用于靶向突变型ras的组合物和方法

文档序号:1820646 发布日期:2021-11-09 浏览:25次 >En<

阅读说明:本技术 用于靶向突变型ras的组合物和方法 (Compositions and methods for targeting mutant RAS ) 是由 阿达姆·贝尔 罗伯特·冯德海德 杰拉尔德·里内特 比阿特丽斯·卡雷诺 于 2020-01-24 设计创作,主要内容包括:本发明涉及治疗与突变型RAS相关的癌症的组合物和方法。在某些方面,本发明涉及抗原性RAS肽片段和在特定HLA类型的背景下结合特定的突变型RAS肽片段的T细胞受体。(The present invention relates to compositions and methods for treating cancers associated with a mutant RAS. In certain aspects, the invention relates to antigenic RAS peptide fragments and T cell receptors that bind to particular mutant RAS peptide fragments in the context of a particular HLA type.)

用于靶向突变型RAS的组合物和方法

相关申请的引证

本申请要求2019年1月25日提交的美国临时专利申请序列号62/796,733的优先权,该临时专利申请通过引证以其整体并入本文。

背景技术

体细胞突变已经被鉴定为肿瘤发生的常见驱动因子。Ras基因中的激活点突变是在人类癌症中鉴定的第一个体细胞点突变。RAS突变是在人类癌症中发现的最常见的体细胞突变,并且它们有助于各种高度流行的恶性肿瘤的发病机制,所述恶性肿瘤包括肺、结肠直肠和胰腺导管腺癌。突变型RAS(mutant RAS)是用于治疗癌症的一个有吸引力的靶标,因为其被认为是由癌细胞独特表达的驱动突变并且对肿瘤生长和存活很重要。这些突变通常涉及RAS蛋白的密码子12位置,并且氨基酸变化高度保守,最常见的是由G12C、G12D、G12R和G12V氨基酸取代引起的。病理性RAS突变是功能增益突变,其导致促进细胞生长的细胞内GTP酶信号转导的组成型激活(constitutive activation)。RAS突变可以在某些癌症类型中以高频率发现。例如,G12D和G12V突变存在于60%至70%的胰腺癌和20%至30%的结肠直肠癌中。不幸的是,没有有效的RAS癌蛋白的药理学抑制剂。

因此,本领域需要用于治疗突变型RAS相关癌症的组合物和方法。本发明解决并满足这些和其它需求。

发明内容

在一个方面,本发明提供了包含突变型RAS肽的免疫原性组合物(immunogeniccomposition),所述突变型RAS肽包含在相对于野生型RAS的G12的位置处的突变。在一个实施方式中,所述肽包含G12C、G12D、G12R或G12V突变。在一个实施方式中,突变型RAS肽包含9或10个氨基酸残基。

在一个实施方式中,突变型RAS肽包含与选自SEQ ID NO:1-16的氨基酸序列至少80%同源的氨基酸序列。在一个实施方式中,突变型RAS肽包含选自SEQ ID NO:1-16的氨基酸序列。

在一个实施方式中,本发明提供了包含编码突变型RAS肽的核酸序列的分离的核酸分子,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变。

在一个实施方式中,本发明提供了被修饰以包含或表达突变型RAS肽的细胞,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变。在一个实施方式中,所述细胞为免疫细胞。在一个实施方式中,免疫细胞选自由下述组成的组:抗原呈递细胞、B细胞、树突细胞、巨噬细胞、朗格汉斯细胞、T细胞、NK细胞、NK T细胞。

在一个方面,本发明提供了在受试者中诱导免疫应答(immune response,免疫响应)的方法,所述方法包括向受试者施用免疫组合物(immunological composition),所述免疫组合物包含突变型RAS肽,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变;或编码突变型RAS肽的核酸分子,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变。

在一个实施方式中,所述方法包括鉴定(identify,确定,识别)受试者的HLA类型,以及向受试者施用包含或编码突变型RAS肽的组合物,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变,其中突变型RAS肽与受试者的鉴定的HLA分子结合。在一个实施方式中,受试者患有RAS相关癌症或处于患上RAS相关癌症的风险中。在一个实施方式中,癌症选自由下述组成的组:胰腺癌、胰腺导管腺癌(PDA)、结肠癌、结直肠腺癌、骨髓瘤、多发性骨髓瘤、肺腺癌、黑色素瘤、子宫癌、甲状腺癌、急性骨髓性白血病(AML)、尿路上皮癌、胃腺癌和宫颈腺癌、头颈部鳞状细胞癌(SCC)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、食管腺癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、肺SCC、小细胞肺癌(SCLC)、肾乳头状癌、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌、宫颈SCC、卵巢腺癌、肾上腺癌、前列腺癌、成神经细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤(GBM)、成神经管细胞瘤、肾细胞癌(RCC)、食管SCC、骨肉瘤、肉瘤和小肠神经内分泌肿瘤(NET)。

在一个方面,本发明提供了在受试者中诱导免疫应答的方法,所述方法包括使细胞与包含突变型RAS肽的组合物接触,所述突变型RAS肽在相对于野生型RAS的G12的位置处包含突变,从而刺激细胞;以及向受试者施用经刺激的细胞(stimulated cell)。在一个实施方式中,所述方法包括使受试者的初始T细胞(T cell,幼稚T细胞)与呈递突变型RAS肽的抗原呈递细胞接触,从而刺激T细胞。在一个实施方式中,细胞对受试者而言是自体的。在一个实施方式中,T细胞和抗原呈递细胞对受试者而言是自体的。

在一个方面,本发明提供了一种组合物,其包含在选自由以下组成的组的HLA分子的背景下特异性地结合突变型RAS(mRAS)肽的T细胞受体(TCR):HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02。在一个实施方式中,相对于野生型RAS,所述RAS肽在对应于G12的位置处包含突变。在一个实施方式中,相对于野生型RAS,mRAS肽的突变对应于选自由G12C、G12D、G12R和G12V组成的组的突变。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2、TRAV39 CDR3、TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2、TRAV39 CDR3、TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV12-1CDR1、TRAV12-1 CDR2、TRAV12-1 CDR3、TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2、TRAV12-1 CDR3、TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2、TRAV17 CDR3、TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2、TRAV17 CDR3、TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2、TRAV17 CDR3、TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2、TRAV17 CDR3、TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2、TRAV19 CDR3、TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2、TRAV19 CDR3、TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3。

在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的至少一种CDR:TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2、TRAV4 CDR3、TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3。在一个实施方式中,TCR包含TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2、TRAV4 CDR3、TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2CDR3。

在一个实施方式中,所述组合物包含融合多肽,所述融合多肽包含TCRα链和TCRβ链。在一个实施方式中,融合多肽包含接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。

在一个方面,本发明提供了一种组合物,其包含编码TCR的分离的核酸分子,所述TCR在选自由以下组成的组的HLA分子的背景下特异性地结合突变型RAS(mRAS)肽:HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02。

在一个方面,本发明提供了一种细胞,其被修饰以表达在选自由以下组成的组的HLA分子的背景下特异性地结合突变型RAS(mRAS)肽的T细胞受体(TCR):HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02。在一个实施方式中,mRAS肽相对于野生型RAS在对应于G12的位置处包含突变。在一个实施方式中,相对于野生型RAS,mRAS肽的突变对应于选自由G12C、G12D、G12R和G12V组成的组的突变。

在一个实施方式中,所述细胞被修饰以表达包含TCRα链和TCRβ链的融合多肽。在一个实施方式中,通过引入编码多肽的分离的核酸分子对细胞进行遗传修饰(geneticallymodified,基因修饰),所述多肽包含TCRα链和TCRβ链中的至少一种。在一个实施方式中,所述细胞为免疫细胞。在一个实施方式中,免疫细胞选自由T细胞、NK细胞和NK T细胞组成的组。在一个实施方式中,所述细胞对患有与RAS相关的癌症的受试者而言是自体的。在一个实施方式中,所述细胞对具有选自由以下组成的组的HLA类型的受试者而言是自体的:HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02。

在一个方面,本发明提供了治疗患有与mRAS相关的癌症的受试者的方法,所述方法包括向受试者施用细胞,所述细胞被修饰以表达在选自由以下组成的组的HLA分子的背景下特异性地结合突变型RAS(mRAS)肽的T细胞受体(TCR):HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02。在一个实施方式中,受试者患有选自由以下组成的组的癌症:胰腺癌、胰腺导管腺癌(PDA)、结肠癌、结直肠腺癌、骨髓瘤、多发性骨髓瘤、肺腺癌、黑色素瘤、子宫癌、甲状腺癌、急性骨髓性白血病(AML)、尿路上皮癌、胃腺癌和宫颈腺癌、头颈部鳞状细胞癌(SCC)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、食管腺癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、肺SCC、小细胞肺癌(SCLC)、肾乳头状癌、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌、宫颈SCC、卵巢腺癌、肾上腺癌、前列腺癌、成神经细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤(GBM)、成神经管细胞瘤、肾细胞癌(RCC)、食管SCC、骨肉瘤、肉瘤和小肠神经内分泌肿瘤(NET)。

在一个实施方式中,所述方法包括鉴定受试者的HLA类型。在一个实施方式中,所述方法包括分离受试者的一个或多个细胞,以及修饰所述一个或多个细胞以表达TCR。在一个实施方式中,所述方法包括通过使所述一个或多个细胞与编码TCRα链和TCRβ链中的一种或多种的分离的核酸分子接触来修饰所述一个或多个细胞以表达TCR。

附图说明

当结合附图阅读时,将更好地理解上述发明内容以及下文本发明的示例性实施方式的详细描述。然而,应当理解,本发明不限于附图中示出的实施方式的精确布置和仪器。在附图中:

图1描绘了展示突变型RAS(mRAS)表位的发现策略的示意图。

图2描绘了用于预测mRAS的新表位的示例性计算方法的示意图。

图3描绘了证明所预测的mRAS肽对各种HLA分子的亲和力的示例性实验的结果。

图4A和图4B描绘了证明所预测的G12 mRAS肽对各种HLA分子的亲和力的示例性实验的结果。图4A描绘了代表使用antigen.garnish通过计算的方式预测具有<500nM亲和力的mRAS表位的热图。还代表了在美国人群中的HLA频率和在胰腺腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)和肺腺癌(LAC)中发生的KRAS突变频率。图4B描绘了总结所预测的mRAS表位与各种HLA分子的结合的表格。

图5描绘了使用荧光偏振测定来确定肽-MHC结合的示例性实验的结果。显示了各种mRAS肽对特定HLA分子的亲和力。

图6A和图6B描绘了提供对mRAS表位结合的生物化学评估的示例性实验的结果。(图6A)竞争性肽结合荧光偏振测定。由log[IC50]<3.7指示强的结合亲和力(虚线)。(图6B)通过闪烁迫近测定确定的肽稳定性。由灰色区域(范围)和虚线(平均值)指示已发表的T细胞表位的稳定性。

图7A至图7E描绘了使用所产生的单等位基因RAS串联小基因(TMG)细胞系的实验结果。(图7A)慢病毒载体构建体的示意图。(图7B)由mCherry和GFP阳性指示的HLA/RAS TMG修饰的K56细胞系的FACS图。通过FACS验证RAS TMG细胞系的(图7C)HLA I类和(图7D)HLA特异性表达。图7E描绘了野生型和mRAS长肽序列以及由RAS TMG构建体编码的病毒对照肽的表格。

图8A至图8J描绘了证明通过HLA I类免疫沉淀肽洗脱和串联质谱(MS/MS)检测到mRAS表位的示例性实验的结果。(图8A)A*03:01限制性KRAS G12D表位VVV_D。(图8B)A*03:01限制性KRAS G12V表位VV_V。(图8C)A*03:01限制性RAS G12V表位VVV_V。(图8D)A*03:01限制性RAS G12R表位VV_R。(图8E)A*11:01限制性RAS G12D表位VV_D。(图8F)A*11:01限制性RAS G12D表位VVV_D。(图8G)A*11:01限制性RAS G12V表位VVV_V。(图8H)A*11:01限制性RAS G12V表位VV_V。(图8I)A*11:01限制性RAS G12R表位VV_R。(图8J)B*07:02限制性RASG12R表位GA_R。

图9是描绘通过质谱检测到的mRAS表位的概要的示意图,其中阴影框表示在表位与HLA分子之间的结合。

图10描绘了比较在特定HLA类型的背景下预测到和检测到的mRAS表位的示例性实验的结果。红色突出显示的肽是通过计算预测的表位,所述表位是使用p/MHC IP HPLC串联质谱检测的。

图11描绘了详细说明用于产生和鉴定mRAS特异性CD8+ T细胞的方案的实验的示意图。

图12描绘了总结健康供体中mRAS特异性CD8+ T细胞反应的示例性实验的结果。

图13A至图13F描绘了证明mRAS表位的抗原性的示例性实验的结果。(图13A)A*03:01限制性、(图13B)A*11:01限制性和(图13C)B*07:02限制性mRAS表位反应的IFN-γELISPOT。(图13D-图13F)供体的代表性肽-MHC多聚体染色结果用红色符号突出显示。

图14描绘了证明了通过肽/MHC多聚体染色检测对mRAS特异性CD8+的检测的示例性实验的结果。

图15描绘了证明mRAS T细胞反应对感兴趣的mRAS肽具有高度特异性并且不表现出对野生型RAS肽有任何交叉反应性的示例性实验的结果。

图16描绘了如IFN-γ分泌和细胞毒性测定所证明的证明B7-G12R反应具有高亲和力的示例性实验的结果。重要的是,没有检测到针对表达野生型或可替代地突变型RAS肽的细胞系的反应性。

图17描绘了证明当被遗传修饰以表达HLA-B*07:02时HLA-B*07:02限制性RASG12R特异性CD8+ T细胞表现出针对PSN(一种具有内源性RAS G12R表达的PDA细胞系)的细胞毒性的示例性实验的结果。

图18描绘了证明鉴定mRAS特异性TCR序列的示例性实验的结果。

图19描绘了TCR831和TCR833的慢病毒构建体的设计。

图20描绘了总结另外的TCR构建体、它们的KRAS突变特异性、HLA限制性、α链和β链的同一性、以及相关的CDR3氨基酸序列的表格。

图21描绘了证明TCR831和TCR833在原代CD8+细胞上的转基因表达的示例性实验的结果。

图22描绘了证明转基因TCR831和TCR833对HLA-A*11:01限制性KRAS G12V具有高亲和力并且对野生型RAS抗原没有反应性的示例性实验的结果。此外,TCR831和TCR833识别由被遗传修饰以表达RASmg构建体的K562-A*11:01细胞内源性地加工和呈递的抗原。

图23描绘了证明TCR831和TCR833的转基因表达对表达内源性RASmg构建体的RASG12V肽但不表达野生型RAS G12V肽的K562-A*11:01细胞赋予细胞毒性的示例性实验的结果。

图24描绘了证明当被遗传修饰以表达HLA-A*11:01时TCR831和TCR833的转基因表达对Panc03.27(一种具有内源性RAS G12V表达的PDA细胞系)赋予细胞毒性的示例性实验的结果。

图25A至图25G描绘了表征TCR831表达和功能的实验结果。(图25A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图25B)通过Jurkat报告细胞评估TCR总亲和力(avidity)。(图25C)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型KRAS表位的交叉反应性。TCR831表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VVV_C)的交叉反应性。(图25D)在与A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR激活。(图25E)TCR831在原代CD8+ T细胞上的表达。(图25F)4小时51Cr测定结果表明,用G12V肽脉冲(蓝色)以及表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*11:01细胞的特异性裂解。(图25G)4小时51Cr测定结果表明,在10:1的效应子与靶标比率下A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解。细胞系颜色对应于图25C。

图26A至图26G描绘了表征TCR833表达和功能的示例性实验的结果。(图26A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图26B)通过Jurkat报告细胞评估TCR总亲和力。(图26C)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR831表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VVV_C)的交叉反应性。(图26D)在与A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR激活。(图26E)TCR833在原代CD8+ T细胞上的表达。(图26F)4小时51Cr测定结果表明,用G12V肽脉冲(蓝色)以及表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*11:01细胞的特异性裂解。(图26G)4小时51Cr测定结果表明,A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解。

图27A至图27C描绘了表征TCR897表达和功能的示例性实验的结果。(图27A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图27B)通过Jurkat报告细胞评估TCR总亲和力。(图27C)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR897表现出对RAS G12V(VV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VV_C)和G12D(VV_D)表位的交叉反应性。

图28A至图28G描绘了表征TCR896表达和功能的实验结果。(图28A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图28B)通过Jurkat报告细胞评估TCR总亲和力。(图28C)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR896表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型或可替代地突变型KRAS表位无特异性。(图28D)在与A*03:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR激活。(图28E)TCR896在原代CD8+ T细胞上的表达。(图28F)4小时51Cr测定结果表明,用G12V肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*03:01细胞的特异性裂解。(图28G)4小时51Cr测定结果表明,A*03:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解。

图29A和图29B描绘了表征TCR847表达和功能的示例性实验的结果。(图29A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图29B)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR847表现出对RAS G12R(GA_R)有特异性,但对野生型或可替代地突变型RAS表位无特异性。

图30A至图30E描绘了表征TCR864表达和功能的示例性实验的结果。(图30A)通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证TCR表达。(图30B)通过Jurkat报告细胞评估TCR总亲和力。(图30C)通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR864表现出对RAS G12R(GA_R)有特异性,但对野生型或可替代地突变型RAS表位无特异性。(图30D)TCR864在原代CD8+ T细胞上的表达。(图30E)4小时51Cr测定结果表明,用G12R肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-B*07:02细胞的特异性裂解。

图31描绘了使用树突状细胞(DC)针对mRAS短肽接种的临床试验的示意图。

图32描绘了用于鉴定在接种疫苗的PDA患者中的mRAS TCR的实验过程的示意图。

具体实施方式

本发明涉及用于治疗与突变型RAS(mRAS)相关的癌症的组合物和方法。RAS内的体细胞突变提供了一种非自身抗原的形式,使RAS突变的肿瘤对基于免疫的治疗方法(包括但不限于过继性T细胞疗法)敏感。T细胞具有能够识别可能由肿瘤细胞在HLA分子上表达和呈现的细胞内蛋白质中的细微突变的独特的T细胞受体(TCR)。

本发明适用于致癌蛋白RAS家族的任何成员,包括但不限于KRAS、NRAS和HRAS。本文所述的RAS热点突变(例如,在位置G12处的突变)在KRAS、NRAS和HRAS相关癌症中很常见。此外,本文所述的RAS肽的氨基酸序列在所有RAS家族成员中是保守的。因此,本文所述的突变型RAS肽和TCR可应用于诱导针对突变型RAS家族成员的免疫应答,以治疗与突变型RAS家族成员相关的癌症。如本文所用,“RAS”意在包括RAS蛋白质家族的任何成员。

本发明部分基于抗原性HLA限制性突变型RAS肽的鉴定。本文所述的RAS肽可以用作免疫原性组合物,以诱导针对mRAS的免疫应答。在某些实施方式中,本发明涉及包含本文所述的抗原性mRAS肽或编码本文所述的抗原性mRAS肽的核酸分子的免疫原性组合物,诸如疫苗。

本发明部分基于特异性地识别HLA限制性突变型RAS抗原的T细胞受体(TCR)序列的鉴定。本文所述的TCR序列在高度流行的HLA类型中识别常见的突变型RAS抗原。在某些方面,本发明涉及包含分离的TCR的组合物,或者涉及编码分离的TCR的核酸分子,其中分离的TCR特异性地结合RAS、mRAS或其片段。在一个实施方式中,组合物包含被遗传修饰以表达与RAS、mRAS或其片段特异性地结合的TCR的细胞,例如自体或同种异体T细胞。

在某些方面,本发明涉及使用本文所述的抗原性mRAS肽或TCR治疗或预防mRAS相关癌症的方法。在一个实施方式中,所述方法包括向受试者施用包含本文所述的mRAS肽或编码mRAS肽的核酸分子的免疫原性组合物。在一个实施方式中,所述方法包括向受试者施用免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含已经装载了一种或多种mRAS肽或编码本文所述的一种或多种mRAS肽的一种或多种核酸分子的抗原呈递细胞(APC),诸如树突细胞。在某些实施方式中,本发明涉及使用TCR疗法(例如过继性TCR疗法)的方法。在一个实施方式中,所述方法包括向患有mRAS相关癌症的受试者施用被遗传修饰以表达与RAS、mRAS或其片段特异性地结合的TCR的至少一种T细胞。

通过本发明的组合物和方法可治疗的示例性mRAS相关癌症包括但不限于胰腺导管腺癌(PDA)、结肠癌、结直肠腺癌、骨髓瘤、多发性骨髓瘤、肺腺癌、黑色素瘤、子宫癌、甲状腺癌、急性骨髓性白血病(AML)、尿路上皮癌、胃腺癌和宫颈腺癌、头颈部鳞状细胞癌(SCC)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、食管腺癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、肺SCC、小细胞肺癌(SCLC)、肾乳头状癌、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌、宫颈SCC、卵巢腺癌、肾上腺癌、前列腺癌、成神经细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤(GBM)、成神经管细胞瘤、肾细胞癌(RCC)、食管SCC、骨肉瘤、肉瘤和小肠神经内分泌肿瘤(NET)。

定义

除非另外定义,否则本文使用的所有技术和科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。尽管与本文中描述的那些方法和材料类似或等同的任何方法和材料可用于本发明的实践或测试,但对示例性方法和材料进行了描述。

如本文所用,以下每个术语在本节中都具有与之相关的含义。

本文中使用的冠词“一个”和“一种”是指冠词的语法对象的一个或超过一个(即,是指至少一个)。通过举例的方式,“一个要素”意指一个要素或超过一个要素。

如本文所用的术语“抑制(inhibit)”和“抑制(inhibition)”意指相对于对照值将活性或功能降低、抑制、减少或阻断了至少约10%。在一些实施方式中,与对照值相比,活性被抑制或阻断了至少约50%。在一些实施方式中,活性被抑制或阻断了至少约75%。在一些实施方式中,活性被抑制或阻断了至少约95%。

术语“有效量”和“药物有效量”是指足以提供所需生物学结果的药剂的量。该结果可以是疾病或障碍的体征、症状或原因的减少和/或缓解、或生物系统的任何其它期望的改变。本领域普通技术人员可以使用常规实验来确定任何个别情况下的适当有效量。

术语“患者”、“受试者”、“个体”等在本文中可互换使用,并且是指具有补体系统的任何动物(在一些实施方式中哺乳动物、以及在一些实施方式中人),包括需要针对病症或其后遗症的疗法或对病症或其后遗症易感的人。个体可以包括例如狗、猫、猪、牛、绵羊、山羊、马、大鼠、猴子和小鼠以及人。

术语“异常的”当用于生物体、组织、细胞或其成分的上下文中时,是指在至少一个可观察或可检测的特征(例如,年龄、治疗、一天中的时间等)上与显示“正常的”(预期的/稳态的)各自特征的那些生物体、组织、细胞或其成分不同的那些生物体、组织、细胞或其成分。对于一种细胞、组织类型或受试者而言正常或预期的特征对于不同的细胞或组织类型而言可能是异常的。

如本文所用的“激活”是指已经被充分刺激以诱导可检测的细胞增殖的T细胞状态。激活也可以与诱导的细胞因子产生和可检测的效应物功能相关。术语“激活的T细胞”是指除别的以外正在进行细胞分裂的T细胞。

“疾病”是受试者的一种健康状态,其中受试者不能维持体内平衡,并且其中如果疾病没有得到改善,则受试者的健康继续恶化。

相比之下,受试者的“障碍”是一种健康状态,其中受试者能够维持体内平衡,但是受试者的健康状态比不存在障碍的情况下更为不利。如果不进行治疗,障碍不一定会导致受试者的健康状态进一步下降。

如果疾病或障碍的体征或症状的严重性、患者经历这种体征或症状的频率、或两者都降低,则疾病或障碍被“减轻”。

如本文所用的术语“癌症”被定义为以异常细胞的快速和不受控制的生长为特征的疾病。癌细胞可以局部扩散,也可以通过血流和淋巴系统扩散到身体的其它部位。各种癌症的实例包括但不限于乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、宫颈癌、皮肤癌、胰腺癌、结直肠癌、肾癌、肝癌、脑癌、淋巴瘤、白血病、肺癌等。

如本文所用的术语“抗肿瘤效应”是指可以通过肿瘤体积减小、肿瘤细胞数量减少、转移数量减少、预期寿命增加、或与癌性病症相关的各种生理症状的改善来表现的生物效应。“抗肿瘤效应”也可以通过本发明的肽、多核苷酸、细胞和抗体首先预防肿瘤发生的能力来表现。

如本文所用,术语“自体的”意在是指来源于同一个体的随后将被重新引入该个体的任何材料。

“同种异体的”是指来源于同一物种的不同动物的移植物。

“异种的”是指来源于不同物种的动物的移植物。

化合物的“有效量”或“治疗有效量”是指化合物足以向施用该化合物的受试者提供有益效果的量。

如本文所用,“指导材料”包括出版物、记录、图表或任何其它表达介质,其可以用于传达在试剂盒中的本发明的化合物、组合物、载体或递送系统用于实现减轻本文所述的各种疾病或障碍的有用性。任选地或者可替代地,指导材料可以描述减轻哺乳动物的细胞或组织中的疾病或障碍的一种或多种方法。例如,本发明试剂盒的指导材料可以附着在含有本发明的鉴定化合物、组合物、载体或递送系统的容器上,或者与含有所鉴定化合物、组合物、载体或递送系统的容器一起运输。可替代地,指导材料可以与容器分开运输,目的是所述指导材料和所述化合物由接受者协同使用。

如本文所用的“可操作地连接(operably linked)”或“可操作地连接(operatively linked)”可以意指基因的表达受与其空间连接的启动子的控制。启动子可以位于受其控制的基因的5'(上游)或3'(下游)。在启动子与基因之间的距离可以近似等于在所述启动子所来源的基因中在该启动子与其所控制的基因之间的距离。如本领域已知的,可以调节该距离的变化而不损失启动子功能。

“治疗性治疗”是向表现出疾病或障碍的体征的受试者施用的治疗,目的是减轻或消除那些体征。

如本文所用,“治疗疾病或障碍”意指降低患者所经历的疾病或障碍的体征和/或症状的频率和/或严重性。

如本文所用的短语“生物样品”、“样品”或“样本”旨在包括其中可以检测到核酸或多肽的表达的包含细胞、组织或体液的任何样品。生物样品可以含有适合于检测所需生物标志物的任何生物材料,并且可以包含从个体获得的细胞和/或非细胞材料。此类生物样品的实例包括但不限于血液、淋巴、骨髓、活检和涂片。本质上是液体的样品在本文中被称为“体液”。生物样品可以通过各种技术(包括例如通过刮擦或擦拭区域或通过使用针来获取体液)从患者中获得。收集各种身体样品的方法在本领域中是熟知的。

“CDR”被定义为TCR或TCR链的互补决定区氨基酸序列。

如本文所用,“免疫测定”是指使用能够与靶分子特异性地结合的抗体来检测和定量所述靶分子的任何结合测定。

术语“特异性地结合”如在本文中针对多肽(例如,TCR或TCR链)使用时,意指识别并结合特定靶分子但基本上不识别或结合样品中的其它分子的多肽。在一些情况下,术语“特异性结合”或“特异性地结合”用于表示识别和结合取决于靶分子上特定结构(例如,抗原决定簇或表位)的存在。

基因的“编码区”由分别与由基因转录产生的mRNA分子的编码区同源或互补的基因编码链核苷酸残基和基因非编码链核苷酸组成。

mRNA分子的“编码区”也由与在翻译mRNA分子期间的转移RNA分子的反密码子区匹配或者编码终止密码子的mRNA分子的核苷酸残基组成。因此,编码区可以包括核苷酸残基,所述核苷酸残基包含在由mRNA分子编码的成熟蛋白质中不存在的氨基酸残基(例如,蛋白质输出信号序列中的氨基酸残基)的密码子。

“差异降低的表达”或“下调”是指生物标志物产物水平比对照低至少10%或更多,例如低20%、30%、40%、或50%、60%、70%、80%、90%或更少,和/或低2.0倍、1.8倍、1.6倍、1.4倍、1.2倍、1.1倍或更少,以及其间的任何和所有整体或部分增量。

“差异增加的表达”或“上调”是指生物标志物产物水平比对照高至少10%或更多,例如高20%、30%、40%、或50%、60%、70%、80%、90%或更多,和/或高1.1倍、1.2倍、1.4倍、1.6倍、1.8倍、2.0倍或更多,以及其间的任何和所有整体或部分增量。

如本文所用的“互补”是指核酸,是指在两个核酸链的区域之间或在同一核酸链的两个区域之间的序列互补的广义概念。已知第一核酸区域的腺嘌呤残基能够与第二核酸区域的残基形成特定的氢键(“碱基配对”),如果所述残基是胸腺嘧啶或尿嘧啶,则第二核酸区域与第一区域反平行。类似地,已知第一核酸链的胞嘧啶残基能够与第二核酸链的残基碱基配对,如果所述残基是鸟嘌呤,则第二核酸链与第一链反平行。如果当两个区域以反平行的方式排列时,第一区域的至少一个核苷酸残基能够与第二区域的残基碱基配对,则核酸的第一区域与相同或不同核酸的第二区域互补。在一些实施方式中,第一区域包含第一部分,并且第二区域包含第二部分,由此,当第一部分和第二部分以反平行的方式排列时,第一部分的至少约50%、和/或至少约75%、或至少约90%、或至少约95%的核苷酸残基能够与第二部分中的核苷酸残基碱基配对。在一些实施方式中,第一部分的所有核苷酸残基能够与第二部分的核苷酸残基碱基配对。

如本文所用的术语“DNA”被定义为脱氧核糖核酸。

“编码”是指在生物过程中用作合成具有确定的核苷酸序列(即,rRNA、tRNA和mRNA)或确定的氨基酸序列的其它聚合物和大分子的模板的、在多核苷酸中的特定核苷酸序列(诸如基因、cDNA或mRNA)的固有特性,以及由此产生的生物学特性。因此,如果与基因对应的mRNA的转录和翻译在细胞或其它生物系统中产生蛋白质,那么该基因编码该蛋白质。其核苷酸序列与mRNA序列相同并且通常在序列表中提供的编码链和用作基因或cDNA转录的模板的非编码链两者都可以被称为编码该基因或cDNA的蛋白质或其它产物。

除非另有说明,“编码氨基酸序列的核苷酸序列”包括为彼此的简并形式且编码相同氨基酸序列的所有核苷酸序列。短语编码蛋白质或RNA的核苷酸序列也可以包括内含子,以至于编码所述蛋白质的核苷酸序列在一些形式中可以含有内含子。

如本文所用的术语“杂交瘤”是指由B淋巴细胞和融合配偶体诸如骨髓瘤细胞的融合而产生的细胞。杂交瘤可以在细胞培养物中无限地克隆和维持,并且能够产生单克隆抗体。杂交瘤也可以被认为是杂交细胞。

“分离的”意指改变或脱离自然状态。例如,在活的受试者中天然地存在于其正常环境中的核酸或肽不是“分离的”,但是从其自然环境的共存物质中部分或完全分离的相同核酸或肽是“分离的”。分离的核酸或蛋白质可以作为基本上纯的形式存在,或者可以存在于非天然环境,诸如,例如宿主细胞中。

“分离的核酸”是指已从天然存在的状态中在侧面与其连接的序列中分离出来的核酸区段或片段,即已从通常与该片段邻接的序列中脱离的DNA片段,即所述序列在其天然存在的基因组中与所述片段邻接。该术语还适用于已从天然陪伴该核酸的其它组分(即在细胞中天然陪伴其的RNA或DNA或蛋白)中基本上纯的核酸。该术语因此包括例如并入载体中、并入自主复制的质粒或病毒中或并入原核细胞或真核细胞的基因组DNA中的重组DNA,或者其作为独立于其它序列的单独分子(即,作为cDNA或者通过PCR或限制酶消化产生的基因组或cDNA片段)存在。它还包括作为编码另外的多肽序列的杂种基因的一部分的重组DNA。

在本发明的上下文中,使用以下常见核酸碱基的缩写。“A”是指腺苷,“C”是指胞苷,“G”是指鸟苷,“T”是指胸苷,并且“U”是指尿苷。

如本文所用的术语“多核苷酸”被定义为核苷酸链。此外,核酸是核苷酸的聚合物。因此,如本文所用的核酸和多核苷酸是可互换的。本领域技术人员具有这样的一般知识:核酸是多核苷酸,所述多核苷酸可以被水解成单体“核苷酸”。单体核苷酸可以被水解成核苷。如本文所用,多核苷酸包括但不限于通过本领域可获得的任何手段获得的所有核酸序列,所述任何手段包括但不限于重组手段(即,使用普通克隆技术和PCR等从重组文库或细胞基因组中克隆核酸序列),以及通过合成手段。

如本文所用的“慢病毒”是指逆转录病毒科的一个属。慢病毒是逆转录病毒中唯一能够感染非分裂细胞的病毒;它们可以将大量的遗传信息递送到宿主细胞的DNA中,因此它们是基因递送载体最有效的方法之一。HIV、SIV和FIV全部都是慢病毒的实例。来源于慢病毒的载体提供了在体内实现显著水平的基因转移的手段。

如本文所用,术语“肽”、“多肽”和“蛋白质”可互换使用,并且是指由通过肽键共价连接的氨基酸残基构成的化合物。蛋白质或肽必须含有至少两个氨基酸,并且对可以组成蛋白质或肽的序列的最大氨基酸数量没有限制。多肽包括包含两个或更多个通过肽键彼此连接的氨基酸的任何肽或蛋白质。如本文所用,该术语既指短链(其在本领域中也通常被称为例如肽、寡肽和低聚物),也指长链(其在本领域中通常被称为蛋白质,蛋白质有许多类型)。“多肽”包括例如生物活性片段、基本同源的多肽、寡肽、同源二聚体、异质二聚体、多肽变体、经修饰的多肽、衍生物、类似物、融合蛋白等。多肽包括天然肽、重组肽、合成肽或其组合。

如本文所用的术语“RNA”被定义为核糖核酸。

如本文所用的术语“重组DNA”被定义为通过连接来自不同来源的DNA片段而产生的DNA。

如本文所用的术语“重组多肽”被定义为通过使用重组DNA方法产生的多肽。

如本文所用,“缀合”是指一个分子共价附接到第二个分子上。

“同源”是指在两种多肽之间或在两种核酸分子之间的序列相似性或序列同一性。当两条比较序列中的两者的某一位置均被相同的碱基或氨基酸单体亚基占据时,例如,如果两个DNA分子中的每一个中的某一位置均被腺嘌呤占据,则所述两个分子在该位置上是同源的。在两个序列之间的同源性百分比是由两个序列共享的匹配或同源位置数除以所比较位置数X 100的函数。例如,如果在两个序列中10个位置中有6个匹配或同源,那么这两个序列是60%同源的。举例来说,DNA序列ATTGCC和TATGGC享有50%的同源性。一般来说,当两个序列被比对以给出最大同源性时,进行比较。

如本文所用的术语“变体”是核酸序列或肽序列,其在序列上分别不同于参考核酸序列或肽序列,但保留了参考分子的基本生物学特性。核酸变体序列的变化可能不会改变由参考核酸编码的肽的氨基酸序列,或者可能导致氨基酸取代、添加、缺失、融合和截短。肽变体序列的变化通常是有限的或保守的,因此参考肽和变体的序列总体上非常相似,并且在许多区域中是相同的。变体和参考肽在氨基酸序列上可以因任意组合的一个或多个取代、添加、缺失而不同。核酸或肽的变体可以是天然存在的,诸如等位基因变体,或者可以是并非已知天然存在的变体。可以通过诱变技术或通过直接合成来制备核酸和肽的非天然存在的变体。在各种实施方式中,变体序列与参考序列是至少99%、至少98%、至少97%、至少96%、至少95%、至少94%、至少93%、至少92%、至少91%、至少90%、至少89%、至少88%、至少87%、至少86%、至少85%相同的。

如本文所用的术语“调节”可以意指改变底物水平或活性的任何方法。关于蛋白质的调节的非限制性实例包括影响表达(包括转录和/或翻译)、影响折叠、影响降解或蛋白质周转以及影响蛋白质的定位。关于酶的调节的非限制性实例还包括影响酶促活性。“调节因子”是指其活性包括影响底物的水平或活性的分子。调节因子可以是直接的或间接的。调节因子可以起着激活或抑制或以其它方式调节其底物的作用。

如本文所用的“扫描窗口”是指许多个连续位置的片段,其中序列可以独立于任何侧翼序列进行评估。扫描窗口通常沿着待评估序列的长度增量地移位,每个新的区段被独立评估。增量移位可以是1个或超过一个位置的移位。

