本发明公开了一种从百香果果皮中联合提取黄酮和果胶的方法,包括以下步骤:清洗,烘干,粉碎,得百香果果皮粉末;将百香果果皮粉末加入提取罐中,加入乙醇、增溶剂三乙醇胺和碳酸二甲酯,并用碱调节pH至8.0~8.5,超声波提取,过滤,分离滤液A和滤渣A;滤液A过柱、减压蒸馏,得百香果果皮总黄酮;取滤渣A,灭酶活,加入水,Tween-80和纤维素酶,浸泡并超声波提取5~15min,过滤,分离滤液B和滤渣B;滤液B减压浓缩、脱色,醇析,过滤后取沉淀物,沉淀物干燥,得果胶。通过本发明能实现从百香果果皮中联合提取黄酮和果胶,实现百香果果皮的综合利用。