阅读说明：本技术 用于快速筛选重组菌株的重组表达载体及应用 (Recombinant expression vector for rapidly screening recombinant strain and application thereof ) 是由 姚斌 苏小运 高飞 罗会颖 黄火清 柏映国 王苑 涂涛 王亚茹 孟昆 于 2018-07-27 设计创作，主要内容包括：本发明属于农业生物技术领域,具体涉及一种用于快速筛选高表达菌株的重组表达载体和快速筛选高表达菌株的方法。本发明将一个外源的红色荧光蛋白和烟曲霉细胞表面蛋白定位信号融合表达,将该融合基因(DsRed-AfMP1)整合到里氏木霉基因组中,从而构建里氏木霉表面展示红色荧光蛋白的菌株。将表面展示红色荧光蛋白的里氏木霉菌株通过流式细胞仪分选,可以快速分离出有益于纤维素酶活提高的基因变化。(The invention belongs to the technical field of agricultural biology, and particularly relates to a recombinant expression vector for rapidly screening high-expression strains and a method for rapidly screening the high-expression strains. According to the invention, an exogenous red fluorescent protein and an Aspergillus fumigatus cell surface protein positioning signal are fused and expressed, and the fusion gene (DsRed-AfMP1) is integrated into a Trichoderma reesei genome, so that a strain for displaying the red fluorescent protein on the surface of Trichoderma reesei is constructed. The Trichoderma reesei strain with the surface displaying the red fluorescent protein is sorted by a flow cytometer, and the gene change beneficial to improving the cellulase activity can be quickly separated.)

用于快速筛选重组菌株的重组表达载体及应用

技术领域

本发明属于农业生物技术领域，具体涉及一种用于快速筛选重组菌株的重组表达载体及应用。

背景技术

植物细胞壁主要由纤维素(cellulose)、半纤维素(hemicellulose)和木质素(lignin)组成。其中，纤维素作为构建细胞壁的主要成分，是一种由8,000-10,000个葡萄糖通过β-l,4-糖苷键连接而形成的天然线性大分子聚合物，以纤维二糖为其基本单元。将植物细胞壁中的纤维素多糖降解为可发酵的简单寡糖和单糖如葡萄糖需要复杂的纤维素酶酶系协同作用。

里氏木霉作为主要的丝状真菌之一，具有强大的分泌纤维素酶的能力。工业上，经改造的里氏木霉，其产纤维素酶的产量可达到100g/L以上，因此，在降解植物细胞壁多糖以及相关应用上具有重要的应用价值。

里氏木霉的纤维素酶系包括两个外切纤维素酶、五个内切纤维素酶、一个β-葡萄糖苷酶和三个裂解性多糖单加氧酶(lytic polysaccharides monooxygenases,LPMOs，即原GH61家族成员)。

随着里氏木霉遗传操作体系的不断优化，其转化效率已经可以基本满足工业的需要，但当得到大量的转化子时，如何筛选高效表达目的蛋白的转化子成了问题的关键。里氏木霉为丝状真菌，不同于常见的单一纯系菌落，里氏木霉为多核的菌落为多核菌丝相互缠绕形成的菌团结构。为了在高假阳性背景的转化平板上获得纯系转化子，只能通过繁琐的单孢分离过程分离单核孢子，导致遗传改造周期过长，进而导致筛选高表达量的菌株更加费时费力。

流式细胞仪技术(Flow cytometry)是一种对处在液流中的单个细胞或其它生物颗粒等进行快速定量分析和分选的技术。流式细胞仪可以高速分析上万个细胞，同时从一个细胞中测得多个细胞特征参数，进行定性或定量分析，具有速度快、精度高、准确性好等特点。但是现有的流式检测技术只能检测到作用于转录阶段的调控因子变化，而无法检测转录阶段后期的调控因子变化。里氏木霉纤维素酶通过转录、翻译、转运和糖基化修饰等多个关键环节后进行分泌表达，而非胞内表达。因此，现有的只能检测转录水平变化的流式检测技术不能满足筛选酶活提高的纤维素酶的要求。

发明内容

为了解决现有技术中存在的无法快速筛选酶活提高的里氏木霉转化子的问题，本申请提供一种用于快速筛选重组菌株的重组表达载体和快速筛选及应用，本发明能够快速筛选里氏木霉纤维素酶高产菌株，大大缩短了筛选时间，提高了筛选的工作效率，获得高产量纯系转化子，以适应实际生产的需要。

本发明的目的在于提供一种用于快速筛选高表达菌株的重组表达载体。

本发明的再一目的在于提供一种含有上述重组表达载体的重组菌株。

本发明的再一目的在于提供快速筛选高表达纤维素酶的里氏木霉的方法。

本发明的再一目的在于提供一种快速筛选高表达纤维素酶且高酶活的里氏木霉的方法。

根据本发明

具体实施方式

，用于快速筛选高表达菌株的重组表达载体，在所述重组表达载体的基因表达盒中由上游到下游依次包括元件：cbh1启动子、红色荧光蛋白基因DsRed、细胞表面蛋白锚定信号肽基因AfMp1及cbh1终止子，其中，DsRed基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，AfMp1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

cbh1启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示：

Tcaacctttggcgtttccctgattcagcgtacccgtacaagtcgtaatcactattaacccagactgaccggacgtgttttgcccttcatttggagaaataatgtcattgcgatgtgtaatttgcctgcttgaccgactggggctgttcgaagcccgaatgtaggattgttatccgaactctgctcgtagaggcatgttgtgaatctgtgtcgggcaggacacgcctcgaaggttcacggcaagggaaaccaccgatagcagtgtctagtagcaacctgtaaagccgcaatgcagcatcactggaaaatacaaaccaatggctaaaagtacataagttaatgcctaaagaagtcatataccagcggctaataattgtacaatcaagtggctaaacgtaccgtaatttgccaacggcttgtggggttgcagaagcaacggcaaagccccacttccccacgtttgtttcttcactcagtccaatctcagctggtgatcccccaattgggtcgcttgtttgttccggtgaagtgaaagaagacagaggtaagaatgtctgactcggagcgttttgcatacaacc

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DsRed基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示：

ggcggctccggctccggctccggctccagcactggtactgccactgcctccaccagcaccaacctcctcAAGactggcgccgccagcaaggagcacttcagctactccctcggcggtgccgtcgtcgcggccgccatcgccgtcgctctctaa

