他合适的方法和材料。

材料、方法和实例仅仅是说明性的而非限制性的。本文提到的所有出版物、专利申请、专利、序列、数据库条目和其它参考文献都通过引用而整体并入本申请中。如有冲突,以本说明书(包括定义)为准。

化学定义

除非另外明确定义,否则上文和本文整个说明书中使用的化学术语应被本领域普通技术人员理解为具有以下指示的含义。

如本文所使用的,术语“C1-6烷基”通常是指具有1至8个碳原子的直链或支链构型的饱和烃基,包括但不限于甲基、乙基、正-丙基(也称为丙基或丙烷基)、异丙基、正丁基(也称为丁基或丁烷基)、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基(也称为戊基或戊烷基)、正己基(也称为己基或己烷基)等。在某些方面,C1-6烷基包括但不限于C1-6烷基、C1-4烷基等。在可用价数允许的情况下,C1-6烷基基团任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“杂-C1-6烷基”通常是指具有1至6个碳原子的直链或支链构型的饱和烃基,其中一个或多个杂原子(例如O、S或N原子)是链中的成员,包括但不限于杂甲基、杂乙基、杂丙基、杂丁基、杂戊基、杂己基等。在某些方面,杂-C1-6烷基包括但不限于杂-C2-6烷基、杂-C1-4烷基、杂-C2-4烷基等。在可用价数允许的情况下,杂-C1-6烷基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“C2-6烯基”通常是指具有2至8个碳原子的直链或支链构型且直链或支链构型中具有一个或多个碳-碳双键的部分不饱和烃基,包括但不限于乙烯基(ethenyl)(也称为乙烯基(vinyl))、烯丙基、丙烯基等。在某些方面,C2-6烯基包括但不限于C2-6烯基、C2-4烯基等。在可用价数允许的情况下,C2-6烯基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“C2-6炔基”通常是指具有2至8个碳原子的直链或支链构型且的直链或支链构型中具有一个或多个碳-碳叁键的部分不饱和烃基,包括但不限于乙炔基(ethynyl)(也称为乙炔基(acetylenyl))、丙炔基、丁炔基等。在某些方面,C2-6炔基包括但不限于C2-6炔基、C2-4炔基等。在可用价数允许的情况下,C2-6炔基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“C1-6烷氧基”通常是指具有下述结构式的1至8个碳原子的直链或支链构型的饱和烃基:-O-C1-6烷基,包括但不限于甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基、正己氧基等。在某些方面,C1-6烷氧基包括但不限于C1-6烷氧基、C1-4烷氧基等。在可用价数允许的情况下,C1-6烷氧基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“氧代”指的是具有下述结构式的基团:=O。

如本文所使用的,术语“羧基”指的是具有下述结构式的基团:-COOH、-C(O)OH或-CO2H。

如本文所使用的,术语“C1-6烷氧基-羰基”指的是具有下述结构式的基团:-COO-C1-6烷基、-C(O)O-C1-6烷基或-CO2-C1-6烷基。

如本文所使用的,术语“氨基甲酰基”指的是具有下述结构式的基团:-C(O)NH2

如本文所使用的,术语“C3-10环烷基”通常是指饱和或部分不饱和的单环、双环或多环烃基,包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环己烯基、环庚基、环辛基、1H-茚满基、茚基、四氢-萘基等。在某些方面,C3-10环烷基包括但不限于C3-8环烷基、C5-8环烷基、C3-10环烷基等。在可用价数允许的情况下,C3-10环烷基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“芳基”通常指单环、双环或多环芳族碳原子环结构基团,包括但不限于苯基、萘基、蒽基、芴基、薁基、菲基等。在可用价数允许的情况下,芳基任选地被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“杂芳基”通常是指单环、双环或多环芳族碳原子环结构基团,其中一个或多个碳原子环成员在结构稳定性允许的情况下被一个或多个杂原子(例如O、S或N原子)取代,包括但不限于呋喃基、噻吩基、吡咯基、吡唑基、咪唑基、异恶唑基、异噻唑基、恶唑基、1,3-噻唑基、三唑基、恶二唑基、噻二唑基、四唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、三嗪基、吲哚基、吲唑基、吲哚嗪基、异吲哚基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并咪唑基、1,3-苯并噻唑基、1,3-苯并恶唑基、嘌呤基、喹啉基、异喹啉基、喹唑啉基、喹喔啉基等。在可用价数允许的情况下,杂芳基任选地在碳或氮原子环成员处被本文所述的取代基取代。

在某些方面,杂芳基的命名法可能不同,例如在非限制性实例中,其中呋喃基(furanyl)也可以称为呋喃基(furyl),噻吩基(thiophenyl)也可以称为噻吩基(thienyl),吡啶基(pyridinyl)也可以称为氮苯基(pyridyl),苯并噻吩基(benzothiophenyl)也可以称为苯并噻吩基(benzothienyl),1,3-苯并恶唑基(1,3-benzoxazolyl)也可以被称为1,3-苯并噁唑基(1,3-benzooxazolyl)。

在某些其他方面,术语“杂芳基”还可以包括其他位置异构体,例如在非限制性实例中,术语“吡咯基”还可以包括2H-吡咯基、3H-吡咯基等,术语“吡唑基”还可以包括1H-吡唑基等,术语“咪唑基”还可以包括1H-咪唑基等,术语“三唑基”还可以包括1H-1,2,3-三唑基等,术语“恶二唑基”还可以包括1,2,4-恶二唑基、1,3,4-恶二唑基等,术语“四唑基”还可以包括1H-四唑基、2H-四唑基等,术语“吲哚基”还可以包括1H-吲哚基等,术语“吲唑基”还可以包括1H-吲唑基、2H-吲唑基等,术语“苯并咪唑基”还可以包括1H-苯并咪唑基,和术语“嘌呤基”还可以包括9H-嘌呤基等。

如本文所使用的,术语“杂环基”通常是指饱和或部分不饱和的单环、双环或多环碳原子环结构基团,其中一个或多个碳原子环成员在结构稳定性允许的情况下已被杂原子(例如O、S或N原子)取代,包括但不限于环氧乙烷基、氧杂环丁烷基、氮杂环丁烷基、四氢呋喃基、吡咯啉基、吡咯烷基、吡唑啉基、吡唑烷基、咪唑啉基、咪唑烷基、异恶唑啉基、异恶唑烷基、异噻唑啉基、异噻唑烷基、恶唑啉基、恶唑烷基、噻唑啉基、噻唑烷基、三唑啉基、三唑烷基、恶二唑啉基、恶二唑烷基、噻二唑啉基、噻二唑烷基、四唑啉基、四唑烷基、吡喃基、二氢-2H-吡喃基、四氢吡喃基、硫代吡喃基、1,3-二氧杂环己烷基(1,3dioxanyl)、1,3-恶嗪基、1,2,5,6-四氢吡啶基、1,2,3,6-四氢吡啶基、哌啶基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基、1,4-二氮杂环庚烷基、1,3-苯并二氧杂环戊基、1,4-苯并二氧杂环己基等。在可用价数允许的情况下,杂环基任选地在碳或氮原子环成员处被本文所述的取代基取代。

如本文所使用的,术语“C1-6烷基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-C1-6烷基。

如本文所使用的,术语“卤代-C1-6烷基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-C1-6烷基,其中在可用价数允许的情况下,C1-6烷基被1个或多个卤原子部分或全部取代。

如本文所使用的,术语“(C1-6烷基)2-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-N(C1-6烷基)2

如本文所使用的,术语“C1-6烷基-羧基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-C(O)-。

如本文所使用的,术语“芳基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-芳基。

如本文所使用的,术语“杂环基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-杂环基。

如本文所使用的,术语“杂芳基-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-NH-杂芳基。

如本文所使用的,术语“芳基-(C1-6烷基)-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-N(C1-6烷基)-芳基。

如本文所使用的,术语“杂环基-(C1-6烷基)-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-N(C1-6烷基)-杂环基。

如本文所使用的,术语“杂芳基-(C1-6烷基)-氨基”指的是具有下述结构式的基团:-N(C1-6烷基)-杂芳基。

如本文所使用的,术语“C1-6烷基-硫基”指的是具有下述结构式的基团:-S-C1-6烷基。

如本文所使用的,术语“C1-6烷基-亚硫酰基”指的是具有下述结构式的基团:-S(O)-C1-6烷基。

如本文所使用的,术语“C1-6烷基-磺酰基”指的是具有下述结构式的基团:-SO2-C1-6烷基。

如本文所使用的,术语“卤代”或“卤素”通常是指卤素原子基团,包括氟、氯、溴和碘。

如本文所使用的,术语“卤代-C1-6烷氧基”指的是具有下述结构式的基团:-O-C1-6烷基-卤素,其中在可用价数允许的情况下,C1-6烷基被1个或多个卤原子部分或全部取代。

如本文所使用的,术语“卤代-C1-6烷基”指的是具有下述结构式的基团:-C1-6烷基-卤素,其中在可用价数允许的情况下,C1-6烷基被1个或多个卤原子部分或全部取代。

如本文所使用的,术语“羟基”指的是具有下述结构式的基团:-OH。

如本文所使用的,术语“羟基-C1-6烷基”指的是具有下述结构式的基团:-C1-6烷基-OH,其中在可用价数允许的情况下,C1-6烷基被1个或多个羟基部分或全部取代。

如本文所使用的,术语“取代基”是指在指定原子位置被取代的核心分子的原子上的位置变量,替换指定原子上的一个或多个氢,条件是不超过指定原子的正常化合价,并且所述取代产生稳定的化合物。取代基和/或变量的组合只有在这种组合产生稳定的化合物时才被允许。本领域普通技术人员应注意的是,具有如本文所述或所示看起来不满足的化合价的任何碳以及杂原子被假定具有足够数量的氢原子以满足所述或所示的化合价。在某些情况下,一个或多个具有双键(例如,“氧代”或“=O”)作为连接点的取代基可以在本文取代基组内进行描述、示出或列出,其中所述结构可以仅示出单键作为与式(I)核心结构连接的点。本领域普通技术人员将理解的是,虽然仅示出了单键,但双键适用于那些取代基。

本文所使用的,提到本文提供的化学术语的定义时的词语“等”是指本领域技术人员可以预期的化学结构变化,包括但不限于异构体(包括链、支链或位置结构异构体)、环系统的水合(包括单环、双环或多环环结构的饱和或部分不饱和)以及在可用价数允许的情况下产生稳定化合物的所有其他变化。

出于本说明书的目的,当式(I)化合物或其形式的一个或多个取代基变量包含并入式(I)化合物中的官能团时,出现在所公开化合物内任何位置的每个官能团可以独立地选择,并视情况独立地和/或任选地被取代。

如本文所使用的,术语“独立选择的”或“每次选择的”是指可在式(I)的结构上出现不止一次的取代基列表中的官能团变量,每次出现的取代模式独立于任何其他出现的模式。此外,本文所述的化合物的任何分子式或结构上使用通用取代基变量应理解为包括用包括在特定属内的取代基替换通用取代基,例如芳基可以用苯基或萘基等替换,并且所得到的化合物包括在本文所述化合物的范围内。

如本文所使用的,当在例如“……C3-10环烷基、C3-10环烷基-C1-4烷基、芳基、芳基-C1-4烷基、杂芳基、杂芳基-C1-4烷基、杂环基和杂环基-C1-4烷基”短语前使用时,术语“每个实例”和“在每个实例中,当存在时”是指各自单独存在或作为取代基存在的C3-10环烷基、芳基、杂芳基和杂环基环系统。

如本文所使用的,术语“任选地被取代”指的是任选采用指定的取代基变量、基团、自由基或部分取代。

化合物的形式

如本文所使用的,术语“形式”是指具有选自由其游离酸、游离碱、盐、水合物、溶剂化物、外消旋体、对映异构体、非对映异构体、立体异构体和互变异构体形式组成的组的形式的式(I)化合物。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物的形式是其游离酸、游离碱或盐。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物的形式是其盐。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物的形式是其立体异构体、外消旋体、对映异构体或非对映异构体。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物的形式是其互变异构体。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物的形式是药学上可接受的形式。

在本文所述的某些方面,式(I)化合物或其形式经分离以供使用。

本文所述的术语“分离的”是指根据本文所述的或技术人员熟知的分离或纯化方法(例如色谱法、重结晶等),从合成过程(例如,从反应混合物)或天然来源或它们的组合中分离和/或纯化后,纯度足够的式(I)化合物或其形式的物理状态,其中纯度采用本文所述的或技术人员熟知的标准分析方法表征。

如本文所使用的,术语“保护”是指式(I)化合物或其形式中的官能团处于经修饰的形式,以在化合物进行反应时防止在保护位点发生不希望的副反应。本领域普通技术人员以及通过参考标准教科书如T.W.Greene et al,Protective Groups in organicSynthesis(1991),Wiley,New York将可以了解合适的保护基团。所述官能团包括羟基、酚、氨基和羧酸。合适的羟基或酚的保护基团包括三烷基甲硅烷基或二芳基烷基甲硅烷基(例如,叔丁基二甲基甲硅烷基、叔丁基二苯基甲硅烷基或三甲基甲硅烷基)、四氢吡喃基、苄基、取代苄基、甲基、甲氧基甲醇等。合适的氨基、脒基和胍基保护基包括叔丁氧基羰基、苄氧基羰基等。合适的羧酸保护基团包括烷基酯、芳基酯或芳烷基酯。在某些情况下,保护基团也可以是聚合物树脂,例如Wang树脂或2-氯三苯甲基-氯树脂。保护基团可以根据本领域技术人员熟知的和本文所述的标准方法添加或去除。本领域技术人员还将理解的是,尽管本文所述化合物的此类保护衍生物本身可能不具有药理活性,但可以将它们向受试者施用,然后在体内代谢,形成具有药理活性的本文所述的化合物。因此,此类衍生物被描述为“前药”。本文所述化合物的所有前药均包括在本文所述用途的范围内。

如本文所使用的,术语“前药”是指在体内转化产生式(I)或其形式的活性化合物的即时化合物(例如,药物前体)的形式。转化可以通过各种机制(例如,通过代谢和/或非-代谢化学过程)发生,例如通过血液、肝脏和/或其他器官和组织中的水解和/或代谢发生。有关前药使用的讨论参见T.Higuchi and W.Stella,“Pro-drugs as Novel DeliverySystems,”Vol.14 of the A.C.S.Symposium Series,and in Bioreversible Carriersin Drug Design,ed.Edward B.Roche,American Pharmaceutical Association andPergamon Press,1987。

在一个实例中,当式(I)化合物或其形式含有羧酸官能团时,前药可包含通过用官能团(如烷基等)取代酸基团的氢原子而形成的酯。在另一实例中,当式(I)化合物或其形式含有羟基官能团时,前药形式可通过用另一官能团(如烷基、烷基羰基或膦酸酯等)取代羟基的氢原子来制备。在另一实例中,当式(I)化合物或其形式含有胺官能团时,前药形式可通过用官能团(如烷基或取代羰基)取代一个或多个胺的氢原子来制备。式(I)化合物或其形式的药学上可接受的前药包括被一个或多个下述基团取代(若合适的话)的那些化合物:羧酸酯、磺酸酯、氨基酸酯、膦酸酯和单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯或烷基取代基。正如本文所述,本领域普通技术人员理解的是,一个或多个此类取代基可用于提供作为前药形式的式(I)化合物或其形式。

本文所述的一种或多种化合物可以以非溶剂化形式以及以药学上可接受的溶剂(例如水、乙醇等)的溶剂化形式存在,并且本文所述旨在包括溶剂化形式和非溶剂化形式。

如本文所使用的,术语“溶剂化物”指的是本文所述化合物与一种或多种溶剂分子的物理结合。这种物理结合涉及不同程度的离子结合和共价结合(包括氢键结合)。在某些情况下,溶剂化物能够分离,例如,当一个或多个溶剂分子被引入到结晶固体的晶格中时。如本文所使用的,“溶剂化物”包括溶液相和可分离的溶剂化物。合适的溶剂化物的非限制性实例包括乙醇化物、甲醇化物等。

如本文所使用的,术语“水合物”是指其中溶剂分子为水的溶剂化物。

式(I)化合物可形成盐,其旨在包括在本说明书的范围内。除非另外说明,本文提及式(I)化合物或其形式都应理解为包括提及其盐形式。本文所使用的术语“盐”指的是与无机和/或有机酸形成的酸性盐,以及与无机和/或有机碱形成的碱性盐。此外,当式(I)化合物或其形式含有碱性单元(例如但不限于胺单元)和酸性单元(例如但不限于羧酸)时,可以形成两性离子(“内盐”),两性离子包括在本文所述的术语“盐”内。

虽然其它盐也有用,但本文所使用的术语“药学上可接受的盐”是指本文所述化合物的那些可安全且有效(即无毒、生理学上可接受的)的用于哺乳动物且具有生物活性的盐。式(I)化合物的盐可以例如通过使式(I)化合物或其形式与一定量(例如等当量)的酸或碱在介质(例如盐在其中沉淀的介质或水性介质)中反应,然后冷冻干燥而形成。

药学上可接受的盐包括本文所述化合物中存在的酸性或碱性基团的一种或多种盐。酸加成盐的具体方面包括但不限于乙酸盐、抗坏血酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、酒石酸氢盐、硼酸盐、溴化物、丁酸盐、氯化物、柠檬酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、乙磺酸盐、甲酸盐、富马酸盐、龙胆酸盐(gentisinate)、葡萄糖酸盐、葡糖醛酸盐、谷氨酸盐、碘化物、异烟酸盐、乳酸盐、马来酸盐、甲磺酸盐、萘磺酸盐、硝酸盐、草酸盐、双羟萘酸盐、泛酸盐、磷酸盐、丙酸盐、糖酸盐、水杨酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐(toluenesulfonate)(也称为甲苯磺酸盐(tosylate))、三氟乙酸盐等。酸加成盐的某些具体方面包括氯化物或二氯化物。

此外,通常认为适用于与碱性药物化合物反应而形成药学上有用的盐的酸例如在以下文献中进行了讨论:P.Stahl et al,Camille G.(eds.)Handbook of PharmaceuticalSalts.Properties,Selection and Use.(2002)Zurich:Wiley-VCH;S.Berge et al,Journal of Pharmaceutical Sciences(1977)66(1)1-19;P.Gould,International J.ofPharmaceutics(1986)33,201-217;Anderson et al,The Practice of MedicinalChemistry(1996),Academic Press,New York;以及The Orange Book(Food&DrugAdministration,Washington,D.C.在其网站上)。这些公开文献通过引用而并入本申请中。

