本发明涉及一种奶酪产品及其制备方法和应用,具体地,所述奶酪产品含有奶酪、益生菌和巧克力,并且具有“芯材+包覆层”结构,有利于奶酪和益生菌的保存,并且特定层数的包覆层有利于提高口感,相对于原始的奶酪,进一步延长保存期。同时,本发明采用冻干奶酪块或经膨化的奶酪作为芯材,使产品含有了较多的钙和蛋白质,满足了人体对钙和蛋白质的需求。本发明所提供的制备方法,通过控制冷冻温度和冷冻干燥温度,可以控制奶酪芯材的松脆度,提高产品的口感,同时也可以更好地提高产品的保存期。本发明可以应用于改善口腔健康,特别是降低龋齿发病率。