如本文所用的“载体”可以意指含有复制起点的核酸序列。载体可以是质粒、噬菌体、细菌人工染色体或酵母人工染色体。载体可以是DNA或RNA载体。载体可以是自我复制的染色体外载体或整合到宿主基因组中的载体。

如本文所用,“基本上纯的”细胞是基本上不含其它细胞类型的细胞。基本上纯的细胞也是指已经从在其自然状态下通常与其相关联的其它细胞类型中分离出来的细胞。在一些情形中,基本上纯的细胞的群体是指同质的细胞群体。在其它情形中,这个术语简单地是指已经从在其天然状态下与它们天然地相关联的细胞中分离出来的细胞。在一些实施方式中,在体外培养细胞。在其它实施方式中,细胞不在体外培养。

范围:在整个本公开中,本发明的各个方面可以以范围的形式呈现。应理解,以范围形式描述仅是出于方便和简洁,而不应认为是对发明范围的呆板限制。因此,对范围的描述应认为是已具体公开了所有可能的子范围以及该范围内的各个数值。例如,对诸如1至6的范围的描述应理解为已具体公开了诸如1至3、1至4、1至5、2至4、2至6、3至6等的子范围,以及该范围内的各个数值,例如1、2、2.7、3、4、5、5.3和6。这种适用性与范围的广度无关。

描述

本发明涉及用于治疗mRAS相关癌症的组合物和方法。在各种实施方式中,本文所述的组合物和方法可以用于杀死癌细胞,减小肿瘤大小,抑制肿瘤生长,抑制肿瘤转移,减缓肿瘤进展或降低严重性等。

在一个方面,本发明涉及包含抗原性mRAS肽的免疫原性组合物,其中mRAS肽刺激或诱导抗-mRAS免疫应答。在某些实施方式中,mRAS肽包含mRAS的片段。在某些实施方式中,mRAS肽包含约5-15个氨基酸的氨基酸序列。在某些实施方式中,mRAS肽包含相对于野生型RAS在位置G12处具有突变的氨基酸序列。例如,在一个实施方式中,mRAS肽包含约5-15个氨基酸的氨基酸序列,并相对于野生型RAS包含G12C、G12D、G12R或G12V突变。

在一个方面,本发明提供了编码本文所述的mRAS肽的分离的核酸分子。在一个方面,本发明提供了包含本文所述的mRAS肽或编码mRAS肽的核酸分子的细胞,例如抗原呈递细胞。

在一个方面,本发明涉及包含多肽的组合物,所述多肽包含单独或一起特异性地结合RAS、mRAS或其片段的一个或多个TCR链(例如,TCRα链、TCRβ链、TCRδ链和TCRγ链)。在一个实施方式中,所述组合物包含含有TCRα链和TCRβ链的TCR,其中所述TCR特异性地结合RAS、mRAS或其片段。在下文中,提及“TCR”是指异质二聚体T细胞受体、单独的T细胞受体链(例如,TCRα链、TCRβ链、TCRδ链和TCRγ链)及其功能部分和变体。

在一个实施方式中,TCR特异性地结合mRAS,所述mRAS相对于野生型RAS包含在位置G12处的突变。例如,在某些实施方式中,相对于野生型RAS,TCR特异性地结合包含G12C、G12D、G12R或G12V突变的mRAS。在某些实施方式中,TCR特异性地结合mRAS的片段,其中所述片段在对应于G12的位置处包含突变。在某些实施方式中,在特定的HLA类型的背景下,TCR特异性地结合mRAS片段。在一个实施方式中,所述组合物包含含有TCRα链和TCRβ链的融合多肽,其中TCRα链和TCRβ链一起形成异质二聚体TCR。在一个实施方式中,融合多肽包含在TCRα链与TCRβ链之间的可切割接头。

在一个方面,本发明提供了编码本文所述的TCR的分离的核酸分子。在一个方面,本发明提供了被修饰以表达本文所述的TCR的细胞,诸如T细胞。

在一个实施方式中,本发明提供了在患有mRAS相关癌症、怀疑患有mRAS相关癌症或处于患上mRAS相关癌症的风险中的受试者中治疗或预防mRAS相关癌症的方法。通过本发明的组合物和方法可治疗或可预防的示例性mRAS相关癌症包括但不限于胰腺癌、胰腺导管腺癌(PDA)、结肠癌、结直肠腺癌、骨髓瘤、多发性骨髓瘤、肺腺癌、黑色素瘤、子宫癌、甲状腺癌、急性骨髓性白血病(AML)、尿路上皮癌、胃腺癌和宫颈腺癌、头颈部鳞状细胞癌(SCC)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、食管腺癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、肺SCC、小细胞肺癌(SCLC)、肾乳头状癌、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌、宫颈SCC、卵巢腺癌、肾上腺癌、前列腺癌、成神经细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤(GBM)、成神经管细胞瘤、肾细胞癌(RCC)、食管SCC、骨肉瘤、肉瘤和小肠神经内分泌肿瘤(NET)。

在一个实施方式中,所述方法包括向受试者施用免疫原性组合物,所述免疫原性组合物包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸分子或至少一种包含mRAS肽或编码mRAS肽的核酸分子的细胞。在一个实施方式中,所述方法包括施用负载有一种或多种mRAS肽或编码一种或多种mRAS肽的一种或多种核酸分子的抗原呈递细胞,诸如树突细胞。在一些实施方式中,抗原呈递细胞是自体细胞或来源于自体细胞。例如,在一个实施方式中,所述方法包括从受试者中分离自体细胞;离体培养自体细胞;用一种或多种mRAS肽或编码一种或多种mRAS肽的一种或多种核酸分子装载分离的自体细胞,从而产生呈递本文所述的mRAS肽的抗原呈递细胞;以及向受试者施用抗原呈递细胞。在某些实施方式中,在本发明方法中使用的特定类型的mRAS肽取决于受试者或细胞的特定HLA类型。

在一个实施方式中,所述方法包括向受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸分子或表达TCR的至少一种细胞的组合物,其中TCR特异性地结合RAS、mRAS或其片段。在一个实施方式中,所述方法包括过继性TCR疗法,其中自体T细胞被遗传修饰以表达本文所述的TCR,并向受试者施用以诱导针对呈递mRAS或其片段的癌细胞的免疫应答。例如,在一个实施方式中,所述方法包括从受试者中分离自体细胞;离体培养自体细胞;遗传修饰所分离的自体细胞以表达本文所述的TCR;以及向受试者施用经遗传修饰的细胞。在某些实施方式中,在本发明方法中使用的特定类型的TCR取决于受试者或细胞的特定HLA类型。

mRAS肽和疫苗

在一些实施方式中,本发明提供了包含抗原性mRAS肽的组合物。在一个实施方式中,mRAS肽刺激或诱导受试者中的抗-mRAS免疫应答。

在一个实施方式中,相对于野生型RAS,mRAS肽包含在位置G12处的突变。在一个实施方式中,相对于野生型RAS,mRAS肽包含G12C、G12D、G12R或G12V突变。在某些实施方式中,mRAS肽是全长mRAS的短片段。

在一个实施方式中,mRAS肽的长度为约8至约24个氨基酸残基,或约9至约11个氨基酸残基。在本发明的一个实施方式中,mRAS肽相对于野生型mRAS包含对应于G12的突变,并且其中mRAS肽的长度为约8个氨基酸残基、约9个氨基酸残基、约10个氨基酸残基、约11个氨基酸残基、约12个氨基酸残基、约13个氨基酸残基、约14个氨基酸残基、约15个氨基酸残基、约16个氨基酸残基、约17个氨基酸残基、约18个氨基酸残基、约19个氨基酸残基、约20个氨基酸残基、约21个氨基酸残基、约22个氨基酸残基、约23个氨基酸残基、或约24个氨基酸残基。

表1提供了本发明的示例性抗原性mRAS肽。

在一个实施方式中,本发明提供了用于在受试者中诱导针对mRAS的免疫应答的免疫原性组合物。例如,在一个实施方式中,免疫原性组合物是疫苗。对于可用作疫苗的组合物,所述组合物必须在细胞、组织或哺乳动物(例如,人)中诱导对mRAS的免疫应答。在某些情形中,疫苗在哺乳动物中诱导保护性免疫应答。如本文所用,“免疫原性组合物”可以包含抗原(例如,mRAS肽)、编码抗原的核酸、表达或呈递抗原或细胞组分的细胞或其组合。在特定实施方式中,所述组合物包含或编码本文所述的任何肽抗原的全部或部分、或其免疫原性功能等同物。在其它实施方式中,所述组合物是在包含另外的免疫刺激剂或编码这样的药剂的核酸的混合物中。免疫刺激剂包括但不限于另外的抗原、免疫调节剂、抗原呈递细胞、脂质纳米颗粒或佐剂。在其它实施方式中,一种或多种另外的药剂以任何组合共价结合到抗原或免疫刺激剂上。

在本发明的上下文中,术语“疫苗”是指在接种到动物体内时诱导免疫应答的组合物。在一些实施方式中,诱导的免疫应答提供保护性免疫。

本发明的疫苗在其核酸和/或细胞组分的组成上可以不同。在非限制性实例中,包含或编码mRAS肽抗原的疫苗也可以与佐剂一起配制。当然,应当理解,本文所述的各种组合物还可以包含另外的组分。例如,一种或多种疫苗组分可以包含在脂质、脂质体或脂质纳米颗粒中。在另一个非限制性实例中,疫苗可以包含一种或多种佐剂。示例性佐剂包括但不限于α-干扰素、γ-干扰素、血小板衍生生长因子(PDGF)、TNFα、TNFβ、GM-CSF、表皮生长因子(EGF)、皮肤T细胞吸引趋化因子(CTACK)、上皮胸腺表达趋化因子(TECK)、粘膜相关上皮趋化因子(MEC)、IL-12、IL-15、MHC、CD80、CD86。可以是有用佐剂的其它基因包括编码以下的那些:MCP-I、MIP-Ia、MIP-Ip、IL-8、RANTES、L-选择素、P-选择素、E-选择素、CD34、GlyCAM-1、MadCAM-1、LFA-I、VLA-I、Mac-1、pl50.95、PECAM、ICAM-I、ICAM-2、ICAM-3、CD2、LFA-3、M-CSF、G-CSF、IL-4、IL-18的突变形式、CD40、CD40L、血管生长因子、成纤维细胞生长因子、IL-7、神经生长因子、血管内皮生长因子、Fas、TNF受体、Fit、Apo-1、p55、WSL-I、DR3、TRAMP、Apo-3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DR5、KILLER、TRAIL-R2、TRICK2、DR6、半胱天冬酶ICE、Fos、c-jun、Sp-I、Ap-I、Ap-2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、无活性的NIK、SAP K、SAP-I、JNK、干扰素响应基因、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL-R3、TRAIL-R4、RANK、RANK配体、Ox40、Ox40配体、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAP1、TAP2、抗CTLA4-sc、抗LAG3-Ig、抗TIM3-Ig及其功能片段。

根据本公开,本发明的疫苗及其各种组分可以通过本文所公开的任何方法或本领域普通技术人员将已知的方法来制备和/或施用。

可以通过在体内或体外观察宿主免疫系统的全部或任何部分对mRAS的反应来检测mRAS肽抗原对免疫的诱导。

本发明包括已经暴露于抗原(例如,mRAS肽抗原)或以其它方式用抗原(例如,mRAS肽抗原)“脉冲(pulsed)”的细胞。例如,抗原呈递细胞(APC),诸如树突细胞(DC),可以在体外变成负载Ag的,例如通过在抗原的存在下离体培养,或通过体内暴露于抗原。

本领域技术人员也将容易地理解,可以以将APC暴露于抗原一段时间的方式“脉冲”APC,该时间足以促进抗原在APC表面上的呈递。例如,可以将APC暴露于呈被直接“脉冲”到APC外部的小肽片段(称为抗原性肽)形式的抗原;或者APC可以与抗原性肽一起温育,然后所述抗原性肽被APC摄取。然后APC在APC表面上呈递抗原性肽。呈肽形式的抗原可以通过本文所述和如本领域已知的标准“脉冲”技术暴露于细胞。

负载抗原的APC(也称为本发明的“脉冲APC”)通过将APC在体外或体内暴露于抗原而产生。在体外脉冲APC的情况下,可以将APC置于培养皿上,并暴露于足够量的抗原且持续足够长的时间段以允许抗原与APC结合。实现抗原与APC结合所需的量和时间可以通过使用本领域已知或本文所公开的方法来确定。本领域技术人员已知的其它方法(例如免疫测定法或结合测定法)可以用于检测暴露于抗原后抗原在APC上的存在。

在本发明的另外的实施方式中,可以用允许APC表达特定肽的载体转染APC。然后,由APC表达的肽可以被加工并呈递在MHC受体的细胞表面上。然后,转染的APC可以用作免疫原性组合物,以产生针对由载体编码的蛋白质的免疫应答。

如本文别处所讨论的,可以制备载体以包括编码和表达对其具有期望免疫原性反应的肽的特定多核苷酸。在一个实施方式中,将逆转录病毒载体用于感染细胞。在一个实施方式中,将腺病毒载体用于感染细胞。

在另一个实施方式中,可以通过修饰病毒载体以编码由APC上的受体识别的蛋白质或其部分来将载体靶向至APC,由此载体占据APC受体将引发载体的内吞,从而允许加工和呈递由病毒载体的核酸编码的抗原。

如本文所设想的,可以使用各种方法将多核苷酸转染到宿主细胞中。所述方法包括但不限于磷酸钙沉淀、脂转染、粒子轰击、显微注射、电穿孔、胶体分散系统(即大分子复合物、纳米胶囊、微球、珠和基于脂质的系统(包括水包油乳液、胶束、混合胶束和脂质体))。这些方法在本领域中是理解的,并且在公开的文献中有所描述,以便使本领域技术人员能够实施这些方法。

在另一个实施方式中,编码抗原的多核苷酸可以被克隆到表达载体中,并且该载体可以被引入APC中以另外产生负载的APC。在可获得的公开文献中讨论了将核酸引入细胞中的各种类型的载体和方法。例如,表达载体可以通过物理、化学或生物手段转移到宿主细胞中。参见例如,Sambrook等人(2001,分子克隆:实验室手册,冷泉港实验室(MolecularCloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory),纽约)以及在Ausubel等人(1997,分子生物学现行规范(Current Protocols in Molecular Biology),JohnWiley&Sons,纽约)。很容易理解,引入包含编码抗原的多核苷酸的表达载体产生脉冲细胞(pulsed cell)。

本发明包括多种用于脉冲APC的方法,所述方法包括但不限于用肽抗原或用编码肽抗原的cDNA或mRNA装载APC。然而,本发明不应被解释为局限于用于脉冲APC的抗原的特定形式。相反,本发明涵盖本领域已知的用于产生负载抗原的APC的其它方法。在一个实施方式中,用编码限定的抗原的mRNA转染APC。使用适当的引物和逆转录酶-聚合酶链反应(RT-PCR)结合转录反应,可以在体外快速地产生与其序列已知的基因产物对应的mRNA。用mRNA转染APC提供了优于其它用于产生脉冲APC的抗原装载技术的优势。例如,从微小量的组织(即肿瘤组织)中扩增RNA的能力将用于疫苗接种的APC的使用扩展到了大量患者上。

有许多方法可以用于工程化DC和其它APC,诸如基于mRNA的递送、基于DNA质粒的递送,所有这些都涵盖在本发明中。也就是说,任何递送系统都可以用于工程化免疫细胞以表达本文所述的mRAS肽。

应当理解,本发明的抗原组合物可以通过本领域熟知的方法制备,所述方法包括但不限于通过固相合成的化学合成和通过HPLC从化学反应的其它产物中纯化出来、或者通过在体外翻译系统或在活细胞中表达编码本发明的肽抗原的核酸序列(例如,DNA序列)来产生。此外,抗原组合物可以包含从生物样品中分离的细胞组分。抗原组合物被分离并广泛透析,以除去一种或多种不需要的小分子量分子和/或被冻干以便更容易地配制成所需的载体。还应理解,疫苗组分中制备的另外的氨基酸、突变、化学修饰等(如果有的话)基本上不会干扰表位序列的抗体识别。肽序列可以通过本领域普通技术人员已知的方法合成,例如使用自动化肽合成机器(诸如从Applied Biosystems,Inc.,福斯特城,CA(福斯特城,CA)可获得的那些机器)的肽合成。

也可以例如通过重组手段制备更长的肽或多肽。在某些实施方式中,编码本文所述的抗原组合物和/或组分的核酸可以用于例如在体外或体内产生抗原组合物来用于本发明各种组合物和方法。例如,在某些实施方式中,编码抗原的核酸包含在例如重组细胞中的载体中。核酸可以被表达以产生包含抗原序列的肽或多肽。肽或多肽可以从细胞分泌,或者作为细胞的一部分被包含或包含在细胞内。

在某些实施方式中,可以通过用编码抗原的核酸转染或接种哺乳动物来促进免疫应答。在将核酸施用至哺乳动物之后,包含在靶标哺乳动物中的一种或多种细胞表达由所述核酸编码的序列。疫苗也可以呈例如编码抗原的全部或部分肽或多肽序列的核酸(例如,cDNA或RNA)的形式。核酸的体内表达可以是例如通过质粒型载体、病毒载体或病毒/质粒构建体载体。

在另一个实施方式中,核酸包含编码区,所述编码区包含编码适当抗原或其免疫功能等同物的所有或部分序列。当然,核酸可以包含和/或编码另外的序列,包括但不限于包含一种或多种免疫调节剂或佐剂的序列。

在某些实施方式中,免疫组合物包含由装载有一种或多种本文所述的mRAS肽抗原或用其脉冲的APC刺激的免疫细胞。例如,在一个实施方式中,免疫组合物包含经刺激的T细胞,所述经刺激的T细胞与装载有一种或多种本文所述的mRAS肽抗原或用一种或多种本文所述的mRAS肽抗原脉冲的APC一起培养并被其激活。在一个实施方式中,经刺激的细胞来源于初始细胞(例如初始T细胞),所述初始细胞然后用装载有一种或多种本文所述的mRAS肽抗原或用一种或多种本文所述的mRAS肽抗原脉冲的APC一起培养并被其激活。在某些实施方式中,初始细胞对于刺激细胞的最终接受者而言是自体的或同种异体的。在一个实施方式中,初始细胞和APC两者都来自同一受试者。在一个实施方式中,初始细胞和APC两者来自同一物种内的不同受试者。

用于检测细胞毒性T淋巴细胞诱导的方法是熟知的。进入活体的外来物质通过APC的作用呈递给T细胞和B细胞。由于抗原的刺激,以抗原特异性方式对由APC呈递的抗原做出反应的T细胞分化为细胞毒性T细胞(也称为细胞毒性T淋巴细胞或CTL)。这些抗原刺激细胞然后增殖。这一过程在本文中被称为T细胞的“激活”。因此,通过多肽或肽或其组合的表位的CTL诱导可以通过APC将多肽或肽或其组合的表位呈递到T细胞并检测CTL的诱导来评估。此外,APC具有激活B细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞、嗜酸性粒细胞和NK细胞的作用。

使用树突细胞(DC)作为APC来评估CTL的诱导作用的方法在本领域中是熟知的。DC是在APC中具有稳健的CTL诱导作用的代表性APC。在本发明的方法中,多肽或肽或其组合的表位最初由DC表达,并且然后该DC与T细胞接触。检测在与DC接触之后对感兴趣的细胞具有细胞毒性作用的T细胞表明,多肽或肽或其组合的表位具有诱导细胞毒性T细胞的活性。此外,也可以通过使用抗IFN-γ抗体进行可视化(诸如ELISPOT测定)通过测量在携带固定肽或肽组合的抗原呈递细胞的存在下由CTL产生和释放的IFN-γ来检查诱导的免疫应答。

除DC以外,外周血单核细胞(PBMC)也可以用作APC。据报道,通过在GM-CSF和IL-4的存在下培养PBMC来增强对CTL的诱导。类似地,CTL已被证明通过在钥孔血蓝蛋白(KLH)和IL-7的存在下培养PBMC被诱导。

通过这些方法证实拥有CTL诱导活性的抗原是具有DC激活效应和随后的CTL诱导活性的抗原。此外,由于通过APC的抗原呈递而获得细胞毒性的CTL也可以用作针对抗原相关障碍的疫苗。

通过观察针对mRAS的抗体产生的诱导,可以进一步证实通过mRAS肽抗原的表达诱导免疫。例如,当在用编码抗原的组合物免疫的实验室动物中诱导针对抗原的抗体时,并且当抗原相关的病理被那些抗体抑制时,确定所述组合物诱导免疫。

通过观察CD4+ T细胞的诱导,可以进一步证实通过表达mRAS肽抗原诱导免疫。CD4+ T细胞也可以裂解靶细胞,但主要是在诱导其它类型的免疫应答(包括CTL和抗体产生)方面提供帮助。CD4+ T细胞帮助的类型可以被表征为Th1、Th2、Th9、Th17、调节性T细胞或T卵泡辅助(Tfh)细胞。CD4+ T细胞的每个亚型都为某些类型的免疫应答提供帮助。在一个实施方式中,所述组合物选择性地诱导T卵泡辅助细胞,其驱动有效的抗体反应。

mRAS特异性TCR

在一些实施方式中,本发明提供了包含与RAS、mRAS或其片段特异性地结合的多肽的组合物。在一个实施方式中,多肽包含在特定HLA类型的背景下与RAS、mRAS或其片段特异性地结合的TCR。

在一个实施方式中,相对于野生型RAS,TCR特异性地结合在位置G12处包含突变的mRAS。例如,在某些实施方式中,相对于野生型RAS,TCR特异性地结合包含G12C、G12D、G12R或G12V突变的mRAS。在某些实施方式中,TCR特异性地结合mRAS的片段,其中所述片段在对应于G12的位置处包含突变。

在本发明的一个实施方式中,如上所述,TCR对在G12处具有突变的mRAS肽具有抗原特异性,所述mRAS肽具有任何长度。例如,TCR可以对具有与G12对应的突变的mRAS肽具有抗原特异性,所述mRAS肽具有约8至约24个氨基酸残基、或约9至约11个氨基酸残基的长度。在本发明的一个实施方式中,TCR可以对具有与G12对应的突变的mRAS肽具有抗原特异性,所述mRAS肽具有约8个氨基酸残基、约9个氨基酸残基、约10个氨基酸残基、约11个氨基酸残基、约12个氨基酸残基、约13个氨基酸残基、约14个氨基酸残基、约15个氨基酸残基、约16个氨基酸残基、约17个氨基酸残基、约18个氨基酸残基、约19个氨基酸残基、约20个氨基酸残基、约21个氨基酸残基、约22个氨基酸残基、约23个氨基酸残基、或约24个氨基酸残基的长度。在表1中可以找到TCR与其特异性地结合的、具有与G12对应的突变的示例性mRAS肽。

在某些实施方式中,在特定的HLA分子的背景下,TCR特异性地结合mRAS肽。与mRAS肽对应的HLA分子可以在表1中找到。

HLA-A*02:01G12C

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)的mRAS肽。

HLA-A*02:01G12D

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含KLVVVGADGV(SEQ ID NO:2)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含KLVVVGADGV(SEQ ID NO:2)的mRAS肽。

HLA-A*02:01G12R

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)的mRAS肽。

HLA-A*02:01G12V

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*02:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)的mRAS肽。

HLA-A*11:01G12C

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

HLA-A*11:01G12D

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。

HLA-A*11:01G12R

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。

HLA-A*11:01G12V

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*11:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

HLA-A*03:01G12C

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

HLA-A*03:01G12D

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。

HLA-A*03:01G12R

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。

HLA-A*03:01G12V

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-A*03:01分子的背景下,TCR特异性地结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

HLA-B*07:02G12C

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12C突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)的mRAS肽。

HLA-B*07:02G12D

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12D突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合包含GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)的mRAS肽。

HLA-B*07:02G12R

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

HLA-B*07:02G12V

在一个实施方式中,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,TCR特异性地结合包含GAVGVGKSAL(SEQ ID NO:16)的mRAS肽。例如,在一个实施方式中,在HLA-B*07:02分子的背景下,TCR特异性地结合包含GAVGVGKSAL(SEQ ID NO:16)的mRAS肽。

TCR831

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区39(TRAV39-01*01;本文也称为“TRAV39”)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39CDR1,其中TRAV39 CDR1包含以下氨基酸序列:STTSDRL(SEQ ID NO:17)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39 CDR2,其中TRAV39 CDR2包含以下氨基酸序列:VLLSNGAVK(SEQ ID NO:18)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39 CDR3,其中TRAV39 CDR3包含以下氨基酸序列:CAVDKDGGYQKVTF(SEQ ID NO:19)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV39的可变结构域,其中TRAV39的可变结构域包含以下氨基酸序列:ELKVEQNPLFLSMQEGKNYTIYCNYSTTSDRLYWYRQDPGKSLESLFVLLSNGAVKQEGRLMASLDTKARLSTLHITAAVHDLSATYFCAVDKDGGYQKVTFGTGTKLQVIP(SEQ ID NO:20)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区20-1(TRBV20-1*01;本文也称为“TRBV20”)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1CDR1,其中TRBV20-1 CDR1包含以下氨基酸序列:LDFQATTM(SEQ ID NO:23)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1 CDR2,其中TRBV20-1 CDR2包含以下氨基酸序列:TSNEGSKAT(SEQ ID NO:24)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1 CDR3,其中TRBV20-1 CDR3包含以下氨基酸序列:CSASPRAGQLSSYNSPLHF(SEQ ID NO:25)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV20-1的可变结构域,其中TRBV20-1的可变结构域包含以下氨基酸序列:GAVVSQHPSWVICKSGTSVKIECRSLDFQATTMFWYRQFPKQSLMLMATSNEGSKATYEQGVEKDKFLINHASLTLSTLTVTSAHPEDSSFYICSASPRAGQLSSYNSPLHFGNGTRLTV(SEQ IDNO:26)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RASG12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ IDNO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV39-CDR1:SEQ IDNO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ IDNO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ ID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQID NO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQ ID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV39-CDR1:SEQ ID NO:17;TRAV39-CDR2:SEQ IDNO:18;TRAV39-CDR3:SEQ ID NO:19;TRBV20-1-CDR1:SEQ ID NO:23;TRBV20-1-CDR2:SEQID NO:24;和TRBV20-1-CDR3:SEQ ID NO:25,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:29)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:

TCR833

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区12-1(TRAV12-1*01;本文也称为“TRAV12-1”)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR1,其中TRAV12-1 CDR1包含以下氨基酸序列:SNSASQSF(SEQ ID NO:31)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR2,其中TRAV12-1 CDR2包含以下氨基酸序列:SVYSSGNE(SEQ ID NO:32)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR3,其中TRAV12-1 CDR3包含以下氨基酸序列:CAVNPPDTGFQKLVF(SEQ ID NO:33)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV12-1的可变结构域,其中TRAV12-1的可变结构域包含以下氨基酸序列:RKEVEQDPGPFNVPEGATVAFNCTYSNSASQSFFWYRQDCRKEPKLLMSVYSSGNEDGRFTAQLNRASQYISLLIRDSKLSDSATYLCAVNPPDTGFQKLVFGTGTRLLVSP(SEQ ID NO:34)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:IQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:35)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:MISLRVLLVILWLQLSWVWSQRKEVEQDPGPFNVPEGATVAFNCTYSNSASQSFFWYRQDCRKEPKLLMSVYSSGNEDGRFTAQLNRASQYISLLIRDSKLSDSATYLCAVNPPDTGFQKLVFGTGTRLLVSPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:36)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区28(TRBV28*01;本文也称为“TRBV28”)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28CDR1,其中TRBV28 CDR1包含以下氨基酸序列:DMDHENM(SEQ ID NO:37)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28 CDR2,其中TRBV28 CDR2包含以下氨基酸序列:FSYDVKME(SEQ ID NO:38)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28 CDR3,其中TRBV28 CDR3包含以下氨基酸序列:CASSLSFRQGLREQYF(SEQ ID NO:39)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV28的可变结构域,其中TRBV28的可变结构域包含以下氨基酸序列:MGIRLLCRVAFCFLAVGLVDVKVTQSSRYLVKRTGEKVFLECVQDMDHENMFWYRQDPGLGLRLIYFSYDVKMKEKGDIPEGYSVSREKKERFSLILESASTNQTSMYLCASSLSFRQGLREQYFGPGTRLTVT(SEQ ID NO:40)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:41)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:MGIRLLCRVAFCFLAVGLVDVKVTQSSRYLVKRTGEKVFLECVQDMDHENMFWYRQDPGLGLRLIYFSYDVKMKEKGDIPEGYSVSREKKERFSLILESASTNQTSMYLCASSLSFRQGLREQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ IDNO:42)

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1CDR2和TRAV12-1 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ IDNO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV12-1-CDR1:SEQID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ IDNO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V或G12C突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV12-1-CDR1:SEQ ID NO:31;TRAV12-1-CDR2:SEQ ID NO:32;TRAV12-1-CDR3:SEQ ID NO:33;TRBV28-CDR1:SEQ ID NO:37;TRBV28-CDR2:SEQ ID NO:38;和TRBV28-CDR3:SEQ ID NO:39,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:43)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:MISLRVLLVILWLQLSWVWSQRKEVEQDPGPFNVPEGATVAFNCTYSNSASQSFFWYRQDCRKEPKLLMSVYSSGNEDGRFTAQLNRASQYISLLIRDSKLSDSATYLCAVNPPDTGFQKLVFGTGTRLLVSPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSSGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPMGIRLLCRVAFCFLAVGLVDVKVTQSSRYLVKRTGEKVFLECVQDMDHENMFWYRQDPGLGLRLIYFSYDVKMKEKGDIPEGYSVSREKKERFSLILESASTNQTSMYLCASSLSFRQGLREQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:44)。

TCR897

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区17(TRAV17)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR1,其中TRAV17 CDR1包含以下氨基酸序列:KTSINNL(SEQ ID NO:45)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR2,其中TRAV17 CDR2包含以下氨基酸序列:LIRSNEREK(SEQ ID NO:46)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR3,其中TRAV17 CDR3包含以下氨基酸序列:CATDPGGFKTIF(SEQ ID NO:47)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17的可变结构域,其中TRAV17的可变结构域包含以下氨基酸序列:SQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATD(SEQ ID NO:169)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:IQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:48)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:METLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDPGGFKTIFGAGTRLFVKANIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:49)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区11-2(TRBV11-2)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR1,其中TRBV11-2CDR1包含以下氨基酸序列:ISGHATL(SEQ ID NO:50)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR2,其中TRBV11-2 CDR2包含以下氨基酸序列:QFQNNGVV(SEQ ID NO:51)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR3,其中TRBV11-2 CDR3包含以下氨基酸序列:CASSLYGGSISYEQYF(SEQ ID NO:52)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV11-2的可变结构域,其中TRBV11-2的可变结构域包含以下氨基酸序列:EAGVAQSPRYKIIEKRQSVAFWCNPISGHATLYWYQQILGQGPKLLIQFQNNGVVDDSQLPKDRFSAERLKGVDSTLKIQPAKLEDSAVYLCASSL(SEQ ID NO:170)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:53)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:MGTRLLCWAALCLLGAELTEAGVAQSPRYKIIEKRQSVAFWCNPISGHATLYWYQQILGQGPKLLIQFQNNGVVDDSQLPKDRFSAERLKGVDSTLKIQPAKLEDSAVYLCASSLYGGSISYEQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ IDNO:54)。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V、G12C或G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RASG12的位置处的G12V、G12C或G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ IDNO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ IDNO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V、G12C或G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ IDNO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ IDNO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ IDNO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ IDNO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ IDNO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ IDNO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V、G12C或G12D突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ IDNO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:45;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:46;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:47;TRBV11-2-CDR1:SEQ ID NO:50;TRBV11-2-CDR2:SEQ ID NO:51;和TRBV11-2-CDR3:SEQ ID NO:52,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*11:01分子的背景下结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:55)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:METLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATDPGGFKTIFGAGTRLFVKANIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSSGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPMGTRLLCWAALCLLGAELTEAGVAQSPRYKIIEKRQSVAFWCNPISGHATLYWYQQILGQGPKLLIQFQNNGVVDDSQLPKDRFSAERLKGVDSTLKIQPAKLEDSAVYLCASSLYGGSISYEQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:56)。

TCR896

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12V突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区19(TRAV19)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR1,其中TRAV19 CDR1包含以下氨基酸序列:ETRDTTYYL(SEQ ID NO:57)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR2,其中TRAV19 CDR2包含以下氨基酸序列:RRNSFDEQNE(SEQ ID NO:58)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR3,其中TRAV19 CDR3包含以下氨基酸序列:CALSEAGTYKYIF(SEQ ID NO:59)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV19的可变结构域,其中TRAV19的可变结构域包含以下氨基酸序列:AQKVTQAQTEISVVEKEDVTLDCVYETRDTTYYLFWYKQPPSGELVFLIRRNSFDEQNEISGRYSWNFQKSTSSFNFTITASQVVDSAVYFCALSE(SEQ ID NO:171)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:IQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:60)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:MLTASLLRAVIASICVVSSMAQKVTQAQTEISVVEKEDVTLDCVYETRDTTYYLFWYKQPPSGELVFLIRRNSFDEQNEISGRYSWNFQKSTSSFNFTITASQVVDSAVYFCALSEAGTYKYIFGTGTRLKVLANIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:61)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区9(TRBV9)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RASG12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR1,其中TRBV9 CDR1包含以下氨基酸序列:RSGDLSV(SEQ ID NO:62)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR2,其中TRBV9 CDR2包含以下氨基酸序列:QYYNGEER(SEQ ID NO:63)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR3,其中TRBV9 CDR3包含以下氨基酸序列:CASSVAGGGQETQYF(SEQ ID NO:64)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV9的可变结构域,其中TRBV9的可变结构域包含以下氨基酸序列:DSGVTQTPKHLITATGQRVTLRCSPRSGDLSVYWYQQSLDQGLQFLIQYYNGEERAKGNILERFSAQQFPDLHSELNLSSLELGDSALYFCASSV(SEQ ID NO:172)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:65)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:MGFRLLCCVAFCLLGAGPVDSGVTQTPKHLITATGQRVTLRCSPRSGDLSVYWYQQSLDQGLQFLIQYYNGEERAKGNILERFSAQQFPDLHSELNLSSLELGDSALYFCASSVAGGGQETQYFGPGTRLLVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ IDNO:66)。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-A*03:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV9CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-A*03:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQ ID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ ID NO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQ ID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ ID NO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQ ID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ ID NO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*03:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

在另一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQ ID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ ID NO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ IDNO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RASG12的位置处的G12V突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV19-CDR1:SEQ ID NO:57;TRAV19-CDR2:SEQ ID NO:58;TRAV19-CDR3:SEQ ID NO:59;TRBV9-CDR1:SEQ ID NO:62;TRBV9-CDR2:SEQ ID NO:63;和TRBV9-CDR3:SEQ ID NO:64,或其一种或多种变体,并且在HLA-A*03:01分子的背景下结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:67)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:MLTASLLRAVIASICVVSSMAQKVTQAQTEISVVEKEDVTLDCVYETRDTTYYLFWYKQPPSGELVFLIRRNSFDEQNEISGRYSWNFQKSTSSFNFTITASQVVDSAVYFCALSEAGTYKYIFGTGTRLKVLANIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSSGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPMGFRLLCCVAFCLLGAGPVDSGVTQTPKHLITATGQRVTLRCSPRSGDLSVYWYQQSLDQGLQFLIQYYNGEERAKGNILERFSAQQFPDLHSELNLSSLELGDSALYFCASSVAGGGQETQYFGPGTRLLVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:68)。

