Yh66-rs07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用

文档序号:1871403 发布日期:2021-11-23 浏览:30次 >En<

阅读说明:本技术 Yh66-rs07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用 (Engineering bacterium obtained by YH66-RS07020 gene modification and application thereof in preparation of valine ) 是由 田斌 孟刚 魏爱英 赵春光 贾慧萍 杨立鹏 于 2021-08-23 设计创作,主要内容包括:本发明公开了YH66-RS07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用。本发明提供了用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质或降低YH66-RS07020蛋白丰度的物质或降低YH66-RS07020蛋白活性的物质在提高细菌缬氨酸产量中的应用。本发明发现YH66-RS07020蛋白对细菌的缬氨酸产量存在负调控,即YH66-RS07020蛋白含量增高、缬氨酸产量降低,YH66-RS07020蛋白含量降低、缬氨酸产量增高。抑制YH66-RS07020基因表达可以提高缬氨酸产量,过表达YH66-RS07020基因降低缬氨酸产量。进一步,本发明发现了YH66-RS07020~(C251T)蛋白及其编码基因和应用。本发明对于缬氨酸工业化生产,具有重大的应用价值。(The invention discloses an engineering bacterium obtained by YH66-RS07020 gene modification and application thereof in valine preparation. The invention provides an application of a substance for inhibiting YH66-RS07020 gene expression or a substance for reducing YH66-RS07020 protein abundance or a substance for reducing YH66-RS07020 protein activity in improving the yield of bacterial valine. The invention discovers that YH66-RS07020 protein has negative regulation and control on the yield of valine of bacteria, namely YH66-RS07020 protein content is increased,The yield of valine is reduced, the content of YH66-RS07020 protein is reduced, and the yield of valine is increased. The suppression of YH66-RS07020 gene expression can improve valine yield, and the overexpression of YH66-RS07020 gene can reduce valine yield. Further, YH66-RS07020 was found in the invention C251T Protein and its coding gene and application. The invention has great application value for industrial production of valine.)

YH66-RS07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的 应用

技术领域

本发明属于生物技术领域,涉及一种YH66-RS07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用,具体的所述改造为C251T。

背景技术

缬氨酸是组成蛋白质的20种氨基酸之一,是人体必需的8种氨基酸和生糖氨基酸,它与其他两种高浓度氨基酸(异亮氨酸和亮氨酸)一起工作促进身体正常生长,修复组织,调节血糖,并提供需要的能量。在参加激烈体力活动时,缬氨酸可以给肌肉提供额外的能量产生葡萄糖,以防止肌肉衰弱。缬氨酸还帮助从肝脏清除多余的氮(潜在的毒素),并将身体需要的氮运输到各个部位。

缬氨酸是一种必需氨基酸,这意味着身体本身不能生产,必须通过膳食来源获得补充。它的天然食物来源包括谷物、奶制品、香菇、蘑菇、花生、大豆蛋白和肉类。尽管大多数人都可以从饮食中获得足够的数量,但是缬氨酸缺乏症的案例也屡见不鲜。当缬氨酸不足时,大脑中枢神经系统功能会发生紊乱,共济失调而出现四肢震颤。通过解剖切片脑组织,发现有红核细胞变性现象,晚期肝硬化病人因肝功能损害,易形成高胰岛素血症,致使血中支链氨基酸减少,支链氨基酸和芳香族氨基酸的比值由正常人的3.0-3.5降至1.0-1.5,故常用缬氨酸等支链氨基酸的注射液治疗肝功能衰竭以及酗酒和吸毒对这些器官造成的损害。此外,缬氨酸也可作为加快创伤愈合的治疗剂。L-缬氨酸,别名为2-氨基-3-甲基丁酸,CAS号为72-18-4,MDL号为MFCD00064220,EINECS号为200-773-6。目前制备L-缬氨酸主要是化学合成法。化学合成法的局限性:生产成本高,反应复杂,步骤多,且有许多副产物。

发明内容

本发明的目的是提供一种YH66-RS07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用。

本发明提供了用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质或降低YH66-RS07020蛋白丰度的物质或降低YH66-RS07020蛋白活性的物质的应用;

所述应用为如下(Ⅰ)或(Ⅱ)或(Ⅲ):

(Ⅰ)在提高细菌缬氨酸产量中的应用;

(Ⅱ)在生产缬氨酸中的应用;

(Ⅲ)在提高细菌菌量中的应用。

所述YH66-RS07020基因为编码YH66-RS07020蛋白的基因。

所述YH66-RS07020蛋白为如下(a1)或(a2)或(a3):

(a1)序列表的序列3所示的蛋白质;

(a2)来源于细菌且与(a1)具有95%以上同一性且与细菌产缬氨酸相关的蛋白质;

(a3)将(a1)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的且与细菌产缬氨酸相关的由(a1)衍生的蛋白质。

这里使用的术语“同一性”指与天然氨基酸序列的序列相似性。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。

所述95%以上同一性具体可为96%以上同一性或97%以上同一性或98%以上同一性或99%以上同一性。

具体的,所述YH66-RS07020基因为如下(b1)或(b2)或(b3):

(b1)编码区如序列表的序列4所示的DNA分子;

(b2)来源于细菌且与(b1)具有95%以上同一性且编码所述蛋白质的DNA分子;

(b3)在严格条件下与(b1)杂交且编码所述蛋白质的DNA分子。

这里使用的术语“同一性”指与天然核酸序列的序列相似性。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。

所述95%以上同一性具体可为96%以上同一性或97%以上同一性或98%以上同一性或99%以上同一性。

所述严格条件可为在0.1×SSPE(或0.1×SSC),0.1%SDS的溶液中,在65℃条件下杂交并洗膜。

所述抑制YH66-RS07020基因表达可为敲除YH66-RS07020基因,也可为突变YH66-RS07020基因。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列5所示的DNA分子或具有序列表的序列5所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列8所示的DNA分子或具有序列表的序列8所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为实施例中的重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T或重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020。

本发明还提供了一种重组菌,是抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达得到的。

所述抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达可为敲除细菌中的YH66-RS07020基因,也可为突变细菌中的YH66-RS07020基因。

所述敲除可为敲除基因的部分区段,也可为敲除基因的整个编码框。

示例性的,敲除细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中缺失序列表的序列4所示的DNA分子。

对于突变细菌中的YH66-RS07020基因,本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向突变或基因编辑等。

示例性的,突变细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中编码的YH66-RS07020蛋白的第84位氨基酸残基的密码子由编码A的密码子突变为编码其他氨基酸残基的密码子。具体的,所述其他氨基酸残基为V。