AfMp1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示：

Atggacaacaccgaggacgtcatcaaggagttcatgcagttcaaggtgcgcatggagggctccgtgaacggccactacttcgagatcgagggcgagggcgagggcaagccctacgagggcacccagaccgccaagctgcaggtgaccaagggcggccccctgcccttcgcctgggacatcctgtccccccagttccagtacggctccaaggcctacgtgaagcaccccgccgacatccccgactacatgaagctgtccttccccgagggcttcacctgggagcgctccatgaacttcgaggacggcggcgtggtggaggtgcagcaggactcctccctgcaggacggcaccttcatctacaaggtgaagttcaagggcgtgaacttccccgccgacggccccgtaatgcagaagaagactgccggctgggagccctccaccgagaagctgtacccccaggacggcgtgctgaagggcgagatctcccacgccctgaagctgaaggacggcggccactacacctgcgacttcaagaccgtgtacaaggccaagaagcccgtgcagctgcccggcaaccactacgtggactccaagctggacatcaccaaccacaacgaggactacaccgtggtggggcagtacgagcacgccgaggcccgccactccggctcccag

cbh1终止子的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示：

Agctccgtggcgaaagcctgacgcaccggtagattcttggtgagcccgtatcatgacggcggcgggagctacatggccccgggtgatttattttttttgtatctacttctgacccttttcaaatatacggtcaactcatctttcactggagatgcggcctgcttggtattgcgatgttgtcagcttggcaaattgtggctttcgaaaacacaaaacgattccttagtagccatgcattttaagataacggaatagaagaaagaggaaattaaaaaaaaaaaaaaaacaaacatcccgttcataacccgtagaatcgccgctcttcgtgtatcccagtaccacggcaaaggtatttcatgatcgttcaatgttgatattgttcccgccagtatggctccacccccatctccgcgaatctcctcttctcgaacgcggtagtggcgcgccaattggtaatgacccatagggagacaaacagcataatagcaacagtggaaatt

本发明还提供了用于快速筛选高表达菌株的重组表达载体的重组菌株，所述重组菌株优选为里氏木霉。

本发明还提供了快速筛选重组里氏木霉的方法，所述方法包括以下步骤：

(1)将含有元件cbh1启动子、红色荧光蛋白基因DsRed、细胞表面蛋白锚定信号肽基因AfMp1及cbh1终止子的基因表达盒导入质粒中，得到重组表达载体，其中，DsRed基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，AfMp1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

(2)用步骤(1)构建的重组表达载体转化宿主细胞，得到重组菌株；

(3)培养重组菌株，诱导红色荧光蛋白表达于重组菌株的表面；

(4)筛选展示红色荧光的重组菌株。

根据本发明的具体实施方式，用流式细胞仪筛选表面展示红色荧光的重组菌株，得到重组菌株。

本发明还提供了快速筛选高表达纤维素酶且高酶活的里氏木霉的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

(1)将含有元件cbh1启动子、红色荧光蛋白基因DsRed、细胞表面蛋白锚定信号肽基因AfMp1及cbh1终止子的基因表达盒导入质粒中，得到重组表达载体，其中，DsRed基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，AfMp1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

(2)用步骤(1)构建的重组表达载体转化宿主细胞，得到重组里氏木霉；

(3)向步骤(2)得到的所述重组里氏木霉中导入蛋白分泌途径相关的基因，或者向步骤(2)得到的重组里氏木霉中随机***载体或基因，获得重组里氏木霉的突变体库；

(4)用流式细胞仪筛选表面展示强烈红色荧光的重组里氏木霉；

(5)测定步骤(4)中筛选重组里氏木霉的纤维素酶酶活，获得纤维素酶酶活提高的重组里氏木霉。

根据本发明的具体实施方式，快速筛选与提高纤维素酶酶活相关的蛋白分泌途径相关基因的方法中，步骤(3)中，与蛋白分泌途径相关基因包括bip1基因、hac1基因、ftt1基因、sso2基因、sar1基因、ypt1基因。

bip1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示：

ataaagtggcccatcgtcacctctcggcttcaactcgagtttttccctttttccttttcttcttcttcttcaaacaaagataccccccctcaacccggtgcaaccagcctggtccgaggacaaaacacgatagagctcgctgcgttggatcgctgcgcgtcttctcttgttctctctctcttttcttctctgcaacgcttataactctttttgcgcggggcatctgggaaaaccgtttcttcacacatctcttcttccacaatggctcgttcacggagctccctggccctcgggctgggcctgctctgctggatcacgctgctcttcgctcctctggcgtttgtcggaaaggccaatgccgcgagcgacgacgcggacaactacggcactgttatcggaattgtaagtcgactgacggcagcaaccccgccattttcttggtgttgatgctcaggcagccctgctaacacgcttctcctccgcccaggatctcggaactacctacagctgcgtcggtgtgatgcagaagggcaaggttgagattctcgtcaacgaccagggtaaccgaatcactccctcctacgtggcctttaccgacgaggagcgtctggttggcgattccgccaagaaccaggccgccgccaaccccaccaacaccgtctacgatgtcaagtcagttctaccgccctgttggcttctattgtataagtggacaattagctaactgttgtcacaggcgattgattggccgcaaattcgacgagaaggagatccaggccgacatcaagcacttcccctacaaggtcattgagaagaacggcaagcccgtcgtccaggtccaggtcaacggccagaagaagcagtt cactcccgaggagatttctgccatgattcttggcaagatgaaggaggttgccgagtcgtacctgggcaagaaggttacccacgccgtcgtcaccgtccctgcctacttcaacgtgagtcttttccccgaaattcctcgaggattccaagagccatctgctaacagcccgataggacaaccagcgacaggccaccaaggacgccggtaccattgccggcttgaacgttctccgaatcgtcaacgaacccaccgctgccgctatcgcctatggtctggacaagaccgacggtgagcgccagatcattgtctacgatctcggtggtggtacctttgatgtttctctcctgtccattgacaatggcgtcttcgaggtcttggctaccgccggtgacacccaccttggtggtgaggactttgaccagcgcattatcaactacctggccaaggcctacaacaagaagaacaacgtcgacatctccaaggacctcaaggccatgggcaagctcaagcgtgaagccgaaaaggccaagcgtaccctctcttcccagatgagcactcgtatcgaaatcgaggccttcttcgagggcaacgacttctccgagactctcacccgggccaagttcgaggagctcaacatggacctcttcaagaagaccctgaagcctgtcgagcaggttctcaaggacgccaacgtcaagaagagcgaggttgacgacatcgttctggtcggcggttccacccgtatccccaaggttcagtctcttatcgaggagtactttaacggcaagaaggcttccaagggtatcaaccccgacgaggctgttgctttcggtgccgccgtccaggccggtgtcctttctggtgaggaaggtaccgatgacattgttctcatggacgtcaaccccctgactctcggtatcgagaccactggcggagtcatgaccaagctcattccccgcaacacccccatccccactcgcaagagccagatcttctcgactgctgccgataaccagcccgtcgtcctgatccaggtcttcgagggtgagcgttccatgaccaaggacaacaacctcctgggcaagttcgagcttaccggcattcctcctgccccccgcggtgtcccccagattgaggtttccttcgagttggatgccaacggtatcctcaaggtctccgctcacgacaagggcaccggcaagcaggagtccatcaccatcaccaacgacaagggccgtctcacccaggaggagattgaccgcatggttgccgaggccgagaagttcgccgaggaggacaaggctacccgtgagcgcatcgaggcccgtaacggtcttgagaactacgccttcagcctgaagaaccaggtcaatgacgaggagggcctcggcggcaagattgacgaggaggacaaggagactgtaagttgaagcgatccatcactgctttctgatgcggacatgtcacactaacacttgaccagattcttgacgccgtcaaggaggctaccgagtggctcgaggagaacggcgccgacgccactaccgaggactttgaggagcagaaggagaagctgtccaacgtcgcctaccccatcacctccaagatgtaccagggtgctggtggctccgaggacgatggcgacttccacgacgaattgtaaaaaattaaaaaaagggaaattattgatgcatagatacttattagaggaaccaaagaagttcccaggtgttatcgtcggttatgacgcggatgtgttttcagtcttgtaaagttcgaatgcagctctgagtgtagtagatgcataaatgaatc