TCR847

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区17(TRAV17)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR1,其中TRAV17 CDR1包含以下氨基酸序列:KTSINNL(SEQ ID NO:69)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR2,其中TRAV17 CDR2包含以下氨基酸序列:LIRSNEREK(SEQ ID NO:70)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR3,其中TRAV17 CDR3包含以下氨基酸序列:CATFPNFGNEKLTF(SEQ ID NO:71)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV17的可变结构域,其中TRAV17的可变结构域包含以下氨基酸序列:SQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATF(SEQ ID NO:173)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:IQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:72)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:METLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATFPNFGNEKLTFGTGTRLTIIPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:73)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区10-3(TRBV10-3)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR1,其中TRBV10-3CDR1包含以下氨基酸序列:TENHRYM(SEQ ID NO:74)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR2,其中TRBV10-3 CDR2包含以下氨基酸序列:YSYGVKDT(SEQ ID NO:75)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR3,其中TRBV10-3 CDR3包含以下氨基酸序列:CAISESERYYEQYF(SEQ ID NO:76)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV10-3的可变结构域,其中TRBV10-3的可变结构域包含以下氨基酸序列:DAGITQSPRHKVTETGTPVTLRCHQTENHRYMYWYRQDPGHGLRLIHYSYGVKDTDKGEVSDGYSVSRSKTEDFLLTLESATSSQTSVYFCAISE(SEQ ID NO:174)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:EDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:77)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:MGTRLFFYVALCLLWTGHMDAGITQSPRHKVTETGTPVTLRCHQTENHRYMYWYRQDPGHGLRLIHYSYGVKDTDKGEVSDGYSVSRSKTEDFLLTLESATSSQTSVYFCAISESERYYEQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:78)。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RASG12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ IDNO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ ID NO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ IDNO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ IDNO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ ID NO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在另一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ ID NO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ ID NO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV17-CDR1:SEQ ID NO:69;TRAV17-CDR2:SEQ ID NO:70;TRAV17-CDR3:SEQ ID NO:71;TRBV10-3-CDR1:SEQ ID NO:74;TRBV10-3-CDR2:SEQ ID NO:75;和TRBV10-3-CDR3:SEQ ID NO:76,或其一种或多种变体,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:79)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:METLLGVSLVILWLQLARVNSQQGEEDPQALSIQEGENATMNCSYKTSINNLQWYRQNSGRGLVHLILIRSNEREKHSGRLRVTLDTSKKSSSLLITASRAADTASYFCATFPNFGNEKLTFGTGTRLTIIPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSSGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPMGTRLFFYVALCLLWTGHMDAGITQSPRHKVTETGTPVTLRCHQTENHRYMYWYRQDPGHGLRLIHYSYGVKDTDKGEVSDGYSVSRSKTEDFLLTLESATSSQTSVYFCAISESERYYEQYFGPGTRLTVTEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSESYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDSRG(SEQ ID NO:80)。

TCR864

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRα链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体α可变区4(TRAV4)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RASG12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR1,其中TRAV4 CDR1包含以下氨基酸序列:NNIATNDYI(SEQ ID NO:81)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR2,其中TRAV4 CDR2包含以下氨基酸序列:QGYKTKV(SEQ ID NO:82)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR3,其中TRAV4 CDR3包含以下氨基酸序列:CLVGDFNSNSGYALNF(SEQ ID NO:83)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRAV4的可变结构域,其中TRAV4的可变结构域包含以下氨基酸序列:LAKTTQPISMDSYEGQEVNITCSHNNIATNDYITWYQQFPSQGPRFIIQGYKTKVTNEVASLFIPADRKSSTLSLPRVSLSDTAVYYCLVGD(SEQ ID NO:175)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:IQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:84)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRα链:MRQVARVIVFLTLSTLSLAKTTQPISMDSYEGQEVNITCSHNNIATNDYITWYQQFPSQGPRFIIQGYKTKVTNEVASLFIPADRKSSTLSLPRVSLSDTAVYYCLVGDFNSNSGYALNFGKGTSLLVTPHIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS(SEQ ID NO:85)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含以下中的一种或多种:TCRβ链的CDR1、CDR2和CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含T细胞受体β可变区7-2(TRBV7-2)CDR1。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR1,其中TRBV7-2 CDR1包含以下氨基酸序列:ISGHTAL(SEQ ID NO:86)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR2。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR2,其中TRBV7-2 CDR2包含以下氨基酸序列:YFQGNSAP(SEQ ID NO:87)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR3。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR3,其中TRBV7-2 CDR3包含以下氨基酸序列:CASKVYGYTF(SEQ ID NO:88)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2的可变结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12突变的mRAS肽的TCR包含TRBV7-2的可变结构域,其中TRBV7-2的可变结构域包含以下氨基酸序列:GAGVSQSPSNKVTEKGKDVELRCDPISGHTALYWYRQRLGQGLEFLIYFQGNSAPDKSGLPSDRFSAERTGESVSTLTIQRTQQEDSAVYLCASK(SEQ ID NO:176)。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域。在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含恒定结构域,其中所述恒定结构域包含以下氨基酸序列:EDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF(SEQ ID NO:89)。

在一个实施方式中,TCR包含含有以下氨基酸序列的TCRβ链:MGTRLLFWVAFCLLGAYHTGAGVSQSPSNKVTEKGKDVELRCDPISGHTALYWYRQRLGQGLEFLIYFQGNSAPDKSGLPSDRFSAERTGESVSTLTIQRTQQEDSAVYLCASKVYGYTFGSGTRLTVVEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF(SEQ ID NO:90)。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3中的一种或多种的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3中的一种或多种的TCRβ链,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3的TCRβ链。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3的TCRβ链,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含(a)含有TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4CDR3的TCRα链,和(b)含有TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3的TCRβ链,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ ID NO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ ID NO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ ID NO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ ID NO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RAS G12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含选自由以下组成的组的CDR中的至少一种:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ IDNO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ IDNO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。

在另一个实施方式中,特异性地结合在与RAS G12对应的位置处具有G12R突变的mRAS肽的TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ ID NO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ ID NO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ IDNO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ IDNO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体,并且结合包含在相对于RASG12的位置处的G12R突变的mRAS肽。在一个实施方式中,TCR包含由以下组成的组的CDR的全部:TRAV4-CDR1:SEQ ID NO:81;TRAV4-CDR2:SEQ ID NO:82;TRAV4-CDR3:SEQ ID NO:83;TRBV7-2-CDR1:SEQ ID NO:86;TRBV7-2-CDR2:SEQ ID NO:87;和TRBV7-2-CDR3:SEQ ID NO:88,或其一种或多种变体,并且在HLA-B*07:02分子的背景下结合包含GARGVGKSAL(SEQ IDNO:15)的mRAS肽。

在一个实施方式中,所述组合物包含含有如上所述的TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,融合蛋白包含将TCRα链与TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。例如,在一个实施方式中,接头结构域包含GSG-T2A结构域。在一个实施方式中,GSG-T2A包含以下的氨基酸序列:GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(SEQ ID NO:91)。

在一个实施方式中,组合物包含含有以下的氨基酸序列的融合蛋白:MRQVARVIVFLTLSTLSLAKTTQPISMDSYEGQEVNITCSHNNIATNDYITWYQQFPSQGPRFIIQGYKTKVTNEVASLFIPADRKSSTLSLPRVSLSDTAVYYCLVGDFNSNSGYALNFGKGTSLLVTPHIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSSGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPMGTRLLFWVAFCLLGAYHTGAGVSQSPSNKVTEKGKDVELRCDPISGHTALYWYRQRLGQGLEFLIYFQGNSAPDKSGLPSDRFSAERTGESVSTLTIQRTQQEDSAVYLCASKVYGYTFGSGTRLTVVEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF(SEQ ID NO:92)。

在某些实施方式中,所述组合物包含融合蛋白,所述融合蛋白包含将TCRα链和TCRβ链分开的接头结构域。在一个实施方式中,接头结构域是可切割的接头结构域。可以使用任何合适的接头结构域,使得α链和β链的功能均得以保留。

在某些实施方式中,所述组合物包含含有与本文所述的mRAS肽、TCR或其部分的氨基酸序列基本上同源的氨基酸序列并且保留了原始氨基酸序列的功能的肽或多肽(例如,mRAS肽抗原或TCR)。例如,在某些实施方式中,氨基酸序列相对于原始氨基酸序列具有至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或至少99.5%的同一性程度。

在一些实施方式中,所述组合物包含相对于本文所述的mRAS肽或TCR或其部分的氨基酸序列具有一个或多个、两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个或十个或更多个突变(诸如点突变)的肽。

在一些实施方式中,TCR包含与本文所述的CDR序列中的一种或多种具有至少约85%氨基酸同一性的氨基酸序列。本发明涵盖具有与本文所述的CDR序列至少约85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、99%或100%相同的CDR序列的TCR。

在一个实施方式中,所述组合物包含具有与本文所述的CDR序列至少约85%同一性的CDR序列的多肽。本发明涵盖具有与本文所述的CDR序列至少约85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、99%或100%相同的CDR序列的多肽。

可以使用化学方法制备本发明的肽。例如,肽可以通过固相技术合成(Roberge JY等人(1995)Science 269:202-204),从树脂上切割下来,并通过制备型高效液相色谱纯化。例如,可以根据制造商提供的说明书,使用ABI 431A肽合成仪(Perkin Elmer)实现自动化合成。可替代地,所述肽可以通过重组方式或通过从较长的多肽上切割来制备。肽的组成可以通过氨基酸分析或测序来确认。

根据本发明的多肽的变体可以是(i)其中一种或多种氨基酸残基被保守或非保守氨基酸残基(优选保守氨基酸残基)取代并且此类经取代的氨基酸残基可以是或可以不是由遗传密码编码的氨基酸残基的一种变体,(ii)其中存在一种或多种经修饰的氨基酸残基(例如通过附接取代基团而被修饰的残基)的一种变体,(iii)其中多肽是本发明多肽的替代性剪接变体的一种变体,(iv)多肽的片段和/或(v)其中多肽与另一种多肽(诸如前导或分泌序列或用于纯化的序列(例如His-标签)或用于检测的序列(例如Sv5表位标签))融合的一种变体。片段包括通过原始序列的蛋白水解切割(包括多位点蛋白水解)产生的多肽。变体可以是翻译后的或化学修饰的。此类变体被认为根据本文的教导在本领域技术人员的范围内。

如本领域所已知,在两种多肽之间的“相似性”是通过将一种多肽的氨基酸序列及其保守氨基酸取代物与第二种多肽的序列进行比较来确定的。变体被定义为包括与原始序列不同(优选地与原始序列相差每个感兴趣区段中少于40%的残基,更优选地与原始序列相差每个感兴趣区段中少于25%的残基,更优选地相差每个感兴趣区段中少于10%的残基,最优选地与原始蛋白质序列相差每个感兴趣区段中仅几个残基)并且同时与原始序列足够同源以保持原始序列的功能和/或结合泛素或泛素化蛋白质的能力的多肽序列。本发明包括与原始氨基酸序列至少60%、65%、70%、72%、74%、76%、78%、80%、90%或95%相似或相同的氨基酸序列。使用本领域技术人员所公知的计算机算法和方法来确定两种多肽之间的同一性程度。在两个氨基酸序列之间的同一性优选地通过使用BLASTP算法来确定[BLAST Manual,Altschul,S.等人,NCBI NLM NIH Bethesda,Md.20894,Altschul,S.等人,J.Mol.Biol.215:403-410(1990)]。

本发明的多肽可以被翻译后修饰。例如,落入本发明范围内的翻译后修饰包括信号肽切割、糖基化、乙酰化、异戊烯化、蛋白水解、豆蔻酰化、蛋白质折叠和蛋白水解加工等。一些修饰或加工事件需要引入另外的生物机制。例如,通过添加犬微粒体膜或非洲爪蟾卵提取物(美国专利号6,103,489)到标准翻译反应中来检查加工事件,诸如信号肽切割和核心糖基化。

本发明的多肽可以包括通过翻译后修饰或通过在翻译期间引入非天然氨基酸而形成的非天然氨基酸。多种方法可用于在蛋白质翻译期间引入非天然氨基酸。举例来说,特殊的tRNA(诸如具有抑制剂特性的tRNA,抑制剂tRNA)已经被用于定点非天然氨基酸置换(SNAAR)的过程中。在SNAAR中,在mRNA和抑制剂tRNA上需要独特的密码子,从而在蛋白质合成期间用于将非天然氨基酸靶向到独特的位点(描述于WO90/05785)。然而,抑制剂tRNA不一定可被蛋白质翻译系统中存在的氨基酰tRNA合成酶识别。在某些情况下,在使用化学反应对tRNA分子进行氨基酰化之后可以形成非天然氨基酸,所述化学反应特异性地修饰天然氨基酸并且不会显著改变氨基酰化tRNA的功能活性。这些反应被称为氨基酰化后修饰。例如,与其同源tRNA(tRNALYS)连接的赖氨酸的ε-氨基基团可以用胺特异性光亲和标记进行修饰。

本发明的肽可以通过与无机酸(诸如盐酸、硫酸、氢溴酸、磷酸等)或与有机酸(诸如甲酸、乙酸、丙酸、乙醇酸、乳酸、丙酮酸、草酸、琥珀酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸、水杨酸、苯磺酸和甲苯磺酸)反应转化成药用盐。

核酸分子

在一个方面,本发明提供了组合物,所述组合物包含编码一种或多种本文所述的肽或多肽的分离的核酸分子。例如,在某些方面,所述组合物包含编码一种或多种本文所述的肽或多肽的DNA、RNA、mRNA或cDNA。

在一个实施方式中,所述组合物包含编码一种或多种本文所述的抗原性mRAS肽的一种或多种分离的核酸分子。例如,在一个实施方式中,所述组合物包含编码含有选自SEQID NO:1-16的氨基酸序列的一种或多种抗原性mRAS肽的一种或多种分离的核酸分子。

在一个实施方式中,核酸分子包含编码选自SEQ ID NO:1-92的氨基酸序列的核酸序列。在一个实施方式中,核酸分子包含编码氨基酸序列的核酸序列,所述氨基酸序列与选自SEQ ID NO:1-92的氨基酸序列具有实质同源性。例如,在某些实施方式中,核酸分子包含编码氨基酸序列的核酸序列,所述氨基酸序列与选自SEQ ID NO:1-92的氨基酸序列至少60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%相同。在某些实施方式中,核酸分子包含编码氨基酸序列的核酸序列,所述氨基酸序列相对于选自SEQ ID NO:1-92的氨基酸序列具有一个或多个、两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个或十个或更多个突变,诸如点突变。

在一个实施方式中,所述组合物包含一种或多种分离的核酸分子,其编码一种或多种本文所述的TCR、一种或多种本文所述的CDR、一种或多种本文所述的α链、一种或多种本文所述的β结构域、一种或多种本文所述的可变结构域、一种或多种本文所述的恒定结构域、一种或多种本文所述的接头或一种或多种本文所述的融合蛋白。

编码TCR831的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV39 CDR1、TRAV39 CDR2和TRAV39 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列的TRAV39CDR1、包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列的TRAV39 CDR2、以及包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的TRAV39 CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV39 CDR1的核酸序列包含ACCACTTCAGA(SEQID NO:93)。在一个实施方式中,编码TRAV39 CDR2的核酸序列包含TTGCTATCAAATGGAGCAGTG(SEQ ID NO:94)。在一个实施方式中,编码TRAV39 CDR3的核酸序列包含GCCGTGGACAAGGATGGGGGTTACC(SEQ ID NO:95)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有TRAV39的可变结构域的TCRα链的TCR,所述可变结构域包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码TRAV39可变结构域的核酸序列包含:ATGAAGAAGCTACTAGCAATGATTCTGTGGCTTCAACTAGACCGGTTAAGTGGAGAGCTGAAAGTGGAACAAAACCCTCTGTTCCTGAGCATGCAGGAGGGAAAAAACTATACCATCTACTGCAATTATTCAACCACTTCAGACAGACTGTATTGGTACAGGCAGGATCCTGGGAAAAGTCTGGAATCTCTGTTTGTGTTGCTATCAAATGGAGCAGTGAAGCAGGAGGGACGATTAATGGCCTCACTTGATACCAAAGCCCGTCTCAGCACCCTCCACATCACAGCTGCCGTGCATGACCTCTCTGCCACCTACTTCTGTGCCGTGGACAAGGATGGGGGTTACCAGAAAGTTACCTTTGGAACTGGAACAAAGCTCCAAGTCATCCCAA(SEQ ID NO:96)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:97)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGAAGAAGCTACTAGCAATGATTCTGTGGCTTCAACTAGACCGGTTAAGTGGAGAGCTGAAAGTGGAACAAAACCCTCTGTTCCTGAGCATGCAGGAGGGAAAAAACTATACCATCTACTGCAATTATTCAACCACTTCAGACAGACTGTATTGGTACAGGCAGGATCCTGGGAAAAGTCTGGAATCTCTGTTTGTGTTGCTATCAAATGGAGCAGTGAAGCAGGAGGGACGATTAATGGCCTCACTTGATACCAAAGCCCGTCTCAGCACCCTCCACATCACAGCTGCCGTGCATGACCTCTCTGCCACCTACTTCTGTGCCGTGGACAAGGATGGGGGTTACCAGAAAGTTACCTTTGGAACTGGAACAAAGCTCCAAGTCATCCCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:98)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV20-1 CDR1、TRBV20-1 CDR2和TRBV20-1 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列的TRBV20-1 CDR1、包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列的TRBV20-1 CDR2、以及包含SEQ ID NO:25的氨基酸序列的TRBV20-1 CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV20-1CDR1的核酸序列包含GACTTTCAGGCCACAACT(SEQ ID NO:99)。在一个实施方式中,编码TRBV20-1 CDR2的核酸序列包含TCCAATGAGGGCTCCAAGGCC(SEQ ID NO:100)。在一个实施方式中,编码TRBV20-1 CDR3的核酸序列包含AGTGCTAGCCCACGGGCGGGACAGTTGAGCTCCTATAATTCACCCCTCCAC(SEQ ID NO:101)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有TRBV20-1的可变结构域的TCRβ链的TCR,所述可变结构域包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码TRBV20-1可变结构域的核酸序列包含:ATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGTATAAGCCTCCTTCTACCTGGGAGCTTGGCAGGCTCCGGGCTTGGTGCTGTCGTCTCTCAACATCCGAGCTGGGTTATCTGTAAGAGTGGAACCTCTGTGAAGATCGAGTGCCGTTCCCTGGACTTTCAGGCCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGTTCCCGAAACAGAGTCTCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGGCTCCAAGGCCACATACGAGCAAGGCGTCGAGAAGGACAAGTTTCTCATCAACCATGCAAGCCTGACCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTGCCCATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACATCTGCAGTGCTAGCCCACGGGCGGGACAGTTGAGCTCCTATAATTCACCCCTCCACTTTGGGAATGGGACCAGGCTCACTGTGAC(SEQ ID NO:102)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTC(SEQ ID NO:103)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGTATAAGCCTCCTTCTACCTGGGAGCTTGGCAGGCTCCGGGCTTGGTGCTGTCGTCTCTCAACATCCGAGCTGGGTTATCTGTAAGAGTGGAACCTCTGTGAAGATCGAGTGCCGTTCCCTGGACTTTCAGGCCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGTTCCCGAAACAGAGTCTCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGGCTCCAAGGCCACATACGAGCAAGGCGTCGAGAAGGACAAGTTTCTCATCAACCATGCAAGCCTGACCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTGCCCATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACATCTGCAGTGCTAGCCCACGGGCGGGACAGTTGAGCTCCTATAATTCACCCCTCCACTTTGGGAATGGGACCAGGCTCACTGTGACAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTCTGA(SEQ ID NO:104)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,所述接头结构域包含SEQID NO:29的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:105)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGAAGAAGCTACTAGCAATGATTCTGTGGCTTCAACTAGACCGGTTAAGTGGAGAGCTGAAAGTGGAACAAAACCCTCTGTTCCTGAGCATGCAGGAGGGAAAAAACTATACCATCTACTGCAATTATTCAACCACTTCAGACAGACTGTATTGGTACAGGCAGGATCCTGGGAAAAGTCTGGAATCTCTGTTTGTGTTGCTATCAAATGGAGCAGTGAAGCAGGAGGGACGATTAATGGCCTCACTTGATACCAAAGCCCGTCTCAGCACCCTCCACATCACAGCTGCCGTGCATGACCTCTCTGCCACCTACTTCTGTGCCGTGGACAAGGATGGGGGTTACCAGAAAGTTACCTTTGGAACTGGAACAAAGCTCCAAGTCATCCCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGCTGCTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGTATAAGCCTCCTTCTACCTGGGAGCTTGGCAGGCTCCGGGCTTGGTGCTGTCGTCTCTCAACATCCGAGCTGGGTTATCTGTAAGAGTGGAACCTCTGTGAAGATCGAGTGCCGTTCCCTGGACTTTCAGGCCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGTTCCCGAAACAGAGTCTCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGGCTCCAAGGCCACATACGAGCAAGGCGTCGAGAAGGACAAGTTTCTCATCAACCATGCAAGCCTGACCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTGCCCATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACATCTGCAGTGCTAGCCCACGGGCGGGACAGTTGAGCTCCTATAATTCACCCCTCCACTTTGGGAATGGGACCAGGCTCACTGTGACAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTCTGA(SEQ IDNO:106)。

编码TCR833的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV12-1 CDR1、TRAV12-1 CDR2和TRAV12-1 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列的TRAV12-1 CDR1、包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列的TRAV12-1 CDR2、以及包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列的TRAV12-1 CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV12-1CDR1的核酸序列包含AACAGTGCTTCTCAGTCT(SEQ ID NO:107)。在一个实施方式中,编码TRAV12-1 CDR2的核酸序列包含GTATACTCCAGTGGTAAC(SEQ ID NO:108)。在一个实施方式中,编码TRAV12-1 CDR3的核酸序列包含GCGGTGAACCCCCCGGACACAGGCTTTCAGAAACTTGTA(SEQ ID NO:109)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有TRAV12-1的可变结构域的TCRα链的TCR,所述可变结构域包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码TRAV12-1可变结构域的核酸序列包含:ATGATATCCTTGAGAGTTTTACTGGTGATCCTGTGGCTTCAGTTAAGCTGGGTTTGGAGCCAACGGAAGGAGGTGGAGCAGGATCCTGGACCCTTCAATGTTCCAGAGGGAGCCACTGTCGCTTTCAACTGTACTTACAGCAACAGTGCTTCTCAGTCTTTCTTCTGGTACAGACAGGATTGCAGGAAAGAACCTAAGTTGCTGATGTCCGTATACTCCAGTGGTAACGAAGATGGAAGGTTTACAGCACAGCTCAATAGAGCCAGCCAGTATATTTCCCTGCTCATCAGAGACTCCAAGCTCAGTGATTCAGCCACCTACCTCTGTGCGGTGAACCCCCCGGACACAGGCTTTCAGAAACTTGTATTTGGAACTGGCACCCGACTTCTGGTCAGTCCAA(SEQ ID NO:110)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:35的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:111)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:36的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGATATCCTTGAGAGTTTTACTGGTGATCCTGTGGCTTCAGTTAAGCTGGGTTTGGAGCCAACGGAAGGAGGTGGAGCAGGATCCTGGACCCTTCAATGTTCCAGAGGGAGCCACTGTCGCTTTCAACTGTACTTACAGCAACAGTGCTTCTCAGTCTTTCTTCTGGTACAGACAGGATTGCAGGAAAGAACCTAAGTTGCTGATGTCCGTATACTCCAGTGGTAACGAAGATGGAAGGTTTACAGCACAGCTCAATAGAGCCAGCCAGTATATTTCCCTGCTCATCAGAGACTCCAAGCTCAGTGATTCAGCCACCTACCTCTGTGCGGTGAACCCCCCGGACACAGGCTTTCAGAAACTTGTATTTGGAACTGGCACCCGACTTCTGGTCAGTCCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:112)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV28 CDR1、TRBV28 CDR2和TRBV28 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:37的氨基酸序列的TRBV28CDR1、包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列的TRBV28 CDR2、以及包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列的TRBV28 CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV28 CDR1的核酸序列包含ATGGACCATGAAAAT(SEQ ID NO:113)。在一个实施方式中,编码TRBV28 CDR2的核酸序列包含TCATATGATGTTAAAATG(SEQ ID NO:114)。在一个实施方式中,编码TRBV28 CDR3的核酸序列包含GCCAGCAGTTTATCCTTCCGGCAGGGCCTTCGCGAGCAGTAC(SEQ ID NO:115)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有TRBV28的可变结构域的TCRβ链的TCR,所述可变结构域包含SEQ ID NO:40的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码TRBV28可变结构域的核酸序列包含:ATGGGAATCAGGCTCCTGTGTCGTGTGGCCTTTTGTTTCCTGGCTGTAGGCCTCGTAGATGTGAAAGTAACCCAGAGCTCGAGATATCTAGTCAAAAGGACGGGAGAGAAAGTTTTTCTGGAATGTGTCCAGGATATGGACCATGAAAATATGTTCTGGTATCGACAAGACCCAGGTCTGGGGCTACGGCTGATCTATTTCTCATATGATGTTAAAATGAAAGAAAAAGGAGATATTCCTGAGGGGTACAGTGTCTCCAGAGAGAAGAAGGAGCGCTTCTCCCTGATTCTGGAGTCCGCCAGCACCAACCAGACATCTATGTACCTCTGTGCCAGCAGTTTATCCTTCCGGCAGGGCCTTCGCGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACA(SEQ ID NO:116)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGC(SEQ ID NO:117)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGGGAATCAGGCTCCTGTGTCGTGTGGCCTTTTGTTTCCTGGCTGTAGGCCTCGTAGATGTGAAAGTAACCCAGAGCTCGAGATATCTAGTCAAAAGGACGGGAGAGAAAGTTTTTCTGGAATGTGTCCAGGATATGGACCATGAAAATATGTTCTGGTATCGACAAGACCCAGGTCTGGGGCTACGGCTGATCTATTTCTCATATGATGTTAAAATGAAAGAAAAAGGAGATATTCCTGAGGGGTACAGTGTCTCCAGAGAGAAGAAGGAGCGCTTCTCCCTGATTCTGGAGTCCGCCAGCACCAACCAGACATCTATGTACCTCTGTGCCAGCAGTTTATCCTTCCGGCAGGGCCTTCGCGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ IDNO:118)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,所述接头结构域包含SEQID NO:43的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:119)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGATATCCTTGAGAGTTTTACTGGTGATCCTGTGGCTTCAGTTAAGCTGGGTTTGGAGCCAACGGAAGGAGGTGGAGCAGGATCCTGGACCCTTCAATGTTCCAGAGGGAGCCACTGTCGCTTTCAACTGTACTTACAGCAACAGTGCTTCTCAGTCTTTCTTCTGGTACAGACAGGATTGCAGGAAAGAACCTAAGTTGCTGATGTCCGTATACTCCAGTGGTAACGAAGATGGAAGGTTTACAGCACAGCTCAATAGAGCCAGCCAGTATATTTCCCTGCTCATCAGAGACTCCAAGCTCAGTGATTCAGCCACCTACCTCTGTGCGGTGAACCCCCCGGACACAGGCTTTCAGAAACTTGTATTTGGAACTGGCACCCGACTTCTGGTCAGTCCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGGGAATCAGGCTCCTGTGTCGTGTGGCCTTTTGTTTCCTGGCTGTAGGCCTCGTAGATGTGAAAGTAACCCAGAGCTCGAGATATCTAGTCAAAAGGACGGGAGAGAAAGTTTTTCTGGAATGTGTCCAGGATATGGACCATGAAAATATGTTCTGGTATCGACAAGACCCAGGTCTGGGGCTACGGCTGATCTATTTCTCATATGATGTTAAAATGAAAGAAAAAGGAGATATTCCTGAGGGGTACAGTGTCTCCAGAGAGAAGAAGGAGCGCTTCTCCCTGATTCTGGAGTCCGCCAGCACCAACCAGACATCTATGTACCTCTGTGCCAGCAGTTTATCCTTCCGGCAGGGCCTTCGCGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ ID NO:120)。

编码TCR897的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:45的氨基酸序列的TRAV17CDR1、包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列的TRAV17 CDR2、以及包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列的TRAV17 CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR1的核酸序列包含ACTAGTATAAACAAT(SEQ ID NO:121)。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR2的核酸序列包含ATACGTTCAAATGAAAGAGAG(SEQ ID NO:122)。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR3的核酸序列包含TGTGCTACGGACCCTGGAGGCTTCAAAACTATCTTT(SEQ ID NO:123)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:48的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:124)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:49的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGGAAACTCTCCTGGGAGTGTCTTTGGTGATTCTATGGCTTCAACTGGCTAGGGTGAACAGTCAACAGGGAGAAGAGGATCCTCAGGCCTTGAGCATCCAGGAGGGTGAAAATGCCACCATGAACTGCAGTTACAAAACTAGTATAAACAATTTACAGTGGTATAGACAAAATTCAGGTAGAGGCCTTGTCCACCTAATTTTAATACGTTCAAATGAAAGAGAGAAACACAGTGGAAGATTAAGAGTCACGCTTGACACTTCCAAGAAAAGCAGTTCCTTGTTGATCACGGCTTCCCGGGCAGCAGACACTGCTTCTTACTTCTGTGCTACGGACCCTGGAGGCTTCAAAACTATCTTTGGAGCAGGAACAAGACTATTTGTTAAAGCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:125)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV11-2 CDR1、TRBV11-2 CDR2和TRBV11-2 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列的TRBV11-2 CDR1、包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列的TRBV11-2 CDR2、以及包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列的TRBV11-2 CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV11-2CDR1的核酸序列包含TCTGGCCATGCTACC(SEQ ID NO:126)。在一个实施方式中,编码TRBV11-2 CDR2的核酸序列包含TTTCAGAATAACGGTGTA(SEQ ID NO:127)。在一个实施方式中,编码TRBV11-2 CDR3的核酸序列包含TGTGCCAGCAGCTTATATGGGGGGTCGATCTCCTACGAGCAGTACTTC(SEQ ID NO:128)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGC(SEQ ID NO:129)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGGGCACCAGGCTCCTCTGCTGGGCGGCCCTCTGTCTCCTGGGAGCAGAACTCACAGAAGCTGGAGTTGCCCAGTCTCCCAGATATAAGATTATAGAGAAAAGGCAGAGTGTGGCTTTTTGGTGCAATCCTATATCTGGCCATGCTACCCTTTACTGGTACCAGCAGATCCTGGGACAGGGCCCAAAGCTTCTGATTCAGTTTCAGAATAACGGTGTAGTGGATGATTCACAGTTGCCTAAGGATCGATTTTCTGCAGAGAGGCTCAAAGGAGTAGACTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAAAGCTTGAGGACTCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTATATGGGGGGTCGATCTCCTACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQID NO:130)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,接头结构域包含SEQ IDNO:55的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:131)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:56的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGGAAACTCTCCTGGGAGTGTCTTTGGTGATTCTATGGCTTCAACTGGCTAGGGTGAACAGTCAACAGGGAGAAGAGGATCCTCAGGCCTTGAGCATCCAGGAGGGTGAAAATGCCACCATGAACTGCAGTTACAAAACTAGTATAAACAATTTACAGTGGTATAGACAAAATTCAGGTAGAGGCCTTGTCCACCTAATTTTAATACGTTCAAATGAAAGAGAGAAACACAGTGGAAGATTAAGAGTCACGCTTGACACTTCCAAGAAAAGCAGTTCCTTGTTGATCACGGCTTCCCGGGCAGCAGACACTGCTTCTTACTTCTGTGCTACGGACCCTGGAGGCTTCAAAACTATCTTTGGAGCAGGAACAAGACTATTTGTTAAAGCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGGGCACCAGGCTCCTCTGCTGGGCGGCCCTCTGTCTCCTGGGAGCAGAACTCACAGAAGCTGGAGTTGCCCAGTCTCCCAGATATAAGATTATAGAGAAAAGGCAGAGTGTGGCTTTTTGGTGCAATCCTATATCTGGCCATGCTACCCTTTACTGGTACCAGCAGATCCTGGGACAGGGCCCAAAGCTTCTGATTCAGTTTCAGAATAACGGTGTAGTGGATGATTCACAGTTGCCTAAGGATCGATTTTCTGCAGAGAGGCTCAAAGGAGTAGACTCCACTCTCAAGATCCAGCCTGCAAAGCTTGAGGACTCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAGCTTATATGGGGGGTCGATCTCCTACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ ID NO:132)。

编码TCR896的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV19 CDR1、TRAV19 CDR2和TRAV19 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:57的氨基酸序列的TRAV19CDR1、包含SEQ ID NO:58的氨基酸序列的TRAV19 CDR2、以及包含SEQ ID NO:59的氨基酸序列的TRAV19 CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV19 CDR1的核酸序列包含ACCCGTGATACTACTTATTAC(SEQ ID NO:133)。在一个实施方式中,编码TRAV19 CDR2的核酸序列包含CGGAACTCTTTTGATGAGCAAAAT(SEQ ID NO:134)。在一个实施方式中,编码TRAV19CDR3的核酸序列包含TGTGCTCTGAGTGAGGCAGGAACCTACAAATACATCTTT(SEQ ID NO:135)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:60的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:136)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:61的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGCTGACTGCCAGCCTGTTGAGGGCAGTCATAGCCTCCATCTGTGTTGTATCCAGCATGGCTCAGAAGGTAACTCAAGCGCAGACTGAAATTTCTGTGGTGGAGAAGGAGGATGTGACCTTGGACTGTGTGTATGAAACCCGTGATACTACTTATTACTTATTCTGGTACAAGCAACCACCAAGTGGAGAATTGGTTTTCCTTATTCGTCGGAACTCTTTTGATGAGCAAAATGAAATAAGTGGTCGGTATTCTTGGAACTTCCAGAAATCCACCAGTTCCTTCAACTTCACCATCACAGCCTCACAAGTCGTGGACTCAGCAGTATACTTCTGTGCTCTGAGTGAGGCAGGAACCTACAAATACATCTTTGGAACAGGCACCAGGCTGAAGGTATTAGCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:137)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV9 CDR1、TRBV9 CDR2和TRBV9 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:62的氨基酸序列的TRBV9 CDR1、包含SEQ ID NO:63的氨基酸序列的TRBV9 CDR2、以及包含SEQ ID NO:64的氨基酸序列的TRBV9CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV9 CDR1的核酸序列包含TCTGGAGACCTCTCT(SEQ ID NO:138)。在一个实施方式中,编码TRBV9 CDR2的核酸序列包含CGGAACTCTTTTGATGAGCAAAAT(SEQ ID NO:139)。在一个实施方式中,编码TRBV9 CDR3的核酸序列包含TGTGCTCTGAGTGAGGCAGGAACCTACAAATACATCTTT(SEQ ID NO:140)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:65的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGC(SEQ ID NO:141)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:66的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGGGCTTCAGGCTCCTCTGCTGTGTGGCCTTTTGTCTCCTGGGAGCAGGCCCAGTGGATTCTGGAGTCACACAAACCCCAAAGCACCTGATCACAGCAACTGGACAGCGAGTGACGCTGAGATGCTCCCCTAGGTCTGGAGACCTCTCTGTGTACTGGTACCAACAGAGCCTGGACCAGGGCCTCCAGTTCCTCATTCAGTATTATAATGGAGAAGAGAGAGCAAAAGGAAACATTCTTGAACGATTCTCCGCACAACAGTTCCCTGACTTGCACTCTGAACTAAACCTGAGCTCTCTGGAGCTGGGGGACTCAGCTTTGTATTTCTGTGCCAGCAGCGTAGCTGGGGGGGGACAAGAGACCCAGTACTTCGGGCCAGGCACGCGGCTCCTGGTGCTCGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ IDNO:142)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,所述接头结构域包含SEQID NO:67的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:143)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:68的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGCTGACTGCCAGCCTGTTGAGGGCAGTCATAGCCTCCATCTGTGTTGTATCCAGCATGGCTCAGAAGGTAACTCAAGCGCAGACTGAAATTTCTGTGGTGGAGAAGGAGGATGTGACCTTGGACTGTGTGTATGAAACCCGTGATACTACTTATTACTTATTCTGGTACAAGCAACCACCAAGTGGAGAATTGGTTTTCCTTATTCGTCGGAACTCTTTTGATGAGCAAAATGAAATAAGTGGTCGGTATTCTTGGAACTTCCAGAAATCCACCAGTTCCTTCAACTTCACCATCACAGCCTCACAAGTCGTGGACTCAGCAGTATACTTCTGTGCTCTGAGTGAGGCAGGAACCTACAAATACATCTTTGGAACAGGCACCAGGCTGAAGGTATTAGCAAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGGGCTTCAGGCTCCTCTGCTGTGTGGCCTTTTGTCTCCTGGGAGCAGGCCCAGTGGATTCTGGAGTCACACAAACCCCAAAGCACCTGATCACAGCAACTGGACAGCGAGTGACGCTGAGATGCTCCCCTAGGTCTGGAGACCTCTCTGTGTACTGGTACCAACAGAGCCTGGACCAGGGCCTCCAGTTCCTCATTCAGTATTATAATGGAGAAGAGAGAGCAAAAGGAAACATTCTTGAACGATTCTCCGCACAACAGTTCCCTGACTTGCACTCTGAACTAAACCTGAGCTCTCTGGAGCTGGGGGACTCAGCTTTGTATTTCTGTGCCAGCAGCGTAGCTGGGGGGGGACAAGAGACCCAGTACTTCGGGCCAGGCACGCGGCTCCTGGTGCTCGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ ID NO:144)。