示例性的,突变细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中的YH66-RS07020基因发生如下点突变:第251位核苷酸由C突变为其他核苷酸(具体可为T)。

示例性的,抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达的实现方式可为:在细菌中导入用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质。

所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列5所示的DNA分子或具有序列表的序列5所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列8所示的DNA分子或具有序列表的序列8所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为实施例中的重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T或重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020。

本发明还保护所述重组菌在制备缬氨酸中的应用。

本发明还保护一种制备缬氨酸的方法,包括如下步骤:发酵所述重组菌。

本领域技术人员可以采用现有技术中的发酵方法进行发酵。也可通过常规试验进行发酵方法的优化和改进。可以在本领域中已知的发酵条件下在合适的培养基中进行细菌的发酵。培养基可以包含:碳源、氮源、微量元素、及其组合。在培养中,可以调节培养物的pH。此外,培养时可以包括防止气泡产生,例如通过使用消泡剂进行气泡产生的防止。此外,培养时可以包括将气体注射入培养物中。气体可以包括能够维持培养物的需氧条件的任何气体。在培养中,培养物的温度可以是20至45℃。

所述方法还可包括如下步骤:从培养物中获得缬氨酸。从培养物中获得缬氨酸可通过各种方式实现,包括但不限于:用硫酸或氢氯酸等处理培养物,接着进行诸如阴离子交换层析、浓缩、结晶和等电点沉淀的方法的组合。

所述发酵中,示例性的发酵培养基的配方见表3,余量为水。

所述发酵中,示例性的发酵控制工艺见表4。

示例性的,所述发酵中,完成接种的初始时刻,体系OD值可为0.3-0.5。

示例性的,所述发酵的发酵过程中:用于调pH的为氨水;发酵体系中有泡沫时,加入适量消泡剂antifoam(CB-442);通过补加70%葡萄糖水溶液控制体系含糖量(残糖)。

本发明还提供了一种提高细菌的缬氨酸产量的方法,包括如下步骤:抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达或降低细菌中YH66-RS07020蛋白丰度或降低细菌中YH66-RS07020蛋白活性。

所述抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达可为敲除细菌中的YH66-RS07020基因,也可为突变细菌中的YH66-RS07020基因。

所述敲除可为敲除基因的部分区段,也可为敲除基因的整个编码框。

示例性的,敲除细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中缺失序列表的序列4所示的DNA分子。

对于突变细菌中的YH66-RS07020基因,本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向突变或基因编辑等。

示例性的,突变细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中编码的YH66-RS07020蛋白的第84位氨基酸残基的密码子由编码A的密码子突变为编码其他氨基酸残基的密码子。具体的,所述其他氨基酸残基为V。

示例性的,突变细菌中的YH66-RS07020基因具体可为:使细菌基因组DNA中的YH66-RS07020基因发生如下点突变:第251位核苷酸由C突变为其他核苷酸(具体可为T)。

示例性的,抑制细菌中的YH66-RS07020基因表达的实现方式可为:在细菌中导入用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质。

所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列5所示的DNA分子或具有序列表的序列5所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为序列表的序列8所示的DNA分子或具有序列表的序列8所示的DNA分子的重组质粒。

示例性的,所述用于抑制YH66-RS07020基因表达的物质具体可为实施例中的重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T或重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020。

本发明还保护YH66-RS07020蛋白在调控细菌的缬氨酸产量中的应用。

所述调控为负调控,即YH66-RS07020蛋白含量增高,缬氨酸产量降低。

所述调控为负调控,即YH66-RS07020蛋白含量降低,缬氨酸产量增高。

本发明还保护YH66-RS07020蛋白在调控细菌的菌量中的应用。

所述调控为负调控,即YH66-RS07020蛋白含量增高,细菌菌量降低。

所述调控为负调控,即YH66-RS07020蛋白含量降低,细菌菌量增高。

本发明还保护一种突变蛋白,命名为YH66-RS07020C251T蛋白,是将YH66-RS07020蛋白第84位氨基酸残基由A突变为其他氨基酸残基得到的。

具体的,所述其他氨基酸残基为V。

示例性的,所述突变蛋白如序列表的序列1所示。

本发明还保护YH66-RS07020C251T蛋白的编码基因(命名为YH66-RS07020C251T基因)。

本发明还保护具有YH66-RS07020C251T基因的表达盒或具有YH66-RS07020C251T基因的重组载体或具有YH66-RS07020C251T基因的重组菌。

具体的,YH66-RS07020C251T基因为如下(c1)或(c2)或(c3):

(c1)编码区如序列表的序列2所示的DNA分子;

(c2)来源于细菌且与(c1)具有95%以上同一性且编码所述蛋白质的DNA分子;

(c3)在严格条件下与(c1)杂交且编码所述蛋白质的DNA分子。

这里使用的术语“同一性”指与天然核酸序列的序列相似性。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。

所述95%以上同一性具体可为96%以上同一性或97%以上同一性或98%以上同一性或99%以上同一性。

所述严格条件可为在0.1×SSPE(或0.1×SSC),0.1%SDS的溶液中,在65℃条件下杂交并洗膜。

本发明还保护YH66-RS07020C251T蛋白、YH66-RS07020C251T基因、具有YH66-RS07020C251T基因的表达盒或具有YH66-RS07020C251T的重组载体或具有YH66-RS07020C251T的重组菌在制备缬氨酸中的应用。

本发明还保护一种提高细菌的缬氨酸产量的方法,包括如下步骤:使细菌基因组DNA中编码的YH66-RS07020蛋白的第84位氨基酸残基的密码子由编码A的密码子突变为编码其他氨基酸残基的密码子。

具体的,所述其他氨基酸残基为V。

所述方法具体包括如下步骤:使细菌基因组DNA中的YH66-RS07020基因发生如下点突变:第251位核苷酸由C突变为其他核苷酸(具体可为T)。

所述方法具体包括如下步骤:在细菌中导入序列表的序列5所示的DNA分子或具有序列表的序列5所示的DNA分子的重组质粒。

以上任一所述细菌包括但不限于如下:棒杆菌属细菌,优选嗜乙酰棒杆菌(Corynebacterium acetoacidophilum)、醋谷棒杆菌(Corynebacteriumacetoglutamicum)、美棒杆菌(Corynebacterium callunae)、谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)、黄色短杆菌(Brevibacterium flavum)、乳糖发酵短杆菌(Brevibacterium lactofermentum)、产氨棒杆菌(Corynebacterium ammoniagenes)、北京棒杆菌(Corynebacterium pekinense)、解糖短杆菌(Brevibacterium saccharolyticum)、玫瑰色短杆菌(Brevibacterium roseum)、生硫短杆菌(Brevibacterium thiogenitalis)。

