本发明属于废水处理技术领域,具体涉及一种利用微藻光生物反应降低养殖废水中总氮总磷的方法,包括如下步骤:选取微藻藻种,依次进行活化、扩大培养后,接种至光生物反应器中进行高密度培养,直到细胞对数生长期,而后对微藻进行离心收集,洗涤,配置成微藻悬浮液;向微藻悬浮液中加入活性污泥,制成混合液;将混合液加入到载体溶液中,恒温振荡使其分散均匀,并逐滴氯化钙溶液,析出固化微球,直至不再析出;对养殖废水进行预处理后,加入固化微球进行处理;对养殖废水去除液中的固化微球进行收集。该方法可使质粒稳定性更能得到保障,降低了突变的概率,同时可被重复多次利用,提高了对氮磷的去除率,保证了净化效果。