具体实施方式

下面结合实施例对本发明作进一步详细的描述，但本发明的实施方式不限于此。除非特别说明，本发明采用的试剂、方法和设备为本技术领域常规试剂、方法和设备。下列实施例中未注明具体实验条件的试验方法，通常按照常规实验条件。除非特别说明，本发明所用试剂和原材料均可通过市售获得。

术语解释

LB平板：胰蛋白胨10g/L，酵母提取物5g/L，NaCl 5g/L，琼脂20g/L。

LBH平板：酵母粉2.5g/L，蛋白胨5g/L，NaCl 5g/L，脑心浸液(BactoTM BrainHeart Infusion)18.5g/L，山梨醇91g/L和20g/L琼脂。

BHISG培养基：脑心浸液37g/L，山梨醇9.1g/L，葡萄糖10g/L。

10×PBS(磷酸盐缓冲盐水)：40g NaCl，1g KCl，7.1g Na₂HPO₄、1.2g KH₂PO₄，将上述试剂溶于400ml水中，将pH调节至7.4，定容至500ml)。

1×PBS：10×PBS稀释10倍。

MOPS缓冲液：10ml 0.5M 3-(N-吗啉基)丙磺酸(MOPS)(pH 6.9)，并稀释10倍。

实施例1：谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775表面展示载体pEC-EGFP的构建

(1)谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775(氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示)的基因序列(SEQ ID NO:2)，靶蛋白EGFP基因以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e(购自Novagen)上的序列特征，设计扩增引物：

P1：5'-atgAAAGGAGGCCCTTCAGATGAGGAAAACCATCACCGTTAT-3'(SEQ ID NO:3)；

P2：5'-CTTATCGTCATCATCCTTGTAATCTCCGTTGTCGATGAGGTTGGTC-3'(SEQ ID NO:4)。

以谷氨酸棒杆菌ATCC13032的基因组DNA为模板，以P1和P2为引物，通过PCR方法扩增出蛋白Ncgl2775的基因序列，扩增条件为：预变性94℃5分钟；再进行30个以下循环：94℃变性30秒、Tm-5℃(Tm为解链温度；下同)退火30秒、68℃延伸1分钟；最后68℃延伸10分钟。

(2)靶蛋白EGFP基因的克隆

根据靶蛋白EGFP基因(SEQ ID NO:5)以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物：

P3：5'-GATTACAAGGATGATGACGATAAGATGGTGAGCAAGGGCGAGGA-3'(SEQ ID NO:6)；

P4：5'-TCGTCATCATCCTTGTAATCTTACTTGTACAGCTCGTCCATG-3'(SEQ ID NO:7)。

以谷氨酸棒杆菌ATCC13032的基因组DNA为模板，以P3和P4为引物，通过PCR方法扩增出靶蛋白EGFP基因，扩增条件为：预变性94℃5分钟；再进行30个以下循环：94℃变性30秒、Tm-5℃退火30秒、68℃延伸1分钟；最后68℃延伸10分钟。

(3)载体pEC-XK99e的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列(SEQ ID NO:2)，靶蛋白EGFP基因以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物：

P5：5'-GATTACAAGGATGATGACGATAAGggctgttttggcg-3'(SEQ ID NO:8)；

P6：5'-CTGAAGGGCCTCCTTTcatggtctgtttcctgtgtg-3'(SEQ ID NO:9)。

以pEC-XK99e为模板，以P5和P6为引物，通过PCR方法扩增出载体pEC-XK99e的基因序列，扩增条件为：预变性94℃5分钟；再进行30个以下循环：94℃变性30秒、Tm-5℃退火30秒、68℃延伸2分钟；最后68℃延伸10分钟。

(4)载体pEC/Ncgl2775-FLAG-EGFP的构建

将步骤(1)中得到的谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的PCR产物，步骤(2)中得到的EGFP绿色荧光蛋白基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组(该步骤使用Seamless Assembly克隆试剂盒)连接，将连接体系转化大肠杆菌宿主Top10(购自Novagen)。用含50mg/L卡那霉素的LB平板筛选转化子，使用鉴定引物P7和P8挑取阳性的转化子，提取质粒，鉴定并测序，结果表明蛋白Ncgl2775的基因序列正确转化，且FLAG标签在所述蛋白Ncgl2775的基因的上游。