以上任一所述细菌为具有生产缬氨酸的能力的细菌。

“具有生产缬氨酸的能力的细菌”是指细菌具有以下能力:在培养基和/或细菌的细胞中产生并累积缬氨酸的能力。从而,当细菌在培养基中培养时可以收集缬氨酸。

所述细菌可为自然采集的野生型细菌也可为修饰后的细菌。

“修饰后的细菌”指的是将自然采集的野生型细菌进行人工突变和/或诱变得到的改造后的细菌。

具体的,所述谷氨酸棒杆菌可为谷氨酸棒杆菌CGMCC21260。

谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)YPFV1,已于2020年11月30日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所),保藏登记号为CGMCC No.21260。谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)YPFV1,又称为谷氨酸棒杆菌CGMCC21260。

以上任一所述缬氨酸的含义为广义的缬氨酸,包括游离形式缬氨酸、缬氨酸的盐或两者的混合物。

具体的,所述缬氨酸为L-缬氨酸。

以上任何方法或应用还可用于缬氨酸的下游产品的制备。

谷氨酸棒杆菌中的YH66-RS07020蛋白如序列表的序列3所示,其编码基因如序列表的序列4所示。本发明中通过引入点突变,得到了序列表的序列1所示的YH66-RS07020C251T蛋白,YH66-RS07020C251T蛋白的编码基因如序列表的序列2所示。与YH66-RS07020基因相比,YH66-RS07020C251T基因的差异在于第251位核苷酸由C突变为T。与YH66-RS07020蛋白相比,YH66-RS07020C251T蛋白的差异在于第84位氨基酸残基由A突变为V。

本发明发现YH66-RS07020蛋白对细菌的缬氨酸产量存在负调控,即YH66-RS07020蛋白含量增高、缬氨酸产量降低,YH66-RS07020蛋白含量降低、缬氨酸产量增高。抑制YH66-RS07020基因表达可以提高缬氨酸产量,过表达YH66-RS07020基因降低缬氨酸产量。进一步,本发明发现了YH66-RS07020C251T蛋白及其编码基因和应用。本发明对于缬氨酸工业化生产,具有重大的应用价值。

具体实施方式

下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐明本发明,而不是为了限制本发明的范围。以下提供的实施例可作为本技术领域普通技术人员进行进一步改进的指南,并不以任何方式构成对本发明的限制。

下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法,按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。pK18mobsacB质粒:Addgene公司;pK18mobsacB质粒中具有卡那霉素抗性基因作为筛选标记。pXMJ19质粒:BioVector质粒载体菌种细胞基因保藏中心;pXMJ19质粒中具有氯霉素抗性基因作为筛选标记。NEBuilder酶:NEB公司。如无特殊说明,实施例中的培养基为配方为表1的培养基(余量为水,pH为7.0)。不含卡那霉素培养基即表1所示的培养基。含卡那霉素的培养基由表1所示的培养基和卡那霉素组成,卡那霉素的含量为50μg/ml。如无特殊说明,实施例中的培养指的是32℃静置培养。实施例中的单链构象多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳(sscp-PAGE):采用的胶浓度为8%,电泳胶的组成见表2;电泳条件为:使用1×TBE缓冲液,120V电压,电泳时间10h。

如无特殊说明,以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。

表1

组分 在培养基中的浓度
蔗糖 10g/L
多聚蛋白胨 10g/L
牛肉膏 10g/L
酵母粉 5g/L
尿素 2g/L
氯化钠 2.5g/L
琼脂粉 20g/L

表2

组分 加入量
40%丙烯酰胺 8mL
ddH<sub>2</sub>O 26mL
甘油 4mL
10×TBE 2mL
TEMED 40μL
10%AP 600μL

实施例1、谷氨酸棒杆菌CGMCC21260的获得

谷氨酸棒杆菌ATCC15168:ATCC中编号为15168的谷氨酸棒杆菌(Corynebacteriumglutamicum)。

将谷氨酸棒杆菌ATCC15168进行诱变,获得谷氨酸棒杆菌(Corynebacteriumglutamicum)YPFV1。

谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)YPFV1,已于2020年11月30日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所),保藏登记号为CGMCC No.21260。谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)YPFV1,又称为谷氨酸棒杆菌CGMCC21260。

实施例2、构建重组菌YPV-013

P1:5'-CAGTGCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGAACGCCCGCATCGAAGACCT-3';

P2:5'-GCCGTAGTCCATGAGTACCCAGACGGCGTGCTCG-3';

P3:5'-CGAGCACGCCGTCTGGGTACTCATGGACTACGGC-3';

P4:5'-CAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCATCCTAGAGGGGCACTTTTC-3'。

P5:5'-CGGACTGTTTTCCAACTGGC-3';

P6:5'-CCGGGGTTTGTTCCATGAGC-3'。

一、构建重组质粒

1、以谷氨酸棒杆菌ATCC15168为模板,采用引物P1和引物P2组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(674bp)。

2、以谷氨酸棒杆菌ATCC15168为模板,采用引物P3和引物P4组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(674bp)。

3、同时将步骤1回收的扩增产物和步骤2回收的扩增产物作为模板,采用引物P1和引物P4组成的引物对进行PCR扩增(Overlap PCR),回收扩增产物(1314bp)。经测序,扩增产物如序列表的序列5所示。

4、取pK18mobsacB质粒,采用限制性内切酶Xba I进行单酶切,回收线性化质粒。

5、将步骤3回收的扩增产物与步骤4回收的线性化质粒共孵育(采用NEBuilder酶,50℃孵育30min),得到重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T。经测序验证,重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T中具有序列表的序列5所示的DNA分子。

二、构建重组菌YPV-013

1、采用重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T对谷氨酸棒杆菌CGMCC21260进行电击转化,然后培养。

2、挑取步骤1中的菌株,采用含15%蔗糖的培养基培养,然后挑取单菌落,分别采用含卡那霉素的培养基和不含卡那霉素的培养基进行培养,筛选在含卡那霉素的培养基上不能生长且在不含卡那霉素的培养基上可以生长的菌株。

3、取步骤2筛选的菌株,采用引物P5和引物P6组成的引物对进行PCR扩增,然后回收扩增产物(278bp)。

4、取步骤3的扩增产物,先95℃变性10min再冰浴5min,然后进行sscp-PAGE。电泳时,采用重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T的扩增片段(即以重组质粒pK18-YH66-RS07020C251T为模板,采用引物P5和引物P6组成的引物对进行PCR扩增的扩增产物)为阳性对照,采用谷氨酸棒杆菌CGMCC21260的扩增片段(即以谷氨酸棒杆菌CGMCC21260为模板,采用引物P5和引物P6组成的引物对进行PCR扩增的扩增产物)为阴性对照,水作为空白对照。由于片段结构不同,电泳位置不同,电泳位置与阴性对照不一致且与阳性对照一致的菌株为筛选的目的菌株(等位替换成功的重组菌株)。

