本发明公开了一种1,3,5-三甲氧基-2,4,6-三硝基苯的制备方法,包括如下步骤:取三硝基间苯三酚溶解于5倍质量的烷基化试剂中,得原料液;将原料液泵入连续流管式反应器I中于80-110℃下反应5-30min,得烷基化反应液;将烷基化反应液进料到用于冷却的连续流管式反应器II中冷却5-10min,冷却温度为20-30℃;取出产物加入到析晶溶液中,降温析晶,搅拌,过滤,干燥,即得产物1,3,5-三甲氧基-2,4,6-三硝基苯,所述烷基化试剂为甲基化试剂或乙基化试剂或丙基化试剂。利用连续流技术抑制副反应,提高目标产物的产率和纯度,大大简化后处理过程。易于控制反应过程,适于工业化生产。