其中涉及的引物序列如下：

P7：5'-CACTGCATAATTCGTGTCGCTCAAGGCGCACTCC-3'(SEQ ID NO:10)；

P8：5'-GTCGCCGTCCAGCTCGACCAGGATG-3'(SEQ ID NO:11)。

(5)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系CG/Ncgl2775-EGFP的构建和鉴定

用电转法将步骤(4)中得到的质粒pEC/Ncgl2775-FLAG-EGFP转化谷氨酸棒杆菌ATCC13032，在LBH平板上挑取阳性转化子，以P7、P8为引物，进行PCR扩增，结果证明质粒pEC/Ncgl2775-FLAG-EGFP的基因序列转化到了谷氨酸棒杆菌ATCC13032中，得到的重组菌命名为CG/Ncgl2775-EGFP。

(6)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系CG/Ncgl2775-EGFP的阴性对照菌株CG/EGFP和阳性对照菌株CG/Ncgl1221-EGFP、CG/Ncgl1337-EGFP的构建和鉴定

①阴性对照菌株CG/EGFP的构建：以EGFP(SEQ ID NO:5)为模板，以P9和P4为引物，通过PCR方法扩增出EGFP的基因序列；以谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e为模板，以P5和P6为引物，通过PCR方法扩增出pEC-XK99e的基因序列；然后将EGFP基因的PCR产物与谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阴性对照菌株CG/EGFP，具体制备与鉴定方法参见上述步骤(1)～(5)；

②阳性对照菌株CG/Ncgl1221-EGFP的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P10和P11为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1221的基因序列；然后将Ncgl1221基因的PCR产物、步骤(2)中得到的EGFP基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1221-EGFP，鉴定方法参见上述步骤(1)～(5)；

③阳性对照菌株CG/Ncgl1337-EGFP的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P12和P13为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1337的基因序列；然后将将Ncgl1337基因的PCR产物、步骤(2)中得到的EGFP基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1337-EGFP，鉴定方法参见上述步骤(1)～(5)；

其中涉及的引物序列如下：

P9：5'-catgAAAGGAGGCCCTTCAGATGGATTACAAGGATGATGACGATAAGATGGTGAGCAAGGGCGAG-3'(SEQ ID NO:12)；

P10：5'-catgAAAGGAGGCCCTTCAGATGATTTTAGGCGTACCCATTCAATATTTG-3'(SEQ IDNO:13)；

P11：5'-CTTATCGTCATCATCCTTGTAATCAGGGGTGGACGTCGGCGCAACTGTC-3'(SEQ IDNO:14)；

P12：5'-catgAAAGGAGGCCCTTCAGATGGCTCAGCGAAAACTGGCCTC-3'(SEQ ID NO:15)；

P13：5'-CTTATCGTCATCATCCTTGTAATCGGCGTTTACTCGATCTCGCAGGATC-3'(SEQ IDNO:16)。

(7)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系CG/Ncgl2775-EGFP的流式细胞仪分析与共聚焦显微镜分析

将重组菌CG/Ncgl2775-EGFP接种于5ml、含0.5mM IPTG(异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷)的BHISG培养基中，在30℃、220rpm条件下诱导和培养24小时，离心后重悬，添加抗FLAG单克隆抗体和Alexa Fluor 647标记的山羊抗鼠IgG抗体(抗体均购自碧云天)孵育后重悬。最后，使用C6 Plus流式细胞仪测量荧光强度。同时，以CG/EGFP为阴性对照，CG/Ncgl1221-EGFP和CG/Ncgl1337-EGFP为阳性对照。

流式细胞仪检测结果如图1(图1中的M表示Comp-FL-A ::APC-A_Area的平均值)所示：结果显示与阴性对照菌株CG/EGFP、阳性对照菌CG/Ncgl1221-EGFP、CG/Ncgl1337-EGFP相比，重组菌CG/Ncgl2775-EGFP的荧光发生较大偏移，表明在重组菌CG/Ncgl2775-EGFP的细胞表面成功地表达了蛋白Ncgl2775-EGFP融合蛋白。

随后，对样品进行离心和再悬浮，然后将其涂覆在显微镜载玻片上，最后通过共聚焦显微镜进行观察，结果显示二抗的红色荧光显示在重组菌CG/Ncgl2775-EGFP的表面(图2)(图2中：EGFP表示EGFP荧光蛋白激发出的荧光；Alexa Fluor647表示Alexa Fluor647抗体激发出的荧光)，再次验证了重组菌CG/Ncgl2775-EGFP的细胞表面成功地表达了谷氨酸棒杆菌蛋白Ncgl2775-EGFP的融合蛋白。