hac1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示：

ATGGCGTTCCAGCAGTCGTCTCCCCTCGTCAAGTTTGAGGCCTCTCCCGCCGAATCCTTCCTCTCCGCCCCCGGCGACAACTTCACATCCCTCTTCGCCGACTCAACACCCTCAACACTTAACCCTCGGGACATGATGACCCCTGACAGCGTCGCCGACATCGACTCTCGCCTGTCCGTCATCCCCGAATCACAGGACGCGGAAGATGACGAATCACACTCCACATCCGCTACCGCACCCTCTACCTCAGAAAAGAAGCCCGTCAAGAAGAGGAAATCATGGGGCCAGGTTCTTCCTGAGCCCAAGACCAACCTCCCTCCTCGAAAACGTGCAAAGACGGAAGATGAAAAGGAGCAGCGCCGCGTCGAGCGTGTTCTCCGCAACCGCCGCGCCGCGCAGTCCTCGCGCGAGCGCAAGAGGCTCGAGGTCGAGGCTCTCGAGAAGCGCAACAAGGAGCTCGAGACGCTCCTCATCAACGTCCAGAAGACCAACCTGATCCTCGTCGAGGAGCTCAACCGCTTCCGACGCAGCTCAGGCGTCGTCACCCGCTCGTCCTCCCCCCTCGACTCTCTCCAGGACAGCATCACTCTCTCCCAGCAACTCTTTGGCTCGCGGGATGGCCAAACCATGTCCAACCCCGAGCAGTCCTTGATGGACCAGATCATGAGATCTGCCGCTAACCCTACCGTTAACCCGGCCTCTCTTTCCCCCTCCCTCCCCCCCATCTCGGACAAGGAGTTCCAGACCAAGGAGGAGGACGAGGAACAGGCCGACGAAGATGAAGAGATGGAGCAGACATGGCACGAGACCAAAGAAGCCGCCGCCGCCAAGGAGAAGAACAGCAAGCAGTCCCGCGTCTCCACTGATTCGACACAACGTCCTGCAGTGTCAATCGGTGGAGATGCCGCTGTCCCTGTCTTCTCAGACGACGCCGGCGCAAACTGCCTTGGCCTGGACCCTGTTCATCAGGATGATGGTCCTTTCAGCATCGGCCATTCTTTCGGCCTGTCAGCGGCCCTTGATGCAGATCGCTATCTCCTCGAAAGCCAACTTCTCGCTTCGCCCAACGCCTCAACTGTTGACGACGATTATCTGGCTGGTGACTCTGCCGCCTGCTTCACGAATCCTCTCCCCTCCGACTACGACTTCGACATCAACGACTTCCTCACAGACGACGCAAACCACGCCGCCTATGACATTGTGGCAGCGAGCAACTATGCCGCTGCGGACCGCGAGCTCGACCTCGAGATCCACGACCCTGAGAATCAGATCCCTTCGCGACATTCTATCCAGCAGCCCCAGTCTGGCGCGTCCTCTCATGGATGCGACGATGGCGGCATTGCGGTTGGTGTCTGA

根据本发明的具体实施方式，快速筛选高表达蛋白分泌途径相关基因的菌株的方法的步骤(3)中，用根瘤农杆菌介导重组菌株，构建所述重组菌株的基因突变体库。

根据本发明具体实施方式，步骤(3)中，筛选重组载体以Ti质粒为骨架质粒，Ti质粒上连接有pry4基因，pry4基因的核苷酸序列如SEQ ID NO 7所示：

gactgacccccccggttgggcccctcgtcccgtctccaacagagcaccaccagacaaagacccctgcccgcgcgaatccagacccccccagcaattccgggcctcgttgatcctcctctactgtagttgtacatacatacctaccgactgcattgcattggtacagctgcaggcacttccaggcacggccaccaaattgcagcggcccttgcttgcttgcttggttcgagaactaggatctgtgtcttttgccttgccttgtcttgtctgggttcctgctcgtctgcggcaatcggaacgccgccagtgcggtgccaagcaaaccagccaaggtaggtacctaccactaggcttcttttctcgttgtctcactctctcttttcctctttgtcctctcttatccccatcttttctctctctctctgctcctttcctaaccacttccctacctttctctttttccttttcttgtcatctccatcttggctgacgaaaaaggtctgactgggtaggtattatctggcagacttgtgtgtatcattcaccctatttctgcttcatagtacatgtactgtacctgaacggctcaaccgctatttacgactcttatttttttgtggcgttggtcacgtttgccagctgttgtccgtctttctagggctcctcaaacttgacctgaccgagctccctttctggacccggtgggcttcact tccagctgctgagcgacctgagccgaacatcctcagtccttgtccagcgcaattcattttctttccttttctttttttttattcctttctttacttttattctctctttttctcctcttcctcttcttcttctttctcctcctcctccatatcctcactctcgtctccctcattactaccctctcggctcctcaggtccaccaaccctcccgcacccaaacctctgccgctgaaacccattcggtggtcgccgttttttttttttttttctcacccccaaagtcgcaatatcgggtatcgccgccggcattgaatcgccttctccgctagcatcgactactgctgctctgctctcgttgccagcgctgctccctagaattttgaccaggggacgagcccgacattaaagcaactccctcgcctcgagacgactcggatcgcacgaaattctcccaatcgccgacagttcctactcctcttcctcccgcacggctgtcgcgcttccaacgtcattcgcacagcagaattgtgccatctctctcttttttttccccccctctaaaccgccacaacggcaccctaagggttaaactatccaaccagccgcagcctcagcctctctcagcctcatcagccatggcaccacacccgacgctcaaggccaccttcgcggccaggagcgagacggcgacgcacccgctgacggcttacctgttcaagctcatggacctcaaggcgtccaacctgtgcctgagcgccgacgtgccgacagcgcgcgagctgctgtacctggccgacaagattggcccgtcgattgtcgtgctcaagacgcactacgacatggtctcgggctgggacttccacccggagacgggcacgggagcccagctggcgtcgctggcgcgcaagcacggcttcctcatcttcgaggaccgcaagtttggcgacattggccacaccgtcgagctgcagtacacgggcgggtcggcgcgcatcatcgactgggcgcacattgtcaacgtcaacatggtgcccggcaaggcgtcggtggcctcgctggcccagggcgccaagcgctggctcgagcgctacccctgcgaggtcaagacgtccgtcaccgtcggcacgcccaccatggactcgtttgacgacgacgccgactccagggacgccgagcccgccggcgccgtcaacggcatgggctccattggcgtcctggacaagcccatccactcgaaccggtccggcgacggccgcaagggcagcatcgtctccatcaccaccgtcacccagcagtacgagtccgtctcctcgccccggttaacaaaggccatcgccgagggcgacgagtcgctcttcccgggcatcgaggaggcgccgctgagccgcggcctcctgatcctcgcccaaatgtccagccagggcaacttcatgaacaaggagtacacgcaggcctgcgtcgaggccgcccgggagcacaaggactttgtcatgggcttcatctcgcaggagacgctcaacaccgagcccgacgatgcctttatccacatgacgcccggctgccagctgccccccgaagacgaggaccagcagaccaacggatcggtcggtggagacggccagggccagcagtacaacacgccgcacaagctgattggcatcgccggtagcgacattgccattgtgggccggggcatcctcaaggcctcagaccccgtagaggaggcagagcggtaccgatcagcagcgtggaaagcctacaccgagaggctgctgcgataggggagggaagggaagaaagaagtaaagaaaggcatttagcaagaagggggaaaagggagggaggacaaacggagctgagaaagagctcttgtccaaagcccggcatcatagaatgcagctgtatttaggcgacctctttttccatcttgtcgatttttgttatgacgtaccagttgggatgatggatgattgtaccccagctgcgattgatgtgtatctttgcatgcaacaacacgcgatggcggaggcgaactgcacattggaaggttcatatatggtcctgacatatctggtggatctggaagcatggaattgtatttttgatttggcatttgcttttgcgcgtggagggaacatatcaccctcgggcatttttcatttggtaggatggtttggatgcagttgatcgataagcttgatatcg