5、根据步骤4的结果,将筛选得到的菌株的步骤3的扩增产物进行测序验证,得到重组菌YPV-013。与谷氨酸棒杆菌CGMCC21260相比,重组菌YPV-013的差异仅在于将谷氨酸棒杆菌CGMCC21260基因组中的序列表的序列4所示的YH66-RS07020基因取代为了序列表的序列2所示的YH66-RS07020C251T基因。序列2和序列4仅存在一个核苷酸差异,位于第251位。重组菌YPV-013即将谷氨酸棒杆菌CGMCC21260中的YH66-RS07020基因进行突变(单点突变)得到的工程菌株。

实施例2、构建重组菌YPV-015和重组菌YPV-014

P7:5'-CAGTGCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGCATGACGGCTGACTGGACTC-3';

P8:5'-TGAAATGTAAGATTCAAAGAAATCGGACTCCTTAAATGGG-3';

P9:5'-CCCATTTAAGGAGTCCGATTTCTTTGAATCTTACATTTCA-3';

P10:5'-TGGGTGGTAAATTTTTCCATGGAACTCACCGTCCTTACAG-3';

P11:5'-CTGTAAGGACGGTGAGTTCCATGGAAAAATTTACCACCCA-3';

P12:5'-CTATGTGAGTAGTCGATTTATTAAGCGTTAGTGCGTGGCT-3';

P13:5'-AGCCACGCACTAACGCTTAATAAATCGACTACTCACATAG-3';

P14:5'-CAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCTGCATAAGAAACAACCACTT-3'。

P15:5'-GTCCGCTCTGTTGGTGTTCA-3';

P16:5'-AGAAGTTCGATGTCGGACTG-3'。

P17:5'-CCAACGTGGACACCGACCAG-3';

P18:5'-TGGAGGAATATTCGGCCCAG-3'。

一、构建重组菌YPV-015

1、以重组菌YPV-013为模板,采用引物P7和引物P8组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(806bp)。

2、以重组菌YPV-013为模板,采用引物P9和引物P10组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(293bp)。

3、以重组菌YPV-013为模板,采用引物P11和引物P12组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(634bp)。

4、以重组菌YPV-013为模板,采用引物P13和引物P14组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(783bp)。

5、取pK18mobsacB质粒,采用限制性内切酶Xba I进行单酶切,回收线性化质粒。

6、将步骤1回收的扩增产物、步骤2回收的扩增产物、步骤3回收的扩增产物、步骤4回收的扩增产物与步骤5回收的线性化质粒共孵育(采用NEBuilder酶,50℃孵育30min),得到重组质粒015。经测序验证,重组质粒015中具有序列表的序列6所示的DNA分子。

7、采用重组质粒015对谷氨酸棒杆菌CGMCC21260进行电击转化,然后培养,然后对各个单菌落分别进行PCR鉴定(采用引物P15和引物P16组成的引物对),能扩增出1454bp条带的菌株为阳性菌株。

8、挑取步骤7中的阳性菌株,采用含15%蔗糖的培养基培养,然后挑取单菌落,分别采用含卡那霉素的培养基和不含卡那霉素的培养基进行培养,筛选在含卡那霉素的培养基上不能生长且在不含卡那霉素的培养基上可以生长的菌株。

9、取步骤8筛选的菌株,采用引物P17和引物P18组成的引物对进行PCR扩增,扩增出1335bp条带的菌株为YH66-RS07020C251T基因整合到谷氨酸棒杆菌CGMCC21260基因组上的阳性菌株,将其命名为重组菌YPV-015。重组菌YPV-015为基因组上过表达YH66-RS07020C251T基因的工程菌株。

二、构建重组菌YPV-014

将模板均由“重组菌YPV-013”替换为“谷氨酸棒杆菌ATCC15168”,其他同步骤一。

得到YH66-RS07020基因整合到谷氨酸棒杆菌CGMCC21260基因组上的阳性菌株,将其命名为重组菌YPV-014。重组菌YPV-014为基因组上过表达YH66-RS07020基因的工程菌株。与重组菌YPV-015相比,重组菌YPV-014的差异仅在于:整合到谷氨酸棒杆菌CGMCC21260基因组的外源DNA的序列中,序列4取代了序列2。

实施例3、构建重组菌YPV-017和重组菌YPV-016

一、构建重组菌YPV-017

1、以重组菌YPV-013为模板,采用引物P19和引物P20组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(917bp)。经测序,扩增产物如序列表的序列7所示。

P19:5'-GCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGAGGATCCCCTCTTTGAATCTTACATTTCA-3';

P20:5'-ATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACTTAAGCGTTAGTGCGTGGCT-3'。

2、取pXMJ19质粒,采用限制性内切酶EcoR I酶切进行单酶切,回收线性化质粒。

3、将步骤1回收的扩增产物与步骤2回收的线性化质粒共孵育(采用NEBuilder酶,50℃孵育30min),得到重组质粒pXMJ19-YH66-RS07020C251T。经测序验证,重组质粒pXMJ19-YH66-RS07020C251T中具有序列表的序列7所示的DNA分子。

4、将重组质粒pXMJ19-YH66-RS07020C251T电转导入谷氨酸棒杆菌CGMCC21260,得到重组菌YPV-017。重组菌YPV-017为通过质粒过表达pXMJ19-YH66-RS07020C251T基因的工程菌株。

二、构建重组菌YPV-016

将模板由“重组菌YPV-013”替换为“谷氨酸棒杆菌ATCC15168”,其他同步骤一。

得到重组菌YPV-016。重组菌YPV-016为通过质粒过表达YH66-RS07020基因的工程菌株。与重组菌YPV-017相比,重组菌YPV-016的差异仅在于:通过质粒过表达的外源DNA的序列中,序列4取代了序列2。

实施例4、构建基因组上缺失YH66-RS07020基因的工程菌株

P21:5'-CAGTGCCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGCGTGCCGGCATGATCGCCCC-3';

P22:5'-TTTCGCTATCAGACTGAAACTCTTTTTCTAGCCTTCCTTA-3';

P23:5'-TAAGGAAGGCTAGAAAAAGAGTTTCAGTCTGATAGCGAAA-3';