编码TCR847的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV17 CDR1、TRAV17 CDR2和TRAV17 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:69的氨基酸序列的TRAV17CDR1、包含SEQ ID NO:70的氨基酸序列的TRAV17 CDR2、以及包含SEQ ID NO:71的氨基酸序列的TRAV17 CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR1的核酸序列包含ACTAGTATAAACAAT(SEQ ID NO:145)。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR2的核酸序列包含ATACGTTCAAATGAAAGAGAG(SEQ ID NO:146)。在一个实施方式中,编码TRAV17 CDR3的核酸序列包含GCTACTTTTCCTAACTTTGGAAATGAGAAATTAACC(SEQ ID NO:147)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:72的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:148)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:73的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGGAAACTCTCCTGGGAGTGTCTTTGGTGATTCTATGGCTTCAACTGGCTAGGGTGAACAGTCAACAGGGAGAAGAGGATCCTCAGGCCTTGAGCATCCAGGAGGGTGAAAATGCCACCATGAACTGCAGTTACAAAACTAGTATAAACAATTTACAGTGGTATAGACAAAATTCAGGTAGAGGCCTTGTCCACCTAATTTTAATACGTTCAAATGAAAGAGAGAAACACAGTGGAAGATTAAGAGTCACGCTTGACACTTCCAAGAAAAGCAGTTCCTTGTTGATCACGGCTTCCCGGGCAGCAGACACTGCTTCTTACTTCTGTGCTACTTTTCCTAACTTTGGAAATGAGAAATTAACCTTTGGGACTGGAACAAGACTCACCATCATACCCAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:149)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV10-3 CDR1、TRBV10-3 CDR2和TRBV10-3 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:74的氨基酸序列的TRBV10-3 CDR1、包含SEQ ID NO:75的氨基酸序列的TRBV10-3 CDR2、以及包含SEQ ID NO:76的氨基酸序列的TRBV10-3 CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV10-3CDR1的核酸序列包含GAGAACCACCGCTA(SEQ ID NO:150)。在一个实施方式中,编码TRBV10-3 CDR2的核酸序列包含TCATATGGTGTTAAAGAT(SEQ ID NO:151)。在一个实施方式中,编码TRBV10-3 CDR3的核酸序列包含GCCATCAGTGAGTCGGAGCGGTACTACGAGCAGTAC(SEQ ID NO:152)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:77的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGC(SEQ ID NO:153)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:78的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGGGCACAAGGTTGTTCTTCTATGTGGCCCTTTGTCTCCTGTGGACAGGACACATGGATGCTGGAATCACCCAGAGCCCAAGACACAAGGTCACAGAGACAGGAACACCAGTGACTCTGAGATGTCACCAGACTGAGAACCACCGCTATATGTACTGGTATCGACAAGACCCGGGGCATGGGCTGAGGCTGATCCATTACTCATATGGTGTTAAAGATACTGACAAAGGAGAAGTCTCAGATGGCTATAGTGTCTCCAGATCAAAGACAGAGGATTTCCTCCTCACTCTGGAGTCCGCTACCAGCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCATCAGTGAGTCGGAGCGGTACTACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ ID NO:154)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,所述接头结构域包含SEQID NO:79的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:155)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:80的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGGAAACTCTCCTGGGAGTGTCTTTGGTGATTCTATGGCTTCAACTGGCTAGGGTGAACAGTCAACAGGGAGAAGAGGATCCTCAGGCCTTGAGCATCCAGGAGGGTGAAAATGCCACCATGAACTGCAGTTACAAAACTAGTATAAACAATTTACAGTGGTATAGACAAAATTCAGGTAGAGGCCTTGTCCACCTAATTTTAATACGTTCAAATGAAAGAGAGAAACACAGTGGAAGATTAAGAGTCACGCTTGACACTTCCAAGAAAAGCAGTTCCTTGTTGATCACGGCTTCCCGGGCAGCAGACACTGCTTCTTACTTCTGTGCTACTTTTCCTAACTTTGGAAATGAGAAATTAACCTTTGGGACTGGAACAAGACTCACCATCATACCCAATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGGGCACAAGGTTGTTCTTCTATGTGGCCCTTTGTCTCCTGTGGACAGGACACATGGATGCTGGAATCACCCAGAGCCCAAGACACAAGGTCACAGAGACAGGAACACCAGTGACTCTGAGATGTCACCAGACTGAGAACCACCGCTATATGTACTGGTATCGACAAGACCCGGGGCATGGGCTGAGGCTGATCCATTACTCATATGGTGTTAAAGATACTGACAAAGGAGAAGTCTCAGATGGCTATAGTGTCTCCAGATCAAAGACAGAGGATTTCCTCCTCACTCTGGAGTCCGCTACCAGCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCATCAGTGAGTCGGAGCGGTACTACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACAGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCTGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTCACCTCCGAGTCTTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCTTGCTAGGGAAGGCCACCTTGTATGCCGTGCTGGTCAGTGCCCTCGTGCTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTCCAGAGGCTGA(SEQ ID NO:156)。

编码TCR864的核酸分子

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:TRAV4 CDR1、TRAV4 CDR2和TRAV4 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRα链的TCR:包含SEQ ID NO:81的氨基酸序列的TRAV4 CDR1、包含SEQ ID NO:82的氨基酸序列的TRAV4 CDR2、以及包含SEQ ID NO:83的氨基酸序列的TRAV4CDR3。在一个实施方式中,编码TRAV4 CDR1的核酸序列包含AACATTGCTACAAATGATTAT(SEQID NO:157)。在一个实施方式中,编码TRAV4 CDR2的核酸序列包含GGATACAAGACAAAA(SEQID NO:158)。在一个实施方式中,编码TRAV4 CDR3的核酸序列包含CTCGTGGGTGACTTCAACTCAAATTCCGGGTATGCACTCAAC(SEQ ID NO:159)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRα链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:84的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:160)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:85的氨基酸序列的TCRα链。在一个实施方式中,编码TCRα链的核酸序列包含:ATGAGGCAAGTGGCGAGAGTGATCGTGTTCCTGACCCTGAGTACTTTGAGCCTTGCTAAGACCACCCAGCCCATCTCCATGGACTCATATGAAGGACAAGAAGTGAACATAACCTGTAGCCACAACAACATTGCTACAAATGATTATATCACGTGGTACCAACAGTTTCCCAGCCAAGGACCACGATTTATTATTCAAGGATACAAGACAAAAGTTACAAACGAAGTGGCCTCCCTGTTTATCCCTGCCGACAGAAAGTCCAGCACTCTGAGCCTGCCCCGGGTTTCCCTGAGCGACACTGCTGTGTACTACTGCCTCGTGGGTGACTTCAACTCAAATTCCGGGTATGCACTCAACTTCGGCAAAGGCACCTCGCTGTTGGTCACACCCCATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGC(SEQ ID NO:161)。

在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:TRBV7-2 CDR1、TRBV7-2 CDR2和TRBV7-2 CDR3。在实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有以下中的一种或多种的TCRβ链的TCR:包含SEQ ID NO:86的氨基酸序列的TRBV47-2CDR1、包含SEQ ID NO:87的氨基酸序列的TRBV7-2 CDR2、以及包含SEQ ID NO:88的氨基酸序列的TRBV7-2 CDR3。在一个实施方式中,编码TRBV7-2CDR1的核酸序列包含TCAGGTCATACTGCC(SEQ ID NO:162)。在一个实施方式中,编码TRBV7-2 CDR2的核酸序列包含TTCCAAGGCAACAGTGCA(SEQ ID NO:163)。在一个实施方式中,编码TRBV7-2 CDR3的核酸序列包含GCCAGCAAGGTCTATGGCTACACC(SEQ ID NO:164)。

在一个实施方式中,分离的核酸分子编码包含含有恒定结构域的TCRβ链的TCR,所述恒定结构域包含SEQ ID NO:89的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码恒定结构域的核酸序列包含:GAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTC(SEQ ID NO:165)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:90的氨基酸序列的TCRβ链。在一个实施方式中,编码TCRβ链的核酸序列包含:ATGGGCACCAGGCTCCTCTTCTGGGTGGCCTTCTGTCTCCTGGGGGCATATCACACAGGAGCTGGAGTCTCCCAGTCCCCCAGTAACAAGGTCACAGAGAAGGGAAAGGATGTAGAGCTCAGGTGTGATCCAATTTCAGGTCATACTGCCCTTTACTGGTACCGACAGAGGCTGGGGCAGGGCCTGGAGTTTTTAATTTACTTCCAAGGCAACAGTGCACCAGACAAATCAGGGCTGCCCAGTGATCGCTTCTCTGCAGAGAGGACTGGGGAATCCGTCTCCACTCTGACGATCCAGCGCACACAGCAGGAGGACTCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAAGGTCTATGGCTACACCTTCGGTTCGGGGACCAGGTTAACCGTTGTAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTCTGA(SEQ ID NO:166)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白。在一个实施方式中,分离的核酸分子编码融合蛋白,所述融合蛋白包含在TCRα链与TCRβ链之间的接头结构域。在一个实施方式中,核酸分子编码GSG-T2A接头结构域,所述接头结构域包含SEQID NO:91的氨基酸序列。在一个实施方式中,编码GSG-T2A接头结构域的核酸序列包含:GGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCT(SEQ ID NO:167)。

在一个实施方式中,核酸分子编码包含SEQ ID NO:92的氨基酸序列的融合蛋白。在一个实施方式中,编码融合蛋白的核酸序列包含ATGAGGCAAGTGGCGAGAGTGATCGTGTTCCTGACCCTGAGTACTTTGAGCCTTGCTAAGACCACCCAGCCCATCTCCATGGACTCATATGAAGGACAAGAAGTGAACATAACCTGTAGCCACAACAACATTGCTACAAATGATTATATCACGTGGTACCAACAGTTTCCCAGCCAAGGACCACGATTTATTATTCAAGGATACAAGACAAAAGTTACAAACGAAGTGGCCTCCCTGTTTATCCCTGCCGACAGAAAGTCCAGCACTCTGAGCCTGCCCCGGGTTTCCCTGAGCGACACTGCTGTGTACTACTGCCTCGTGGGTGACTTCAACTCAAATTCCGGGTATGCACTCAACTTCGGCAAAGGCACCTCGCTGTTGGTCACACCCCATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTGTTGGACATGCGCAGCATGGACTTCAAGAGCAACAGTGCTGTGGCCTGGAGCAACAAATCTGACTTTGCATGTGCAAACGCCTTCAACAACAGCATTATTCCAGAAGACACCTTCTTCCCCAGCCCAGAAAGTTCCTGTGATGTCAAGCTGGTCGAGAAAAGCTTTGAAACAGATACGAACCTAAACTTTCAAAACCTGTCAGTGATTGGGTTCCGAATCCTCCTCCTGAAAGTGGCCGGGTTTAATCTGCTCATGACGCTGCGGCTGTGGTCCAGCGGCAGCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTTCTAACATGCGGTGACGTGGAGGAGAATCCCGGCCCTATGGGCACCAGGCTCCTCTTCTGGGTGGCCTTCTGTCTCCTGGGGGCATATCACACAGGAGCTGGAGTCTCCCAGTCCCCCAGTAACAAGGTCACAGAGAAGGGAAAGGATGTAGAGCTCAGGTGTGATCCAATTTCAGGTCATACTGCCCTTTACTGGTACCGACAGAGGCTGGGGCAGGGCCTGGAGTTTTTAATTTACTTCCAAGGCAACAGTGCACCAGACAAATCAGGGCTGCCCAGTGATCGCTTCTCTGCAGAGAGGACTGGGGAATCCGTCTCCACTCTGACGATCCAGCGCACACAGCAGGAGGACTCGGCCGTGTATCTCTGTGCCAGCAAGGTCTATGGCTACACCTTCGGTTCGGGGACCAGGTTAACCGTTGTAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTTCCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTGAATGGGAAGGAGGTGCACAGTGGGGTCAGCACGGACCCGCAGCCCCTCAAGGAGCAGCCCGCCCTCAATGACTCCAGATACTGCCTGAGCAGCCGCCTGAGGGTCTCGGCCACCTTCTGGCAGAACCCCCGCAACCACTTCCGCTGTCAAGTCCAGTTCTACGGGCTCTCGGAGAATGATGAGTGGACACAAGATAGGGCCAAACCCGTCACCCAGATCGTCAGCGCCGAGGCCTGGGGTAGAGCAGACTGTGGCTTTACCTCGGTGTCCTACCAGCAAGGGGTCCTGTCTGCCACCATCCTCTATGAGATCCTGCTAGGGAAGGCCACCCTGTATGCTGTGCTGGTCAGCGCCCTTGTGTTGATGGCCATGGTCAAGAGAAAGGATTTCTGA(SEQ ID NO:168)。

在某些实施方式中,编码TCR的α链恒定区或β链恒定区的核酸序列包含对基因编辑(诸如CRISPR介导的基因编辑)有抗性的核酸序列。

此外,本发明涵盖编码与本文所公开的氨基酸序列具有实质同一性的氨基酸序列的分离的核酸。在某些实施方式中,分离的核酸序列编码与本文所公开的氨基酸序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的氨基酸序列。

此外,本发明涵盖与本文所公开的核酸序列具有实质同一性的分离的核酸。在某些实施方式中,分离的核酸序列与本文所公开的核酸序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列同一性。

可以使用本领域已知的许多重组方法中的任何一种(诸如,例如通过从表达基因的细胞中筛选文库,通过从已知包含所述基因的载体中衍生出所述基因,或者通过使用标准技术从含有所述基因的细胞和组织中直接分离)获得编码本发明多肽的分离的核酸序列。可替代地,感兴趣的基因可以合成产生,而不是克隆。

分离的核酸可以包含任何类型的核酸,包括但不限于DNA和RNA。例如,在一个实施方式中,所述组合物包含分离的DNA分子,包括例如编码本发明多肽的分离的cDNA分子或其功能片段。在一个实施方式中,所述组合物包含编码本发明多肽的分离的RNA分子或其功能片段。

本发明的核酸分子可以被修饰以改善在血清中或在用于细胞培养的生长培养基中的稳定性。可以添加修饰以增强稳定性、功能性和/或特异性和最小化本发明核酸分子的免疫刺激特性。例如,为了增强稳定性,可以稳定3’-残基以防止降解,例如,可以选择它们使得它们由嘌呤核苷酸(特别是腺苷或鸟苷核苷酸)组成。可替代地,用经修饰的类似物取代嘧啶核苷酸,例如用2’-脱氧胸苷取代尿苷是容忍的并且不影响分子的功能。

在本发明的一个实施方式中,核酸分子可以含有至少一个经修饰的核苷酸类似物。例如,可以通过掺入经修饰的核苷酸类似物来使末端稳定。

核苷酸类似物的非限制性实例包括糖-和/或骨架-修饰的核糖核苷酸(即包括对磷酸-糖骨架的修饰)。例如,天然RNA的磷酸二酯键可以被修饰以包括氮或硫杂原子中的至少一种。在优选的骨架修饰的核糖核苷酸中,与相邻核糖核苷酸连接的磷酸酯基团被经修饰的基团(例如硫代磷酸酯基团的)替代。在优选的糖修饰的核糖核苷酸中,2’OH-基团被选自H、OR、R、卤代、SH、SR、NH2、NHR、NR2或ON的基团替代,其中R是C1-C6烷基、烯基或炔基并且卤代是F、Cl、Br或I。

修饰的其它实例是含有至少一个非天然存在的核碱基而不是天然存在的核碱基的核碱基修饰的核糖核苷酸,即核糖核苷酸。碱基可以被修饰以阻断腺苷脱氨酶的活性。示例性经修饰的核碱基包括但不限于在5-位经修饰的尿苷和/或胞苷,例如5-(2-氨基)丙基尿苷、5-溴尿苷;在8位经修饰的腺苷和/或鸟苷,例如8-溴鸟苷;去氮杂核苷酸,例如7-去氮杂腺苷;O-和N-烷基化核苷酸,例如N6-甲基腺苷是合适的。应当注意,上述修饰可以被组合。

在一些情形中,核酸分子包含以下化学修饰中的至少一种:一种或多种核苷酸的2’-H、2’-O-甲基或2’-OH修饰。在某些实施方式中,本发明的核酸分子可以具有增强的核酸酶抗性。为了增加核酸酶抗性,核酸分子可以包括例如2’-修饰的核糖单元和/或硫代磷酸酯键。例如,2’羟基(OH)可以被许多不同的“氧基”或“脱氧基”取代基修饰或替代。为了增加核酸酶抗性,本发明的核酸分子可以包括2’-O-甲基、2’-氟、2’-O-甲氧基乙基、2’-O-氨基丙基、2’-氨基和/或硫代磷酸酯键。包含锁定的核酸(LNA)、乙烯核酸(ENA)(例如2’-4’-乙烯-桥接的核酸)以及某些核碱基修饰(诸如2-氨基-A、2-硫代(例如2-硫代-U)、G-钳夹修饰)也可以增加与靶标的结合亲和力。

在一个实施方式中,核酸分子包括2’-修饰的核苷酸,例如2’-脱氧、2’-脱氧-2’-氟、2’-O-甲基、2’-O-甲氧基乙基(2’-O-MOE)、2’-O-氨基丙基(2’-O-AP)、2’-O-二甲基氨基乙基(2’-O-DMAOE)、2’-O-二甲基氨基丙基(2’-O-DMAP)、2’-O-二甲基氨基乙基氧基乙基(2’-O-DMAEOE)或2’-O-N-甲基乙酰胺基(2’-O-NMA)。在一个实施方式中,核酸分子包括至少一个2’-O-甲基-修饰的核苷酸,并且在一些实施方式中,核酸分子的所有核苷酸包括2’-O-甲基修饰。

本发明还包括其中插入了本发明的分离的核酸的载体。本领域有很多可用于本发明的合适载体。

简而言之,编码本发明肽的天然或合成核酸的表达通常通过将编码肽或其部分的核酸可操作地连接到启动子上并使构建体并入表达载体中来实现。待使用的载体适合于在真核细胞中复制和任选地整合。典型的载体含有转录和翻译终止子、起始序列和可用于调节所需核酸序列表达的启动子。

使用标准的基因递送方案,本发明的载体也可以用于核酸免疫和基因疗法。基因递送的方法在本领域中是已知的。参见例如,美国专利号5,399,346、5,580,859、5,589,466,通过引用以其整体并入本文。在另一个实施方式中,本发明提供了基因疗法载体。

可以将本发明的分离的核酸克隆到许多类型的载体中。例如,可以将核酸克隆到载体中,所述载体包括但不限于质粒、噬菌粒、噬菌体衍生物、动物病毒和粘粒。特别感兴趣的载体包括表达载体、复制载体、探针生成载体和测序载体。

此外,可以将载体以病毒载体的形式提供给细胞。病毒载体技术在本领域中是熟知的,并且描述于例如Sambrook等人(2012,Molecular Cloning:ALaboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,纽约)以及其它病毒学和分子生物学手册中。可用作载体的病毒包括但不限于逆转录病毒、腺病毒、腺相关病毒、疱疹病毒和慢病毒。一般来说,合适的载体含有在至少一种生物体中起作用的复制起点、启动子序列、方便的限制性核酸内切酶位点和一种或多种选择性标记(例如,WO 01/96584;WO 01/29058;和美国专利号6,326,193)。

已经开发了许多基于病毒的系统用于将基因转移到哺乳动物细胞中。例如,逆转录病毒为基因递送系统提供了方便的平台。可以使用本领域已知的技术将选定的基因插入载体中并包装在逆转录病毒颗粒中。重组病毒然后可以被分离并体内或离体递送到受试者的细胞中。许多逆转录病毒系统在本领域中是已知的。在一些实施方式中,使用了腺病毒载体。许多腺病毒载体在本领域中是已知的。在一个实施方式中,使用慢病毒载体。

例如,来源于逆转录病毒诸如慢病毒的载体是实现长期基因转移的合适工具,因为它们允许转基因的长期稳定整合及其在子细胞中的增殖。慢病毒载体比来源于肿瘤逆转录病毒诸如鼠白血病病毒的载体具有额外的优势,因为它们可以转导非增殖细胞,诸如肝细胞。它们还具有免疫原性低的额外优势。在一个实施方式中,所述组合物包括来源于腺相关病毒(AAV)的载体。腺相关病毒(AAV)载体已经成为治疗各种障碍的强有力的基因递送工具。AAV载体拥有许多使其非常适合基因疗法的特征,包括缺乏致病性、最小的免疫原性以及以稳定和有效的方式转导有丝分裂后细胞的能力。通过选择AAV血清型、启动子和递送方法的适当组合,可以将AAV载体内所含的特定基因的表达特异性地靶向一种或多种类型的细胞。

在某些实施方式中,载体还包括常规的控制元件,其以允许转基因在用质粒载体转染或用由本发明产生的病毒感染的细胞中转录、翻译和/或表达的方式与转基因可操作地连接。如本文所用,“可操作地连接的”序列包括与感兴趣的基因邻接的表达控制序列和按照反式或在一定距离发挥作用以控制感兴趣的基因的表达控制序列。表达控制序列包括适当的转录起始、终止、启动子和增强子序列;有效的RNA加工信号,诸如剪接和聚腺苷酸化(聚A)信号;稳定细胞质mRNA的序列;增强翻译效率的序列(即,Kozak共有序列);增强蛋白质稳定性的序列;以及当需要时,增强所编码的产物分泌的序列。大量的表达控制序列(包括是天然的、组成型的、诱导型的和/或组织特异性的启动子)在本领域中是已知的,并且可以被利用。

另外的启动子元件(例如增强子)调节转录起始的频率。通常,这些元件位于起始位点上游30-110bp的区域中,但是最近已经表明许多启动子也含有在起始位点下游的功能元件。在启动子元件之间的间距通常是灵活的,因此当元件相对于彼此倒置或移动时,启动子功能得以保留。在胸苷激酶(tk)启动子中,在活性开始下降之前,在启动子元件之间的间距可以增加到50bp。取决于启动子,单独的元件似乎可以协同地或独立地发挥作用以激活转录。

合适启动子的一个实例是巨细胞病毒(CMV)立即早期启动子序列。该启动子序列是能够驱动与其可操作地连接的任何多核苷酸序列的高水平表达的强组成型启动子序列。合适的启动子的另一个实例是延伸生长因子1α(EF-1α)。然而,也可以使用其它组成型启动子序列,包括但不限于猿猴病毒40(SV40)早期启动子、小鼠乳腺肿瘤病毒(MMTV)、人免疫缺陷病毒(HIV)长末端重复序列(LTR)启动子、MoMuLV启动子、禽白血病病毒启动子、爱泼斯坦-巴尔病毒(Epstein-Barr virus)立即早期启动子、劳斯肉瘤病毒启动子、以及人类基因启动子(例如但不限于肌动蛋白启动子、肌球蛋白启动子、血红蛋白启动子和肌酸激酶启动子)。此外,本发明不应局限于使用组成型启动子。诱导型启动子也被认为是本发明的一部分。诱导型启动子的使用提供了一种分子开关,其能够在需要这种表达时开启与其可操作地连接的多核苷酸序列的表达,或者在不需要表达时关闭表达。诱导型启动子的实例包括但不限于金属硫蛋白(metallothionine)启动子、糖皮质激素启动子、孕酮启动子和四环素启动子。

在载体上发现的增强子序列也调节在其中所含基因的表达。通常,增强子与蛋白质因子结合以增强基因的转录。增强子可能位于其调节的基因的上游或下游。增强子也可以是组织特异性的,以增强特定细胞或组织类型中的转录。在一个实施方式中,本发明的载体包含一种或多种增强子以提高载体中存在的基因的转录。

为了评估肽的表达,待引入细胞中的表达载体也可以包含选择性标记基因或报告基因或两者,以促进对从寻求通过病毒载体转染或感染的细胞群体中鉴定和选择表达细胞。在其它方面,选择性标记可以携带在单独的一段DNA上,并用于共转染程序。选择性标记和报告基因两者的两侧都可以带有适当的调节序列,以使其能够在宿主细胞中表达。有用的选择性标记包括例如,抗生素抗性基因,诸如neo等。

报告基因用于鉴定潜在的转染细胞和用于评估调节序列的功能。一般来说,报告基因是接受者生物体或组织中不存在或不表达的基因,并且其编码一种多肽,该多肽的表达表现为一些易于检测的特性,例如酶促活性。在将DNA引入接受者细胞中之后的合适时间测定报告基因的表达。合适的报告基因可以包括编码萤光素酶、β-半乳糖苷酶、氯霉素乙酰转移酶、分泌型碱性磷酸酶的基因或绿色荧光蛋白基因(例如,Ui-Tei等人,2000FEBSLetters 479:79-82)。合适的表达系统是熟知的,并且可以使用已知技术制备或商购获得。一般来说,具有显示报告基因最高表达水平的最小5'侧翼区域的构建体被鉴定为启动子。此类启动子区域可以与报告基因连接,并用于评估药剂调节启动子驱动的转录的能力。

将基因引入细胞中并在细胞中表达的方法在本领域中是已知的。在表达载体的背景下,载体可以通过本领域中的任何方法容易地引入宿主细胞(例如哺乳动物、细菌、酵母或昆虫细胞)中。例如,表达载体可以通过物理、化学或生物手段转移到宿主细胞中。

将多核苷酸引入宿主细胞中的物理方法包括磷酸钙沉淀、脂转染、粒子轰击、显微注射、电穿孔等。生产包含载体和/或外源核酸的细胞的方法在本领域中是熟知的。参见例如,Sambrook等人(2012,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring HarborLaboratory,纽约)。将多核苷酸引入宿主细胞中的优选方法是磷酸钙转染。

将感兴趣的多核苷酸引入宿主细胞中的生物学方法包括使用DNA和RNA载体。病毒载体(以及尤其是逆转录病毒载体)已经成为将基因插入哺乳动物(例如人类)细胞中的最广泛使用的方法。其它病毒载体可以来源于慢病毒、痘病毒、单纯疱疹病毒I、腺病毒和腺相关病毒等。参见,例如美国专利号5,350,674和5,585,362中。

用于将多核苷酸引入宿主细胞中的化学手段包括胶体分散系统(诸如大分子复合物、纳米胶囊、微球、珠)和基于脂质的系统(包括水包油乳液、胶束、混合胶束和脂质体)。用作体外和体内递送载体的示例性胶体系统是脂质体(例如,人工膜囊泡)。

在使用非病毒递送系统的情况下,示例性递送载体是脂质体。预期使用脂质配制品将核酸引入宿主细胞中(体外、离体或体内)。在另一个方面,核酸可以与脂质缔合。与脂质缔合的核酸可以被囊封在脂质体的水性内部中,散布在脂质体的脂质双层内,通过与脂质体和寡核苷酸两者缔合的连接分子附着到脂质体上,被截留在脂质体中,与脂质体复合,分散在含有脂质的溶液中,与脂质混合,与脂质结合,作为悬浮液包含在脂质中,包含在胶束中或与胶束复合,或者以其它方式与脂质缔合。脂质、脂质/DNA或脂质/表达载体相关组合物不限于在溶液中的任何特定结构。例如,它们可以以双层结构、作为胶束或以“塌陷”结构存在。它们也可以简单地分散在溶液中,可能形成大小或形状不均匀的聚集体。脂质是脂肪物质,其可以是天然存在的或合成的脂质。例如,脂质包括天然存在于细胞质中的脂肪滴、以及含有长链脂肪烃及其衍生物(诸如脂肪酸、醇、胺、氨基醇和醛)的一类化合物。

适合使用的脂质可以从商业来源获得。例如,二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱(“DMPC”)可以从Sigma,St.Louis,MO获得;双十六烷基磷酸酯(“DCP”)可以从K&K Laboratories(Plainview,NY)获得;胆固醇(“Choi”)可以从Calbiochem-Behring获得;二肉豆蔻酰磷脂酰甘油(“DMPG”)和其它脂质可以从Avanti Polar Lipids,Inc.(Birmingham,AL)获得。脂质在氯仿或氯仿/甲醇中的储备溶液可以储存在约-20℃。氯仿被用作唯一的溶剂,因为它比甲醇更容易蒸发。“脂质体”是一个通用术语,其涵盖由封闭的脂质双层或聚集体形成的各种单层和多层脂质载体。脂质体可以表征为具有囊泡结构,其具有磷脂双层膜和内部水性介质。多层脂质体具有由水性介质分隔的多个脂质层。当磷脂悬浮在过量的水性溶液中时,它们自发地形成。脂质组分在形成封闭结构之前经历自身重排,并在脂质双层之间截留水和溶解的溶质(Ghosh等人,1991Glycobiology 5:505-10)。然而,也涵盖在溶液中具有与正常囊泡结构不同的结构的组合物。例如,脂质可以采取胶束结构或者仅仅作为脂质分子的不均匀聚集体存在。还考虑了阳离子脂质体-核酸复合物。

不管用于将外源核酸引入宿主细胞中的方法如何,为了确认宿主细胞中重组DNA序列的存在,可以进行多种测定。此类测定包括例如,本领域技术人员熟知的“分子生物学”测定,诸如Southern和Northern印迹、RT-PCR和PCR;“生物化学”测定,诸如检测特定肽的存在或不存在,例如通过免疫学手段(ELISA和Western印迹)或通过本文所述的鉴定落入本发明范围内的药剂的测定。

在一个实施方式中,编码本发明的多肽的分离的核酸包含体外转录的(IVT)RNA。RNA是通过使用聚合酶链反应(PCR)产生的模板进行体外转录而产生的。可以通过PCR将来自任何来源的感兴趣的DNA直接转化为模板用于使用适当的引物和RNA聚合酶的体外mRNA合成。DNA的来源可以是例如基因组DNA、质粒DNA、噬菌体DNA、cDNA、合成DNA序列或任何其它适当的DNA来源。

在一个实施方式中,用于PCR的DNA含有开放阅读框。DNA可以来自生物体基因组中天然存在的DNA序列。在一个实施方式中,DNA是全长感兴趣基因或基因的一部分。所述基因可以包括一些或全部5'和/或3'非翻译区(UTR)。基因可以包括外显子和内含子。在一个实施方式中,用于PCR的DNA是人类基因。在另一个实施方式中,用于PCR的DNA是包括5'和3'UTR的人类基因。可替代地,所述DNA可以是在天然存在的生物体中不正常表达的人工DNA序列。示例性的人工DNA序列是包含连接在一起形成编码融合蛋白开放阅读框的基因的部分的一种DNA序列。连接在一起的DNA的部分可以来自单个生物体,也可以来自多于一个生物体。

可以用作PCR的DNA来源的基因包括编码多肽的基因,所述多肽对生物体提供治疗或预防作用或者可以用于诊断生物体中的疾病或障碍。优选的基因是对短期治疗有用的基因、或存在剂量或表达基因的安全性问题的基因。例如,为了治疗癌症,自身免疫性障碍,寄生虫、病毒、细菌、真菌或其它感染,待表达的转基因可以编码的用作免疫系统细胞的配体或受体或者可以发挥功能以刺激或抑制生物体的免疫系统的多肽。在一些实施方式中,不希望对免疫系统进行长时间的持续刺激,也没必要在成功治疗后产生持续的变化,因为这可能引发新的问题。对于自身免疫性障碍的治疗,可能需要在发作期间抑制或阻抑免疫系统,但不是长期的,这可能导致患者变得对感染过度敏感。

PCR用于产生用于转染的mRNA体外转录的模板。进行PCR的方法在本领域中是熟知的。用于PCR的引物被设计成具有与用作PCR模板的DNA区域基本上互补的区域。如本文所用,“基本上互补”是指引物序列中大部分或全部碱基互补或者一种或多种碱基不互补或错配的核苷酸序列。在用于PCR的退火条件下,基本上互补的序列能够与预期的DNA靶标退火或杂交。引物可以被设计成与DNA模板的任何部分基本上互补。例如,可以设计引物来扩增通常在细胞中转录的基因部分(开放阅读框),包括5'和3'UTR。引物也可以被设计成扩增编码特定感兴趣结构域的基因的一部分。在一个实施方式中,设计引物来扩增人cDNA的编码区,包括5'和3'UTR的全部或部分。通过本领域熟知的合成方法产生可用于PCR的引物。“正向引物”是含有与待扩增的DNA序列上游的DNA模板上的核苷酸基本上互补的核苷酸区域的引物。“上游”在本文中用于指待扩增的DNA序列相对于编码链在5’位置。“反向引物”是含有与待扩增的DNA序列下游的双链DNA模板基本上互补的核苷酸区域的引物。“下游”在本文中用于指待扩增的DNA序列相对于编码链在3'位置。

可用于PCR的任何DNA聚合酶都可以用于本文所公开的方法。试剂和聚合酶可从许多来源商购获得。

也可以使用能够促进稳定性和/或翻译效率的化学结构。RNA优选地具有5'和3'UTR。在一个实施方式中,5'UTR长度在0和3000个核苷酸之间。可以通过不同的方法待添加到编码区的5'和3'UTR序列的长度改变,所述方法包括但不限于设计与UTR不同区域退火的PCR引物。使用这种方法,本领域普通技术人员可以在转染所转录的RNA后,修改达到最佳翻译效率所需的5'和3'UTR长度。

5'和3'UTR可以是感兴趣基因的天然存在的内源性5'和3'UTR。可替代地,可以通过将UTR序列掺入正向引物和反向引物中或通过模板的任何其它修饰来添加对于感兴趣基因而言非内源的UTR序列。使用感兴趣基因非内源的UTR序列可以用于修改RNA的稳定性和/或翻译效率。例如,已知3'UTR序列中富含AU的元件可以降低mRNA的稳定性。因此,可以基于本领域熟知的UTR的特性来选择或设计3'UTR,以增加所转录的RNA的稳定性。

在一个实施方式中,5'UTR可以含有内源基因的Kozak序列。可替代地,当通过如上所述的PCR添加感兴趣基因非内源的5'UTR时,可以通过添加5'UTR序列来重新设计共有Kozak序列。Kozak序列可以增加一些RNA转录物的翻译效率,但似乎不是所有RNA都需要它来实现高效翻译。许多mRNA对Kozak序列的需求在本领域中是已知的。在其它实施方式中,5'UTR可以来源于其RNA基因组在细胞中稳定的RNA病毒。在其它实施方式中,各种核苷酸类似物可以用于3'或5'UTR,以阻止mRNA的核酸外切酶降解。

为了能够在不需要基因克隆的情况下从DNA模板合成RNA,转录启动子应该附着在待转录序列上游的DNA模板上。当作为RNA聚合酶启动子发挥功能的序列被添加到正向引物的5'端时,RNA聚合酶启动子变得被掺入待转录的开放阅读框上游的PCR产物中。在一个优选的实施方式中,启动子是T7聚合酶启动子,如本文别处所述。其它有用的启动子包括但不限于T3和SP6 RNA聚合酶启动子。T7、T3和SP6启动子的共有核苷酸序列在本领域中是已知的。

在优选的实施方式中,mRNA在5'端有一个帽,在3'端有一个聚(A)尾,这决定了核糖体的结合、翻译的起始和mRNA在细胞中的稳定性。在环状的DNA模板(例如质粒DNA)上,RNA聚合酶产生不适合在真核细胞中表达的一种长的多联体产物。在3'UTR末端线性化的质粒DNA的转录产生正常大小的mRNA,这在真核转染中是无效的,即使它是在转录之后。

在线性DNA模板上,噬菌体T7 RNA聚合酶可以将转录物的3'端延伸到模板的最后一个碱基之外(Schenborn和Mierendorf,Nuc Acids Res.,13:6223-36(1985);Nacheva和Berzal-Herranz,Eur.J.Biochem.,270:1485-65(2003)。

将聚A/T延伸段整合到DNA模板中的传统方法是分子克隆。然而,整合到质粒DNA中的聚A/T序列可能导致质粒不稳定性,这就是为什么从细菌细胞中获得的质粒DNA模板经常受到缺失和其它畸变的高度污染。这使得克隆程序不仅费力费时,而且往往不可靠。这就是为什么非常需要一种无需克隆就能构建具有聚A/T 3'延伸段的DNA模板的方法。

转录DNA模板的聚A/T区段可以通过使用含有聚T尾(诸如100T尾(大小可以是50-5000T))的反向引物在PCR期间产生,或者在PCR之后通过任何其它方法(包括但不限于DNA连接或体外重组)产生。聚(A)尾也为RNA提供稳定性,并减少它们的降解。通常,聚(A)尾的长度与所转录的RNA的稳定性正相关。在一个实施方式中,聚(A)尾在100和5000个腺苷之间。

使用聚(A)聚合酶(诸如大肠杆菌聚A聚合酶(E-PAP))在体外转录后可进一步延伸RNA的聚(A)尾。在一个实施方式中,将聚(A)尾的长度从100个核苷酸增加到300与400个核苷酸之间,导致RNA翻译效率增加约两倍。另外,在3'端附接不同的化学基团可以增加mRNA的稳定性。这种附接可以含有经修饰的/人工核苷酸、适体和其它化合物。例如,可以使用聚(A)聚合酶将ATP类似物掺入聚(A)尾中。ATP类似物可以进一步增加RNA稳定性。