所述筛选标记基因为pyr4，是营养选择性标记基因乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶的基因。

本发明还提供快速筛选高与提高纤维素酶酶活相关的蛋白分泌途径相关基因的方法，包括以下步骤：

(1)构建含有红色荧光蛋白基因和细胞表面蛋白锚定信号肽基因的DsRed-AfMP1融合基因的重组表达载体，其中，DsRed基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，AfMp1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

(2)用步骤(1)构建的重组表达载体转化菌株，得到重组菌株；

(3)向步骤(2)得到的所述重组菌株中导入待筛选的目的基因，或者向步骤(2)得到的重组菌株中随机***载体或基因，获得重组菌株的突变体库；

(4)用流式细胞仪筛选表面展示红色荧光的重组菌株；

(5)测定步骤(4)中筛选出的表面展示红色荧光的重组菌株的纤维素酶酶活，获得纤维素酶酶活提高的重组菌株；

(6)确定纤维素酶酶活提高的重组菌株中所表达的外源目的基因，或被干扰的内源基因，从而获得与提高纤维素酶酶活相关的蛋白分泌途径相关基因。

本发明的有益效果：

本发明构建了含有融合基因表达盒的重组表达载体，表达盒由上游至下游依次连接cbh1启动子、cbh1基因信号肽序列、红色荧光蛋白基因、烟曲霉来源的MP1锚定蛋白信号肽序列和cbh1基因终止子。此重组表达载体可诱导菌株表面展示荧光，从而利于快速筛选。

本发明提供了一种快速筛选高表达纤维素酶的重组里氏木霉的方法，根据表达纤维素酶的重组里氏木霉的红色荧光强度的高低鉴定纤维素酶的表达能力，红色荧光强度越高的重组里氏木霉表达纤维素酶能力越强。为了将DsRed的表达与T.reesei纤维素酶的表达相关联，本发明将DsRed基因置于纤维素酶启动子的控制下。CBH1是里氏木霉中表达量最高的纤维素酶，占分泌蛋白的50～60％。因此，将DsRed基因与强诱导CBH1启动子的下游连接，其红色的深度与cbh1启动子的诱导程度正相关，再将DsRed和流氏细胞仪相耦联高通量筛选里氏木霉纤维素酶高产菌株。实验证明，具有信号肽的红色荧光蛋白可以有效锚定到细胞壁上，红色荧光强度越高的重组里氏木霉的纤维素酶表达能力越高。红色荧光蛋白的荧光强度可以很好地表征纤维素酶的表达量，细胞壁上红色荧光蛋白的荧光强度和发酵液中纤维素酶的分泌量呈正相关。

附图说明

图1为里氏木霉菌落，左图为SUS2：出发菌株，右图为SUS4：转入pDsRed-AfMP1质粒的阳性转化子；

图2显示荧光显微镜下里氏木霉菌丝，左图为表面展示红色荧光蛋白的里氏木霉菌丝；右图为明场下荧光显微镜中观察到的里氏木霉菌丝；

图3为流式细胞仪对分泌途径相关质粒转化子的流式分选图，；

图4显示流式筛选的分泌途径相关转化子的菌落PCR结果，其中，4-1为hac1菌落PCR，4-2为bip1菌落PCR，4-3为ypt1菌落PCR，4-4为sso2菌落PCR，4-5为sar1菌落PCR，4-6为ftt1菌落PCR；

图5为出发菌株及分泌途径相关基因转化子摇瓶发酵液的EG酶活测定结果图；

图6为改造分泌途径相关基因转化子的拷贝数鉴定图；

图7显示验证转化入农杆菌的Ti-pyr4质粒的菌落PCR结果；

图8为流式细胞仪对农杆菌随机***突变体库的流式分选图；

图9为对流式筛选的农杆菌随机***转化子菌落的PCR验证结果；

图10为农杆菌随机***转化子酶活的测定结果。

具体实施方式

下面结合附图对本发明做进一步的详细说明，以令本领域技术人员参照说明书文字能够据以实施。

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

下述实施例中所述MM培养基的成分包括：(NH₄)₂SO₄，5.0g/L；KH₂PO₄，15.0g/L；MgSO₄·7H₂O，0.6g/L；CaCl₂·2H₂O，0.6g/L；CoCl₂·6H₂O，0.0037g/L；FeSO₄·7H₂O，0.005g/L；ZnSO₄·7H₂O，0.0014g/L；MnSO₄·H₂O，0.0016g/L；葡萄糖(或Avicel等碳源)，20g/L；所用溶剂为水。

实施例1在里氏木霉细胞表面展示红色荧光蛋白

1.构建表达红色荧光蛋白和烟曲霉细胞表面蛋白锚定信号肽融合基因(DsRed-AfMP1)的重组质粒pDsRed-AfMP1

从含DsRed的质粒中扩增DsRed基因片段，以及从含AfMP1的质粒中扩增AfMP1基因片段，其中DsRed基因F端引物含有51bp的cbh1基因信号肽序列，将这两个片段通过overlapPCR连接起来。

从里氏木霉Tu6基因组中扩增cbh1启动子与终止子，构建cbh1p-DsRed-AfMp-cbh1t表达盒，同时将pAPA质粒线性化后与cbh1p-DsRed-AfMp-cbh1t表达盒采用无缝拼接的方式在体内做同源重组，然后转化大肠杆菌，挑选阳性转化子，并提取质粒。