合适的碱性盐包括但不限于铝盐、铵盐、钙盐、锂盐、镁盐、钾盐、钠盐和锌盐。

所有这些酸性盐和碱性盐都旨在包括在本文所述的药学上可接受的盐的范围内。此外,出于本说明书的目的,所有这些酸性盐和碱性盐都被认为等同于相应化合物的游离形式。

式(I)化合物及其形式还可以以互变异构形式存在。所有此类互变异构形式均被设想和旨在包括在本文所述的式(I)化合物或其形式的范围内。

式(I)化合物或其形式可含有不对称或手性中心,因此以不同的立体异构形式存在。本说明书旨在包括式(I)化合物的所有立体异构形式及它们的混合物,包括外消旋混合物。

本文所述的化合物可以包括一个或多个手性中心,并且因此可以作为外消旋混合物(R/S)或作为基本上纯的对映异构体和非对映异构体存在。化合物也可以以基本上纯的(R)或(S)对映异构体(当存在一个手性中心时)存在。在一个具体方面,本文所述的化合物是(S)异构体,并且可以作为基本上仅包含(S)异构体的对映体纯组合物存在。在另一具体方面,本文所述的化合物是(R)异构体,并且可以作为基本上仅包含(R)异构体的对映体纯组合物存在。正如本领域技术人员将认识到的那样,当存在一个以上手性中心时,本文所述的化合物也可以作为IUPAC命名建议定义的(R,R)、(R,S)、(S,R)或(S,S)异构体存在。

如本文所使用的,术语“手性”是指与四个不同取代基键合的碳原子。本文使用的立体化学定义和惯例通常遵循S.P.Parker,Ed.,McGraw-Hill Dictionary of ChemicalTerms(1984)McGraw-Hill Book Company,New York;及Eliel,E.和Wilen,S.,"Stereochemistry of Organic Compounds",John Wiley&Sons,Inc.,New York,1994。在描述光学活性化合物时,前缀D和L或R和S用于表示分子围绕其手性中心的绝对构型。所考虑的与手性中心连接的取代基根据Cahn、Ingold和Prelog的序列规则排列。(Cahn etal.Angew.Chem.Inter.Edit.1966,5,385;errata 511)。

如本文所使用的,术语“基本上纯”是指基本上由含量大于或等于90%、大于或等于92%、大于或等于95%、大于或等于98%、大于或等于99%或等于100%的单一异构体组成的化合物。

在本说明书的一方面,式(I)化合物或其形式以含量大于或等于90%、大于或等于92%、大于或等于95%、大于或等于98%、大于或等于99%或等于100%的基本上纯的(S)对映异构体形式存在。

在本说明书的一方面,式(I)化合物或其形式以含量大于或等于90%、大于或等于92%、大于或等于95%、大于或等于98%、大于或等于99%或等于100%的基本上纯的(R)对映异构体形式存在。

如本文所使用的,“外消旋体”是非“对映纯”的各种异构体的任何混合物,包括例如但不限于比例为约50/50、约60/40、约70/30或约80/20的混合物。

此外,本说明书包括所有几何和位置异构体。例如,如果式(I)化合物或其形式包含双键或稠环,则顺式和反式形式以及混合物都包含在本说明书的范围内。非对映异构体混合物可以根据它们的物理化学差异采用本领域技术人员熟知的方法(例如色谱法和/或分级结晶法)分离出它们单独的非对映异构体。对映异构体可以采用手性HPLC柱或本领域技术人员了解的其他色谱方法分离。对映异构体也可以通过与适当的旋光活性化合物(例如手性助剂,如手性醇或Mosher酸氯化物)反应,将对映异构体混合物转化为非对映异构体混合物,分离非对映异构体,并将各种非对映异构体转化(例如水解)为相应的纯对映异构体,从而得到分离。此外,一些式(I)化合物可以是阻转异构体(例如,取代联芳基),并且被认为是本说明书的一部分。

本发明化合物的所有立体异构体(例如几何异构体、旋光异构体等)(包括化合物的盐、溶剂化物、酯和前药以及前药的盐、溶剂化物和酯的立体异构体),例如由于各取代基上不对称碳原子而可能存在的那些立体异构体,包括(即使在不存在不对称碳的情况下也可能存在的)对映异构体形式、旋转异构体形式、阻转异构体和非对映异构体形式,以及位置异构体(例如,4-氮苯基和3-氮苯基)都涵盖在本发明的范围内。如上文所述,本文所述化合物的单一立体异构体可例如基本上不含其他异构体,或可存在于外消旋混合物中。

术语“盐”、“溶剂化物”、“酯”、“前药”等的使用旨在同样适用于即时化合物的对映异构体、立体异构体、旋转异构体、互变异构体、位置异构体、外消旋体或同位素体的盐、溶剂化物、酯和前药。

术语“同位素体”是指本文所述的富含同位素的化合物,其与本文所述的那些化合物相同,但一个或多个原子被原子质量或质量数与自然界中通常发现的原子质量或质量数不同的原子替代。可包含在本文所述化合物的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,例如2H、3H、13C、14C、15N、18O、17O、31P、32P、35S、18F、35Cl和36Cl,它们中的每一个也在本说明书的范围内。

本文所述的某些富含同位素的化合物(例如,用3H和14C标记的那些化合物)可用于化合物和/或底物组织分布测定。氚化(即3H)和碳-14(即14C)同位素由于易于制备和可检测,因此是特别优选的同位素。此外,以更重的同位素,如氘(即2H)进行的取代,因代谢更稳定而具有某种治疗优势(例如,延长体内半衰期或降低剂量要求),因此,在某些情况下可能是优先的。

化合物的用途

本文提供了治疗有需要的受试者的疾病的方法。如本文所使用的,术语“受试者”指的是任何动物,包括哺乳动物。例如,小鼠、大鼠、其他啮齿动物、兔子、狗、猫、猪、牛、羊、马、灵长类动物和人类。在一些方面,受试者是人类。在一些方面,所述方法包括向受试者施用治疗有效剂量的本文提供的化合物(例如,式(I)化合物)或其药学上可接受的盐。在具体方面,所述疾病是家族性自主神经功能障碍,这是一种与一个或多个前体-mRNA剪接缺陷有关的中枢和外周神经系统疾病。

本申请进一步提供治疗有需要的受试者的家族性自主神经功能障碍的方法,包括向受试者施用治疗有效剂量的本文提供的化合物(即,式(I)化合物)。

在本文提供的方法的一些方面,所述化合物选自式(I)化合物或其药学上可接受的盐。

在一些方面,改进IKBKAP基因前体-mRNA剪接的方法包括使基因(例如,在表达该基因的细胞或受试者中)与本文提供的化合物(例如,式(I)化合物)接触。

如本文所使用的,短语“治疗有效剂量”是指研究人员、兽医、医生或其他临床医生寻求在组织、系统、动物、个体或人类中引发生物或医学反应的活性化合物或药剂的剂量。在一些方面,向受试者或个体施用的化合物或其药学上可接受的盐的剂量是约1mg至约2g、约1mg至约1000mg、约1mg至约500mg、约1mg至约100mg、约1mg至50mg或约50mg至约500mg。

如本文所使用的,术语“治疗(treating)”或“治疗(treatment)”是指以下中的一种或多种:(1)预防疾病;例如,预防可能易患疾病、病症或失调但尚未经历或表现出所述疾病的病理学或症状学的个体的疾病、病症或失调;(2)抑制疾病;例如,抑制正在经历或表现出疾病、病症或失调的病理学或症状学的个体的疾病、病症或失调(即阻止病理学和/或症状学的进一步发展);(3)改善病情;例如,改善正在经历或表现出疾病、病症或失调的病理学或症状学的个体的疾病、病症或失调(即,逆转病理学和/或症状学),例如降低疾病的严重性或减少或减轻疾病的一种或多种症状。

本文还提供了在有需要的患者中增加IKBKAP(也称为ELP1)蛋白表达的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。例如,所述方法包括增加患者血清样品中的IKBKAP蛋白表达。本文还提供了在有需要的患者中增加IKBKAP蛋白表达的平均百分数的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。

本文还提供增加细胞(例如,离体或体内)中的IKBKAP蛋白表达的方法,所述方法包括使细胞与治疗有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物或其药学上可接受的盐)接触。在一些方面,所述方法是体外方法。在一些方面,所述方法是体内方法。在一些方面,在选自由肺细胞、肌肉细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肾细胞和神经细胞(例如坐骨神经细胞或三叉神经细胞)或它们的任何组合组成的组的细胞中,IKBKAP蛋白表达量增加。在其一些方面,血浆中的IKBKAP蛋白表达量增加。

本文还提供了在有需要的患者中增加IKBKAP蛋白水平的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。例如,所述方法包括增加患者血清样品中的IKBKAP蛋白水平。本文还提供了在有需要的患者中增加IKBKAP蛋白水平的平均百分数的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。

本文还提供增加细胞(例如,离体或体内)中的IKBKAP蛋白水平的方法,所述方法包括使细胞与治疗有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物或其药学上可接受的盐)接触。

在一些方面,所述方法是体外方法。在一些方面,所述方法是体内方法。在一些方面,在选自由肺细胞、肌肉细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肾细胞和神经细胞(例如坐骨神经细胞或三叉神经细胞)或它们的任何组合组成的组的细胞中,IKBKAP蛋白水平增加。在其一些方面,血浆中的IKBKAP蛋白水平增加。

本文还提供了在有需要的患者中增加全长IKBKAP mRNA的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。例如,所述方法包括增加患者血清样品中的全长IKBKAP mRNA的浓度。本文还提供了在有需要的患者中增加外显子包含物(inclusion)的平均百分数(即正确剪接或全长IKBKAP mRNA的百分数)的方法,所述方法包括向患者施用有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物,或其药学上可接受的盐)。

在一些方面,可以测定血清中的全长IKBKAP mRNA,例如,测定施用本文提供的化合物之前从患者获得的血液样品和施用本文提供的化合物之后从患者获得的血液样品中的的血清中的全长IKBKAP mRNA。在某些方面,从患者获得的血液样品在施用本文提供的化合物1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、14天、21天、28天和/或30天之后获得。参见,例如F.B.Axelrod et al.,Pediatr Res(2011)70(5):480-483;和R.S.Shetty etal.,Human Molecular Genetics(2011)20(21):4093-4101,这两篇文献均通过引用而整体并入本申请中。

本文进一步提供增加细胞中的全长IKBKAP mRNA的方法,所述方法包括使细胞与治疗有效剂量的本文提供的化合物(即式(I)化合物)接触。相对于缺乏本文提供的化合物的受试者细胞,治疗细胞中的全长IKBKAP mRNA的含量增加。增加细胞中的全长IKBKAPmRNA含量的方法可以通过使细胞与本文提供的化合物(即式(I)化合物或其药学上可接受的盐形式)在体外接触来进行,从而在体外增加细胞的全长IKBKAP mRNA的含量。这种增加全长IKBKAP mRNA含量的体外方法的用途包括但不限于,在筛选试验中的用途(例如,本文提供的化合物作为阳性对照或标准,与在增加全长IKBKAP mRNA含量方面的活性或效力未知的一种或多种化合物进行对比)。

在一些方面,在选自由肺细胞、肌肉细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肾细胞和神经细胞(例如坐骨神经细胞或三叉神经细胞)或它们的任何组合组成的组的细胞中,全长IKBKAP mRNA的含量增加。在其一些方面,血浆中的全长IKBKAP mRNA的含量增加。

增加细胞中的全长IKBKAP mRNA的方法可以例如通过在体内使细胞(例如肺细胞、肌肉细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肾细胞或神经细胞)与本文提供的化合物(即式(I)化合物或其药学上可接受的盐)接触,从而在体内增加受试者的全长IKBKAP mRNA的含量。通过使本文提供的化合物或其药学上可接受的盐形式以实现全长IKBKAP mRNA含量的增加的有效剂量存在于受试者体内来实现接触。这可以例如通过向受试者施用有效剂量的本文提供的化合物或其药学上可接受的盐形式来实现。这种增加全长IKBKAP mRNA含量的体内方法的用途包括但不限于,在治疗全长IKBKAP mRNA含量增加对其有益的疾病或病症的方法中的用途。

在其的一些方面,在选自由肺细胞、肌肉细胞、肝细胞、心脏细胞、脑细胞、肾细胞和神经细胞(例如坐骨神经细胞或三叉神经细胞)或它们的任何组合组成的组的细胞中,例如在患有本文提供的疾病或失调(例如,家族性自主神经功能障碍)的患者细胞中,全长IKBKAP mRNA的含量增加。所述方法优选通过向患有家族性自主神经功能障碍的受试者施用有效剂量的本文提供的化合物或其药学上可接受的盐形式来进行。

在一些方面,本文提供的一种或多种化合物可以与至少一种其它药剂联合向有需要的受试者施用。在一些实施例中,所述其它药剂是本文提供的化合物(例如,式(I)化合物)。

与本申请的化合物联合用于治疗本文提供的疾病的合适的其它药剂的其它实例包括但不限于,抗氧化剂、抗炎剂、类固醇、免疫抑制剂或其他试剂,例如治疗性抗体。在一些方面,本文提供的化合物可以与至少一种其它药剂联合向有需要的受试者施用,用于治疗家族性自主神经功能障碍。在一些实施例中,其它药剂是磷脂酰丝氨酸。

当用作治疗剂时,本文提供的化合物可以以药物组合物的形式施用;因此,本文所述的方法可包括施用药物组合物。这些组合物可如本文或别处所述制备,并可通过多种途径施用,这取决于是否需要局部或全身治疗以及待治疗的区域。施用可以是肺部施用(例如,通过吸入或吹入粉末或气雾剂,包括通过雾化器;气管内或鼻内)、口服或肠胃外施用。肠胃外施用可包括但不限于静脉内、动脉内、皮下、腹膜内、肌内注射或输注;或颅内(例如鞘内、眼内或心室内)施用。肠胃外施用可以是单次推注剂量的形式,或者可以是,例如,通过连续灌注泵。常规的药物载体、水性、粉末或油性基质、增稠剂等可能是必要的或希望的。在一些方面,本文提供的化合物适合口服和肠胃外施用。在一些方面,本文提供的化合物适合口服。在一些方面,本文提供的化合物适合肠胃外施用。在一些方面,本文提供的化合物适合静脉施用。在一些方面,本文提供的化合物适合透皮施用(例如,采用贴片或微型针施用)。局部施用的药物组合物可以包括透皮贴剂(例如,正常的或电刺激的)、软膏、洗剂、乳膏、凝胶、滴剂、栓剂、喷雾剂、液体和粉末。常规的药物载体、水性、粉末或油性基质、增稠剂等可能是必要的或希望的。

还提供药物组合物,其含有作为活性成分的本文提供的化合物(例如式(I)化合物或其药学上可接受的盐)以及一种或多种药学上可接受的载体(赋形剂)。在制备本文提供的组合物时,活性成分通常与赋形剂混合、采用赋形剂稀释或封装在例如胶囊、小袋、纸或其他容器形式的此类载体中。当赋形剂用作稀释剂时,它可以是固体、半固体或液体材料,用作活性成分的溶媒、载体或介质。因此,组合物可以是片剂、丸剂、粉剂、锭剂、袋剂、扁囊剂、酏剂、混悬剂、乳剂、溶液、糖浆、气雾剂(作为固体或在液体介质中)、软膏、软和硬明胶胶囊、栓剂、无菌注射液和无菌包装粉剂的形式。

合适的赋形剂的一些实例包括但不限于乳糖、葡萄糖、蔗糖、山梨糖醇、甘露糖醇、淀粉、阿拉伯树胶、磷酸钙、藻酸盐、黄蓍胶、明胶、硅酸钙、微晶纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素、水、糖浆和甲基纤维素。制剂可另外包括但不限于润滑剂,例如滑石、硬脂酸镁和矿物油;润湿剂;乳化剂和悬浮剂;防腐剂,例如羟基苯甲酸甲酯和羟基苯甲酸丙酯;甜味剂;调味剂或它们的组合。

活性化合物可以在很宽的剂量范围内有效,并且通常以药学有效剂量施用。应当理解的是,化合物的施用剂量和施用时间表通常由医生根据相关情况确定,包括要治疗的病症、选择的施用途径、实际施用的化合物、个体受试者的年龄、体重和反应、受试者症状的严重程度等。

本文还提供包含本文提供的化合物,更特别是式(I)化合物或其药学上可接受的盐的试剂盒。在一些实施例中,试剂盒可包含一种或多种递送系统,例如用于本文提供的化合物或其药学上可接受的盐,以及试剂盒的使用说明(例如,治疗受试者的说明书)。在一些实施例中,试剂盒可包含本文提供的化合物或其药学上可接受的盐及一种或多种本文提供的其它试剂。

在一些方面,试剂盒可以包含一种或多种本文提供的化合物或其它药剂,或其药学上可接受的盐,以及指示将内容物向对治疗家族性自主神经功能障碍的标准护理剂或佐剂具有耐药性的受试者施用的标签。在一些方面,其它药剂是磷脂酰丝氨酸。另一方面,试剂盒可包含本文提供的化合物或其药学上可接受的盐,以及指示将内容物向细胞表达异常IKBKAP前体-mRNA剪接的受试者施用的标签。在另一方面,试剂盒可以包含一种或多种本文提供的化合物或其它药剂,或其药学上可接受的盐,以及指示将内容物向患有由异常前体-mRNA剪接引起的中枢神经系统或外周神经系统疾病的受试者施用的标签。

另一方面,试剂盒可以包含一种或多种本文提供的化合物或其它药剂,或其药学上可接受的盐,以及指示将内容物向患有家族性自主神经功能障碍的受试者施用的标签。在一些方面,试剂盒可以包含一种或多种本文提供的化合物,或其药学上可接受的盐,以及指示将内容物与本文提供的一种或多种其它药剂一起施用的标签。

另一方面,对于式(I)化合物或其形式观察到的浓度-生物学效应关系,表明目标血浆浓度范围是约0.001μg·hr/mL至约50μg·hr/mL,约0.01μg·hr/mL至约20μg·hr/mL,约0.05μg·hr/mL至约10μg·hr/mL,或约0.1μg·hr/mL至约5μg·hr/mL。为了达到这样的血浆浓度,本文所述化合物可以以变化的剂量施用,例如但不限于1.0ng到10,000mg。

一方面,可依据受试者或患者的特定因素施用实现有效的目标血浆浓度的施用剂量,其中以体重为基础的施用剂量可以在约0.001mg/kg/天至约3500mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约3000mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约2500mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约2000mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约1500mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约1000mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约500mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约250mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约200mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约150mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约100mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约75mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约50mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约25mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约10mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约5mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约1mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约0.5mg/kg/天,或约0.001mg/kg/天至约0.1mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约3500mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约3000mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约2500mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约2000mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约1500mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约1000mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约500mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约250mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约200mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约150mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约100mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约75mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约50mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约25mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约10mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约5mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约1mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约0.5mg/kg/天,或约0.01mg/kg/天至约0.1mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约3500mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约3000mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约2500mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约2000mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约1500mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约1000mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约500mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约250mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约200mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约150mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约100mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约75mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约50mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约25mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约10mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约5mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约1mg/kg/天,或约0.1mg/kg/天至约0.5mg/kg/天的范围内。