5'帽也为RNA分子提供了稳定性。在优选的实施方式中,通过本文所公开的方法产生的RNA包括5'帽。使用本领域已知和本文所述的技术来提供5'帽(Cougot等人,Trends inBiochem.Sci.,29:436-444(2001);Stepinski等人,RNA,7:1468-95(2001);Elango等人,Biochim.Biophys.Res.Commun.,330:958-966(2005))。

通过本文所公开的方法产生的RNA也可以含有内部核糖体进入位点(IRES)序列。IRES序列可以是任何病毒、染色体或人工设计的序列,其启动独立于帽的核糖体与mRNA的结合并促进翻译的启动。可以包括适合于细胞电穿孔的任何溶质,其可以含有促进细胞通透性和存活性的因子,诸如糖、肽、脂质、蛋白质、抗氧化剂和表面活性剂。

可以使用多种不同方法(例如,可商购获得的方法,)中的任何一种将RNA引入靶细胞中,所述方法包括但不限于电穿孔(Amaxa Nucleofector-II(Amaxa Biosystems,科隆,德国))、(ECM 830(BTX)(Harvard Instruments,Boston,Mass)或Gene Pulser II(BioRad,Denver,Colo.)、Multiporator(Eppendort,德国汉堡)、使用脂转染的阳离子脂质体介导的转染、聚合物包封、肽介导的转染或生物粒子递送系统诸如“基因枪”(参见例如,Nishikawa等人Hum Gene Ther.,12(8):861-70(2001)。

在另一个方面,可以通过电穿孔将RNA构建体递送到细胞中。参见例如,如在US2004/0014645、US 2005/0052630A1、US 2005/0070841A1、US 2004/0059285A1、US 2004/0092907A1中教导的将核酸构建体电穿孔到哺乳动物细胞中的配制品和方法。任何已知细胞类型的电穿孔所需的包括电场强度在内的各种参数在相关研究文献以及该领域的许多专利和申请中通常是已知的。参见例如美国专利号6,678,556、美国专利号7,171,264以及美国专利号7,173,116中所述。用于电穿孔治疗应用的装置可商购获得,例如MedPulserTMDNA电穿孔疗法系统(Inovio/Genetronics,San Diego,Calif.),并且描述于专利诸如美国专利号6,567,694;美国专利号6,516,223、美国专利号5,993,434、美国专利号6,181,964、美国专利号6,241,701以及美国专利号6,233,482中;电穿孔也可以用于体外转染细胞,如在例如US20070128708A1中所述。电穿孔也可以用于在体外将核酸递送到细胞中。因此,利用本领域技术人员已知的许多可用装置和电穿孔系统中的任何一种,将包括表达构建体在内的核酸电穿孔介导施用至细胞中,提供了一种将感兴趣的RNA递送到靶细胞中的令人兴奋的新手段。

经修饰的细胞

在某些实施方式中,本发明的组合物包含被修饰以包含或表达本发明肽的细胞。在某些实施方式中,通过使细胞与编码本文所述的多肽诸如mRAS肽、TCR或包含TCRα链和TCRβ链的融合蛋白的分离的核酸接触来对细胞进行遗传修饰。

在一些实施方式中,使用逆转录病毒或慢病毒载体将核酸序列递送到细胞中。例如,使用转导的细胞作为载体或对包封的、结合的或裸的载体的无细胞的局部或全身递送,可以将表达本发明的肽的逆转录病毒和慢病毒载体递送到不同类型的真核细胞中以及组织和整个生物体中。所使用的方法可以用于稳定表达是需要或足够的任何目的。

在其它实施方式中,使用体外转录的mRNA将核酸序列递送到细胞中。使用转染的细胞作为载体或对包封的、结合的或裸的mRNA的无细胞的局部或全身递送,可以将体外转录的mRNA递送到不同类型的真核细胞中以及组织和整个生物体中。所使用的方法可以用于瞬时表达是需要或足够的任何目的。

在某些实施方式中,细胞可以是可以表达所需肽的任何合适的细胞类型。在某些实施方式中,经修饰的细胞用于将细胞引入接受者中的方法中。在某些实施方式中,细胞对于接受者而言是自体的、同种异体的、同系的或异种的。在某些实施方式中,细胞来源于干细胞或前体细胞。在一些实施方式中,经修饰的细胞所来源的干细胞或前体细胞对于接受者而言是自体的、同种异体的、同系的或异种的。

在一个实施方式中,所述细胞为免疫细胞。例如,在某些实施方式中,所述组合物包含含有或表达一种或多种本文所述的mRAS肽或TCR的免疫细胞。可以包含或表达一种或多种本文所述TCR的示例性免疫细胞包括但不限于T细胞(包括杀伤T细胞、辅助T细胞、调节T细胞和γδT细胞)、自然杀伤(NK)细胞和NK T细胞。可以包含或表达一种或多种本文所述的mRAS肽的示例性免疫细胞包括但不限于抗原呈递细胞、树突细胞、B细胞、巨噬细胞、朗格汉斯细胞、T细胞、NK细胞、NK T细胞。示例性免疫细胞包括但不限于T细胞(包括杀伤T细胞、辅助T细胞、调节T细胞和γδT细胞)、B细胞、抗原呈递细胞(APC)、自然杀伤(NK)细胞和NK T细胞。

在一个实施方式中,细胞是抗原呈递细胞(APC)。例如,在某些实施方式中,所述组合物包含被修饰以包含或表达本文所述的mRAS肽的APC。示例性APC包括但不限于树突细胞(DC)、巨噬细胞、朗格汉斯细胞、B细胞等。

所公开的组合物和方法可以应用于在基础研究和疗法中、在癌症、干细胞、急性和慢性感染以及自身免疫性疾病领域(包括评估遗传修饰的T细胞杀死靶癌细胞的能力)中调节T细胞活性。

在扩增和遗传修饰本发明的T细胞之前,从受试者获得T细胞来源。T细胞可以从许多来源获得,所述来源包括外周血单核细胞、骨髓、淋巴结组织、脐带血、胸腺组织、来自感染部位的组织、腹水、胸腔积液、脾组织和肿瘤。在本发明的某些实施方式中,可以使用本领域中可获得的任何数量的T细胞系。在本发明的某些实施方式中,可以使用本领域技术人员已知的任何技术(诸如FicollTM分离)从收集自受试者的单位血液中获得T细胞。在一个优选的实施方式中,来自个体循环血液的细胞通过单采术获得。单采术产物通常含有淋巴细胞,包括T细胞、单核细胞、粒细胞、B细胞、其它有核白细胞、红细胞和血小板。在一个实施方式中,洗涤通过单采术收集的细胞,以去除血浆级分并将细胞置于适当的缓冲液或介质(media,培养基)中用于后续的加工步骤。在本发明的一个实施方式中,用磷酸盐缓冲盐水(PBS)洗涤所述细胞。在替代性的实施方式中,洗涤溶液缺乏钙,并且可能缺乏镁,或者可能缺乏许多(如果不是全部)二价阳离子。再次,令人惊讶的是,在不存在钙的情况下最初的激活步骤导致了放大的激活。如本领域普通技术人员将容易理解的,洗涤步骤可以通过本领域技术人员已知的方法来完成,诸如根据制造商的说明书通过使用半自动“流过”离心机(例如,Cobe 2991细胞处理器、Baxter CytoMate或Haemonetics Cell Saver 5)来完成。洗涤之后,细胞可以重悬于各种生物相容的缓冲液(例如,无Ca2+、无Mg2+的PBS、PlasmaLyte A或其它含或不含缓冲液的盐水溶液)中。可替代地,可以除去单采术样品中不需要的组分,并且将细胞直接重悬于培养基中。

在另一个实施方式中,通过裂解红细胞并耗尽单核细胞,例如通过经PERCOLLTM梯度的离心或通过逆流离心淘洗,从外周血淋巴细胞中分离出T细胞。可以通过阳性或阴性选择技术进一步分离特定的T细胞亚群,诸如CD3+、CD28+、CD4+、CD8+、CD45RA+和CD45RO+ T细胞。例如,在一个实施方式中,通过与抗CD3/抗CD28(即,3x28)-缀合珠(诸如M-450 CD3/CD28T)一起孵育持续足以阳性选择所需T细胞的时间来分离T细胞。在一个实施方式中,时间段为约30分钟。在另外的实施方式中,时间段在从30分钟至36小时或更长时间的范围内以及在其间的所有整数值。在另外的实施方式中,时间段为至少1、2、3、4、5或6小时。在又另一个优选的实施方式中,时间段为10至24小时。在一个优选的实施方式中,孵育时间段为24小时。对于从白血病患者中分离T细胞,使用更长的孵育时间(诸如24小时)可以增加细胞产量。在与其它细胞类型相比T细胞较少的任何情况下,诸如从肿瘤组织或从免疫受损的个体中分离肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL),可以使用更长的孵育时间来分离T细胞。此外,使用更长的孵育时间可以增加CD8+ T细胞的捕获效率。因此,通过简单地缩短或延长允许T细胞与CD3/CD28珠结合的时间和/或通过增加或减少珠与T细胞的比率(如本文进一步所描述),可以在培养开始时或在过程期间的其它时间点优先对于或针对T细胞亚群进行选择。此外,通过增加或减少在珠或其它表面上的抗CD3和/或抗CD28抗体的比率,可以在培养开始时或在其它所需时间点优先对于或针对T细胞亚群进行选择。本领域技术人员将认识到,在本发明的背景下也可以使用多轮选择。在某些实施方式中,可能希望执行选择程序并在激活和扩展过程中使用“未选择的”细胞。“未选择的”细胞也可以经历另外轮的选择。

通过阴性选择富集T细胞群可以用针对阴性选择细胞所特有的表面标记的抗体的组合来完成。一种方法是通过阴性磁性免疫粘附或使用针对在阴性选择的细胞上存在的细胞表面标记的单克隆抗体的混合物的流式细胞术进行细胞分选和/或选择。例如,为了通过阴性选择富集CD4+细胞,单克隆抗体混合物通常包括针对CD14、CD20、CD11b、CD16、HLA-DR和CD8的抗体。在某些实施方式中,可能需要富集或阳性选择通常表达CD4+、CD25+、CD62Lhi、GITR+和FoxP3+的调节性T细胞。可替代地,在某些实施方式中,通过抗C25缀合珠或其它类似的选择方法来耗尽T调节细胞。

为了通过阳性或阴性选择分离所需的细胞群体,细胞和表面的浓度(例如,颗粒诸如珠)可以变化。在某些实施方式中,可能希望显著减少珠和细胞混合在一起的体积(即,增加细胞的浓度),以确保细胞和珠的最大接触。例如,在一个实施方式中,使用20亿个细胞/ml的浓度。在一个实施方式中,使用10亿个细胞/ml的浓度。在另外的实施方式中,使用大于1亿个细胞/ml。在另外的实施方式中,使用1000万、1500万、2000万、2500万、3000万、3500万、4000万、4500万或5000万个细胞/ml的细胞浓度。在又另一个实施方式中,使用7500万、8000万、8500万、9000万、9500万或1亿个细胞/ml的细胞浓度。在另外的实施方式中,可以使用1.25亿或1.5亿个细胞/ml的浓度。使用高浓度可以导致增加的细胞产量、细胞激活和细胞扩增。此外,高细胞浓度的使用允许可能弱表达感兴趣的靶抗原的细胞(诸如CD28阴性的T细胞)的更有效捕获或者从存在许多肿瘤细胞的样品中(即白血病血液、肿瘤组织等)更有效捕获细胞。此类细胞群体可能具有治疗价值,并且是所希望获得的。例如,使用高浓度的细胞允许更有效地选择通常具有较弱的CD28表达的CD8+ T细胞。

在相关实施方式中,可能希望使用更低浓度的细胞。通过显著稀释T细胞和表面(例如,颗粒诸如珠)的混合物,在颗粒与细胞之间的相互作用被最小化。这就选择了与颗粒结合的表达大量所需抗原的细胞。例如,CD4+ T细胞表达更高水平的CD28,并且比稀释浓度的CD8+ T细胞更有效地被捕获。在一个实施方式中,所使用的细胞浓度为5X106/ml。在其它实施方式中,所使用的浓度可以为从约1X105/ml至1X106/ml、以及介于其间的任何整数值。

在其它实施方式中,细胞可以在2-10℃或室温下以不同的速度在转子上孵育不同的时间长度。

也可以在洗涤步骤之后将用于刺激的T细胞冷冻。不希望受理论的束缚,冷冻和后续的解冻步骤通过去除细胞群体中的粒细胞和在一定程度上去除单核细胞来提供更均匀的产物。在去除血浆和血小板的洗涤步骤之后,可以将细胞悬浮在冷冻溶液中。虽然许多冷冻溶液和参数在本领域中是已知的并且在此背景下将是有用的,但是一种方法涉及使用含有20%DMSO和8%人血清白蛋白的PBS,或者含有10%葡聚糖40和5%葡萄糖、20%人血清白蛋白和7.5%DMSO的培养基、或者含有31.25%Plasmalyte-A、31.25%葡萄糖5%、0.45%NaCl、10%葡聚糖40和5%葡萄糖、20%人血清白蛋白和7.5%DMSO的培养基、或者含有例如羟乙基淀粉和PlasmaLyte A的其它合适的细胞冷冻介质,然后将细胞以每分钟1°的速率冷冻到-80℃,并储存在液氮储罐的气相中。除了在-20℃或液氮中立即不受控制的冷冻外,还可以使用其它控制冷冻方法。

在某些实施方式中,冷冻保存的细胞如本文所述被解冻和洗涤,并在使用本发明的方法激活之前允许在室温下静置一小时。

在本发明的背景下还考虑了在可能需要如本文所述的扩增细胞时之前的时间段从受试者中收集血液样品或单采术产物。因此,可以在任何必要的时间点收集待扩增的细胞来源,并且分离和冷冻所需的细胞(例如T细胞)供以后用于治疗将受益于T细胞疗法的任何数量的疾病或病症(诸如本文所述的那些)的T细胞疗法。在一个实施方式中,血液样品或单采术样品取自一般健康的受试者。在某些实施方式中,血液样品或单采术样品取自处于疾病发展风险中但尚未发展成疾病的一般健康受试者,并且分离和冷冻感兴趣的细胞供以后使用。在某些实施方式中,可以将T细胞扩增、冷冻并供以后使用。在某些实施方式中,在诊断出如本文所述的特定疾病后不久,但在任何治疗之前,从患者收集样品。在另外的实施方式中,在任何数量的相关治疗方式之前,从受试者的血液样品或单采术样品中分离细胞,所述治疗方式包括但不限于用药剂如那他珠单抗、依法珠单抗、抗病毒剂、化疗、放疗、免疫抑制剂(诸如环孢菌素、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤、霉酚酸酯和FK506)、抗体或其它免疫清除剂(诸如CAMPATH、抗CD3抗体、环磷酰胺、氟达拉滨、环孢菌素、FK506、雷帕霉素、霉酚酸、类固醇、FR901228和辐照)。这些药物抑制钙依赖性磷酸酶钙调神经素(环孢菌素和FK506)或抑制对生长因子诱导的信号传导重要的p70S6激酶(雷帕霉素)(Liu等人,Cell 66:807-815,1991;Henderson等人,Immun.73:316-321,1991;Bierer等人,Curr.Opin.Immun.5:763-773,1993)。在另外的实施方式中,为患者分离细胞,并将所述细胞冷冻供以后结合(例如,在其之前、同时或之后)骨髓或干细胞移植、使用化疗药剂(诸如氟达拉滨)、外束放射疗法(XRT)、环磷酰胺或抗体诸如OKT3或CAMPATH的T细胞消融疗法使用。在另一个实施方式中,细胞在B细胞消融疗法诸如与CD20反应的药剂(例如,Rituxan)之前被分离,并且可以被冷冻供以后用于在B细胞消融疗法诸如与CD20反应的药剂(例如,Rituxan)后的治疗。

在本发明的另外的实施方式中,在治疗后直接从患者获得T细胞。在这方面,已经观察到,在某些癌症治疗后,特别是在用损害免疫系统的药物治疗后,在患者通常从治疗中恢复的时期期间的治疗后不久,所获得的T细胞的质量可能是最佳的或者由于它们离体扩增的能力而得到改善。同样,在使用本文所述的方法进行离体操作后,这些细胞可能处于增强植入和体内扩增的优选状态。因此,在本发明的背景下设想在该恢复阶段期间收集血细胞,包括T细胞、树突细胞或造血谱系的其它细胞。此外,在某些实施方式中,动员(例如,用GM-CSF动员)和调理方案可以用于在受试者中创造条件,其中特别是在治疗后的限定时间窗口期间有利于特定细胞类型的再增殖、再循环、再生和/或扩增。说明性的细胞类型包括T细胞、B细胞、树突细胞和免疫系统的其它细胞。

无论是在对T细胞进行遗传修饰以表达本发明的肽之前还是之后,通常可以使用如在例如以下文献中所描述的方法激活和扩增T细胞:美国专利6,352,694;6,534,055;6,905,680;6,692,964;5,858,358;6,887,466;6,905,681;7,144,575;7,067,318;7,172,869;7,232,566;7,175,843;5,883,223;6,905,874;6,797,514;6,867,041;和美国专利申请公开号20060121005。

通常,通过与已经附着有刺激CD3/TCR复合物相关信号的药剂和刺激在T细胞表面上的共刺激分子的配体的表面接触来扩增本发明的T细胞。具体地,可以如本文所述的(诸如通过与抗CD3抗体或其抗原结合片段或固定在表面上的抗CD2抗体接触,或者通过结合钙离子载体与蛋白激酶C激活剂(例如苔藓抑素)接触)刺激T细胞群体。对于辅助分子在T细胞表面上的共刺激,使用结合辅助分子的配体。例如,可以在适于刺激T细胞增殖的条件下,将T细胞群体与抗CD3抗体和抗CD28抗体接触。为了刺激CD4+ T细胞或CD8+ T细胞的增殖,使用抗CD3抗体和抗CD28抗体。抗CD28抗体的实例包括9.3,B-T3,XR-CD28(Diaclone,法国),也可以使用本领域公知的其它方法(Berg等人,Transplant Proc.30(8):3975-3977,1998;Haanen等人,J.Exp.Med.190(9):13191328,1999;Garland等人,J.Immunol Meth.227(1-2):53-63,1999)。

在某些实施方式中,针对T细胞的初级刺激信号和共刺激信号可以由不同的方案提供。例如,提供每种信号的药剂可以在溶液中或者偶联到表面上。当偶联到表面上时,药剂可以偶联到同一表面(即呈“顺式”形式)或偶联到单独的表面上(即呈“反式”形式)。可替代地,一种药剂可以偶联到表面上,而另一种药剂在溶液中。在一个实施方式中,提供共刺激信号的药剂结合到细胞表面上,而提供初级激活信号的药剂在溶液中或偶联到表面上。在某些实施方式中,两种药剂都可以在溶液中。在另一个实施方式中,药剂可以呈可溶的形式,并且然后交联到表面(诸如表达Fc受体或抗体或将与药剂结合的其它结合药剂的细胞)上。在这方面,关于被考虑在本发明中用于激活和扩增T细胞的人工抗原呈递细胞(aAPC),参见例如美国专利申请公开号2004/0101519和2006/0034810。

在一个实施方式中,将两种药剂固定在珠上,固定在同一珠上(即“顺式”)或固定在单独的珠上(即“反式”)。举例来说,提供初级激活信号的药剂是抗CD3抗体或其抗原结合片段,并且提供共刺激信号的药剂是抗CD28抗体或其抗原结合片段;并且两种药剂以相等的分子量共同固定在相同珠上。在一个实施方式中,对于CD4+ T细胞扩增和T细胞生长,使用1:1比率的每种与珠结合的抗体。在本发明的某些方面,使用与珠结合的抗CD3:CD28抗体的比率,使得与使用1:1的比率观察到的扩增相比观察到T细胞扩增的增加。在一个特定的实施方式中,与使用1:1比率观察到的扩增相比,观察到从约1倍至约3倍的增加。在一个实施方式中,与珠结合的CD3:CD28抗体的比率在100:1至1:100的范围内以及在其间的所有整数值。在本发明的一个方面,与抗CD3抗体相比,更多的抗CD28抗体结合到颗粒上,即,CD3:CD28的比率小于1。在本发明的某些实施方式中,结合到珠上的抗CD28抗体与抗CD3抗体的比率大于2:1。在一个特定的实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:100 CD3:CD28比率。在另一个实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:75CD3:CD28比率。在另外的实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:50 CD3:CD28比率。在另一个实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:30CD3:CD28比率。在一个优选的实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:10 CD3:CD28比率。在另一个实施方式中,使用与珠结合的抗体的1:3CD3:CD28比率。在又另一个实施方式中,使用与珠结合的抗体的3:1CD3:CD28比率。

从1:500到500:1以及在其间的任何整数值的颗粒与细胞比率都可以用来刺激T细胞或其它靶细胞。如本领域普通技术人员可以容易地理解,颗粒与细胞的比率可能取决于相对于靶细胞的颗粒尺寸。例如,小尺寸的珠可能仅结合几个细胞,而较大的珠可以结合许多细胞。在某些实施方式中,细胞与颗粒的比率在从1:100至100:1的范围内以及在其间的任何整数值,并且在另外的实施方式中,该比例包括1:9至9:1以及在其间的任何整数值,也可以用于刺激T细胞。如上所述,导致T细胞刺激的抗CD3-和抗CD28-偶联颗粒与T细胞的比率可以变化,然而某些优选的值包括1:100、1:50、1:40、1:30、1:20、1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1:1、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1和15:1,其中一个优选的比率为每个T细胞至少1:1的颗粒。在一个实施方式中,使用1:1或更小的颗粒与细胞比率。在一个特定的实施方式中,优选的颗粒:细胞比率为1:5。在另外的实施方式中,颗粒与细胞的比率可以根据刺激的天数而变化。例如,在一个实施方式中,颗粒与细胞的比率在第一天为从1:1至10:1,并且此后每天或每隔一天向细胞中添加额外的颗粒长达10天,最终比率为1:1至1:10(基于添加当天的细胞计数)。在一个特定的实施方式中,颗粒与细胞的比率在刺激的第一天为1:1,并且在刺激的第三天和第五天调节至1:5。在另一个实施方式中,每天或每隔一天添加颗粒,使在刺激第一天的最终比率为1:1,在刺激第三天和第五天的最终比率为1:5。在另一个实施方式中,颗粒与细胞的比率在刺激的第一天为2:1,并且在刺激的第三天和第五天调节至1:10。在另一个实施方式中,每天或每隔一天添加颗粒,使在刺激第一天的最终比率为1:1,在刺激第三天和第五天的最终比率为1:10。本领域技术人员将会理解,多种其它比率可能适合用于本发明。具体地,比率将根据颗粒尺寸以及细胞大小和类型而变化。

在本发明的另外的实施方式中,将细胞诸如T细胞与药剂包被的珠组合,随后分离珠和细胞,并且然后培养细胞。在替代性实施方式中,在培养之前,不分离药剂包被的珠和细胞,而是一起培养。在另外的实施方式中,首先通过施加力(诸如磁力)来浓缩珠和细胞,导致细胞表面标记的连接增加,从而诱导细胞刺激。

举例来说,可以通过允许附着有抗CD3和抗CD28的顺磁性珠(3x28珠)接触T细胞来连接细胞表面蛋白。在一个实施方式中,将细胞(例如,104至109个T细胞)和珠(例如,M-450 CD3/CD28T顺磁性珠,比率为1:1)在缓冲液(优选地PBS(不含二价阳离子,诸如钙和镁))中组合。再次,本领域普通技术人员可以容易地理解,可以使用任何细胞浓度。例如,靶细胞在样品中可能非常罕见,并且仅样品或整个样品(即,100%)的0.01%可能包含感兴趣的靶细胞。因此,任何细胞数量都在本发明的背景内。在某些实施方式中,可能希望显著减少颗粒和细胞混合在一起的体积(即,增加细胞的浓度),以确保细胞和颗粒的最大接触。例如,在一个实施方式中,使用约20亿个细胞/ml的浓度。在另一个实施方式中,使用大于1亿个细胞/ml。在另外的实施方式中,使用1000万、1500万、2000万、2500万、3000万、3500万、4000万、4500万或5000万个细胞/ml的细胞浓度。在又另一个实施方式中,使用7500万、8000万、8500万、9000万、9500万或1亿个细胞/ml的细胞浓度。在另外的实施方式中,可以使用1.25亿或1.5亿个细胞/ml的浓度。使用高浓度可以导致增加的细胞产量、细胞激活和细胞扩增。此外,使用高细胞浓度允许更有效地捕获可能弱表达感兴趣的靶抗原的细胞,诸如CD28阴性T细胞。在某些实施方式中,此类细胞群体可能具有治疗价值,并且是所希望获得的。例如,使用高浓度的细胞允许更有效地选择通常具有较弱的CD28表达的CD8+ T细胞。

在本发明的一个实施方式中,可以将混合物培养数小时(约3小时)至约14天或在其间的任何小时整数值。在另一个实施方式中,可以将混合物培养21天。在本发明的一个实施方式中,珠和T细胞一起培养约8天。在另一个实施方式中,珠和T细胞一起培养2-3天。也可能需要几个刺激周期,使得T细胞的培养时间可以是60天或更长时间。适合于T细胞培养的条件包括适当的培养基(例如,最低基本培养基或RPMI培养基1640或X-vivo 15(Lonza)),其可能含有增殖和存活所必需的因子,包括血清(例如胎牛或人血清)、白介素-2(IL-2)、胰岛素、IFN-γ、IL-4、IL-7、GM-CSF、IL-10、IL-12、IL-15、TGFβ和TNF-α或本领域技术人员已知的用于细胞生长的任何其它添加剂。用于细胞生长的其它添加剂包括但不限于表面活性剂、人血浆蛋白粉(plasmanate)和还原剂(诸如N-乙酰-半胱氨酸和2-巯基乙醇)。培养基可以包括RPMI 1640、AIM-V、DMEM、MEM、α-MEM、F-12、X-Vivo 15和X-Vivo 20、Optimizer,其添加有氨基酸、丙酮酸钠和维生素,其是无血清的或补充有适当量的血清(或血浆)或一组限定的激素、和/或一定量的足以使T细胞生长和扩增的细胞因子。抗生素(例如青霉素和链霉素)只包括在实验培养物中,而不包括在待输注到受试者体内的细胞培养物中。靶细胞维持在支持生长所必需的条件下,例如在适当的温度(例如37℃)和气氛(例如空气加5%CO2)下。

暴露于不同刺激时间的T细胞可能表现出不同的特征。例如,典型的血液或单采术外周血单核细胞产物具有辅助T细胞群(TH,CD4+),其大于细胞毒性或抑制性T细胞群(TC,CD8+)。通过刺激CD3和CD28受体离体扩增T细胞产生了在约第8-9天之前主要由TH细胞组成的T细胞群体,而在约第8-9天之后,T细胞群体包含越来越多的TC细胞群体。因此,取决于治疗的目的,向受试者输注主要包含TH细胞的T细胞群体可能是有利的。类似地,如果已经分离出抗原特异性的TC细胞亚群,以更大程度扩增该亚群可能是有益的。

此外,除了CD4和CD8标记外,其它表型标记变化显著,但在很大程度上,在细胞扩增过程期间可再现。因此,这种再现性使得为特定目的定制激活的T细胞产品的能力成为可能。

方法

本发明提供了治疗患有或疑似患有mRAS相关癌症的受试者的方法。所述方法可以用于治疗与RAS突变(诸如在位置G12处的突变)相关的任何癌症,包括血液恶性肿瘤、实体瘤、原发性或转移性肿瘤。

通过本发明的方式可治疗的示例性肿瘤和癌症类型包括但不限于胰腺癌、胰腺导管腺癌(PDA)、结肠癌、结直肠腺癌、骨髓瘤、多发性骨髓瘤、肺腺癌、黑色素瘤、子宫癌、甲状腺癌、急性骨髓性白血病(AML)、尿路上皮癌、胃腺癌和宫颈腺癌、头颈部鳞状细胞癌(SCC)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、食管腺癌、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、肺SCC、小细胞肺癌(SCLC)、肾乳头状癌、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌、宫颈SCC、卵巢腺癌、肾上腺癌、前列腺癌、成神经细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤(GBM)、成神经管细胞瘤、肾细胞癌(RCC)、食管SCC、骨肉瘤、肉瘤和小肠神经内分泌肿瘤(NET)。

在某些实施方式中,本发明提供了在受试者中诱导针对mRAS的免疫应答的方法。例如,施用本文所述的组合物可以用于诱导针对mRAS和表达mRAS的癌细胞的特异性免疫应答,包括T细胞介导的免疫应答。在某些情形中,诱导针对mRAS的免疫应答导致对肿瘤生长的抑制和肿瘤细胞死亡。

在一个实施方式中,所述方法包括使所述受试者与本发明的组合物接触。例如,在某些实施方式中,所述方法包括使所述受试者与组合物接触,所述组合物包含本文所述的抗原性mRAS肽、编码本文所述的mRAS肽的核酸分子或被修饰以包含或表达本文所述的mRAS肽的细胞。在某些实施方式中,所述方法包括使所述受试者与组合物多肽接触,所述组合物多肽包含本文所述的TCR、编码包含本文所述的TCR的多肽的核酸分子、被修饰以表达本文所述的TCR的细胞。

在某些实施方式中,受试者被鉴定为具有与TCR所结合的mRAS肽相关的HLA类型。例如,如本文所述,在某些情形中,TCR在特定的HLA分子的背景下结合特定的mRAS肽。因此,在某些实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有特定的HLA分子,并且然后向所述受试者施用包含或编码本文所述的TCR的组合物。例如,在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01分子,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)、VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)、VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)、VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)、VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)、VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)、VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)、或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有特定的HLA分子,并且然后向所述受试者施用包含或编码本文所述的特定mRAS肽的组合物。例如,在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01分子,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)、VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)、VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)、VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)、VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)、VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)、VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)、或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01分子,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)、VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)、VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)、VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)、VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)、VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)、VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)、或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01分子,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGACGVGK(SEQ IDNO:5)、VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)、VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)、VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)、VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)、VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)、VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)、或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01分子,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)、KLVVVGADGV(SEQ ID NO:2)、KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)、或KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01分子,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)、KLVVVGADGV(SEQID NO:2)、KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)、或KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02分子,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)、GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)、GARGVGKSAL(SEQ IDNO:15)、或GAVGVGKSAL(SEQ ID NO:16)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02分子,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)、GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)、GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)、或GAVGVGKSAL(SEQ ID NO:16)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有特定的RAS突变。例如,在一个实施方式中,受试者被鉴定为具有在相对于野生型RAS的G12处的特定突变。例如,在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有相对于野生型RAS的G12C、G12D、G12R或G12V突变。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中mRAS肽包含KLVVVGACGV(SEQ ID NO:1)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含KLVVVGADGV(SEQ ID NO:2)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中mRAS肽包含KLVVVGADGV(SEQ ID NO:2)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含KLVVVGARGV(SEQ ID NO:3)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*02:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:10)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*03:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:12)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGACGVGK(SEQ ID NO:5)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)或VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGARGVGK(SEQ ID NO:9)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:10)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-A*11:01等位基因和G12V RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11)或VVVGACGVGK(SEQ ID NO:12)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12C RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含GACGVGKSAL(SEQ ID NO:13)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12D RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14)。

在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含TCR、编码TCR的核酸或表达TCR的细胞的组合物,其中所述TCR特异性地结合包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)的mRAS肽。在一个实施方式中,所述方法包括将受试者鉴定为具有HLA-B*07:02等位基因和G12R RAS突变,并向所述受试者施用包含mRAS肽、编码mRAS肽的核酸或表达mRAS肽的细胞的组合物,其中所述mRAS肽包含GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15)。

可以使用本领域已知的任何方法(包括但不限于DNA测序、RNA测序、下一代测序、PCR、免疫测定等),将受试者鉴定为属于特定的HLA类型或具有特定的RAS突变。

在一个实施方式中,所述方法包括施用至少一种被遗传修饰以表达TCR的细胞,其中所述TCR特异性地结合RAS、mRAS或其片段。例如,在某些实施方式中,所述方法包括施用被遗传修饰以表达TCR的细胞,其中所述TCR特异性地结合具有与G12对应的突变的mRAS肽。在某些实施方式中,所述方法包括施用被遗传修饰以表达TCR的细胞,其中所述TCR特异性地结合具有在与RAS G12对应的位置处的G12C、G12D、G12R或G12V突变的mRAS肽。

在一个实施方式中,本发明包括细胞疗法,其中细胞被修饰以包含或表达本发明的mRAS肽或TCR,并且将细胞输注给有需要的接受者。

在一个实施方式中,本发明包括细胞疗法,其中所述方法包括向受试者施用包含含有或表达本文所述的mRAS肽的细胞(诸如抗原呈递细胞)的组合物。例如,在一个实施方式中,所述方法包括施用包含抗原呈递细胞的组合物,所述抗原呈递细胞负载有本文所述的mRAS肽并在表面上表达所述mRAS肽。

在一个实施方式中,本发明包括细胞疗法,其中所述方法包括向受试者施用包含由包含或表达本文所述的mRAS肽的抗原呈递细胞激活或刺激的细胞的组合物。例如,在一个实施方式中,所述方法包括使细胞(诸如初始T细胞)与负载有本文所述的mRAS肽并在表面上表达mRAS肽的抗原呈递细胞接触;从而激活细胞。所述方法包括向受试者施用包含激活的细胞的组合物。例如,在一个实施方式中,本发明的方法包括以下步骤:(1)提供初始T细胞群体;(2)提供树突细胞群体;(3)用一种或多种本文所述的mRAS肽装载或脉冲树突细胞;(4)将初始T细胞和负载的树突细胞共同培养;和(4)分离刺激的T细胞。在一个实施方式中,所述方法还包括步骤(5)将刺激的T细胞施用给有需要的受试者,诸如患有mRAS相关癌症、怀疑患有mRAS相关癌症或处于患上mRAS相关癌症的风险中的受试者。

在某些实施方式中,输注的细胞(例如,呈递mRAS肽的抗原呈递细胞)能够刺激体内免疫应答。例如,在某些实施方式中,输注的细胞能够激活或刺激内源性免疫细胞以靶向和杀死接受者中的肿瘤细胞。

在某些实施方式中,输注的细胞能够杀死接受者中的肿瘤细胞。与抗体疗法不同的是,在某些情形中,经修饰的细胞能够体内复制,导致长期的持久性和监视,这可能导致持续的肿瘤控制。

在一个实施方式中,本发明的经修饰的T细胞可以经历稳健的体内T细胞扩增,并且可以持续延长量的时间。在另一个实施方式中,本发明的经修饰的T细胞进化成特定的记忆T细胞,其可以被重新激活以抑制任何额外的肿瘤形成或生长。例如,本发明的经修饰的T细胞可以经历稳健的体内T细胞扩增,并在血液和骨髓中保持高水平持续延长量的时间,并形成特定的记忆T细胞。

本发明的组合物可以单独施用,或者作为药物组合物与稀释剂和/或与其它组分诸如IL-2或其它细胞因子或细胞群体组合施用。简而言之,本发明的药物组合物可以包含与一种或多种药学上或生理学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂组合的如本文所述的组合物。此类组合物可以包含缓冲液,诸如中性缓冲盐水、磷酸盐缓冲盐水等;碳水化合物,诸如葡萄糖、甘露糖、蔗糖或葡聚糖、甘露醇;蛋白质;多肽或氨基酸,诸如甘氨酸;抗氧化剂;螯合剂,诸如EDTA或谷胱甘肽;佐剂(例如,氢氧化铝);和防腐剂。

可以将本发明的药物组合物以适合于待治疗(或预防)的疾病的方式施用。施用的数量和频率将由诸如患者的状况、患者疾病的类型和严重性等因素决定,但是适当的剂量可能由临床试验决定。

当指示“免疫有效量”、“抗肿瘤有效量”、“肿瘤抑制有效量”或“治疗量”时,医生可以在考虑患者(受试者)的年龄、体重、肿瘤大小、感染或转移程度和状况的个体差异的情况下确定待施用的本发明组合物的精确量。

主题组合物(例如,包含TCR、编码TCR的核酸分子或表达TCR的遗传修饰的细胞的组合物)的施用可以以任何方便的方式进行,所述任何方便的方式包括通过气溶胶吸入、注射、摄入、输注、植入或移植。本文所述的组合物可以皮下地、皮内地、瘤内地、鼻内地、髓内地、肌内地、通过静脉内(i.v.)注射或腹膜内地施用至患者。在一个实施方式中,本发明的组合物通过皮内或皮下注射施用至患者。在另一个实施方式中,本发明的组合物通过静脉内注射施用。在某些实施方式中,组合物可以直接注射到肿瘤或淋巴结中。