实施例2：谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775表面展示载体pEC-Ncgl2775-mCherry的构建

(1)谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列(SEQ ID NO:2)，靶蛋白mCherry基因以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物P1和P2，通过PCR方法扩增得到谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列，具体制备方法参见实施例1步骤(1)。

(2)靶蛋白mCherry基因的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列(SEQ ID NO:2)，靶蛋白mCherry基因(SEQ ID NO:17)以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物P14和P15，通过PCR方法扩增得到靶蛋白mCherry基因，制备方法参见实施例1。

P14：5'-GATTACAAGGATGATGACGATAAGATGGTTTCCAAGGGCGAGGAGGAC-3'

(SEQ ID NO:18)；

P15：5'-cagccCTTATCGTCATCATCCTTGTAATCTTACTTGTAGAGTTCGTCCATG-3'(SEQ IDNO:19)。

(3)载体pEC-XK99e的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列(SEQ ID NO:2)，靶蛋白mCherry基因以及谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物P5和P6，通过PCR方法扩增出载体pEC-XK99e的基因序列，具体制备方法参见实施例1步骤(3)。

(4)载体pEC/Ncgl2775-mCherry的构建

将步骤(1)中得到的谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的PCR产物，步骤(2)中得到的mCherry基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接(方法同实施例1)，将连接后的体系转化大肠杆菌宿主Top10。用含50mg/L卡那霉素的LB平板筛选转化子，使用鉴定引物P7和P16挑取阳性的转化子，提取质粒，鉴定并测序，得到重组谷氨酸棒杆菌表面展示表达质粒pEC/Ncgl2775-mCherry，且FLAG标签在所述蛋白Ncgl2775的基因的上游。其中涉及的引物序列如下：

P16：5'-CTTGTAGGTGGTCTTAACCTCAGCGTCGTAGTGACCG-3'(SEQ ID NO:20)。

(5)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系pEC/Ncgl2775-mCherry的构建和鉴定

用电转法将步骤(4)中得到的质粒pEC/Ncgl2775-mCherry转化谷氨酸棒杆菌ATCC13032，在LBH平板上挑取阳性转化子，以P7、P11为引物，进行PCR扩增，结果证明质粒pEC/Ncgl2775-mCherry的基因序列转化到了谷氨酸棒杆菌ATCC13032中，得到的重组菌命名为CG/Ncgl2775-mCherry。

(6)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系CG/Ncgl2775-mCherry的阴性对照菌株CG/pEC-XK99e和阳性对照菌株CG/Ncgl1221-mCherry、CG/Ncgl1337-mCherry的构建和鉴定

①阳性对照菌株CG/Ncgl1221-mCherry的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P10和P11为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1221的基因序列；然后将Ncgl1221基因的PCR产物、步骤(2)中得到的mCherry基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1221-mCherry，鉴定方法参见实施例1。

②阳性对照菌株CG/Ncgl1337-mCherry的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P12和P13为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1337的基因序列；然后将Ncgl1337基因的PCR产物、步骤(2)中得到的mCherry基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1337-mCherry，鉴定方法参见实施例1。

(7)重组谷氨酸棒杆菌CG/Ncgl2775-mCherry和对照菌株的流式细胞仪分析与共聚焦显微镜分析

将重组菌CG/Ncgl2775-mCherry和对照菌株接种于5ml、含0.5mM IPTG的BHISG培养基中，在30℃、220rpm条件下诱导和培养24小时，离心后重悬，添加抗FLAG单克隆抗体和Alexa Fluor488标记的山羊抗鼠IgG抗体(抗体均购自碧云天)孵育后重悬。最后，使用C6Plus流式细胞仪测量荧光强度。同时，以菌株ATCC13032为阴性对照，CG/Ncgl1221-mCherry和CG/Ncgl1337-mCherry为阳性对照。

结果如图3(图3中的M表示Comp-FL-A ::FITC-A_Area的平均值)所示：结果显示与阴性对照菌株ATCC13032、阳性对照菌CG/Ncgl1221-mCherry、CG/Ncgl1337-mCherry相比，重组菌CG/Ncgl2775-mCherry的荧光发生较大偏移，表明在重组菌CG/Ncgl2775-mCherry的细胞表面成功地表达了谷氨酸棒杆菌蛋白Ncgl2775-mCherry融合蛋白。