P24:5'-CAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCGTTGCCCTTCAAACCCACCG-3'。

P25:5'-CGTGCCGGCATGATCGCCCC-3';

P26:5'-GTTGCCCTTCAAACCCACCG-3'。

一、构建重组质粒

1、以谷氨酸棒杆菌ATCC15168为模板,采用引物P21和引物P22组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(上游同源臂片段,787bp)。

2、以谷氨酸棒杆菌ATCC15168为模板,采用引物P23和引物P24组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物(下游同源臂片段,773bp)。

3、同时将步骤1回收的扩增产物和步骤2回收的扩增产物作为模板,采用引物P21和引物P24组成的引物对进行PCR扩增(Overlap PCR),回收扩增产物(1520bp)。经测序,扩增产物如序列表的序列8所示。

4、取pK18mobsacB质粒,采用限制性内切酶Xba I进行单酶切,回收线性化质粒。

5、将步骤3回收的扩增产物与步骤4回收的线性化质粒共孵育(采用NEBuilder酶,50℃孵育30min),得到重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020。经测序验证,重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020中具有序列表的序列8所示的DNA分子。

二、构建重组菌YPV-018

1、采用重组质粒pK18-ΔYH66-RS07020对谷氨酸棒杆菌CGMCC21260进行电击转化,然后培养,然后对各个单菌落分别进行PCR鉴定(采用引物P25和P26组成的引物对)。能同时扩增出1446bp及2040bp条带的菌株为阳性菌株。只扩增出2040bp条带的菌株为转化失败的出发菌,其中的2040bp片段如序列表的序列9所示。

2、挑取步骤1中的阳性菌株,采用含15%蔗糖的培养基培养,然后挑取单菌落,分别采用含卡那霉素的培养基和不含卡那霉素的培养基进行培养,筛选在含卡那霉素的培养基上不能生长且在不含卡那霉素的培养基上可以生长的菌株。

3、取步骤2筛选的菌株,采用引物P25和引物P26组成的引物对进行PCR扩增,扩增产物仅为一种且为1446bp的菌株为YH66-RS07020基因编码区被敲除的阳性菌株。

4、将步骤3筛选得到的菌株,再次采用引物P25和引物P26组成的引物对进行PCR扩增并测序,将测序正确的菌株命名为重组菌YPV-018。与谷氨酸棒杆菌CGMCC21260的基因组DNA相比,重组菌YPV-018的差异仅在于缺失了序列表的序列4所示的DNA分子。

实施例5、发酵制备L-缬氨酸

供试菌株分别为:谷氨酸棒杆菌CGMCC21260、重组菌YPV-013、重组菌YPV-014、重组菌YPV-015、重组菌YPV-016、重组菌YPV-017和重组菌YPV-018。

发酵罐:BLBIO-5GC-4-H型号的发酵罐(上海百仑生物科技有限公司)。

发酵培养基的配方见表3,余量为水。

表3发酵培养基配方

成分 含量
硫酸铵 14g/L
磷酸二氢钾 1g/L
磷酸氢二钾 1g/L
硫酸镁 0.5g/L
酵母粉 2g/L
硫酸亚铁 18mg/L
硫酸锰 4.2mg/L
生物素 0.02mg/L
维生素B1 2mg/L
消泡剂antifoam(CB-442) 0.5mL/L
葡萄糖(底糖) 40g/L

发酵控制工艺见表4。

完成接种的初始时刻,体系OD值为0.3-0.5。

发酵过程中:用于调pH的为氨水;发酵体系中有泡沫时,加入适量消泡剂antifoam(CB-442);通过补加70%葡萄糖水溶液控制体系含糖量(残糖)。

表4发酵控制工艺

完成发酵后,收集上清,采用HPLC检测上清中的L-缬氨酸产量。

结果见表5。重组菌YPV-013和重组菌YPV-018的L-缬氨酸产量显著高于谷氨酸棒杆菌CGMCC21260。结果表明,抑制YH66-RS07020基因表达可以提高L-缬氨酸产量,过表达YH66-RS07020基因降低L-缬氨酸产量。

表5 L-缬氨酸发酵实验结果

菌株 OD<sub>610</sub> L-缬氨酸产量(g/L)
谷氨酸棒杆菌CGMCC21260 98.1 82.4
重组菌YPV-013 98.7 85.9
重组菌YPV-014 97.9 80.9
重组菌YPV-015 97.4 80.6
重组菌YPV-016 97.3 79.7
重组菌YPV-017 97.2 80.8
重组菌YPV-018 99.7 85.3

以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说,在不脱离本发明的宗旨和范围,以及无需进行不必要的实验情况下,可在等同参数、浓度和条件下,在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例,应该理解为,可以对本发明作进一步的改进。总之,按本发明的原理,本申请欲包括任何变更、用途或对本发明的改进,包括脱离了本申请中已公开范围,而用本领域已知的常规技术进行的改变。按以下附带的权利要求的范围,可以进行一些基本特征的应用。