在一个实施方式中,本发明提供了一种治疗癌症的方法,所述方法包括在施用本发明的组合物之前、同时或之后用针对癌症的补充疗法(诸如手术、化疗、化学治疗剂、放射疗法或激素疗法或其组合)来治疗受试者。

化学治疗剂包括细胞毒性剂(例如,5-氟尿嘧啶、顺铂、卡铂、甲氨蝶呤、柔红霉素、多柔比星、长春新碱、长春碱、阿霉素(oxorubicin)、卡莫司汀(BCNU)、洛莫司汀(CCNU)、阿糖胞苷USP、环磷酰胺、雌氮芥磷酸钠(estramucine phosphate sodium)、六甲蜜胺、羟基脲、异环磷酰胺(ifosfamide)、丙卡巴肼、丝裂霉素、白消安、环磷酰胺、米托蒽醌、卡铂、顺铂、干扰素α-2a重组体、紫杉醇、替尼泊苷和链脲佐菌素(streptozoci))、细胞毒性烷化剂(例如,白消安、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、美法仑、或乙基磺酸)、烷化剂(例如,亮氨酸溶肉瘤素、AZQ、BCNU、白消安、双硫丹(bisulphan)、羧基邻苯二甲酰基铂(carboxyphthalatoplatinum)、CBDCA、CCNU、CHIP、苯丁酸氮芥、氯脲菌素、顺铂、氯乙矾、氰基吗啉代多柔比星、甲基二磺酸乙二醇酯(cyclodisone)、环磷酰胺、环氧乳醇、氟多潘、西磺非(hepsulfam)、海恩酮、异环磷酰胺(iphosphamide)、美法仑、甲基CCNU、丝裂霉素C、米托唑胺、氮芥、PCNU、哌嗪、哌嗪双酮、哌泊溴烷、泊菲霉素、螺莫司汀(spirohydantoinmustard)、链脲霉素、替罗昔隆、四铂、硫替派、三乙撑密胺、尿嘧啶氮芥和Yoshi-864)、抗有丝分裂剂(例如,别秋水仙碱、软海绵素(Halichondrin M)、秋水仙碱、秋水仙碱衍生物、多拉司他汀10、美坦辛、根霉素、紫杉醇衍生物、紫杉醇、硫代秋水仙碱、三苯甲基半胱氨酸、硫酸长春碱和硫酸长春新碱)、植物生物碱(例如,放线菌素D、博来霉素、L-天冬酰胺酶、伊达比星、硫酸长春碱、硫酸长春新碱、光辉霉素、丝裂霉素、柔红霉素、VP-16-213、VM-26、诺维本和泰索帝)、生物制品(例如,α干扰素、BCG、G-CSF、GM-CSF和白介素-2)、拓扑异构酶I抑制剂(例如,喜树碱、喜树碱衍生物和吗啉代多柔比星)、拓扑异构酶II抑制剂(例如,米托蒽醌、氨萘非特、m-AMSA、蒽吡唑衍生物、吡唑并吖啶(pyrazoloacridine)、盐酸比生群、柔红霉素、脱氧多柔比星、美诺立尔、N,N-二苄基柔红霉素、奥散拉唑(oxanthrazole)、柔红霉素苯腙、VM-26和VP-16)以及合成剂(例如,羟基脲、丙卡巴肼、o,p'-DDD、达卡巴嗪、CCNU、BCNU、顺二氯化二氨亚铂(cis-diamminedichloroplatimun)、米托蒽醌、CBDCA、左旋咪唑、六甲嘧胺、全反式维甲酸、卡氮芥糯米纸胶囊剂(gliadel)和卟吩姆钠)。

抗增殖剂是减少细胞增殖的化合物。抗增殖剂包括烷化剂、抗代谢药、酶、生物反应调节剂、各种药剂、激素和拮抗剂、雄激素抑制剂(例如,氟他胺和醋酸亮丙瑞林)、抗雌激素药(例如,枸橼酸他莫昔芬及其类似物、托瑞米芬、屈洛昔芬和罗洛昔芬(roloxifene))。具体抗增殖剂的另外的实例包括但不限于左旋咪唑、硝酸镓、格拉司琼、沙格司亭锶-89氯化物、菲格司汀(filgrastim)、匹鲁卡品、右丙氧嗪和昂丹司琼。

在另外的实施方式中,结合(例如,在其之前、同时或之后)骨髓移植、使用化疗药剂(诸如氟达拉滨)、外束放射疗法(XRT)、环磷酰胺或抗体(诸如OKT3或CAMPATH)的T细胞消融疗法,将本发明的组合物施用至患者。在另一个实施方式中,在B细胞消融疗法(诸如与CD20反应的药剂(例如,Rituxan))后施用本发明的组合物。例如,在一个实施方式中,受试者可以经历用高剂量化疗的标准治疗,随后进行外周血干细胞移植。在某些实施方式中,在移植后,受试者接受本发明的扩增的免疫细胞的输注。在另外的实施方式中,在手术之前或之后施用扩增的细胞。

在某些实施方式中,在肿瘤或患病组织的外科切除或减瘤期间施用本发明的组合物。例如,在经历患病组织或肿瘤的外科治疗的受试者中,可以将组合物施用到该部位以便进一步治疗肿瘤。

预期施用本发明组合物和药物组合物的受试者包括但不限于人类和其它灵长类动物,哺乳动物包括商业相关哺乳动物,诸如非人灵长类动物、牛、猪、马、羊、猫和狗。

待向患者施用的上述治疗的剂量将随着所治疗病症的确切性质和治疗的接受者而变化。用于人类施用的剂量的缩放可以根据本领域接受的实践进行。已经讨论了T细胞给药和时间安排的策略(Ertl等人,2011,Cancer Res,71:3175-81;Junghans,2010,Journalof Translational Medicine,8:55)。

试剂盒

本发明还包括试剂盒,所述试剂盒包含组合物和描述组合物的使用的指导材料,所述组合物包含本发明的mRAS肽、编码mRAS肽的核酸分子、包含或表达mRAS肽的细胞、包含TCR的多肽、编码TCR的核酸分子、表达TCR的细胞或其组合。例如,在一些实施方式中,所述指导材料描述了将组合物或其组合作为本文别处所述的治疗性治疗或非治疗用途施用至个体。在一个实施方式中,该试剂盒还包含适合于例如在向个体施用组合物之前溶解或悬浮本发明的治疗组合物的(任选地无菌的)药学上可接受的载体。任选地,所述试剂盒包含用于施用组合物的施药器。在某些实施方式中,所述试剂盒包含用于鉴定受试者的HLA类型的试剂。在某些实施方式中,所述试剂盒包含用于鉴定受试者中RAS突变(例如在位置G12的突变)的试剂。

实验实施例

现在参考以下实施例描述本发明。提供这些实施例仅仅是处于说明的目的,并且本发明决不应被解释为限于这些实施例,而是应被解释为涵盖由于本文提供的教导而变得明显的任何和所有变化。

没有进一步的描述,据信本领域普通技术人员可以使用前面的描述和下面的说明性实施例来制备和利用本发明的化合物并实施所要求保护的方法。以下工作实施例因此且不应被解释为以任何方式限制本公开的其余部分。

实施例1:mRAS新抗原的鉴定

如本文所述,进行了各种计算和蛋白质组学研究来鉴定mRAS新抗原及其与HLA类型的相互作用。图1是描绘突变型RAS表位的发现策略的示意图,其中使用计算机模型预测mRAS肽对MHC的亲和力,随后进行实验以测量相互作用的亲和力/稳定性并通过质谱检测肽。

进行了一项计算机研究以利用antigen.garnish软件预测mRAS新抗原,所述软件分析人或鼠的DNA错义突变、插入、缺失和融合且并使用7种有效算法通过计算的方式预测新表位。所述模型通过MHC I/II结合亲和力输出新表位。例如,如图2所示,所述模型用于预测含有与RAS中的G12对应的位置处的突变的9-10聚体新表位。

如图3以及图4A和图4B所示,所述模型预测了mRAS新抗原与不同的HLA I类等位基因的结合。图4B中的表格总结了预测与特定HLA类型结合的mRAS短肽。

还进行了实验来检查肽-MHC结合。图5显示了荧光偏振测定,其利用了感兴趣的肽的竞争性结合。所述测定用于测量各种mRAS肽序列对感兴趣的HLA I类等位基因的亲和力,总结在图5的表格中。图6A显示了在荧光偏振测定中证明肽结合的额外数据。还进行了通过闪烁迫近测定研究肽稳定性的实验。图6A和图6B中所描绘的突变型RAS肽的符号如下:对于A*02:01小图,C-10=KLV_C;D-10=KLV_D;R-10=KLV_R;和V-10=KLV_V。对于A*03:01和A*11:01小图,C-9=VV_C;C-10=VVV_C;D-9=VV_D;D-10=VVV_D;R-9=VV_R;R-10=VVV_R;V-9=VV_V;V-10=VVV_V。对于B*07:02小图,C-10=GA_C;D-10=GA_D;R-10=GA_R;V-10=GA_V。

使用质谱进行额外的抗原加工和呈递研究。首先,建立单等位基因K562细胞系来表达特定的HLA类型(图7A)。此外,产生了表达各种wt RAS和mRAS肽的慢病毒构建体(图7E)。然后建立了表达特定HLA类型和各种RAS和mRAS肽的单等位基因细胞系。通过FACS验证RAS TMG细胞系的HLA I类表达和HLA特异性表达(图7C和图7D)。

图8A-图8J显示了关于各种HLA分子与突变型肽结合的结果。通过质谱检测到的突变型RAS表位汇总如图9所示。有趣的是,发现对于HLA-A*03:01和HLA-A*11-01存在冗余表位。此外,为HLA-B*07:02鉴定了新的表位。

图10呈现了在计算机预测研究(左)和肽-MHC结合研究(右)期间鉴定的新抗原的比较。

总之,本文所呈现的实验表明,高度普遍的MHC I类等位基因HLA-A2亚型、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01和HLA-B*07:02被预测与mRAS新表位结合。此外,发现mRAS新表位对下列HLA:肽对具有高结合亲和力:HLA-A*02:01:G12V(KLVVVGAVGV(SEQ ID NO:4));HLA-A*03:01:G12V(VVVGAVGVGK(SEQ ID NO:12)和VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11))和G12R(VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10));HLA-A*11:01:G12C(VVVGACGVGK(SEQ ID NO:6)和VVGACGVGK(SEQ ID NO:5))、G12D(VVVGADGVGK(SEQ ID NO:8)和VVGADGVGK(SEQ ID NO:7)、G12R(VVVGARGVGK(SEQ ID NO:10)和VVGARGVGK(SEQ ID NO:9))和G12V(VVVGAVGVGK(SEQID NO:12)和VVGAVGVGK(SEQ ID NO:11));HLA-B*07:02:G12R(GARGVGKSAL(SEQ ID NO:15))。此外,蛋白质组学研究证实了预测表位的抗原加工/呈递,并鉴定了新的表位:HLA-B*07:02:G12D(GADGVGKSAL(SEQ ID NO:14))。

实施例2:评估mRAS的免疫原性

如本文所述,进行实验以评估mRAS肽-MHC识别的免疫原性。如图11所示,从选择了HLA类型(HLA-A02、HLA-A03、HLA-A11和HLA-B07)的正常供体中分离并刺激PMBC。进行了使用IFN-γELISPOT测定的实验来评估CD8+ T细胞反应。mRAS CTL反应的汇总如图12以及图13A-图13F所示。

在T细胞培养物上进行了使用pMHC多聚体染色的额外实验,以鉴定mRAS特异性T细胞(图14)。实验还表明,mRAS T细胞反应具有高度特异性(图15)。使用各种剂量的B7-G12R的实验被用来证明观察到的反应具有高亲和力(图16)。

还进行了实验来检查B7-G12R CTL反应是否可以杀死G12R+PDA细胞系。如图17所示,被修饰以表达HLA-B*07:02的PSN1细胞能够通过B7-G12R CTL被杀死。

总之,目前的实验证明,mRAS新抗原特异性T细胞反应可以在正常供体中产生。对于以下各项观察到T细胞反应:HLA-A*02:06:G12V;HLA-A*11:01:G12C、G12D、G12V;以及HLA-B*07:02:G12R。此外,mRAS特异性T细胞可以通过pMHC多聚体染色来检测和纯化。还观察到,mRAS T细胞对靶突变具有高度特异性,并且没有表现出对野生型抗原的反应性。最后,外包的mRAS特异性T细胞可以具有足够的亲和力来靶向内源性突变的肿瘤细胞系。

实施例3:mRAS特异性TCR疗法的开发

如本文所述,进行实验以设计靶向针对在特定HLA类型的背景下的特定mRAS肽的TCR疗法。

如图18所示,分选、扩增观察到与A11-G12V和B7-G12R mRAS肽-HLA类型复合物结合的T细胞,并对其进行TCRα/β测序。两个不同的CD8+ T细胞克隆被鉴定为HLA-A*11:01限制性G12V特异性T细胞:(1)观察到TRAV39/TRBV20-1和TRAV12-1/TRBV28。

基于测序,设计了称为TCR831和TCR833的慢病毒构建体(图19)。TCR831包含TRAV39和TRBV20-1,而TCR833包含TRAV12-1和TRBV28。两种构建体都包含T2A接头结构域和EF1α启动子。类似地,设计了另外的构建体,称为TCR896、TCR897、TCR847和TCR864,如图20所汇总。图20还列出了所有设计的TCR构建体的RAS突变敏感性、HLA限制性、α链和β链的同一性以及相关的CDR3。

在原代CD8+ T细胞中评估了TCR831和TCR833的表达(图21)。使用IFN-γELISPOT测定和使用各种剂量的K562-A11+G12V检查了TCR831和TCR833的亲和力。如图22所示,TCR831和TCR833显示了在HLA-A*11:01的背景下对mRAS G12V的高亲和力。

此外,使用IFN-γELISPOT的额外实验证明,转基因TCR831和TCR833构建体识别内源性抗原(图22),其中在A11的情况下观察到反应,而A3则没有。转基因TCR831和TCR833构建体的特异性及其识别内源性抗原的能力也显示在图23中,其中在G12V而不是野生型RAS的存在下观察到CTL反应。

还进行了实验来检查TCR831和TCR833对G12V+PDA细胞系的反应性。将含有KRASG12V突变的PDA细胞系Panc03.21用编码HLA-A*11:01分子的慢病毒构建体进行了修饰(图24)。

图25A-图25G显示了TCR831构建体的进一步特征。图25A显示了通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色对TCR831表达的验证。进行实验以通过Jurkat报告细胞检查TCR831的亲合力(图25B)。还进行了实验以通过Jurkat报告测定评估TCR831对替代性突变型RAS表位的特异性和交叉反应性。TCR831表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VVV_C)的交叉反应性。图24D描绘了在与A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR激活。图25E描绘了TCR831在原代CD8+ T细胞上的表达。还使用4小时51Cr测定进行实验,其表明用G12V肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*11:01细胞的特异性裂解。此外,4小时51Cr测定结果表明,在10:1的效应子与靶标比率下A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解(图25G)。细胞系颜色对应于图25D。

还进行了实验来进一步表征TCR833的表达和功能。图26A显示了通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色对TCR833表达的验证。图26B描绘了通过Jurkat报告细胞评估TCR833总亲和力的实验结果。还进行了实验以通过Jurkat报告测定评估TCR833对替代性突变型RAS表位的特异性和交叉反应性。如图26C所示,TCR833表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VVV_C)的交叉反应性。图26D描绘了在与A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR833激活。TCR833在原代CD8+ T细胞上的表达如图26E所示。使用4小时51Cr测定进行实验,其表明用G12V肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*11:01细胞的特异性裂解(图26F)。图26G描绘了来自4小时51Cr测定的结果,其表明A*11:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解。

进行进一步的实验来表征TCR897的表达和功能。如图27A所示,通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证了TCR897表达。图27B描绘了通过Jurkat报告细胞评估TCR897总亲和力的实验结果。进行了实验以通过Jurkat报告测定评估TCR897对替代性突变型RAS表位的特异性和交叉反应性。如图27C所示,TCR897表现出对RAS G12V(VV_V)有特异性,但对野生型无特异性。观察到与RAS G12C(VV_C)和G12D(VV_D)表位的交叉反应性。

进行进一步的实验来表征TCR896的表达和功能。如图28A所示,通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证了TCR896表达。图28B描绘了通过Jurkat报告细胞评估TCR896总亲和力的实验结果。进行了实验以通过Jurkat报告测定评估TCR对替代性突变型RAS表位的特异性和交叉反应性。如图28C所示,TCR896表现出对RAS G12V(VVV_V)有特异性,但对野生型或可替代地突变型RAS表位无特异性。图28D描绘了在与A*03:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系共培养后Jurkat报告细胞的TCR激活。TCR896在原代CD8+ T细胞上的表达如图28E所示。使用4小时51Cr测定进行实验,其表明,用G12V肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-A*03:01细胞的特异性裂解(图28F)。图28G描绘了4小时51Cr测定的结果,其表明A*03:01阳性RAS G12V肿瘤细胞系的特异性裂解。

进行进一步的实验来表征TCR847的表达和功能。如图29A所示,通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证了TCR847表达。图29B描绘了通过Jurkat报告测定评估TCR特异性和对替代性突变型RAS表位的交叉反应性。TCR847表现出对RAS G12R(GA_R)有特异性,但对野生型或可替代地突变型RAS表位无特异性。

进行进一步的实验来表征TCR864的表达和功能。如图30A所示,通过慢病毒转导的Jurkat报告细胞的肽-MHC多聚体染色验证了TCR864表达。图30B描绘了通过Jurkat报告细胞评估TCR864总亲和力的实验结果。进行了实验以通过Jurkat报告测定检查TCR864对替代性突变型RAS表位的特异性和交叉反应性。如图30C所示,TCR864表现出对RAS G12R(GA_R)有特异性,但对野生型或可替代地突变型RAS表位无特异性。TCR864在原代CD8+ T细胞上的表达如图30D所描绘。图30E描绘了使用4小时51Cr测定的实验结果,其表明用G12R肽脉冲(蓝色)或者表达RAS TMG构建体(红色)但不表达野生型(黑色)的K562-B*07:02细胞的特异性裂解。

总之,本文呈现的实验证明,在正常供体中可以鉴定出mRAS特异性TCR序列。此外,mRAS特异性TCR可以在原代CD8+ T细胞上转基因表达。实验还证明,转基因mRAS特异性TCR表现出高亲和力和特异性。

实施例4:针对mRAS短肽的DC疫苗

如本文所述,使用接种疫苗的PDA患者进行实验。进行实验以评估mDC3/8-RAS疫苗的安全性/耐受性,检查对mDC3/8-RAS疫苗接种的RAS特异性免疫应答,并鉴定HLA特异性抗RAS TCR序列(图31)。如果出现以下情况将患者纳入研究:(1)患者为I-III期PDA,采取NEDs/p手术+/-新辅助或辅助化疗和/或放疗;(2)病理证实的RAS G12C、RAS G12D、RAS G12R或RAS G12V突变;以及(3)被鉴定为HLA-A*02:01、HLA-A*03:01、HLA-A*11:01、HLA-B*07:02和/或HLA-C*08:02。这些研究可以用于进一步鉴定mRAS TCR以开发另外的过继细胞疗法(图32)。

本文引用的每个和每篇专利、专利申请和出版物的公开内容通过引用以其整体并入本文。

虽然已经参考特定实施方式公开了本发明,但是很明显,在不背离本发明的真实精神和范围的情况下,本领域的其他技术人员可以设计出本发明的其它实施方式和变化。所附权利要求旨在被解释为包括所有此类实施方式和等价变化。

序列表

<110> 宾夕法尼亚大学理事会(The Trustees of the University ofPennsylvania)

阿达姆·贝尔(Bear, Adham)

鲍勃·冯德海德(Vonderheide, Bob)

杰拉尔德·里内特(Linette, Gerald)

比阿特丽斯·卡雷诺(Carreno, Beatriz)

<120> 用于靶向突变型RAS的组合物和方法

<130> 046483-6175-00WO

<150> 62/796,733

<151> 2019-01-25

<160> 203

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> KLV_C

<400> 1

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Cys Gly Val

1 5 10

<210> 2

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> KLV_D

<400> 2

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val

1 5 10

<210> 3

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> KLV_R

<400> 3

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Arg Gly Val

1 5 10

<210> 4

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> KLV_V

<400> 4

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Val Gly Val

1 5 10

<210> 5

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VV_C

<400> 5

Val Val Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys

1 5

<210> 6

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VVV_C

<400> 6

Val Val Val Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 7

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VV_D

<400> 7

Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys

1 5

<210> 8

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VVV_D

<400> 8

Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 9

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VV_R

<400> 9

Val Val Gly Ala Arg Gly Val Gly Lys

1 5

<210> 10

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VVV_R

<400> 10

Val Val Val Gly Ala Arg Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 11

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VV_V

<400> 11

Val Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys

1 5

<210> 12

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VVV_V

<400> 12

Val Val Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 13

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> GA_C

<400> 13

Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 14

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> GA_D

<400> 14

Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 15

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> GA_R

<400> 15

Gly Ala Arg Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 16

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> GA_V

<400> 16

Gly Ala Val Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 17

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR1

<400> 17

Ser Thr Thr Ser Asp Arg Leu

1 5

<210> 18

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR2

<400> 18

Val Leu Leu Ser Asn Gly Ala Val Lys

1 5

<210> 19

<211> 14

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR3

<400> 19

Cys Ala Val Asp Lys Asp Gly Gly Tyr Gln Lys Val Thr Phe

1 5 10

<210> 20

<211> 112

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39可变结构域

<400> 20

Glu Leu Lys Val Glu Gln Asn Pro Leu Phe Leu Ser Met Gln Glu Gly

1 5 10 15

Lys Asn Tyr Thr Ile Tyr Cys Asn Tyr Ser Thr Thr Ser Asp Arg Leu

20 25 30

Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Lys Ser Leu Glu Ser Leu Phe Val

35 40 45

Leu Leu Ser Asn Gly Ala Val Lys Gln Glu Gly Arg Leu Met Ala Ser

50 55 60

Leu Asp Thr Lys Ala Arg Leu Ser Thr Leu His Ile Thr Ala Ala Val

65 70 75 80

His Asp Leu Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Val Asp Lys Asp Gly Gly

85 90 95

Tyr Gln Lys Val Thr Phe Gly Thr Gly Thr Lys Leu Gln Val Ile Pro

100 105 110

<210> 21

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 α恒定结构域

<400> 21

Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser

1 5 10 15

Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

20 25 30

Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val

35 40 45

Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp

50 55 60

Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile

65 70 75 80

Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val

85 90 95

Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln

100 105 110

Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly

115 120 125

Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

130 135 140

<210> 22

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 α链

<400> 22

Met Lys Lys Leu Leu Ala Met Ile Leu Trp Leu Gln Leu Asp Arg Leu

1 5 10 15

Ser Gly Glu Leu Lys Val Glu Gln Asn Pro Leu Phe Leu Ser Met Gln

20 25 30

Glu Gly Lys Asn Tyr Thr Ile Tyr Cys Asn Tyr Ser Thr Thr Ser Asp

35 40 45

Arg Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Lys Ser Leu Glu Ser Leu

50 55 60

Phe Val Leu Leu Ser Asn Gly Ala Val Lys Gln Glu Gly Arg Leu Met

65 70 75 80

Ala Ser Leu Asp Thr Lys Ala Arg Leu Ser Thr Leu His Ile Thr Ala

85 90 95

Ala Val His Asp Leu Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Val Asp Lys Asp

100 105 110

Gly Gly Tyr Gln Lys Val Thr Phe Gly Thr Gly Thr Lys Leu Gln Val

115 120 125

Ile Pro Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

145 150 155 160

Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

165 170 175

Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

260 265 270

<210> 23

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1 CDR1

<400> 23

Leu Asp Phe Gln Ala Thr Thr Met

1 5

<210> 24

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1 CDR2

<400> 24

Thr Ser Asn Glu Gly Ser Lys Ala Thr

1 5

<210> 25

<211> 19

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1CDR3

<400> 25

Cys Ser Ala Ser Pro Arg Ala Gly Gln Leu Ser Ser Tyr Asn Ser Pro

1 5 10 15

Leu His Phe

<210> 26

<211> 120

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1可变区

<400> 26

Gly Ala Val Val Ser Gln His Pro Ser Trp Val Ile Cys Lys Ser Gly

1 5 10 15

Thr Ser Val Lys Ile Glu Cys Arg Ser Leu Asp Phe Gln Ala Thr Thr

20 25 30

Met Phe Trp Tyr Arg Gln Phe Pro Lys Gln Ser Leu Met Leu Met Ala

35 40 45

Thr Ser Asn Glu Gly Ser Lys Ala Thr Tyr Glu Gln Gly Val Glu Lys

50 55 60

Asp Lys Phe Leu Ile Asn His Ala Ser Leu Thr Leu Ser Thr Leu Thr

65 70 75 80

Val Thr Ser Ala His Pro Glu Asp Ser Ser Phe Tyr Ile Cys Ser Ala

85 90 95

Ser Pro Arg Ala Gly Gln Leu Ser Ser Tyr Asn Ser Pro Leu His Phe

100 105 110

Gly Asn Gly Thr Arg Leu Thr Val

115 120

<210> 27

<211> 177

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 β恒定结构域

<400> 27

Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

1 5 10 15

Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu

20 25 30

Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn

35 40 45

Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys

50 55 60

Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu

65 70 75 80

Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys

85 90 95

Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp

100 105 110

Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg

115 120 125

Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser

130 135 140

Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala

145 150 155 160

Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

165 170 175

Phe

<210> 28

<211> 323

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 β链

<400> 28

Met Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gly Pro Gly Ile Ser Leu Leu Leu

1 5 10 15

Pro Gly Ser Leu Ala Gly Ser Gly Leu Gly Ala Val Val Ser Gln His

20 25 30

Pro Ser Trp Val Ile Cys Lys Ser Gly Thr Ser Val Lys Ile Glu Cys

35 40 45

Arg Ser Leu Asp Phe Gln Ala Thr Thr Met Phe Trp Tyr Arg Gln Phe

50 55 60

Pro Lys Gln Ser Leu Met Leu Met Ala Thr Ser Asn Glu Gly Ser Lys

65 70 75 80

Ala Thr Tyr Glu Gln Gly Val Glu Lys Asp Lys Phe Leu Ile Asn His

85 90 95

Ala Ser Leu Thr Leu Ser Thr Leu Thr Val Thr Ser Ala His Pro Glu

100 105 110

Asp Ser Ser Phe Tyr Ile Cys Ser Ala Ser Pro Arg Ala Gly Gln Leu

115 120 125

Ser Ser Tyr Asn Ser Pro Leu His Phe Gly Asn Gly Thr Arg Leu Thr

130 135 140

Val Thr Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe

145 150 155 160

Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val

165 170 175

Cys Leu Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp

180 185 190

Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro

195 200 205

Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser

210 215 220

Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe

225 230 235 240

Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr

245 250 255

Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp

260 265 270

Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly Val

275 280 285

Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu

290 295 300

Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg

305 310 315 320

Lys Asp Phe

<210> 29

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 29

Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

1 5 10 15

Glu Asn Pro Gly Pro

20

<210> 30

<211> 615

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831融合

<400> 30

Met Lys Lys Leu Leu Ala Met Ile Leu Trp Leu Gln Leu Asp Arg Leu

1 5 10 15

Ser Gly Glu Leu Lys Val Glu Gln Asn Pro Leu Phe Leu Ser Met Gln

20 25 30

Glu Gly Lys Asn Tyr Thr Ile Tyr Cys Asn Tyr Ser Thr Thr Ser Asp

35 40 45

Arg Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Lys Ser Leu Glu Ser Leu

50 55 60

Phe Val Leu Leu Ser Asn Gly Ala Val Lys Gln Glu Gly Arg Leu Met

65 70 75 80

Ala Ser Leu Asp Thr Lys Ala Arg Leu Ser Thr Leu His Ile Thr Ala

85 90 95

Ala Val His Asp Leu Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Val Asp Lys Asp

100 105 110

Gly Gly Tyr Gln Lys Val Thr Phe Gly Thr Gly Thr Lys Leu Gln Val

115 120 125

Ile Pro Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

145 150 155 160

Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

165 170 175

Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Gly

260 265 270

Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu

275 280 285

Asn Pro Gly Pro Met Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gly Pro Gly Ile

290 295 300

Ser Leu Leu Leu Pro Gly Ser Leu Ala Gly Ser Gly Leu Gly Ala Val

305 310 315 320

Val Ser Gln His Pro Ser Trp Val Ile Cys Lys Ser Gly Thr Ser Val

325 330 335

Lys Ile Glu Cys Arg Ser Leu Asp Phe Gln Ala Thr Thr Met Phe Trp

340 345 350

Tyr Arg Gln Phe Pro Lys Gln Ser Leu Met Leu Met Ala Thr Ser Asn

355 360 365

Glu Gly Ser Lys Ala Thr Tyr Glu Gln Gly Val Glu Lys Asp Lys Phe

370 375 380

Leu Ile Asn His Ala Ser Leu Thr Leu Ser Thr Leu Thr Val Thr Ser

385 390 395 400

Ala His Pro Glu Asp Ser Ser Phe Tyr Ile Cys Ser Ala Ser Pro Arg

405 410 415

Ala Gly Gln Leu Ser Ser Tyr Asn Ser Pro Leu His Phe Gly Asn Gly

420 425 430

Thr Arg Leu Thr Val Thr Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu

435 440 445

Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys

450 455 460

Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu

465 470 475 480

Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr

485 490 495

Asp Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr

500 505 510

Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro

515 520 525

Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn

530 535 540

Asp Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser

545 550 555 560

Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr

565 570 575

Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly

580 585 590

Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala

595 600 605

Met Val Lys Arg Lys Asp Phe

610 615

<210> 31

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR1

<400> 31

Ser Asn Ser Ala Ser Gln Ser Phe

1 5

<210> 32

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR2

<400> 32

Ser Val Tyr Ser Ser Gly Asn Glu

1 5

<210> 33

<211> 15

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR3

<400> 33

Cys Ala Val Asn Pro Pro Asp Thr Gly Phe Gln Lys Leu Val Phe

1 5 10 15

<210> 34

<211> 112

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1可变结构域

<400> 34

Arg Lys Glu Val Glu Gln Asp Pro Gly Pro Phe Asn Val Pro Glu Gly

1 5 10 15

Ala Thr Val Ala Phe Asn Cys Thr Tyr Ser Asn Ser Ala Ser Gln Ser

20 25 30

Phe Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Cys Arg Lys Glu Pro Lys Leu Leu Met

35 40 45

Ser Val Tyr Ser Ser Gly Asn Glu Asp Gly Arg Phe Thr Ala Gln Leu

50 55 60

Asn Arg Ala Ser Gln Tyr Ile Ser Leu Leu Ile Arg Asp Ser Lys Leu

65 70 75 80

Ser Asp Ser Ala Thr Tyr Leu Cys Ala Val Asn Pro Pro Asp Thr Gly

85 90 95

Phe Gln Lys Leu Val Phe Gly Thr Gly Thr Arg Leu Leu Val Ser Pro

100 105 110

<210> 35

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 α恒定结构域

<400> 35

Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser

1 5 10 15

Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

20 25 30

Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val

35 40 45

Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp

50 55 60

Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile

65 70 75 80

Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val

85 90 95

Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln

100 105 110

Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly

115 120 125

Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

130 135 140

<210> 36

<211> 274

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 α链

<400> 36

Met Ile Ser Leu Arg Val Leu Leu Val Ile Leu Trp Leu Gln Leu Ser

1 5 10 15

Trp Val Trp Ser Gln Arg Lys Glu Val Glu Gln Asp Pro Gly Pro Phe

20 25 30

Asn Val Pro Glu Gly Ala Thr Val Ala Phe Asn Cys Thr Tyr Ser Asn

35 40 45

Ser Ala Ser Gln Ser Phe Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Cys Arg Lys Glu

50 55 60

Pro Lys Leu Leu Met Ser Val Tyr Ser Ser Gly Asn Glu Asp Gly Arg

65 70 75 80

Phe Thr Ala Gln Leu Asn Arg Ala Ser Gln Tyr Ile Ser Leu Leu Ile

85 90 95

Arg Asp Ser Lys Leu Ser Asp Ser Ala Thr Tyr Leu Cys Ala Val Asn

100 105 110

Pro Pro Asp Thr Gly Phe Gln Lys Leu Val Phe Gly Thr Gly Thr Arg

115 120 125

Leu Leu Val Ser Pro Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln

130 135 140

Leu Arg Asp Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp

145 150 155 160

Phe Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr

165 170 175

Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser

180 185 190

Asn Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn

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210 215 220

Glu Ser Ser Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp

225 230 235 240

Thr Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu

245 250 255

Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp

260 265 270

Ser Ser

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<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR1

<400> 37

Asp Met Asp His Glu Asn Met

1 5

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR2

<400> 38

Phe Ser Tyr Asp Val Lys Met Glu

1 5

<210> 39

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR3

<400> 39

Cys Ala Ser Ser Leu Ser Phe Arg Gln Gly Leu Arg Glu Gln Tyr Phe

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<210> 40

<211> 134

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28可变结构域

<400> 40

Met Gly Ile Arg Leu Leu Cys Arg Val Ala Phe Cys Phe Leu Ala Val

1 5 10 15

Gly Leu Val Asp Val Lys Val Thr Gln Ser Ser Arg Tyr Leu Val Lys

20 25 30

Arg Thr Gly Glu Lys Val Phe Leu Glu Cys Val Gln Asp Met Asp His

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Glu Asn Met Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu

50 55 60

Ile Tyr Phe Ser Tyr Asp Val Lys Met Lys Glu Lys Gly Asp Ile Pro

65 70 75 80

Glu Gly Tyr Ser Val Ser Arg Glu Lys Lys Glu Arg Phe Ser Leu Ile

85 90 95

Leu Glu Ser Ala Ser Thr Asn Gln Thr Ser Met Tyr Leu Cys Ala Ser

100 105 110

Ser Leu Ser Phe Arg Gln Gly Leu Arg Glu Gln Tyr Phe Gly Pro Gly

115 120 125

Thr Arg Leu Thr Val Thr

130

<210> 41

<211> 179

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 β恒定结构域

<400> 41

Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

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Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu

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Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys

50 55 60

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65 70 75 80

Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys

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Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp

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115 120 125

Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser

130 135 140

Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala

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Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

165 170 175

Ser Arg Gly

<210> 42

<211> 313

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 β链

<400> 42

Met Gly Ile Arg Leu Leu Cys Arg Val Ala Phe Cys Phe Leu Ala Val

1 5 10 15

Gly Leu Val Asp Val Lys Val Thr Gln Ser Ser Arg Tyr Leu Val Lys

20 25 30

Arg Thr Gly Glu Lys Val Phe Leu Glu Cys Val Gln Asp Met Asp His

35 40 45

Glu Asn Met Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Leu Gly Leu Arg Leu

50 55 60

Ile Tyr Phe Ser Tyr Asp Val Lys Met Lys Glu Lys Gly Asp Ile Pro

65 70 75 80

Glu Gly Tyr Ser Val Ser Arg Glu Lys Lys Glu Arg Phe Ser Leu Ile

85 90 95

Leu Glu Ser Ala Ser Thr Asn Gln Thr Ser Met Tyr Leu Cys Ala Ser

100 105 110

Ser Leu Ser Phe Arg Gln Gly Leu Arg Glu Gln Tyr Phe Gly Pro Gly

115 120 125

Thr Arg Leu Thr Val Thr Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu

130 135 140

Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys

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Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu

165 170 175

Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr

180 185 190

Asp Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr

195 200 205

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210 215 220

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225 230 235 240

Asp Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser

245 250 255

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260 265 270

Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly

275 280 285

Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala

290 295 300

Met Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

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<210> 43

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

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Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

1 5 10 15

Glu Asn Pro Gly Pro

20

<210> 44

<211> 608

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833融合

<400> 44

Met Ile Ser Leu Arg Val Leu Leu Val Ile Leu Trp Leu Gln Leu Ser

1 5 10 15

Trp Val Trp Ser Gln Arg Lys Glu Val Glu Gln Asp Pro Gly Pro Phe

20 25 30

Asn Val Pro Glu Gly Ala Thr Val Ala Phe Asn Cys Thr Tyr Ser Asn

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Ser Ala Ser Gln Ser Phe Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Cys Arg Lys Glu

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Pro Lys Leu Leu Met Ser Val Tyr Ser Ser Gly Asn Glu Asp Gly Arg