随后，对样品进行离心和再悬浮，然后将其涂覆在显微镜载玻片上，最后通过共聚焦显微镜进行观察，结果显示二抗的绿色荧光显示在重组菌CG/Ncgl2775-mCherry的表面(图4)(图4中：mCherry表示mCherry荧光蛋白激发出的荧光；Alexa Fluor647表示AlexaFluor647抗体激发出的荧光)，再次验证了重组菌CG/Ncgl2775-mCherry的细胞表面成功地表达了谷氨酸棒杆菌蛋白Ncgl2775-mCherry的融合蛋白。

实施例3：谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775表面展示载体pEC-Amy的构建

(1)谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的克隆

根据谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列(SEQ ID NO:2)，设计扩增引物，通过PCR方法扩增得到谷氨酸棒杆菌蛋白Ncgl2775基因序列，具体制备方法参见实施例1步骤(1)。

(2)靶蛋白α-amylase基因的克隆

根据靶蛋白α-淀粉酶(α-amylase EC 3.2.1.1)的基因amyE(来源于枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)168；序列SEQ ID NO:21所示)设计扩增引物P17和P18，以枯草芽孢杆菌168的基因组为模板，通过PCR方法扩增出靶蛋白α-淀粉酶的基因序列，制备方法参见实施例1：

P17：5'-GATTACAAGGATGATGACGATAAGATGTTTGCAAAACGATTCAAAACCTCTTTACTGCC-3'(SEQ ID NO:22)；

P18：5'-CTTATCGTCATCATCCTTGTAATCTCAATGGGGAAGAGAACCGCTTAAGCCCG-3'(SEQID NO:23)。

(3)载体pEC-XK99e的克隆

根据谷氨酸棒杆菌质粒pEC-XK99e上的序列特征，设计扩增引物P5和P6，通过PCR方法扩增出载体pEC-XK99e的基因序列，具体制备方法参见实施例1步骤(3)。

(4)载体pEC/Ncgl2775-Amy的构建

将步骤(1)中得到的谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775基因的PCR产物，步骤(2)中得到的α-淀粉酶基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接(方法同实施例1)，得到重组谷氨酸棒杆菌表面展示表达质粒pEC/Ncgl2775-Amy，将得到的pEC/Ncgl2775-Amy质粒转化大肠杆菌宿主Top10。用含50mg/L卡那霉素的LB平板筛选转化子，挑取阳性的转化子，提取质粒，使用鉴定引物P7和P19鉴定并测序，结果表明蛋白Ncgl2775的基因序列正确转化，且FLAG标签在所述蛋白Ncgl2775的基因的上游。其中涉及的引物序列如下：

P19：5'-GAACGACCAATTCCATGCATGAAGAATGGTTCCGC-3'(SEQ ID NO:24)。

(5)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系CG/Ncgl2775-Amy的构建

用电转法将步骤(4)中得到的质粒pEC/Ncgl2775-Amy转化谷氨酸棒杆菌ATCC13032，在LBH平板上挑取阳性转化子，以P7、P14为引物，进行PCR扩增，结果证明质粒pEC/Ncgl2775-Amy的基因序列转化到了谷氨酸棒杆菌ATCC13032中，得到的重组菌命名为CG/Ncgl2775-Amy。

(6)重组谷氨酸棒杆菌表面展示体系Ncgl2775-Amy的阳性对照菌株CG/Ncgl1221-Amy、CG/Ncgl1337-Amy和阴性对照菌株CG/pEC-XK99e的构建和鉴定

①阳性对照菌株CG/Ncgl1221-Amy(PC1)的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P10和P11为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1221的基因序列；然后将Ncgl1221基因的PCR产物、步骤(2)中得到的Amy基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1221-Amy，鉴定方法参见实施例1。

②阳性对照菌株CG/Ncgl1337-Amy(PC2)的构建：以谷氨酸棒杆菌ATCC13032基因组DNA为模板，以P12和P13为引物，通过PCR方法扩增出Ncgl1337的基因序列；然后将Ncgl1337基因的PCR产物、步骤(2)中得到的Amy基因的PCR产物与步骤(3)中得到的谷氨酸棒杆菌表达质粒pEC-XK99e的PCR产物经过Gibson同源重组连接，最后构建阳性对照菌株CG/Ncgl1337-Amy，鉴定方法参见实施例1。