序列表

<110> 黑龙江伊品生物科技有限公司

<120> YH66-RS07020基因改造得到的工程菌及其在制备缬氨酸中的应用

<130> GNCYX211994

<160> 9

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 197

<212> PRT

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

Met Glu Lys Phe Thr Thr His Thr Gly Val Gly Val Pro Leu Gln Arg

1 5 10 15

Ser Asn Val Asp Thr Asp Gln Ile Ile Pro Ala Val Tyr Leu Lys Arg

20 25 30

Val Thr Arg Thr Gly Phe Glu Asp Gly Leu Phe Ser Asn Trp Arg Gln

35 40 45

Asn Asp Pro Asn Phe Val Leu Asn Thr Asp Thr Tyr Lys Asn Gly Ser

50 55 60

Val Leu Val Ala Gly Pro Asp Phe Gly Thr Gly Ser Ser Arg Glu His

65 70 75 80

Ala Val Trp Val Leu Met Asp Tyr Gly Phe Arg Ala Val Phe Ser Ser

85 90 95

Arg Phe Ala Asp Ile Phe Arg Gly Asn Ser Gly Lys Ala Gly Met Leu

100 105 110

Ala Gly Ile Met Glu Gln Ser Asp Ile Glu Leu Leu Trp Lys Leu Met

115 120 125

Glu Gln Thr Pro Gly Leu Glu Leu Thr Val Asn Leu Glu Lys Gln Ile

130 135 140

Val Thr Ala Gly Asp Val Val Ile Ser Phe Glu Val Asp Pro Tyr Ile

145 150 155 160

Arg Trp Arg Leu Met Glu Gly Leu Asp Asp Ala Gly Leu Thr Leu Arg

165 170 175

Lys Leu Asp Glu Ile Glu Asp Tyr Glu Ala Lys Arg Pro Ala Phe Lys

180 185 190

Pro Arg Thr Asn Ala

195

<210> 2

<211> 594

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

atggaaaaat ttaccaccca caccggcgtt ggcgttccac tgcagcgatc caacgtggac 60

accgaccaga tcatccccgc cgtctacctc aagcgcgtca cccgcacagg cttcgaagac 120

ggactgtttt ccaactggcg ccaaaacgac cccaactttg tcctcaacac cgacacctac 180

aagaacggct ccgttctcgt agcaggccct gactttggca ccggctcctc ccgcgagcac 240

gccgtctggg tactcatgga ctacggcttc cgcgctgtct tctcctcacg attcgccgac 300

atcttccgcg gcaactccgg aaaagctggc atgctcgccg gcatcatgga acagtccgac 360

atcgaacttc tgtggaagct catggaacaa accccgggcc tcgaactgac cgtgaacctg 420

gaaaagcaga tcgtcactgc aggcgacgta gtgatcagct tcgaagttga cccttacatt 480

cgctggcgtt tgatggaagg cctcgacgac gctggcctga ccctgcgcaa gctcgatgaa 540

attgaagact acgaggctaa gcgccctgcg tttaagccac gcactaacgc ttaa 594

<210> 3

<211> 197

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum

<400> 3

Met Glu Lys Phe Thr Thr His Thr Gly Val Gly Val Pro Leu Gln Arg

1 5 10 15

Ser Asn Val Asp Thr Asp Gln Ile Ile Pro Ala Val Tyr Leu Lys Arg

20 25 30

Val Thr Arg Thr Gly Phe Glu Asp Gly Leu Phe Ser Asn Trp Arg Gln

35 40 45

Asn Asp Pro Asn Phe Val Leu Asn Thr Asp Thr Tyr Lys Asn Gly Ser

50 55 60

Val Leu Val Ala Gly Pro Asp Phe Gly Thr Gly Ser Ser Arg Glu His

65 70 75 80

Ala Val Trp Ala Leu Met Asp Tyr Gly Phe Arg Ala Val Phe Ser Ser

85 90 95

Arg Phe Ala Asp Ile Phe Arg Gly Asn Ser Gly Lys Ala Gly Met Leu

100 105 110

Ala Gly Ile Met Glu Gln Ser Asp Ile Glu Leu Leu Trp Lys Leu Met

115 120 125

Glu Gln Thr Pro Gly Leu Glu Leu Thr Val Asn Leu Glu Lys Gln Ile

130 135 140

Val Thr Ala Gly Asp Val Val Ile Ser Phe Glu Val Asp Pro Tyr Ile

145 150 155 160

Arg Trp Arg Leu Met Glu Gly Leu Asp Asp Ala Gly Leu Thr Leu Arg

165 170 175

Lys Leu Asp Glu Ile Glu Asp Tyr Glu Ala Lys Arg Pro Ala Phe Lys

180 185 190

Pro Arg Thr Asn Ala

195

<210> 4

<211> 594

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum

<400> 4

atggaaaaat ttaccaccca caccggcgtt ggcgttccac tgcagcgatc caacgtggac 60

accgaccaga tcatccccgc cgtctacctc aagcgcgtca cccgcacagg cttcgaagac 120

ggactgtttt ccaactggcg ccaaaacgac cccaactttg tcctcaacac cgacacctac 180

aagaacggct ccgttctcgt agcaggccct gactttggca ccggctcctc ccgcgagcac 240

gccgtctggg cactcatgga ctacggcttc cgcgctgtct tctcctcacg attcgccgac 300

atcttccgcg gcaactccgg aaaagctggc atgctcgccg gcatcatgga acagtccgac 360

atcgaacttc tgtggaagct catggaacaa accccgggcc tcgaactgac cgtgaacctg 420

gaaaagcaga tcgtcactgc aggcgacgta gtgatcagct tcgaagttga cccttacatt 480

cgctggcgtt tgatggaagg cctcgacgac gctggcctga ccctgcgcaa gctcgatgaa 540

attgaagact acgaggctaa gcgccctgcg tttaagccac gcactaacgc ttaa 594

<210> 5

<211> 1314

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 5

cagtgccaag cttgcatgcc tgcaggtcga ctctagaacg cccgcatcga agacctgcag 60

atcgccgctg acatcctcaa gggccacaaa atcgccgacg gcatgcgcat gatggtcgtg 120

ccttcctcca cctggatcaa gcaagaggcc gaagcactcg gactggacaa aatcttcacc 180

gacgctggcg ctgaatggcg taccgcaggc tgctccatgt gcctgggcat gaacccagac 240

caactgaagc caggcgagcg ctctgcatcc acctccaacc gaaacttcga aggacgccaa 300

ggaccaggag gccgcaccca cctggtatcc ccagcagtcg cagccgccac cgcaatccgc 360

ggcaccctgt cctcacctgc agatatctaa ggaaggctag aaaaagaatg gaaaaattta 420

ccacccacac cggcgttggc gttccactgc agcgatccaa cgtggacacc gaccagatca 480

tccccgccgt ctacctcaag cgcgtcaccc gcacaggctt cgaagacgga ctgttttcca 540

actggcgcca aaacgacccc aactttgtcc tcaacaccga cacctacaag aacggctccg 600

ttctcgtagc aggccctgac tttggcaccg gctcctcccg cgagcacgcc gtctgggtac 660

