本发明提供一种由甘油制备1,3-丙二醇的方法及其系统,该方法包括:将甘油水溶液与氢气混合后引入加氢单元中,在反应条件下使所述甘油水溶液、氢气与催化剂相接触,反应生成含1,3-丙二醇的加氢混合产物;以及将所述加氢混合产物引入分离单元,分离出1,3-丙二醇和副产物;其中,所述催化剂包括载体和负载在所述载体上的活性组分,所述载体包括金属M的碳化物和金属M的氧化物,M选自第VIB族金属,所述活性组分选自第VIII族金属的金属组分的一种或多种。本发明在选定的系统中采用具体的催化剂,氢气与甘油均为一次通过流程,借助于该工艺,催化剂在高空速下的仍保持甘油完全转化,同时1,3-丙二醇选择性高,有利于工业化推广。