65 70 75 80

Phe Thr Ala Gln Leu Asn Arg Ala Ser Gln Tyr Ile Ser Leu Leu Ile

85 90 95

Arg Asp Ser Lys Leu Ser Asp Ser Ala Thr Tyr Leu Cys Ala Val Asn

100 105 110

Pro Pro Asp Thr Gly Phe Gln Lys Leu Val Phe Gly Thr Gly Thr Arg

115 120 125

Leu Leu Val Ser Pro Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln

130 135 140

Leu Arg Asp Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp

145 150 155 160

Phe Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr

165 170 175

Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser

180 185 190

Asn Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn

195 200 205

Ala Phe Asn Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro

210 215 220

Glu Ser Ser Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp

225 230 235 240

Thr Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu

245 250 255

Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp

260 265 270

Ser Ser Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp

275 280 285

Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Gly Ile Arg Leu Leu Cys Arg Val

290 295 300

Ala Phe Cys Phe Leu Ala Val Gly Leu Val Asp Val Lys Val Thr Gln

305 310 315 320

Ser Ser Arg Tyr Leu Val Lys Arg Thr Gly Glu Lys Val Phe Leu Glu

325 330 335

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370 375 380

Lys Glu Arg Phe Ser Leu Ile Leu Glu Ser Ala Ser Thr Asn Gln Thr

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Ser Met Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ser Phe Arg Gln Gly Leu Arg

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Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala

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Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro

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Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln

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Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys

530 535 540

Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys

545 550 555 560

Gly Phe Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile

565 570 575

Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val

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Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

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<210> 45

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR1

<400> 45

Lys Thr Ser Ile Asn Asn Leu

1 5

<210> 46

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR2

<400> 46

Leu Ile Arg Ser Asn Glu Arg Glu Lys

1 5

<210> 47

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR3

<400> 47

Cys Ala Thr Asp Pro Gly Gly Phe Lys Thr Ile Phe

1 5 10

<210> 48

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 α恒定结构域

<400> 48

Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser

1 5 10 15

Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

20 25 30

Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val

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Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp

50 55 60

Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile

65 70 75 80

Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val

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Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly

115 120 125

Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

130 135 140

<210> 49

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 α链

<400> 49

Met Glu Thr Leu Leu Gly Val Ser Leu Val Ile Leu Trp Leu Gln Leu

1 5 10 15

Ala Arg Val Asn Ser Gln Gln Gly Glu Glu Asp Pro Gln Ala Leu Ser

20 25 30

Ile Gln Glu Gly Glu Asn Ala Thr Met Asn Cys Ser Tyr Lys Thr Ser

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Ile Asn Asn Leu Gln Trp Tyr Arg Gln Asn Ser Gly Arg Gly Leu Val

50 55 60

His Leu Ile Leu Ile Arg Ser Asn Glu Arg Glu Lys His Ser Gly Arg

65 70 75 80

Leu Arg Val Thr Leu Asp Thr Ser Lys Lys Ser Ser Ser Leu Leu Ile

85 90 95

Thr Ala Ser Arg Ala Ala Asp Thr Ala Ser Tyr Phe Cys Ala Thr Asp

100 105 110

Pro Gly Gly Phe Lys Thr Ile Phe Gly Ala Gly Thr Arg Leu Phe Val

115 120 125

Lys Ala Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

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Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

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Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

260 265 270

<210> 50

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR1

<400> 50

Ile Ser Gly His Ala Thr Leu

1 5

<210> 51

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR2

<400> 51

Gln Phe Gln Asn Asn Gly Val Val

1 5

<210> 52

<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR3

<400> 52

Cys Ala Ser Ser Leu Tyr Gly Gly Ser Ile Ser Tyr Glu Gln Tyr Phe

1 5 10 15

<210> 53

<211> 179

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 β恒定结构域

<400> 53

Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

1 5 10 15

Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu

20 25 30

Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn

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Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys

50 55 60

Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu

65 70 75 80

Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys

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Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp

100 105 110

Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg

115 120 125

Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser

130 135 140

Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala

145 150 155 160

Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

165 170 175

Ser Arg Gly

<210> 54

<211> 314

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 β链

<400> 54

Met Gly Thr Arg Leu Leu Cys Trp Ala Ala Leu Cys Leu Leu Gly Ala

1 5 10 15

Glu Leu Thr Glu Ala Gly Val Ala Gln Ser Pro Arg Tyr Lys Ile Ile

20 25 30

Glu Lys Arg Gln Ser Val Ala Phe Trp Cys Asn Pro Ile Ser Gly His

35 40 45

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50 55 60

Leu Ile Gln Phe Gln Asn Asn Gly Val Val Asp Asp Ser Gln Leu Pro

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Lys Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Leu Lys Gly Val Asp Ser Thr Leu

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Ser Ser Leu Tyr Gly Gly Ser Ile Ser Tyr Glu Gln Tyr Phe Gly Pro

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Gly Thr Arg Leu Thr Val Thr Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro

130 135 140

Glu Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln

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Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val

165 170 175

Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser

180 185 190

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195 200 205

Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn

210 215 220

Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu

225 230 235 240

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245 250 255

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260 265 270

Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu

275 280 285

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290 295 300

Ala Met Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

305 310

<210> 55

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 55

Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

1 5 10 15

Glu Asn Pro Gly Pro

20

<210> 56

<211> 606

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897融合

<400> 56

Met Glu Thr Leu Leu Gly Val Ser Leu Val Ile Leu Trp Leu Gln Leu

1 5 10 15

Ala Arg Val Asn Ser Gln Gln Gly Glu Glu Asp Pro Gln Ala Leu Ser

20 25 30

Ile Gln Glu Gly Glu Asn Ala Thr Met Asn Cys Ser Tyr Lys Thr Ser

35 40 45

Ile Asn Asn Leu Gln Trp Tyr Arg Gln Asn Ser Gly Arg Gly Leu Val

50 55 60

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65 70 75 80

Leu Arg Val Thr Leu Asp Thr Ser Lys Lys Ser Ser Ser Leu Leu Ile

85 90 95

Thr Ala Ser Arg Ala Ala Asp Thr Ala Ser Tyr Phe Cys Ala Thr Asp

100 105 110

Pro Gly Gly Phe Lys Thr Ile Phe Gly Ala Gly Thr Arg Leu Phe Val

115 120 125

Lys Ala Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

145 150 155 160

Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

165 170 175

Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Gly

260 265 270

Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu

275 280 285

Asn Pro Gly Pro Met Gly Thr Arg Leu Leu Cys Trp Ala Ala Leu Cys

290 295 300

Leu Leu Gly Ala Glu Leu Thr Glu Ala Gly Val Ala Gln Ser Pro Arg

305 310 315 320

Tyr Lys Ile Ile Glu Lys Arg Gln Ser Val Ala Phe Trp Cys Asn Pro

325 330 335

Ile Ser Gly His Ala Thr Leu Tyr Trp Tyr Gln Gln Ile Leu Gly Gln

340 345 350

Gly Pro Lys Leu Leu Ile Gln Phe Gln Asn Asn Gly Val Val Asp Asp

355 360 365

Ser Gln Leu Pro Lys Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Leu Lys Gly Val

370 375 380

Asp Ser Thr Leu Lys Ile Gln Pro Ala Lys Leu Glu Asp Ser Ala Val

385 390 395 400

Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Tyr Gly Gly Ser Ile Ser Tyr Glu Gln

405 410 415

Tyr Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Thr Glu Asp Leu Lys Asn

420 425 430

Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile

435 440 445

Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Tyr

450 455 460

Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His

465 470 475 480

Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu

485 490 495

Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr

500 505 510

Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr

515 520 525

Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val

530 535 540

Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe

545 550 555 560

Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr

565 570 575

Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala

580 585 590

Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

595 600 605

<210> 57

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR1

<400> 57

Glu Thr Arg Asp Thr Thr Tyr Tyr Leu

1 5

<210> 58

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR2

<400> 58

Arg Arg Asn Ser Phe Asp Glu Gln Asn Glu

1 5 10

<210> 59

<211> 13

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR3

<400> 59

Cys Ala Leu Ser Glu Ala Gly Thr Tyr Lys Tyr Ile Phe

1 5 10

<210> 60

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 α恒定结构域

<400> 60

Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser

1 5 10 15

Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

20 25 30

Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val

35 40 45

Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp

50 55 60

Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile

65 70 75 80

Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val

85 90 95

Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln

100 105 110

Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly

115 120 125

Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

130 135 140

<210> 61

<211> 275

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 α链

<400> 61

Met Leu Thr Ala Ser Leu Leu Arg Ala Val Ile Ala Ser Ile Cys Val

1 5 10 15

Val Ser Ser Met Ala Gln Lys Val Thr Gln Ala Gln Thr Glu Ile Ser

20 25 30

Val Val Glu Lys Glu Asp Val Thr Leu Asp Cys Val Tyr Glu Thr Arg

35 40 45

Asp Thr Thr Tyr Tyr Leu Phe Trp Tyr Lys Gln Pro Pro Ser Gly Glu

50 55 60

Leu Val Phe Leu Ile Arg Arg Asn Ser Phe Asp Glu Gln Asn Glu Ile

65 70 75 80

Ser Gly Arg Tyr Ser Trp Asn Phe Gln Lys Ser Thr Ser Ser Phe Asn

85 90 95

Phe Thr Ile Thr Ala Ser Gln Val Val Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys

100 105 110

Ala Leu Ser Glu Ala Gly Thr Tyr Lys Tyr Ile Phe Gly Thr Gly Thr

115 120 125

Arg Leu Lys Val Leu Ala Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr

130 135 140

Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr

145 150 155 160

Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val

165 170 175

Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys

180 185 190

Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala

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Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser

210 215 220

Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr

225 230 235 240

Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile

245 250 255

Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu

260 265 270

Trp Ser Ser

275

<210> 62

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR1

<400> 62

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1 5

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR2

<400> 63

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1 5

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR3

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Cys Ala Ser Ser Val Ala Gly Gly Gly Gln Glu Thr Gln Tyr Phe

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 β恒定结构域

<400> 65

Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

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Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys

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Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys

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Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg

115 120 125

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130 135 140

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Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

165 170 175

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 β链

<400> 66

Met Gly Phe Arg Leu Leu Cys Cys Val Ala Phe Cys Leu Leu Gly Ala

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Gly Pro Val Asp Ser Gly Val Thr Gln Thr Pro Lys His Leu Ile Thr

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Glu Arg Phe Ser Ala Gln Gln Phe Pro Asp Leu His Ser Glu Leu Asn

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Ser Val Ala Gly Gly Gly Gln Glu Thr Gln Tyr Phe Gly Pro Gly Thr

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Arg Leu Leu Val Leu Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val

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Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp

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Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

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<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

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Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

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20

<210> 68

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896融合

<400> 68

Met Leu Thr Ala Ser Leu Leu Arg Ala Val Ile Ala Ser Ile Cys Val

1 5 10 15

Val Ser Ser Met Ala Gln Lys Val Thr Gln Ala Gln Thr Glu Ile Ser

20 25 30

Val Val Glu Lys Glu Asp Val Thr Leu Asp Cys Val Tyr Glu Thr Arg

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65 70 75 80

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115 120 125

Arg Leu Lys Val Leu Ala Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr

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Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr

145 150 155 160

Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val

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Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys

180 185 190

Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala

195 200 205

Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser

210 215 220

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225 230 235 240

Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile

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Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu

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Trp Ser Ser Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly

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<210> 69

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR1

<400> 69

Lys Thr Ser Ile Asn Asn Leu

1 5

<210> 70

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR2

<400> 70

Leu Ile Arg Ser Asn Glu Arg Glu Lys

1 5

<210> 71

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR3

<400> 71

Cys Ala Thr Phe Pro Asn Phe Gly Asn Glu Lys Leu Thr Phe

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<210> 72

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 α恒定结构域

<400> 72

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Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

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<210> 73

<211> 273

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 α链

<400> 73

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Ser

<210> 74

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR1

<400> 74

Thr Glu Asn His Arg Tyr Met

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<210> 75

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR2

<400> 75

Tyr Ser Tyr Gly Val Lys Asp Thr

1 5

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<211> 14

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR3

<400> 76

Cys Ala Ile Ser Glu Ser Glu Arg Tyr Tyr Glu Gln Tyr Phe

1 5 10

<210> 77

<211> 179

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 β恒定结构域

<400> 77

Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

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Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

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Ser Arg Gly

<210> 78

<211> 311

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 β链

<400> 78

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Gly His Met Asp Ala Gly Ile Thr Gln Ser Pro Arg His Lys Val Thr

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Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

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<210> 79

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 79

Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

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Glu Asn Pro Gly Pro

20

<210> 80

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847融合

<400> 80

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1 5 10 15

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85 90 95

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115 120 125

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130 135 140

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145 150 155 160

Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile

165 170 175

Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn

180 185 190

Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala

195 200 205

Phe Asn Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu

210 215 220

Ser Ser Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr

225 230 235 240

Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu

245 250 255

Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser

260 265 270

Ser Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val

275 280 285

Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Gly Thr Arg Leu Phe Phe Tyr Val Ala

290 295 300

Leu Cys Leu Leu Trp Thr Gly His Met Asp Ala Gly Ile Thr Gln Ser

305 310 315 320

Pro Arg His Lys Val Thr Glu Thr Gly Thr Pro Val Thr Leu Arg Cys

325 330 335

His Gln Thr Glu Asn His Arg Tyr Met Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro

340 345 350

Gly His Gly Leu Arg Leu Ile His Tyr Ser Tyr Gly Val Lys Asp Thr

355 360 365

Asp Lys Gly Glu Val Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser Arg Ser Lys Thr

370 375 380

Glu Asp Phe Leu Leu Thr Leu Glu Ser Ala Thr Ser Ser Gln Thr Ser

385 390 395 400

Val Tyr Phe Cys Ala Ile Ser Glu Ser Glu Arg Tyr Tyr Glu Gln Tyr

405 410 415

Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Thr Glu Asp Leu Lys Asn Val

420 425 430

Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser

435 440 445

His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Tyr Pro

450 455 460

Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser

465 470 475 480

Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn

485 490 495

Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe

500 505 510

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515 520 525

Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr

530 535 540

Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr

545 550 555 560

Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu

565 570 575

Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu

580 585 590

Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp Ser Arg Gly

595 600 605

<210> 81

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<212> PRT

<213> 人工序列

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<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4 CDR2

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1 5

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<211> 16

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4 CDR3

<400> 83

Cys Leu Val Gly Asp Phe Asn Ser Asn Ser Gly Tyr Ala Leu Asn Phe

1 5 10 15

<210> 84

<211> 140

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 α恒定结构域

<400> 84

Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser

1 5 10 15

Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn

20 25 30

Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val

35 40 45

Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp

50 55 60

Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile

65 70 75 80

Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val

85 90 95

Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln

100 105 110

Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly

115 120 125

Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

130 135 140

<210> 85

<211> 271

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 α链

<400> 85

Met Arg Gln Val Ala Arg Val Ile Val Phe Leu Thr Leu Ser Thr Leu

1 5 10 15

Ser Leu Ala Lys Thr Thr Gln Pro Ile Ser Met Asp Ser Tyr Glu Gly

20 25 30

Gln Glu Val Asn Ile Thr Cys Ser His Asn Asn Ile Ala Thr Asn Asp

35 40 45

Tyr Ile Thr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Ser Gln Gly Pro Arg Phe Ile

50 55 60

Ile Gln Gly Tyr Lys Thr Lys Val Thr Asn Glu Val Ala Ser Leu Phe

65 70 75 80

Ile Pro Ala Asp Arg Lys Ser Ser Thr Leu Ser Leu Pro Arg Val Ser

85 90 95

Leu Ser Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Val Gly Asp Phe Asn Ser

100 105 110

Asn Ser Gly Tyr Ala Leu Asn Phe Gly Lys Gly Thr Ser Leu Leu Val

115 120 125

Thr Pro His Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

145 150 155 160

Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

165 170 175

Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser

260 265 270

<210> 86

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR1

<400> 86

Ile Ser Gly His Thr Ala Leu

1 5

<210> 87

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR2

<400> 87

Tyr Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro

1 5

<210> 88

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR3

<400> 88

Cys Ala Ser Lys Val Tyr Gly Tyr Thr Phe

1 5 10

<210> 89

<211> 177

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 β恒定结构域

<400> 89

Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro

1 5 10 15

Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu

20 25 30

Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn

35 40 45

Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys

50 55 60

Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu

65 70 75 80

Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys

85 90 95

Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp

100 105 110

Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg

115 120 125

Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser

130 135 140

Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala

145 150 155 160

Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp

165 170 175

Phe

<210> 90

<211> 306

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 β链

<400> 90

Met Gly Thr Arg Leu Leu Phe Trp Val Ala Phe Cys Leu Leu Gly Ala

1 5 10 15

Tyr His Thr Gly Ala Gly Val Ser Gln Ser Pro Ser Asn Lys Val Thr

20 25 30

Glu Lys Gly Lys Asp Val Glu Leu Arg Cys Asp Pro Ile Ser Gly His

35 40 45

Thr Ala Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Arg Leu Gly Gln Gly Leu Glu Phe

50 55 60

Leu Ile Tyr Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro Asp Lys Ser Gly Leu Pro

65 70 75 80

Ser Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Thr Gly Glu Ser Val Ser Thr Leu

85 90 95

Thr Ile Gln Arg Thr Gln Gln Glu Asp Ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala

100 105 110

Ser Lys Val Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val

115 120 125

Val Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu

130 135 140

Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys

145 150 155 160

Leu Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val

165 170 175

Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu

180 185 190

Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg

195 200 205

Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg

210 215 220

Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln

225 230 235 240

Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly

245 250 255

Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu

260 265 270

Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr

275 280 285

Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys

290 295 300

Asp Phe

305

<210> 91

<211> 21

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 91

Gly Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu

1 5 10 15

Glu Asn Pro Gly Pro

20

<210> 92

<211> 598

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864融合

<400> 92

Met Arg Gln Val Ala Arg Val Ile Val Phe Leu Thr Leu Ser Thr Leu

1 5 10 15

Ser Leu Ala Lys Thr Thr Gln Pro Ile Ser Met Asp Ser Tyr Glu Gly

20 25 30

Gln Glu Val Asn Ile Thr Cys Ser His Asn Asn Ile Ala Thr Asn Asp

35 40 45

Tyr Ile Thr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Ser Gln Gly Pro Arg Phe Ile

50 55 60

Ile Gln Gly Tyr Lys Thr Lys Val Thr Asn Glu Val Ala Ser Leu Phe

65 70 75 80

Ile Pro Ala Asp Arg Lys Ser Ser Thr Leu Ser Leu Pro Arg Val Ser

85 90 95

Leu Ser Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Val Gly Asp Phe Asn Ser

100 105 110

Asn Ser Gly Tyr Ala Leu Asn Phe Gly Lys Gly Thr Ser Leu Leu Val

115 120 125

Thr Pro His Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp

130 135 140

Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser

145 150 155 160

Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp

165 170 175

Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala

180 185 190

Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn

195 200 205

Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser

210 215 220

Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu

225 230 235 240

Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys

245 250 255

Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Gly

260 265 270

Ser Gly Glu Gly Arg Gly Ser Leu Leu Thr Cys Gly Asp Val Glu Glu

275 280 285

Asn Pro Gly Pro Met Gly Thr Arg Leu Leu Phe Trp Val Ala Phe Cys

290 295 300

Leu Leu Gly Ala Tyr His Thr Gly Ala Gly Val Ser Gln Ser Pro Ser

305 310 315 320

Asn Lys Val Thr Glu Lys Gly Lys Asp Val Glu Leu Arg Cys Asp Pro

325 330 335

Ile Ser Gly His Thr Ala Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Arg Leu Gly Gln

340 345 350

Gly Leu Glu Phe Leu Ile Tyr Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro Asp Lys

355 360 365

Ser Gly Leu Pro Ser Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Thr Gly Glu Ser

370 375 380

Val Ser Thr Leu Thr Ile Gln Arg Thr Gln Gln Glu Asp Ser Ala Val

385 390 395 400

Tyr Leu Cys Ala Ser Lys Val Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr

405 410 415

Arg Leu Thr Val Val Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val

420 425 430

Ala Val Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala

435 440 445

Thr Leu Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu

450 455 460

Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp

465 470 475 480

Pro Gln Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys

485 490 495

Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg

500 505 510

Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp

515 520 525

Glu Trp Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala

530 535 540

Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln

545 550 555 560

Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys

565 570 575

Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met

580 585 590

Val Lys Arg Lys Asp Phe

595

<210> 93

<211> 11

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR1

<400> 93

accacttcag a 11

<210> 94

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR2

<400> 94

ttgctatcaa atggagcagt g 21

<210> 95

<211> 25

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39 CDR3

<400> 95

gccgtggaca aggatggggg ttacc 25

<210> 96

<211> 391

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV39可变结构域

<400> 96

atgaagaagc tactagcaat gattctgtgg cttcaactag accggttaag tggagagctg 60

aaagtggaac aaaaccctct gttcctgagc atgcaggagg gaaaaaacta taccatctac 120

tgcaattatt caaccacttc agacagactg tattggtaca ggcaggatcc tgggaaaagt 180

ctggaatctc tgtttgtgtt gctatcaaat ggagcagtga agcaggaggg acgattaatg 240

gcctcacttg ataccaaagc ccgtctcagc accctccaca tcacagctgc cgtgcatgac 300

ctctctgcca cctacttctg tgccgtggac aaggatgggg gttaccagaa agttaccttt 360

ggaactggaa caaagctcca agtcatccca a 391

<210> 97

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 α恒定结构域

<400> 97

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 98

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 α链

<400> 98

atgaagaagc tactagcaat gattctgtgg cttcaactag accggttaag tggagagctg 60

aaagtggaac aaaaccctct gttcctgagc atgcaggagg gaaaaaacta taccatctac 120

tgcaattatt caaccacttc agacagactg tattggtaca ggcaggatcc tgggaaaagt 180

ctggaatctc tgtttgtgtt gctatcaaat ggagcagtga agcaggaggg acgattaatg 240

gcctcacttg ataccaaagc ccgtctcagc accctccaca tcacagctgc cgtgcatgac 300

ctctctgcca cctacttctg tgccgtggac aaggatgggg gttaccagaa agttaccttt 360

ggaactggaa caaagctcca agtcatccca aatatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agc 813

<210> 99

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1 CDR1

<400> 99

gactttcagg ccacaact 18

<210> 100

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1 CDR2

<400> 100

tccaatgagg gctccaaggc c 21

<210> 101

<211> 51

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1CDR3

<400> 101

agtgctagcc cacgggcggg acagttgagc tcctataatt cacccctcca c 51

<210> 102

<211> 437

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV20-1可变区

<400> 102

atgctgctgc ttctgctgct tctggggcca ggtataagcc tccttctacc tgggagcttg 60

gcaggctccg ggcttggtgc tgtcgtctct caacatccga gctgggttat ctgtaagagt 120

ggaacctctg tgaagatcga gtgccgttcc ctggactttc aggccacaac tatgttttgg 180

tatcgtcagt tcccgaaaca gagtctcatg ctgatggcaa cttccaatga gggctccaag 240

gccacatacg agcaaggcgt cgagaaggac aagtttctca tcaaccatgc aagcctgacc 300

ttgtccactc tgacagtgac cagtgcccat cctgaagaca gcagcttcta catctgcagt 360

gctagcccac gggcgggaca gttgagctcc tataattcac ccctccactt tgggaatggg 420

accaggctca ctgtgac 437

<210> 103

<211> 531

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 β恒定结构域

<400> 103

gaggacctga acaaggtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttctt ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacggacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacccgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttta cctcggtgtc ctaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcctgctag ggaaggccac cctgtatgct 480

gtgctggtca gcgcccttgt gttgatggcc atggtcaaga gaaaggattt c 531

<210> 104

<211> 972

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831 β链

<400> 104

atgctgctgc ttctgctgct tctggggcca ggtataagcc tccttctacc tgggagcttg 60

gcaggctccg ggcttggtgc tgtcgtctct caacatccga gctgggttat ctgtaagagt 120

ggaacctctg tgaagatcga gtgccgttcc ctggactttc aggccacaac tatgttttgg 180

tatcgtcagt tcccgaaaca gagtctcatg ctgatggcaa cttccaatga gggctccaag 240

gccacatacg agcaaggcgt cgagaaggac aagtttctca tcaaccatgc aagcctgacc 300

ttgtccactc tgacagtgac cagtgcccat cctgaagaca gcagcttcta catctgcagt 360

gctagcccac gggcgggaca gttgagctcc tataattcac ccctccactt tgggaatggg 420

accaggctca ctgtgacaga ggacctgaac aaggtgttcc cacccgaggt cgctgtgttt 480

gagccatcag aagcagagat ctcccacacc caaaaggcca cactggtgtg cctggccaca 540

ggcttcttcc ccgaccacgt ggagctgagc tggtgggtga atgggaagga ggtgcacagt 600

ggggtcagca cggacccgca gcccctcaag gagcagcccg ccctcaatga ctccagatac 660

tgcctgagca gccgcctgag ggtctcggcc accttctggc agaacccccg caaccacttc 720

cgctgtcaag tccagttcta cgggctctcg gagaatgatg agtggacaca agatagggcc 780

aaacccgtca cccagatcgt cagcgccgag gcctggggta gagcagactg tggctttacc 840

tcggtgtcct accagcaagg ggtcctgtct gccaccatcc tctatgagat cctgctaggg 900

aaggccaccc tgtatgctgt gctggtcagc gcccttgtgt tgatggccat ggtcaagaga 960

aaggatttct ga 972

<210> 105

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 105

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 106

<211> 1848

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR831融合

<400> 106

atgaagaagc tactagcaat gattctgtgg cttcaactag accggttaag tggagagctg 60

aaagtggaac aaaaccctct gttcctgagc atgcaggagg gaaaaaacta taccatctac 120

tgcaattatt caaccacttc agacagactg tattggtaca ggcaggatcc tgggaaaagt 180

ctggaatctc tgtttgtgtt gctatcaaat ggagcagtga agcaggaggg acgattaatg 240

gcctcacttg ataccaaagc ccgtctcagc accctccaca tcacagctgc cgtgcatgac 300

ctctctgcca cctacttctg tgccgtggac aaggatgggg gttaccagaa agttaccttt 360

ggaactggaa caaagctcca agtcatccca aatatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agcggcagcg gagagggcag aggaagtctt 840

ctaacatgcg gtgacgtgga ggagaatccc ggccctatgc tgctgcttct gctgcttctg 900

gggccaggta taagcctcct tctacctggg agcttggcag gctccgggct tggtgctgtc 960

gtctctcaac atccgagctg ggttatctgt aagagtggaa cctctgtgaa gatcgagtgc 1020

cgttccctgg actttcaggc cacaactatg ttttggtatc gtcagttccc gaaacagagt 1080

ctcatgctga tggcaacttc caatgagggc tccaaggcca catacgagca aggcgtcgag 1140

aaggacaagt ttctcatcaa ccatgcaagc ctgaccttgt ccactctgac agtgaccagt 1200

gcccatcctg aagacagcag cttctacatc tgcagtgcta gcccacgggc gggacagttg 1260

agctcctata attcacccct ccactttggg aatgggacca ggctcactgt gacagaggac 1320

ctgaacaagg tgttcccacc cgaggtcgct gtgtttgagc catcagaagc agagatctcc 1380

cacacccaaa aggccacact ggtgtgcctg gccacaggct tcttccccga ccacgtggag 1440

ctgagctggt gggtgaatgg gaaggaggtg cacagtgggg tcagcacgga cccgcagccc 1500

ctcaaggagc agcccgccct caatgactcc agatactgcc tgagcagccg cctgagggtc 1560

tcggccacct tctggcagaa cccccgcaac cacttccgct gtcaagtcca gttctacggg 1620

ctctcggaga atgatgagtg gacacaagat agggccaaac ccgtcaccca gatcgtcagc 1680

gccgaggcct ggggtagagc agactgtggc tttacctcgg tgtcctacca gcaaggggtc 1740

ctgtctgcca ccatcctcta tgagatcctg ctagggaagg ccaccctgta tgctgtgctg 1800

gtcagcgccc ttgtgttgat ggccatggtc aagagaaagg atttctga 1848

<210> 107

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR1

<400> 107

aacagtgctt ctcagtct 18

<210> 108

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR2

<400> 108

gtatactcca gtggtaac 18

<210> 109

<211> 39

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1 CDR3

<400> 109

gcggtgaacc ccccggacac aggctttcag aaacttgta 39

<210> 110

<211> 400

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV12-1可变结构域

<400> 110

atgatatcct tgagagtttt actggtgatc ctgtggcttc agttaagctg ggtttggagc 60

caacggaagg aggtggagca ggatcctgga cccttcaatg ttccagaggg agccactgtc 120

gctttcaact gtacttacag caacagtgct tctcagtctt tcttctggta cagacaggat 180

tgcaggaaag aacctaagtt gctgatgtcc gtatactcca gtggtaacga agatggaagg 240

tttacagcac agctcaatag agccagccag tatatttccc tgctcatcag agactccaag 300

ctcagtgatt cagccaccta cctctgtgcg gtgaaccccc cggacacagg ctttcagaaa 360

cttgtatttg gaactggcac ccgacttctg gtcagtccaa 400

<210> 111

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 α恒定结构域

<400> 111

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 112

<211> 822

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 α链

<400> 112

atgatatcct tgagagtttt actggtgatc ctgtggcttc agttaagctg ggtttggagc 60

caacggaagg aggtggagca ggatcctgga cccttcaatg ttccagaggg agccactgtc 120

gctttcaact gtacttacag caacagtgct tctcagtctt tcttctggta cagacaggat 180

tgcaggaaag aacctaagtt gctgatgtcc gtatactcca gtggtaacga agatggaagg 240

tttacagcac agctcaatag agccagccag tatatttccc tgctcatcag agactccaag 300

ctcagtgatt cagccaccta cctctgtgcg gtgaaccccc cggacacagg ctttcagaaa 360

cttgtatttg gaactggcac ccgacttctg gtcagtccaa atatccagaa ccctgaccct 420

gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt ctgtctgcct attcaccgat 480

tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg atgtgtatat cacagacaaa 540

actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca gtgctgtggc ctggagcaac 600

aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca ttattccaga agacaccttc 660

ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg agaaaagctt tgaaacagat 720

acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc gaatcctcct cctgaaagtg 780

gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca gc 822

<210> 113

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR1

<400> 113

atggaccatg aaaat 15

<210> 114

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR2

<400> 114

tcatatgatg ttaaaatg 18

<210> 115

<211> 42

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28 CDR3

<400> 115

gccagcagtt tatccttccg gcagggcctt cgcgagcagt ac 42

<210> 116

<211> 402

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV28可变结构域

<400> 116

atgggaatca ggctcctgtg tcgtgtggcc ttttgtttcc tggctgtagg cctcgtagat 60

gtgaaagtaa cccagagctc gagatatcta gtcaaaagga cgggagagaa agtttttctg 120

gaatgtgtcc aggatatgga ccatgaaaat atgttctggt atcgacaaga cccaggtctg 180

gggctacggc tgatctattt ctcatatgat gttaaaatga aagaaaaagg agatattcct 240

gaggggtaca gtgtctccag agagaagaag gagcgcttct ccctgattct ggagtccgcc 300

agcaccaacc agacatctat gtacctctgt gccagcagtt tatccttccg gcagggcctt 360

cgcgagcagt acttcgggcc gggcaccagg ctcacggtca ca 402

<210> 117

<211> 537

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 β恒定结构域

<400> 117

gaggacctga aaaacgtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttcta ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacagacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacctgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttca cctccgagtc ttaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcttgctag ggaaggccac cttgtatgcc 480

gtgctggtca gtgccctcgt gctgatggcc atggtcaaga gaaaggattc cagaggc 537

<210> 118

<211> 942

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833 β链

<400> 118

atgggaatca ggctcctgtg tcgtgtggcc ttttgtttcc tggctgtagg cctcgtagat 60

gtgaaagtaa cccagagctc gagatatcta gtcaaaagga cgggagagaa agtttttctg 120

gaatgtgtcc aggatatgga ccatgaaaat atgttctggt atcgacaaga cccaggtctg 180

gggctacggc tgatctattt ctcatatgat gttaaaatga aagaaaaagg agatattcct 240

gaggggtaca gtgtctccag agagaagaag gagcgcttct ccctgattct ggagtccgcc 300

agcaccaacc agacatctat gtacctctgt gccagcagtt tatccttccg gcagggcctt 360

cgcgagcagt acttcgggcc gggcaccagg ctcacggtca cagaggacct gaaaaacgtg 420

ttcccacccg aggtcgctgt gtttgagcca tcagaagcag agatctccca cacccaaaag 480

gccacactgg tgtgcctggc cacaggcttc taccccgacc acgtggagct gagctggtgg 540

gtgaatggga aggaggtgca cagtggggtc agcacagacc cgcagcccct caaggagcag 600

cccgccctca atgactccag atactgcctg agcagccgcc tgagggtctc ggccaccttc 660

tggcagaacc cccgcaacca cttccgctgt caagtccagt tctacgggct ctcggagaat 720

gatgagtgga cacaagatag ggccaaacct gtcacccaga tcgtcagcgc cgaggcctgg 780

ggtagagcag actgtggctt cacctccgag tcttaccagc aaggggtcct gtctgccacc 840

atcctctatg agatcttgct agggaaggcc accttgtatg ccgtgctggt cagtgccctc 900

gtgctgatgg ccatggtcaa gagaaaggat tccagaggct ga 942

<210> 119

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 119

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 120

<211> 1827

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR833融合

<400> 120

atgatatcct tgagagtttt actggtgatc ctgtggcttc agttaagctg ggtttggagc 60

caacggaagg aggtggagca ggatcctgga cccttcaatg ttccagaggg agccactgtc 120

gctttcaact gtacttacag caacagtgct tctcagtctt tcttctggta cagacaggat 180

tgcaggaaag aacctaagtt gctgatgtcc gtatactcca gtggtaacga agatggaagg 240

tttacagcac agctcaatag agccagccag tatatttccc tgctcatcag agactccaag 300

ctcagtgatt cagccaccta cctctgtgcg gtgaaccccc cggacacagg ctttcagaaa 360

cttgtatttg gaactggcac ccgacttctg gtcagtccaa atatccagaa ccctgaccct 420

gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt ctgtctgcct attcaccgat 480

tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg atgtgtatat cacagacaaa 540

actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca gtgctgtggc ctggagcaac 600

aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca ttattccaga agacaccttc 660

ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg agaaaagctt tgaaacagat 720

acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc gaatcctcct cctgaaagtg 780

gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca gcggcagcgg agagggcaga 840

ggaagtcttc taacatgcgg tgacgtggag gagaatcccg gccctatggg aatcaggctc 900

ctgtgtcgtg tggccttttg tttcctggct gtaggcctcg tagatgtgaa agtaacccag 960

agctcgagat atctagtcaa aaggacggga gagaaagttt ttctggaatg tgtccaggat 1020

atggaccatg aaaatatgtt ctggtatcga caagacccag gtctggggct acggctgatc 1080

tatttctcat atgatgttaa aatgaaagaa aaaggagata ttcctgaggg gtacagtgtc 1140

tccagagaga agaaggagcg cttctccctg attctggagt ccgccagcac caaccagaca 1200

tctatgtacc tctgtgccag cagtttatcc ttccggcagg gccttcgcga gcagtacttc 1260

gggccgggca ccaggctcac ggtcacagag gacctgaaaa acgtgttccc acccgaggtc 1320

gctgtgtttg agccatcaga agcagagatc tcccacaccc aaaaggccac actggtgtgc 1380

ctggccacag gcttctaccc cgaccacgtg gagctgagct ggtgggtgaa tgggaaggag 1440

gtgcacagtg gggtcagcac agacccgcag cccctcaagg agcagcccgc cctcaatgac 1500

tccagatact gcctgagcag ccgcctgagg gtctcggcca ccttctggca gaacccccgc 1560

aaccacttcc gctgtcaagt ccagttctac gggctctcgg agaatgatga gtggacacaa 1620

gatagggcca aacctgtcac ccagatcgtc agcgccgagg cctggggtag agcagactgt 1680

ggcttcacct ccgagtctta ccagcaaggg gtcctgtctg ccaccatcct ctatgagatc 1740

ttgctaggga aggccacctt gtatgccgtg ctggtcagtg ccctcgtgct gatggccatg 1800

gtcaagagaa aggattccag aggctga 1827

<210> 121

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR1

<400> 121

actagtataa acaat 15

<210> 122

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR2

<400> 122

atacgttcaa atgaaagaga g 21

<210> 123

<211> 36

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR3

<400> 123

tgtgctacgg accctggagg cttcaaaact atcttt 36

<210> 124

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 α恒定结构域

<400> 124

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 125

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 α链

<400> 125

atggaaactc tcctgggagt gtctttggtg attctatggc ttcaactggc tagggtgaac 60

agtcaacagg gagaagagga tcctcaggcc ttgagcatcc aggagggtga aaatgccacc 120

atgaactgca gttacaaaac tagtataaac aatttacagt ggtatagaca aaattcaggt 180

agaggccttg tccacctaat tttaatacgt tcaaatgaaa gagagaaaca cagtggaaga 240

ttaagagtca cgcttgacac ttccaagaaa agcagttcct tgttgatcac ggcttcccgg 300

gcagcagaca ctgcttctta cttctgtgct acggaccctg gaggcttcaa aactatcttt 360

ggagcaggaa caagactatt tgttaaagca aatatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agc 813