③阴性对照菌株CG/pEC-XK99e的构建：将载体pEC-XK99e直接转化谷氨酸棒杆菌ATCC13032，最后构建阴性对照菌株CG/pEC-XK99e，鉴定方法参见实施例1。

(7)重组谷氨酸棒杆菌CG/Ncgl2775-Amy的发酵与淀粉酶酶活性的测定

将CG/Ncgl2775-Amy接种于5ml的BHISG培养基中过夜培养后，再转接于30ml、含0.5mM IPTG的BHISG培养基(抗性菌株添加终浓度为25μg/mL的卡那霉素)中在30℃、220rpm下诱导和培养24小时，获得细胞发酵液。淀粉酶活性的测定方法采用EnzChek^TM淀粉酶检测试剂盒(货号E33651)。反应底物包括细胞悬浮液、上清液和细胞发酵液，上清液和细胞悬浮液由细胞发酵液离心获得，细胞悬浮液需由MOPS缓冲液洗涤3次后重悬，离心条件为6000rpm。酶活性的一个单位(U/ml)定义为在20℃、pH值6.9、3分钟内从淀粉中释放1毫克麦芽糖所需的酶量。以谷氨酸棒杆菌ATCC13032、(WT)、CG/pEC-XK99e(NC)为阴性对照，以CG/Ncgl1221-Amy(PC1)、CG/Ncgl1337-Amy(PC2)为阳性对照。

淀粉酶酶活性测定结果如图5所示：结果显示，CG/Ncgl2775-Amy的细胞悬液在24h发酵后酶活达到了的0.40U/ml，高于两个阳性对照菌CG/Ncgl1221-Amy(0.13U/ml)、CG/Ncgl1337-Amy(0.24U/ml)。表明α-淀粉酶被Ncgl2775蛋白以活性形式成功且高效地展示在谷氨酸棒杆菌细胞表面。

(8)重组谷氨酸棒杆菌CG/Ncgl2775-Amy的生长曲线的测定

将从平板上挑选的重组菌株CG/Ncgl2775-Amy接种到BHIS(抗性菌株添加终浓度为25μg/mL的卡那霉素)培养基中，并在30℃和220rpm下培养过夜。取适当体积的细菌，以葡萄糖或可溶性淀粉((天津市大茂化学试剂厂；CAS No:9005-84-9))(4％，w/w)溶液作为唯一碳源接种培养基，然后在12孔板中培养(抗性菌株添加终浓度为25μg/mL的卡那霉素)。初始OD600nm的细胞密度为0.3左右，培养条件为30℃和280rpm。OD600光密度每4小时测量一次，持续32小时。

ATCC13032、CG/pEC-XK99e和CG/Ncgl2775-Amy菌株在葡萄糖培养基中具有相似的生长曲线(图6)。阴性对照ATCC13032和CG/pEC-XK99e的细胞在淀粉培养基中生长效果不佳，因为它们不能利用淀粉。相比之下，重组菌CG/Ncgl2775-Amy在淀粉培养基中生长效果较好，并且在淀粉和葡萄糖培养基中的生长趋势相似，包括进入稳定期的时间点和最大OD600值。这表明CG/Ncgl2775-Amy中的α-淀粉酶被以活性形式成功地展示在谷氨酸棒杆菌细胞表面，并且对淀粉有很好的利用能力。

上述实施例为本发明较佳的实施方式，但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制，其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化，均应为等效的置换方式，都包含在本发明的保护范围之内。

序列表

<110> 华南理工大学

<120> 谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775及其表面展示系统和构建方法

<160> 24

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 309

<212> PRT

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> 谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775