tcatggacta cggcttccgc gctgtcttct cctcacgatt cgccgacatc ttccgcggca 720

actccggaaa agctggcatg ctcgccggca tcatggaaca gtccgacatc gaacttctgt 780

ggaagctcat ggaacaaacc ccgggcctcg aactgaccgt gaacctggaa aagcagatcg 840

tcactgcagg cgacgtagtg atcagcttcg aagttgaccc ttacattcgc tggcgtttga 900

tggaaggcct cgacgacgct ggcctgaccc tgcgcaagct cgatgaaatt gaagactacg 960

aggctaagcg ccctgcgttt aagccacgca ctaacgctta agtttcagtc tgatagcgaa 1020

agcaccccgc aaccttcatt gtcgcggggt gcatttgtgc gtcttggtgg gcgagtggag 1080

tgggcatgtc tggaatagac caagaggccc tggattccct taaggtcttg gtctttttcg 1140

tacgttttga ggcctgggaa gtgcatatcc agaccaaggg accccggcaa gccaagaccc 1200

ttggtttaat atgacgttcc gccccgagca agccgaaacc attacctaga acgcatgaaa 1260

agtgcccctc taggatgggt accgagctcg aattcgtaat catggtcata gctg 1314

<210> 6

<211> 2396

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 6

cagtgccaag cttgcatgcc tgcaggtcga ctctagcatg acggctgact ggactcgact 60

tccatacgag gttctggaga agatctccac ccgcatcacc aacgaagttc cagatgtgaa 120

ccgcgtggtt ttggacgtaa cctccaagcc accaggaacc atcgaatggg agtaggcctt 180

aaatgagcct tcgttaagcg gcaatcacct tattggagat tgtcgctttt cccatttctc 240

cgggttttct ggaacttttt gggcgtatgc tgggaatgat tctattattg ccaaatcaga 300

aagcaggaga gacccgatga gcgaaatcct agaaacctat tgggcacccc actttggaaa 360

aaccgaagaa gccacagcac tcgtttcata cctggcacaa gcttccggcg atcccattga 420

ggttcacacc ctgttcgggg atttaggttt agacggactc tcgggaaact acaccgacac 480

tgagattgac ggctacggcg acgcattcct gctggttgca gcgctatccg tgttgatggc 540

tgaaaacaaa gcaacaggtg gcgtgaatct gggtgagctt gggggagctg ataaatcgat 600

ccggctgcat gttgaatcca aggagaacac ccaaatcaac accgcattga agtattttgc 660

gctctcccca gaagaccacg cagcagcaga tcgcttcgat gaggatgacc tgtctgagct 720

tgccaacttg agtgaagagc tgcgcggaca gctggactaa ttgtctccca tttaaggagt 780

ccgatttctt tgaatcttac atttcataga gtgagacgct tgcaggttgg ggtttaaacg 840

ttgtggatat cgattccctg caggggagct gtataaagtg tgaggtaaat ctaaaacgca 900

ggacgtgaca tttttggcgc gttttaggtt atactgtctc agacaacgaa actcttgtcc 960

cacattgtga gatttgcttg ctagaatgtg ggctagaaat tcctgaaaat ttttacgcac 1020

tgtaaggacg gtgagttcca tggaaaaatt taccacccac accggcgttg gcgttccact 1080

gcagcgatcc aacgtggaca ccgaccagat catccccgcc gtctacctca agcgcgtcac 1140

ccgcacaggc ttcgaagacg gactgttttc caactggcgc caaaacgacc ccaactttgt 1200

cctcaacacc gacacctaca agaacggctc cgttctcgta gcaggccctg actttggcac 1260

cggctcctcc cgcgagcacg ccgtctgggt actcatggac tacggcttcc gcgctgtctt 1320

ctcctcacga ttcgccgaca tcttccgcgg caactccgga aaagctggca tgctcgccgg 1380

catcatggaa cagtccgaca tcgaacttct gtggaagctc atggaacaaa ccccgggcct 1440

cgaactgacc gtgaacctgg aaaagcagat cgtcactgca ggcgacgtag tgatcagctt 1500

cgaagttgac ccttacattc gctggcgttt gatggaaggc ctcgacgacg ctggcctgac 1560

cctgcgcaag ctcgatgaaa ttgaagacta cgaggctaag cgccctgcgt ttaagccacg 1620

cactaacgct taataaatcg actactcaca tagggtcggg ctagtcattc tgatcagcga 1680

attccacgtt cacatcgcca attccagagt tcacaaccag attcagcatt ggaccttcta 1740

gatcagcatt gtgggcggtg agatctccaa catcacagcg cgctgtgccc acaccggcgg 1800

tacaacttag gctcacgggc acatcatcgg gcagggtgac catgacttcg ccgatccctg 1860

aggtgatttg gatgttttgt tcctgatcca attgggtgag gtggctgaaa tcgaggttca 1920

tttcacccac gccagaggtg tagctgctga ggagttcatc gttggtgggg atgagattga 1980

catcgccgat tccagggtcg tcttcaaagt agatgggatc gatatttgaa ataaacaggc 2040

ctgcgagggc gctcatgaca actccggtac caactacacc gccgacaatc catggccaca 2100

catggcgctt tttctgaggc ttttgtggag ggacttgtac atcccaggtg ttgtattggt 2160

tttgggcaag tggatcccaa tgaggcgctt cgggggtttg ttgcgcgaag ggtgcatagt 2220

agccctcaac gggggtgata gtgcttagat ctggttgggg ttgtgggtag agatcttcgt 2280

ttttcatggt ggcatcctca gaaacagtga attcagtggt gagtagtccg cggggtggaa 2340

gtggttgttt cttatgcagg gtaccgagct cgaattcgta atcatggtca tagctg 2396

<210> 7

<211> 917

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 7

gcttgcatgc ctgcaggtcg actctagagg atcccctctt tgaatcttac atttcataga 60

gtgagacgct tgcaggttgg ggtttaaacg ttgtggatat cgattccctg caggggagct 120

gtataaagtg tgaggtaaat ctaaaacgca ggacgtgaca tttttggcgc gttttaggtt 180

atactgtctc agacaacgaa actcttgtcc cacattgtga gatttgcttg ctagaatgtg 240

ggctagaaat tcctgaaaat ttttacgcac tgtaaggacg gtgagttcca tggaaaaatt 300

taccacccac accggcgttg gcgttccact gcagcgatcc aacgtggaca ccgaccagat 360

catccccgcc gtctacctca agcgcgtcac ccgcacaggc ttcgaagacg gactgttttc 420

caactggcgc caaaacgacc ccaactttgt cctcaacacc gacacctaca agaacggctc 480

cgttctcgta gcaggccctg actttggcac cggctcctcc cgcgagcacg ccgtctgggt 540

actcatggac tacggcttcc gcgctgtctt ctcctcacga ttcgccgaca tcttccgcgg 600

caactccgga aaagctggca tgctcgccgg catcatggaa cagtccgaca tcgaacttct 660

gtggaagctc atggaacaaa ccccgggcct cgaactgacc gtgaacctgg aaaagcagat 720