根据与受试者相关的因素,可以通过属于临床医生或本领域技术人员的技能和判断范围内的常规实验确定给定受试者的有效剂量。可以调整剂量和施用以提供足够水平的活性剂或维持所需的效果。可以考虑的因素包括基因筛查、疾病状况的严重程度、疾病进展状况、受试者的总体健康状况、种族、年龄、体重、性别、饮食、施用时间和施用频率、药物组合、反应敏感性、其他治疗经验以及对治疗的耐受性/反应。

实现有效目标血浆浓度的施用剂量可以每天口服施用一次(大约每24小时一次;即“q.d.”)、两次(大约每12小时一次;即“b.i.d.”或“q.12h”)、三次(大约8小时一次;即“t.i.d.”或“q.8h”)或四次(大约6小时一次;即“q.d.s.”、“q.i.d.”或“q.6h”)。

在某些方面,对于体重在约40至约200kg范围内的患者或受试者,实现有效目标血浆浓度的施用剂量也可以以单次、分次或连续剂量施用(对于体重高于或低于此范围的患者或受试者,特别是40kg以下的儿童,此剂量可以进行调整)。典型成年受试者的中值体重预期是在大约70kg范围内。根据特定制剂的半衰期和清除率,长效药物组合物可以每2、3或4天施用一次、每周施用一次或每两周施用一次。

本文所述的化合物和组合物可以通过本领域已知的任何药物递送途径向受试者施用。非限制性实例包括口服、眼部、直肠、颊、局部、鼻部、舌下、经皮、皮下、肌肉内、静脉内(推注和输注)、脑内和肺部施用途径。

另一方面,可根据本文所述配制递送的剂型,调整施用剂量为约0.02、0.025、0.03、0.05、0.06、0.075、0.08、0.09、0.10、0.20、0.25、0.30、0.50、0.60、0.75、0.80、0.90、1.0、1.10、1.20、1.25、1.50、1.75、2.0、3.0、5.0、10、20、30、40、50、100、150、200、250、300、400、500、1000、1500、2000、2500、3000或4000mg/天。

对于任何化合物,可以在细胞培养试验或相关动物模型,例如小鼠、豚鼠、黑猩猩、狨猴或绢毛猴动物模型中初步估计有效剂量。相关动物模型也可用于确定合适的浓度范围和施用途径。然后可以使用此类信息来确定人体的有用剂量和施用途径。治疗效果和毒性可以通过细胞培养物或实验动物的标准药物程序确定,例如ED50(在50%群体中治疗有效的剂量)和LD50(对50%群体致死的剂量)。治疗效果和毒性作用之间的剂量比是治疗指数,可以表示为比例LD50/ED50。在某些方面,有效剂量是实现较大治疗指数的剂量。在进一步的具体方面,所述剂量在包括ED50的毒性很小或没有毒性的循环浓度范围内。剂量可在此范围内变化,这取决于所采用的剂型、患者的敏感性和施用途径。

包括在本发明范围内的另一方面是本文所述化合物的体内代谢产物的用途。此类产物可以由例如所施用化合物主要因酶促过程导致的氧化、还原、水解、酰胺化、酯化等产生。因此,本说明书包括由包含将本文所述化合物与哺乳动物组织或哺乳动物接触足以产生其代谢产物的一段时间的工艺而产生的化合物的用途。

此类产物通常通过以下方法鉴定:制备本文所述化合物的放射性标记同位素体(例如,14C或3H),将放射性标记化合物以可检测的剂量(例如,大于约0.5mg/kg)向哺乳动物施用,例如大鼠、小鼠、豚鼠、狗、猴或人,允许足够的时间进行代谢(通常约30秒至约30小时),并鉴定来自尿液、胆汁、血液或其他生物样品的代谢转化产物。转化产物因富含同位素而被“放射性标记”,因此很容易分离(其他的采用能够与代谢物中存活表位结合的抗体进行分离)。代谢物结构以常规方式测定,例如通过MS或NMR分析。通常,代谢物的分析可以以与本领域技术人员熟知的常规药物代谢研究相同的方式进行。转化产物,只要它们在体内没有发现,即使它们本身不具有任何生物活性,也可用于本文所述化合物治疗剂量的诊断测定。

化合物的制备

一般合成方法

正如本文所公开,制备本文所述式(I)化合物或其形式的一般方法可采用众所周知的标准合成方法。许多起始材料可以商购,或者当无法获得时,可以采用本领域技术人员已知的技术通过下面描述的路线制备。本文提供的合成方案包括多个反应步骤,每个反应步骤旨在独立进行,并且可以在有或没有任何先前步骤或后续步骤的情况下进行。换句话说,设想了本文单独提供的合成方案的各反应步骤中的每一个反应步骤。

方案A:

式(I)化合物可以如下述方案A中所述制备。

在碱(例如三乙胺等)存在下,在合适的溶剂(例如DCM等)中,在适当的温度(如室温等)下,采用任选取代的3-氯-3-氧代丙酸酯处理具有任选的R4取代基的化合物A1,得到化合物A2。在碱(如乙醇钠等)的存在下,在合适的溶剂(如乙醇等)中,在适当的温度(如回流温度等)下,将化合物A2环化为化合物A3。A3在碱(如NaOH等)的水溶液中水解,得到化合物A4,在适当的温度下,采用氯化试剂(如POCl3等)处理化合物A4,得到化合物A5。

在碱(例如TEA等)存在下,采用合适的溶剂(例如DMSO等),在适当的温度下,采用任选取代的芳基/杂芳基甲胺处理化合物A5,得到化合物A6。在催化剂DMAP存在下,采用Boc2O保护A6,得到A7。在强碱(如LDA等)存在下,在适当的溶剂(如THF等)中,在适当的温度(如-78℃)下,化合物A7可以与相应氨基醇制备的任选取代的环状氨基磺酸酯(sulfamidate)反应,得到A8。采用酸(例如二恶烷或TFA等中的HCl)处理完成去保护,得到化合物A8。

方案B:

式(I)化合物可以如下述方案B中所述制备。

在强碱(如LDA等)存在下,在合适的溶剂(如THF等)中,在适当的温度(如-78℃)下,将化合物B1与碘反应,得到B2。在催化剂(例如Pd(dppf)Cl2等)的存在下,在合适的溶剂(如THF等)中,在适当的温度下,化合物B2可以与任选取代且适当保护的含氨基的烷基/环烷基锌试剂通过Negeshi反应转化为化合物B3。采用酸(例如二恶烷或TFA等中的HCl)处理B3,得到化合物B4。

方案C:

式(I)化合物可以如下述方案C中所述制备。

在适当的温度(例如-78℃)下,采用强碱(例如LDA等)处理,然后在合适的溶剂(例如THF等)中用DMF处理,可以将化合物C1转化为相应的醛C2。在路易斯酸(例如CuSO4等)存在下,在合适的溶剂(例如DCE等)中,在适当的温度下,化合物C2可以与埃尔曼亚磺酰胺(Ellman’s sulfinamide)缩合,得到化合物C3。C3与格氏试剂在合适的溶剂(例如THF等)中反应,得到化合物C4,化合物C4可以进一步用酸(例如二恶烷或TFA等中的HCl)去保护,得到化合物C5。

具体合成实例

为了更详细地描述和帮助理解,提供以下非限制性实例,从而更全面地阐明本文所述化合物的范围,并且不应被解释为具体限制其范围。本文所述化合物现在已知的或以后开发的这些变化,将在本领域技术人员确信的范围内,被认为属于本文所述和下文权利要求保护的化合物的范围内。这些实例说明了某些化合物的制备。本领域技术人员将理解的是,这些实例中描述的技术代表如本领域普通技术人员所描述的在合成实践中发挥很好作用的技术,并且因此构成其实践的优选方式。然而,本领域技术人员应当理解的是,根据本发明,可以对公开的具体方法进行许多改变,并且仍然获得类似或相似的结果,但并不背离本说明书的精神和范围。

除了在以下具体化合物的实例中,除非另外说明,否则说明书和权利要求中使用的所有表示成分数量、反应条件、实验数据等的数值应理解为由术语“约”修饰。因此,所有这些数字代表近似值,它们可根据通过反应获得的希望性质或作为可变实验条件的结果而变化。因此,在预期的实验重现性范围内,所得数据背景中的术语“约”是指所提供数据的范围,其可以根据标准偏差在平均值左右变化。同样,对于提供的实验结果,所得数据可以向上或向下舍入以一致地呈现数据,而不会丢失有效数字。至少,并且不是试图将相当物原则的应用限制在权利要求的范围内,每个数字参数应根据本领域技术人员使用的有效位数和舍入方法进行解释。

虽然阐述本说明书的较宽范围的数值范围和参数是近似值,但下述实例中提供的数值尽可能精确地进行了报告。然而,任何数值都固有地含有某些各自试验测定标准偏差必定产生的误差。

化合物实例

除非另外说明,否则正如在上文及整个发明中所示,以下缩写应被理解为具有以下含义:

中间体1

(S)-4-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-1,2,3-氧杂噻唑烷(oxathiazolidine)-3-羧酸叔丁酯2,2-二氧化物

步骤1:N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-丝氨酸酯

在0℃下,向(叔丁氧基羰基)-L-丝氨酸甲酯(25g,114.0mmol)的DCM(250mL)溶液中加入咪唑(62.1g,912mmol)和TBSCl(32g,205.9mmol)。将混合物搅拌2小时,然后倒入到DCM(300mL)和水(200mL)的混合物中。分离有机相,用水(2x100mL)和盐水(1x100mL)洗涤,在Na2SO4上干燥并过滤。真空浓缩滤液,得到呈油状的N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-丝氨酸甲酯(35.5g,收率93.3%)。LC-MS:m/z:356.2[M+Na]+

步骤2:(R)-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-羟基丙-2-基)氨基甲酸叔丁

在0℃下,向N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-丝氨酸甲酯(35.5g,106mmol)的THF(200mL)和EtOH(100mL)溶液中加入CaCl2(23.6g,213mmol),然后加入NaBH4(16.1g,426mmol)。将混合物在0℃下搅拌0.5小时,在室温下搅拌16小时,然后倒入到EtOAc(200mL)和水(150mL)的混合物中。分离有机相,用水(2x200mL)和盐水(1x150mL)洗涤,在无水Na2SO4上干燥并过滤。真空浓缩滤液,得到呈白色固体状的(R)-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-羟基丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(30g,收率92.3%)。LC-MS:m/z:328.2[M+Na]+;RT=1.93min。

步骤3:(4S)-4-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧 酸叔丁酯2-氧化物

在0℃下,向咪唑(54g,785.3mmol)的DCM(300mL)溶液中加入SOCl2(12.9mL,176.0mmol)。将混合物在0℃搅拌1小时,加入(R)-(1-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-3-羟基丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(30g,98.2mmol)。将混合物在0℃搅拌1小时,然后倒入到EtOAc(500mL)和水(400mL)的混合物中。分离有机相,用水(2x800mL)和盐水(800mL)洗涤,然后在Na2SO4上干燥并过滤。真空浓缩滤液,得到呈白色固体状的(4S)-4-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2-氧化物(32.6g,收率94.4%)。LC-MS:m/z:374.1[M+Na]+;RT=2.08min。

步骤4:(4S)-4-[[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基甲基]-2,2-二氧代-氧杂噻唑 烷-3-羧酸叔丁酯

在室温下,向(4S)-4-(((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)甲基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2-氧化物(32.6g,92.7mmol)的水(300mL)和DCM(300mL)溶液中加入NaIO4(31.8g,148.0mmol)和RuCl3(1.94g,9.3mmol)。将混合物搅拌过夜,然后用DCM(3×500mL)萃取。合并的有机相用饱和NaHSO3(水溶液,500mL)洗涤,无水Na2SO4干燥并过滤。将滤液真空浓缩。残余物采用快速色谱法(二氧化硅)纯化,用DCM/己烷(50-100%)洗脱,得到呈白色固体状的(4S)-4-[[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基甲基]-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(18g,52.8%收率)。LC-MS:m/z:390.2[M+Na]+;RT=2.05min;1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 4.53-4.51(m,2H),4.2(s,1H),3.76-3.69(m,2H),1.46(s,9H),0.81(s,9H),0.00(s,6H)。

中间体2

(S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2,2-二氧化物

步骤1:N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-高丝氨酸

向(叔丁氧基羰基)-L-高丝氨酸(21g,96.0mmol)和咪唑(52g,770mmol)的DCM(210mL)溶液中,加入TBSCl(23g,153mmol)。将混合物在室温下搅拌5小时。然后加入水(100mL),分离有机相,用盐水(80mL)洗涤,在无水Na2SO4上干燥并真空浓缩,得到呈无色油状的N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-高丝氨酸(31.9g,99%收率)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δppm 5.85(d,1H),4.22(m,1H),3.69-3.75(m,2H),1.93-2.01(m,2H),1.36(s,9H),0.83(s,9H),0.00(s,6H)。

步骤2:(S)-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-羟基丁-2-基)氨基甲酸叔丁

在0℃下,向N-(叔丁氧基羰基)-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-L-高丝氨酸(31.9g,96mmol)和N-甲基吗啉(10.7g,105mmol)的THF(300mL)溶液中加入氯甲酸异丙酯(12.8g,105mmol)。将混合物在0℃搅拌1小时,然后过滤。将滤液冷却至0℃,向其中缓慢加入NaBH4的水溶液(4g,105.0mmol)。将混合物在0℃搅拌2小时,然后用水(100mL)稀释。分离有机相,用盐水(2x100mL)洗涤,在Na2SO4上干燥并过滤。真空浓缩滤液,得到呈无色油状的(S)-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-羟基丁-2-基)氨基甲酸叔丁酯(20g,收率57%)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δppm 5.41(s,1H),3.75-3.79(m,1H),3.66(t,1H),3.55-3.58(m,2H),1.69-1.99(m,2H),1.85-1.66(m,2H),1.36(s,9H),0.83(s,9H),0.00(s,6H)。

步骤3:(4S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3- 羧酸叔丁酯2-氧化物

在0℃下,向咪唑(22g,313mmol)的DCM(200mL)溶液中加入SOCl2(13.5g,113mmol)。将混合物在室温下搅拌1小时,冷却至0℃,加入(S)-(4-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-1-羟基丁-2-基)氨基甲酸叔丁酯(20g,62.7mmol)的DCM(100mL)溶液。将混合物在室温搅拌2小时,然后用水(100mL)稀释。分离有机相,用盐水(100mL)洗涤,在Na2SO4上干燥并过滤。真空浓缩滤液,得到呈无色油状的(4S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2-氧化物(23g,收率99%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 3.83-4.05(m,1H),3.62-3.69(m,2H),3.53-3.59(m,2H),1.60-1.78(m,2H),1.36(d,9H),0.81(d,9H),0.02(d,6H)。

步骤4:(S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3- 羧酸叔丁酯2,2-二氧化物

向(4S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2-氧化物(23g,62.7mmol)和NaIO4(31g,144mmol)的混合物的DCM(300mL)和水(310mL)的溶液中加入RuCl3(0.83g,4mmol)。将反应在室温下搅拌5小时。分离有机相,采用10%NaHSO3(4×150mL)和盐水(150mL)洗涤,在Na2SO4上干燥并过滤。将滤液真空浓缩。残余物以石油醚和乙酸乙酯(20:1)为洗脱剂,采用硅胶柱色谱法纯化,得到呈白色固体状的(S)-4-(2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2,2-二氧化物(5g,收率21%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 4.95(q,2H),4.30-3.35(m,1H),3.64-3.77(m,2H),1.96-2.11(m,2H),1.52(s,9H),0.83(s,9H),0.00(s,6H)。

中间体3

(R)-4-(氟甲基)-1,2,3-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯2,2-二氧化物

步骤1:(4R)-4-(苄氧基甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯

在-78℃下,向咪唑(4.5g,4.37mL,66.1mmol,3.80eq.)的DCM(160mL)溶液中加入亚硫酰氯(2.290g,1.40mL,19.2mmol,1.10eq.),然后加入N,N-二异丙基乙胺(4.450g,6.00mL,34.1mmol,1.96eq.)。30分钟后,在-78℃下,在30分钟内加入N-[(1S)-1-(苄氧基甲基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(4.894g,17.39mmol,1.00eq.)的DCM(20mL)溶液。将混合物升温至室温,并搅拌过夜。反应用水(50mL)淬灭。分离有机相,水层用DCM(2x50mL)萃取。合并的有机层用水(50mL)和盐水(100mL)洗涤,用硫酸钠干燥,然后浓缩,得到呈油状的(4R)-4-(苄氧基甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(5.9g,18.0mmol,1.04eq.),无需纯化即可使用。

步骤2:(4R)-4-(苄氧基甲基)-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯

在0℃下,向(4R)-4-(苄氧基甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(5.9g,18.0mmol,1.00eq.)的CH3CN(160mL)和水(100mL)的溶液中加入NaIO4(6.0g,28.0mmol,1.55eq.),然后加入RuCl3(16mg,0.077mmol,0.0043eq.)。将混合物在0℃下搅拌45分钟,然后用水(50mL)稀释。混合物采用乙醚(2x80mL)萃取。合并的有机萃取液依次用水(50mL)和盐水(100mL)洗涤,并用硫酸钠干燥。在减压下脱除挥发性物质,残余物通过快速柱色谱法(120g,0-100%DCM/己烷)纯化,得到呈无色油状的(4R)-4-(苄氧基甲基)-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(5.228g,收率85%),采用己烷研磨后在室温下静置固化。

步骤3:N-[(1R)-1-(苄氧基甲基)-2-氟-乙基]氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向(4R)-4-(苄氧基甲基)-2,2-二氧代-氧杂唑烷-3-羧酸叔丁酯(5.228g,15.22mmol,1.00eq.)的THF(70mL)溶液中,加入TBAF(1M)的THF(18.0mL,18.0mmol,1.18eq.)溶液。将混合物在0℃搅拌1小时,然后在室温搅拌过夜。反应用柠檬酸水溶液(1N,~20mL)淬灭。混合物采用EtOAc(2x80mL)萃取。将合并的有机相依次用水和盐水(~50mL)洗涤。在减压下移除挥发性物质,残余物通过快速柱色谱法(0-30%EtOAc的己烷溶液(含10%DCM)纯化,得到呈无色油状的N-[(1R)-1-(苄氧基甲基)-2-氟-乙基]氨基甲酸叔丁酯(3.250g,收率75%)。

步骤4:N-[(1R)-1-(氟甲基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯

在室温下,向N-[(1R)-1-(苄氧基甲基)-2-氟-乙基]氨基甲酸叔丁酯(2.505g,8.84mmol,1.00eq.)的EtOAc(30mL)溶液中,加入128mg10%钯碳(德固赛型)(~5%质量)。将烧瓶抽真空,并在三个循环中用氢气球(1atm)回充。将所得混合物在室温搅拌3小时,然后过滤和蒸发。浓缩滤液,得到N-[(1R)-1-(氟甲基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.725g,定量)。