2.pDsRed-AfMp1融合基因在里氏木霉菌株SUS2中的表达

将里氏木霉SUS2接种于土豆培养基(PDA)平板上，30℃静置培养7d待其产孢，将孢子刮下并接种于100mL含有uridine的PDB培养基中，30℃、180rpm振摇培养过夜。在12层纱布上过滤收集萌发的菌丝，加入10mg/mL的酵母破壁酶，在30℃消化1-2小时。收集原生质体，将pDsRed-AfMp1质粒以PEG介导的原生质体转化法转入里氏木霉SUS2菌株。

转化子在含1M山梨醇的MM-glucose琼脂培养基上生长、选择。挑取单个克隆，接种于MM-lactose琼脂培养基上，30℃培养箱中培养5d，观察颜色变化。能表达肉眼可见的红色，如图1所示，成功转化并表达pDsRed-AfMp1质粒的阳性转化子的表面展示红色荧光蛋白，该转化子命名为SUS4。

本发明通过在里氏木霉中表达于细胞表面展示的红色荧光蛋白，获得了能够在细胞表面表达红色荧光蛋白的转化子，转化子在MM-Avicel中培养24h后，如图2所示，在共聚焦显微镜下可以观察到红色荧光蛋白的表达。

实施例2.筛选高表达纤维素酶且纤维素酶酶活高的转化子

1.在里氏木霉SUS4中表达里氏木霉来源的蛋白分泌途径相关基因

选取6个表达里氏木霉来源的蛋白分泌途径相关基因片段：分别为bip1基因、hac1基因、ftt1基因、sso2基因、sar1基因、ypt1基因，并与适当的启动子和终止子连接，分别构建表达盒为：eno1p-bip1-eno1t、eno1p-hac1-eno1t、pdc1p-ftt1-pdc1t、pdc1p-sso2-pdc1t、gpd1p-sar1-gpd1t、gpd1p-ypt1-gpd1t。

将pAPA质粒线性化，分别和上述6个基因片段按1:2的摩尔比用无缝拼接法连接，构建6中分泌途径相关质粒：pAPA-eno1-bip1、pAPA-eno1-hac1、pAPA-pdc1-sso2、pAPA-pdc1-ftt1、pAPA-gpd1-sar1和pAPA-gpd1-ypt1。将重组质粒转化大肠杆菌T感受态细胞，对大肠杆菌菌落做菌落PCR，以鉴定6个片段是否分别已经连接到pAPA上。将PCR鉴定为阳性的大肠菌落挑取并接种于1mL LB(含100μg/mL氨苄)培养基上，37℃、220rpm振摇培养过夜，提取质粒，备用于转化。将上述六种分泌途径相关质粒等体积混合后，以PEG介导的原生质体转化法转入里氏木霉SUS4菌株。

将转化子菌块挑至新的筛选培养基PDA上进行培养，每个平板可挑4个转化子，28℃培养至产孢。用8ml无菌水冲洗平板上的孢子(所有转化子的孢子)，重悬混匀，200目筛过滤至无菌尖底离心管中，即为流式细胞仪分析及分选的孢子悬液，孢子浓度控制在10⁶至10⁸个孢子。

转化子孢子的分析使用流式细胞仪进行，样品压力设为1000EPS(每秒分析1000个信号颗粒)，利用前向角散射光面积和宽度图，去除粘连和杂信号，荧光信号使用488nm激光激发，利用RFP表达的阴性对照菌株设定电压以分辨表达的孢子集群。根据阴阳性孢子的信号差别，设门圈定阳性孢子区域，所有样品的分析在相同的方法下进行。将荧光信号最强的孢子直接分选到含PDA的6孔板中，共分选了36个转化子，培养至产孢，流式分选图如图3所示。

将筛选出的转化子孢子接种于25mL液体MM-glucose中，30℃、180rpm振摇培养1d。提取基因组DNA，通过PCR验证6个表达蛋白分泌相关的重组质粒是否已成功转化进入里氏木霉细胞。

将过流式细胞仪筛选出的分泌途径相关的转化子分别用6对分泌途径相关引物进行菌落PCR，以确定筛选出的红色荧光增强的转化子是含有何种分泌途径相关质粒。所用引物如下表所示，PCR片段大小约200bp，电泳结果如图4所示。

表1引物序列

如图4所示，流式细胞仪筛选出的36个转化子中共菌落PCR出31个转化子，其中22个为含hac1基因的转化子，9个为含bip1基因的转化子，且经测序为这两个转化子序列，其他四个分泌途径相关质粒序列均未扩增出。实验结果说明，hac1基因和bip1基因对DsRed-AfMP1转化子菌株的纤维素酶产生能力有增强作用，而另外4种分泌相关基因的过表达在当前菌株和培养条件下不能起到促进纤维素酶分泌表达的作用。

2.测定分泌相关的重组质粒转化子纤维素酶活

(1)诱导培养分选出的转化子

将出发菌株的孢子和流式细胞仪分选出的孢子，接种1×10⁷个于100mL MM-glucose培养基中。30℃、180rpm振摇培养1d。将菌丝用12层纱布过滤，收集菌丝并用大量无菌水冲洗，以去除残余的葡萄糖。

称取等量(500mg)的菌丝，接种于100mL MM-Avicel液体培养基中，出发菌株和每个转化子均做3个平行。30℃、180rpm振摇培养168h以诱导纤维素酶的生产。从第72h开始，每24h收集发酵液，储存于4℃冰箱备用。

(2)纤维素酶酶活测定

1)纤维素酶的提取

将每个时间段收集的2mL发酵液8000rpm离心取上清液。

2)纤维素酶酶活测定

对出发菌株SUS4和菌落PCR出的31个转化子的酶活进行测定。选取3-6d的发酵液，分别测定内切纤维素酶酶活(CMC酶活)。

内切纤维素酶酶活测定：采用羧甲基纤维素钠(CMC)作为底物进行测定。取1000mg羧甲基纤维素钠，用柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液(0.05M、pH 5.0)定容至50mL，得到2％的羧甲基纤维素钠溶液。

取酶液100μL，加入到10mL柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液(0.05M、pH 5.0)中，得到稀释101倍的酶液。在各试管中加入2％的羧甲基纤维素钠溶液和柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液(0.05M、pH 5.0)各0.45mL，50℃水浴平衡后，加入已经稀释的酶液0.1mL(空白先不加)，振荡混合均匀。50℃水浴保温30min，迅速冷却。向各试管中加入1.5mL DNS试剂，再向空白中加酶液0.1mL，混合均匀。在沸水中煮10min，迅速冷却。以0号管为参比，测定540nm的吸光度。1mL液体酶，在50℃、pH 5.0的条件下，每小时水解羧甲基纤维素钠，产生1μmol还原糖(以葡萄糖计)所需要的酶量定义为一个酶活力单位(U)。