cgtcactgca ggcgacgtag tgatcagctt cgaagttgac ccttacattc gctggcgttt 780

gatggaaggc ctcgacgacg ctggcctgac cctgcgcaag ctcgatgaaa ttgaagacta 840

cgaggctaag cgccctgcgt ttaagccacg cactaacgct taagttttgg cggatgagag 900

aagattttca gcctgat 917

<210> 8

<211> 1520

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 8

cagtgccaag cttgcatgcc tgcaggtcga ctctagcgtg ccggcatgat cgccccagac 60

caaaccacct tcgactacgt tgaaggccgc gaaatggcac caaagggcgc cgactgggac 120

gaagcagttg cttactggaa gaccctgcca accgacgaag gcgcaacctt tgacaaggtc 180

gtagaaatcg atggctccgc actgacccca ttcatcacct ggggcaccaa cccaggccaa 240

ggtctgccac tgagcgaaac cgtgccaaac ccagaagact tcaccaacga caacgacaag 300

gcagcagccg aaaaggcact gcagtacatg gacctggtac caggaacccc actgcgcgac 360

atcaagatcg acaccgtctt cctgggatcc tgcaccaacg cccgcatcga agacctgcag 420

atcgccgctg acatcctcaa gggccacaaa atcgccgacg gcatgcgcat gatggtcgtg 480

ccttcctcca cctggatcaa gcaagaggcc gaagcactcg gactggacaa aatcttcacc 540

gacgctggcg ctgaatggcg taccgcaggc tgctccatgt gcctgggcat gaacccagac 600

caactgaagc caggcgagcg ctctgcatcc acctccaacc gaaacttcga aggacgccaa 660

ggaccaggag gccgcaccca cctggtatcc ccagcagtcg cagccgccac cgcaatccgc 720

ggcaccctgt cctcacctgc agatatctaa ggaaggctag aaaaagagtt tcagtctgat 780

agcgaaagca ccccgcaacc ttcattgtcg cggggtgcat ttgtgcgtct tggtgggcga 840

gtggagtggg catgtctgga atagaccaag aggccctgga ttcccttaag gtcttggtct 900

ttttcgtacg ttttgaggcc tgggaagtgc atatccagac caagggaccc cggcaagcca 960

agacccttgg tttaatatga cgttccgccc cgagcaagcc gaaaccatta cctagaacgc 1020

atgaaaagtg cccctctagg atgggttcta agcccctaac aggctcaaac ccaagcccat 1080

gcccgctcgc caaaccggag gccttaaacg cgctcctatt taaccggcag ggaactcgcc 1140

aggtaatcag cgccggtgaa cacaccgtcg tgaaagctca acacccacac gctgcccttt 1200

ttcgccttga tcttctcatc gatagggagg gtgccgttct cggagaacca tttgatcatt 1260

tccggaatga tgtcgccctg cccaacgatc atcggcacgc caccttgtgc aaccacgtcg 1320

gtgaagcgct tcttgcaggc ctcgggatcg gtttcccagg cgtcgtcgcc gaacagtcgg 1380

ttgacggaca cgtcgaggcc gagctcatcg gcaaggggga gcgcggtggc ttggcagcga 1440

tcgggcaccg ccgagtaaat tgcggtgggt ttgaagggca acgggtaccg agctcgaatt 1500

cgtaatcatg gtcatagctg 1520

<210> 9

<211> 2040

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 9

cgtgccggca tgatcgcccc agaccaaacc accttcgact acgttgaagg ccgcgaaatg 60

gcaccaaagg gcgccgactg ggacgaagca gttgcttact ggaagaccct gccaaccgac 120

gaaggcgcaa cctttgacaa ggtcgtagaa atcgatggct ccgcactgac cccattcatc 180

acctggggca ccaacccagg ccaaggtctg ccactgagcg aaaccgtgcc aaacccagaa 240

gacttcacca acgacaacga caaggcagca gccgaaaagg cactgcagta catggacctg 300

gtaccaggaa ccccactgcg cgacatcaag atcgacaccg tcttcctggg atcctgcacc 360

aacgcccgca tcgaagacct gcagatcgcc gctgacatcc tcaagggcca caaaatcgcc 420

gacggcatgc gcatgatggt cgtgccttcc tccacctgga tcaagcaaga ggccgaagca 480

ctcggactgg acaaaatctt caccgacgct ggcgctgaat ggcgtaccgc aggctgctcc 540

atgtgcctgg gcatgaaccc agaccaactg aagccaggcg agcgctctgc atccacctcc 600

aaccgaaact tcgaaggacg ccaaggacca ggaggccgca cccacctggt atccccagca 660

gtcgcagccg ccaccgcaat ccgcggcacc ctgtcctcac ctgcagatat ctaaggaagg 720

ctagaaaaag aatggaaaaa tttaccaccc acaccggcgt tggcgttcca ctgcagcgat 780

ccaacgtgga caccgaccag atcatccccg ccgtctacct caagcgcgtc acccgcacag 840

gcttcgaaga cggactgttt tccaactggc gccaaaacga ccccaacttt gtcctcaaca 900

ccgacaccta caagaacggc tccgttctcg tagcaggccc tgactttggc accggctcct 960

cccgcgagca cgccgtctgg gcactcatgg actacggctt ccgcgctgtc ttctcctcac 1020

gattcgccga catcttccgc ggcaactccg gaaaagctgg catgctcgcc ggcatcatgg 1080

aacagtccga catcgaactt ctgtggaagc tcatggaaca aaccccgggc ctcgaactga 1140

ccgtgaacct ggaaaagcag atcgtcactg caggcgacgt agtgatcagc ttcgaagttg 1200

acccttacat tcgctggcgt ttgatggaag gcctcgacga cgctggcctg accctgcgca 1260

agctcgatga aattgaagac tacgaggcta agcgccctgc gtttaagcca cgcactaacg 1320

cttaagtttc agtctgatag cgaaagcacc ccgcaacctt cattgtcgcg gggtgcattt 1380

gtgcgtcttg gtgggcgagt ggagtgggca tgtctggaat agaccaagag gccctggatt 1440

cccttaaggt cttggtcttt ttcgtacgtt ttgaggcctg ggaagtgcat atccagacca 1500

agggaccccg gcaagccaag acccttggtt taatatgacg ttccgccccg agcaagccga 1560

aaccattacc tagaacgcat gaaaagtgcc cctctaggat gggttctaag cccctaacag 1620

gctcaaaccc aagcccatgc ccgctcgcca aaccggaggc cttaaacgcg ctcctattta 1680

accggcaggg aactcgccag gtaatcagcg ccggtgaaca caccgtcgtg aaagctcaac 1740

acccacacgc tgcccttttt cgccttgatc ttctcatcga tagggagggt gccgttctcg 1800

gagaaccatt tgatcatttc cggaatgatg tcgccctgcc caacgatcat cggcacgcca 1860

ccttgtgcaa ccacgtcggt gaagcgcttc ttgcaggcct cgggatcggt ttcccaggcg 1920

tcgtcgccga acagtcggtt gacggacacg tcgaggccga gctcatcggc aagggggagc 1980

gcggtggctt ggcagcgatc gggcaccgcc gagtaaattg cggtgggttt gaagggcaac 2040

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