步骤5:(4R)-4-(氟甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯

在-78℃下,向咪唑(3.0g,2.91mL,44.07mmol,3.73eq.)的DCM(110mL)溶液中加入亚硫酰氯(1.00mL,13.73mmol,1.16eq.),然后加入N,N-二异丙基乙胺(3.90mL,22.2mmol,1.87eq.)。将反应在-78℃下搅拌30分钟,在-78℃下,在30分钟内加入N-[(1R)-1-(氟甲基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(2.285g,11.83mmol,1.00eq.)的DCM(15mL)溶液。将混合物升温至室温,并在室温搅拌过夜。反应用水(50mL)淬灭。分离有机层,用水(50mL)和盐水(100mL)洗涤,用硫酸钠干燥并浓缩,得到呈油状的(4R)-4-(氟甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(2.830g),其无需进一步纯化即可用于下一步。

步骤6:(4R)-4-(氟甲基)-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯

在0℃下,向(4R)-4-(氟甲基)-2-氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(2.830g,11.8mmol,1.00eq.)的混合溶剂CH3CN(100mL)和水(60mL)的溶液中,加入NaIO4(3.940g,18.4mmol,1.55eq.),然后加入RuCl3(20mg,0.096mmol,0.0081eq.)。将混合物在0℃搅拌45min,然后用水(50mL)稀释,并用乙醚(2x80mL)萃取。将合并的有机相用水(50mL)和盐水(100mL)洗涤,用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用快速柱色谱法(120g,0-100%DCM/己烷)纯化,得到(4R)-4-(氟甲基)-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(2384mg,收率78.9%)。1HNMR(400MHz,CDCl3)δppm 4.47-4.74(m,5H),1.56(s,9H)。

中间体4

3-溴-5,7-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶

步骤1:3-氨基-4-溴噻吩-2-羧酸甲酯

在25℃下,向3-氨基噻吩-2-羧酸甲酯(40.0g,255.0mmol)的AcOH(1000mL)溶液中加入Br2(80.2g,510.0mmol)。将混合物在65℃搅拌12小时,然后冷却至室温。然后,将混合物倒入水(2000mL)中,过滤悬浮液。收集滤饼并真空干燥,然后采用10%EtOAc的石油醚溶液洗脱,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的3-氨基-4-溴噻吩-2-羧酸甲酯(30.0g,收率50.0%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.29(s,1H),5.64(m,2H),3.84(s,3H)。

步骤2:4-溴-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯

在0℃下,向3-氨基-4-溴噻吩-2-羧酸甲酯(30.0g,128mmol)的DCM(500mL)溶液中加入三乙胺(16.8g,166mmol)和3-氯-3-氧代丙酸乙酯(25.0g,166mmol)。将混合物在25℃下搅拌3小时。混合物用冰水(1.5L)淬灭,并用DCM(3×500mL)萃取。将合并的有机层在Na2SO4上干燥,并过滤。将滤液浓缩,得到呈棕色固体状的4-溴-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯(40.0g,收率90.0%),其无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS:m/z:350.0[M+H]+;RT=1.59min。

步骤3:3-溴-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯

在0℃下,向4-溴-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯(35.0g,100mmol)的乙醇(500mL)溶液中加入乙醇钠(10.0g,166mmol)。将混合物在100℃搅拌12h,然后冷却到室温。过滤混合物。将滤饼用乙酸乙酯(100mL)洗涤并真空干燥,得到呈棕色固体状的3-溴-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯(33.0g,收率95.0%),其无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS:m/z:317.6[M+H]+;RT=1.53min。

步骤4:3-溴噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮

在0℃下,向3-溴-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯(30.0g,94.6mmol)的水(1000mL)溶液中加入氢氧化钠(7.60g,189mmol)。将混合物在110℃搅拌12h,然后冷却到室温。采用HCl(10N)将pH值调节至pH=6,并将混合物过滤。收集滤饼并真空干燥,得到呈棕色固体状的3-溴噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮(20.0g,收率86.0%),其无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS:m/z:245.9[M+H]+;RT=1.35min。

步骤5:3-溴-5,7-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶

向POCl3(60mL)中加入3-溴噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮(20.0g,81.6mmol)。将混合物搅拌回流12小时,然后冷却到室温,用冰水(1.5L)淬灭,并用乙酸乙酯(3×500mL)萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,并过滤。将滤液浓缩得到残余物。残余物采用石油醚和乙酸乙酯(5:1)为洗脱剂,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈白色固体状的3-溴-5,7-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶(20.0g,收率87.0%)。1H NMR 400MHz(DMSO-d6)δppm 8.58(s,1H),7.99(s,1H)。

中间体5

3,5,7-三氯-噻吩并[3,2-b]吡啶

步骤1:3-乙酰氨基噻吩-2-羧酸甲酯

在室温下,向Ac2O(300mL)中加入3-氨基噻吩-2-羧酸甲酯(80g,508.9mmol),并将混合物在室温下搅拌过夜。反应采用MeOH(800mL)淬灭,将混合物在室温下搅拌30min。真空移除溶剂,残余物采用饱和NaHCO3水溶液中和至pH=9~10。混合物采用乙酸乙酯(3x400mL)萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,并过滤。将滤液真空浓缩,得到呈灰白色固体状的3-乙酰氨基噻吩-2-羧酸甲酯(96g,收率94.7%)。LC-MS:m/z:200.1[M+H]+;RT=1.63min。

步骤2:3-乙酰氨基-4,5-二氯噻吩-2-羧酸甲酯

向3-乙酰氨基噻吩-2-羧酸甲酯(96g,482.6mmol)的CHCl3(500mL)溶液中,滴加SO2Cl2(96mL,1206.1mmol)。将混合物在75℃搅拌过夜,冷却至室温,并真空浓缩得到固体,将所得固体与乙醚一起研磨,得到呈灰白色固体状的3-乙酰氨基-4,5-二氯噻吩-2-羧酸甲酯(103.6g,收率80.2%)。1H NMR 400MHz(CDCl3)δppm 8.24(s,1H),3.87-3.90(m,3H),2.23(s,3H)。

步骤3:3-乙酰氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯

向3-乙酰氨基-4,5-二氯噻吩-2-羧酸甲酯(103.5g,386.0mmol)的H2O和HOAc(3:1(v/v),800mL)溶液中加入Zn粉(100.9g,1544.2mmol)。将混合物在100℃下搅拌过夜。冷却到室温后,过滤混合物。滤液采用乙酸乙酯(3x1000 mL)萃取。将合并的有机层用水和盐水洗涤,用无水Na2SO4干燥并真空蒸发,得到呈灰白色固体状的3-乙酰氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯(72.2g,收率80.1%)。1H NMR 400MHz(CDCl3)δppm 7.36(s,1H),7.26(s,1H),3.87-3.88(m,3H),2.23(s,3H)。

步骤4:3-氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯

将3-乙酰氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯(70.0g,299.5mmol)在MeOH和浓HCl(1:1(v/v),300mL)中的混合物在110℃下搅拌过夜,然后冷却至室温并真空浓缩。将所得固体溶解在水(200mL)中,并用NaHCO3水溶液中和。混合物采用乙酸乙酯(3x300mL)萃取。将合并的有机层用无水Na2SO4干燥,并浓缩。残余物采用石油醚/乙酸乙酯(8:1)为洗脱剂,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈灰白色固体状的3-氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯(47.1g,收率82.2%)。LC-MS:m/z:192.0[M+H]+;RT=1.70min。

步骤5:4-氯-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯

在0℃下,向3-氨基-4-氯噻吩-2-羧酸甲酯(45.0g,234.8mmol)的DCM(300mL)溶液中加入Et3N(47.5g,469.7mmol),然后逐滴加入3-氯-3-氧代丙酸乙酯(53.1g,352.3mmol)。将混合物在室温搅拌过夜,然后用水(2x300mL)洗涤。有机层用Na2SO4干燥,并真空浓缩。残余物采用石油醚/乙酸乙酯(1:1)为洗脱剂,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈灰白色固体状的4-氯-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯(41.8g,收率58.3%)。LC-MS:m/z:306.0[M+H]+;RT=1.55min;1H NMR 400MHz(CDCl3)δppm 10.12(s,1H),8.01(s,1H),4.11-4.13(m,2H),3.79(s,3H),3.48(s,2H),1.19-1.22(m,3H)。

步骤6:3-氯-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯

向4-氯-3-(3-乙氧基-3-氧代丙酰胺)噻吩-2-羧酸甲酯(40.0g,130.8mmol)的EtOH(300mL)溶液中加入NaOEt(9.0g,130.8mmol)。将混合物在85℃搅拌过夜,然后冷却至室温。将产物过滤,得到呈灰白色固体状的3-氯-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯(34.3g,收率95.8%)。LC-MS:m/z:274.0[M+H]+;RT=1.56min;1H NMR400MHz(CDCl3)δppm 7.55(s,1H),4.07-4.09(m,2H),3.44-3.46(m,1H),1.18-1.21(m,3H),1.06-1.08(m,1H)。

步骤7:3-乙基氯噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮

将3-氯-5,7-二氧代-4,5,6,7-四氢噻吩并[3,2-b]吡啶-6-羧酸乙酯(34.3g,125.2mmol)加入到NaOH(10.0g,250.4mmol)的H2O(200毫升)溶液中。将混合物在105℃下搅拌过夜,然后冷却到室温。采用浓HCl将pH调节到~6-7。过滤收集滤饼,并真空干燥,得到呈灰白色固体状的3-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮(22.3g,收率88.3%)。LC-MS:m/z:202.0[M+H]+;RT=1.34min。

步骤8:3,5,7-三氯噻吩并[3,2-b]吡啶

将3-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-5,7(4H,6H)-二酮(22.0g,109.1mmol)和N,N-二甲基苯胺(6.6g,0.5eq,54.5mmol)加入到POCl3(150mL)中。将混合物在110℃下搅拌过夜,然后冷却到室温。真空移除过量的POCl3,将固体倒入到冰水(100mL)中。过滤得到白色固体,真空干燥,并采用石油醚和乙酸乙酯(5:1),通过硅胶柱色谱法进一步纯化,得到呈灰白色固体状的3,5,7-三氯噻吩并[3,2-b]吡啶(18.7g,收率72.1%)。LC-MS:m/z:237.9,239.9,241.9[M+H]+;RT=2.01min;1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 8.49(s,1H),7.99(s,1H)。

中间体6

(5-氯-2-碘-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在-78℃下,向根据实例2程序制备的(5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(410mg,1.08mmol,1.0eq.)的THF(3mL)溶液中,加入LDA(2.0M THF溶液,0.60mL,1.1eq.)。搅拌15分钟后,滴加碘(288mg,1.14mmol,1.05eq.)的THF(2mL)溶液,并继续搅拌1h。反应通过加入EtOAc和NH4Cl(饱和水溶液)淬灭,并升温至室温。有机层用硫代硫酸钠溶液、水和盐水洗涤,用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用0-15%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(5-氯-2-碘-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(436mg,收率80%)。MS m/z 505.5,507.5[M+H]+

实例1(化合物2)

5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

将5,7-二氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶(201mg,0.922mmol,1.00eq.)和2-呋喃基甲胺(895mg,0.81mL,9.22mmol,10.0eq.)在DMSO(0.8mL)中的混合物在100℃下搅拌24h。将混合物冷却,用乙酸乙酯稀释,用水和盐水洗涤,干燥并蒸发。残余物采用乙酸乙酯和己烷在硅胶柱上纯化,得到5-氯-N-(2-呋喃基甲基)-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(230mg,收率90%)。MS m/z 279.1,281.1[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.44(d,J=1.2Hz,1H),7.26(d,J=1.1Hz,1H),6.58(s,1H),6.39(dd,J=3.2,1.8Hz,1H),6.35(d,J=3.2Hz,1H),4.70(br s,1H),4.54(d,J=5.3Hz,2H),2.49(d,J=1.1Hz,3H)。

根据实例1的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例2(化合物28)

2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-甲基-N-[(噻吩-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:N-(5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸 叔丁酯

向根据实例1的程序制备的5-氯-3-甲基-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(3.90g,13.0mmol,1.0eq.)的CH2Cl2(53mL)溶液中,加入二碳酸二叔丁酯(5.8g,26.0mmol,2.0eq.),然后加入4-(二甲氨基)吡啶(1.6g,13.0mmol,1.0eq.)。将混合物在室温搅拌2h。将混合物采用乙酸乙酯稀释,并采用水和盐水洗涤。有机层用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩。残余物采用乙酸乙酯的己烷溶液(5%至35%梯度)通过硅胶柱色谱法纯化,得到N-(5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(4.77g,收率91%)。MS m/z 395.1[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.41(s,1H),7.24(dd,J=1.00Hz,1H),7.06(s,1H),6.89(dd,J=1.00Hz,1H),6.81(d,J=1.00Hz,1H),5.07(s,2H),2.51(d,J=1.07Hz,3H),1.47(s,9H)。

步骤2:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b] 吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在-78℃下,向N-(5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(4.77g,12.1mmol,1.0eq.)的THF(24mL)溶液中,加入二异丙基氨基锂(2.0M)的THF/庚烷/乙苯(7.2mL,14.5mmol,1.2eq.)溶液。15分钟后,将(4S)-4-甲基-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(3.44g,14.5mmol,1.2eq.)的THF(24mL)溶液加入到反应溶液中,并将混合物在-78℃搅拌20min。反应用1.0M柠檬酸淬灭,然后搅拌30min。混合物用乙酸乙酯稀释,并用水和盐水洗涤。将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并真空浓缩。残余物采用乙酸乙酯的CH2Cl2溶液(0至25%梯度)通过硅胶柱色谱法纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(4.10g,收率61%)。MS m/z 553.0,555.0[M+H]+1H NMR(400MHz,CDCl3)δppm 7.22(d,J=5.33Hz,1H),6.99(s,1H),6.86(dd,J=5.04,3.51Hz,1H),6.78(d,J=2.90Hz,1H),5.02(dd,J=1.00Hz,2H),4.46(br s,1H),4.01(br s,1H),3.07-3.16(m,1H),2.93-3.07(m,1H),2.41(s,3H),1.45(s,18H),1.14(d,J=6.71Hz,3H)。

步骤3:2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-甲基-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

Boc-去保护的一般程序:将N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(4.10g,7.4mmol,1.0eq.)和HCl(4M)在二恶烷(35mL)中的混合物,在室温下搅拌1h。混合物用乙醚(2x)稀释并过滤。滤饼用乙醚洗涤,收集并干燥,得到2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-甲基-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐(2.5g,收率96%)。MS m/z 352.1,354.1[M+H]+1HNMR(甲醇-d4)δppm 7.38(dd,J=5.19,1.07Hz,1H),7.18(d,J=2.75Hz,1H),7.10(s,1H),7.01(dd,J=5.04,3.51Hz,1H),4.97(s,2H),3.60-3.72(m,1H),3.37-3.44(m,1H),3.24-3.30(m,1H),2.47(s,3H),1.39(d,J=6.56Hz,3H)。

根据实例2的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例3(化合物17)

(2R)-2-氨基-3-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙-1-醇二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b] 吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向根据实例2的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基-丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(41mg,0.063mmol,1.0eq.)的THF(0.5mL)溶液中,加入TBAF(1.0M THF溶液)(0.25mL,0.25mmol,4.0eq.)。在室温下1小时后,混合物用乙醚稀释,用水和盐水洗涤,干燥并蒸发。残余物采用乙酸乙酯和己烷(5至65%梯度)通过硅胶纯化,得到N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(33mg,收率98%)。MS m/z 538.3,540.1[M+H]+

步骤2:(2R)-2-氨基-3-[5-氯-7-(2-呋喃基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙-1-醇

将N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(33mg,0.061mmol,1.0eq.)、苯甲醚(0.1mL)和HCl(4M二恶烷溶液)(1.0mL)的混合物在室温下搅拌30min,然后加入3滴MeOH,再搅拌混合物30min。混合物用乙醚稀释并过滤。收集固体并干燥,得到(2R)-2-氨基-3-[5-氯-7-(2-呋喃基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙-1-醇二盐酸盐(21mg,收率83%)。MS m/z338.3,340.2[M+H]+.1H NMR(甲醇-d4)δppm 7.52(d,J=1.2Hz,1H),7.42(s,1H),7.16(s,1H),6.49(s,1H),6.41-6.45(m,1H),4.77(s,2H),3.79-3.86(m,1H),3.64-3.71(m,2H),3.44-3.50(m,1H),3.36-3.42(m,1H)。

根据实例3的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例4(化合物42)

5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基-2-[(2S)-2-[(甲氨基)丙基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在-50℃下,向(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(120mg,0.22mmol,1.0eq.)的THF(1mL)溶液中加入LHMDS(1.0M THF溶液,0.27mL,1.1eq.)。30min后,加入MeI(42mg,1.2eq.)的THF(1mL)溶液。将混合物在1h内逐渐升温至室温,在室温下搅拌1h,冷却至-50℃,然后用几滴柠檬酸淬灭。升温到室温后,将反应用水和EtOAc稀释。有机层用水和盐水洗涤,用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用0-10%EtOAc的DCM溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,然后采用20-100%ACN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,通过制备型HPLC纯化,得到呈白色固体状的(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,收率28%)。MS m/z 550.2,552.2[M+H]+

步骤2:(S)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基-2-(2-(甲氨基)丙基)噻吩并[3,2- b]吡啶-7-胺

在室温下,将(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,0.064mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1h。真空浓缩混合物。将固体与乙醚一起研磨并过滤,得到(S)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基-2-(2-(甲氨基)丙基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐(12mg,收率49%)。MS m/z 350.1,352.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 7.49(t,J=1.2Hz,1H),6.90(s,1H),6.41(d,J=1.3Hz,2H),4.66(s,2H),3.57-3.60(m,1H),3.44-3.47(m,1H),3.18-3.23(m,1H),2.80(s,3H),2.43(s,3H),1.35(d,J=6.6Hz,3H)。

实例5(化合物104)

2-[(2R)-2-氨基-3-(甲基硫酰基)丙基]-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨 基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙基]甲烷磺酸酯

在0℃下,向根据实例3的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(217.0mg,0.393mmol,1.0eq.)的DCM(2.5mL)溶液中,加入甲磺酰氯(592mg,0.40mL,5.17mmol,13.1eq.)的DCM(9.60mL)溶液,然后加入N,N-二异丙基乙胺(75.5mg,0.10mL,0.57mmol,1.46eq.)。将反应在0℃下搅拌1h,然后用碳酸氢钠(~5mL)淬灭,并使用相分离器采用DCM(5x10mL)萃取。减压移除挥发性物质,得到呈浅黄色泡沫状的[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙基]甲烷磺酸酯(262.2mg,0.42mmol,1.06eq.),其无需进一步纯化即可用于下一步骤。MS m/z630.4,632.3[M+H]+