酶活测定结果如图5所示，酶活提高的转化子一共7个，其中三个为含有hac1基因的转化子，命名为SUS4-H7，SUS4-H28，SUS4-H43，四个为含有bip基因的转化子，命名为SUS4-B3，SUS4-B5，SUS4-B26，SUS4-B31。

3.转化子的拷贝数的鉴定

转化子拷贝数的鉴定：转化子拷贝数的鉴定采用qRT-PCR的方法，选用7个转化子的基因组为模板，actin基因作为内参基因；将各基因组稀释5倍，取1μl为模板。引物如下：

RTQactF(5'-TGAGAGCGGTGGTATCCACG-3')

RTQactR(5'-GGTACCACCAGACATGACAATGTTG-3')

RTQhacF(5'-ACAACGTCCTGCAGTGTCAA-3')

RTQhacR(5'-TAGCGATCTGCATCAAGGGC-3')

RTQbipF(5'-AAGAAGGTTACCCACGCCG-3')

RTQbipR(5'-ATCAAAGGTACCACCACCGAG-3')

Bgl3P1基因的拷贝数用2^-△△Ct法相对定量。转化子拷贝数的鉴定结果如图6A和图6B所示，定量PCR分析表明，在染色体中整合了1至2个拷贝的HAC1和BIP1基因。

实施例3.构建基因突变体库以筛选高表达纤维素酶且高酶活的转化子

1.农杆菌pTi-pyr4质粒的构建

扩增里氏木霉转化pyr4基因，构建农杆菌pTi-pyr4质粒。

将构建好的pTi-pyr4质粒转化根癌农杆菌感受态AGL1中。该质粒含有木霉转化筛选标记基因pyr4，以及用以农杆菌随机***的左臂(LB)及右臂(RB)。

待转化子菌落长出后，挑取单菌落验证，菌落PCR验证目的基因pry4，如图7所示，扩增出的目的片段500bp，与预验证片段大小相吻合，送测序后比对正确。

2.构建农杆菌pTi-pyr4随机***里氏木霉突变体库

将已转入目的质粒pTi-pyr4的农杆菌(3μL)接种于3mL LB液体(含50μg/mL卡那霉素和25μg/mL利福平)于28℃摇床中220rpm培养。

制备SUS4里氏木霉孢子悬液，涂布至铺有玻璃纸的CM平板，24℃预萌发3h左右。将上述农杆菌菌液100μl涂布于已预萌发有里氏木霉真菌菌丝的CM平板，25℃黑暗环境下共培养，获得根癌农杆菌介导的里氏木霉突变体库。

在不含尿嘧啶和头孢霉素的MM平板上经初筛、复筛获得可正常生长的菌落,视为疑似转化子，抽提基因组DNA，并通过PCR验证转化子。

3.农杆菌pTi-pyr4随机***突变体库流式细胞仪分选

利用农杆菌介导的转化将pTi-pyr4质粒转化入SUS4菌株原生质体，成功构建了农杆菌转化突变体库，并将转化子通过转膜影印于含有头孢霉素的PDA平板上，如图8所示,产孢后过流式筛选，流式分选表面展示红色荧光的里氏木霉菌株。

用引物验证过流式筛选得到的转化子中是否含有质粒pTi-pry4。如图9所示，验证结果表明转化SUS4后筛选得到4个含有该质粒，分别为SUS4-T7、SUS4-T33、SUS4-T37、SUS4-T47。

4.过流式筛选得到的农杆菌pTi-pyr4随机***转化子酶活分析

以SUS4为对照菌株，对过流式筛选得到的转化子进行摇瓶发酵分析。MM+Avicel诱导后，取样测定上清中CMC-Na酶活。如图10所示，通过摇瓶发酵发现四株转化子的内切葡聚糖酶活性(26.3～33.3U/mL)分别高于亲本菌株(11.1U/mL)。

序列表

<110> 中国农业科学院饲料研究所

<120> 用于快速筛选重组菌株的重组表达载体及应用

<160> 7

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 1193

<212> DNA

<213> 里氏木霉(Trichodermareesei)

<400> 1

tcaacctttg gcgtttccct gattcagcgt acccgtacaa gtcgtaatca ctattaaccc 60

agactgaccg gacgtgtttt gcccttcatt tggagaaata atgtcattgc gatgtgtaat 120

ttgcctgctt gaccgactgg ggctgttcga agcccgaatg taggattgtt atccgaactc 180

tgctcgtaga ggcatgttgt gaatctgtgt cgggcaggac acgcctcgaa ggttcacggc 240

aagggaaacc accgatagca gtgtctagta gcaacctgta aagccgcaat gcagcatcac 300

tggaaaatac aaaccaatgg ctaaaagtac ataagttaat gcctaaagaa gtcatatacc 360

agcggctaat aattgtacaa tcaagtggct aaacgtaccg taatttgcca acggcttgtg 420

gggttgcaga agcaacggca aagccccact tccccacgtt tgtttcttca ctcagtccaa 480

tctcagctgg tgatccccca attgggtcgc ttgtttgttc cggtgaagtg aaagaagaca 540

gaggtaagaa tgtctgactc ggagcgtttt gcatacaacc aagggcagtg atggaagaca 600

gtgaaatgtt gacattcaag gagtatttag ccagggatgc ttgagtgtat cgtgtaagga 660

ggtttgtctg ccgatacgac gaatactgta tagtcacttc tgatgaagtg gtccatattg 720

aaatgtaagt cggcactgaa caggcaaaag attgagttga aactgcctaa gatctcgggc 780

cctcgggcct tcggcctttg ggtgtacatg tttgtgctcc gggcaaatgc aaagtgtggt 840

aggatcgaac acactgctgc ctttaccaag cagctgaggg tatgtgatag gcaaatgttc 900

aggggccact gcatggtttc gaatagaaag agaagcttag ccaagaacaa tagccgataa 960

agatagcctc attaaacgga atgagctagt aggcaaagtc agcgaatgtg tatatataaa 1020

ggttcgaggt ccgtgcctcc ctcatgctct ccccatctac tcatcaactc agatcctcca 1080

ggagacttgt acaccatctt ttgaggcaca gaaacccaat agtcaaccgc ggactgcgca 1140

tcatgtatcg gaagttggcc gtcatctcgg ccttcttggc cacagctcgt gct 1193

<210> 2

<211> 153

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

ggcggctccg gctccggctc cggctccagc actggtactg ccactgcctc caccagcacc 60

aacctcctca agactggcgc cgccagcaag gagcacttca gctactccct cggcggtgcc 120

gtcgtcgcgg ccgccatcgc cgtcgctctc taa 153

<210> 3

<211> 675

<212> DNA

<213> 烟曲霉(Aspergillus funigatus)