<210> 126

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR1

<400> 126

tctggccatg ctacc 15

<210> 127

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR2

<400> 127

tttcagaata acggtgta 18

<210> 128

<211> 48

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2 CDR3

<400> 128

tgtgccagca gcttatatgg ggggtcgatc tcctacgagc agtacttc 48

<210> 129

<211> 537

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 β恒定结构域

<400> 129

gaggacctga aaaacgtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttcta ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacagacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacctgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttca cctccgagtc ttaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcttgctag ggaaggccac cttgtatgcc 480

gtgctggtca gtgccctcgt gctgatggcc atggtcaaga gaaaggattc cagaggc 537

<210> 130

<211> 945

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897 β链

<400> 130

atgggcacca ggctcctctg ctgggcggcc ctctgtctcc tgggagcaga actcacagaa 60

gctggagttg cccagtctcc cagatataag attatagaga aaaggcagag tgtggctttt 120

tggtgcaatc ctatatctgg ccatgctacc ctttactggt accagcagat cctgggacag 180

ggcccaaagc ttctgattca gtttcagaat aacggtgtag tggatgattc acagttgcct 240

aaggatcgat tttctgcaga gaggctcaaa ggagtagact ccactctcaa gatccagcct 300

gcaaagcttg aggactcggc cgtgtatctc tgtgccagca gcttatatgg ggggtcgatc 360

tcctacgagc agtacttcgg gccgggcacc aggctcacgg tcacagagga cctgaaaaac 420

gtgttcccac ccgaggtcgc tgtgtttgag ccatcagaag cagagatctc ccacacccaa 480

aaggccacac tggtgtgcct ggccacaggc ttctaccccg accacgtgga gctgagctgg 540

tgggtgaatg ggaaggaggt gcacagtggg gtcagcacag acccgcagcc cctcaaggag 600

cagcccgccc tcaatgactc cagatactgc ctgagcagcc gcctgagggt ctcggccacc 660

ttctggcaga acccccgcaa ccacttccgc tgtcaagtcc agttctacgg gctctcggag 720

aatgatgagt ggacacaaga tagggccaaa cctgtcaccc agatcgtcag cgccgaggcc 780

tggggtagag cagactgtgg cttcacctcc gagtcttacc agcaaggggt cctgtctgcc 840

accatcctct atgagatctt gctagggaag gccaccttgt atgccgtgct ggtcagtgcc 900

ctcgtgctga tggccatggt caagagaaag gattccagag gctga 945

<210> 131

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 131

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 132

<211> 1821

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR897融合

<400> 132

atggaaactc tcctgggagt gtctttggtg attctatggc ttcaactggc tagggtgaac 60

agtcaacagg gagaagagga tcctcaggcc ttgagcatcc aggagggtga aaatgccacc 120

atgaactgca gttacaaaac tagtataaac aatttacagt ggtatagaca aaattcaggt 180

agaggccttg tccacctaat tttaatacgt tcaaatgaaa gagagaaaca cagtggaaga 240

ttaagagtca cgcttgacac ttccaagaaa agcagttcct tgttgatcac ggcttcccgg 300

gcagcagaca ctgcttctta cttctgtgct acggaccctg gaggcttcaa aactatcttt 360

ggagcaggaa caagactatt tgttaaagca aatatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agcggcagcg gagagggcag aggaagtctt 840

ctaacatgcg gtgacgtgga ggagaatccc ggccctatgg gcaccaggct cctctgctgg 900

gcggccctct gtctcctggg agcagaactc acagaagctg gagttgccca gtctcccaga 960

tataagatta tagagaaaag gcagagtgtg gctttttggt gcaatcctat atctggccat 1020

gctacccttt actggtacca gcagatcctg ggacagggcc caaagcttct gattcagttt 1080

cagaataacg gtgtagtgga tgattcacag ttgcctaagg atcgattttc tgcagagagg 1140

ctcaaaggag tagactccac tctcaagatc cagcctgcaa agcttgagga ctcggccgtg 1200

tatctctgtg ccagcagctt atatgggggg tcgatctcct acgagcagta cttcgggccg 1260

ggcaccaggc tcacggtcac agaggacctg aaaaacgtgt tcccacccga ggtcgctgtg 1320

tttgagccat cagaagcaga gatctcccac acccaaaagg ccacactggt gtgcctggcc 1380

acaggcttct accccgacca cgtggagctg agctggtggg tgaatgggaa ggaggtgcac 1440

agtggggtca gcacagaccc gcagcccctc aaggagcagc ccgccctcaa tgactccaga 1500

tactgcctga gcagccgcct gagggtctcg gccaccttct ggcagaaccc ccgcaaccac 1560

ttccgctgtc aagtccagtt ctacgggctc tcggagaatg atgagtggac acaagatagg 1620

gccaaacctg tcacccagat cgtcagcgcc gaggcctggg gtagagcaga ctgtggcttc 1680

acctccgagt cttaccagca aggggtcctg tctgccacca tcctctatga gatcttgcta 1740

gggaaggcca ccttgtatgc cgtgctggtc agtgccctcg tgctgatggc catggtcaag 1800

agaaaggatt ccagaggctg a 1821

<210> 133

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR1

<400> 133

acccgtgata ctacttatta c 21

<210> 134

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR2

<400> 134

cggaactctt ttgatgagca aaat 24

<210> 135

<211> 39

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19 CDR3

<400> 135

tgtgctctga gtgaggcagg aacctacaaa tacatcttt 39

<210> 136

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 α恒定结构域

<400> 136

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 137

<211> 825

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 α链

<400> 137

atgctgactg ccagcctgtt gagggcagtc atagcctcca tctgtgttgt atccagcatg 60

gctcagaagg taactcaagc gcagactgaa atttctgtgg tggagaagga ggatgtgacc 120

ttggactgtg tgtatgaaac ccgtgatact acttattact tattctggta caagcaacca 180

ccaagtggag aattggtttt ccttattcgt cggaactctt ttgatgagca aaatgaaata 240

agtggtcggt attcttggaa cttccagaaa tccaccagtt ccttcaactt caccatcaca 300

gcctcacaag tcgtggactc agcagtatac ttctgtgctc tgagtgaggc aggaacctac 360

aaatacatct ttggaacagg caccaggctg aaggtattag caaatatcca gaaccctgac 420

cctgccgtgt accagctgag agactctaaa tccagtgaca agtctgtctg cctattcacc 480

gattttgatt ctcaaacaaa tgtgtcacaa agtaaggatt ctgatgtgta tatcacagac 540

aaaactgtgt tggacatgcg cagcatggac ttcaagagca acagtgctgt ggcctggagc 600

aacaaatctg actttgcatg tgcaaacgcc ttcaacaaca gcattattcc agaagacacc 660

ttcttcccca gcccagaaag ttcctgtgat gtcaagctgg tcgagaaaag ctttgaaaca 720

gatacgaacc taaactttca aaacctgtca gtgattgggt tccgaatcct cctcctgaaa 780

gtggccgggt ttaatctgct catgacgctg cggctgtggt ccagc 825

<210> 138

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR1

<400> 138

tctggagacc tctct 15

<210> 139

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR2

<400> 139

cggaactctt ttgatgagca aaat 24

<210> 140

<211> 39

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9 CDR3

<400> 140

tgtgctctga gtgaggcagg aacctacaaa tacatcttt 39

<210> 141

<211> 537

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 β恒定结构域

<400> 141

gaggacctga aaaacgtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttcta ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacagacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacctgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttca cctccgagtc ttaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcttgctag ggaaggccac cttgtatgcc 480

gtgctggtca gtgccctcgt gctgatggcc atggtcaaga gaaaggattc cagaggc 537

<210> 142

<211> 939

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896 β链

<400> 142

atgggcttca ggctcctctg ctgtgtggcc ttttgtctcc tgggagcagg cccagtggat 60

tctggagtca cacaaacccc aaagcacctg atcacagcaa ctggacagcg agtgacgctg 120

agatgctccc ctaggtctgg agacctctct gtgtactggt accaacagag cctggaccag 180

ggcctccagt tcctcattca gtattataat ggagaagaga gagcaaaagg aaacattctt 240

gaacgattct ccgcacaaca gttccctgac ttgcactctg aactaaacct gagctctctg 300

gagctggggg actcagcttt gtatttctgt gccagcagcg tagctggggg gggacaagag 360

acccagtact tcgggccagg cacgcggctc ctggtgctcg aggacctgaa aaacgtgttc 420

ccacccgagg tcgctgtgtt tgagccatca gaagcagaga tctcccacac ccaaaaggcc 480

acactggtgt gcctggccac aggcttctac cccgaccacg tggagctgag ctggtgggtg 540

aatgggaagg aggtgcacag tggggtcagc acagacccgc agcccctcaa ggagcagccc 600

gccctcaatg actccagata ctgcctgagc agccgcctga gggtctcggc caccttctgg 660

cagaaccccc gcaaccactt ccgctgtcaa gtccagttct acgggctctc ggagaatgat 720

gagtggacac aagatagggc caaacctgtc acccagatcg tcagcgccga ggcctggggt 780

agagcagact gtggcttcac ctccgagtct taccagcaag gggtcctgtc tgccaccatc 840

ctctatgaga tcttgctagg gaaggccacc ttgtatgccg tgctggtcag tgccctcgtg 900

ctgatggcca tggtcaagag aaaggattcc agaggctga 939

<210> 143

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 143

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 144

<211> 1827

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR896融合

<400> 144

atgctgactg ccagcctgtt gagggcagtc atagcctcca tctgtgttgt atccagcatg 60

gctcagaagg taactcaagc gcagactgaa atttctgtgg tggagaagga ggatgtgacc 120

ttggactgtg tgtatgaaac ccgtgatact acttattact tattctggta caagcaacca 180

ccaagtggag aattggtttt ccttattcgt cggaactctt ttgatgagca aaatgaaata 240

agtggtcggt attcttggaa cttccagaaa tccaccagtt ccttcaactt caccatcaca 300

gcctcacaag tcgtggactc agcagtatac ttctgtgctc tgagtgaggc aggaacctac 360

aaatacatct ttggaacagg caccaggctg aaggtattag caaatatcca gaaccctgac 420

cctgccgtgt accagctgag agactctaaa tccagtgaca agtctgtctg cctattcacc 480

gattttgatt ctcaaacaaa tgtgtcacaa agtaaggatt ctgatgtgta tatcacagac 540

aaaactgtgt tggacatgcg cagcatggac ttcaagagca acagtgctgt ggcctggagc 600

aacaaatctg actttgcatg tgcaaacgcc ttcaacaaca gcattattcc agaagacacc 660

ttcttcccca gcccagaaag ttcctgtgat gtcaagctgg tcgagaaaag ctttgaaaca 720

gatacgaacc taaactttca aaacctgtca gtgattgggt tccgaatcct cctcctgaaa 780

gtggccgggt ttaatctgct catgacgctg cggctgtggt ccagcggcag cggagagggc 840

agaggaagtc ttctaacatg cggtgacgtg gaggagaatc ccggccctat gggcttcagg 900

ctcctctgct gtgtggcctt ttgtctcctg ggagcaggcc cagtggattc tggagtcaca 960

caaaccccaa agcacctgat cacagcaact ggacagcgag tgacgctgag atgctcccct 1020

aggtctggag acctctctgt gtactggtac caacagagcc tggaccaggg cctccagttc 1080

ctcattcagt attataatgg agaagagaga gcaaaaggaa acattcttga acgattctcc 1140

gcacaacagt tccctgactt gcactctgaa ctaaacctga gctctctgga gctgggggac 1200

tcagctttgt atttctgtgc cagcagcgta gctggggggg gacaagagac ccagtacttc 1260

gggccaggca cgcggctcct ggtgctcgag gacctgaaaa acgtgttccc acccgaggtc 1320

gctgtgtttg agccatcaga agcagagatc tcccacaccc aaaaggccac actggtgtgc 1380

ctggccacag gcttctaccc cgaccacgtg gagctgagct ggtgggtgaa tgggaaggag 1440

gtgcacagtg gggtcagcac agacccgcag cccctcaagg agcagcccgc cctcaatgac 1500

tccagatact gcctgagcag ccgcctgagg gtctcggcca ccttctggca gaacccccgc 1560

aaccacttcc gctgtcaagt ccagttctac gggctctcgg agaatgatga gtggacacaa 1620

gatagggcca aacctgtcac ccagatcgtc agcgccgagg cctggggtag agcagactgt 1680

ggcttcacct ccgagtctta ccagcaaggg gtcctgtctg ccaccatcct ctatgagatc 1740

ttgctaggga aggccacctt gtatgccgtg ctggtcagtg ccctcgtgct gatggccatg 1800

gtcaagagaa aggattccag aggctga 1827

<210> 145

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR1

<400> 145

actagtataa acaat 15

<210> 146

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR2

<400> 146

atacgttcaa atgaaagaga g 21

<210> 147

<211> 36

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17 CDR3

<400> 147

gctacttttc ctaactttgg aaatgagaaa ttaacc 36

<210> 148

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 α恒定结构域

<400> 148

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 149

<211> 819

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 α链

<400> 149

atggaaactc tcctgggagt gtctttggtg attctatggc ttcaactggc tagggtgaac 60

agtcaacagg gagaagagga tcctcaggcc ttgagcatcc aggagggtga aaatgccacc 120

atgaactgca gttacaaaac tagtataaac aatttacagt ggtatagaca aaattcaggt 180

agaggccttg tccacctaat tttaatacgt tcaaatgaaa gagagaaaca cagtggaaga 240

ttaagagtca cgcttgacac ttccaagaaa agcagttcct tgttgatcac ggcttcccgg 300

gcagcagaca ctgcttctta cttctgtgct acttttccta actttggaaa tgagaaatta 360

acctttggga ctggaacaag actcaccatc atacccaata tccagaaccc tgaccctgcc 420

gtgtaccagc tgagagactc taaatccagt gacaagtctg tctgcctatt caccgatttt 480

gattctcaaa caaatgtgtc acaaagtaag gattctgatg tgtatatcac agacaaaact 540

gtgttggaca tgcgcagcat ggacttcaag agcaacagtg ctgtggcctg gagcaacaaa 600

tctgactttg catgtgcaaa cgccttcaac aacagcatta ttccagaaga caccttcttc 660

cccagcccag aaagttcctg tgatgtcaag ctggtcgaga aaagctttga aacagatacg 720

aacctaaact ttcaaaacct gtcagtgatt gggttccgaa tcctcctcct gaaagtggcc 780

gggtttaatc tgctcatgac gctgcggctg tggtccagc 819

<210> 150

<211> 14

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR1

<400> 150

gagaaccacc gcta 14

<210> 151

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR2

<400> 151

tcatatggtg ttaaagat 18

<210> 152

<211> 36

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3 CDR3

<400> 152

gccatcagtg agtcggagcg gtactacgag cagtac 36

<210> 153

<211> 537

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 β恒定结构域

<400> 153

gaggacctga aaaacgtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttcta ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacagacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacctgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttca cctccgagtc ttaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcttgctag ggaaggccac cttgtatgcc 480

gtgctggtca gtgccctcgt gctgatggcc atggtcaaga gaaaggattc cagaggc 537

<210> 154

<211> 936

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847 β链

<400> 154

atgggcacaa ggttgttctt ctatgtggcc ctttgtctcc tgtggacagg acacatggat 60

gctggaatca cccagagccc aagacacaag gtcacagaga caggaacacc agtgactctg 120

agatgtcacc agactgagaa ccaccgctat atgtactggt atcgacaaga cccggggcat 180

gggctgaggc tgatccatta ctcatatggt gttaaagata ctgacaaagg agaagtctca 240

gatggctata gtgtctccag atcaaagaca gaggatttcc tcctcactct ggagtccgct 300

accagctccc agacatctgt gtacttctgt gccatcagtg agtcggagcg gtactacgag 360

cagtacttcg ggccgggcac caggctcacg gtcacagagg acctgaaaaa cgtgttccca 420

cccgaggtcg ctgtgtttga gccatcagaa gcagagatct cccacaccca aaaggccaca 480

ctggtgtgcc tggccacagg cttctacccc gaccacgtgg agctgagctg gtgggtgaat 540

gggaaggagg tgcacagtgg ggtcagcaca gacccgcagc ccctcaagga gcagcccgcc 600

ctcaatgact ccagatactg cctgagcagc cgcctgaggg tctcggccac cttctggcag 660

aacccccgca accacttccg ctgtcaagtc cagttctacg ggctctcgga gaatgatgag 720

tggacacaag atagggccaa acctgtcacc cagatcgtca gcgccgaggc ctggggtaga 780

gcagactgtg gcttcacctc cgagtcttac cagcaagggg tcctgtctgc caccatcctc 840

tatgagatct tgctagggaa ggccaccttg tatgccgtgc tggtcagtgc cctcgtgctg 900

atggccatgg tcaagagaaa ggattccaga ggctga 936

<210> 155

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 155

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 156

<211> 1818

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR847融合

<400> 156

atggaaactc tcctgggagt gtctttggtg attctatggc ttcaactggc tagggtgaac 60

agtcaacagg gagaagagga tcctcaggcc ttgagcatcc aggagggtga aaatgccacc 120

atgaactgca gttacaaaac tagtataaac aatttacagt ggtatagaca aaattcaggt 180

agaggccttg tccacctaat tttaatacgt tcaaatgaaa gagagaaaca cagtggaaga 240

ttaagagtca cgcttgacac ttccaagaaa agcagttcct tgttgatcac ggcttcccgg 300

gcagcagaca ctgcttctta cttctgtgct acttttccta actttggaaa tgagaaatta 360

acctttggga ctggaacaag actcaccatc atacccaata tccagaaccc tgaccctgcc 420

gtgtaccagc tgagagactc taaatccagt gacaagtctg tctgcctatt caccgatttt 480

gattctcaaa caaatgtgtc acaaagtaag gattctgatg tgtatatcac agacaaaact 540

gtgttggaca tgcgcagcat ggacttcaag agcaacagtg ctgtggcctg gagcaacaaa 600

tctgactttg catgtgcaaa cgccttcaac aacagcatta ttccagaaga caccttcttc 660

cccagcccag aaagttcctg tgatgtcaag ctggtcgaga aaagctttga aacagatacg 720

aacctaaact ttcaaaacct gtcagtgatt gggttccgaa tcctcctcct gaaagtggcc 780

gggtttaatc tgctcatgac gctgcggctg tggtccagcg gcagcggaga gggcagagga 840

agtcttctaa catgcggtga cgtggaggag aatcccggcc ctatgggcac aaggttgttc 900

ttctatgtgg ccctttgtct cctgtggaca ggacacatgg atgctggaat cacccagagc 960

ccaagacaca aggtcacaga gacaggaaca ccagtgactc tgagatgtca ccagactgag 1020

aaccaccgct atatgtactg gtatcgacaa gacccggggc atgggctgag gctgatccat 1080

tactcatatg gtgttaaaga tactgacaaa ggagaagtct cagatggcta tagtgtctcc 1140

agatcaaaga cagaggattt cctcctcact ctggagtccg ctaccagctc ccagacatct 1200

gtgtacttct gtgccatcag tgagtcggag cggtactacg agcagtactt cgggccgggc 1260

accaggctca cggtcacaga ggacctgaaa aacgtgttcc cacccgaggt cgctgtgttt 1320

gagccatcag aagcagagat ctcccacacc caaaaggcca cactggtgtg cctggccaca 1380

ggcttctacc ccgaccacgt ggagctgagc tggtgggtga atgggaagga ggtgcacagt 1440

ggggtcagca cagacccgca gcccctcaag gagcagcccg ccctcaatga ctccagatac 1500

tgcctgagca gccgcctgag ggtctcggcc accttctggc agaacccccg caaccacttc 1560

cgctgtcaag tccagttcta cgggctctcg gagaatgatg agtggacaca agatagggcc 1620

aaacctgtca cccagatcgt cagcgccgag gcctggggta gagcagactg tggcttcacc 1680

tccgagtctt accagcaagg ggtcctgtct gccaccatcc tctatgagat cttgctaggg 1740

aaggccacct tgtatgccgt gctggtcagt gccctcgtgc tgatggccat ggtcaagaga 1800

aaggattcca gaggctga 1818

<210> 157

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4 CDR1

<400> 157

aacattgcta caaatgatta t 21

<210> 158

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4 CDR2

<400> 158

ggatacaaga caaaa 15

<210> 159

<211> 42

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4 CDR3

<400> 159

ctcgtgggtg acttcaactc aaattccggg tatgcactca ac 42

<210> 160

<211> 422

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 α恒定结构域

<400> 160

atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 60

ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 120

atgtgtatat cacagacaaa actgtgttgg acatgcgcag catggacttc aagagcaaca 180

gtgctgtggc ctggagcaac aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca 240

ttattccaga agacaccttc ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg 300

agaaaagctt tgaaacagat acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc 360

gaatcctcct cctgaaagtg gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca 420

gc 422

<210> 161

<211> 813

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 α链

<400> 161

atgaggcaag tggcgagagt gatcgtgttc ctgaccctga gtactttgag ccttgctaag 60

accacccagc ccatctccat ggactcatat gaaggacaag aagtgaacat aacctgtagc 120

cacaacaaca ttgctacaaa tgattatatc acgtggtacc aacagtttcc cagccaagga 180

ccacgattta ttattcaagg atacaagaca aaagttacaa acgaagtggc ctccctgttt 240

atccctgccg acagaaagtc cagcactctg agcctgcccc gggtttccct gagcgacact 300

gctgtgtact actgcctcgt gggtgacttc aactcaaatt ccgggtatgc actcaacttc 360

ggcaaaggca cctcgctgtt ggtcacaccc catatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agc 813

<210> 162

<211> 15

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR1

<400> 162

tcaggtcata ctgcc 15

<210> 163

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR2

<400> 163

ttccaaggca acagtgca 18

<210> 164

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2 CDR3

<400> 164

gccagcaagg tctatggcta cacc 24

<210> 165

<211> 531

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 β恒定结构域

<400> 165

gaggacctga acaaggtgtt cccacccgag gtcgctgtgt ttgagccatc agaagcagag 60

atctcccaca cccaaaaggc cacactggtg tgcctggcca caggcttctt ccccgaccac 120

gtggagctga gctggtgggt gaatgggaag gaggtgcaca gtggggtcag cacggacccg 180

cagcccctca aggagcagcc cgccctcaat gactccagat actgcctgag cagccgcctg 240

agggtctcgg ccaccttctg gcagaacccc cgcaaccact tccgctgtca agtccagttc 300

tacgggctct cggagaatga tgagtggaca caagataggg ccaaacccgt cacccagatc 360

gtcagcgccg aggcctgggg tagagcagac tgtggcttta cctcggtgtc ctaccagcaa 420

ggggtcctgt ctgccaccat cctctatgag atcctgctag ggaaggccac cctgtatgct 480

gtgctggtca gcgcccttgt gttgatggcc atggtcaaga gaaaggattt c 531

<210> 166

<211> 921

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864 β链

<400> 166

atgggcacca ggctcctctt ctgggtggcc ttctgtctcc tgggggcata tcacacagga 60

gctggagtct cccagtcccc cagtaacaag gtcacagaga agggaaagga tgtagagctc 120

aggtgtgatc caatttcagg tcatactgcc ctttactggt accgacagag gctggggcag 180

ggcctggagt ttttaattta cttccaaggc aacagtgcac cagacaaatc agggctgccc 240

agtgatcgct tctctgcaga gaggactggg gaatccgtct ccactctgac gatccagcgc 300

acacagcagg aggactcggc cgtgtatctc tgtgccagca aggtctatgg ctacaccttc 360

ggttcgggga ccaggttaac cgttgtagag gacctgaaca aggtgttccc acccgaggtc 420

gctgtgtttg agccatcaga agcagagatc tcccacaccc aaaaggccac actggtgtgc 480

ctggccacag gcttcttccc cgaccacgtg gagctgagct ggtgggtgaa tgggaaggag 540

gtgcacagtg gggtcagcac ggacccgcag cccctcaagg agcagcccgc cctcaatgac 600

tccagatact gcctgagcag ccgcctgagg gtctcggcca ccttctggca gaacccccgc 660

aaccacttcc gctgtcaagt ccagttctac gggctctcgg agaatgatga gtggacacaa 720

gatagggcca aacccgtcac ccagatcgtc agcgccgagg cctggggtag agcagactgt 780

ggctttacct cggtgtccta ccagcaaggg gtcctgtctg ccaccatcct ctatgagatc 840

ctgctaggga aggccaccct gtatgctgtg ctggtcagcg cccttgtgtt gatggccatg 900

gtcaagagaa aggatttctg a 921

<210> 167

<211> 63

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 接头

<400> 167

ggcagcggag agggcagagg aagtcttcta acatgcggtg acgtggagga gaatcccggc 60

cct 63

<210> 168

<211> 1797

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> TCR864融合

<400> 168

atgaggcaag tggcgagagt gatcgtgttc ctgaccctga gtactttgag ccttgctaag 60

accacccagc ccatctccat ggactcatat gaaggacaag aagtgaacat aacctgtagc 120

cacaacaaca ttgctacaaa tgattatatc acgtggtacc aacagtttcc cagccaagga 180

ccacgattta ttattcaagg atacaagaca aaagttacaa acgaagtggc ctccctgttt 240

atccctgccg acagaaagtc cagcactctg agcctgcccc gggtttccct gagcgacact 300

gctgtgtact actgcctcgt gggtgacttc aactcaaatt ccgggtatgc actcaacttc 360

ggcaaaggca cctcgctgtt ggtcacaccc catatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420

cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480

caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgttg 540

gacatgcgca gcatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600

tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660

ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720

aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780

aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agcggcagcg gagagggcag aggaagtctt 840

ctaacatgcg gtgacgtgga ggagaatccc ggccctatgg gcaccaggct cctcttctgg 900

gtggccttct gtctcctggg ggcatatcac acaggagctg gagtctccca gtcccccagt 960

aacaaggtca cagagaaggg aaaggatgta gagctcaggt gtgatccaat ttcaggtcat 1020

actgcccttt actggtaccg acagaggctg gggcagggcc tggagttttt aatttacttc 1080

caaggcaaca gtgcaccaga caaatcaggg ctgcccagtg atcgcttctc tgcagagagg 1140

actggggaat ccgtctccac tctgacgatc cagcgcacac agcaggagga ctcggccgtg 1200

tatctctgtg ccagcaaggt ctatggctac accttcggtt cggggaccag gttaaccgtt 1260

gtagaggacc tgaacaaggt gttcccaccc gaggtcgctg tgtttgagcc atcagaagca 1320

gagatctccc acacccaaaa ggccacactg gtgtgcctgg ccacaggctt cttccccgac 1380

cacgtggagc tgagctggtg ggtgaatggg aaggaggtgc acagtggggt cagcacggac 1440

ccgcagcccc tcaaggagca gcccgccctc aatgactcca gatactgcct gagcagccgc 1500

ctgagggtct cggccacctt ctggcagaac ccccgcaacc acttccgctg tcaagtccag 1560

ttctacgggc tctcggagaa tgatgagtgg acacaagata gggccaaacc cgtcacccag 1620

atcgtcagcg ccgaggcctg gggtagagca gactgtggct ttacctcggt gtcctaccag 1680

caaggggtcc tgtctgccac catcctctat gagatcctgc tagggaaggc caccctgtat 1740

gctgtgctgg tcagcgccct tgtgttgatg gccatggtca agagaaagga tttctga 1797

<210> 169

<211> 92

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17可变结构域

<400> 169

Ser Gln Gln Gly Glu Glu Asp Pro Gln Ala Leu Ser Ile Gln Glu Gly

1 5 10 15

Glu Asn Ala Thr Met Asn Cys Ser Tyr Lys Thr Ser Ile Asn Asn Leu

20 25 30

Gln Trp Tyr Arg Gln Asn Ser Gly Arg Gly Leu Val His Leu Ile Leu

35 40 45

Ile Arg Ser Asn Glu Arg Glu Lys His Ser Gly Arg Leu Arg Val Thr

50 55 60

Leu Asp Thr Ser Lys Lys Ser Ser Ser Leu Leu Ile Thr Ala Ser Arg

65 70 75 80

Ala Ala Asp Thr Ala Ser Tyr Phe Cys Ala Thr Asp

85 90

<210> 170

<211> 96

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV11-2可变结构域

<400> 170

Glu Ala Gly Val Ala Gln Ser Pro Arg Tyr Lys Ile Ile Glu Lys Arg

1 5 10 15

Gln Ser Val Ala Phe Trp Cys Asn Pro Ile Ser Gly His Ala Thr Leu

20 25 30

Tyr Trp Tyr Gln Gln Ile Leu Gly Gln Gly Pro Lys Leu Leu Ile Gln

35 40 45

Phe Gln Asn Asn Gly Val Val Asp Asp Ser Gln Leu Pro Lys Asp Arg

50 55 60

Phe Ser Ala Glu Arg Leu Lys Gly Val Asp Ser Thr Leu Lys Ile Gln

65 70 75 80

Pro Ala Lys Leu Glu Asp Ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu

85 90 95

<210> 171

<211> 96

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV19可变结构域

<400> 171

Ala Gln Lys Val Thr Gln Ala Gln Thr Glu Ile Ser Val Val Glu Lys

1 5 10 15

Glu Asp Val Thr Leu Asp Cys Val Tyr Glu Thr Arg Asp Thr Thr Tyr

20 25 30

Tyr Leu Phe Trp Tyr Lys Gln Pro Pro Ser Gly Glu Leu Val Phe Leu

35 40 45

Ile Arg Arg Asn Ser Phe Asp Glu Gln Asn Glu Ile Ser Gly Arg Tyr

50 55 60

Ser Trp Asn Phe Gln Lys Ser Thr Ser Ser Phe Asn Phe Thr Ile Thr

65 70 75 80

Ala Ser Gln Val Val Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys Ala Leu Ser Glu

85 90 95

<210> 172

<211> 95

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV9可变结构域

<400> 172

Asp Ser Gly Val Thr Gln Thr Pro Lys His Leu Ile Thr Ala Thr Gly

1 5 10 15

Gln Arg Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Arg Ser Gly Asp Leu Ser Val

20 25 30

Tyr Trp Tyr Gln Gln Ser Leu Asp Gln Gly Leu Gln Phe Leu Ile Gln

35 40 45

Tyr Tyr Asn Gly Glu Glu Arg Ala Lys Gly Asn Ile Leu Glu Arg Phe

50 55 60

Ser Ala Gln Gln Phe Pro Asp Leu His Ser Glu Leu Asn Leu Ser Ser

65 70 75 80

Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Ser Ser Val

85 90 95

<210> 173

<211> 92

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV17可变区

<400> 173

Ser Gln Gln Gly Glu Glu Asp Pro Gln Ala Leu Ser Ile Gln Glu Gly

1 5 10 15

Glu Asn Ala Thr Met Asn Cys Ser Tyr Lys Thr Ser Ile Asn Asn Leu

20 25 30

Gln Trp Tyr Arg Gln Asn Ser Gly Arg Gly Leu Val His Leu Ile Leu

35 40 45

Ile Arg Ser Asn Glu Arg Glu Lys His Ser Gly Arg Leu Arg Val Thr

50 55 60

Leu Asp Thr Ser Lys Lys Ser Ser Ser Leu Leu Ile Thr Ala Ser Arg

65 70 75 80

Ala Ala Asp Thr Ala Ser Tyr Phe Cys Ala Thr Phe

85 90

<210> 174

<211> 95

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV10-3可变区

<400> 174

Asp Ala Gly Ile Thr Gln Ser Pro Arg His Lys Val Thr Glu Thr Gly

1 5 10 15

Thr Pro Val Thr Leu Arg Cys His Gln Thr Glu Asn His Arg Tyr Met

20 25 30

Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly His Gly Leu Arg Leu Ile His Tyr

35 40 45

Ser Tyr Gly Val Lys Asp Thr Asp Lys Gly Glu Val Ser Asp Gly Tyr

50 55 60

Ser Val Ser Arg Ser Lys Thr Glu Asp Phe Leu Leu Thr Leu Glu Ser

65 70 75 80

Ala Thr Ser Ser Gln Thr Ser Val Tyr Phe Cys Ala Ile Ser Glu

85 90 95

<210> 175

<211> 92

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRAV4可变区

<400> 175

Leu Ala Lys Thr Thr Gln Pro Ile Ser Met Asp Ser Tyr Glu Gly Gln

1 5 10 15

Glu Val Asn Ile Thr Cys Ser His Asn Asn Ile Ala Thr Asn Asp Tyr

20 25 30

Ile Thr Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Ser Gln Gly Pro Arg Phe Ile Ile

35 40 45

Gln Gly Tyr Lys Thr Lys Val Thr Asn Glu Val Ala Ser Leu Phe Ile

50 55 60

Pro Ala Asp Arg Lys Ser Ser Thr Leu Ser Leu Pro Arg Val Ser Leu

65 70 75 80

Ser Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Val Gly Asp

85 90

<210> 176

<211> 95

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> TRBV7-2可变区

<400> 176

Gly Ala Gly Val Ser Gln Ser Pro Ser Asn Lys Val Thr Glu Lys Gly

1 5 10 15

Lys Asp Val Glu Leu Arg Cys Asp Pro Ile Ser Gly His Thr Ala Leu

20 25 30

Tyr Trp Tyr Arg Gln Arg Leu Gly Gln Gly Leu Glu Phe Leu Ile Tyr

35 40 45

Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro Asp Lys Ser Gly Leu Pro Ser Asp Arg

50 55 60

Phe Ser Ala Glu Arg Thr Gly Glu Ser Val Ser Thr Leu Thr Ile Gln

65 70 75 80

Arg Thr Gln Gln Glu Asp Ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser Lys

85 90 95

<210> 177

<211> 24

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS

<400> 177

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile

20

<210> 178

<211> 23

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<400> 178

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Val Gly Lys Ser

1 5 10 15

Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile

20

<210> 179

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 179

Xaa Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile

1 5 10

<210> 180

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (2)..(2)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 180

Ala Xaa Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr

1 5 10

<210> 181

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (3)..(3)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 181

Gly Ala Xaa Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 182

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (4)..(4)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 182

Val Gly Ala Xaa Gly Val Gly Lys Ser Ala

1 5 10

<210> 183

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (5)..(5)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 183

Val Val Gly Ala Xaa Gly Val Gly Lys Ser

1 5 10

<210> 184

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (6)..(6)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 184

Val Val Val Gly Ala Xaa Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 185

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (7)..(7)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 185

Leu Val Val Val Gly Ala Xaa Gly Val Gly

1 5 10

<210> 186

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (8)..(8)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 186

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Xaa Gly Val

1 5 10

<210> 187

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (9)..(9)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 187

Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Xaa Gly

1 5 10

<210> 188

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> RAS G12突变的片段

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> Xaa可以是任何天然存在的氨基酸

<400> 188

Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Xaa

1 5 10

<210> 189

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> KLV_G

<400> 189

Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val

1 5 10

<210> 190

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VV_G

<400> 190

Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys

1 5

<210> 191

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> VVV_G

<400> 191

Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys

1 5 10

<210> 192

<211> 10

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> GA_G

<400> 192

Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu

1 5 10

<210> 193

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> WT

<400> 193

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 194

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12A

<400> 194

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Ala Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 195

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12C

<400> 195

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 196

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12D

<400> 196

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 197

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12R

<400> 197

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Arg Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 198

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12S

<400> 198

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Ser Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 199

<211> 25

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> G12V

<400> 199

Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys

1 5 10 15

Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln

20 25

<210> 200

<211> 20

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> CMV pp65- NLV(A*02:01)

<400> 200

Gly Ile Leu Ala Arg Asn Leu Val Pro Met Val Ala Thr Val Gln Gly

1 5 10 15

Gln Asn Leu Lys

20

<210> 201

<211> 20

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> 甲型流感NP - ILR(A*03:01)

<400> 201

Ala Arg Ser Ala Leu Ile Leu Arg Gly Ser Val Ala His Lys Ser Cys

1 5 10 15

Leu Pro Ala Cys

20

<210> 202

<211> 20

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> EBV EBNA4 - IVT(A*11:01)

<400> 202

Lys Lys Cys Arg Ala Ile Val Thr Asp Phe Ser Val Ile Lys Ala Ile

1 5 10 15

Glu Glu Glu His

20

<210> 203

<211> 20

<212> PRT

<213> 人工序列

<220>

<223> CMV pp65 - TPR(B*07:02)

<400> 203

Thr Thr Glu Arg Lys Thr Pro Arg Val Thr Gly Gly Gly Ala Met Ala

1 5 10 15

Gly Ala Ser Thr

20

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