步骤2:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基硫酰基-丙基]-5-氯-3-甲基- 噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在室温下,向[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙基]甲烷磺酸酯(262.2mg,0.42mmol,1.0eq.)的DMF(2.5mL)溶液中加入甲硫醇钠(45.0mg,0.58mmol,1.39eq.)。将混合物在室温搅拌过夜,然后用水(2mL)淬灭。混合物采用EtOAc(2x30mL)萃取。将合并的有机层依次用水和盐水(30mL)洗涤,并用硫酸钠干燥。在减压下移除挥发性物质,残余物通过硅胶快速柱色谱法(12g,0-20%EtOAc的己烷溶液,含有10%DCM)纯化,得到呈浅黄色泡沫状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(202.3mg,收率84%)。MS m/z 582.3,584.3[M+H]+

步骤3:(R)-2-(2-氨基-3-(甲硫基)丙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩 并[3,2-b]吡啶-7-胺

按照实例2步骤3中描述的一般程序移除Boc基团,得到(R)-2-(2-氨基-3-(甲硫基)丙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐。MS m/z382.3,384.3[M+H]+1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm 8.31-8.48(m,3H),7.68(br s,1H),7.59(d,J=0.92Hz,1H),6.60(s,1H),6.40(dd,J=3.05,1.83Hz,1H),6.35(d,J=3.05Hz,1H),4.51(s,2H),3.46-3.54(m,1H),3.36(dd,J=14.84,6.15Hz,1H),3.29(dd,J=14.92,7.57Hz,1H),2.83(dd,J=14.21,6.37Hz,1H),2.76(dd,J=14.14,5.93Hz,1H),2.28(s,3H),2.11(s,3H)。

根据实例5的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例6(化合物111)

(3S)-3-氨基-4-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁腈二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-氰基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在室温下,向根据实例5的程序制备的[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙基]甲烷磺酸酯(216mg,0.34mmol,1.0eq.)的DMF(2.5mL)溶液中加入氰化钠(30mg,0.58mmol,1.7eq.)。将反应在60℃下搅拌3h。反应用水(2.0mL)淬灭,然后用EtOAc(2x40 mL)萃取。将合并的有机相依次用水和盐水(30mL)洗涤,然后用硫酸钠干燥。在减压下移除挥发性物质,残余物通过快速柱色谱法(12g,0-20%EtOAc的己烷溶液,含有10%DCM)纯化,得到呈灰白色泡沫状的N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-氰基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(134.2mg,收率70%)。MS m/z 561.3,563.3[M+H]+

步骤2:(S)-3-氨基-4-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b] 吡啶-2-基)丁腈

按照实例2步骤3中描述的一般程序移除Boc基团,得到(S)-3-氨基-4-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁腈盐酸盐。MS m/z361.3,363.3[M+H]+,359.2,361.2[M-H]-1H NMR 500MHz(DMSO-d6)δppm 8.61(br s,3H),7.66(brs,1H),7.59(s,1H),6.60(s,1H),6.40(br s,1H),6.35(br s,1H),4.51(br s,2H),3.33-3.45(m,2H),3.24(br dd,J=14.95,8.24Hz,1H),2.91-3.06(m,2H),2.28(s,3H)。

根据实例6的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例7(化合物64和化合物65)

2-[(2R)-2-氨基-3-(三氟甲氧基)丙基]-3-溴-5-氯-N-[(1,3-噻唑-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺甲酸盐和

(2R)-3-(3-溴-5-氯-7-{[(1,3-噻唑-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-[(三氟甲基)氨基]丙-1-醇甲酸盐

步骤1:N-[3-溴-2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(三氟甲氧基)丙基]-5-氯- 噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯和N-[(1R)-1-[[3-溴-7- [叔丁氧基羰基(噻唑-2-基甲基)氨基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-2-羟基-乙 基]-N-(三氟甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例3中的程序制备的N-[3-溴-2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(64mg,0.10mmol,1.0eq.)、三氟甲烷磺酸银(78mg,0.30mmol,3.0eq.)、(56mg,0.15mmol,1.5eq.)、氟化钾(23mg,0.40mmol,4.0eq.)和2,6-二叔丁基苯酚(11mg,0.050mmol,0.50eq.)的混合物中,加入2-氟吡啶(30mg,0.027mL,0.30mmol,3.0eq.)和(三氟甲基)三甲基硅烷(43mg,0.046mL,0.30mmol,3.0eq.)的EtOAc(0.5mL)溶液。将混合物在室温搅拌过夜。混合物用DCM稀释,并在硅胶上用乙酸乙酯的二氯甲烷溶液(0至25至75%梯度)纯化,得到极性较小的组分N-[3-溴-2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(三氟甲氧基)丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.5mg,收率4.9%),1H NMR(CDCl3)δppm 7.52-7.77(m,1H),7.40-7.25(m,2H),5.08(br s,2H),4.68-4.82(m,1H),4.11-4.23(m,1H),3.98(dd,J=17.3,3.6Hz,2H),3.23(d,J=6.3Hz,2H),1.29-1.42(m,18H),和N-[(1R)-1-[[3-溴-7-[叔丁氧基羰基(噻唑-2-基甲基)氨基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-2-羟基-乙基]-N-(三氟甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,收率49%),1H NMR(氯仿-d)δppm7.77(br s,1H),7.44(br s,1H),7.35(s,1H),5.22(d,J=6.6Hz,2H),4.86(br s,1H),4.26(br s.,1H),4.02-4.12(m,2H),3.32(d,J=6.0Hz,2H),1.36-1.49(m,18H)。

步骤2:2-[(2R)-2-氨基-3-(三氟甲氧基)丙基]-3-溴-5-氯-N-[(噻唑-2-基)甲 基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

按照实例2步骤3中所述的一般程序移除Boc基团,用HCl的二恶烷溶液处理N-[3-溴-2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(三氟甲氧基)丙基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.5mg),然后通过HPLC纯化,得到2-[(2R)-2-氨基-3-(三氟甲氧基)丙基]-3-溴-5-氯-N-(噻唑-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺甲酸盐,MS m/z 501.2,503.1,505.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 8.39(s,1H),7.74-7.82(m,1H),7.51-7.58(m,1H),6.57(s,1H),4.90(s,2H),4.04-4.22(m,2H),3.62-3.79(m,1H),3.33-3.41(m,1H),3.19-3.27(m,1H)。

(2R)-3-[3-溴-5-氯-7-(噻唑-2-基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]-2-(三 氟甲基氨基)丙-1-醇甲酸盐

将N-[(1R)-1-[[3-溴-7-[叔丁氧基羰基(噻唑-2-基甲基)氨基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-2-羟基-乙基]-N-(三氟甲基)氨基甲酸叔丁酯去保护,得到(2R)-3-[3-溴-5-氯-7-(噻唑-2-基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]-2-(三氟甲基氨基)丙-1-醇甲酸盐,MS m/z 501.2,503.1,505.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 8.37(s,1H),7.80(d,J=3.1Hz,1H),7.56(d,J=3.2Hz,1H),6.59(s,1H),4.92(s,2H),4.26(br s,1H),4.14-4.22(m,1H),3.80-3.94(m,1H),3.35-3.47(m,2H)。

实例8(化合物113)

2-[(2R)-2-氨基-3-(甲磺酰基)丙基]-3,5-二氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基磺酰基-丙基]-3,5-二氯-噻 吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向根据实例5的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基硫酰基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(256.0mg,0.42mmol,1.0eq.)的DCM(3.0mL)溶液中加入3-氯过苯甲酸(189.4mg,0.82mmol,1.9eq.)。将反应在0℃下搅拌1h,然后采用碳酸氢钠(3.0mL)淬灭。混合物采用相分离器通过DCM(5x10mL)萃取。将合并的有机相采用硫酸钠干燥,然后浓缩。残余物通过快速柱色谱法(24g,0-40%EtOAc的己烷溶液,含有10%DCM)纯化,得到呈灰白色泡沫状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基磺酰基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(232.8mg,收率86%)。MS m/z 634.3[M+H]+,656.4[M+Na]+

步骤2:(R)-2-(2-氨基-3-(甲基磺酰基)丙基)-3,5-二氯-N-(呋喃-2-基甲基)噻 吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

按照实例2步骤3中描述的一般程序移除Boc基团,得到(R)-2-(2-氨基-3-(甲基磺酰基)丙基)-3,5-二氯-N-(呋喃-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐。MS m/z434.3,436.3[M+H]+,432.2[M-H]-1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm 8.47(br s,3H),7.98(brt,J=5.49Hz,1H),7.60(s,1H),6.71(s,1H),6.37-6.43(m,2H),4.54(br d,J=5.19Hz,2H),3.95-4.06(m,1H),3.45-3.66(m,4H),3.17(s,3H)。

根据实例8的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例9(化合物47)

2-[(2S)-2-氨基-4-氟丁基]-3,5-二氯-N-[(1,3-噻唑-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-4-氟-丁基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2- b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例3的程序制备的N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-4-羟基-丁基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,0.058mmol,1.0eq.)和吡啶-2-磺酰氟(11mg,0.064mmol,1.1eq.)在甲苯(0.2mL)中的混合物,加入7-甲基-1,5,7-三氮杂二环[4.4.0]癸-5-烯(18mg,0.017mL,0.12mmol,2.0eq.)。将混合物在室温搅拌3天以上,然后采用DCM稀释,并采用乙酸乙酯的己烷溶液(5至50%梯度)通过硅胶纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-4-氟-丁基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,收率85%)。MS m/z627.2,629.1[M+Na]+

步骤2:(3S)-3-氨基-4-[3,5-二氯-7-(噻唑-2-基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶- 2-基]丁-1-醇

采用HCl的二恶烷溶液,进行实例2步骤3中描述的一般Boc-去保护程序,得到(3S)-3-氨基-4-[3,5-二氯-7-(噻唑-2-基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丁-1-醇二盐酸盐(14mg,收率99%)。MS m/z 405.1,407.2,409.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:8.08(d,J=3.5Hz,1H),7.91(d,J=3.5Hz,1H),6.99(s,1H),5.23(s,2H),4.61-4.81(m,2H),3.85-3.95(m,1H),3.51(qd,J=14.9,7.2Hz,2H),2.12-2.26(m,2H)。

根据实例9的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例10(化合物107)

2-[(2S)-2-氨基-4,4-二氟丁基]-3-溴-5-氯-N-[(噻吩-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:(3S)-3-氨基-4-[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2- 基]丁-1-醇

向根据实例2的程序制备的N-[3-溴-2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-4-[叔丁基(二甲基)甲硅烷基]氧基-丁基]-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.4mmol)的CH2Cl2(3mL)溶液中,加入三氟乙酸(0.5mL,7mmol)。室温搅拌4h后,在减压条件下将反应浓缩。产品无需进一步纯化即可用于后续步骤。MS m/z446.8,448.2,450.2[M+H]+

步骤2:N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基] 甲基]-3-羟基-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺

在室温下,向(3S)-3-氨基-4-[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丁-1-醇(100mg,0.2mmol)的CH2Cl2(1mL)溶液中,加入2-硝基苯磺酰氯(50mg,0.2mmol,1.0eq),然后加入N,N-二异丙基乙胺(0.12mL,0.69mmol,3.5eq)。在室温搅拌1h后,混合物用水(5mL)稀释,并用CH2Cl2(3x10mL)萃取。将合并的有机层依次用1M HCl(10mL)和饱和NaHCO3(10mL)洗涤,然后用Na2SO4干燥,过滤并浓缩。沉淀物用乙醚研磨并过滤,得到呈淡黄色固体状的N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-3-羟基-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺(119mg,收率84%)。MS m/z 631.2,633.2,635.2[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 8.08(br d,J=8.5Hz,1H),7.84(br t,J=5.8Hz,1H),7.65(t,J=7.9Hz,2H),7.30-7.47(m,3H),7.10-7.20(m,1H),7.03(t,J=4.1Hz,1H),6.59(s,1H),4.71(br d,J=5.8Hz,2H),4.41(t,J=4.9Hz,1H),3.78-3.97(m,1H),3.44-3.54(m,1H),3.15(br dd,J=14.3,5.2Hz,1H),2.99(dd,J=14.5,8.7Hz,1H),1.63-1.81(m,2H)。

步骤3:N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基] 甲基]-3-氧代-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺

向N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-3-羟基-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺(50mg,0.08mmol)的CH2Cl2(2mL)悬浮液中,加入戴斯-马丁氧化剂(Dess-Martin periodinane),1,1,1-三(乙酰氧基)-1,1-二氢-1,2-苯碘酰-3-(1H)-酮(40mg,0.09mmol,1.1eq.)。在室温下搅拌4h后,将混合物浓缩,得到N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-3-氧代-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺,其无需进一步纯化即可使用。MS m/z 629.2,631.2,633.2[M+H]+

步骤4:(S)-N-(1-(3-溴-5-氯-7-((噻吩-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2- 基)-4,4-二氟丁-2-基)-2-硝基苯磺酰胺

在室温下,向来自步骤3的N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-3-氧代-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺的CH2Cl2(1mL)溶液中加入二乙氨基三氟化硫(0.25g,1M)。搅拌30min后,反应用饱和NaHCO3(5mL)淬灭,并用CH2Cl2(10mL)萃取。有机层用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到(S)-N-(1-(3-溴-5-氯-7-((噻吩-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-4,4-二氟丁-2-基)-2-硝基苯磺酰胺,其无需进一步纯化即可使用。MS m/z 651.1,653.3[M+H]+

步骤5:2-[(2S)-2-氨基-4,4-二氟-丁基]-3-溴-5-氯-N-[(2-噻吩基甲基)噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-胺

向N-[(1S)-1-[[3-溴-5-氯-7-(2-噻吩基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]甲基]-3,3-二氟-丙基]-2-硝基-苯磺酰胺的DMF(1mL,12.9mmol)溶液中加入苯硫酚(0.02mL,0.2mmol)和K2CO3(40mg,0.29mmol)。在室温下搅拌18h后,将混合物用MeOH(1mL)稀释,过滤,并通过制备型HPLC纯化。将收集的组分进行浓缩,然后采用1M HCl/Et2O(1mL)处理,得到呈白色固体状的2-[(2S)-2-氨基-4,4-二氟-丁基]-3-溴-5-氯-N-[(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐(4.0mg,收率9.4%)。MS m/z 466.1,468.0,470.1[M+H]+1HNMR(甲醇-d4)δppm 7.33(d,J=5.2Hz,1H),7.11(d,J=3.1Hz,1H),7.00(t,J=4.3Hz,1H),6.66(s,1H),6.04-6.37(m,1H),4.71-4.83(m,2H),3.98(quin,J=6.8Hz,1H),3.36-3.51(m,2H),2.25-2.45(m,2H)。

实例11(化合物45)

2-[(2R)-2-氨基-3-甲氧基丙基]-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲氧基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩 并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向根据实例3中的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(126.6mg,0.23mmol,1.0eq.)的DMF(0.5mL)和THF(2.0mL)的溶液中,加入氢化钠(60质量%)的矿物油(15mg,0.38mmol,1.6eq.)溶液。将混合物在0℃下搅拌5min,然后加入碘甲烷(2.0M)的叔丁基甲基醚(112mg,0.120mL,0.24mmol,1.0eq.)溶液。将反应升至室温,然后在室温下搅拌过夜。反应用水(~5mL)淬灭,并用EtOAc(2x40mL)萃取。将合并的有机相依次用水和盐水(~30mL)洗涤。在减压下移除挥发性物质,残余物通过快速柱色谱法(12g,0-30%EtOAc的己烷溶液,含有10%DCM)纯化,得到呈灰白色固体状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲氧基-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(88.0mg,0.155mmol,0.68eq.)。MS m/z 566.3[M+H]+,588.2,590.3[M+Na]+

步骤2:(R)-2-(2-氨基-3-甲氧基丙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-胺

采用HCl的二恶烷溶液,按照实例2步骤3中描述的一般程序移除Boc基团,得到(R)-2-(2-氨基-3-甲氧基丙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐。MS m/z 366.3,368.2[M+H]+1H NMR 500MHz(DMSO-d6)δppm 8.33(br s,3H),7.65(br s,1H),7.56-7.62(m,1H),6.60(s,1H),6.39-6.42(m,1H),6.36(d,J=3.05Hz,1H),4.51(br s,2H),3.44-3.53(m,2H),3.34-3.43(m,1H),3.31(s,3H),3.24(dd,J=14.55,5.29Hz,1H),3.18(dd,J=14.49,9.25Hz,1H),2.25(s,3H)。

根据实例11的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例12(化合物115)

3-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-D-丙氨酸二盐酸盐

步骤1:(R)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-氧代丙基)-3,5-二氯噻吩并[3,2- b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例3的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-羟基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(614mg,1.0mmol)的CH2Cl2(3mL)溶液中,加入戴斯-马丁氧化剂,1,1,1-三(乙酰氧基)-1,1-二氢-1,2-苯碘酰-3-(1H)-酮(546mg,1.3mmol,1.3eq)。在室温搅拌2h后,将混合物减压浓缩,用乙醚(3mL)稀释,并与饱和Na2S2O3(1mL)和饱和NaHCO3(1mL)一起搅拌30min。分离有机层,用MgSO4干燥,过滤并浓缩,得到呈透明油状的(R)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-氧代丙基)-3,5-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(510mg,收率83%)。MS m/z 569.9[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 9.51(s,1H),7.55(m,2H),6.33(br s,1H),6.24(br s,1H),4.90-4.98(m,2H),4.10-4.23(m,1H),3.35-3.41(m,1H),3.13-3.26(m,1H),1.39(s,9H),1.36(s,9H)。

步骤2:(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨 基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酸

向N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-氧代-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(510mg,0.9mmol)的叔丁醇(4.0mL)和水(1.0mL)的溶液中,加入NaH2PO4(322mg,2.7mmol,3eq.),然后加入2-甲基-2-丁烯(0.8mL,9mmol,10eq),最后加入NaClO2(162mg,1.8mmol,2.0eq.)。在室温搅拌0.5h后,混合物用CH2Cl2(10mL)稀释,并用水(10mL)洗涤。分离有机层,用Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到呈白色固体状的(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酸(498mg,收率95%)。MS m/z 586.1[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 12.79-13.13(m,1H),7.55-7.59(m,1H),7.51-7.54(m,1H),7.25-7.33(m,1H),6.29-6.36(m,1H),6.20-6.26(m,1H),4.90-5.01(m,2H),4.19-4.25(m,1H),3.50-3.59(m,1H),3.21-3.29(m,1H),1.37-1.40(s,9H),1.33-1.37(s,9H)。

步骤3:(2R)-2-氨基-3-[3,5-二氯-7-(2-呋喃基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶- 2-基]丙酸

将(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酸(80mg,0.14mmol)在HCl(4M二恶烷溶液)(1mL,4mmol)溶液中的混合物在室温下搅拌1h。在减压下浓缩混合物。固体用乙醚研磨并过滤,得到(2R)-2-氨基-3-[3,5-二氯-7-(2-呋喃基甲氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酸二盐酸盐(55mg,收率88%)。MS m/z 366.1,368.2[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 8.64(br s,3H),7.93-8.06(m,1H),7.57-7.65(m,1H),6.68-6.75(m,1H),6.35-6.46(m,2H),4.48-4.60(m,2H),4.11-4.23(m,1H),3.48-3.57(m,2H),COOH峰未测出。