<400> 1

Met Arg Lys Thr Ile Thr Val Ile Ala Val Leu Ile Val Leu Ala Leu

1 5 10 15

Ile Gly Val Gly Ile Val Gln Tyr Val Asn Thr Ser Asp Asp Ser Asp

20 25 30

Phe Ile Gly Gln Pro Gly Glu Pro Thr Gly Thr Glu Thr Thr Glu Pro

35 40 45

Pro Val Gln Pro Asp Trp Cys Pro Ala Val Glu Val Ile Ala Ala Pro

50 55 60

Gly Thr Trp Glu Ser Ala Ala Asn Asp Asp Pro Ile Asn Pro Thr Ala

65 70 75 80

Asn Pro Leu Ser Phe Met Leu Ser Ile Thr Gln Pro Leu Gln Glu Arg

85 90 95

Tyr Ser Ala Asp Asp Val Lys Val Trp Thr Leu Pro Tyr Thr Ala Gln

100 105 110

Phe Arg Asn Ile Asn Ser Gln Asn Glu Met Ser Tyr Asp Asp Ser Arg

115 120 125

Asn Glu Gly Thr Ala Lys Met Asn Glu Glu Leu Ile Asn Thr His Asn

130 135 140

Glu Cys Pro Ala Thr Glu Phe Ile Ile Val Gly Phe Ser Gln Gly Ala

145 150 155 160

Val Ile Ala Gly Asp Val Ala Ala Gln Ile Gly Ser Glu Gln Gly Val

165 170 175

Ile Pro Ala Asp Ser Val Arg Gly Val Ala Leu Ile Ala Asp Gly Arg

180 185 190

Arg Glu Pro Gly Val Gly Gln Phe Pro Gly Thr Phe Val Asp Gly Ile

195 200 205

Gly Ala Glu Val Thr Leu Gln Pro Leu Asn Leu Leu Val Gln Pro Ile

210 215 220

Val Pro Gly Ala Thr Met Arg Gly Gly Arg Ala Gly Gly Phe Gly Val

225 230 235 240

Leu Asn Asp Arg Val Gln Asp Ile Cys Ala Pro Asn Asp Ala Ile Cys

245 250 255

Asp Ala Pro Val Asn Val Gly Asn Ala Leu Asp Arg Ala Leu Ala Met

260 265 270

Val Ser Ala Asn Gly Val His Ala Leu Tyr Ala Thr Asn Pro Asp Val

275 280 285

Phe Pro Gly Thr Thr Thr Asn Ala Trp Val Val Asp Trp Ala Thr Asn

290 295 300

Leu Ile Asp Asn Gly

305

<210> 2

<211> 933

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> 谷氨酸棒杆菌膜蛋白Ncgl2775的基因序列

<400> 2

atgaggaaaa ccatcaccgt tattgctgta ttgatcgtcc tcgccttaat cggcgtgggc 60

atcgtgcagt atgtgaacac atccgatgac tcagatttca ttggccagcc tggcgagcca 120

accggtaccg aaaccacgga accaccggtt caacctgatt ggtgccctgc ggtagaagtc 180

attgccgcgc cgggtacgtg ggagtcggct gctaatgatg atccgatcaa cccgaccgct 240

aatccgctgt cattcatgtt gagcatcact cagccactgc aggagcgtta ttctgcggat 300

gacgtcaagg tgtggacgct gccgtacact gcgcagttcc gcaacatcaa ctcgcaaaat 360

gagatgtcct atgatgattc gcgcaatgaa ggcaccgcga agatgaatga ggaactgatc 420

aacactcaca atgagtgccc tgccacggag ttcatcatcg ttggtttctc ccagggtgcg 480

gtcattgcgg gcgatgtggc tgctcagatc ggttcagagc aaggtgttat tccagctgac 540

agcgtcaggg gtgtcgccct gatcgctgac ggtcgccggg agcctggtgt gggccagttc 600

ccaggcacgt ttgtggatgg catcggcgcg gaggttactc tgcagccttt gaacttgctg 660

gtgcagccga ttgttccggg cgcaaccatg cgtggcgggc gcgcgggcgg tttcggtgtg 720

ctcaacgacc gggtgcagga tatttgtgct ccaaatgatg cgatctgtga tgctccggtg 780

aatgtcggca acgcccttga tcgtgcgttg gccatggtct ccgccaacgg tgtgcacgcg 840

ctctacgcca ccaatccgga tgttttccca ggcacaacca ccaatgcgtg ggttgtggat 900

tgggcgacca acctcatcga caacggataa 930

<210> 3

<211> 42

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P1

<400> 3

atgaaaggag gcccttcaga tgaggaaaac catcaccgtt at 42

<210> 4

<211> 46

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P2

<400> 4

cttatcgtca tcatccttgt aatctccgtt gtcgatgagg ttggtc 46

<210> 5

<211> 720

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> EGFP基因

<400> 5

atggtgagca agggcgagga gctgttcacc ggggtggtgc ccatcctggt cgagctggac 60

ggcgacgtaa acggccacaa gttcagcgtg tccggcgagg gcgagggcga tgccacctac 120