<400> 3

atggacaaca ccgaggacgt catcaaggag ttcatgcagt tcaaggtgcg catggagggc 60

tccgtgaacg gccactactt cgagatcgag ggcgagggcg agggcaagcc ctacgagggc 120

acccagaccg ccaagctgca ggtgaccaag ggcggccccc tgcccttcgc ctgggacatc 180

ctgtcccccc agttccagta cggctccaag gcctacgtga agcaccccgc cgacatcccc 240

gactacatga agctgtcctt ccccgagggc ttcacctggg agcgctccat gaacttcgag 300

gacggcggcg tggtggaggt gcagcaggac tcctccctgc aggacggcac cttcatctac 360

aaggtgaagt tcaagggcgt gaacttcccc gccgacggcc ccgtaatgca gaagaagact 420

gccggctggg agccctccac cgagaagctg tacccccagg acggcgtgct gaagggcgag 480

atctcccacg ccctgaagct gaaggacggc ggccactaca cctgcgactt caagaccgtg 540

tacaaggcca agaagcccgt gcagctgccc ggcaaccact acgtggactc caagctggac 600

atcaccaacc acaacgagga ctacaccgtg gtggggcagt acgagcacgc cgaggcccgc 660

cactccggct cccag 675

<210> 4

<211> 500

<212> DNA

<213> 里氏木霉(Trichodermareesei)

<400> 4

agctccgtgg cgaaagcctg acgcaccggt agattcttgg tgagcccgta tcatgacggc 60

ggcgggagct acatggcccc gggtgattta ttttttttgt atctacttct gacccttttc 120

aaatatacgg tcaactcatc tttcactgga gatgcggcct gcttggtatt gcgatgttgt 180

cagcttggca aattgtggct ttcgaaaaca caaaacgatt ccttagtagc catgcatttt 240

aagataacgg aatagaagaa agaggaaatt aaaaaaaaaa aaaaaacaaa catcccgttc 300

ataacccgta gaatcgccgc tcttcgtgta tcccagtacc acggcaaagg tatttcatga 360

tcgttcaatg ttgatattgt tcccgccagt atggctccac ccccatctcc gcgaatctcc 420

tcttctcgaa cgcggtagtg gcgcgccaat tggtaatgac ccatagggag acaaacagca 480

taatagcaac agtggaaatt 500

<210> 5

<211> 2680

<212> DNA

<213> 里氏木霉(Trichodermareesei)

<400> 5

ataaagtggc ccatcgtcac ctctcggctt caactcgagt ttttcccttt ttccttttct 60

tcttcttctt caaacaaaga taccccccct caacccggtg caaccagcct ggtccgagga 120

caaaacacga tagagctcgc tgcgttggat cgctgcgcgt cttctcttgt tctctctctc 180

ttttcttctc tgcaacgctt ataactcttt ttgcgcgggg catctgggaa aaccgtttct 240

tcacacatct cttcttccac aatggctcgt tcacggagct ccctggccct cgggctgggc 300

ctgctctgct ggatcacgct gctcttcgct cctctggcgt ttgtcggaaa ggccaatgcc 360

gcgagcgacg acgcggacaa ctacggcact gttatcggaa ttgtaagtcg actgacggca 420

gcaaccccgc cattttcttg gtgttgatgc tcaggcagcc ctgctaacac gcttctcctc 480

cgcccaggat ctcggaacta cctacagctg cgtcggtgtg atgcagaagg gcaaggttga 540

gattctcgtc aacgaccagg gtaaccgaat cactccctcc tacgtggcct ttaccgacga 600

ggagcgtctg gttggcgatt ccgccaagaa ccaggccgcc gccaacccca ccaacaccgt 660

ctacgatgtc aagtcagttc taccgccctg ttggcttcta ttgtataagt ggacaattag 720

ctaactgttg tcacaggcga ttgattggcc gcaaattcga cgagaaggag atccaggccg 780

acatcaagca cttcccctac aaggtcattg agaagaacgg caagcccgtc gtccaggtcc 840

aggtcaacgg ccagaagaag cagttcactc ccgaggagat ttctgccatg attcttggca 900

agatgaagga ggttgccgag tcgtacctgg gcaagaaggt tacccacgcc gtcgtcaccg 960

tccctgccta cttcaacgtg agtcttttcc ccgaaattcc tcgaggattc caagagccat 1020

ctgctaacag cccgatagga caaccagcga caggccacca aggacgccgg taccattgcc 1080

ggcttgaacg ttctccgaat cgtcaacgaa cccaccgctg ccgctatcgc ctatggtctg 1140

gacaagaccg acggtgagcg ccagatcatt gtctacgatc tcggtggtgg tacctttgat 1200

gtttctctcc tgtccattga caatggcgtc ttcgaggtct tggctaccgc cggtgacacc 1260

caccttggtg gtgaggactt tgaccagcgc attatcaact acctggccaa ggcctacaac 1320

aagaagaaca acgtcgacat ctccaaggac ctcaaggcca tgggcaagct caagcgtgaa 1380

gccgaaaagg ccaagcgtac cctctcttcc cagatgagca ctcgtatcga aatcgaggcc 1440

ttcttcgagg gcaacgactt ctccgagact ctcacccggg ccaagttcga ggagctcaac 1500

atggacctct tcaagaagac cctgaagcct gtcgagcagg ttctcaagga cgccaacgtc 1560

aagaagagcg aggttgacga catcgttctg gtcggcggtt ccacccgtat ccccaaggtt 1620

cagtctctta tcgaggagta ctttaacggc aagaaggctt ccaagggtat caaccccgac 1680

gaggctgttg ctttcggtgc cgccgtccag gccggtgtcc tttctggtga ggaaggtacc 1740

gatgacattg ttctcatgga cgtcaacccc ctgactctcg gtatcgagac cactggcgga 1800

gtcatgacca agctcattcc ccgcaacacc cccatcccca ctcgcaagag ccagatcttc 1860

tcgactgctg ccgataacca gcccgtcgtc ctgatccagg tcttcgaggg tgagcgttcc 1920

atgaccaagg acaacaacct cctgggcaag ttcgagctta ccggcattcc tcctgccccc 1980

cgcggtgtcc cccagattga ggtttccttc gagttggatg ccaacggtat cctcaaggtc 2040

tccgctcacg acaagggcac cggcaagcag gagtccatca ccatcaccaa cgacaagggc 2100

cgtctcaccc aggaggagat tgaccgcatg gttgccgagg ccgagaagtt cgccgaggag 2160

gacaaggcta cccgtgagcg catcgaggcc cgtaacggtc ttgagaacta cgccttcagc 2220

ctgaagaacc aggtcaatga cgaggagggc ctcggcggca agattgacga ggaggacaag 2280

gagactgtaa gttgaagcga tccatcactg ctttctgatg cggacatgtc acactaacac 2340

ttgaccagat tcttgacgcc gtcaaggagg ctaccgagtg gctcgaggag aacggcgccg 2400

acgccactac cgaggacttt gaggagcaga aggagaagct gtccaacgtc gcctacccca 2460

tcacctccaa gatgtaccag ggtgctggtg gctccgagga cgatggcgac ttccacgacg 2520

aattgtaaaa aattaaaaaa agggaaatta ttgatgcata gatacttatt agaggaacca 2580

aagaagttcc caggtgttat cgtcggttat gacgcggatg tgttttcagt cttgtaaagt 2640

tcgaatgcag ctctgagtgt agtagatgca taaatgaatc 2680

<210> 6

<211> 1356

<212> DNA

<213> 里氏木霉(Trichodermareesei)