根据实例12的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例13(化合物72)

2-[(2R)-2-氨基丁-3-烯-1-基]-3-溴-5-氯-N-[(1,3-噻唑-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:(R)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丁-3-烯-1-基)-5-氯噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基)(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向甲基三苯基溴化鏻(260mg,0.71mmol,2.1eq.)的THF(3.5mL)悬浮液中,加入KHMDS(1M)的THF(0.68mL,0.68mmol,2.0eq.)溶液。将所得混合物在室温搅拌2h,然后冷却至-78℃。加入根据实例12中的程序制备的(R)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-氧代丙基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(215mg,0.34mmol,1.0eq.)的THF(2.5mL)溶液,将温度升至室温,并搅拌过夜。反应用饱和NH4Cl淬灭,用乙酸乙酯萃取,用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用乙酸乙酯和己烷(5至35%梯度)通过硅胶纯化,得到(R)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丁-3-烯-1-基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(86mg,收率40%)。1H NMR(CDCl3)δ:7.71(d,J=3.1Hz,1H),7.30-7.39(m,2H),5.87(s,1H),5.23(d,J=17.1Hz,1H),5.16-5.20(m,3H),4.50-4.75(m,2H),3.20-3.40(m,2H),1.38-1.51(m,18H)。

步骤2:2-[(2R)-2-氨基丁-3-烯基]-3-溴-5-氯-N-(噻唑-2-基甲基)噻吩并[3,2- b]吡啶-7-胺

采用HCl的二恶烷溶液,按照实例2步骤3中描述的一般程序移除Boc基团,得到2-[(2R)-2-氨基丁-3-烯基]-3-溴-5-氯-N-(噻唑-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐。MS m/z 429.0,431.1,433.0[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.82-7.89(m,1H),7.63-7.69(m,1H),6.66-6.73(m,1H),5.81-5.91(m,1H),5.28-5.37(m,2H),4.98(s,2H),4.06-4.17(m,1H),3.38-3.46(m,2H)。

根据实例13的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例14(化合物123)

2-[(2R)-2-氨基丁-3-炔-1-基]-3-甲基-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丁-3-炔基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向根据实例12中的程序制备的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-氧代-丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(202mg,0.37mmol,1.0eq.)和碳酸钾(100mg,0.043mL,0.72mmol,1.97eq.)在MeOH(5.0mL)中的搅拌悬浮液中,加入(1-重氮-2-氧代丙基)膦酸二甲酯(10质量%)的乙腈(800mg,1.0mL,0.42mmol,1.1eq.)溶液。反应在室温搅拌过夜。在减压下移除挥发性物质,残余物进行水后处理,并通过快速柱色谱法(24g,0-20%EtOAc/己烷)纯化,得到呈灰白色泡沫状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丁-3-炔基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(136.5mg,收率68%)。MS m/z 546.2,548.4[M+H]+

步骤2:(R)-2-(2-氨基丁-3-炔-1-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-胺

采用HCl的二恶烷溶液,进行一般去保护程序,得到(R)-2-(2-氨基丁-3-炔-1-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐。MS m/z 346.2,348.3[M+H]+1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δppm 8.84(br d,J=4.27Hz,3H),7.67(br s,1H),7.55-7.63(m,1H),6.60(s,1H),6.40(dd,J=3.05,1.83Hz,1H),6.36(d,J=2.75Hz,1H),4.51(br s,2H),4.23-4.36(m,1H),3.72(d,J=2.25Hz,1H),3.49(dd,J=14.19,4.73Hz,1H),3.32(dd,J=14.19,10.25Hz,1H),2.29(s,3H)。

根据实例14的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例15(化合物124)

3-(3,5-二氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-N-(2-氟苯基)-D-丙氨酰胺二盐酸盐

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯胺)-3-氧代-丙基]-3,5- 二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例12中的程序制备的(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-[7-[叔丁氧基羰基(2-呋喃基甲基)氨基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酸(100mg,0.17mmol)、氯-N,N,N',N'-四甲基甲脒六氟磷酸盐(55mg,0.2mmol,1.1eq)和4-氯苯胺(30mg,0.2mmol,1.1eq.)的乙腈(1mL)溶液中,加入1-甲基咪唑(0.03mL,0.4mmol,2eq.)。在室温搅拌1h后,混合物用水(5mL)稀释,并用乙酸乙酯(3x10mL)萃取。将合并的有机相用MgSO4干燥,并过滤和浓缩。残余物采用0-30%乙酸乙酯的己烷溶液洗脱,通过硅胶纯化,得到呈透明泡沫状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯胺)-3-氧代-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(52mg,收率44%)。MS m/z 695.3,697.3[M+H]+1H NMR(CDCl3)δppm 8.51(br s,1H),7.46(d,J=8.5Hz,2H),7.26-7.32(m,4H),7.18(s,1H),6.27(br s,1H),6.19(d,J=3.1Hz,1H),4.79-4.86(m,2H),4.65-4.72(m,1H),3.52-3.64(m,2H),1.44(s,9H),1.41(s,9H)。

步骤2:(2R)-2-氨基-N-(4-氯苯基)-3-[3,5-二氯-7-(2-呋喃基甲氨基)噻吩并 [3,2-b]吡啶-2-基]丙酰胺

将N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯胺)-3-氧代-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(52mg,0.07mmol)在HCl(4M二恶烷溶液)(1mL,4mmol)中的混合物在室温下搅拌4h。将混合物浓缩,固体用乙醚研磨并过滤,得到呈米色固体状的(2R)-2-氨基-N-(4-氯苯基)-3-[3,5-二氯-7-(2-呋喃基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙酰胺盐酸盐(33mg,收率78%)。MS m/z 495.0,497.0[M+H]+1HNMR(DMSO-d6)δppm10.94-11.08(s,1H),8.70-8.82(br s,3H),7.90-8.02(m,1H),7.54-7.66(m,3H),7.40(d,J=8.9Hz,2H),6.68(s,1H),6.32-6.44(m,2H),4.47-4.59(m,2H),4.22-4.32(m,1H),3.51-3.67(m,2H)。

根据实例15的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例16(化合物51)

2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-环丙基-N-[(呋喃-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯-3-环丙基噻吩并[3,2-b] 吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例2的程序制备的(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(88mg,0.15mmol,1.0eq.)和环丙基三氟硼酸钾(29mg,0.19mmol,1.3eq.)的二恶烷(0.8mL)溶液中,加入Pd(dppf)Cl2(12mg,0.1000eq.)和K2CO3(2M H2O溶液,0.22mL,3.0eq.)。将密封管加热至90℃并保持5小时。冷却后,混合物用EtOAc和NH4Cl(水溶液)稀释,并用EtOAc萃取。将合并的有机相干燥和浓缩。残余物采用0-10%EtOAc的DCM溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到目标产品和未反应的起始材料的混合物,然后将混合物采用25-100%CH3CN的水溶液(含有0.1%TFA),通过制备型HPLC进一步纯化,得到呈白色固体状的(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯-3-环丙基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(53mg,收率64%)。MS m/z 562.2,564.2[M+H]+

步骤2:(S)-2-(2-氨丙基)-5-氯-3-环丙基-N-(呋喃-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

在室温下,将(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯-3-环丙基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(53mg,0.094mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1h。移除有机挥发性物质。残余物用乙醚研磨并过滤,得到(S)-2-(2-氨丙基)-5-氯-3-环丙基-N-(呋喃-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(33mg,收率89%)。MS m/z 362.1,364.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 7.49(t,J=0.9Hz,1H),7.04(s,1H),6.42(dd,J=3.2,12.5Hz,2H),4.71(s,2H),3.75-3.78(m,1H),3.42-3.44(m,1H),3.38-3.40(m,1H),1.84-1.87(m,1H),1.39(d,J=6.6Hz,3H),1.19-1.21(m,2H),0.85-0.86(m,2H)。

根据实例16的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例17(化合物109)

2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-3-甲腈甲酸盐

步骤1:(S)-(1-(5-氯-3-氰基-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2- 基)丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯

采用氩气将根据实例2的程序制备的(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(67mg,0.11mmol,1.0eq.)和CuCN(22mg,2.2eq.)在DMF(0.6mL)中的混合物脱气。密封管在150℃下加热8h。冷却后,加入0.1mLNH4Cl(饱和水溶液)和0.1mL NaHCO3(饱和水溶液)。将混合物搅拌15min,过滤并用MeOH(0.5mL x 3)洗涤。将合并的滤液采用10-100%ACN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,通过制备型HPLC纯化,得到(S)-(1-(5-氯-3-氰基-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(15mg,收率30%)。MS m/z 447.2,449.2[M+H]+

步骤2:(S)-2-(2-氨丙基)-5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶- 3-甲腈

在室温下,将(S)-(1-(5-氯-3-氰基-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(15mg,0.034mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1h。移除有机挥发性物质。固体采用5-50%ACN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,通过制备型HPLC纯化,得到(S)-2-(2-氨丙基)-5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-3-甲腈甲酸盐(5mg,收率36%)。MS m/z 347.1,349.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 8.44(s,1H),7.36(s,1H),6.61(s,1H),6.27(d,J=1.3Hz,2H),4.45(s,2H),3.48-3.51(m,1H),3.27-3.31(m,2H),1.21(d,J=6.6Hz,3H)。

实例18(化合物50和化合物49)

2-[(2S)-2-氨丙基]-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-3,5-二甲腈盐酸盐和

2-[(2S)-2-氨丙基]-3-溴-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}噻吩并[3,2-b]吡啶-5-甲腈盐酸盐

步骤1:(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-3,5-二氰基噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯和(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙 基)-5-氰基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例2的程序制备的(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(90mg,0.15mmol,1.0eq.)的DMF(1mL)溶液中,加入氰化锌(11mg,0.60eq.)、Pd2(dba)3(7.1mg,0.05eq.)和XantPhos(8.9mg,0.10eq.)。将密封管在120℃搅拌1h。冷却后,混合物用EtOAc和NH4Cl(水溶液)稀释,并用EtOAc萃取。将合并的有机相干燥和浓缩。残余物采用0-10%EtOAc的DCM溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到混合物,所述混合物采用25-100%ACN的水溶液(含0.1%TFA),通过制备型HPLC进一步纯化,得到(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-3,5-二氰基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(23mg,收率29%),MS m/z 536.3[M-H]-,和(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氰基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,收率40%)。MS m/z 591.2,593.2[M+H]+

步骤2:(S)-2-(2-氨丙基)-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-3,5- 二甲腈

采用实例2步骤3中描述的一般Boc-去保护程序,将(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-3,5-二氰基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯去保护,得到(S)-2-(2-氨丙基)-7-(呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-3,5-二甲腈盐酸盐(17mg,收率95%)。MS m/z 338.0[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 7.48(d,J=0.9Hz,1H),7.20(s,1H),6.40-6.42(m,2H),4.64(s,2H),3.79-3.81(m,1H),3.55-3.59(m,1H),3.45-3.49(m,1H),1.42(d,J=6.6Hz,3H)。

(S)-2-(2-氨丙基)-3-溴-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-5-甲腈

采用实例2步骤3中描述的一般Boc-去保护程序,将(S)-(3-溴-2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)-5-氰基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯去保护,得到(S)-2-(2-氨丙基)-3-溴-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-5-甲腈盐酸盐(19mg,收率83%)。MS m/z 391.0,393.0[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm 7.49(d,J=0.9Hz,1H),7.22(s,1H),6.40-6.42(m,2H),4.66(s,2H),3.76-3.80(m,1H),3.41-3.45(m,1H),3.37-3.39(m,1H),1.42(d,J=6.6Hz,3H)。

根据实例18的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例19(化合物60)

2-[(2S)-2-氨丙基]-3-氯-5-甲基-N-[(1,3-噻唑-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐

步骤1:N-(3-氯-5-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲 酸叔丁酯

将根据实例2的程序制备的N-(3,5-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.240mmol,1.0eq.)、2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼烷(trioxatriborinane)(44mg,0.049mL,0.35mmol,1.5eq.)、Cs2CO3(171mg,0.524mmol,2.2eq.)和PdCl2dppf DCM(14.4mg,0.0175mmol,0.0727eq.)在二恶烷(1.0mL)和水(0.1mL)中的混合物,在120℃下搅拌2h,然后冷却,采用乙酸乙酯稀释,并用盐水洗涤,干燥并蒸发。残余物采用乙酸乙酯和二氯甲烷(0至50%梯度)通过硅胶纯化,得到N-(3-氯-5-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(71mg收率,75%)。1H NMR(CDCl3)δ:7.69(d,J=2.6Hz,1H),7.34(d,J=2.9Hz,1H),7.07-7.20(m,1H),5.19(br s,2H),4.40-4.63(m,1H),4.00-4.11(m,1H),3.22(br s,2H),2.74(br s,3H),1.46(s,18H),1.19(d,J=5.8Hz,3H)。

步骤2:2-[(2S)-2-氨丙基]-3-氯-5-甲基-N-(噻唑-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

采用一般的Boc-去保护程序,采用HCl的二恶烷溶液,将N-(3-氯-5-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(噻唑-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯去保护,得到2-[(2S)-2-氨丙基]-3-氯-5-甲基-N-(噻唑-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐(52mg,收率96%)。MS m/z 353.1,355.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.88-7.95(m,1H),7.71-7.78(m,1H),6.97-7.05(m,1H),5.21(s,2H),3.73-3.85(m,1H),3.46-3.54(m,1H),3.37-3.44(m,1H),2.73(s,3H),1.43(d,J=6.6Hz,3H)。

实例20(化合物21)

2-[(1S)-1-氨乙基]-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:(5-氯-2-甲酰基-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基 甲酸叔丁酯

在-78℃下,向根据实例2程序制备的N-(5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(90mg,0.24mmol,1.0eq.)的THF(1mL)溶液中,加入LDA(2.0M THF溶液,0.14mL,1.2eq.)。30分钟后,滴加DMF(0.11mL,1.4mmol,5.8eq.)。将温度升至-50℃,并用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应,然后用EtOAc稀释。混合物依次用水和盐水洗涤,有机层用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用0-25%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到呈白色固体状的(5-氯-2-甲酰基-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(83mg,收率86%)。1H NMR(丙酮-d6)δppm 10.5(s,1H),7.55(s,1H),7.45(s,1H),6.29-6.33(m,2H),5.03(s,2H),2.84(s,3H),1.43(s,9H)。

步骤2:(R,E)-(2-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2- b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基))氨基甲酸叔丁酯

在55℃下,将(5-氯-2-甲酰基-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(151mg,0.37mmol,1.0eq.)、R-(+)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(54mg,0.45mmol,1.2eq.)和CuSO4(91mg,0.56mmol,1.5eq.)在DCE(0.4mL)中的混合物搅拌18h。冷却后,混合物采用0-50%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(R,E)-(2-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基))氨基甲酸叔丁酯(140mg,收率74%)。MS m/z 510.4,512.4[M+H]+

步骤3:(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯和(2-((R)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基) 氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在-78℃下,向(R,E)-(2-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基))氨基甲酸叔丁酯(140mg,0.27mmol,0.74eq.)的THF(2.3mL)溶液中,加入MeMgBr(3.0M Et2O溶液,0.31mL,2.5eq.)。在1h内,将混合物升温至0℃,然后用NH4Cl和EtOAc饱和溶液淬灭。混合物依次用水和盐水洗涤,有机层用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用0-100%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(88mg,收率45%,主要非对映异构体),MS m/z 526.5,528.5[M+H]+1H NMR(丙酮-d6)δppm 7.44(d,J=0.9Hz,1H),7.25(s,1H),6.30-6.32(m,1H),6.25-6.27(m,1H),5.07-5.10(m,1H),4.95-4.97(m,3H),2.41(t,3H),1.60(d,J=6.6Hz,3H),1.41(s,9H),1.20(s,9H),和(2-((R)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(26mg,收率13%,次要非对映异构体),MS m/z 526.5,528.5[M+H]+1H NMR(丙酮-d6)δppm 7.43(s,1H),7.26(s,1H),6.29-6.31(m,1H),6.23-6.25(m,1H),5.10-5.11(m,1H),4.97(d,J=4.9Hz,2H),4.69(br s,1H),2.43(t,3H),1.60(d,J=6.6Hz,3H),1.41(s,9H),1.20(s,9H)。

步骤4:(S)-2-(1-氨乙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

将(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸酯(20mg,0.038mmol)的HCl(4M二恶烷溶液,1mL)溶液在室温下搅拌1h。移除有机挥发性物质,残余物用乙醚研磨并过滤,得到(S)-2-(1-氨乙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺二盐酸盐(12mg,收率74%)。MS m/z 322.1,324.1[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 8.67(br s,3H),7.80(br s,1H),7.60(d,J=0.9Hz,1H),6.63(s,1H),6.40-6.41(m,1H),6.35-6.37(m,1H),4.96-4.99(m,1H),4.53(br s,2H),2.36(s,3H),1.64(d,J=6.8Hz,3H)。

实例21(化合物26)

5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基-2-[(1S)-1-(甲氨基)乙基]噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)(甲基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩 并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(88mg,0.17mmol,1.0eq.)的DMF(0.3mL)溶液中,加入NaH(60%油溶液,8.7mg,1.3eq.)。10min后,加入碘甲烷(31.0mg,1.3eq.)的DMF(0.3mL)溶液。30min后,反应用柠檬酸(1.0M)淬灭,并用EtOAc稀释。有机相用水和盐水洗涤,用硫酸钠干燥和蒸发。残余物采用0-70%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)(甲基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(79mg,收率87%)。MS m/z 540.6,542.6,[M+H]+

步骤2:(S)-2-(1-氨乙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

在室温下,将(2-((S)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)(甲基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(79mg,0.15mmol)的HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)搅拌1小时。移除有机挥发性物质。残余物用乙醚研磨并过滤,得到(S)-2-(1-氨乙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(41mg,收率72%)。MS m/z 336.3,338.1[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 9.38(br s,1H),9.07(br s,1H),7.79(t,J=6.0Hz,1H),7.60(s,1H),6.66(s,1H),6.37-6.42(m,2H),4.93-4.98(m,1H),4.53(d,J=5.8Hz,2H),2.60(br s,3H),2.38(s,3H),1.64(d,J=6.8Hz,3H)。

根据实例21的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例22(化合物22和化合物3)

2-[(1R)-1-氨乙基]-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐和

1-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙-1-醇

步骤1:(5-氯-2-(1-羟乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基) 氨基甲酸叔丁酯和(2-((R)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

将按照实例20的程序制备的N-(5-氯-2-甲酰基-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(160mg,0.39mmol,1.0eq.)、S-(+)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(54mg,0.45mmol,1.2eq.)和CuSO4(96mg,0.59mmol,1.5eq.)在DCE(0.4mL)中的混合物,在55℃下搅拌18h。混合物通过硅藻土垫过滤,并用DCE洗涤固体。将滤液浓缩。在-78℃下,向残余物的THF(2mL)溶液中,加入MeMgBr(3.0M Et2O溶液,0.52mL,4.0eq.)。在1h内将混合物逐渐升温至0℃,然后用NH4Cl和EtOAc的饱和溶液淬灭。混合物依次用水和盐水洗涤,有机层用硫酸钠干燥并蒸发。残余物采用0-60%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(5-氯-2-(1-羟乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(44mg,27%),MS m/z 423.2,425.2[M+H]+,然后用100%EtOAc洗脱,得到(2-((R)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(40mg,27%,主要非对映异构体),MS m/z 526.5,528.5[M+H]+