ggcaagctga ccctgaagtt catctgcacc accggcaagc tgcccgtgcc ctggcccacc 180

ctcgtgacca ccctgaccta cggcgtgcag tgcttcagcc gctaccccga ccacatgaag 240

cagcacgact tcttcaagtc cgccatgccc gaaggctacg tccaggagcg caccatcttc 300

ttcaaggacg acggcaacta caagacccgc gccgaggtga agttcgaggg cgacaccctg 360

gtgaaccgca tcgagctgaa gggcatcgac ttcaaggagg acggcaacat cctggggcac 420

aagctggagt acaactacaa cagccacaac gtctatatca tggccgacaa gcagaagaac 480

ggcatcaagg tgaacttcaa gatccgccac aacatcgagg acggcagcgt gcagctcgcc 540

gaccactacc agcagaacac ccccatcggc gacggccccg tgctgctgcc cgacaaccac 600

tacctgagca cccagtccgc cctgagcaaa gaccccaacg agaagcgcga tcacatggtc 660

ctgctggagt tcgtgaccgc cgccgggatc actctcggca tggacgagct gtacaagtaa 742

<210> 6

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P3

<400> 6

gattacaagg atgatgacga taagatggtg agcaagggcg agga 44

<210> 7

<211> 42

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P4

<400> 7

tcgtcatcat ccttgtaatc ttacttgtac agctcgtcca tg 42

<210> 8

<211> 37

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P5

<400> 8

gattacaagg atgatgacga taagggctgt tttggcg 37

<210> 9

<211> 36

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P6

<400> 9

ctgaagggcc tcctttcatg gtctgtttcc tgtgtg 36

<210> 10

<211> 34

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P7

<400> 10

cactgcataa ttcgtgtcgc tcaaggcgca ctcc 34

<210> 11

<211> 25

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P8

<400> 11

gtcgccgtcc agctcgacca ggatg 25

<210> 12

<211> 65

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P9

<400> 12

catgaaagga ggcccttcag atggattaca aggatgatga cgataagatg gtgagcaagg 60

gcgag 67

<210> 13

<211> 50

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P10

<400> 13

catgaaagga ggcccttcag atgattttag gcgtacccat tcaatatttg 50

<210> 14

<211> 49

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P11

<400> 14

cttatcgtca tcatccttgt aatcaggggt ggacgtcggc gcaactgtc 49

<210> 15

<211> 43

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P12

<400> 15

catgaaagga ggcccttcag atggctcagc gaaaactggc ctc 43

<210> 16

<211> 49

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P13

<400> 16

cttatcgtca tcatccttgt aatcggcgtt tactcgatct cgcaggatc 49

<210> 17

<211> 711

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> mCherry基因

<400> 17

atggtttcca agggcgagga ggacaacatg gcaatcatca aggaattcat gcgcttcaag 60

gttcacatgg agggctccgt caacggtcac gagttcgaaa tcgagggcga gggcgaaggt 120

cgtccatacg agggcaccca gaccgctaag ctcaaggtta ctaagggcgg tccactgcct 180

ttcgcatggg acatcctctc cccacagttc atgtacggct ctaaggctta cgttaagcac 240

ccagcagata tccctgacta cctgaagctt tccttcccag agggcttcaa gtgggaacgc 300

gtcatgaact tcgaggacgg tggcgttgtt accgtcaccc aggattcctc cctccaggac 360

ggcgagttca tctacaaggt gaagctgcgt ggtaccaact tcccatctga cggccctgtt 420

atgcagaaga agactatggg ctgggaagct tcctccgagc gcatgtaccc agaggatggt 480

gcactcaagg gcgaaatcaa gcagcgtctg aagcttaagg acggcggtca ctacgacgct 540

gaggttaaga ccacctacaa ggcaaagaag ccagtccagc tccctggcgc ttacaacgtt 600

aacatcaagc tggatatcac ctcccacaac gaggactaca ctatcgttga acagtacgag 660

cgcgcagagg gccgtcactc taccggtggc atggacgaac tctacaagta a 711

<210> 18

<211> 48

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P14

<400> 18