<400> 6

atggcgttcc agcagtcgtc tcccctcgtc aagtttgagg cctctcccgc cgaatccttc 60

ctctccgccc ccggcgacaa cttcacatcc ctcttcgccg actcaacacc ctcaacactt 120

aaccctcggg acatgatgac ccctgacagc gtcgccgaca tcgactctcg cctgtccgtc 180

atccccgaat cacaggacgc ggaagatgac gaatcacact ccacatccgc taccgcaccc 240

tctacctcag aaaagaagcc cgtcaagaag aggaaatcat ggggccaggt tcttcctgag 300

cccaagacca acctccctcc tcgaaaacgt gcaaagacgg aagatgaaaa ggagcagcgc 360

cgcgtcgagc gtgttctccg caaccgccgc gccgcgcagt cctcgcgcga gcgcaagagg 420

ctcgaggtcg aggctctcga gaagcgcaac aaggagctcg agacgctcct catcaacgtc 480

cagaagacca acctgatcct cgtcgaggag ctcaaccgct tccgacgcag ctcaggcgtc 540

gtcacccgct cgtcctcccc cctcgactct ctccaggaca gcatcactct ctcccagcaa 600

ctctttggct cgcgggatgg ccaaaccatg tccaaccccg agcagtcctt gatggaccag 660

atcatgagat ctgccgctaa ccctaccgtt aacccggcct ctctttcccc ctccctcccc 720

cccatctcgg acaaggagtt ccagaccaag gaggaggacg aggaacaggc cgacgaagat 780

gaagagatgg agcagacatg gcacgagacc aaagaagccg ccgccgccaa ggagaagaac 840

agcaagcagt cccgcgtctc cactgattcg acacaacgtc ctgcagtgtc aatcggtgga 900

gatgccgctg tccctgtctt ctcagacgac gccggcgcaa actgccttgg cctggaccct 960

gttcatcagg atgatggtcc tttcagcatc ggccattctt tcggcctgtc agcggccctt 1020

gatgcagatc gctatctcct cgaaagccaa cttctcgctt cgcccaacgc ctcaactgtt 1080

gacgacgatt atctggctgg tgactctgcc gcctgcttca cgaatcctct cccctccgac 1140

tacgacttcg acatcaacga cttcctcaca gacgacgcaa accacgccgc ctatgacatt 1200

gtggcagcga gcaactatgc cgctgcggac cgcgagctcg acctcgagat ccacgaccct 1260

gagaatcaga tcccttcgcg acattctatc cagcagcccc agtctggcgc gtcctctcat 1320

ggatgcgacg atggcggcat tgcggttggt gtctga 1356

<210> 7

<211> 2919

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 7

gactgacccc cccggttggg cccctcgtcc cgtctccaac agagcaccac cagacaaaga 60

cccctgcccg cgcgaatcca gaccccccca gcaattccgg gcctcgttga tcctcctcta 120

ctgtagttgt acatacatac ctaccgactg cattgcattg gtacagctgc aggcacttcc 180

aggcacggcc accaaattgc agcggccctt gcttgcttgc ttggttcgag aactaggatc 240

tgtgtctttt gccttgcctt gtcttgtctg ggttcctgct cgtctgcggc aatcggaacg 300

ccgccagtgc ggtgccaagc aaaccagcca aggtaggtac ctaccactag gcttcttttc 360

tcgttgtctc actctctctt ttcctctttg tcctctctta tccccatctt ttctctctct 420

ctctgctcct ttcctaacca cttccctacc tttctctttt tccttttctt gtcatctcca 480

tcttggctga cgaaaaaggt ctgactgggt aggtattatc tggcagactt gtgtgtatca 540

ttcaccctat ttctgcttca tagtacatgt actgtacctg aacggctcaa ccgctattta 600

cgactcttat ttttttgtgg cgttggtcac gtttgccagc tgttgtccgt ctttctaggg 660

ctcctcaaac ttgacctgac cgagctccct ttctggaccc ggtgggcttc acttccagct 720

gctgagcgac ctgagccgaa catcctcagt ccttgtccag cgcaattcat tttctttcct 780

tttctttttt tttattcctt tctttacttt tattctctct ttttctcctc ttcctcttct 840

tcttctttct cctcctcctc catatcctca ctctcgtctc cctcattact accctctcgg 900

ctcctcaggt ccaccaaccc tcccgcaccc aaacctctgc cgctgaaacc cattcggtgg 960

tcgccgtttt tttttttttt ttctcacccc caaagtcgca atatcgggta tcgccgccgg 1020

cattgaatcg ccttctccgc tagcatcgac tactgctgct ctgctctcgt tgccagcgct 1080

gctccctaga attttgacca ggggacgagc ccgacattaa agcaactccc tcgcctcgag 1140

acgactcgga tcgcacgaaa ttctcccaat cgccgacagt tcctactcct cttcctcccg 1200

cacggctgtc gcgcttccaa cgtcattcgc acagcagaat tgtgccatct ctctcttttt 1260

tttccccccc tctaaaccgc cacaacggca ccctaagggt taaactatcc aaccagccgc 1320

agcctcagcc tctctcagcc tcatcagcca tggcaccaca cccgacgctc aaggccacct 1380

tcgcggccag gagcgagacg gcgacgcacc cgctgacggc ttacctgttc aagctcatgg 1440

acctcaaggc gtccaacctg tgcctgagcg ccgacgtgcc gacagcgcgc gagctgctgt 1500

acctggccga caagattggc ccgtcgattg tcgtgctcaa gacgcactac gacatggtct 1560

cgggctggga cttccacccg gagacgggca cgggagccca gctggcgtcg ctggcgcgca 1620

agcacggctt cctcatcttc gaggaccgca agtttggcga cattggccac accgtcgagc 1680

tgcagtacac gggcgggtcg gcgcgcatca tcgactgggc gcacattgtc aacgtcaaca 1740

tggtgcccgg caaggcgtcg gtggcctcgc tggcccaggg cgccaagcgc tggctcgagc 1800

gctacccctg cgaggtcaag acgtccgtca ccgtcggcac gcccaccatg gactcgtttg 1860

acgacgacgc cgactccagg gacgccgagc ccgccggcgc cgtcaacggc atgggctcca 1920

ttggcgtcct ggacaagccc atccactcga accggtccgg cgacggccgc aagggcagca 1980

tcgtctccat caccaccgtc acccagcagt acgagtccgt ctcctcgccc cggttaacaa 2040

aggccatcgc cgagggcgac gagtcgctct tcccgggcat cgaggaggcg ccgctgagcc 2100

gcggcctcct gatcctcgcc caaatgtcca gccagggcaa cttcatgaac aaggagtaca 2160

cgcaggcctg cgtcgaggcc gcccgggagc acaaggactt tgtcatgggc ttcatctcgc 2220

aggagacgct caacaccgag cccgacgatg cctttatcca catgacgccc ggctgccagc 2280

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