步骤2:1-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基) 乙-1-醇

在室温下,将(2-((R)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)乙基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(20mg,0.038mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1小时,然后移除有机挥发性物质。残余物用乙醚研磨并过滤,得到(R)-2-(1-氨乙基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(12mg,收率74%)。MS m/z 322.1,324.1[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm 8.67(br s,3H),7.80(br s,1H),7.60(d,J=0.9Hz,1H),6.63(s,1H),6.40-6.41(m,1H),6.35-6.37(m,1H),4.96-4.99(m,1H),4.53(br s,2H),2.36(s,3H),1.64(d,J=6.8Hz,3H)。在室温下,将(5-氯-2-(1-羟乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(35mg,0.083mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1小时,然后移除有机挥发性物质。残余物用乙醚研磨并过滤,得到呈白色固体状的1-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)乙-1-醇(13mg,收率49%)。MS m/z 323.1,325.1[M+H]+1H NMR(丙酮-d6)δppm 7.45(s,1H),6.58(s,1H),6.32-6.33(m,2H),5.31(q,J=6.4Hz,1H),4.59(d,J=5.3Hz,2H),3.50(br s,1H),2.25(s,3H),1.45(d,J=6.4Hz,3H)。

根据实例22的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例23(化合物5和化合物25)

(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲醇和

5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-2-((甲氨基)甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐

步骤1:((7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶- 2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯和(2-(((叔丁氧基羰基)氧基)甲基)-5-氯噻吩并[3,2- b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据实例20程序制备的N-(5-氯-2-甲酰基-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(40mg,0.10mmol,1.0eq.)的DCM溶液中,加入甲胺(2.0M THF溶液,0.2mL,4eq.)和三乙酰氧基硼氢化钠(64mg,0.30mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后,加入NaHCO3(饱和水溶液)淬灭。粗产品用DCM萃取,将合并的有机相干燥并浓缩。将这种粗物质与4-DMAP(5mg)和二碳酸二叔丁酯(50mg)的DCM(1mL)溶液混合。在室温下搅拌1-2h后,将反应浓缩,并采用0-100%EtOAc的己烷溶液洗脱,直接通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到((7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯。MS m/z 508.1,510.1,[M+H]+和(2-(((叔丁氧基羰基)氧基)甲基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯。

步骤2:5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-2-((甲氨基)甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺和 (5-氯-7-((呋喃-2-基甲基))氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲醇

在室温下,将中间体((7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯在HCl溶液(4M二恶烷溶液,0.5mL)中搅拌1h,然后移除有机挥发性物质。将粗固体与乙醚一起研磨并过滤,得到5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-2-((甲氨基)甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(1.8mg,三步收率5.8%)。MS m/z 308.1,310.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.61(s,1H),7.51(s,1H),7.06(s,1H),6.42-6.46(m,2H),4.73(s,2H),4.63(s,2H),2.83(s,3H)。

(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲醇

在室温下,将中间体(2-(((叔丁氧基羰基)氧基)甲基)-5-氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯在HCl溶液(4M二恶烷溶液,0.5mL)中搅拌1h,然后移除有机挥发性物质。将粗固体与乙醚一起研磨并过滤,得到(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)甲醇(9mg,三步收率31%)。MS m/z 295.0,297.0[M+H]+1HNMR(甲醇-d4)δ:7.35(s,1H),7.29(s,1H),6.66(s,1H),6.26-6.27(m,2H),4.49(s,2H),4.29(br s,2H)。

根据实例23的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例24(化合物163)

N2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-甲基-N7-[(噻吩-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b]吡啶-2,7-二胺

步骤1:(S)-(2-((2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基)(噻吩-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向根据中间体6制备的(5-氯-2-碘-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(噻吩-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.19mmol,1.0eq)、(S)-(1-氨基丙-2-基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.29mmol,1.5eq)、Cs2CO3(200mg,0.61mmol,3.0eq)、Pd2(dba)3(9mg,0.01mmol,0.1eq)、XantPhos(12mg,0.02mmol,0.2eq)和甲苯(1mL)的混合物在100℃在氩气氛围下加热3h。粗反应混合物冷却到室温,并采用EtOAc(20mL)稀释。将有机相依次用H2O(20mL)和盐水(20mL)洗涤。有机相用MgSO4干燥,过滤和真空浓缩。粗残余物采用0-30%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色泡沫状的(S)-(2-((2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(噻吩-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,74%)。MS m/z 567.2,569.2[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δ:7.39-7.43(m,1H),6.71-6.95(m,5H),5.00(s,2H),3.67-3.80(m,1H),3.14-3.23(m,1H),3.03-3.13(m,1H),2.05(s,3H),1.39(s,18H),1.03-1.10(d,J=6.4Hz,3H)。

步骤2:N2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-3-甲基-N7-[(噻吩-2-基)甲基]噻吩并[3,2-b] 吡啶-2,7-二胺

在室温下,将(S)-(2-((2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(噻吩-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.14mmol)在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1h。移除有机挥发性物质。残余物用乙醚研磨并过滤,得到(S)-N2-(2-氨丙基)-5-氯-3-甲基-N7-(噻吩-2-基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2,7-二胺盐酸盐(52mg,收率62%)。MS m/z 367.2,369.2[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δ:8.34(br s,4H),8.11(br s,1H),7.39-7.46(m,1H),7.08-7.14(m,1H),6.97-7.02(m,1H),6.58(s,1H),4.71-4.80(m,2H),3.47-3.55(m,1H),3.41-3.45(m,1H),3.31-3.36(m,1H),2.15(s,3H),1.29(d,J=6.4Hz,3H)。

根据实例24的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例25(化合物131)

3-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-D-丙氨酸甲酯

步骤1:(R)-3-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-2-基)-2-((叔丁氧羰基)氨基)丙酸甲酯

向根据实例12步骤2制备的(R)-3-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(45mg,0.08mmol,1.0eq.)和K2CO3(35mg,0.25mmol,3.0eq.)的DMF(1mL)溶液中加入MeI(25μL,0.4mmol,5eq.),然后在50℃下搅拌12h。将反应混合物冷却至室温,并用H2O(10mL)稀释。水相采用EtOAc(2x30mL)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,用MgSO4干燥,过滤并真空浓缩。粗残余物采用0-30%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈透明油状的(R)-3-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-((叔丁氧羰基)氨基)丙酸甲酯(28mg,60%)。MS m/z 580.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.36-7.48(m,1H),7.12-7.20(m,1H),6.27-6.35(m,1H),6.16-6.26(m,1H),4.88-4.95(m,2H),4.46-4.55(m,1H),4.06-4.18(m,1H),3.75(s,3H),3.45-3.57(m,1H),2.38(s,3H),1.44(s,9H),1.42(s,9H),1个NH未测出。

步骤2:3-(5-氯-7-{[(呋喃-2-基)甲基]氨基}-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2- 基)-D-丙氨酸甲酯

将(R)-3-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-((叔丁氧羰基)氨基)丙酸酯(28mg,0.05mmol)在HCl(4M二恶烷溶液)(1mL,4mmol)溶液中的混合物在室温下搅拌1h。在减压下浓缩混合物。固体用乙醚研磨并过滤,得到(R)-2-氨基-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙酸甲酯二盐酸盐(12mg,收率65%)。MS m/z 380.1,382.1[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.49-7.56(m,1H),7.12-7.18(m,1H),6.45-6.51(m,1H),6.40-6.44(m,1H),4.75(s,2H),4.46-4.53(m,1H),3.90(s,3H),3.67-3.74(m,1H),3.58-3.66(m,1H),2.46(s,3H),3个NH未测出。

实例26(化合物127、化合物130和化合物132)

(2S)-2-氨基-1-[3,5-二氯-7-(2-噻吩基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙-1-醇二盐酸盐和

2-[(2S)-2-氨基-1-氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺甲酸盐和

2-[(2S)-2-氨基-1,1-二氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-羟基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸酯

向在-78℃下冷却的N-(3,5-二氯噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)-氨基甲酸叔丁酯(110mg,0.27mmol,2.0eq.)的THF(1.0mL)溶液中,加入LDA(2.0M,0.15mL,0.30mmol,2.2eq.)。15min后,逐滴加入Boc-L-丙氨醛(alaninal)(25mg,0.14mmol,1.0eq.)的THF(0.5mL)溶液,在30min内将温度升至0℃。反应采用饱和NH4Cl淬灭,然后采用乙酸乙酯稀释,并采用盐水洗涤,干燥,然后浓缩。残余物采用乙酸乙酯的己烷溶液(10至50%梯度)通过硅胶纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-羟基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(28mg,收率35%)。MS m/z588.2,590.2,592.5[M+H]+

步骤2:(2S)-2-氨基-1-[3,5-二氯-7-(2-噻吩基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶- 2-基]丙-1-醇二盐酸盐

采用HCl的二恶烷溶液,进行一般去保护程序,得到(2S)-2-氨基-1-[3,5-二氯-7-(2-噻吩基甲基氨基)噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]丙-1-醇二盐酸盐(20mg)。MS m/z 388.2,390.2,392.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.34(d,J=5.2Hz,1H),7.07-7.20(m,1H),7.00(t,J=4.0Hz,1H),6.89(s,1H),5.25(d,J=7.6Hz,1H),4.87(s,2H),3.59-3.70(m,1H),1.33(d,J=6.7Hz,3H),3个NH和1个OH未测出。

步骤3:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-氟-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2- b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在-78℃下,向N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-羟基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(30.0mg,0.0510mmol,1.00eq.)和DIPEA(26.9mg,0.036mL,0.20mmol,4.00eq.)的DCM(0.5mL)溶液中,加入DAST(1.0M DCM溶液,0.20mL,0.20mmol,4.00eq.)。将温度缓慢升至室温,并在室温下搅拌过夜。采用LC/MS检测反应中间体。反应采用饱和碳酸氢钠淬灭,然后用乙酸乙酯稀释,采用盐水洗涤,干燥,然后蒸发。残余物采用乙酸乙酯和己烷(10至50%梯度)通过硅胶纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-氟-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(17mg,收率56%)。MS m/z 590.3,592.2,594.2[M+H]+

步骤4:2-[(2S)-2-氨基-1-氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2- b]吡啶-7-胺甲酸盐

采用HCl的二恶烷溶液,进行一般去保护程序,然后采用甲酸作为流动相改性剂,进行反相HPLC纯化,得到2-[(2S)-2-氨基-1-氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺甲酸盐(8.0mg,收率64%)。MS m/z 390.2,392.2,394.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:8.23-8.56(br s,1H),7.33(d,J=4.3Hz,1H),7.06-7.17(m,1H),7.00(t,J=4.3Hz,1H),6.68(s,1H),6.34(d,J=45.3Hz,1H),4.79(s,2H),3.89-4.07(m,1H),1.39(d,J=6.4Hz,3H),3个NH未测出。

步骤5:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙酰基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯

将N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1-羟基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(28mg,0.048mmol,1.0eq.)和戴斯-马丁氧化剂(31mg,0.071mmol,1.5eq.)在DCM(0.5mL)中的混合物在室温下搅拌1h。移除DCM,残余物用乙醚稀释,向其中加入1.0M Na2S2O3和饱和碳酸氢钠。分离混合物。有机层用2.0M K2CO3和盐水洗涤,采用硫酸钠干燥并蒸发,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙酰基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(32mg),其无需进一步纯化即可用于下一步。MS m/z 586.2,588.3,590.3[M+H]+

步骤6:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1,1-二氟-丙基]-3,5-二氯-噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯

将N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙酰基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(32mg,0.055mmol,1.1eq.)和DAST(1.0M DCM溶液)(1.0mL,1.0mmol,21eq.)的混合物在室温搅拌过夜。LC/MS表明含有~13%的目标产品。将混合物转移到Eppendorf小瓶中,向其中加入Deoxo-Fluor(55mg,0.046mL,0.24mmol,5.0eq.),并将混合物在室温下搅拌6h,然后用饱和碳酸氢钠淬灭。混合物用乙酸乙酯萃取,采用水和盐水洗涤,用硫酸钠干燥和蒸发。残余物采用乙酸乙酯的己烷溶液(5至50%梯度)通过硅胶纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-1,1-二氟-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(3.5mg,收率12%)。MS m/z608.2,610.2,612.2[M+H]+

步骤7:2-[(2S)-2-氨基-1,1-二氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-胺

采用HCl的二恶烷溶液,进行一般去保护程序,然后采用甲酸作为流动相改性剂,进行反相HPLC纯化,得到呈游离碱形式的2-[(2S)-2-氨基-1,1-二氟-丙基]-3,5-二氯-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(2.3mg,收率98%)。MS m/z 408.3,410.3,412.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.28-7.38(m,1H),7.07-7.17(m,1H),6.95-7.05(m,1H),6.73(s,1H),4.79(s,2H),4.47-4.58(br s,1H),1.40(br d,J=7.0Hz,3H),3个NH未测出。

根据实例26的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例27(化合物149)

5-氯-3-(二氟甲氧基)-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:N-(5-氯-3-羟基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸 叔丁酯

向在-78℃下冷却的N-(3-溴-5-氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(460mg,1.0mmol,1.0eq.)和2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(220mg,0.24mL,1.2mmol,1.2eq.)在THF(1.0mL)和甲苯(4.0mL)中的混合物中,滴加n-BuLi(2.5M己烷溶液,0.48mL,1.2mmol,1.2eq.)。将混合物在-78℃下搅拌1h,然后用饱和氯化铵淬灭,用乙酸乙酯稀释,用盐水洗涤,然后干燥并浓缩。向残余物中加入Et2O(10mL),然后加入过氧化氢(30质量%水溶液,0.41mL,4.0mmol,4.0eq.)。将混合物在室温下搅拌16h,然后用乙醚稀释,用饱和硫代硫酸钠处理并分离。将有机层用水和盐水洗涤,用硫酸钠干燥,并浓缩。残余物采用乙酸乙酯的己烷溶液(5至40%梯度)通过硅胶纯化,得到N-(5-氯-3-羟基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(294mg,收率74%)。MS m/z 397.3,399.3[M+H]+

步骤2:N-(5-氯-3-(二氟甲氧基)-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基) 氨基甲酸叔丁酯

将N-(5-氯-3-羟基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.252mmol,1.00eq.)、氯二氟乙酸钠(91.1mg,0.579mmol,2.30eq.)和Cs2CO3(115mg,0.353mmol,1.40eq.)在DMF(240mg)和水(0.025mL)中的混合物在100℃下搅拌16h,然后冷却,采用乙酸乙酯稀释,然后用盐水洗涤,干燥并蒸发。残余物采用乙酸乙酯的己烷溶液(5至25%梯度)通过硅胶纯化,得到N-(5-氯-3-(二氟甲氧基)-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-噻吩基甲基)氨基甲酸叔丁酯(29mg,收率26%)。MS m/z 447.1,449.1[M+H]+

步骤3:5-氯-3-(二氟甲氧基)-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

采用HCl的二恶烷溶液,进行一般去保护程序,采用甲酸为改性剂,通过C18 EZ-Prep纯化,得到5-氯-3-(二氟甲氧基)-N-(2-噻吩基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺。MS m/z 347.0,349.0[M+H]+1H NMR(CDCl3)δ:7.31-7.36(m,1H),7.22-7.26(m,1H),7.10-7.15(m,1H),7.03-7.07(m,1H),6.95-6.98(t,J=77Hz,1H),6.62(s,1H),4.87-5.01(m,1H),4.75(br s,2H)。

根据实例27的程序,替换合适的起始材料、试剂和反应条件制备以下化合物。

实例28(化合物167)

2-[(2R)-2-氨基-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯-N-(2-呋喃基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯- 噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基硫酰基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(119.6mg,0.19mmol,1.0eq.)在THF(2.0mL)和水(1.0mL)混合溶剂中的搅拌溶液中,加入高碘酸钠(60mg,0.28mmol,1.4eq.)。将反应在0℃下搅拌1h,然后升至室温并搅拌48h。用水淬灭反应,然后用EtOAc(2×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,用硫酸钠干燥,然后浓缩,得到粗产物,粗产物通过快速柱色谱法(0-80%EtOAc的DCM溶液)纯化,得到呈浅黄色泡沫状的N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(103.3mg,收率84%)。MS m/z 640.1,642.1,[M+Na]+1H NMR(丙酮-d6)δppm:7.46(br d,J=4.4Hz,1H),7.39(s,1H),6.44(br d,J=8.1Hz,1H),6.30-6.32(m,1H),6.27(t,J=2.7Hz,1H),4.98(s,2H),4.33-4.46(m,1H),3.49-3.56(m,1H),3.42(br dd,J=14.0,7.9Hz,1H),2.91-3.18(m,2H),2.63(s,2H),2.58(s,1H),1.43(s,9H),1.37(s,9H)。

步骤2:叔-2-[(2R)-2-氨基-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯-N-(2-呋喃基甲 基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

向N-[2-[(2R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-呋喃基甲基)氨基甲酸叔丁酯(103.3mg,0.167mmol,1.0eq.)的乙腈(3.0mL)和THF(1.0mL)溶液中,加入对甲苯磺酸一水合物(135mg,0.672mmol,4.0eq.),并加热至60℃,然后在60℃下搅拌1h。LC-MS分析表明,起始材料完全消耗。反应混合物用碳酸钠(水溶液,0.3M,5mL)淬灭,然后采用EtOAc(2x30mL)萃取。将合并的有机相用硫酸钠干燥,然后浓缩得到粗产物,粗产物在高真空下干燥过夜,得到呈灰白色固体状的2-[(2R)-2-氨基-3-甲基亚磺酰基-丙基]-3,5-二氯-N-(2-呋喃基甲基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(55.8mg,收率80%)。MS m/z 418.4,420.4,[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δppm:7.83-7.91(m,1H),7.60(s,1H),6.65(d,J=4.0Hz,1H),6.37-6.43(m,2H),4.50-4.55(m,2H),3.39-3.57(m,1H),3.31(s,3H),3.19(td,J=14.6,5.5Hz,1H),3.05(ddd,J=14.5,12.4,7.3Hz,1H),2.72-2.84(m,2H),2个NH未测出。

实例29(化合物129)

2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-N-[(5-氟噻唑-2-基)甲基]-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b] 吡啶-7-基]-N-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)氨基甲酸叔丁酯