gattacaagg atgatgacga taagatggtt tccaagggcg aggaggac 48

<210> 19

<211> 51

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P15

<400> 19

cagcccttat cgtcatcatc cttgtaatct tacttgtaga gttcgtccat g 51

<210> 20

<211> 37

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P16

<400> 20

cttgtaggtg gtcttaacct cagcgtcgta gtgaccg 37

<210> 21

<211> 1980

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> amyE基因

<400> 21

atgtttgcaa aacgattcaa aacctcttta ctgccgttat tcgctggatt tttattgctg 60

tttcatttgg ttctggcagg accggcggct gcgagtgctg aaacggcgaa caaatcgaat 120

gagcttacag caccgtcgat caaaagcgga accattcttc atgcatggaa ttggtcgttc 180

aatacgttaa aacacaatat gaaggatatt catgatgcag gatatacagc cattcagaca 240

tctccgatta accaagtaaa ggaagggaat caaggagata aaagcatgtc gaactggtac 300

tggctgtatc agccgacatc gtatcaaatt ggcaaccgtt acttaggtac tgaacaagaa 360

tttaaagaaa tgtgtgcagc cgctgaagaa tatggcataa aggtcattgt tgacgcggtc 420

atcaatcata ccaccagtga ttatgccgcg atttccaatg aggttaagag tattccaaac 480

tggacacatg gaaacacaca aattaaaaac tggtctgatc gatgggatgt cacgcagaat 540

tcattgctcg ggctgtatga ctggaataca caaaatacac aagtacagtc ctatctgaaa 600

cggttcttag acagggcatt gaatgacggg gcagacggtt ttcgatttga tgccgccaaa 660

catatagagc ttccagatga tggcagttac ggcagtcaat tttggccgaa tatcacaaat 720

acatctgcag agttccaata cggagaaatc ctgcaggata gtgcctccag agatgctgca 780

tatgcgaatt atatggatgt gacagcgtct aactatgggc attccataag gtccgcttta 840

aagaatcgta atctgggcgt gtcgaatatc tcccactatg catctgatgt gtctgcggac 900

aagctagtga catgggtaga gtcgcatgat acgtatgcca atgatgatga agagtcgaca 960

tggatgagcg atgatgatat ccgtttaggc tgggcggtga tagcttctcg ttcaggcagt 1020

acgcctcttt tcttttccag acctgaggga ggcggaaatg gtgtgaggtt cccggggaaa 1080

agccaaatag gcgatcgcgg gagtgcttta tttgaagatc aggctatcac tgcggtcaat 1140

agatttcaca atgtgatggc tggacagcct gaggaactct cgaacccgaa tggaaacaac 1200

cagatattta tgaatcagcg cggctcacat ggcgttgtgc tggcaaatgc aggttcatcc 1260

tctgtctcta tcaatacggc aacaaaattg cctgatggca ggtatgacaa taaagctgga 1320

gcgggttcat ttcaagtgaa cgatggtaaa ctgacaggca cgatcaatgc caggtctgta 1380

gctgtgcttt atcctgatga tattgcaaaa gcgcctcatg ttttccttga gaattacaaa 1440

acaggtgtaa cacattcttt caatgatcaa ctgacgatta ccttgcgtgc agatgcgaat 1500

acaacaaaag ccgtttatca aatcaataat ggaccagaga cggcgtttaa ggatggagat 1560

caattcacaa tcggaaaagg agatccattt ggcaaaacat acaccatcat gttaaaagga 1620

acgaacagtg atggtgtaac gaggaccgag aaatacagtt ttgttaaaag agatccagcg 1680

tcggccaaaa ccatcggcta tcaaaatccg aatcattgga gccaggtaaa tgcttatatc 1740

tataaacatg atgggagccg agtaattgaa ttgaccggat cttggcctgg aaaaccaatg 1800

actaaaaatg cagacggaat ttacacgctg acgctgcctg cggacacgga tacaaccaac 1860

gcaaaagtga tttttaataa tggcagcgcc caagtgcccg gtcagaatca gcctggcttt 1920

gattacgtgc taaatggttt atataatgac tcgggcttaa gcggttctct tccccattga 1980

<210> 22

<211> 59

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P17

<400> 22

gattacaagg atgatgacga taagatgttt gcaaaacgat tcaaaacctc tttactgcc 59

<210> 23

<211> 53

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P18

<400> 23

cttatcgtca tcatccttgt aatctcaatg gggaagagaa ccgcttaagc ccg 53

<210> 24

<211> 35

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<220>

<223> P19

<400> 24

gaacgaccaa ttccatgcat gaagaatggt tccgc 35