本发明公开了一种同步硝化反硝化菌剂的制备方法及其在废水处理中的应用,属于反硝化菌应用技术领域。该技术方法是在4℃条件下,以海藻酸钠和β-环糊精为载体,以硫酸铁为交联剂,将反硝化细菌进行包埋形成球状体,球状体直径为2~5mm,球状体采用生理盐水洗净后进行风干得到厌氧反硝化菌剂。该技术主要包括:反硝化菌的活化,反硝化细菌扩大培养和固定化小球的制备,反硝化菌剂的使用条件和效果。本发明制作所需的原料环保可降解,制作工艺及设备要求简单。本发明获得的同步硝化反硝化菌剂在低氧条件下反硝化效果仍然明显,在同一个反应器内同时硝化和反硝化,克服传统工艺的缺点,降低污水处理过程中的基建和运行费用,拥有较好的应用前景。