向两颈圆底烧瓶中,加入溶于THF(0.25M)中的N-(5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)-N-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)氨基甲酸叔丁酯(1.95g,4.55mmol,1.0eq.),然后加入(4S)-4-甲基-2,2-二氧代-氧杂噻唑烷-3-羧酸叔丁酯(1.40g,5.91mmol,1.3eq.)。将混合物冷却至-78℃。向冷却的反应混合物中逐滴加入溶于THF/庚烷/乙苯中的二异丙基氨基锂(2.0M,2.7mL,5.45mmol,1.2eq.),搅拌反应至反应结束,反应结束通过UPLC监测。一旦反应结束(~1.5h),将反应从槽中移出,用1.0M柠檬酸淬灭,并用乙酸乙酯萃取。将合并的萃取物用水和盐水洗涤,用Na2SO4干燥,并浓缩。粗混合物进行柱色谱法(EtOAc/DCM,0-15%)纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)氨基甲酸叔丁酯(1.91g,收率72%)。MS m/z 586.4,588.4,[M+H]+1H NMR(CDCl3)δppm:7.25(s,1H),5.07(s,2H),4.47(br d,J=1.7Hz,1H),4.02(br s,1H),3.13-3.19(m,1H),3.05(br s,1H),2.43(s,3H),1.65(br s,1H),1.44(s,18H),1.17(d,J=6.7Hz,3H),0.98(s,1H),0.95(s,1H),0.03(s,9H),1个NH未测出。

步骤2:N-[(1S)-2-[7-(叔丁氧基羰基氨基)-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶- 2-基]-1-甲基-乙基]氨基甲酸叔丁酯

在氮气气氛下,向装有N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)氨基甲酸叔丁酯(0.41g,0.70mmol,1.0eq.)的反应管中,加入THF(7.0mL)和四丁基氟化铵(1mol/L)的THF(7mL,7.0mmol,10eq.)溶液。在40℃下搅拌反应12h。反应结束后,将反应冷却到室温,采用乙酸乙酯稀释,用水洗涤,干燥和浓缩。粗物质进行柱色谱法(EtOAc/DCM,0-15%)纯化,得到N-[(1S)-2-[7-(叔丁氧基羰基氨基)-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]-1-甲基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(19mg,收率6.0%)。MS m/z 456.4,458.4,[M+H]+1H NMR(CDCl3)δppm:6.61(s,1H),4.47(br s,1H),4.02(br s,1H),3.32-3.32(m,1H),3.09-3.16(m,1H),3.01-3.06(m,1H),2.41(s,3H),1.57(s,9H),1.43(s,9H),1.18(d,J=6.7Hz,3H)。

步骤3:N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b] 吡啶-7-基]-N-(5-氟噻唑-2-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯

将N-[(1S)-2-[7-(叔丁氧基羰基氨基)-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基]-1-甲基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(19mg,0.041mmol,1.0eq.)和(5-氟噻唑-2-基)甲醇(17mg,0.125mmol,3.0eq.)的甲苯(0.1M)溶液用N2鼓泡30min。向该混合物中加入1,1'-(偶氮二羰基)二哌啶(33mg,0.129mmol,3.1eq.),混合物再次用N2鼓泡,并再搅拌10min。加入三正丁基膦(28mg,0.138mmol,3.3eq.),并将反应混合物在30℃搅拌约17h。将混合物冷却至室温并真空浓缩。粗物质采用硅胶快速柱色谱法纯化,得到N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(5-氟噻唑-2-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯(13mg,收率55%)。MS m/z 571.3,573.3[M+H]+1H NMR(CDCl3)δppm:7.20(d,J=2.4Hz,1H),7.14(s,1H),4.99(s,2H),4.47(br d,J=1.1Hz,1H),4.01(br s,1H),3.12-3.17(m,1H),3.05(br s,1H),2.41(s,3H),1.44(s,18H),1.16(d,J=6.7Hz,3H)。

步骤4:2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-N-[(5-氟噻唑-2-基)甲基]-3-甲基-噻吩并[3, 2-b]吡啶-7-胺

向装有N-[2-[(2S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)丙基]-5-氯-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基]-N-(5-氟噻唑-2-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯(13mg,0.022mmol,1.0eq.)的反应管中,加入盐酸的二恶烷溶液(4.0M,1.0mL,4.0mmol),在室温搅拌1h。反应结束后,将反应用乙醚稀释并过滤,得到2-[(2S)-2-氨丙基]-5-氯-N-[(5-氟噻唑-2-基)甲基]-3-甲基-噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺(5.6mg,收率66%)。MS m/z371.2,373.2,[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δppm:7.41(d,J=2.0Hz,1H),7.04(s,1H),4.92(s,2H),3.63-3.71(m,1H),3.35-3.42(m,1H),3.23-3.29(m,1H),2.45(s,3H),1.38(d,J=6.4Hz,3H),3个NH未测出。

实例30(化合物148)

2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:2-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2- b]吡啶-2-基)-2-氰基乙酸乙酯

在氩气条件下,将根据中间体6中的程序制备的(5-氯-2-碘-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯溶液(202mg,0.40mmol,1.0eq.)和2-氰基乙酸乙酯(50mg,1.1eq.)的二恶烷(1.6mL)溶液,加入到KOtBu(116mg,2.5eq.)的二恶烷(0.5mL)悬浮液中,然后加入Pd(OAc)2(4.5mg,0.05eq.)和dppf(23mg,0.100eq.)。采用氩气鼓泡2min后,将反应密封并加热至70℃,保持2h。冷却后,反应用柠檬酸(1.0M)和EtOAc淬灭,然后用EtOAc萃取。粗材料采用0-60%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到呈橙色油状的2-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-氰基乙酸乙酯(145mg,收率74%)。MS m/z 490.1,492.1[M+H]+

步骤2:2-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2- b]吡啶-2-基)-2-氰基丙酸乙酯

在氩气条件下,向2-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-氰基乙酸乙酯(145mg,0.30mmol,1.0eq.)和K2CO3(62mg,1.5eq.)在丙酮(0.6mL)中的冷混合物中,加入MeI(127mg,3.0eq.)。将混合物在室温下搅拌3h,采用UPLC分析来指示反应结束。冷却到0℃后,反应用柠檬酸(1M)和EtOAc淬灭。粗产品无需进一步提纯直接用于下一步。MS m/z 504.1,506.1[M+H]+

步骤3:(5-氯-2-(1-氰乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基) 氨基甲酸叔丁酯

在室温下,将2-(7-((叔丁氧基羰基)(呋喃-2-基甲基)氨基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)-2-氰基丙酸乙酯(149mg,0.30mmol,1.0eq.)和K2CO3(62mg,1.5eq.)的混合物在MeOH(0.60mL)中搅拌3h,然后用EtOAc和柠檬酸(1.0M,水溶液)淬灭。粗材料采用0-50%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(5-氯-2-(1-氰乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(81mg,收率63%)。MS m/z 432.1,434.2[M+H]+

步骤4:(2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基 甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向(5-氯-2-(1-氰乙基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(81mg,0.19mmol,1.0eq.)的THF(2.0mL)冷却溶液中,滴加LAH(1.0MTHF溶液,0.28mL,1.5eq.)。搅拌15min后,将混合物升至室温,并在室温下继续搅拌3h。在0℃下,通过加入Na2SO4.xH2O(固体)淬灭反应。混合物在室温下搅拌1h,过滤,固体用MeOH洗涤。将合并的滤液浓缩,并采用5-100%ACN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,通过制备型HPLC纯化,得到(2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(10mg,收率12%)。MS m/z 436.2,438.2[M+H]+

步骤5:2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡 啶-7-胺

Boc-去保护的一般程序:在室温下,将(2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(10mg,0.022mmol)的混合物在HCl溶液(4M二恶烷溶液,1mL)中搅拌1h,然后移除有机挥发性物质。粗固体采用5-40%ACN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,通过制备型HPLC纯化,得到2-(1-氨基丙-2-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺甲酸盐(5.0mg,收率65%)。MS m/z 335.8,338.0[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:8.44(s,1H),7.46(t,J=1.2Hz,1H),6.62(s,1H),6.38(d,J=1.3Hz,1H),4.55(s,2H),3.69-3.74(m,1H),3.23-3.25(m,1H),3.18-3.20(m,1H),2.39(s,3H),1.48(d,J=6.6Hz,3H),3个NH未测出,甲酸盐。

实例31(化合物146)

2-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙-1-醇

步骤1:(5-氯-3-甲基-2-(丙-1-烯-2-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基 甲基)氨基甲酸叔丁酯

将根据中间体6的程序制备的(5-氯-2-碘-3-甲基噻吩[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(101mg,0.20mmol,1.0eq)和4,4,5,5-四甲基-2-(丙-1-烯-2-基)-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(46.0mg,1.3eq.)和Pd(dppf)Cl2(8.3mg,0.05eq.)在二恶烷(1mL)和K2CO3(2M H2O溶液,0.30mL,3.0eq.)中的混合物在75℃下搅拌3h。反应用EtOAc和水淬灭。粗材料采用0-5%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到呈无色油状的(5-氯-3-甲基-2-(丙-1-烯-2-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(75mg,收率90%),其直接用于下一步。MS m/z419.2,421.2[M+H]+

步骤2:(5-氯-2-(1-羟基丙-2-基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基 甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向(5-氯-3-甲基-2-(丙-1-烯-2-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(75mg,1.0eq.)的THF(1mL)冷却溶液中,逐滴加入9-BBN(0.5MTHF溶液,1mL,4.0eq.)。在0℃下搅拌1h后,将混合物升至室温,并继续搅拌过夜。然后将混合物冷却到0℃。加入EtOH(0.2mL),然后加入NaOAc(饱和溶液,0.5mL)和过氧化氢(30wt%水溶液,0.2mL)。将混合物在0℃下继续搅拌1h,在室温下搅拌5h,然后用EtOAc和水淬灭。有机相用水和盐水洗涤。粗材料采用0-60%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到呈浅黄色油状的(5-氯-2-(1-羟基丙-2-基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(62mg,收率79%)。MS m/z437.2,439.2[M+H]+

步骤3:2-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基) 丙-1-醇

在室温下,将(5-氯-2-(1-羟基丙-2-基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(16mg,0.037mmol)和HCl(4M)在二恶烷(1.0mL)中的混合物搅拌1h。混合物用乙醚(2x)稀释并过滤。滤饼用乙醚洗涤、收集和干燥,得到2-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丙-1-醇(6mg,收率48%)。MSm/z337.1,339.1[M+H]+1H NMR(DMSO-d6)δ:7.59(s,1H),7.50(br s,1H),6.52(s,1H),6.39(d,J=1.3Hz,1H),6.34(d,J=1.3Hz,1H),4.90(br s,1H),4.49(s,2H),3.51-3.55(m,2H),3.43-3.48(m,1H),2.24(s,3H),1.27(d,J=6.1Hz,3H)。

实例32(化合物150和化合物151)

2-[(2R,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺和

2-[(2S,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺

步骤1:(5-氯-3-甲基-2-(1-氧代丙-2-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基 甲基)氨基甲酸叔丁酯

在0℃下,向根据实例31程序制备的(5-氯-2-(1-羟基丙-2-基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(141mg,0.32mmol,1.0eq.)的DCM(1.0mL)溶液中加入马丁试剂(171mg,1.2eq.)。将淡粉色溶液在室温下搅拌1h,UPLC分析表明反应结束。将混合物过滤,并用DCM洗涤固体。合并滤液,用NaHCO3(饱和水溶液)洗涤并浓缩。所得粗产品无需进一步纯化即可用于下一步。MS m/z433.3,435.3[M-H]+

步骤2:(2-((E)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)亚氨基)丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩 并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯

将(5-氯-3-甲基-2-(1-氧代丙-2-基)噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(115mg,0.26mmol,1.0eq.)、R-(+)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(48mg,1.5eq.)和CuSO4(215mg,5.0eq.)在DCE(0.5mL)中的混合物,在室温搅拌18h。冷却后,混合物用0-30%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到(2-((E)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)亚氨基)丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(79mg,收率49%)。MS m/z 560.2,562.2[M+Na]+

步骤3:(R)-N-((2S,3R/S)-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺和(R)-N-((2S,3S/R)-3-(5-氯-7- ((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺 酰胺

在-78℃下,向(2-((E)-1-(((R)-叔丁基亚磺酰基)亚氨基)丙-2-基)-5-氯-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-基)(呋喃-2-基甲基)氨基甲酸叔丁酯(70mg,0.13mmol,1.0eq.)的DCM(0.9mL)溶液中加入MeMgBr(3.0M Et2O溶液,0.11mL,2.5eq.)。将混合物升温至-50℃,并在-50℃保持4h,然后升至室温,并继续搅拌过夜。反应用NH4Cl饱和溶液淬灭。混合物用EtOAc稀释,然后依次用水和盐水洗涤,有机层用硫酸钠干燥并蒸发。残余物用0-100%EtOAc的己烷溶液洗脱,通过硅胶快速柱色谱法纯化,得到两种非对映异构体的混合物,将该混合物用10-80%CH3CN的水溶液(含0.1%甲酸)洗脱,在制备型HPLC上进一步纯化,得到(R)-N-((2S,3R/S)-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(18mg,收率45%),MS m/z 454.3,456.3[M+H]+;和(R)-N-((2S,3S/R)-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(20mg,收率42%),MS m/z 454.3,456.3[M+H]+

步骤4:2-[(2R,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并 [3,2-b]吡啶-7-胺

在室温下,将(R)-N-((2S,3R/S)-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(18mg,0.04mmol)和HCl(4M)在二恶烷(1.0mL)中的混合物搅拌1h。混合物用乙醚(2x)稀释并过滤。滤饼用乙醚洗涤、收集和干燥,得到2-((2R/S,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(5.4mg,收率41%)。MS m/z350.2,352.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.50(d,J=1.1Hz,1H),7.16(s,1H),6.48(d,J=3.0Hz,1H),6.42(dd,J=3.0,1.1Hz,1H),4.77(s,2H),3.69–3.71(m,1H),3.58–3.61(m,1H),2.50(s,3H),1.50(d,J=7.0Hz,3H),1.44(d,J=6.56Hz,3H),3个NH未测出。

2-[(2S,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-[(呋喃-2-基)甲基]-3-甲基噻吩并[3,2- b]吡啶-7-胺

在室温下,将(R)-N-((2S,3S/R)-3-(5-氯-7-((呋喃-2-基甲基)氨基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-2-基)丁-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(20mg,0.04mmol)和HCl(4M)在二恶烷(1.0mL)中的混合物搅拌1h。混合物用乙醚(2x)稀释并过滤。滤饼用乙醚洗涤、收集和干燥,得到2-((2R/S,3S)-3-氨基丁-2-基)-5-氯-N-(呋喃-2-基甲基)-3-甲基噻吩并[3,2-b]吡啶-7-胺盐酸盐(7.4mg,收率53%)。MS m/z350.2,352.2[M+H]+1H NMR(甲醇-d4)δ:7.50(d,J=1.1Hz,1H),7.10(s,1H),6.46(d,J=3.2Hz,1H),6.42(dd,J=3.0,1.1Hz,1H),4.74(s,2H),3.64-3.67(m,1H),3.55-3.58(m,1H),2.47(s,3H),1.54(d,J=7.0Hz,3H),1.27(d,J=6.56Hz,3H),3个NH未测出。

生物学实例

以下体外生物学实例证明了本说明书的化合物用于治疗家族性自主神经功能障碍的用途。

为了更详细地描述和帮助理解本说明书,提供以下非限制性生物学实例,从而更全面地说明本说明书的范围,并且不应被解释为具体限制其范围。本说明书现在已知的或以后开发的这些变化,将在本领域技术人员确信的范围内,被认为属于本说明书和下文权利要求保护的范围。

实例1

IKBKAP-HTRF检测

本检测用于采用(均相时间分辨荧光)技术定量测定细胞裂解物中Elongator复合蛋白1(ELP1,也称为IKBKAP)的浓度。在夹心HTRF测定中,通过使用供体标记的抗-IKAP抗体和受体标记的抗-IKAP抗体检测IKBKAP。

实验方案

将细胞解冻并在DMEM-10%FBS中培养72小时。将细胞用胰蛋白酶化、计数,并在DMEM-10%FBS中以50,000个细胞/mL的浓度重悬。将199μL细胞悬液以每孔10,000个细胞的数量接种在96孔微量滴定板中,并培养3至5小时。为了提供对照信号,三个孔不接收细胞并用作空白对照孔。将测试化合物在100%DMSO中连续稀释3.16倍,生成7点浓度曲线。将1μL200x化合物溶液转移到含细胞的孔中,并将细胞在细胞培养箱(37℃、5%CO2、100%相对湿度)中培养48小时。每个化合物浓度设置三个平行样品。48小时后,从细胞中取出上清液,将50μL含有蛋白酶抑制剂的1x LB4裂解缓冲液加入到细胞中,并在室温下振荡培养1小时。随后将该裂解物的36μL试样转移到含有4μL抗体溶液(检测缓冲液中抗IKAP d2和抗IKAP K(9+8)的1:50稀释液)的384孔板中。然后,将384-孔板离心1分钟,使溶液位于板底部,并在4℃下培养过夜。采用EnVision酶标仪(Perkin Elmer)测量板中每个孔在665nm和620nm处的荧光。每个样品的ΔF按以下公式计算:

其中信号是每个样品孔的归一化荧光,而空白是空白对照孔的平均归一化平均荧光。

表1中给出了式(I)化合物或其形式的IKBKAP蛋白质丰度相对于溶媒对照的最大倍数增加(MFI)。MFI由每个样品孔的ΔF值除以溶媒对照孔的样品ΔF计算得出。

MFI≤1.9用一颗星(*)表示,在>1.9和≤2.9之间用两颗星(**)表示,在>2.9和≤3.9之间用三颗星(***)表示,和>3.9和≤4.9之间用四颗星(****)表示,>4.9用五颗星(*****)表示。

表1中示出了从根据生物学实例1中的实验方案的每个测试化合物生成的7点浓度曲线获得的IKBKAP蛋白表达的EC2x。术语“IKBKAP蛋白表达的EC2x”定义为与DMSO溶媒对照产生的IKBKAP蛋白数量相比,在FD患者细胞中有效产生两倍IKBKAP蛋白数量的测试化合物的浓度。

Ec2x>1μM用一颗星(*)表示,在>0.5μM和≤1μM之间用两颗星(**)表示,在>0.02μM和≤0.5μM之间用三颗星(***)表示,在>0.005μM和≤0.02μM之间用四颗星(****)表示,≤0.005μM用五颗星(*****)表示。

表1

不管本文引用的文献是否具体地且特定地指示为通过引用而并入本申请中,本文提及的所有文献均出于任何和所有目的通过引用而全部并入本申请中,其引用的程度就如同每篇单独的文献在本文完全阐述一般。

现在已经完整地描述了权利要求的主题,本领域普通技术人员将理解的是,可以在广泛的相当物范围内执行相同的内容而不影响本文描述的主题或特定方面的范围。所附权利要求旨在解释为包括所有此类相当物。

147页详细技术资料下载
上一篇:一种医用注射器针头装配设备
下一篇:神经功能调节剂

网友询问留言

已有0条留言

还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!

精彩留言,会给你点赞!